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Ana Maria Rodrigues de Sousa Faria de Mendonça graduated in Electrotechnical Engineering from the Faculty of Engineering of the University of Porto (FEUP) in August 1981, and received her PhD and her habilitation in Electrotechnical and Computer Engineering from the same school in February 1994 and January 2023, respectively. She was a Trainee Lecturer at the Department of Electrical and Computers Engineering (DEEC)/FEUP from November 1981 to January 1986 and an Assistant Lecturer until February 1994, having taught theoretical and practical classes in various curricular units. She was an Assistant Professor from 1994, with a permanent appointment from 1999, and became an Associate Professor in January 2009. Since 1994, she has taught theoretical, theoretical-practical and practical classes in various subjects in the Bachelor's Degree in Electrical and Computer Engineering (LEEC), the Bachelor's Degree in Informatics and Computer Engineering (LEIC) and, since 2006, the Integrated Master's Degree in Electrical and Computer Engineering (MIEEC), the Integrated Master's Degree in Informatics and Computer Engineering (MIEIC) and the Integrated Master's Degree in Bioengineering (MIB). She has also taught curricular units and modules in postgraduate courses, namely the Master's in Electrical and Computer Engineering (MEEC) and the Master's in Biomedical Engineering (MEB) and the Doctoral Programs in Electrical and Computer Engineering (PDEEC) and Biomedical Engineering (PRODEB). From 2021 onwards, she taught on the L.BIO, M.BIO and M.EEC study cycles, which resulted from the disintegration of the MIB and MIEEC, respectively. She has published several texts to support her teaching activities, and has supervised projects, internships and dissertations for final-year students. She has also taken part in various academic juries. As part of her teaching activities, she held and continues to hold various positions in the management of study cycles, in particular as Director of MEB , Director of M.BIO and L.BIO (since July 2023) and Director of PRODEB (since July 2023). She has also been actively collaborated in various management bodies at DEEC and FEUP, namely as member of DEEC's Executive Committee for several periods (3 terms) and member of DEEC's Department Council until February 2019, rejoining this body in December 2022. She was an elected member of FEUP's Scientific Council and is currently a member of FEUP's Pedagogical Council. She was Deputy Director of FEUP from October 2014 to October 2022. Since 1986 she has been developing research activities in the areas of Computer Vision, Biomedical Image Processing and Analysis, and Biomedical Engineering. She was a researcher at INEB from its foundation in 1989 until the end of December 2014, but at the beginning of 2015 she joined INESC TEC. She has collaborated on scientific projects, both as a manager and as a researcher, and has supervised doctoral and post-doctoral work, as well as undergraduate and postgraduate research internships. She held various management positions while associated with INEB, and was president of this institute between December 2012 and December 2014. As result of her research activities, she published scientific articles in journals and conference proceedings. She has taken part in several scientific meetings for presenting invited papers, oral presentations and posters. She was a member of the scientific and technical committees of several national and international conferences. She was co-chair of the RecPad2000, IbPRIA 2007 and IbPRIA 2009 conferences, and was involved in the organization of several editions of the ICIAR - International Conference on Image Analysis and Recognition. She was also co-editor of the proceedings of three international conferences (RecPad2000, IbPRIA 2007 and IbPRIA 2009), of a special issue of the journal Pattern Recognition Letters and was guest editor of the journal Computerized Medical Imaging.
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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
ANA MARIA RODRIGUES DE SOUSA FARIA DE MENDONÇA

Nomes de citação

  • Mendonça, Ana
  • Mendonça, Ana Maria

Identificadores de autor

Ciência ID
6D15-48F9-6A2F
ORCID iD
0000-0002-4319-738X
AuthenticusID
R-000-17Q
Google Scholar ID
mYHMDdYAAAAJ
Researcher Id
M-7629-2013
Scopus Author Id
56252793600

Endereços de correio eletrónico

  • amendon@fe.up.pt (Profissional)
  • ana.mendonca@inesctec.pt (Profissional)

Telefones

Telefone
  • 225081859 (Profissional)

Moradas

  • Faculdade de Engenharia da Universidade do Porto. Rua Dr. Roberto Frias, s/n, 4200-465 P, Porto, Porto, Portugal (Profissional)

Websites

Domínios de atuação

  • Ciências da Engenharia e Tecnologias - Engenharia Eletrotécnica, Eletrónica e Informática - Engenharia Eletrotécnica e Eletrónica
  • Ciências da Engenharia e Tecnologias - Engenharia Médica

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Inglês Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1)
Francês Utilizador independente (B1) Utilizador independente (B1) Utilizador independente (B1) Utilizador independente (B1)
Formação
Grau Classificação
2023/01/17
Concluído
 Agregação (Título de Agregado)
Especialização em Engenharia Eletrotécnica e de Computadores
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
1994
Concluído
 Doutoramento em Engenharia Electrotécnica e de Computadores (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
"Métodos de Tratamento Digital de Imagem. Aplicação no Arquivo, Processamento e Análise de Imagens de Oftalmologia" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 Distinção e Louvor
1981
Concluído
 Licenciatura em Engenharia Electrotécnica (Licenciatura)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
 17 valores
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2015 - Atual Investigador (Investigação) Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Tecnologia e Ciência, Portugal
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Tecnologia e Ciência, Portugal
1986/06/26 - 2014/12/31 Investigador (Investigação) Instituto Nacional de Engenharia Biomédica, Portugal

Docência no Ensino Superior

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2009/01/15 - Atual Professor Associado (Docente Universitário) Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
1994 - 2009 Professor Auxiliar (Docente Universitário) Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
1986/02/24 - 1994/01/14 Assistente (Docente Universitário) Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
1981 - 1986 Assistente Estagiário (Docente Universitário) Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal

Cargos e Funções

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2023/07/25 - Atual Director of the Doctoral Program in Biomedical Engineering Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2023/07/25 - Atual Director of the 1st cycle Program in Bioengineering Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2023/07/25 - Atual Director of the Master Program in Bioengineering Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2023/05/31 - Atual Member of the Pedagogical Council Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2022/11/22 - Atual Director of the Master Program in Biomedical Engineering Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2014/10/20 - 2022/10/20 Subdirector de Unidade Orgânica Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2014 - 2019/02 Conselho científico/técnico-científico ou orgão correspondente Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal

Outros

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2006/09/01 - Atual Member of the Scientific Committee of the Doctoral Programme in Biomedical Engineering. Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2009/09/14 - 2014/11/24 Director of the Master in Biomedical Engineering. Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2010/12/01 - 2014/10/20 Deputy Director of DEEC Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2002/03/31 - 2012/12/26 Member of the Board of Directors Instituto Nacional de Engenharia Biomédica, Portugal
2005/09/01 - 2009/09/14 Member of the Scientific Committee of the Master Programme in Biomedical Engineering. Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
Projetos

Projeto

Designação Financiadores
2024/01/01 - Atual AI4LUNGS: AI-BASED PERSONALISED CARE FOR RESPIRATORY DISEASE USING MULTI-MODAL DATA IN PATIENT STRATIFICATION
101080756 — AI4LUNGS
Investigador
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Tecnologia e Ciência, Portugal
Em curso
2023/01/01 - Atual DEEPSCREENAMD - DEEP LEARNING AND EXPLAINABLE ARTIFICIAL INTELLIGENCE IN THE SCREENING OF AGE-RELATED MACULAR DEGENERATION
Proyectos de Transición Ecológica y Transición Digita
Investigador
Em curso
1987 - Atual Co-operative Modular Neural Network for Detection, Classification and Prediction of Ophthalmologic Diseases
AS-5-2-05 CRG97151
Investigador
Concluído
2020/04/01 - 2023/06/30 TAMI - Transparent Artificial Medical Intelligence
Projeto de I&DT em Co-promoção (Parcerias Internacionais - Projeto nº 45905
Investigador
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Tecnologia e Ciência, Portugal
Em curso
2016/04 - 2020/12 SCREEN-DR: Image Analysis and Machine Learning Platform for Innovation in Diabetic Retinopathy Screning
CMUP-ERI/TIC/0028/2014
Investigador
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Tecnologia e Ciência, Portugal
Concluído
2016/07 - 2019/06 ADiMEC - Identification and Characterization of Diabetic Macular Edema by Means of Automatic Analysis of Optical Coherence Tomography Images and Machine Learning Techniques
DPI2015-69948-R
Investigador
Em curso
2016/06 - 2019/05 LNDetector - Automatic Detection, Segmentation and Classification of Pulmonary Nodules System in Computed Tomography Images
PTDC/EEI-SII/6599/2014
PTDC/EEI-SII/6599/2014
Investigador
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Tecnologia e Ciência, Portugal
 N/A
Em curso
2015/06 - 2018/12 NanoSTIMA - Macro-to-Nano Human Sensing: Towards Integrated Multimodal Health Monitoring and Analytic
NORTE-01-0145-FEDER-000016
Investigador
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Tecnologia e Ciência, Portugal
Concluído
2012/01 - 2014/12 Análisis automatico de imágenes de retina y carótida: correlación entre microcirculación retiniana y macrocirculación cerebro-vascular
TIN2011-25476
Concluído
2010/10/01 - 2013/09/30 Relación entre Microcirculación Retiniana e Microcirculación Cerebral"
10/CSA918054PR
Investigador
Concluído
2010/04 - 2013/09 FabryScreen - Screening for Fabry disease based on automatic classification of chromatographic images
Provided by PTCRIS: 100875
Investigador responsável
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Concluído
2007/09 - 2010/12 Integrated Analysis of Stem Cells Function in Plant Growth and Development
Provided by PTCRIS: 82001
Investigador
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Concluído
2001/01 - 2004/12 CombDec - Combining Decisions. Application in Chest Radiograph Image Analysis
35590/90
Investigador
Instituto Nacional de Engenharia Biomédica, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
1996/01 - 1999/12 AQIDO - Análise Quantitativa de Imagem na Avaliação de Doenças Oftalmológicas de Grande Prevalência
PBIC/C/TIT/2457/95
Investigador responsável
Instituto Nacional de Engenharia Biomédica, Portugal
Concluído
1987/01 - 1987 Diagnóstico Automático de Alterações do Fundo do Olho com Aplicação ao Rastreio de Situações Patológicas
900.86.4
Investigador
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
Concluído
Produções

Publicações

Artigo em conferência
  1. Matilde Costa; Sofia C. Pereira; João Pedrosa; Ana Maria Mendonça; Aurélio Campilho. "Deep Feature-Based Automated Chest Radiography Compliance Assessment". 2023.
    10.1109/ENBENG58165.2023.10175341
  2. Ricardo Coimbra Brioso; João Pedrosa; Ana Maria Mendonça; Aurélio Campilho; Brioso, RC; Pedrosa, J; Mendonça, AM; Campilho, A. "Semi-supervised Multi-structure Segmentation in Chest X-Ray Imaging". 2023.
    10.1109/CBMS58004.2023.00325
  3. Pedrosa, J; Sousa, P; Silva, J; Mendonça, AM; Campilho, A; João Pedrosa; Pedro Sousa; et al. "Lesion-Aware Chest Radiography Abnormality Classification with Object Detection Framework". 2023.
    10.1109/cbms58004.2023.00152
  4. Melo, T; Cardoso, J; Carneiro, A; Campilho, A; Mendonça, AM. "OCT Image Synthesis through Deep Generative Models". 2023.
    10.1109/cbms58004.2023.00107
  5. Belo, RM; Rocha, J; Mendonca, AM; Campilho, A. "An Active Learning Approach for Support Device Detection in Chest Radiography Images". 2023.
    10.1117/12.2679310
  6. Joana Rocha; Sofia Cardoso Pereira; Joao Pedrosa; Aurelio Campilho; Ana Maria Mendonca. "Attention-driven Spatial Transformer Network for Abnormality Detection in Chest X-Ray Images". 2022.
    10.1109/CBMS55023.2022.00051
  7. Rocha, J; Pereira, S; Campilho, A; Mendonça, AM. "Segmentation of COVID-19 Lesions in CT Images". 2021.
    10.1109/bhi50953.2021.9508520
  8. Sousa, MQE; Pedrosa, J; Rocha, J; Pereira, SC; Mendonça, AM; Campilho, A. "Chest Radiography Few-Shot Image Synthesis for Automated Pathology Screening Applications". 2021.
    10.1109/bibm52615.2021.9669859
  9. Pedrosa, J; Aresta, G; Ferreira, C; Mendonca, A; Campilho, A. "Automatic Label Detection in Chest Radiography Images". 2021.
    10.5220/0010888100003123
  10. Carvalho, CB; Pedrosa, J; Maia, C; Penas, S; Carneiro, A; Mendonça, L; Mendonça, AM; Campilho, A. "A Multi-dataset Approach for DME Risk Detection in Eye Fundus Images". 2020.
    10.1007/978-3-030-50516-5_25
  11. Rocha, J; Cunha, A; Mendonca, AM. "Segmentation of Pulmonary Nodules in CT Images Using the Sliding Band Filter". 2020.
    10.1007/978-3-030-31635-8_42
  12. Wanderley, DS; Araujo, T; Carvalho, CB; Maia, C; Penas, S; Carneiro, A; Mendonca, AM; Campilho, A. "Analysis of the performance of specialists and an automatic algorithm in retinal image quality assessment". 2019.
    10.1109/enbeng.2019.8692506
  13. Ferreira, CA; Penas, S; Silva, J; Mendonca, AM. "Quantitative Assessment of Central Serous Chorioretinopathy in Angiographic Sequences of Retinal Images". 2019.
    10.1109/enbeng.2019.8692445
  14. Ferreira, CA; Aresta, G; Cunha, A; Mendonca, AM; Campilho, A. "Wide Residual Network for Lung-Rads (TM) Screening Referral". 2019.
    10.1109/enbeng.2019.8692560
  15. Costa, P; Araujo, T; Aresta, G; Galdran, A; Mendonca, AM; Smailagic, A; Campilho, A. "EyeWeS: Weakly Supervised Pre-Trained Convolutional Neural Networks for Diabetic Retinopathy Detection". 2019.
    10.23919/mva.2019.8757991
  16. Meyer, MI; Galdran, A; Costa, P; Mendonça, AM; Campilho, A. "Deep Convolutional Artery/Vein Classification of Retinal Vessels". 2018.
    10.1007/978-3-319-93000-8_71
  17. Galdran, A; Costa, P; Bria, A; Araújo, T; Mendonça, AM; Campilho, A. "A No-Reference Quality Metric for Retinal Vessel Tree Segmentation". 2018.
    10.1007/978-3-030-00928-1_10
  18. Araújo, T; Aresta, G; Galdran, A; Costa, P; Mendonça, AM; Campilho, A. "UOLO - Automatic Object Detection and Segmentation in Biomedical Images". 2018.
    10.1007/978-3-030-00889-5_19
  19. Melo, T; Mendonça, AM; Campilho, A. "Creation of Retinal Mosaics for Diabetic Retinopathy Screening: A Comparative Study". 2018.
    10.1007/978-3-319-93000-8_76
  20. Meyer, MI; Galdran, A; Mendonça, AM; Campilho, A. "A Pixel-Wise Distance Regression Approach for Joint Retinal Optical Disc and Fovea Detection". 2018.
    10.1007/978-3-030-00934-2_5
  21. Galdran, A; Araujo, T; Mendonca, AM; Campilho, A. "Retinal Image Quality Assessment by Mean-Subtracted Contrast-Normalized Coefficients". 2018.
    10.1007/978-3-319-68195-5_92
  22. Moura, Jd; Novo, J; Penas, S; Ortega, M; Silva, JA; Mendonça, AM. "Automatic Characterization of the Serous Retinal Detachment Associated with the Subretinal Fluid Presence in Optical Coherence Tomography Images". 2018.
    10.1016/j.procs.2018.07.258
  23. Faria, SP; Penas, S; Mendonca, L; Silva, JA; Mendonca, AM. "3D Mapping of Choroidal Thickness from OCT B-Scans". 2018.
    10.1007/978-3-319-68195-5_91
  24. Meyer, MariaInes; Costa, Pedro; Galdran, Adrian; Mendonça, AnaMaria; Campilho, Aurelio. "A Deep Neural Network for Vessel Segmentation of Scanning Laser Ophthalmoscopy Images". 2017.
    10.1007/978-3-319-59876-5_56
  25. Remeseiro, B; Mendonca, AM; Campilho, A. "Objective Quality Assessment of Retinal Images Based on Texture Features". 2017.
    10.1109/ijcnn.2017.7966429
  26. Costa, Pedro; Galdran, Adrian; Meyer, MariaInes; Mendonça, AnaMaria; Campilho, Aurelio. "Adversarial Synthesis of Retinal Images from Vessel Trees". 2017.
    10.1007/978-3-319-59876-5_57
  27. Araujo, T; Aresta, G; Almada Lobo, B; Mendonca, AM; Campilho, A. "Improving Convolutional Neural Network Design via Variable Neighborhood Search". 2017.
    10.1007/978-3-319-59876-5_41
  28. Mendonca, AM; Remeseiro, B; Dashtbozorg, B; Campilho, A. "Automatic and semi-automatic approaches for arteriolar-to-venular computation in retinal photographs". 2017.
    10.1117/12.2255096
  29. Araujo, T; Mendonca, AM; Campilho, A. "Estimation of retinal vessel caliber using model fitting and random forests". 2017.
    10.1117/12.2252025
  30. Dashtbozorg, B; Mendonca, AM; Campilho, A. "Assessment of Retinal Vascular Changes Through Arteriolar-to-Venular Ratio Calculation". 2015.
    10.1007/978-3-319-20801-5_36
  31. Novo, J; Goncalves, L; Mendonca, AM; Campilho, A. "3D lung nodule candidate detection in multiple scales". 2015.
    10.1109/MVA.2015.7153133
  32. Dashtbozorg, B.; Mendonca, A.M.; Campilho, A.. "Assessment of vascular changes in retinal images". 2014.
    10.1109/memea.2014.6860023
  33. Dashtbozorg, B.; Mendonca, A.M.; Penas, S.; Campilho, A.. "RetinaCAD, a system for the assessment of retinal vascular changes". 2014.
    10.1109/EMBC.2014.6945076
  34. Dashtbozorg, B.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. "An automatic method for the estimation of Arteriolar-to-Venular Ratio in retinal images". 2013.
    10.1109/CBMS.2013.6627854
  35. Quelhas, P.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. "3D cell nuclei fluorescence quantification using sliding band filter". 2010.
    10.1109/icpr.2010.614
  36. Quelhas, P.; Marcuzzo, M.; Mendonça, A.M.; Oliveira, M.J.; Campilho, A.. "Cancer cell detection and invasion depth estimation in brightfield images". 2009.
    10.5244/C.23.68
  37. Marcuzzo, M.; Quelhas, P.; Campilho, A.; Mendonça, A.M.. "Automatic cell segmentation from confocal microscopy images of the Arabidopsis root". 2008.
    10.1109/ISBI.2008.4541095
  38. Marcuzzo, M.; Quelhas, P.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. "Tracking of Arabidopsis thaliana root cells in time-lapse microscopy". 2008.
    10.1109/ICPR.2008.4761746
  39. Mendonça, A.M.; Da Silva, J.A.; Campilho, A.. "Automatic delimitation of lung fields on chest radiographs". 2004.
  40. Mendonça, A.M.; Alves Da Silva, J.; Campilho, A.. "Detection and validation of lung field contours on chest radiographs". 2003.
  41. Kamel, M.; Belkassim, S.; Mendonça, A.; Campilho, A.. "A neural network approach for the automatic detection of microaneurysms in retinal angiograms". 2001.
    10.1109/ijcnn.2001.938798
  42. Mendonca, A.M.; Campilho, A.J.; Nunes, J.M.. "Automatic segmentation of microaneurysms in retinal angiograms of diabetic patients". 1999.
    10.1109/iciap.1999.797681
  43. MENDONCA, AM; CAMPILHO, A; NUNES, JMR. "A NEW SIMILARITY CRITERION FOR RETINAL IMAGE REGISTRATION". 1994.
    10.1109/ICIP.1994.413799
  44. CAMPILHO, AJC; DEMENDONCA, AMRSF; NUNES, JMR. "IMAGE-ANALYSIS TECHNIQUES FOR AVASCULAR REGION DETECTION IN RETINAL ANGIOGRAPHY". 1992.
  45. MENDONCA, AM; CAMPILHO, AJC. "REVERSIBLE METHODS FOR MEDICAL IMAGE COMPRESSION". 1992.
  46. CAMPILHO, AJC; MENDONCA, AMRSF. "DIGITAL IMAGE-PROCESSING - FUNDAMENTALS AND MICROCOMPUTER APPLICATIONS IN MEDICAL IMAGING". 1992.
  47. DEMENDONCA, AMRSF; CAMPILHO, AJC; RESTIVO, FJO; NUNES, JMR. "IMAGE REGISTRATION OF EYE FUNDUS ANGIOGRAMS". 1990.
Artigo em revista
  1. Sofia Cardoso Pereira; Ana Maria Mendonça; Aurélio Campilho; Pedro Sousa; Carla Teixeira Lopes. "Automated image label extraction from radiology reports — A review". Artificial Intelligence in Medicine (2024): http://dx.doi.org/10.1016/j.artmed.2024.102814.
    10.1016/j.artmed.2024.102814
  2. Joana Rocha; Sofia Cardoso Pereira; Pedrosa, João; CAMPILHO, AURÉLIO; Mendonça, Ana Maria. Autor correspondente: Joana Rocha. "STERN: Attention-driven Spatial Transformer Network for Abnormality Detection in Chest X-Ray Images". Artificial Intelligence in Medicine 147 102737 (2024): https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0933365723002518?pes=vor.
    Publicado
  3. Sofia C. Pereira; Joana Rocha; Aurélio Campilho; Pedro Sousa; Ana Maria Mendonça. "Lightweight multi-scale classification of chest radiographs via size-specific batch normalization". Computer Methods and Programs in Biomedicine (2023): https://doi.org/10.1016/j.cmpb.2023.107558.
    10.1016/j.cmpb.2023.107558
  4. Melo, T; Carneiro, A; Campilho, A; Mendonca, AM. "Retinal layer and fluid segmentation in optical coherence tomography images using a hierarchical framework". JOURNAL OF MEDICAL IMAGING (2023):
    10.1117/1.jmi.10.1.014006
  5. Penas, S; Araujo, T; Mendonca, AM; Faria, S; Silva, J; Campilho, A; Martins, ML; et al. "Retinal and choroidal vasoreactivity in central serous chorioretinopathy". GRAEFES ARCHIVE FOR CLINICAL AND EXPERIMENTAL OPHTHALMOLOGY (2022):
    10.1007/s00417-022-05757-9
  6. Pedrosa, J; Aresta, G; Ferreira, C; Carvalho, C; Silva, J; Sousa, P; Ribeiro, L; Mendonca, AM; Campilho, A. "Assessing clinical applicability of COVID-19 detection in chest radiography with deep learning". SCIENTIFIC REPORTS (2022):
    10.1038/s41598-022-10568-3
  7. Joana Rocha; Ana Maria Mendonça; Aurélio Campilho. "Review on Deep Learning Methods for Chest X-Ray based Abnormality Detection and Thoracic Pathology Classification". U.Porto Journal of Engineering (2021): https://doi.org/10.24840/2183-6493_007.004_0002.
    10.24840/2183-6493_007.004_0002
  8. Tânia Melo; Ana Maria Mendonça; Aurélio Campilho. "Microaneurysm detection in color eye fundus images for diabetic retinopathy screening". Computers in Biology and Medicine 126 (2020): 103995-103995. https://doi.org/10.1016/j.compbiomed.2020.103995.
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  9. Teresa Araújo; Guilherme Aresta; Luís Mendonça; Susana Penas; Carolina Maia; Ângela Carneiro; Ana Maria Mendonça; Aurélio Campilho. "DR|GRADUATE: Uncertainty-aware deep learning-based diabetic retinopathy grading in eye fundus images". Medical Image Analysis 63 (2020): 101715-101715. https://doi.org/10.1016/j.media.2020.101715.
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    10.1109/tmi.2006.879955
Capítulo de livro
  1. Rui Santos; João Pedrosa; Ana Maria Mendonça; Aurélio Campilho. "Automatic Eye-Tracking-Assisted Chest Radiography Pathology Screening". 2023.
    10.1007/978-3-031-36616-1_41
  2. João Pedrosa; Pedro Sousa; Joana Silva; Ana Maria Mendonça; Aurélio Campilho. "Lesion-Based Chest Radiography Image Retrieval for Explainability in Pathology Detection". 81-94. Springer International Publishing, 2022.
    10.1007/978-3-031-04881-4_7
  3. Ana Maria Mendonça; Tânia Melo; Teresa Araújo; Aurélio Campilho. "Optic Disc and Fovea Detection in Color Eye Fundus Images". 2020.
    10.1007/978-3-030-50516-5_29
  4. Ferreira, CA; Cunha, A; Mendonça, AM; Campilho, A. "Convolutional Neural Network Architectures for Texture Classification of Pulmonary Nodules". 2019.
    10.1007/978-3-030-13469-3_91
  5. Mendonça, A; Dashtbozorg, B; Campilho, A. "Segmentation of the Vascular Network of the Retina". 2014.
    10.1201/b16510-6
Livro
  1. Novo, J.; Rouco, J.; Mendonça, A.; Campilho, A.. Reliable lung segmentation methodology by including juxtapleural nodules. 2014.
    10.1007/978-3-319-11755-3_26
  2. Moreira, B.M.; Sousa, A.V.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. Lane background removal for the classification of thin-layer chromatography images. 2013.
    10.1007/978-3-642-39094-4_63
  3. Dashtbozorg, B.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. Automatic classification of retinal vessels using structural and intensity information. 2013.
    10.1007/978-3-642-38628-2_71
  4. Moreira, B.M.; Sousa, A.V.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. Correction of geometrical distortions in bands of chromatography images. 2013.
    10.1007/978-3-642-39094-4_31
  5. Dashtbozorg, B.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. Automatic estimation of the arteriolar-to-venular ratio in retinal images using a graph-based approach for artery/vein classification. 2013.
    10.1007/978-3-642-39094-4_60
  6. Mendonça, A.M.; Cardoso, F.; Sousa, A.V.; Campilho, A.. Automatic localization of the optic disc in retinal images based on the entropy of vascular directions. 2012.
    10.1007/978-3-642-31298-4_50
  7. Moreira, B.M.; Sousa, A.V.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. Automatic lane detection in chromatography images. 2012.
    10.1007/978-3-642-31298-4_22
  8. Quelhas, P.; Nieuwland, J.; Dewitte, W.; Mendonça, A.M.; Murray, J.; Campilho, A.. Arabidopsis thaliana automatic cell file detection and cell length estimation. 2011.
    10.1007/978-3-642-21596-4_1
  9. Sousa, A.V.; Mendonça, A.M.; Sá-Miranda, M.C.; Campilho, A.. Classification-based segmentation of the region of interest in chromatographic images. 2011.
    10.1007/978-3-642-21596-4_8
  10. Quelhas, P.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.; Quelhas, P; Mendonca, AM; Campilho, A. Optical flow based Arabidopsis thaliana root meristem cell division detection. 2010.
    10.1007/978-3-642-13775-4_22
  11. Sousa, A.V.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. Chromatographic pattern recognition using optimized one-class classifiers. 2009.
    10.1007/978-3-642-02172-5_58
  12. Marcuzzo, M.; Quelhas, P.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. Evaluation of symmetry enhanced sliding band filter for plant cell nuclei detection in low contrast noisy fluorescent images. 2009.
    10.1007/978-3-642-02611-9_81
  13. Araújo, H.; Mendonça, A.M.; Pinho, A.J.; Torres, M.I.. Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics): Preface. 2009.
  14. Marcuzzo, M.; Guichard, T.; Quelhas, P.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.; Marcuzzo, M; Guichard, T; et al. Cell division detection on the arabidopsis thaliana root. 2009.
    10.1007/978-3-642-02172-5_23
  15. Marcuzzo, M.; Quelhas, P.; Campilho, A.; Mendonça, A.M.. A hybrid approach for arabidopsis root cell image segmentation. 2008.
    10.1007/978-3-540-69812-8_73
  16. Sousa, A.V.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. Minimizing the imbalance problem in chromatographic profile classification with one-class classifiers. 2008.
    10.1007/978-3-540-69812-8_41
  17. Pereira, C.S.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. Evaluation of contrast enhancement filters for lung nodule detection. 2007.
    10.1007/978-3-540-74260-9_78
  18. Pereira, C.S.; Fernandes, H.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. Detection of lung nodule candidates in chest radiographs. 2007.
    10.1007/978-3-540-72849-8_22
  19. Sousa, A.V.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. The class imbalance problem in TLC image classification. 2006.
    10.1007/11867661_46
  20. Pereira, C.S.; Alexandre, L.A.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. A multiclassifier approach for lung nodule classification. 2006.
    10.1007/11867661_55
  21. Sousa, A.V.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.; Aguiar, R.; Sá Miranda, C.. Feature extraction for classification of thin-layer chromatography images. 2005.
    10.1007/11559573_118
  22. Sousa, A.V.; Aguiar, R.; Mendonca, A.M.; Campilho, A.. Automatic lane and band detection in images of thin layer chromatography. 2004.
    10.1007/978-3-540-30126-4_20
  23. Moreira, R.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. Detection of Rib Borders on X-ray Chest Radiographs. 2004.
    10.1007/978-3-540-30126-4_14
Resumo em conferência
  1. Mendonca, L; Faria, S; Penas, S; Silva, J; Mendonca, AM. "Calculation and mapping of choroidal thickness in OCT images". 2018.

Outros

Outra produção
  1. Data-Driven Color Augmentation Techniques for Deep Skin Image Analysis. 2017. Galdran, Adrian; Gila, AitorAlvarez; Meyer, MariaInes; Saratxaga, CristinaLopez; Araujo, Teresa; Garrote, Estibaliz; Aresta, Guilherme; et al.
  2. Towards Adversarial Retinal Image Synthesis. 2017. Costa, Pedro; Galdran, Adrian; Meyer, MariaInes; Abràmoff, MichaelDavid; Niemeijer, Meindert; Mendonça, AnaMaria; Campilho, Aurelio.
  3. Special issue - Selected papers from the 11th Portuguese Conference on Pattern Recognition - RECPAD2000 - Preface. 2001. Campilho, AC; Mendonca, AM. https://www.authenticus.pt/P-009-3S1.
    10.1016/s0167-8655(01)00069-1
Atividades

Orientação

Título / Tema
Papel desempenhado 		Curso (Tipo)
Instituição / Organização
2024/02 - Atual Characterization of Retinal Fluid in OCT images
Orientador
 Mestrado em Engenharia Biomédica (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2023/10 - Atual Edge Computing Image Processing for Contextual Insights Towards Lighting Applications
Orientador
 Mestrado em Engenharia Eletrotécnica e de Computadores (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2023/09 - Atual Characterization and Assessment of Vessel Tortuosity in Retinal Images
Orientador
 Mestrado em Bioengenharia (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2020/09 - Atual Explainable Artificial Medical Intelligence for Automated Thoracic Pathology Screening
Orientador
 PDEEC (Doutoramento)
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Tecnologia e Ciência, Portugal
2020/09 - Atual Explainable AI-based Decision Support Models for COVID-19 Detection
Orientador
 PRODEB (Doutoramento)
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Tecnologia e Ciência, Portugal
2020/02 - Atual Computer-aided diagnosis and follow-up of prevalent eye diseases using OCT/OCTA images
Orientador
 PDEEC (Doutoramento)
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Tecnologia e Ciência, Portugal
2017 - Atual Lung nodule characterization and follow-up assessment
Orientador
 Programa Doutoral em Engenharia Electrotécnica e de Computadores (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2022/09 - 2023/10 Collaborative and Explainable Automatic Chest Radiography Pathology Detection and Reporting
Coorientador
 Mestrado em Engenharia Biomédica (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2022 - 2023 Guided Chest Radiography Content-Based Image Retrieval
Coorientador
 Mestrado em Engenharia Eletrotécnica e de Computadores (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2022 - 2023 Segmentation and characterization of the vascular network in OCTA images
Orientador
 Mestrado em Bioengenharia (Mestrado)
2021 - 2022 Automatic Eyetracking-Assisted Chest Radiography Pathology Screening
Coorientador
 Mestrado em Bioengenharia (Mestrado)
2021 - 2022 Anatomical Segmentation in Automated Chest Radiography Screening
Coorientador
 Mestrado em Bioengenharia (Mestrado)
2020/10 - 2021/07 Generative Adversarial Networks in Automated Chest Radiography Screening
Coorientador
 Mestrado Integrado em Bioengenharia (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2016/01 - 2021/05 Diabetic Retinopathy Grading in Color Eye Fundus Images
Coorientador
 Programa Doutoral em Engenharia Electrotécnica e de Cumpotadores (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2020 - 2021 Generative Adversarial Networks in Automated Chest Radiography Screening
Coorientador
 Mestrado em Bioengenharia (Mestrado)
2019 - 2019 Automatic segmentation of exudates in colour retinal fundus images
Orientador
2019 - 2019 Segmentation of Pulmonary Nodules in CT images
Orientador
 Mestrado em Bioengenharia (Mestrado)
2015/09 - 2016/10 Detection of Red Lesions Associated with Diabetic Retinopathy
Orientador
 Mestrado Integrado em Bioengenharia (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2015/05 - 2016/08 Retinal image quality assessment
Coorientador
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Tecnologia e Ciência, Portugal
2015/09 - 2016/06 Estimation of choroidal thickness in OCT images
Orientador
 Mestrado Integrado em Bioengenharia (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2015/09 - 2016/06 Estimation of vessel caliber in retinal images
Coorientador
 Mestradi Integrado em Bioengenharia (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2013/01 - 2015/07 3D detection and segmentation of pulmonary nodules in computerized tomography images
Coorientador
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Tecnologia e Ciência, Portugal
2013 - 2015 Advanced Methods for Optical Coherence Tomography Choroidal Image Analysis
Orientador
 Programa Doutoral em Engenharia Electrotécnica e de Computadores (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2011 - 2015 Advanced Image Analysis Methods for the Assessment of Vascular Changes in Retinal Images
Orientador
 Programa Doutoral em Engenharia Electrotécnica e de Computadores (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2011 - 2013 Advanced Image Classification for the Identification of Rare Genetic Disorders
Orientador
 Programa Doutoral em Engenharia Biomédica (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2011/09 - 2012/10 Diagnóstico Assistido por Computador para Rastreio da Doença de Fabry
Orientador
 Mestrado em Engenharia Biomédica (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2011/02 - 2011/07 Detecção Automática de Estruturas Anatómicas em Imagens Digitais da Retina
Orientador
 Mestrado Integrado em Engenharia Electrotécnica e de Computadores (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2009 - 2009 Identificação de regiões nodulares em imagens digitais de radiografia pulmonar
Orientador
 Mestrado Integrado em Engenharia Electrotécnica e de Computadores (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2007/09 - 2008/10 Alinhamento de Imagens da Retina usando a Estrutura Vascular e Transformada de Distância
Orientador
 Mestrado em Engenharia Biomédica (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2008 - 2008 Detecção de núcleos de células em sequências de imagens de microscopia confocal
Orientador
 Mestrado Integrado em Engenharia Electrotécnica e de Computadores (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2007 - 2008 Identificação automática do disco óptico em imagens coloridas da retina
Orientador
 Mestrado em Engenharia Biomédica (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2005 - 2008 Análise e Reconhecimento de Imagem em Cromatografia de Camada Fina
Coorientador
 Programa Doutoral em Engenharia Electrotécnica e de Computadores (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2006 - 2007 Detecção de hiperplasias paratiroideas. Aplicação de técnicas de processamento de imagem em medicina nuclear
Orientador
 Mestrado em Engenharia Biomédica (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2004 - 2005 Detecção da grade costal em imagens de radiografia pulmonar
Orientador
 Mestrado em Engenharia Biomédica (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
1999 - 2000 Análise de Imagem na Caracterização Biomecânica do Movimento dos Membros Inferiores
Orientador
 Mestrado em Engenharia Electrotécnica e de Computadores (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal

Participação em evento

Descrição da atividade
Tipo de evento 		Nome do evento
Instituição / Organização
2017/10 - Atual Medical Image Analysis:Applications in Ophthalmology, - Apresentação convidada no IEEE Women in Engineering Meeting, Porto, Portugal, October, 2017.
Encontro
 IEEE Women in Engineering Meeting
2017/02 - Atual Medical Image Analysis Applications in Ophthalmology - Apresentação convidada , 5th Portuguese Meeting in Bioengineering, Coimbra, Portugal, Fevereiro, 2017.
Conferência
 5th Portuguese Meeting in Bioengineering
2014/12 - Atual Detection and Quantification of Vascular Changes in Retinal Images - Apresentação Convidada nas X Jornadas de Engenharia Biomédica, Universidade do Minho, Dezembro de 2014.
Encontro
 X Jornadas de Engenharia Biomédica, Universidade do Minho, 2014
2007/10 - Atual Análise Automática de Imagens de Radiografia Pulmonar- Apresentação convidada no 2º Seminário de Engenharia Biomédica do IPB_ESTIG, Bragança, October 2007.
Encontro
 2º Seminário de Engenharia Biomédica do IPB_ESTIG, Bragança, Outubro 2007
2007/04 - Atual Análise de Imagem de Radiografia Pulmonar, Apresentação convidada nas 1as Jornadas de Radiologia da ESTSP/IPP, Porto, April 2007.
Encontro
 1as Jornadas de Radiologia da ESTSP/IPP, Porto, April 2007.
2005/11 - Atual Digital Image Processing: An Introduction, Apresentação convidada no 1st Workshop on Advanced Light Microscopy and Flow Cytometry, Porto, November 2005.
Encontro
 1st Workshop on Advanced Light Microscopy and Flow Cytometry, Porto, November 2005
1992 - Atual Aquisição e Arquivo de Imagem em Oftalmologia, Apresentação convidada nas Jornadas de Imagem em Oftalmologia da Clipóvoa, Póvoa de Varzim, 1992.
Encontro
 Jornadas de Imagem em Oftalmologia da Clipóvoa, Póvoa de Varzim, 1992.
1990 - Atual Processamento de Imagem no Estudo da Área Macular, Apresentação convidada nas Reuniões Científicas em Oftalmologia do Hospital S. João - Faculdade de Medicina, Porto, 1990.
Encontro
 Reuniões Científicas em Oftalmologia do Hospital S. João - Faculdade de Medicina, Porto, 1990.

Júri de grau académico

Tema
Tipo de participação 		Nome do candidato (Tipo de grau)
Instituição / Organização
2023/10 Automated Macular Edema Detection and Segmentation in Optical Coherence Tomography using Deep Learning
Arguente principal
 Alex Bolívar Cazañas-Gordón (Doutoramento)
Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal
2023/05 Corirretinopatia Serosa Central – Avaliação da Dinâmica Vascular nos Mecanismos Fisiopatológicos e sua implicação na resposta terapêutica
Vogal
 Susana Costa Nunes Penas (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Medicina, Portugal
2022/07 Computational Analysis of Fundus Images. Rule-Based and Scale-Space Models
Arguente principal
 Ivo Miguel da Fonseca Gravito Soares (Doutoramento)
Universidade da Beira Interior, Portugal
2020/01 Contributions to the segmentation of moving objects in video sequences
Presidente do júri
 Maria Isabel de Castro Lopes Martins Pinto Ferreira (Doutoramento)
Universidade de Vigo - Campus de Pontevedra, Espanha
2019/04 Automatic detection of drusen associated with age-related macular degeneration in optical coherence tomography: a graph-based approach
Arguente principal
 Jorge Miguel Gomes de Oliveira (Doutoramento)
Universidade do Minho, Portugal

Comissão de avaliação

Descrição da atividade
Tipo de assessoria 		Instituição / Organização Entidade financiadora
2023/09 - 2024/02 Participation as member of an External Evaluation Committee (CAE) in the evaluation process of Portuguese Higher Education Institutions
Avaliador
Distinções

Prémio

2019 Fraunhofer Portugal Best Paper Award (6th ENBENG, Lisboa, 2019)
Associação Fraunhofer Portugal Research, Portugal
2019 Best Practical Paper Award - 16th International Conference on Machine Vision Applications (MVA),
2014 Best Oral Paper Award
APRP - Associação Portuguesa de Reconhecimento de Padrões, Portugal
1982 Prémio Engenheiro António de Almeida
Fundação Engenheiro António de Almeida, Portugal

Outra distinção

1998 Best Oral Paper
1º Congresso Ibero-Americano de Engenharia Biomédica, México