Octávio Manuel Ribeiro Serra (A611-D1BC-5959)

Curriculum Vitae

Octávio Manuel Ribeiro Serra

*****EN***** Octávio Serra finished his PhD in Plant biology and biotechnology in 2017 at the Universitat Autònoma de Barcelona, Spain. Previously he completed a Masters degree in molecular genetics in 2013 at Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro and graduated in genetics and biotechnology in 2011 by the same university. His PhD thesis was focused on the genomics and breeding of peach species, developed at IRTA, and deserved the highest score with cum laude distinction. During his PhD, Octávio has participated in two research projects that aimed to produce molecular markers and generate new strategies that could allow to better understand and accelerate the breeding cycle of woody species, using peach and almond as model species. Since 2017, Octávio is a Junior Researcher at the National Institute for Agriculture and Veterinary Research (INIAV), and he has been collaborating in several projects, namely GENOSUBER (The genome sequencing of cork oak) and FASTBREED (Implementation of a wheat breeding program established in genomic selection). Octávio has published 12 research articles in specialized first quartile journals and has several participations (oral and poster) in national and international congresses. He has been supervisor of 2 graduate students and one master student, and is currently supervising of one graduate student and one PhD student. He has completed several online courses related with computation sciences, bioinformatics and genomics. Recently, Octávio has joined the Portuguese Plant Genebank and nowadays his main interests are the implementation of new tools and technologies to promote and accelerate the knowledge of the criobiology of woody Rosaceae species. *****PT***** Octávio Serra concluiu o Doutoramento em Plant biology and biotechnology em 2017 pela Universitat Autònoma de Barcelona, Espanha. Previamente concluiu o Mestrado em "Genética Molecular Comparativa e Tecnológica" em 2013 pela Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro e a Licenciatura em "Genética e Biotecnologia" em 2011 pela mesma universidade. A sua tese de Doutoramento focada na genómica e melhoramento genético do pessegueiro foi desenvolvida no IRTA e mereceu a classificação máxima de Excelente com distinção Cum laude. Durante o período do seu doutoramento participou em dois projetos de investigação focados no desenvolvimento de marcadores moleculares e criação de novas estratégias que permitam entender e acelerar o processo de melhoramento genético em espécies lenhosas, utilizando o pessegueiro e a amendoeira como espécies modelo. Desde 2017 é investigador no Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária (INIAV) onde tem colaborado em diversos projetos, nomeadamente o projeto GENOSUBER - Sequenciação do genoma do sobreiro e FASTBREED - Implementação de um programa de melhoramento de variedades de trigo com base em seleção genómica. Publicou 12 artigos em revistas especializadas de primeiro quartil nas áreas de biotecnologia vegetal. No seu percurso científico conta ainda com diversas comunicações orais e sob a forma de psoter, em congressos nacionais e internacionais. Coorientou dois estudantes de licenciatura e um estudante de mestrado nos seus trabalhos de final de curso, e atualmente é co-orientador de uma estudante de Licenciatura e de uma estudante de Doutoramento. Frequentou e completou com sucesso vários cursos relacionados com as ciencias da computação, bioinformática e genómica. Recentemente integrou a equipa do Banco Português de Germolasma Vegetal e os seus interesses atuais focam-se na implementação de novas ferramentas e tecnologias para promover e acelerar o conhecimento da criobiologia das principais culturas vegetais nacionais, sobretudo dentro da familia das Rosaceas.

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Identification

Personal identification

Full name: Octávio Manuel Ribeiro Serra

Citation names

Serra, Octávio

Author identifiers

Ciência ID: A611-D1BC-5959
ORCID iD: 0000-0002-1370-6614
Scopus Author Id: 57014780800

Email addresses

octavio.mr.serra@gmail.com (Professional)
octavio.serra@iniav.pt (Professional)

Addresses

INIAV - Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária. Banco Português de Germplasma, 4700-859, São Pedro de Merelim, Braga, Portugal (Professional)

Websites

www.linkedin.com/in/octaviomrserra (Professional)

Knowledge fields

Agrarian Sciences - Agrarian and Food Biotechnology
Natural sciences - Biological Sciences - Biodiversity Conservation
Exact Sciences - Computer and Information Sciences - Bioinformatics
Natural sciences - Biological Sciences - Genetics and Heredity

Languages

Language	Speaking	Reading	Writing	Listening
Portuguese	Advanced (C1)	Advanced (C1)	Advanced (C1)	Advanced (C1)
English	Intermediate (B1)	Intermediate (B1)	Intermediate (B1)	Intermediate (B1)
Spanish; Castilian	Advanced (C1)	Advanced (C1)	Intermediate (B1)	Advanced (C1)
Catalan	Beginner (A1)	Beginner (A1)	Beginner (A1)	Beginner (A1)

Education

	Degree	Classification
2023/12/22 - 2025/04/30 Ongoing	Associate Data Scientist in Python track (Outros) Datacamp, United States
2025/01/30 Concluded	Sampling in Python (Outros) Datacamp, United States
2024/09/23 Concluded	Introduction to Regression with statsmodels in Python (Outros) Datacamp, United States
2024/09/06 Concluded	Writing Functions in Python (Outros) Datacamp, United States
2024/08/26 Concluded	Working with Dates and Times in Python (Outros) Datacamp, United States
2024/08/07 Concluded	Cleaning Data in Python (Outros) Datacamp, United States
2024/07/21 Concluded	Introduction to Importing Data in Python (Outros) Datacamp, United States
2024/07/17 Concluded	Data Communication Concepts (Outros) Datacamp, United States
2024/07/11 Concluded	Working with Categorical Data in Python (Outros) Datacamp, United States
2024/07/01 Concluded	Exploratory Data Analysis in Python (Outros) Datacamp, United States
2024/05/22 Concluded	Python Toolbox (Outros) Datacamp, United States
2024/03/05 Concluded	Introduction to Functions in Python (Outros) Datacamp, United States
2024/02/21 Concluded	Introduction to Data Visualization with Seaborn (Outros) Datacamp, United States
2024/02/15 Concluded	Introduction to Data Visualization with Matplotlib (Outros) Datacamp, United States
2024/01/24 Concluded	Introduction to Statistics in Python (Outros) Datacamp, United States
2024/01/17 Concluded	Joining Data with pandas (Outros) Datacamp, United States
2024/01/10 Concluded	Data Manipulation with pandas (Outros) Datacamp, United States
2024/01/04 Concluded	Intermediate Python (Outros) Datacamp, United States
2023/12/22 Concluded	Introduction to Python (Outros) Datacamp, United States
2023/12/19 - 2023/12/19 Concluded	Data Science: Transformação de Dados em Conhecimento (Outros) Instituto Nacional de Administração, Portugal
2023/12/18 - 2023/12/18 Concluded	Data Science: Competências e Ferramentas do Data Scientist (Outros) Instituto Nacional de Administração, Portugal
2023/12/18 - 2023/12/18 Concluded	Data Science: Conceitos Introdutórios (Outros) Instituto Nacional de Administração, Portugal
2021/02/01 - 2021/05/18 Concluded	Machine Learning with Python-From Linear Models to Deep Learning (Outros) Massachusetts Institute of Technology, United States	67%
2018/03/06 - 2018/03/09 Concluded	Computational Pangenomics (Outros) Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal	NA
2017/06/13 - 2017/11/30 Concluded	Using Python for Research, PH526x (Outros) Harvard University, United States	98%
2017/01/10 - 2017/03/18 Attended	Introduction to computer science CS50 (Outros) Harvard University, United States
2017 Concluded	Plant biology and biotechnology (Doutoramento) Universitat Autònoma de Barcelona, Spain "TOWARDS INCREASING GENETIC VARIABILITY AND IMPROVING FRUIT QUALITY IN PEACH USING GENOMIC AND BIOINFORMATIC TOOLS" (THESIS/DISSERTATION)	Excelent cum laude
2015/11/04 - 2015/12/22 Attended	Introduction to Computational Thinking and Data Science, MITx-6.00.2x (Outros) Massachusetts Institute of Technology, United States
2015/08/15 - 2015/10/28 Concluded	Introduction to computer science and programming using Python, MITx-6.00.1x (Outros) Massachusetts Institute of Technology, United States	94%
2015/09/28 - 2015/09/30 Concluded	Intellectual Property Course (Outros) Centre de Recerca en Agrigenómica, Spain	NA
2014/11/10 - 2014/11/14 Concluded	Introduction to Bioinformatics (Outros) Centre de Recerca en Agrigenómica, Spain	NA
2013 Concluded	Genética Molecular Comparativa e Tecnológica (Mestrado) Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro, Portugal "Increasing Strawberry nutritional quality: Development and selection of new markers for marker assisted selection based on the co-localization of QTLs and e-QTLs" (THESIS/DISSERTATION)	18 out of 20
2011/06/11 - 2011/06/11 Concluded	Iniciação à Genómica Computacional (Outros) Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal	NA
2011 Concluded	Genética e Biotecnologia (Licenciatura) Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro, Portugal "Análise da expressáo génica da transtirretina em peixe-zebra (Danio rerio) por Qpcr" (THESIS/DISSERTATION)	16 out of 20

Affiliation

Science

	Category Host institution	Employer
2019/12/23 - Current	Researcher (Research)	Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal
	Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária - Banco Português de Germoplasma Vegetal, Portugal
2017/06/01 - 2019/12/20	Postdoc (Research)	Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal
	Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária Polo de Santarém, Portugal
2017/07/01 - 2018/03/01	Visiting Researcher (Research)	Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal
	Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal
2013/12/02 - 2017/04/24	Contracted Researcher (Research)	Universitat Autònoma de Barcelona, Spain

2012/09/01 - 2013/05/30	Research Trainee (Research)	Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries, Spain

Projects

Contract

	Designation	Funders
2023/01/01 - 2025/06/30	PRO-GRACE - Promoting a Plant Genetic Resource Community for Europe 101094738 Researcher	Horizon 2020 Ongoing
2019/07/01 - 2022/08/31	Ecosmart Alternative Control Strategies against T. annulata and its Tick Vectors LEAPAgri/0005/2017 Researcher	Concluded
2017/06/01 - 2019/09/05	Implementação de um programa de melhoramento de variedades de trigo com base em seleção genómica - FASTBREED ALT20-03-0145-FEDER-000018 Post-doc Fellow Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal	Concluded
2017/06/01 - 2018/02/28	GenoSuber - Sequenciação do genoma do sobreiro ALENT-07-0224-FEDER-001754 Post-doc Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal	Concluded
2013/07/09 - 2017/01/31	Evaluation and introgression of new sources of genetic variability in the peach European and North American gene pool AGL2009 - 07305 Other Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries, Spain Centre de Recerca en Agrigenómica, Spain	Concluded
2013/07/09 - 2016/06/30	Use of the genome sequence to characterize intraclonal and interspecific variability in peach and almond AGL2012-40228-C02-01 PhD Student Fellow Centre de Recerca en Agrigenómica, Spain Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries, Spain	Concluded

Other

	Designation	Funders
2019 - Current	WOOF - Tracing the origins and evolutionary paths of the Iberian and the Maghreb Dog PTDC/HIS-ARQ/29545/2017 Other	Ongoing

Outputs

Publications

Book chapter	Rocha, Filomena; Serra, Octávio; Vaz, Madalena; Silva, Isabel; Gaspar, Carlos; Lopes, Violeta; Barata, Ana Maria. "Portugal Gene Bank". In Plant Gene Banks, 1-36. Springer Nature Singapore, 2025. 10.1007/978-981-99-4236-7_79-1
Conference abstract	GOOR, Mahaut; Blaschikoff, Ludmilla; Silvia de Lima Guimaraes Chiarelli; Serra, Octávio; Simões, Fernanda; Detry, Cleia; Bustamante-Álvarez, M.; et al. "Getting to know ancient dogs through a genomic approach (Poster presentation)". Paper presented in 10th ICAZ Archaeozoology, Genetics, Proteomics & Morphometrics Group Meeting. https://agpm2023.sciencesconf.org/data/pages/ICAZ_AGPM_Munich_book_FINAL_4.pdf, Munich, 2023. Blaschikoff, Ludmilla; Serra, Octávio; Simões, F.; Matos, J.; Romão, R.; Ostrander, E.; Ginja, C.; Pires, Ana Elisabete. "Unveiling signatures of old world dogs in the genomes of their brazilian counterparts (Poster presentation)". Paper presented in XXIV Simposio Iberoamericano Conbiand y I SIMPOSIO REZGEN-IBA. October 2 to 6. https://conbiand.site/?page_id=3234, Veracruz, 2023. Published
Conference paper	Serra, Octávio. "Fenotipagem e Seleção Genómica no Programa de Melhoramento de Trigo". Paper presented in 4 º Simpósio “Produção e transformação de alimentos em ambiente sustentável”, Costa da Caparica, 2018. Serra, Octávio; Carmen Villatoro; Wilfried Schwab; Juan Muñoz-blanco; Amparo Monfort Vives, PhD. "Increasing Strawberry nutritional quality: Development and selection of new markers for marker assisted selection based on the co-localization of QTLs and e-QTLs". Paper presented in II International Strawberry Congress, Antwerp, 2013. Published
Conference poster	Valente, Diana; Serra, Octávio; Carolino, Nuno; Gomes, Jacinto; Pais, José; Carolino, I.. "Caracterização genética dos diferentes ecótipos da raça autóctone Mertolenga relativamente à sua resistência à Teileriose Tropical". Paper presented in XXIII Jornadas APB, 2024. Pires, Ana Elisabete. "CREOLEs – Genomics and Immunity of Cape Verde Stray Dogs". Paper presented in 3º Encontro do AL4animalS, 2024. Blaschikoff, Ludmilla; Serra, Octávio; Simões, Fernanda; Matos, José; Romão, Ricardo; Ostrander, Elaine; Ginja, Catarina; Pires, Ana Elisabete. Corresponding author: Blaschikoff, Ludmilla. "Insights into the genomics of the Iberian dog breeds and searching for their influence on the development of Brazilian counterparts - preliminary results". Paper presented in XIX ENBE, 2023. GOOR, Mahaut; Blaschikoff, Ludmilla; Guimaraes, Silvia; Serra, Octávio; Simões, Fernanda; Detry, Cleia; Macarena Bustamante-Álvarez; et al. "Getting to know ancient dogs through a genomic approach". Paper presented in 10th ICAZ AGPM (International Council for Archaeozoology- Archaeozoology, Genetics, Proteomics and Morphometrics working group), 2023. Pires, Ana Elisabete; Blaschikoff, Ludmilla; Guimaraes, Silvia; GOOR, Mahaut; Serra, Octávio; Simões, Fernanda; Detry, Cleia; Ginja, Catarina. "Iberian dogs - a diachronic genomic analysis". Paper presented in FMVet Research Meetings: II Encontro de Investigação da FMV da Universidade Lusófona » Faculdade de Medicina Veterinária (ulusofona.pt)), 2023. Valente, Diana. "A preliminary genome-wide association study for resistance to Tropical Theileriosis in Portuguese Mertolenga cattle breed". 2023. Blaschikoff, Ludmilla; Serra, Octávio; JL Cardoso; Carlos Fernández-Rodríguez; Ana Catarina Sousa; Marta Moreno-Garcia; Guimaraes, Silvia; et al. "Unraveling the genomes of ancient Iberian Canis". Paper presented in XV Encontro Nacional de Biologia Evolutiva, 2019. Pires, Ana Elisabete; Serra, Octávio; Ginja, Catarina; Detry, Cleia; Chikhi, Lounes; Rasteiro, Rita; Blaschikoff, Ludmilla; et al. "News from Old Iberian Dogs". Paper presented in 8th meeting of the ICAZ Archaeozoology, Genetics, Proteomics and Morphometrics (AGPM) Working Group, 2019. Blaschikoff, Ludmilla; Serra, Octávio; Cardoso, João Luís; Fernández-Rodríguez, Carlos; Sousa, Ana Catarina; Moreno-Garcia, Marta; Guimarães, Silvia; et al. "Iberian Chalcolithic Canis: a genomic approach to know them better". Paper presented in ICAZ AGPM - 8th meeting of the International Council for Archaeozooloy (ICAZ) Archaeozoology, Genetics, Proteomics, Morphometrics (AGPM) working group, 2019. 10.13140/RG.2.2.19316.30085 Blaschikoff, Ludmilla; Serra, Octávio; Guimaraes, Silvia; João Luis Cardoso; Fernanda Simões; Detry, Cleia; Ginja, Catarina. "Bioinformatic tools in the study of ancient dogs – preliminary results of an Iberian case study". Paper presented in Bioinformatics open days 2019, 2019. Serra, Octávio; Fernanda Simões; Ana Rita Costa; Nuno Pinheiro; Ana Almeida; João Coutinho; José Matos; et al. "Phenotyping and genomic selection on advanced breeding lines of bread wheat". Paper presented in COST FA1306 - Current and future applications of phenotyping for plant breeding, 2017. Serra, Octávio; Pere Arús, PhD; José Manuel Donoso; Iban Eduardo; Werner Howad, PhD; M.J. Aranzana. "Marker Assisted Introgression (MAI): A Fast Approach to Assess the Value of Almond Genes and Integrate them in the Peach Genetic Background". Paper presented in XXIII International Plant and Animal genome congress, 2015. Serra, Octávio; Carmen Villatoro; Juan Muñoz-blanco; Wilfried Schwab; Amparo Monfort Vives, PhD. "Marker Assisted Selection Based on Co-Localization of mQTLs and e-QTLs Linked to Fruit Polyphenol Content". Paper presented in XXII International Plant and Animal genome congress, 2014.
Journal article	Carmo Serrano; M. Conceição Oliveira; V. R. Lopes; Andreia Soares; Adriana K. Molina; Beatriz H. Paschoalinotto; Tânia C. S. P. Pires; Octávio Serra; Ana M. Barata. "Chemical Profile and Biological Activities of Brassica rapa and Brassica napus Ex Situ Collection from Portugal". Foods (2024): https://doi.org/10.3390/foods13081164. 10.3390/foods13081164 Diana Valente; Octávio Serra; Nuno Carolino; Jacinto Gomes; Ana Cláudia Coelho; Pedro Espadinha; José Pais; Inês Carolino. "A Genome-Wide Association Study for Resistance to Tropical Theileriosis in Two Bovine Portuguese Autochthonous Breeds". Pathogens (2024): https://doi.org/10.3390/pathogens13010071. 10.3390/pathogens13010071 Ana Usié; Octávio Serra; Pedro M. Barros; Pedro Barbosa; Célia Leão; Tiago Capote; Tânia Almeida; et al. "An improved reference genome and first organelle genomes of Quercus suber". Tree Genetics & Genomes (2023): https://doi.org/10.1007/s11295-023-01624-8. 10.1007/s11295-023-01624-8 Helena Darmancier; Celia P. F. Domingues; Joao S. Rebelo; Ana Amaro; Dionisio, Francisco; Joël Pothier; Serra, Octávio; Nogueira, Teresa. "Are Virulence and Antibiotic Resistance Genes Linked? A Comprehensive Analysis of Bacterial Chromosomes and Plasmids". Antibiotics 11 706 (2022): https://doi.org/10.3390/antibiotics11060706. Published Helena Darmancier; Célia P. F. Domingues; João S. Rebelo; Ana Amaro; Francisco Dionísio; Joël Pothier; Octávio Serra; Teresa Nogueira. "Are Virulence and Antibiotic Resistance Genes Linked? A Comprehensive Analysis of Bacterial Chromosomes and Plasmids". Antibiotics (2022): https://doi.org/10.3390/antibiotics11060706. 10.3390/antibiotics11060706 Serra, Octávio. "Genome-wide clonal variability in European pear 'Rocha' using High-throughput sequencing". Horticulture Research (2022): https://doi.org/10.1093/hr/uhac111. Open access • Published Blaschikoff, Ludmilla; Daza-Perea, Arantxa; Requicha, João; Detry, Cleia; Rasteiro, Rita; Guimarães, Sílvia; Ureña, Irene; et al. "A multidisciplinary study of Iberian Chalcolithic dogs". Journal of Archaeological Science: Reports 42 (2022): 103338. http://dx.doi.org/10.1016/j.jasrep.2022.103338. 10.1016/j.jasrep.2022.103338 Kalluri, Naveen; Serra, Octávio; Donoso, José Manuel; Picañol, Roger; Howad, Werner; Eduardo, Iban; Arús, Pere. "Construction of a collection of introgression lines of 'Texas' almond DNA fragments in the 'Earlygold' peach genetic background". Horticulture Research (2022): http://dx.doi.org/10.1093/hr/uhac070. Published • 10.1093/hr/uhac070 Scotti-Campos, Paula; Oliveira, Karliana; Pais, Isabel P.; Bagulho, Ana Sofia; Semedo, José N.; Serra, Octávio; Simões, Fernanda; et al. "Grain Composition and Quality in Portuguese Triticum aestivum Germplasm Subjected to Heat Stress after Anthesis". Plants 11 3 (2022): 365. http://dx.doi.org/10.3390/plants11030365. 10.3390/plants11030365 Octávio Serra; Jordi Giné-Bordonaba; Iban Eduardo; Joan Bonany; Gemma Echeverria; Christian Larrigaudière; Pere Arús. "Genetic analysis of the slow-melting flesh character in peach". Tree Genetics & Genomes 13 4 (2017): https://doi.org/10.1007%2Fs11295-017-1160-x. 10.1007/s11295-017-1160-x Octávio Serra; José Manuel Donoso; Roger Picañol; Ignasi Batlle; Werner Howad; Iban Eduardo; Pere Arús. "Marker-assisted introgression (MAI) of almond genes into the peach background: a fast method to mine and integrate novel variation from exotic sources in long intergeneration species". Tree Genetics & Genomes 12 5 (2016): https://doi.org/10.1007%2Fs11295-016-1056-1. 10.1007/s11295-016-1056-1 J. M. Donoso; R. Picañol; O. Serra; W. Howad; S. Alegre; P. Arús; I. Eduardo. "Exploring almond genetic variability useful for peach improvement: mapping major genes and QTLs in two interspecific almond × peach populations". Molecular Breeding 36 2 (2016): https://doi.org/10.1007%2Fs11032-016-0441-7. 10.1007/s11032-016-0441-7 P. Arús; M.J. Aranzana; W. Howad; I. Eduardo; J.M. Donoso; E. López-Girona; O. Serra. "THE PEACH GENOME AND ITS APPLICATIONS". Acta Horticulturae 1100 (2015): 29-33. https://doi.org/10.17660%2Factahortic.2015.1100.3. 10.17660/actahortic.2015.1100.3
Magazine article	Barata, Ana Maria; Gaspar, Carlos; Rocha, Filomena; Silva, Isabel; Vaz, Madalena; Serra, Octávio; Lopes, Violeta. "A contribuição do BPGV para o desenho contemporâneo da agricultura e alimentação", Cultivar, 2024, https://www.gpp.pt/images/GPP/O_que_disponibilizamos/Publicacoes/CULTIVAR_30/22/. Serra, Octávio; Fernanda Simões; Ana Rita Costa; Nuno Pinheiro; Conceição Gomes; José Coutinho; Ana Almeida; Paula Scotti; Benvindo Maçãs. "Novas estratégias no melhoramento do trigo", Agrotec - Revista Técnico-Científica Agrícola, 2019 Serra, Octávio; Sílvia Alves. "Previsão de valores genéticos em programas de melhoramento de trigo", Vida Rural - Revista profissional de agronegócios, 2019

Activities

Oral presentation

	Presentation title	Event name Host (Event location)
2025/04/11	Conservação dos recursos genéticos vegetais para alimentação e agricultura	Investigação em Plantas para Suportar "Uma Só Saúde" ITQB (Oeiras, Portugal)
2025/04/07	The importance of cryopreservation for the conservation of plant genetic resources	Advanced course - Advances in Plant Molecular Biology Universidade do Minho (Braga, Portugal)
2024/12/12	A variabilidade genética dos clones de pera ‘Rocha’	Balanço da campanha das Pomóideas – campanha de 2024 COTHN (Óbidos, Portugal)
2024/10/10	The role of cryopreservation in the conservation of Portuguese Plant Genetic Resources	UTAD (Vila Real, Portugal)
2024/09	Portuguese native dog breeds - genome-wide assessment of their geneticdiversity and population structure	XIV Congresso Ibérico sobre Recursos Genéticos Animais SPREGA (Vila Real, Portugal)
2024/02/02	Strategies and tools to uncover the genetic basis of key traits in Roseacea species	Advanced Course in Plant Functional Biology - Models, crops and genomics strategies towards phenotype-genotype inference CIBIO (Vairão, Portugal)
2023/09/12	Current status of the National Inventory of Plant Genetic Resources in Portugal	EURISCO Training Workshop 2023 Institute for Plant Genetic Resources "K. Malkov" (Plovdiv, Bulgaria)
2023/05/03	Cryopreservation in Portugal	ECPGR Cryopreservation Working Group - first meeting Crop Research Institute (Prague, Czech Republic)
2022/11/25	Inovação nos RGV - O mundo digital	A Transformação Digital na Valorização e Gestão dos Recursos Genéticos Vegetais - Tradição, Ciência e Inovação Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária - Banco Português de Germoplasma Vegetal (Braga, Portugal)
2022/10/19	The implementation of GRIN-Global in Portugal: History, challenges, experiences and prospects	Crop Research Institute European Cooperative Programme for Plant Genetic Resources (ECPGR) (Prague, Czech Republic)
2022/07/22	Revealing the bacterial diversity associated with Platypus cylindrus (Coleoptera: Curculionidae) on Portuguese cork oaks	XXVI International Congress of Entomology (Helsinki, Finland)
2019/02/20	Implementation of Genomic Selection in the Portuguese wheat breeding program	Bioinformatics Open Days 2019 Universidade do Minho (Braga, Portugal)
2016/06/21	Resequence analysis of interspecific and intraspecific recombination in an [(almond × peach) × peach] backcross progeny	8th International Rosaceae Genomics Conference INRA (Angers, France)
2015/06/04	QTL analysis of the slow melting flesh character in peach	2nd Annual Congress of Young Researchers (ACYR). CRAG (Barcelona, Spain)
2014/06/24	TxE revisited. Use of a Prunus reference mapping population in the NGS era.	7th International Rosaceae Genomics Conference. Washington State University (Seattle, United States)
2014/06/02	In silico detection of recombination breakpoints in an almond x peach interspecific cross.	Next Generation Sequencing Conference (NGS) International Society for Computational Biology (Barcelona, Spain)
2013/09/25	Peach breeding in the genomics era.	III Molecular Markers Horticulture Symposium International society for Horticulture Science (Riva del Garda, Italy)
2013/09/18	Nuevos marcadores para selección asistida en fresa basados en la co-localización de QTLs y e-QTLs relacionados con el contenido de polifenoles en fruto maduro.	XXXIX Congreso de la sociedad española de genética Sociedad Española de Genética (Girona, Spain)

Supervision

	Thesis Title Role	Degree Subject (Type) Institution / Organization
2022/12/01 - Current	Tracking the genomic signatures of dog origins and breed development in Iberia and Brazil Co-supervisor	Biodiversidade, Genética e Evolução (PhD) Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2024/03/14 - 2024/09/30	Estabelecimento, Propagação e Enraizamento em Pomóideas Supervisor	Agronomia (Degree) Instituto Politécnico de Viana do Castelo Escola Superior Agrária, Portugal
2018/09/17 - 2019/07/18	Dogs (Canis lupus familiaris) from the Iberian Peninsula dated to the Chalcolithic period: a genomic approach Co-supervisor of Ludmilla Paixão Blaschikoff	Ecologia Aplicada (Master) Universidade de Aveiro, Portugal Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal Universidade do Porto Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Portugal
2016/02/01 - 2016/06/01	Fine mapping of the locus responsible for flower type in Prunus persica Co-supervisor	Universitat Autònoma de Barcelona, Spain Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries, Spain Centre de Recerca en Agrigenómica, Spain
2015/02/01 - 2015/06/30	Exploring a region of the Prunus genome which contains an almond gene responsable for powder mildew resistance. Co-supervisor	Universitat Autònoma de Barcelona, Spain Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries, Spain Centre de Recerca en Agrigenómica, Spain

Event organisation

	Event name Type of event (Role)	Institution / Organization
2024/05/14 - 2024/05/15	First physical meeting of the European Genebank Managers Network (2024/05/14 - 2024/05/15) Meeting (Co-organisor)	Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária - Banco Português de Germoplasma Vegetal, Portugal
2011/02/16 - 2011/02/18	III Jornadas Nacionais de Genética e Biotecnologia (2011/02/16 - 2011/02/18) Congress (Member of the Organising Committee)	Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro Escola de Ciências da Vida e do Ambiente, Portugal
2010/05/14 - 2010/05/15	II Jornadas Nacionais de Genética e Biotecnologia (2010/05/14 - 2010/05/15) Congress (Member of the Organising Committee)	Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro Escola de Ciências da Vida e do Ambiente, Portugal

Event participation

	Activity description Type of event	Event name Institution / Organization
2024/09/17 - 2024/09/20	Workshop on garlic cryopreservation using vitrification methods on several explants Workshop	Training School on Allium cryopreservation European Cooperative Programme for Plant Genetic Resources (ECPGR), Italy
2024/03/15 - 2024/03/15	10º Encontro Rocha em Flor Meeting	10º Encontro Rocha em Flor APAS - Associação dos Produtores Agrícolas da Sobrena, Portugal
2024/02/27 - 2024/02/27	Estratégias Territoriais Para Uma Alimentação Sustentável Seminar	Estratégias Territoriais Para Uma Alimentação Sustentável Associação de desenvolvimento das terras altas do Homem Cávado e Ave, Portugal
2023/05/03 - 2023/05/04	First meeting of the ECPGR Cryopreservation Working Group Other	First meeting of the ECPGR Cryopreservation Working Group European Cooperative Programme for Plant Genetic Resources (ECPGR), Italy
2023/03/30 - 2023/03/30	GeoSimplex 2.0 Transição Digital com Norte Seminar	GeoSimplex 2.0 Transição Digital com Norte Direção Regional de Agricultura e Pescas do Norte, Portugal
2023/01/16 - 2023/01/16	A Conservação da variabilidade genética intravarietal da videira e a sustentabilidade do sector vitivinícola Conference	A Conservação da variabilidade genética intravarietal da videira e a sustentabilidade do sector vitivinícola Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2022/11/25 - 2022/11/25	A Transformação Digital na Valorização e Gestão dos Recursos Genéticos Vegetais - Tradição, Ciência e Inovação Conference	A Transformação Digital na Valorização e Gestão dos Recursos Genéticos Vegetais - Tradição, Ciência e Inovação Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária - Banco Português de Germoplasma Vegetal, Portugal
2019/04/10 - 2019/04/10	AgroIn'2019 Conference	AgroIn'2019
2018/06/04 - 2018/06/05	Seleção genómica em trigo Workshop	Seleção genómica em trigo Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal
2011 - 2011	Conferências de Nanotecnologia Conference	Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro Escola de Ciências da Vida e do Ambiente, Portugal
2011 - 2011	XXXVI Jornadas Portuguesas de Genética Congress	Universidade de Coimbra, Portugal
2010 - 2010	23 rd Trna Workshop: From The Origin Of Life To Biomedicine Workshop	Universidade de Aveiro, Portugal
2010 - 2010	Os Antibióticos e a Sua Aplicação à Saúde Workshop	Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro Escola de Ciências da Vida e do Ambiente, Portugal
2010 - 2010	XXXV Jornadas Portuguesas de Genética Congress	Universidade do Minho, Portugal
2009 - 2009	XXXIV Jornadas Portuguesas de Genética Congress	XXXIV Jornadas Portuguesas de Genética Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2009 - 2009	Comet assay: DNA damage and repair - Componente teórica e prática Workshop	Comet assay: DNA damage and repair Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro Escola de Ciências da Vida e do Ambiente, Portugal
2009 - 2009	Doenças Hereditárias: Métodos de Diagnóstico e Bases Moleculares Conference	Doenças Hereditárias: Métodos de Diagnóstico e Bases Moleculares Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro Escola de Ciências da Vida e do Ambiente, Portugal
2009 - 2009	Bioética: Desafios da Nova Genética Round table	Bioética: Desafios da Nova Genética Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro Escola de Ciências da Vida e do Ambiente, Portugal
2009 - 2009	III ´s Jornadas de Biologia Congress	III ´s Jornadas de Biologia Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro Escola de Ciências da Vida e do Ambiente, Portugal
2008/11/21 - 2008/11/23	I ´s Jornadas Nacionais de Genética e Biotecnologia Congress	I ´s Jornadas Nacionais de Genética e Biotecnologia Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro Escola de Ciências da Vida e do Ambiente, Portugal

Jury of academic degree

	Topic Role	Candidate name (Type of degree) Institution / Organization
2023/12/13	Characterization of biodiversity and domestication in grapevine using whole genome sequencing approaches (Thesis) Arguer	João Pedro Martins Nunes (Master) Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal

Association member

	Society Organization name	Role
2010/12 - 2011/12	AAUTAD - Associação Académica da UTAD	Vice-Presidente

Committee member

	Activity description Role	Institution / Organization
2012/02 - 2014/02	Representante dos estudantes no Conselho Geral da UTAD Member	Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro, Portugal

Journal scientific committee

	Journal title (ISSN)	Publisher
2019/01/23 - 2019/02/24	Acta Botanica Croatica (1847-8476)	Division of Biology, Faculty of Science, University of Zagreb
2017/08/14 - 2017/08/30	Plant Cell Tissue and Organ Culture (PCTOC) (1573-5044)	Springer Netherlands

Distinctions

Title

2017	Cum laude Universitat Autònoma de Barcelona, Spain