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Rui João de Sousa Loureiro. Junior Researcher at Coimbra Chemistry Center - Institute of Molecular Sciences, University of Coimbra. Completed the PhD in Systems Biology by the University of Lisbon in 2019, the MSc in Molecular Biomedicine in 2012 by the University of Aveiro and the BSc in Biomedical Sciences in 2010 by the University of Aveiro. Recipient of 5 prizes or distinctions.
Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Rui João de Sousa Loureiro

Nomes de citação

  • Loureiro, Rui João
  • Rui J Loureiro
  • JS Loureiro R
  • Loureiro RJS
  • Loureiro Rui JS

Identificadores de autor

Ciência ID
0311-5F5F-DE7F
ORCID iD
0000-0002-1957-1853

Endereços de correio eletrónico

  • ruijoaoloureiro@gmail.com (Profissional)

Websites

Domínios de atuação

  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia
  • Ciências Exatas - Ciências da Computação e da Informação - Bioinformática
  • Ciências Médicas e da Saúde - Ciências da Saúde

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Inglês Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1)
Espanhol; Castelhano Utilizador independente (B1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador elementar (A1) Utilizador independente (B1)
Francês Utilizador elementar (A1) Utilizador independente (B1) Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1)
Formação
Grau Classificação
2015/01/01 - 2019/11/26
Concluído
 Biologia (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
"Disclosing the aggregation mechanism of ß2-microglobulin in amyloid disease " (TESE/DISSERTAÇÃO)
 Approved with distinction
2010/09/02 - 2012/07/17
Concluído
 Mestrado em Biomedicina Molecular (Mestrado)
Universidade de Aveiro, Portugal
"Perfis de Resistência Microbiana no Hospital Infante D. Pedro" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 17/20
2007/09/19 - 2010/06/28
Concluído
 Ciências Biomédicas (Licenciatura)
Universidade de Aveiro, Portugal
"n/a" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 15/20
Percurso profissional

Outros

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2020/09/30 - Atual Junior Researcher at Centro de Química de Coimbra - Institute of Molecular Sciences, University of Coimbra Universidade de Coimbra Centro de Química de Coimbra, Portugal
Universidade de Coimbra, Portugal
2015/01/01 - 2019/11/26 PhD student Universidade de Lisboa Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas, Portugal
Universidade de Lisboa Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas, Portugal
2018/04/02 - 2018/06/29 Visiting PhD student Harvard University Department of Chemistry and Chemical Biology, Estados Unidos
Harvard University Department of Chemistry and Chemical Biology, Estados Unidos
2013/09/03 - 2014/03/26 Research trainee in the Molecular Neurogenetics Group of the Instituto de Neurociencias de Alicante Instituto de Neurociencias, Espanha
Instituto de Neurociencias, Espanha
2012/09/03 - 2013/07/05 Research trainee in the Clinical Research Lab of the Centre for Cell Biology of the University of Aveiro. Universidade de Aveiro, Portugal
2010/09/02 - 2012/07/17 MSc student Universidade de Aveiro, Portugal
Projetos

Projeto

Designação Financiadores
2020/09/30 - Atual Leads4FLU - Novel antivirals against Influenza: NS1 target validation and lead discovery
POCI-01-145-FEDER-032572
Investigador
Universidade de Coimbra Centro de Química de Coimbra, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2015/01/01 - 2019/11/26 Biosystems & Integrative Sciences Institute
info:eu-repo/grantAgreement/FCT/5876/147256/PT
Bolseiro de Doutoramento
Universidade de Lisboa Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2018/11 - 2019/11 The Physical Basis of Disease: The case of dialysis related amyloidosis
PTDC/FIS-OUT/28210/2017
Bolseiro de Doutoramento
Universidade de Lisboa Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2013/09 - 2014/03 Patterns of MNB/DYRK1A substrate recognition
2013-1-PT1-LEO02-15658
Investigador
European Commission
Concluído
2011/09 - 2013/07 An educational intervention to improve the use of antibiotics in Portuguese Health Professionals: cluster-randomized trial.
PTDC/SAU-ESA/105530/2008
Investigador
Universidade de Aveiro, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
Produções

Publicações

Artigo em revista
  1. Nuno F B Oliveira; Filipe E P Rodrigues; João N M Vitorino; Rui João Loureiro; PFN Faisca; Miguel Machuqueiro. "Predicting stable binding modes from simulated dimers of the D76N mutant of ß2-microglobulin". Computational and Structural Biotechnology Journal (2021): https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2001037021003883.
    10.1016/j.csbj.2021.09.003
  2. Loureiro RJS, Faísca PFN, The early phase of ß2-microglobulin aggregation: Perspectives from Molecular Simulations,. "The Early Phase of ß2-Microglobulin Aggregation: Perspectives From Molecular Simulations.". Frontiers in molecular biosciences 7 (2020): https://europepmc.org/articles/PMC7550760.
    Publicado • 10.3389/fmolb.2020.578433
  3. Loureiro, Rui João. "The Early Phase of ß2m Aggregation: An Integrative Computational Study Framed on the D76N Mutant and the ¿N6 Variant". Biomolecules (2019): http://dx.doi.org/10.3390/biom9080366.
    10.3390/biom9080366
  4. Loureiro, Rui J. S.; Vila-Viçosa, Diogo; Machuqueiro, Miguel; Shakhnovich, Eugene I.; Faísca, Patricia F. N.. "A tale of two tails: The importance of unstructured termini in the aggregation pathway of ß2-microglobulin". Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics 85 11 (2017): 2045-2057. http://dx.doi.org/10.1002/prot.25358.
    Publicado • 10.1002/prot.25358
  5. Loureiro, Rui João; Roque, Fátima; Teixeira Rodrigues, António; Herdeiro, Maria Teresa; Ramalheira, Elmano. "O uso de antibióticos e as resistências bacterianas: breves notas sobre a sua evolução". Revista Portuguesa de Saúde Pública 34 1 (2016): 77-84. http://dx.doi.org/10.1016/j.rpsp.2015.11.003.
    Publicado • 10.1016/j.rpsp.2015.11.003
Poster em conferência
  1. Daniela Amado; Otávio A. Chaves; Rui Loureiro; Zaida L. Almeida; Catarina S. H. Jesus; Carlos Serpa; Rui M. M. Brito. "(One) microsecond dynamics and volume expansion in a single turn of B-hairpin peptide chignolin upon ultra-fast pH-jump". Trabalho apresentado em Biophysics Festival - 2nd Meeting of Young Biophysicists, 2022.
  2. Otávio Augusto Chaves; Andreia F.C. Tuna; Rui Loureiro; Zaida L. Almeida; João Pina; Rui M. M. Brito; Carlos Serpa. "Biophysical characterization of the interaction between human serum albumin and two commercial azo food dyes". Trabalho apresentado em Biophysics Festival - 2nd Meeting of Young Biophysicists, 2022.
  3. Rui João Loureiro; Andreia Cunha; Nícia Rosário-Ferreira; Rui M. M. Brito. "Non-structural protein 1 (NS1) as a drug target for seasonal and pandemic Influenza". Trabalho apresentado em Biophysics Festival - 2nd Meeting of Young Biophysicists, 2022.
  4. Rui João Loureiro; Andreia Cunha; Rui M. M. Brito. "Non-structural protein 1 (NS1) interaction with TRIM25 as a target for influenza antiviral therapy". Trabalho apresentado em EJIBCE 2021, 2021.
  5. Rui João Loureiro; Andreia Cunha; Rui M. M. Brito. "Non-structural protein 1 (NS1) interaction with PI3K as a target for influenza antiviral therapy". Trabalho apresentado em EMBO Workshop on Advances and Challenges in Biomolecular Simulations, 2021.
  6. Rui J. Loureiro, Diogo Vila-Viçosa, Miguel Machuqueiro, Eugene I. Shakhnovich, Patrícia F.N. Faísca. "The early phase of the ß2m aggregation mechanism: an integrative computational analysis based on the D76N mutant and ¿N6 variant". Trabalho apresentado em EJIBCE 2019, 2019.
  7. Rui J. Loureiro, Diogo Vila-Viçosa, Miguel Machuqueiro, Eugene I. Shakhnovich, Patrícia F.N. Faísca. "The dimerization phase of the ß2m aggregation mechanism: An integrative computational analysis based on the D76N mutant and ¿N6 variant.". Trabalho apresentado em Workshop on Integrative Approaches to Protein Folding & Aggregation, 2019.
  8. Loureiro, Rui João; Vila-Viçosa, Diogo; Machuqueiro, Miguel; Shakhnovich, Eugene; Faísca, Patrícia. "The importance of unstructured termini in the aggregation cascade of beta-2-microglobulin: insights from molecular simulations of D76N mutant". Trabalho apresentado em EJIBCE 2018, 2018.
    10.3390/mol2net-04-06085
  9. Rui J. Loureiro, Diogo Vila-Viçosa, Miguel Machuqueiro, Eugene I. Shakhnovich, Patrícia F.N. Faísca. "The importance of unstructured termini in the aggregation cascade of beta-2-microglobulin: Insights from molecular simulations of D76N mutant". Trabalho apresentado em Biomolecules and Nanostructures 6, 2017.
  10. Rui J. Loureiro, Diogo Vila-Viçosa, Miguel Machuqueiro, Patrícia F.N. Faísca. "Novel insights into beta-2-microglobulin amyloidogenesis from molecular simulations: the importance of unstructured termini in the aggregation cascade". Trabalho apresentado em Protein misfolding in disease - Toxic aggregation-prone proteins in aging and age-related diseases: from structure to pathology and spreading, 2016.
  11. Rui J. Loureiro, Diogo Vila-Viçosa, Miguel Machuqueiro, Patrícia F.N. Faísca. "The importance of unstructured termini in the aggregation cascade of beta-2-microglobulin: insights from molecular simulations of D76N mutant". Trabalho apresentado em EMBO Practical Course on Integrative modelling of biomolecular interactions, 2016.
  12. Rui J. Loureiro, Patrícia F.N. Faísca. "Molecular events triggering the aggregation cascade in ß2-microglobulin amyloidosis". Trabalho apresentado em EJIBCE 2015, 2015.
Tese / Dissertação
  1. Loureiro, Rui. "Disclosing the aggregation mechanism of ß2-microglobulin in amyloid disease". Doutoramento, Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, 2019.
  2. Loureiro, Rui. "Perfis de resistência microbiana no Hospital Infante D. Pedro". Mestrado, Universidade de Aveiro, 2012.
Atividades

Apresentação oral de trabalho

Título da apresentação Nome do evento
Anfitrião (Local do evento)
2020/02/17 The early phase of the ß2m aggregation mechanism: an integrative computational analysis framed on the D76N mutant and ¿N6 variant 1st BioSIM Cycle of Conferences
BioSIM (Porto, Portugal)
2018/07/06 The importance of unstructured termini in the aggregation cascade of beta-2-microglobulin: Insights from molecular simulations of D76N mutant Biophysics Party
ITQB (Oeiras, Portugal)
2016/07/04 "The importance of unstructured termini in the aggregation cascade of beta-2-microglobulin: insights from molecular simulations of D76N mutant." flash poster presentation EMBO Practical Course on Integrative modelling of biomolecular interactions
EMBO (Barcelona, Espanha)

Organização de evento

Nome do evento
Tipo de evento (Tipo de participação) 		Instituição / Organização
2017/10/06 - 2017/10/07 Member of the Organizing Committee of the 2017 BioSys Retreat, an annual meeting of the BioSys PhD programme students. (2017/10/06 - 2017/10/07)
Encontro (Membro da Comissão Organizadora)
 Universidade de Lisboa Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas, Portugal

Participação em evento

Descrição da atividade
Tipo de evento 		Nome do evento
Instituição / Organização
2022/06/03 - 2022/06/03 Biophysics Festival - 2nd Meeting of Young Biophysicists, Universidade de Aveiro, Aveiro, Portugal
Encontro
 Biophysics Festival - 2nd Meeting of Young Biophysicists
2021/12/20 - 2021/12/20 Encontro de Jovens Investigadores de Biologia Computacional Estrutural 2021 (EJIBCE 2021), Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade de Coimbra, Coimbra, Portugal
Encontro
 Encontro de Jovens Investigadores de Biologia Computacional Estrutural 2021 (EJIBCE 2021)
2021/12/15 - 2021/12/15 Coimbra Chemistry Center Day 2021, Auditório da Reitoria da Universidade de Coimbra, Coimbra, Portugal
Encontro
 Coimbra Chemistry Center Day 2021
2021/11/02 - 2021/11/04 ELIXIR 3D-Bioinfo Community in Structural Bioinformatics
Encontro
 ELIXIR 3D-Bioinfo Community in Structural Bioinformatics
2021/10/18 - 2021/10/21 EMBO Workshop on Advances and Challenges in Biomolecular Simulations, Virtual Event
Oficina (workshop)
 EMBO Workshop on Advances and Challenges in Biomolecular Simulations
2021/09/13 - 2021/09/17 Vienna Summer School on Drug Design 2021, Virtual Event
Oficina (workshop)
 Vienna Summer School on Drug Design 2021
2021/06/14 - 2021/06/16 7th International Iberian Biophysics Congress, Universidade de Coimbra, Coimbra, Portugal
Conferência
 7th International Iberian Biophysics Congress
2019/12/20 - 2019/12/20 EJIBCE 2019
Encontro
 EJIBCE 2019
2019/06/11 - 2019/06/12 Workshop on Integrative Approaches to Protein Folding & Aggregation
Conferência
2018/12/21 - 2018/12/21 EJIBCE 2018
Encontro
2017/07/03 - 2017/07/05 Participation in the BioISI research centre stand exhibition in Ciência 2017 outreach event.
Encontro
 Ciência 2017
2017/05/10 - 2017/05/14 Biomolecules and Nanostructures 6 Conference
Conferência
2017/02/09 - 2017/02/09 Chemistry and Biochemistry Postgraduate Students Meeting
Encontro
2016/12/21 - 2016/12/21 EJIBCE 2016
Encontro
2016/09/12 - 2016/09/16 "Protein misfolding in disease - Toxic aggregation-prone proteins in aging and age-related diseases: from structure to pathology and spreading" Jacques Monod Conference
Conferência
2016/07/23 - 2016/07/24 2016 BioSys Retreat
Encontro
2015/12/18 - 2015/12/18 EJIBCE 2015
Encontro
2015/12/11 - 2015/12/11 1st BioISI Annual Meeting
Encontro
2015/09/02 - 2015/09/11 2015 Summer School in Computational Biology
Outro

Outro júri / avaliação

Descrição da atividade Instituição / Organização
2022/09/08 - 2022/09/08 Membership of the evaluation jury of a bachelor traineeship project as examiner. Universidade de Coimbra, Portugal

Revisão ad hoc de artigos em revista

Nome da revista (ISSN) Editora
2020/12/01 - 2021/01/26 Scientific Reports (2045-2322) Springer Nature
2020/12/01 - 2021/01/05 BMC Bioinformatics (1471-2105) Springer Nature
Distinções

Outra distinção

2021 Fee waiver for the 2021 EMBO Worksop on Advances and Challenges in Biomolecular Simulations
European Molecular Biology Laboratory, Alemanha
2016 Travel Grant for the 2016 EMBO Practical Course on Integrated modelling of biomolecular interactions.
EMBO Press, Alemanha
2015 PhD fellowship
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
2013 Leonardo da Vinci program fellowship for a professional internship in the Instituto de Neurociências de Alicante
2007 Presence in the excellence board of the José Loureiro Botas High School, distinction awarded to the best students of the school