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ANA MARIA RODRIGUES DE SOUSA FARIA DE MENDONÇA. Concluiu o(a) Doutoramento em Doutoramento em Engenharia Electrotécnica e de Computadores em 1994 pelo(a) Universidade do Porto Faculdade de Engenharia e Licenciatura em Licenciatura em Engenharia Electrotécnica em 1981 pelo(a) Universidade do Porto Faculdade de Engenharia. É Member of the Scientific Committee of the Doctoral Programme in Biomedical Engineering. no(a) Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Professor Associado no(a) Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Subdirector de Unidade Orgânica no(a) Universidade do Porto Faculdade de Engenharia e Investigador no(a) Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Tecnologia e Ciência. Publicou 16 artigos em revistas especializadas. Possui 2 capítulo(s) de livros e 23 livro(s). Participou em 8 evento(s). Orientou 4 tese(s) de doutoramento e coorientou 2. Orientou 11 dissertação(ões) de mestrado e coorientou 1. Recebeu 3 prémio(s) e/ou homenagens. Participa e/ou participou como Investigador em 6 projeto(s) e Investigador responsável em 1 projeto(s). Atua na(s) área(s) de Ciências da Engenharia e Tecnologias com ênfase em Engenharia Eletrotécnica, Eletrónica e Informática com ênfase em Engenharia Eletrotécnica e Eletrónica e Ciências da Engenharia e Tecnologias com ênfase em Engenharia Médica. Nas suas atividades profissionais interagiu com 122 colaborador(es) em coautorias de trabalhos científicos.
Identification

Personal identification

Full name
ANA MARIA RODRIGUES DE SOUSA FARIA DE MENDONÇA

Citation names

  • Mendonça, Ana

Author identifiers

Ciência ID
6D15-48F9-6A2F
ORCID iD
0000-0002-4319-738X
Researcher Id
M-7629-2013
Scopus Author Id
8404000600

Knowledge fields

  • Engineering and Technology - Electrotechnical Engineering, Electronics and Informatics - Electrical and Electronic Engineering
  • Engineering and Technology - Medical Engineering

Languages

Language Speaking Reading Writing Listening Peer-review
English Advanced (C1) Advanced (C1) Advanced (C1) Advanced (C1)
French Intermediate (B1) Intermediate (B1) Intermediate (B1) Intermediate (B1)
Education
Degree Classification
1994
Concluded
Doutoramento em Engenharia Electrotécnica e de Computadores (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
"Métodos de Tratamento Digital de Imagem. Aplicação no Arquivo, Processamento e Análise de Imagens de Oftalmologia" (THESIS/DISSERTATION)
Distinção e Louvor
1981
Concluded
Licenciatura em Engenharia Electrotécnica (Licenciatura)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
17 valores
Affiliation

Science

2015 - Current Researcher (Research)
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Tecnologia e Ciência, Portugal
1986/06/26 - 2014/12/31 Researcher (Research)
Instituto Nacional de Engenharia Biomédica, Portugal

Teaching in Higher Education

2009/01/15 - Current Associate Professor (University Teacher)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
1994 - 2009 Assistant Professor (University Teacher)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
1986/02/24 - 1994/01/14 Assistant (University Teacher)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
1981 - 1986 Trainee Assistant (University Teacher)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal

Positions / Appointments

2014/10/20 - Current Organic Unit Sub-director
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2014 - 2019/02 Conselho científico/técnico-científico ou orgão correspondente
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal

Others

2006/09/01 - Current Member of the Scientific Committee of the Doctoral Programme in Biomedical Engineering.
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2009/09/14 - 2014/11/24 Director of the Master in Biomedical Engineering.
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2010/12/01 - 2014/10/20 Deputy Director of DEEC
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2002/03/31 - 2012/12/26 Member of the Board of Directors
Instituto Nacional de Engenharia Biomédica, Portugal
2005/09/01 - 2009/09/14 Member of the Scientific Committee of the Master Programme in Biomedical Engineering.
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
Projects

Contract

Designation Funders
2016 - Current SCREEN-DR: Image Analysis and Machine Learning Platform for Innovation in Diabetic Retinopathy Screning
CMUP-ERI/TIC/0028/2014
Researcher
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Tecnologia e Ciência, Portugal
1987 - Current Co-operative Modular Neural Network for Detection, Classification and Prediction of Ophthalmologic Diseases
AS-5-2-05 CRG97151
Researcher
2016 - 2019/06 ADiMEC - Identification and Characterization of Diabetic Macular Edema by Means of Automatic Analysis of Optical Coherence Tomography Images and Machine Learning Techniques
DPI2015-69948-R
Researcher
2016 - 2019/05 LNDetector - Automatic Detection, Segmentation and Classification of Pulmonary Nodules System in Computed Tomography Images
PTDC/EEI-SII/6599/2014
Researcher
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Tecnologia e Ciência, Portugal
2016 - 2019/05 LNDetector - Automatic Detection, Segmentation and Classification of Pulmonary Nodules System in Computed Tomography Images
PTDC/EEI-SII/6599/2014
N/A
2015 - 2018/12 NanoSTIMA - Macro-to-Nano Human Sensing: Towards Integrated Multimodal Health Monitoring and Analytic
NORTE-01-0145-FEDER-000016
Researcher
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Tecnologia e Ciência, Portugal
2012 - 2014/12 Análisis automatico de imágenes de retina y carótida: correlación entre microcirculación retiniana y macrocirculación cerebro-vascular
TIN2011-25476
2010 - 2013/09/30 Relación entre Microcirculación Retiniana e Microcirculación Cerebral"
10/CSA918054PR
Researcher
2010 - 2013/09 FabryScreen - Screening for Fabry disease based on automatic classification of chromatographic images
Provided by PTCRIS: 100875
Principal investigator
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
2007 - 2010/12 Integrated Analysis of Stem Cells Function in Plant Growth and Development
Provided by PTCRIS: 82001
Researcher
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
2001 - 2004/12 CombDec - Combining Decisions. Application in Chest Radiograph Image Analysis
35590/90
Researcher
Instituto Nacional de Engenharia Biomédica, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
1996 - 1999/12 AQIDO - Análise Quantitativa de Imagem na Avaliação de Doenças Oftalmológicas de Grande Prevalência
PBIC/C/TIT/2457/95
Principal investigator
Instituto Nacional de Engenharia Biomédica, Portugal
1987 - 1987 Diagnóstico Automático de Alterações do Fundo do Olho com Aplicação ao Rastreio de Situações Patológicas
900.86.4
Researcher
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
Outputs

Publications

Book
  1. Novo, J.; Rouco, J.; Mendonça, A.; Campilho, A.. Reliable lung segmentation methodology by including juxtapleural nodules. 2014.
    10.1007/978-3-319-11755-3_26
  2. Moreira, B.M.; Sousa, A.V.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. Lane background removal for the classification of thin-layer chromatography images. 2013.
    10.1007/978-3-642-39094-4_63
  3. Dashtbozorg, B.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. Automatic classification of retinal vessels using structural and intensity information. 2013.
    10.1007/978-3-642-38628-2_71
  4. Moreira, B.M.; Sousa, A.V.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. Correction of geometrical distortions in bands of chromatography images. 2013.
    10.1007/978-3-642-39094-4_31
  5. Dashtbozorg, B.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. Automatic estimation of the arteriolar-to-venular ratio in retinal images using a graph-based approach for artery/vein classification. 2013.
    10.1007/978-3-642-39094-4_60
  6. Mendonça, A.M.; Cardoso, F.; Sousa, A.V.; Campilho, A.. Automatic localization of the optic disc in retinal images based on the entropy of vascular directions. 2012.
    10.1007/978-3-642-31298-4_50
  7. Moreira, B.M.; Sousa, A.V.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. Automatic lane detection in chromatography images. 2012.
    10.1007/978-3-642-31298-4_22
  8. Quelhas, P.; Nieuwland, J.; Dewitte, W.; Mendonça, A.M.; Murray, J.; Campilho, A.. Arabidopsis thaliana automatic cell file detection and cell length estimation. 2011.
    10.1007/978-3-642-21596-4_1
  9. Sousa, A.V.; Mendonça, A.M.; Sá-Miranda, M.C.; Campilho, A.. Classification-based segmentation of the region of interest in chromatographic images. 2011.
    10.1007/978-3-642-21596-4_8
  10. Quelhas, P.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. Optical flow based Arabidopsis thaliana root meristem cell division detection. 2010.
    10.1007/978-3-642-13775-4_22
  11. Sousa, A.V.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. Chromatographic pattern recognition using optimized one-class classifiers. 2009.
    10.1007/978-3-642-02172-5_58
  12. Marcuzzo, M.; Quelhas, P.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. Evaluation of symmetry enhanced sliding band filter for plant cell nuclei detection in low contrast noisy fluorescent images. 2009.
    10.1007/978-3-642-02611-9_81
  13. Araújo, H.; Mendonça, A.M.; Pinho, A.J.; Torres, M.I.. Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics): Preface. 2009.
  14. Marcuzzo, M.; Guichard, T.; Quelhas, P.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. Cell division detection on the arabidopsis thaliana root. 2009.
    10.1007/978-3-642-02172-5_23
  15. Marcuzzo, M.; Quelhas, P.; Campilho, A.; Mendonça, A.M.. A hybrid approach for arabidopsis root cell image segmentation. 2008.
    10.1007/978-3-540-69812-8_73
  16. Sousa, A.V.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. Minimizing the imbalance problem in chromatographic profile classification with one-class classifiers. 2008.
    10.1007/978-3-540-69812-8_41
  17. Pereira, C.S.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. Evaluation of contrast enhancement filters for lung nodule detection. 2007.
    10.1007/978-3-540-74260-9_78
  18. Pereira, C.S.; Fernandes, H.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. Detection of lung nodule candidates in chest radiographs. 2007.
    10.1007/978-3-540-72849-8_22
  19. Sousa, A.V.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. The class imbalance problem in TLC image classification. 2006.
    10.1007/11867661_46
  20. Pereira, C.S.; Alexandre, L.A.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. A multiclassifier approach for lung nodule classification. 2006.
    10.1007/11867661_55
  21. Sousa, A.V.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.; Aguiar, R.; Sá Miranda, C.. Feature extraction for classification of thin-layer chromatography images. 2005.
    10.1007/11559573_118
  22. Sousa, A.V.; Aguiar, R.; Mendonca, A.M.; Campilho, A.. Automatic lane and band detection in images of thin layer chromatography. 2004.
    10.1007/978-3-540-30126-4_20
  23. Moreira, R.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. Detection of Rib Borders on X-ray Chest Radiographs. 2004.
    10.1007/978-3-540-30126-4_14
Book chapter
  1. Ferreira, CA; Cunha, A; Mendonça, AM; Campilho, A. "Convolutional Neural Network Architectures for Texture Classification of Pulmonary Nodules". 2019.
    10.1007/978-3-030-13469-3_91
  2. Mendonça, A; Dashtbozorg, B; Campilho, A. "Segmentation of the Vascular Network of the Retina". 2014.
    10.1201/b16510-6
Conference abstract
  1. Mendonca, L; Faria, S; Penas, S; Silva, J; Mendonca, AM. "Calculation and mapping of choroidal thickness in OCT images". 2018.
Conference paper
  1. Wanderley, DS; Araujo, T; Carvalho, CB; Maia, C; Penas, S; Carneiro, A; Mendonca, AM; Campilho, A. "Analysis of the performance of specialists and an automatic algorithm in retinal image quality assessment". 2019.
    10.1109/enbeng.2019.8692506
  2. Ferreira, CA; Penas, S; Silva, J; Mendonca, AM. "Quantitative Assessment of Central Serous Chorioretinopathy in Angiographic Sequences of Retinal Images". 2019.
    10.1109/enbeng.2019.8692445
  3. Ferreira, CA; Aresta, G; Cunha, A; Mendonca, AM; Campilho, A. "Wide Residual Network for Lung-Rads (TM) Screening Referral". 2019.
    10.1109/enbeng.2019.8692560
  4. Costa, P; Araujo, T; Aresta, G; Galdran, A; Mendonca, AM; Smailagic, A; Campilho, A. "EyeWeS: Weakly Supervised Pre-Trained Convolutional Neural Networks for Diabetic Retinopathy Detection". 2019.
    10.23919/mva.2019.8757991
  5. Meyer, MI; Galdran, A; Costa, P; Mendonça, AM; Campilho, A. "Deep Convolutional Artery/Vein Classification of Retinal Vessels". 2018.
    10.1007/978-3-319-93000-8_71
  6. Galdran, A; Costa, P; Bria, A; Araújo, T; Mendonça, AM; Campilho, A. "A No-Reference Quality Metric for Retinal Vessel Tree Segmentation". 2018.
    10.1007/978-3-030-00928-1_10
  7. Araújo, T; Aresta, G; Galdran, A; Costa, P; Mendonça, AM; Campilho, A. "UOLO - Automatic Object Detection and Segmentation in Biomedical Images". 2018.
    10.1007/978-3-030-00889-5_19
  8. Melo, T; Mendonça, AM; Campilho, A. "Creation of Retinal Mosaics for Diabetic Retinopathy Screening: A Comparative Study". 2018.
    10.1007/978-3-319-93000-8_76
  9. Meyer, MI; Galdran, A; Mendonça, AM; Campilho, A. "A Pixel-Wise Distance Regression Approach for Joint Retinal Optical Disc and Fovea Detection". 2018.
    10.1007/978-3-030-00934-2_5
  10. Galdran, A; Araujo, T; Mendonca, AM; Campilho, A. "Retinal Image Quality Assessment by Mean-Subtracted Contrast-Normalized Coefficients". 2018.
    10.1007/978-3-319-68195-5_92
  11. Moura, Jd; Novo, J; Penas, S; Ortega, M; Silva, JA; Mendonça, AM. "Automatic Characterization of the Serous Retinal Detachment Associated with the Subretinal Fluid Presence in Optical Coherence Tomography Images". 2018.
    10.1016/j.procs.2018.07.258
  12. Faria, SP; Penas, S; Mendonca, L; Silva, JA; Mendonca, AM. "3D Mapping of Choroidal Thickness from OCT B-Scans". 2018.
    10.1007/978-3-319-68195-5_91
  13. Meyer, MariaInes; Costa, Pedro; Galdran, Adrian; Mendonça, AnaMaria; Campilho, Aurelio. "A Deep Neural Network for Vessel Segmentation of Scanning Laser Ophthalmoscopy Images". 2017.
    10.1007/978-3-319-59876-5_56
  14. Remeseiro, B; Mendonca, AM; Campilho, A. "Objective Quality Assessment of Retinal Images Based on Texture Features". 2017.
  15. Costa, Pedro; Galdran, Adrian; Meyer, MariaInes; Mendonça, AnaMaria; Campilho, Aurelio. "Adversarial Synthesis of Retinal Images from Vessel Trees". 2017.
    10.1007/978-3-319-59876-5_57
  16. Araujo, T; Aresta, G; Almada Lobo, B; Mendonca, AM; Campilho, A. "Improving Convolutional Neural Network Design via Variable Neighborhood Search". 2017.
    10.1007/978-3-319-59876-5_41
  17. Mendonca, AM; Remeseiro, B; Dashtbozorg, B; Campilho, A. "Automatic and semi-automatic approaches for arteriolar-to-venular computation in retinal photographs". 2017.
    10.1117/12.2255096
  18. Araujo, T; Mendonca, AM; Campilho, A. "Estimation of retinal vessel caliber using model fitting and random forests". 2017.
    10.1117/12.2252025
  19. Dashtbozorg, B; Mendonca, AM; Campilho, A. "Assessment of Retinal Vascular Changes Through Arteriolar-to-Venular Ratio Calculation". 2015.
    10.1007/978-3-319-20801-5_36
  20. Novo, J; Goncalves, L; Mendonca, AM; Campilho, A. "3D lung nodule candidate detection in multiple scales". 2015.
    10.1109/MVA.2015.7153133
  21. Dashtbozorg, B.; Mendonca, A.M.; Campilho, A.. "Assessment of vascular changes in retinal images". 2014.
    10.1109/memea.2014.6860023
  22. Dashtbozorg, B.; Mendonca, A.M.; Penas, S.; Campilho, A.. "RetinaCAD, a system for the assessment of retinal vascular changes". 2014.
    10.1109/EMBC.2014.6945076
  23. Dashtbozorg, B.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. "An automatic method for the estimation of Arteriolar-to-Venular Ratio in retinal images". 2013.
    10.1109/CBMS.2013.6627854
  24. Quelhas, P; Mendonca, AM; Campilho, A. "Optical Flow Based Arabidopsis Thaliana Root Meristem Cell Division Detection". 2010.
  25. Quelhas, P.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. "3D cell nuclei fluorescence quantification using sliding band filter". 2010.
    10.1109/icpr.2010.614
  26. Quelhas, P.; Marcuzzo, M.; Mendonça, A.M.; Oliveira, M.J.; Campilho, A.. "Cancer cell detection and invasion depth estimation in brightfield images". 2009.
    10.5244/C.23.68
  27. Marcuzzo, M; Guichard, T; Quelhas, P; Mendonca, AM; Campilho, A. "Cell Division Detection on the Arabidopsis Thaliana Root". 2009.
  28. Marcuzzo, M.; Quelhas, P.; Campilho, A.; Mendonça, A.M.. "Automatic cell segmentation from confocal microscopy images of the Arabidopsis root". 2008.
    10.1109/ISBI.2008.4541095
  29. Marcuzzo, M.; Quelhas, P.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. "Tracking of Arabidopsis thaliana root cells in time-lapse microscopy". 2008.
    10.1109/ICPR.2008.4761746
  30. Mendonça, A.M.; Da Silva, J.A.; Campilho, A.. "Automatic delimitation of lung fields on chest radiographs". 2004.
  31. Mendonça, A.M.; Alves Da Silva, J.; Campilho, A.. "Detection and validation of lung field contours on chest radiographs". 2003.
  32. Kamel, M.; Belkassim, S.; Mendonça, A.; Campilho, A.. "A neural network approach for the automatic detection of microaneurysms in retinal angiograms". 2001.
    10.1109/ijcnn.2001.938798
  33. Mendonca, A.M.; Campilho, A.J.; Nunes, J.M.. "Automatic segmentation of microaneurysms in retinal angiograms of diabetic patients". 1999.
    10.1109/iciap.1999.797681
  34. MENDONCA, AM; CAMPILHO, A; NUNES, JMR. "A NEW SIMILARITY CRITERION FOR RETINAL IMAGE REGISTRATION". 1994.
    10.1109/ICIP.1994.413799
  35. CAMPILHO, AJC; DEMENDONCA, AMRSF; NUNES, JMR. "IMAGE-ANALYSIS TECHNIQUES FOR AVASCULAR REGION DETECTION IN RETINAL ANGIOGRAPHY". 1992.
  36. MENDONCA, AM; CAMPILHO, AJC. "REVERSIBLE METHODS FOR MEDICAL IMAGE COMPRESSION". 1992.
  37. CAMPILHO, AJC; MENDONCA, AMRSF. "DIGITAL IMAGE-PROCESSING - FUNDAMENTALS AND MICROCOMPUTER APPLICATIONS IN MEDICAL IMAGING". 1992.
  38. DEMENDONCA, AMRSF; CAMPILHO, AJC; RESTIVO, FJO; NUNES, JMR. "IMAGE REGISTRATION OF EYE FUNDUS ANGIOGRAMS". 1990.
Journal article
  1. Porwal, P; Pachade, S; Kokare, M; Deshmukh, G; Son, J; Bae, W; Liu, LH; et al. "IDRiD: Diabetic Retinopathy - Segmentation and Grading Challenge". MEDICAL IMAGE ANALYSIS (2020):
    10.1016/j.media.2019.101561
  2. Shakibapour, E; Cunha, A; Aresta, G; Mendonca, AM; Campilho, A. "An unsupervised metaheuristic search approach for segmentation and volume measurement of pulmonary nodules in lung CT scans". EXPERT SYSTEMS WITH APPLICATIONS (2019):
    10.1016/j.eswa.2018.11.010
  3. Pedro Costa; Adrian Galdran; Maria Ines Meyer; Meindert Niemeijer; Michael Abramoff; Ana Maria Mendonca; Aurelio Campilho; et al. "End-to-End Adversarial Retinal Image Synthesis". IEEE Transactions on Medical Imaging 37 3 (2018): 781-791. https://doi.org/10.1109/TMI.2017.2759102.
    10.1109/TMI.2017.2759102
  4. Araujo, T; Mendonca, AM; Campilho, A. "Parametric model fitting-based approach for retinal blood vessel caliber estimation in eye fundus images". PLOS ONE (2018):
    10.1371/journal.pone.0194702
  5. Dashtbozorg, B.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. "Optic disc segmentation using the sliding band filter". Computers in Biology and Medicine 56 (2015): 1-12. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84920088206&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.compbiomed.2014.10.009
  6. Mendonça, Ana. "An automatic graph-based approach for artery/Vein classification in retinal images". IEEE Transactions on Image Processing (2014):
    10.1109/tip.2013.2263809
  7. Moreira, Bruno; Sousa, Antonio; Mendonca, Ana Maria; Campilho, Aurelio. "Automatic lane segmentation in TLC images using the continuous wavelet transform.". Computational and mathematical methods in medicine 2013 (2013): 218415-218415.
    10.1155/2013/218415
  8. Mendonca, AM; Sousa, A; Mendonca, L; Campilho, A. "Automatic localization of the optic disc by combining vascular and intensity information". COMPUTERIZED MEDICAL IMAGING AND GRAPHICS (2013): https://www.authenticus.pt/P-006-K2N.
    10.1016/j.compmedimag.2013.04.004
  9. Pinho, S.S.; Figueiredo, J.; Cabral, J.; Carvalho, S.; Dourado, J.; Magalhães, A.; Gärtner, F.; et al. "E-cadherin and adherens-junctions stability in gastric carcinoma: Functional implications of glycosyltransferases involving N-glycan branching biosynthesis, N-acetylglucosaminyltransferases III and v". Biochimica et Biophysica Acta - General Subjects 1830 3 (2013): 2690-2700. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84873589547&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.bbagen.2012.10.021
  10. Esteves, T.; Quelhas, P.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. "Gradient convergence filters and a phase congruency approach for in vivo cell nuclei detection". Machine Vision and Applications 23 4 (2012): 623-638. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84865374061&partnerID=MN8TOARS.
    10.1007/s00138-012-0407-7
  11. Mendonca, Ana M.; Sousa, Antonio V.; Sa-Miranda, M. Clara; Campilho, Aurelio C.; Dawant, BM; Haynor, DR. "Automatic segmentation of chromatographic images for region of interest delineation". Medical Imaging 2011: Image Processing 7962 (2011):
    10.1117/12.877671
  12. Quelhas, P.; Marcuzzo, M.; Mendonça, A.M.; Campilho, A.. "Cell nuclei and cytoplasm joint segmentation using the sliding band filter". IEEE Transactions on Medical Imaging 29 8 (2010): 1463-1473. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-77955339493&partnerID=MN8TOARS.
    10.1109/TMI.2010.2048253
  13. Amaral, Isabel F.; Unger, Ronald E.; Fuchs, Sabine; Mendonca, Ana M.; Sousa, Susana R.; Barbosa, Mario A.; Pego, Ana P.; Kirkpatrick, C. J.. "Fibronectin-mediated endothelialisation of chitosan porous matrices". Biomaterials 30 29 (2009): 5465-5475.
    10.1016/j.biomaterials.2009.06.056
  14. Marcuzzo, Monica; Quelhas, Pedro; Campilho, Ana; Mendonca, Ana Maria; Campilho, Aurelio. "Automated Arabidopsis plant root cell segmentation based on SVM classification and region merging". Computers in Biology and Medicine 39 9 (2009): 785-793.
    10.1016/j.compbiomed.2009.06.008
  15. Sousa, Antonio V.; Mendonca, Ana Maria; Campilho, Aurelio. "Chromatographic pattern classification". Ieee Transactions on Biomedical Engineering 55 6 (2008): 1687-1696.
    10.1109/tbme.2008.919852
  16. Sousa, Antonio V.; Mendonca, Ana Maria; Campilho, Aurelio. "Dissimilarity-based classification of chromatographic profiles". Pattern Analysis and Applications 11 3-4 (2008): 409-423.
    10.1007/s10044-008-0113-2
  17. Mendonça, A.M.; Campilho, A.. "Segmentation of retinal blood vessels by combining the detection of centerlines and morphological reconstruction". IEEE Transactions on Medical Imaging 25 9 (2006): 1200-1213. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-33748118111&partnerID=MN8TOARS.
    10.1109/tmi.2006.879955

Other

Other output
  1. Galdran, Adrian; Gila, AitorAlvarez; Meyer, MariaInes; Saratxaga, CristinaLopez; Araujo, Teresa; Garrote, Estibaliz; Aresta, Guilherme; et al. 2017. Data-Driven Color Augmentation Techniques for Deep Skin Image Analysis.
  2. Costa, Pedro; Galdran, Adrian; Meyer, MariaInes; Abràmoff, MichaelDavid; Niemeijer, Meindert; Mendonça, AnaMaria; Campilho, Aurelio. 2017. Towards Adversarial Retinal Image Synthesis.
  3. Campilho, AC; Mendonca, AM. 2001. Special issue - Selected papers from the 11th Portuguese Conference on Pattern Recognition - RECPAD2000 - Preface. https://www.authenticus.pt/P-009-3S1.
    10.1016/s0167-8655(01)00069-1
Activities

Supervision

Thesis Title
Role
Degree Subject (Type)
Institution / Organization
2017 - Current Lung nodule characterization and follow-up assessment
Supervisor
Programa Doutoral em Engenharia Electrotécnica e de Computadores (PhD)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2016/01 - Current Diabetic Retinopathy Grading in Color Eye Fundus Images
Co-supervisor
Programa Doutoral em Engenharia Electrotécnica e de Cumpotadores (PhD)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2015/09 - 2016/10 Detection of Red Lesions Associated with Diabetic Retinopathy
Supervisor
Mestrado Integrado em Bioengenharia (Master)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2015/05 - 2016/08 Retinal image quality assessment
Co-supervisor
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Tecnologia e Ciência, Portugal
2015/09 - 2016/06 Estimation of choroidal thickness in OCT images
Supervisor
Mestrado Integrado em Bioengenharia (Master)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2015/09 - 2016/06 Estimation of vessel caliber in retinal images
Co-supervisor
Mestradi Integrado em Bioengenharia (Master)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2013/01 - 2015/07 3D detection and segmentation of pulmonary nodules in computerized tomography images
Co-supervisor
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Tecnologia e Ciência, Portugal
2013 - 2015 Advanced Methods for Optical Coherence Tomography Choroidal Image Analysis
Supervisor
Programa Doutoral em Engenharia Electrotécnica e de Computadores (PhD)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2011 - 2015 Advanced Image Analysis Methods for the Assessment of Vascular Changes in Retinal Images
Supervisor
Programa Doutoral em Engenharia Electrotécnica e de Computadores (PhD)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2011 - 2013 Advanced Image Classification for the Identification of Rare Genetic Disorders
Supervisor
Programa Doutoral em Engenharia Biomédica (PhD)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2011/09 - 2012/10 Diagnóstico Assistido por Computador para Rastreio da Doença de Fabry
Supervisor
Mestrado em Engenharia Biomédica (Master)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2011/02 - 2011/07 Detecção Automática de Estruturas Anatómicas em Imagens Digitais da Retina
Supervisor
Mestrado Integrado em Engenharia Electrotécnica e de Computadores (Master)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2009 - 2009 Identificação de regiões nodulares em imagens digitais de radiografia pulmonar
Supervisor
Mestrado Integrado em Engenharia Electrotécnica e de Computadores (Master)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2007/09 - 2008/10 Alinhamento de Imagens da Retina usando a Estrutura Vascular e Transformada de Distância
Supervisor
Mestrado em Engenharia Biomédica (Master)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2008 - 2008 Detecção de núcleos de células em sequências de imagens de microscopia confocal
Supervisor
Mestrado Integrado em Engenharia Electrotécnica e de Computadores (Master)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2007 - 2008 Identificação automática do disco óptico em imagens coloridas da retina
Supervisor
Mestrado em Engenharia Biomédica (Master)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2005 - 2008 Análise e Reconhecimento de Imagem em Cromatografia de Camada Fina
Co-supervisor
Programa Doutoral em Engenharia Electrotécnica e de Computadores (PhD)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2006 - 2007 Detecção de hiperplasias paratiroideas. Aplicação de técnicas de processamento de imagem em medicina nuclear
Supervisor
Mestrado em Engenharia Biomédica (Master)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2004 - 2005 Detecção da grade costal em imagens de radiografia pulmonar
Supervisor
Mestrado em Engenharia Biomédica (Master)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
1999 - 2000 Análise de Imagem na Caracterização Biomecânica do Movimento dos Membros Inferiores
Supervisor
Mestrado em Engenharia Electrotécnica e de Computadores (Master)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal

Event participation

Activity description
Type of event
Event name
Institution / Organization
2017/10 - Current Medical Image Analysis:Applications in Ophthalmology, - Apresentação convidada no IEEE Women in Engineering Meeting, Porto, Portugal, October, 2017.
Meeting
IEEE Women in Engineering Meeting
2017/02 - Current Medical Image Analysis Applications in Ophthalmology - Apresentação convidada , 5th Portuguese Meeting in Bioengineering, Coimbra, Portugal, Fevereiro, 2017.
Conference
5th Portuguese Meeting in Bioengineering
2014/12 - Current Detection and Quantification of Vascular Changes in Retinal Images - Apresentação Convidada nas X Jornadas de Engenharia Biomédica, Universidade do Minho, Dezembro de 2014.
Meeting
X Jornadas de Engenharia Biomédica, Universidade do Minho, 2014
2007/10 - Current Análise Automática de Imagens de Radiografia Pulmonar- Apresentação convidada no 2º Seminário de Engenharia Biomédica do IPB_ESTIG, Bragança, October 2007.
Meeting
2º Seminário de Engenharia Biomédica do IPB_ESTIG, Bragança, Outubro 2007
2007/04 - Current Análise de Imagem de Radiografia Pulmonar, Apresentação convidada nas 1as Jornadas de Radiologia da ESTSP/IPP, Porto, April 2007.
Meeting
1as Jornadas de Radiologia da ESTSP/IPP, Porto, April 2007.
2005/11 - Current Digital Image Processing: An Introduction, Apresentação convidada no 1st Workshop on Advanced Light Microscopy and Flow Cytometry, Porto, November 2005.
Meeting
1st Workshop on Advanced Light Microscopy and Flow Cytometry, Porto, November 2005
1992 - Current Aquisição e Arquivo de Imagem em Oftalmologia, Apresentação convidada nas Jornadas de Imagem em Oftalmologia da Clipóvoa, Póvoa de Varzim, 1992.
Meeting
Jornadas de Imagem em Oftalmologia da Clipóvoa, Póvoa de Varzim, 1992.
1990 - Current Processamento de Imagem no Estudo da Área Macular, Apresentação convidada nas Reuniões Científicas em Oftalmologia do Hospital S. João - Faculdade de Medicina, Porto, 1990.
Meeting
Reuniões Científicas em Oftalmologia do Hospital S. João - Faculdade de Medicina, Porto, 1990.
Distinctions

Award

2019 Fraunhofer Portugal Best Paper Award (6th ENBENG, Lisboa, 2019)
Associação Fraunhofer Portugal Research, Portugal
2014 Best Oral Paper Award
APRP - Associação Portuguesa de Reconhecimento de Padrões, Portugal
1982 Prémio Engenheiro António de Almeida
Fundação Engenheiro António de Almeida, Portugal

Other distinction

1998 Best Oral Paper
1º Congresso Ibero-Americano de Engenharia Biomédica, Mexico