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*****EN***** Octávio Serra finished his PhD in Plant biology and biotechnology in 2017 at the Universitat Autònoma de Barcelona, Spain. Previously he completed a Masters degree in molecular genetics in 2013 at Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro and graduated in genetics and biotechnology in 2011 by the same university. His PhD thesis was focused on the genomics and breeding of peach species, developed at IRTA, and deserved the highest score with cum laude distinction. During his PhD, Octávio has participated in two research projects that aimed to produce molecular markers and generate new strategies that could allow to better understand and accelerate the breeding cycle of woody species, using peach and almond as model species. Since 2017, Octávio is a Junior Researcher at the National Institute for Agriculture and Veterinary Research (INIAV), and he has been collaborating in several projects, namely GENOSUBER (The genome sequencing of cork oak) and FASTBREED (Implementation of a wheat breeding program established in genomic selection). Octávio has published 12 research articles in specialized first quartile journals and has several participations (oral and poster) in national and international congresses. He has been supervisor of 2 graduate students and one master student, and is currently supervising of one graduate student and one PhD student. He has completed several online courses related with computation sciences, bioinformatics and genomics. Recently, Octávio has joined the Portuguese Plant Genebank and nowadays his main interests are the implementation of new tools and technologies to promote and accelerate the knowledge of the criobiology of woody Rosaceae species. *****PT***** Octávio Serra concluiu o Doutoramento em Plant biology and biotechnology em 2017 pela Universitat Autònoma de Barcelona, Espanha. Previamente concluiu o Mestrado em "Genética Molecular Comparativa e Tecnológica" em 2013 pela Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro e a Licenciatura em "Genética e Biotecnologia" em 2011 pela mesma universidade. A sua tese de Doutoramento focada na genómica e melhoramento genético do pessegueiro foi desenvolvida no IRTA e mereceu a classificação máxima de Excelente com distinção Cum laude. Durante o período do seu doutoramento participou em dois projetos de investigação focados no desenvolvimento de marcadores moleculares e criação de novas estratégias que permitam entender e acelerar o processo de melhoramento genético em espécies lenhosas, utilizando o pessegueiro e a amendoeira como espécies modelo. Desde 2017 é investigador no Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária (INIAV) onde tem colaborado em diversos projetos, nomeadamente o projeto GENOSUBER - Sequenciação do genoma do sobreiro e FASTBREED - Implementação de um programa de melhoramento de variedades de trigo com base em seleção genómica. Publicou 12 artigos em revistas especializadas de primeiro quartil nas áreas de biotecnologia vegetal. No seu percurso científico conta ainda com diversas comunicações orais e sob a forma de psoter, em congressos nacionais e internacionais. Coorientou dois estudantes de licenciatura e um estudante de mestrado nos seus trabalhos de final de curso, e atualmente é co-orientador de uma estudante de Licenciatura e de uma estudante de Doutoramento. Frequentou e completou com sucesso vários cursos relacionados com as ciencias da computação, bioinformática e genómica. Recentemente integrou a equipa do Banco Português de Germolasma Vegetal e os seus interesses atuais focam-se na implementação de novas ferramentas e tecnologias para promover e acelerar o conhecimento da criobiologia das principais culturas vegetais nacionais, sobretudo dentro da familia das Rosaceas.
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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Octávio Manuel Ribeiro Serra

Nomes de citação

  • Serra, Octávio

Identificadores de autor

Ciência ID
A611-D1BC-5959
ORCID iD
0000-0002-1370-6614
Scopus Author Id
57014780800

Endereços de correio eletrónico

  • octavio.mr.serra@gmail.com (Profissional)
  • octavio.serra@iniav.pt (Profissional)

Moradas

  • INIAV - Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária. Banco Português de Germplasma, 4700-859, São Pedro de Merelim, Braga, Portugal (Profissional)

Websites

Domínios de atuação

  • Ciências Agrárias - Biotecnologia Agrária e Alimentar
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Conservação da Biodiversidade
  • Ciências Exatas - Ciências da Computação e da Informação - Bioinformática
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Genética e Hereditariedade

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Português Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1)
Inglês Utilizador independente (B1) Utilizador independente (B1) Utilizador independente (B1) Utilizador independente (B1)
Espanhol; Castelhano Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador independente (B1) Utilizador proficiente (C1)
Catalão Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1)
Formação
Grau Classificação
2023/12/22 - 2025/04/30
Em curso
 Associate Data Scientist in Python track (Outros)
Datacamp, Estados Unidos
2025/01/30
Concluído
 Sampling in Python (Outros)
Datacamp, Estados Unidos
2024/09/23
Concluído
 Introduction to Regression with statsmodels in Python (Outros)
Datacamp, Estados Unidos
2024/09/06
Concluído
 Writing Functions in Python (Outros)
Datacamp, Estados Unidos
2024/08/26
Concluído
 Working with Dates and Times in Python (Outros)
Datacamp, Estados Unidos
2024/08/07
Concluído
 Cleaning Data in Python (Outros)
Datacamp, Estados Unidos
2024/07/21
Concluído
 Introduction to Importing Data in Python (Outros)
Datacamp, Estados Unidos
2024/07/17
Concluído
 Data Communication Concepts (Outros)
Datacamp, Estados Unidos
2024/07/11
Concluído
 Working with Categorical Data in Python (Outros)
Datacamp, Estados Unidos
2024/07/01
Concluído
 Exploratory Data Analysis in Python (Outros)
Datacamp, Estados Unidos
2024/05/22
Concluído
 Python Toolbox (Outros)
Datacamp, Estados Unidos
2024/03/05
Concluído
 Introduction to Functions in Python (Outros)
Datacamp, Estados Unidos
2024/02/21
Concluído
 Introduction to Data Visualization with Seaborn (Outros)
Datacamp, Estados Unidos
2024/02/15
Concluído
 Introduction to Data Visualization with Matplotlib (Outros)
Datacamp, Estados Unidos
2024/01/24
Concluído
 Introduction to Statistics in Python (Outros)
Datacamp, Estados Unidos
2024/01/17
Concluído
 Joining Data with pandas (Outros)
Datacamp, Estados Unidos
2024/01/10
Concluído
 Data Manipulation with pandas (Outros)
Datacamp, Estados Unidos
2024/01/04
Concluído
 Intermediate Python (Outros)
Datacamp, Estados Unidos
2023/12/22
Concluído
 Introduction to Python (Outros)
Datacamp, Estados Unidos
2023/12/19 - 2023/12/19
Concluído
 Data Science: Transformação de Dados em Conhecimento (Outros)
Instituto Nacional de Administração, Portugal
2023/12/18 - 2023/12/18
Concluído
 Data Science: Competências e Ferramentas do Data Scientist (Outros)
Instituto Nacional de Administração, Portugal
2023/12/18 - 2023/12/18
Concluído
 Data Science: Conceitos Introdutórios (Outros)
Instituto Nacional de Administração, Portugal
2021/02/01 - 2021/05/18
Concluído
 Machine Learning with Python-From Linear Models to Deep Learning (Outros)
Massachusetts Institute of Technology, Estados Unidos
 67%
2018/03/06 - 2018/03/09
Concluído
 Computational Pangenomics (Outros)
Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal
 NA
2017/06/13 - 2017/11/30
Concluído
 Using Python for Research, PH526x (Outros)
Harvard University, Estados Unidos
 98%
2017/01/10 - 2017/03/18
Frequentou
 Introduction to computer science CS50 (Outros)
Harvard University, Estados Unidos
2017
Concluído
 Plant biology and biotechnology (Doutoramento)
Universitat Autònoma de Barcelona, Espanha
"TOWARDS INCREASING GENETIC VARIABILITY AND IMPROVING FRUIT QUALITY IN PEACH USING GENOMIC AND BIOINFORMATIC TOOLS" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 Excelent cum laude
2015/11/04 - 2015/12/22
Frequentou
 Introduction to Computational Thinking and Data Science, MITx-6.00.2x (Outros)
Massachusetts Institute of Technology, Estados Unidos
2015/08/15 - 2015/10/28
Concluído
 Introduction to computer science and programming using Python, MITx-6.00.1x (Outros)
Massachusetts Institute of Technology, Estados Unidos
 94%
2015/09/28 - 2015/09/30
Concluído
 Intellectual Property Course (Outros)
Centre de Recerca en Agrigenómica, Espanha
 NA
2014/11/10 - 2014/11/14
Concluído
 Introduction to Bioinformatics (Outros)
Centre de Recerca en Agrigenómica, Espanha
 NA
2013
Concluído
 Genética Molecular Comparativa e Tecnológica (Mestrado)
Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro, Portugal
"Increasing Strawberry nutritional quality: Development and selection of new markers for marker assisted selection based on the co-localization of QTLs and e-QTLs" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 18 out of 20
2011/06/11 - 2011/06/11
Concluído
 Iniciação à Genómica Computacional (Outros)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
 NA
2011
Concluído
 Genética e Biotecnologia (Licenciatura)
Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro, Portugal
"Análise da expressáo génica da transtirretina em peixe-zebra (Danio rerio) por Qpcr" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 16 out of 20
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2019/12/23 - Atual Investigador (Investigação) Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal
Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária - Banco Português de Germoplasma Vegetal, Portugal
2017/06/01 - 2019/12/20 Pós-doutorado (Investigação) Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal
Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária Polo de Santarém, Portugal
2017/07/01 - 2018/03/01 Investigador visitante (Investigação) Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal
Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal
2013/12/02 - 2017/04/24 Investigador Contratado (Investigação) Universitat Autònoma de Barcelona, Espanha
2012/09/01 - 2013/05/30 Estagiário de Investigação (Investigação) Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries, Espanha
Projetos

Projeto

Designação Financiadores
2023/01/01 - 2025/06/30 PRO-GRACE - Promoting a Plant Genetic Resource Community for Europe
101094738
Investigador
Horizon 2020
Em curso
2019/07/01 - 2022/08/31 Ecosmart Alternative Control Strategies against T. annulata and its Tick Vectors
LEAPAgri/0005/2017
Investigador
Concluído
2017/06/01 - 2019/09/05 Implementação de um programa de melhoramento de variedades de trigo com base em seleção genómica - FASTBREED
ALT20-03-0145-FEDER-000018
Bolseiro de Pós-Doutoramento
Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal
Concluído
2017/06/01 - 2018/02/28 GenoSuber - Sequenciação do genoma do sobreiro
ALENT-07-0224-FEDER-001754
Investigador Pós-doutorado
Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal
Concluído
2013/07/09 - 2017/01/31 Evaluation and introgression of new sources of genetic variability in the peach European and North American gene pool
AGL2009 - 07305
Outra
Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries, Espanha

Centre de Recerca en Agrigenómica, Espanha
Concluído
2013/07/09 - 2016/06/30 Use of the genome sequence to characterize intraclonal and interspecific variability in peach and almond
AGL2012-40228-C02-01
Bolseiro de Doutoramento
Centre de Recerca en Agrigenómica, Espanha

Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries, Espanha
Concluído

Outro

Designação Financiadores
2019 - Atual WOOF - Tracing the origins and evolutionary paths of the Iberian and the Maghreb Dog
PTDC/HIS-ARQ/29545/2017
Outra
Em curso
Produções

Publicações

Artigo em conferência
  1. Serra, Octávio. "Fenotipagem e Seleção Genómica no Programa de Melhoramento de Trigo". Trabalho apresentado em 4 º Simpósio “Produção e transformação de alimentos em ambiente sustentável”, Costa da Caparica, 2018.
  2. Serra, Octávio; Carmen Villatoro; Wilfried Schwab; Juan Muñoz-blanco; Amparo Monfort Vives, PhD. "Increasing Strawberry nutritional quality: Development and selection of new markers for marker assisted selection based on the co-localization of QTLs and e-QTLs". Trabalho apresentado em II International Strawberry Congress, Antwerp, 2013.
    Publicado
Artigo em revista
  1. Carmo Serrano; M. Conceição Oliveira; V. R. Lopes; Andreia Soares; Adriana K. Molina; Beatriz H. Paschoalinotto; Tânia C. S. P. Pires; Octávio Serra; Ana M. Barata. "Chemical Profile and Biological Activities of Brassica rapa and Brassica napus Ex Situ Collection from Portugal". Foods (2024): https://doi.org/10.3390/foods13081164.
    10.3390/foods13081164
  2. Diana Valente; Octávio Serra; Nuno Carolino; Jacinto Gomes; Ana Cláudia Coelho; Pedro Espadinha; José Pais; Inês Carolino. "A Genome-Wide Association Study for Resistance to Tropical Theileriosis in Two Bovine Portuguese Autochthonous Breeds". Pathogens (2024): https://doi.org/10.3390/pathogens13010071.
    10.3390/pathogens13010071
  3. Ana Usié; Octávio Serra; Pedro M. Barros; Pedro Barbosa; Célia Leão; Tiago Capote; Tânia Almeida; et al. "An improved reference genome and first organelle genomes of Quercus suber". Tree Genetics & Genomes (2023): https://doi.org/10.1007/s11295-023-01624-8.
    10.1007/s11295-023-01624-8
  4. Helena Darmancier; Celia P. F. Domingues; Joao S. Rebelo; Ana Amaro; Dionisio, Francisco; Joël Pothier; Serra, Octávio; Nogueira, Teresa. "Are Virulence and Antibiotic Resistance Genes Linked? A Comprehensive Analysis of Bacterial Chromosomes and Plasmids". Antibiotics 11 706 (2022): https://doi.org/10.3390/antibiotics11060706.
    Publicado
  5. Helena Darmancier; Célia P. F. Domingues; João S. Rebelo; Ana Amaro; Francisco Dionísio; Joël Pothier; Octávio Serra; Teresa Nogueira. "Are Virulence and Antibiotic Resistance Genes Linked? A Comprehensive Analysis of Bacterial Chromosomes and Plasmids". Antibiotics (2022): https://doi.org/10.3390/antibiotics11060706.
    10.3390/antibiotics11060706
  6. Serra, Octávio. "Genome-wide clonal variability in European pear 'Rocha' using High-throughput sequencing". Horticulture Research (2022): https://doi.org/10.1093/hr/uhac111.
    Acesso aberto • Publicado
  7. Blaschikoff, Ludmilla; Daza-Perea, Arantxa; Requicha, João; Detry, Cleia; Rasteiro, Rita; Guimarães, Sílvia; Ureña, Irene; et al. "A multidisciplinary study of Iberian Chalcolithic dogs". Journal of Archaeological Science: Reports 42 (2022): 103338. http://dx.doi.org/10.1016/j.jasrep.2022.103338.
    10.1016/j.jasrep.2022.103338
  8. Kalluri, Naveen; Serra, Octávio; Donoso, José Manuel; Picañol, Roger; Howad, Werner; Eduardo, Iban; Arús, Pere. "Construction of a collection of introgression lines of 'Texas' almond DNA fragments in the 'Earlygold' peach genetic background". Horticulture Research (2022): http://dx.doi.org/10.1093/hr/uhac070.
    Publicado • 10.1093/hr/uhac070
  9. Scotti-Campos, Paula; Oliveira, Karliana; Pais, Isabel P.; Bagulho, Ana Sofia; Semedo, José N.; Serra, Octávio; Simões, Fernanda; et al. "Grain Composition and Quality in Portuguese Triticum aestivum Germplasm Subjected to Heat Stress after Anthesis". Plants 11 3 (2022): 365. http://dx.doi.org/10.3390/plants11030365.
    10.3390/plants11030365
  10. Octávio Serra; Jordi Giné-Bordonaba; Iban Eduardo; Joan Bonany; Gemma Echeverria; Christian Larrigaudière; Pere Arús. "Genetic analysis of the slow-melting flesh character in peach". Tree Genetics & Genomes 13 4 (2017): https://doi.org/10.1007%2Fs11295-017-1160-x.
    10.1007/s11295-017-1160-x
  11. Octávio Serra; José Manuel Donoso; Roger Picañol; Ignasi Batlle; Werner Howad; Iban Eduardo; Pere Arús. "Marker-assisted introgression (MAI) of almond genes into the peach background: a fast method to mine and integrate novel variation from exotic sources in long intergeneration species". Tree Genetics & Genomes 12 5 (2016): https://doi.org/10.1007%2Fs11295-016-1056-1.
    10.1007/s11295-016-1056-1
  12. J. M. Donoso; R. Picañol; O. Serra; W. Howad; S. Alegre; P. Arús; I. Eduardo. "Exploring almond genetic variability useful for peach improvement: mapping major genes and QTLs in two interspecific almond × peach populations". Molecular Breeding 36 2 (2016): https://doi.org/10.1007%2Fs11032-016-0441-7.
    10.1007/s11032-016-0441-7
  13. P. Arús; M.J. Aranzana; W. Howad; I. Eduardo; J.M. Donoso; E. López-Girona; O. Serra. "THE PEACH GENOME AND ITS APPLICATIONS". Acta Horticulturae 1100 (2015): 29-33. https://doi.org/10.17660%2Factahortic.2015.1100.3.
    10.17660/actahortic.2015.1100.3
Artigo em revista (magazine)
  1. Barata, Ana Maria; Gaspar, Carlos; Rocha, Filomena; Silva, Isabel; Vaz, Madalena; Serra, Octávio; Lopes, Violeta. "A contribuição do BPGV para o desenho contemporâneo da agricultura e alimentação", Cultivar, 2024, https://www.gpp.pt/images/GPP/O_que_disponibilizamos/Publicacoes/CULTIVAR_30/22/.
  2. Serra, Octávio; Fernanda Simões; Ana Rita Costa; Nuno Pinheiro; Conceição Gomes; José Coutinho; Ana Almeida; Paula Scotti; Benvindo Maçãs. "Novas estratégias no melhoramento do trigo", Agrotec - Revista Técnico-Científica Agrícola, 2019
  3. Serra, Octávio; Sílvia Alves. "Previsão de valores genéticos em programas de melhoramento de trigo", Vida Rural - Revista profissional de agronegócios, 2019
Capítulo de livro
  1. Rocha, Filomena; Serra, Octávio; Vaz, Madalena; Silva, Isabel; Gaspar, Carlos; Lopes, Violeta; Barata, Ana Maria. "Portugal Gene Bank". In Plant Gene Banks, 1-36. Springer Nature Singapore, 2025.
    10.1007/978-981-99-4236-7_79-1
Poster em conferência
  1. Valente, Diana; Serra, Octávio; Carolino, Nuno; Gomes, Jacinto; Pais, José; Carolino, I.. "Caracterização genética dos diferentes ecótipos da raça autóctone Mertolenga relativamente à sua resistência à Teileriose Tropical". Trabalho apresentado em XXIII Jornadas APB, 2024.
  2. Pires, Ana Elisabete. "CREOLEs – Genomics and Immunity of Cape Verde Stray Dogs". Trabalho apresentado em 3º Encontro do AL4animalS, 2024.
  3. Blaschikoff, Ludmilla; Serra, Octávio; Simões, Fernanda; Matos, José; Romão, Ricardo; Ostrander, Elaine; Ginja, Catarina; Pires, Ana Elisabete. Autor correspondente: Blaschikoff, Ludmilla. "Insights into the genomics of the Iberian dog breeds and searching for their influence on the development of Brazilian counterparts - preliminary results". Trabalho apresentado em XIX ENBE, 2023.
  4. GOOR, Mahaut; Blaschikoff, Ludmilla; Guimaraes, Silvia; Serra, Octávio; Simões, Fernanda; Detry, Cleia; Macarena Bustamante-Álvarez; et al. "Getting to know ancient dogs through a genomic approach". Trabalho apresentado em 10th ICAZ AGPM (International Council for Archaeozoology- Archaeozoology, Genetics, Proteomics and Morphometrics working group), 2023.
  5. Pires, Ana Elisabete; Blaschikoff, Ludmilla; Guimaraes, Silvia; GOOR, Mahaut; Serra, Octávio; Simões, Fernanda; Detry, Cleia; Ginja, Catarina. "Iberian dogs - a diachronic genomic analysis". Trabalho apresentado em FMVet Research Meetings: II Encontro de Investigação da FMV da Universidade Lusófona » Faculdade de Medicina Veterinária (ulusofona.pt)), 2023.
  6. Valente, Diana. "A preliminary genome-wide association study for resistance to Tropical Theileriosis in Portuguese Mertolenga cattle breed". 2023.
  7. Blaschikoff, Ludmilla; Serra, Octávio; JL Cardoso; Carlos Fernández-Rodríguez; Ana Catarina Sousa; Marta Moreno-Garcia; Guimaraes, Silvia; et al. "Unraveling the genomes of ancient Iberian Canis". Trabalho apresentado em XV Encontro Nacional de Biologia Evolutiva, 2019.
  8. Pires, Ana Elisabete; Serra, Octávio; Ginja, Catarina; Detry, Cleia; Chikhi, Lounes; Rasteiro, Rita; Blaschikoff, Ludmilla; et al. "News from Old Iberian Dogs". Trabalho apresentado em 8th meeting of the ICAZ Archaeozoology, Genetics, Proteomics and Morphometrics (AGPM) Working Group, 2019.
  9. Blaschikoff, Ludmilla; Serra, Octávio; Cardoso, João Luís; Fernández-Rodríguez, Carlos; Sousa, Ana Catarina; Moreno-Garcia, Marta; Guimarães, Silvia; et al. "Iberian Chalcolithic Canis: a genomic approach to know them better". Trabalho apresentado em ICAZ AGPM - 8th meeting of the International Council for Archaeozooloy (ICAZ) Archaeozoology, Genetics, Proteomics, Morphometrics (AGPM) working group, 2019.
    10.13140/RG.2.2.19316.30085
  10. Blaschikoff, Ludmilla; Serra, Octávio; Guimaraes, Silvia; João Luis Cardoso; Fernanda Simões; Detry, Cleia; Ginja, Catarina. "Bioinformatic tools in the study of ancient dogs – preliminary results of an Iberian case study". Trabalho apresentado em Bioinformatics open days 2019, 2019.
  11. Serra, Octávio; Fernanda Simões; Ana Rita Costa; Nuno Pinheiro; Ana Almeida; João Coutinho; José Matos; et al. "Phenotyping and genomic selection on advanced breeding lines of bread wheat". Trabalho apresentado em COST FA1306 - Current and future applications of phenotyping for plant breeding, 2017.
  12. Serra, Octávio; Pere Arús, PhD; José Manuel Donoso; Iban Eduardo; Werner Howad, PhD; M.J. Aranzana. "Marker Assisted Introgression (MAI): A Fast Approach to Assess the Value of Almond Genes and Integrate them in the Peach Genetic Background". Trabalho apresentado em XXIII International Plant and Animal genome congress, 2015.
  13. Serra, Octávio; Carmen Villatoro; Juan Muñoz-blanco; Wilfried Schwab; Amparo Monfort Vives, PhD. "Marker Assisted Selection Based on Co-Localization of mQTLs and e-QTLs Linked to Fruit Polyphenol Content". Trabalho apresentado em XXII International Plant and Animal genome congress, 2014.
Resumo em conferência
  1. GOOR, Mahaut; Blaschikoff, Ludmilla; Silvia de Lima Guimaraes Chiarelli; Serra, Octávio; Simões, Fernanda; Detry, Cleia; Bustamante-Álvarez, M.; et al. "Getting to know ancient dogs through a genomic approach (Poster presentation)". Trabalho apresentado em 10th ICAZ Archaeozoology, Genetics, Proteomics & Morphometrics Group Meeting. https://agpm2023.sciencesconf.org/data/pages/ICAZ_AGPM_Munich_book_FINAL_4.pdf, Munich, 2023.
  2. Blaschikoff, Ludmilla; Serra, Octávio; Simões, F.; Matos, J.; Romão, R.; Ostrander, E.; Ginja, C.; Pires, Ana Elisabete. "Unveiling signatures of old world dogs in the genomes of their brazilian counterparts (Poster presentation)". Trabalho apresentado em XXIV Simposio Iberoamericano Conbiand y I SIMPOSIO REZGEN-IBA. October 2 to 6. https://conbiand.site/?page_id=3234, Veracruz, 2023.
    Publicado
Atividades

Apresentação oral de trabalho

Título da apresentação Nome do evento
Anfitrião (Local do evento)
2025/04/11 Conservação dos recursos genéticos vegetais para alimentação e agricultura Investigação em Plantas para Suportar "Uma Só Saúde"
ITQB (Oeiras, Portugal)
2025/04/07 The importance of cryopreservation for the conservation of plant genetic resources Advanced course - Advances in Plant Molecular Biology
Universidade do Minho (Braga, Portugal)
2024/12/12 A variabilidade genética dos clones de pera ‘Rocha’ Balanço da campanha das Pomóideas – campanha de 2024
COTHN (Óbidos, Portugal)
2024/10/10 The role of cryopreservation in the conservation of Portuguese Plant Genetic Resources
UTAD (Vila Real, Portugal)
2024/09 Portuguese native dog breeds - genome-wide assessment of their geneticdiversity and population structure XIV Congresso Ibérico sobre Recursos Genéticos Animais
SPREGA (Vila Real, Portugal)
2024/02/02 Strategies and tools to uncover the genetic basis of key traits in Roseacea species Advanced Course in Plant Functional Biology - Models, crops and genomics strategies towards phenotype-genotype inference
CIBIO (Vairão, Portugal)
2023/09/12 Current status of the National Inventory of Plant Genetic Resources in Portugal EURISCO Training Workshop 2023
Institute for Plant Genetic Resources "K. Malkov" (Plovdiv, Bulgária)
2023/05/03 Cryopreservation in Portugal ECPGR Cryopreservation Working Group - first meeting
Crop Research Institute (Prague, República Checa)
2022/11/25 Inovação nos RGV - O mundo digital A Transformação Digital na Valorização e Gestão dos Recursos Genéticos Vegetais - Tradição, Ciência e Inovação
Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária - Banco Português de Germoplasma Vegetal (Braga, Portugal)
2022/10/19 The implementation of GRIN-Global in Portugal: History, challenges, experiences and prospects Crop Research Institute
European Cooperative Programme for Plant Genetic Resources (ECPGR) (Prague, República Checa)
2022/07/22 Revealing the bacterial diversity associated with Platypus cylindrus (Coleoptera: Curculionidae) on Portuguese cork oaks XXVI International Congress of Entomology
(Helsinki, Finlândia)
2019/02/20 Implementation of Genomic Selection in the Portuguese wheat breeding program Bioinformatics Open Days 2019
Universidade do Minho (Braga, Portugal)
2016/06/21 Resequence analysis of interspecific and intraspecific recombination in an [(almond × peach) × peach] backcross progeny 8th International Rosaceae Genomics Conference
INRA (Angers, França)
2015/06/04 QTL analysis of the slow melting flesh character in peach 2nd Annual Congress of Young Researchers (ACYR).
CRAG (Barcelona, Espanha)
2014/06/24 TxE revisited. Use of a Prunus reference mapping population in the NGS era. 7th International Rosaceae Genomics Conference.
Washington State University (Seattle, Estados Unidos)
2014/06/02 In silico detection of recombination breakpoints in an almond x peach interspecific cross. Next Generation Sequencing Conference (NGS)
International Society for Computational Biology (Barcelona, Espanha)
2013/09/25 Peach breeding in the genomics era. III Molecular Markers Horticulture Symposium
International society for Horticulture Science (Riva del Garda, Itália)
2013/09/18 Nuevos marcadores para selección asistida en fresa basados en la co-localización de QTLs y e-QTLs relacionados con el contenido de polifenoles en fruto maduro. XXXIX Congreso de la sociedad española de genética
Sociedad Española de Genética (Girona, Espanha)

Orientação

Título / Tema
Papel desempenhado 		Curso (Tipo)
Instituição / Organização
2022/12/01 - Atual Tracking the genomic signatures of dog origins and breed development in Iberia and Brazil
Coorientador
 Biodiversidade, Genética e Evolução (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2024/03/14 - 2024/09/30 Estabelecimento, Propagação e Enraizamento em Pomóideas
Orientador
 Agronomia (Licenciatura/Bacharelato)
Instituto Politécnico de Viana do Castelo Escola Superior Agrária, Portugal
2018/09/17 - 2019/07/18 Dogs (Canis lupus familiaris) from the Iberian Peninsula dated to the Chalcolithic period: a genomic approach
Coorientador de Ludmilla Paixão Blaschikoff
 Ecologia Aplicada (Mestrado)
Universidade de Aveiro, Portugal

Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal

Universidade do Porto Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Portugal
2016/02/01 - 2016/06/01 Fine mapping of the locus responsible for flower type in Prunus persica
Coorientador
Universitat Autònoma de Barcelona, Espanha

Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries, Espanha

Centre de Recerca en Agrigenómica, Espanha
2015/02/01 - 2015/06/30 Exploring a region of the Prunus genome which contains an almond gene responsable for powder mildew resistance.
Coorientador
Universitat Autònoma de Barcelona, Espanha

Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries, Espanha

Centre de Recerca en Agrigenómica, Espanha

Organização de evento

Nome do evento
Tipo de evento (Tipo de participação) 		Instituição / Organização
2024/05/14 - 2024/05/15 First physical meeting of the European Genebank Managers Network (2024/05/14 - 2024/05/15)
Encontro (Coorganizador)
 Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária - Banco Português de Germoplasma Vegetal, Portugal
2011/02/16 - 2011/02/18 III Jornadas Nacionais de Genética e Biotecnologia (2011/02/16 - 2011/02/18)
Congresso (Membro da Comissão Organizadora)
 Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro Escola de Ciências da Vida e do Ambiente, Portugal
2010/05/14 - 2010/05/15 II Jornadas Nacionais de Genética e Biotecnologia (2010/05/14 - 2010/05/15)
Congresso (Membro da Comissão Organizadora)
 Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro Escola de Ciências da Vida e do Ambiente, Portugal

Participação em evento

Descrição da atividade
Tipo de evento 		Nome do evento
Instituição / Organização
2024/09/17 - 2024/09/20 Workshop on garlic cryopreservation using vitrification methods on several explants
Oficina (workshop)
 Training School on Allium cryopreservation
European Cooperative Programme for Plant Genetic Resources (ECPGR), Itália
2024/03/15 - 2024/03/15 10º Encontro Rocha em Flor
Encontro
 10º Encontro Rocha em Flor
APAS - Associação dos Produtores Agrícolas da Sobrena, Portugal
2024/02/27 - 2024/02/27 Estratégias Territoriais Para Uma Alimentação Sustentável
Seminário
 Estratégias Territoriais Para Uma Alimentação Sustentável
Associação de desenvolvimento das terras altas do Homem Cávado e Ave, Portugal
2023/05/03 - 2023/05/04 First meeting of the ECPGR Cryopreservation Working Group
Outro
 First meeting of the ECPGR Cryopreservation Working Group
European Cooperative Programme for Plant Genetic Resources (ECPGR), Itália
2023/03/30 - 2023/03/30 GeoSimplex 2.0 Transição Digital com Norte
Seminário
 GeoSimplex 2.0 Transição Digital com Norte
Direção Regional de Agricultura e Pescas do Norte, Portugal
2023/01/16 - 2023/01/16 A Conservação da variabilidade genética intravarietal da videira e a sustentabilidade do sector vitivinícola
Conferência
 A Conservação da variabilidade genética intravarietal da videira e a sustentabilidade do sector vitivinícola
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2022/11/25 - 2022/11/25 A Transformação Digital na Valorização e Gestão dos Recursos Genéticos Vegetais - Tradição, Ciência e Inovação
Conferência
 A Transformação Digital na Valorização e Gestão dos Recursos Genéticos Vegetais - Tradição, Ciência e Inovação
Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária - Banco Português de Germoplasma Vegetal, Portugal
2019/04/10 - 2019/04/10 AgroIn'2019
Conferência
 AgroIn'2019
2018/06/04 - 2018/06/05 Seleção genómica em trigo
Oficina (workshop)
 Seleção genómica em trigo
Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal
2011 - 2011 Conferências de Nanotecnologia
Conferência
Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro Escola de Ciências da Vida e do Ambiente, Portugal
2011 - 2011 XXXVI Jornadas Portuguesas de Genética
Congresso
Universidade de Coimbra, Portugal
2010 - 2010 23 rd Trna Workshop: From The Origin Of Life To Biomedicine
Oficina (workshop)
Universidade de Aveiro, Portugal
2010 - 2010 Os Antibióticos e a Sua Aplicação à Saúde
Oficina (workshop)
Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro Escola de Ciências da Vida e do Ambiente, Portugal
2010 - 2010 XXXV Jornadas Portuguesas de Genética
Congresso
Universidade do Minho, Portugal
2009 - 2009 XXXIV Jornadas Portuguesas de Genética
Congresso
 XXXIV Jornadas Portuguesas de Genética
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2009 - 2009 Comet assay: DNA damage and repair - Componente teórica e prática
Oficina (workshop)
 Comet assay: DNA damage and repair
Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro Escola de Ciências da Vida e do Ambiente, Portugal
2009 - 2009 Doenças Hereditárias: Métodos de Diagnóstico e Bases Moleculares
Conferência
 Doenças Hereditárias: Métodos de Diagnóstico e Bases Moleculares
Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro Escola de Ciências da Vida e do Ambiente, Portugal
2009 - 2009 Bioética: Desafios da Nova Genética
Mesa-redonda
 Bioética: Desafios da Nova Genética
Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro Escola de Ciências da Vida e do Ambiente, Portugal
2009 - 2009 III ´s Jornadas de Biologia
Congresso
 III ´s Jornadas de Biologia
Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro Escola de Ciências da Vida e do Ambiente, Portugal
2008/11/21 - 2008/11/23 I ´s Jornadas Nacionais de Genética e Biotecnologia
Congresso
 I ´s Jornadas Nacionais de Genética e Biotecnologia
Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro Escola de Ciências da Vida e do Ambiente, Portugal

Júri de grau académico

Tema
Tipo de participação 		Nome do candidato (Tipo de grau)
Instituição / Organização
2023/12/13 Characterization of biodiversity and domestication in grapevine using whole genome sequencing approaches
Arguente
 João Pedro Martins Nunes (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal

Arbitragem científica em revista

Nome da revista (ISSN) Editora
2019/01/23 - 2019/02/24 Acta Botanica Croatica (1847-8476) Division of Biology, Faculty of Science, University of Zagreb
2017/08/14 - 2017/08/30 Plant Cell Tissue and Organ Culture (PCTOC) (1573-5044) Springer Netherlands

Membro de associação

Nome da associação Tipo de participação
2010/12 - 2011/12 AAUTAD - Associação Académica da UTAD Vice-Presidente

Membro de comissão

Descrição da atividade
Tipo de participação 		Instituição / Organização
2012/02 - 2014/02 Representante dos estudantes no Conselho Geral da UTAD
Membro
 Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro, Portugal
Distinções

Título

2017 Cum laude
Universitat Autònoma de Barcelona, Espanha