???global.info.a_carregar???
Fábio André da Costa Lopes. Completed the Mestrado integrado in Engenharia Biomédica in 2019/07/16 by Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia. Attends the Doutoramento in Engenharia Informática by Universidade de Coimbra Departamento de Engenharia Informática since 2019/10/07. Published 12 articles in journals. Organized 1 event(s). Participated in 1 event(s). Has received 6 awards and/or honors. Participates and/or participated as Research Fellow in 1 project(s). Works in the area(s) of Engineering and Technology with emphasis on Medical Engineering. In his curriculum Ciência Vitae the most frequent terms in the context of scientific, technological and artistic-cultural output are: Bioinformática; Aprendizagem Computacional; Processamento de Linguagem Natural; Aprendizagem Profunda; Base de Dados; Processamento de Sinal; Robótica; Arduino; Automação; .
Ler resumo completo ↓
Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Fábio André da Costa Lopes

Nomes de citação

  • Lopes, Fábio

Identificadores de autor

Ciência ID
4D12-0E78-61AB
ORCID iD
0000-0003-2919-5959

Endereços de correio eletrónico

  • fadcl@dei.uc.pt (Profissional)
  • fabioacl96@gmail.com (Pessoal)

Moradas

  • Rua Central, 57B, 5000-102, Bustelo, Vila Real, Portugal (Pessoal)

Websites

  • www.linkedin.com/in/fábio-lopes-2493771b0 (Rede social)

Domínios de atuação

  • Ciências da Engenharia e Tecnologias - Engenharia Médica

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Português (Idioma materno)
Inglês Utilizador independente (B2) Utilizador proficiente (C1) Utilizador independente (B2) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1)
Alemão Utilizador independente (B2) Utilizador independente (B2) Utilizador independente (B2) Utilizador independente (B2) Utilizador independente (B2)
Formação
Grau Classificação
2019/10/07 - 2023/11/30
Em curso
 Engenharia Informática (Doutoramento)
Especialização em Ciência de Dados
Universidade de Coimbra Departamento de Engenharia Informática, Portugal
"Towards Adaptive Seizure Prediction using Automatic Electroencephalogram Denoising and Deep Learning Approaches" (TESE/DISSERTAÇÃO)
2020/02/13 - 2020/06/22
Concluído
 Curso de Formação de Língua e Cultura Alemãs VI (Outros)
Universidade de Coimbra Centro de Estudos de Linguística Geral e Aplicada, Portugal
 15
2019/08/30 - 2020/01/16
Concluído
 Curso de Formação de Língua e Cultura Alemãs V (Outros)
Universidade de Coimbra Centro de Estudos de Linguística Geral e Aplicada, Portugal
 15
2014/09/25 - 2019/07/16
Concluído
 Engenharia Biomédica (Mestrado integrado)
Especialização em Informática Clínica e Bioinformática
Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal
"Contributions to Clinical Information Extraction in Portuguese: Corpora, Named Entity Recognition, Word Embeddings" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 18
2019/01/28 - 2019/06/12
Concluído
 Curso de Formação de Língua e Cultura Alemãs IV (Outros)
Universidade de Coimbra Centro de Estudos de Linguística Geral e Aplicada, Portugal
 16
2018/08/30 - 2019/01/17
Concluído
 Curso de Formação de Língua e Cultura Alemãs III (Outros)
Universidade de Coimbra Centro de Estudos de Linguística Geral e Aplicada, Portugal
 15
2018 - 2018/07
Concluído
 Cambridge English Level 1 Certificate in ESOL International (First) (Outros)
Cambridge English Language Assessment Portugal, Portugal
 C
2016 - 2018
Concluído
 Curso de Inglês Geral (Outros)
Wall Street English, Portugal
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2021/10/01 - 2023/09/30 Investigador visitante (Investigação) Universitätsklinikum Freiburg Neurozentrum, Alemanha
2019/10/01 - 2023/09/30 Investigador (Investigação) Universidade de Coimbra Centro de Informatica e Sistemas, Portugal
Universidade de Coimbra Centro de Informatica e Sistemas, Portugal
Projetos

Projeto

Designação Financiadores
2021/01 - 2023/12 Towards Realistic Epileptic Seizure Prediction: dealing with long-term concept drifts and data-labeling uncertainty RECoD
Provided by PTCRIS: PTDC/EEI-EEE/5788/2020
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2019/10/01 - 2020/09/30 WELMO: Wearable Electronics for Effective Lung Monitoring
H2020-825572
Bolseiro de Investigação
Universidade de Coimbra Centro de Informatica e Sistemas, Portugal
Em curso
Produções

Publicações

Artigo em conferência
  1. Lopes, Fábio; Teixeira, César; Gonçalo Oliveira, Hugo. "Named Entity Recognition in Portuguese Neurology Text Using CRF". Trabalho apresentado em 19th EPIA Conference on Artificial Intelligence, Vila Real, 2019.
    Publicado • 10.1007/978-3-030-30241-2_29
  2. Lopes, Fábio; Teixeira, César; Gonçalo Oliveira, Hugo. "Contributions to Clinical Named Entity Recognition in Portuguese". Trabalho apresentado em 18th BioNLP Workshop and Shared Task, Florença, 2019.
    Publicado • 10.18653/v1/w19-5024
Artigo em revista
  1. Pinto, Mauro F.; Batista, Joana; Leal, Adriana; Lopes, Fábio; Oliveira, Ana; Dourado, António; Abuhaiba, Sulaiman I.; et al. "The goal of explaining black boxes in EEG seizure prediction is not to explain models' decisions". Epilepsia Open 8 2 (2023): 285-297. http://dx.doi.org/10.1002/epi4.12748.
    10.1002/epi4.12748
  2. Lopes, Fábio; Leal, Adriana; Pinto, Mauro F.; Dourado, António; Schulze-Bonhage, Andreas; Dümpelmann, Matthias; Teixeira, César. "Removing artefacts and periodically retraining improve performance of neural network-based seizure prediction models". Scientific Reports 13 1 (2023): http://dx.doi.org/10.1038/s41598-023-30864-w.
    10.1038/s41598-023-30864-w
  3. Leal, Adriana; Curty, Juliana; Lopes, Fábio; Pinto, Mauro F.; Oliveira, Ana; Sales, Francisco; Bianchi, Anna M.; et al. "Unsupervised EEG preictal interval identification in patients with drug-resistant epilepsy". Scientific Reports 13 1 (2023): http://dx.doi.org/10.1038/s41598-022-23902-6.
    10.1038/s41598-022-23902-6
  4. Lopes, Fábio; Leal, Adriana; Medeiros, Júlio; Pinto, Mauro F.; Dourado, António; Dümpelmann, Matthias; Teixeira, César. "EPIC: Annotated epileptic EEG independent components for artifact reduction". Scientific Data 9 1 (2022): http://dx.doi.org/10.1038/s41597-022-01524-x.
    10.1038/s41597-022-01524-x
  5. Pinto, Mauro. F.; Leal, Adriana; Lopes, Fábio; Pais, José; Dourado, António; Sales, Francisco; Martins, Pedro; Teixeira, César A.. "On the clinical acceptance of black-box systems for EEG seizure prediction". Epilepsia Open 7 2 (2022): 247-259. http://dx.doi.org/10.1002/epi4.12597.
    10.1002/epi4.12597
  6. Pinto, Mauro; Coelho, Tiago; Leal, Adriana; Lopes, Fábio; Dourado, António; Martins, Pedro; Teixeira, César. "Interpretable EEG seizure prediction using a multiobjective evolutionary algorithm". Scientific Reports 12 1 (2022): http://dx.doi.org/10.1038/s41598-022-08322-w.
    10.1038/s41598-022-08322-w
  7. Lopes, Fabio; Leal, Adriana; Medeiros, Julio; Pinto, Mauro F.; Dourado, Antonio; Dumpelmann, Matthias; Teixeira, Cesar. "Ensemble Deep Neural Network for Automatic Classification of EEG Independent Components". IEEE Transactions on Neural Systems and Rehabilitation Engineering 30 (2022): 559-568. http://dx.doi.org/10.1109/tnsre.2022.3154891.
    10.1109/tnsre.2022.3154891
  8. Leal, Adriana; Pinto, Mauro F.; Lopes, Fábio; Bianchi, Anna M.; Henriques, Jorge; Ruano, Maria G.; de Carvalho, Paulo; Dourado, António; Teixeira, César A.. "Heart rate variability analysis for the identification of the preictal interval in patients with drug-resistant epilepsy". Scientific Reports 11 1 (2021): http://dx.doi.org/10.1038/s41598-021-85350-y.
    10.1038/s41598-021-85350-y
  9. Pinto, Mauro. F.; Leal, Adriana; Lopes, Fábio; Dourado, António; Martins, Pedro; Teixeira, César A.. "A personalized and evolutionary algorithm for interpretable EEG epilepsy seizure prediction". Scientific Reports 11 1 (2021): http://dx.doi.org/10.1038/s41598-021-82828-7.
    10.1038/s41598-021-82828-7
  10. Lopes, Fabio; Leal, Adriana; Medeiros, Julio; Pinto, Mauro F.; Dourado, Antonio; Dumpelmann, Matthias; Teixeira, Cesar. "Automatic Electroencephalogram Artifact Removal Using Deep Convolutional Neural Networks". IEEE Access 9 (2021): 149955-149970. http://dx.doi.org/10.1109/access.2021.3125728.
    10.1109/access.2021.3125728
  11. Lopes, Fábio; Teixeira, César; Gonçalo Oliveira, Hugo. "Comparing Different Methods for Named Entity Recognition in Portuguese Neurology Text". Journal of Medical Systems 44 4 (2020): http://dx.doi.org/10.1007/s10916-020-1542-8.
    10.1007/s10916-020-1542-8
  12. Lopes, Fábio; Agnelo, João; Teixeira, César A.; Laranjeiro, Nuno; Bernardino, Jorge. "Automating orthogonal defect classification using machine learning algorithms". Future Generation Computer Systems 102 (2020): 932-947. http://dx.doi.org/10.1016/j.future.2019.09.009.
    Publicado • 10.1016/j.future.2019.09.009
Poster em conferência
  1. Lopes, Fábio; Leal, Adriana; Pinto, Mauro; Dourado, António; Schulze-Bonhage, Andreas; Dümpelmann, Matthias; Cesar A. Teixeira. "Transfer learning on seizure prediction: Does information from several patients improve patient-specific approaches?". Trabalho apresentado em 4th International Congress on Mobile Health and Digital Technology in Epilepsy (MHDTE2023), 2023.
  2. Lopes, Fábio; Leal, Adriana; Pinto, Mauro; Dourado, António; Schulze-Bonhage, Andreas; Dümpelmann, Matthias; Cesar A. Teixeira. "Evaluating the Influence of Retraining Seizure Prediction Models over Time". Trabalho apresentado em International Conference for Technology and Analysis of Seizures (ICTALS2022), 2022.
  3. Lopes, Fábio; Leal, Adriana; Pinto, Mauro; Dourado, António; Dümpelmann, Matthias; Cesar A. Teixeira. "Long-term EEG Artifact Removal in Real-time". Trabalho apresentado em 33º Encontro Nacional de Epileptologia (ENE) – CONGRESSO VIRTUAL DA Liga Portuguesa Contra a Epilepsia (LPCE), 2021.
Atividades

Organização de evento

Nome do evento
Tipo de evento (Tipo de participação) 		Instituição / Organização
2019/09/26 - 2019/09/28 Volunteer at the MEDICON 2019, 15th Mediterranean Conference on Medical and Biological Engineering and Computing. (2019/09/26 - 2019/09/28)
Conferência (Outra)
 Universidade de Coimbra, Portugal

Participação em evento

Descrição da atividade
Tipo de evento 		Nome do evento
Instituição / Organização
2018/04/19 - 2018/04/20 World Health Summit Regional Meeting 2018 was a meeting where the health of low and middle-income countries was discussed. Moreover, new biomedical engineer approaches were presented.
Congresso
 World Health Summit Regional Meeting 2018
Universidade de Coimbra, Portugal

Hospitais da Universidade de Coimbra, Portugal
Distinções

Prémio

2020 Honorable Mention MSc Dissertation in PROPOR 2020
2020 3% Best Students Award in the academic year 2018/2019
Universidade de Coimbra, Portugal
2019 3% Best Students Award in the academic year 2017/2018
Universidade de Coimbra, Portugal
2019 Honorable Mention MSc Dissertation in RECPAD 2019
2018 3% Best Students Award in the academic year 2016/2017
Universidade de Coimbra, Portugal
2018 Third Place in BotOlympics
Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal