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ALEXANDRE RAFAEL MACHADO OLIVEIRA. Concluiu o(a) Mestrado integrado em Bioinformática em 2019/12/10 pelo(a) Universidade do Minho e Licenciatura em Biologia Aplicada em 2017/07/10 pelo(a) Universidade do Minho. Atua na(s) área(s) de Ciências Exatas com ênfase em Ciências da Computação e da Informação com ênfase em Bioinformática.
Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Alexandre Rafael Machado Oliveira

Nomes de citação

  • OLIVEIRA, ALEXANDRE

Identificadores de autor

Ciência ID
911C-D6A4-580D
ORCID iD
0000-0002-2255-8983

Endereços de correio eletrónico

  • alexandre36285@gmail.com (Profissional)

Websites

Domínios de atuação

  • Ciências Exatas - Ciências da Computação e da Informação - Bioinformática

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Português (Idioma materno)
Inglês Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C1)
Francês Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C1)
Formação
Grau Classificação
2021 - 2025
Em curso
 Engenharia Biomédica (Doutoramento)
Especialização em Bioinformática e Biologia de Sistemas
Universidade do Minho, Portugal
"A Systems Biology approach to model COVID19 phenotypes and drive drug discovery" (TESE/DISSERTAÇÃO)
2017/09 - 2019/12/10
Concluído
 Bioinformática (Mestrado integrado)
Universidade do Minho, Portugal
"A kinetic model of the central carbon metabolism for acrylic acid production in Escherichia coli" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 16
2014/09/10 - 2017/07/10
Concluído
 Biologia Aplicada (Licenciatura)
Universidade do Minho, Portugal
 14
Produções

Publicações

Artigo em conferência
  1. OLIVEIRA, ALEXANDRE; Cunha, Emanuel; Cruz, Fernando; Capela, João; Sequeira, João C.; Sampaio, Marta; Óscar Dias. Autor correspondente: Óscar Dias. "Towards a multivariate analysis of genome-scale metabolic models derived from the BiGG models database". Trabalho apresentado em PACBB 2021, Salamanca, 2021.
    Publicado
Artigo em revista
  1. Alexandre Oliveira; Miguel Rocha; Oscar Dias. "Metabolic modelling reveals key pathways in COVID-19 in an effort to drive drug purposing". IFAC-PapersOnLine (2024): http://dx.doi.org/10.1016/j.ifacol.2024.10.016.
    10.1016/j.ifacol.2024.10.016
  2. Alexandre Oliveira; Emanuel Cunha; Fernando Cruz; João Capela; João C. Sequeira; Marta Sampaio; Cláudia Sampaio; Oscar Dias. "Systematic assessment of template-based genome-scale metabolic models created with the BiGG Integration Tool". Journal of Integrative Bioinformatics (2022): https://doi.org/10.1515/jib-2022-0014.
    10.1515/jib-2022-0014
  3. Oliveira, Alexandre; Rodrigues, Joana; Ferreira, Eugénio Campos; Rodrigues, Lígia; Dias, Oscar. "A kinetic model of the central carbon metabolism for acrylic acid production in Escherichia coli". PLOS Computational Biology 17 3 (2021): e1008704. http://dx.doi.org/10.1371/journal.pcbi.1008704.
    10.1371/journal.pcbi.1008704
Capítulo de livro
  1. Alexandre Oliveira; Emanuel Cunha; Miguel Silva; Cristiana Faria; Oscar Dias. "Exploring Xylella fastidiosa’s Metabolic Traits Using a GSM Model of the Phytopathogenic Bacterium". 2023.
    10.1007/978-3-031-17024-9_8
Poster em conferência
  1. OLIVEIRA, ALEXANDRE; Rodrigues, Joana L.; Rodrigues, Lígia R.; Dias, Oscar. "A kinetic model of the central carbon metabolism for acrylic acid production in Escherichia coli". Trabalho apresentado em VIII Bioinformatics Open Days, 2019.

Outros

Outra produção
  1. TROPPO: Tissue-specific RecOnstruction and Phenotype Prediction using Omics data. 2025. Alexandre Oliveira; Jorge Ferreira; Vitor Vieira; Bruno Sá; Miguel Rocha. https://doi.org/10.1093/bioadv/vbaf113.
    10.1093/bioadv/vbaf113
Atividades

Organização de evento

Nome do evento
Tipo de evento (Tipo de participação) 		Instituição / Organização
2018/10/01 - 2019/02/28 Head of the Promotion Department of the VIII Bioinformatics Open Days (2019/02/20 - 2019/02/22)
Conferência (Membro da Comissão Organizadora)
 Universidade do Minho, Portugal
2016/09/01 - 2017/02/28 Head of the Organizing Committee of the XVIII Jornadas de Biologia Aplicada (2017/02/08 - 2017/02/10)
Conferência (Presidente da Comissão Organizadora)
 Universidade do Minho, Portugal

Participação em evento

Descrição da atividade
Tipo de evento 		Nome do evento
Instituição / Organização
2020/02/19 - 2020/02/21 BOD 2020 - IX Bioinformatics Open Days
Conferência
Universidade do Minho, Portugal
2018/02/14 - 2018/02/16 BOD 2018 - VII Bioinformatics Open Days
Conferência
Universidade do Minho, Portugal
2015/03/27 - 2015/03/31 ENEB 2015 - XVIII Encontro Nacional de Estudantes de Biologia
Conferência
Universidade do Minho, Portugal