Identification
Personal identification
- Full name
- Ricardo Bruno da Costa Oliveira
Citation names
- Oliveira, Ricardo
Author identifiers
- Ciência ID
- 441A-683A-40E8
- ORCID iD
- 0000-0001-9175-4278
Email addresses
- ricardo.oliveira@iniav.pt (Professional)
Knowledge fields
- Agrarian Sciences - Agrarian and Food Biotechnology - Diagnostics
- Engineering and Technology - Other Engineering and Technologies - Food and Beverages
- Natural sciences - Biological Sciences - Microbiology
- Natural sciences - Biological Sciences - Biochemical Research Methods
- Medical and Health Sciences - Medical Biotechnology - Health-Related Biotechnology
Languages
Language | Speaking | Reading | Writing | Listening | Peer-review |
---|---|---|---|---|---|
Portuguese (Mother tongue) | |||||
English | Advanced (C1) | Advanced (C1) | Advanced (C1) | Advanced (C1) |
Education
Degree | Classification | |
---|---|---|
2018/10 - 2023/10
Concluded
|
Chemical and Biological Engineering (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
"Application of nucleic acid mimics (NAM) in the selection of aptamers against staphylococcal enterotoxins" (THESIS/DISSERTATION)
|
Approved unanimously |
2023/05/08 - 2023/06/12
Concluded
|
Transferable skills for engineering: basic teaching skills (Pós-Graduação)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
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18 |
2016 - 2017
Concluded
|
Biotechnology (Mestrado)
Universidade do Minho, Portugal
"Design and validation of an alternative molecular method using peptide nucleic acid fluorescence in situ hybridization (PNA
FISH) for the detection of Campylobacter spp. in food samples" (THESIS/DISSERTATION)
|
19 |
2012/10 - 2015/10
Concluded
|
Biochemistry (Licenciatura)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
Universidade do Porto Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar, Portugal "Identification of multi-drug resistant Mycobacterium tuberculosis by padlock probes and lateral flow nucleic acid biosensors" (THESIS/DISSERTATION)
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17 (ECTS Grading scale: Class A - Top Student) |
Affiliation
Science
Category Host institution |
Employer | |
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2023/12 - Current | Postdoc (Research) | Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, I. P. , Portugal |
Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, I. P. , Portugal | ||
2018/10 - 2023/10 | Research Trainee (Research) | Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, I. P. , Portugal |
Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, I. P. , Portugal (...) |
||
2023/02 - 2023/05 | Contracted Researcher (Research) | Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal |
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal | ||
2018/10 - 2023/02 | Research Trainee (Research) | Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal |
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal | ||
2019/05 - 2019/07 | Visiting Researcher (Research) | Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal |
University of Maryland at College Park Cell Biology and Molecular Genetics, United States | ||
2018/02 - 2018/09 | Contracted Researcher (Research) | Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal |
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal | ||
2016/09 - 2017/11 | Research Trainee (Research) | Biomode SA, Portugal |
International Iberian Nanotechnology Laboratory, Portugal | ||
2015/02 - 2015/07 | Research Trainee (Research) | Stockholms Universitet, Sweden |
Science for Life Laboratory (SciLifeLab), Sweden | ||
2013/11 - 2014/06 | Research Trainee (Research) | REQUIMTE LAQV Porto, Portugal |
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal |
Projects
Contract
Designation | Funders | |
---|---|---|
2022/01/01 - Current | APTAcoli: NAM-aptamers for blocking enterotoxins in pig colibacillosis
PTDC/CVT-CVT/4620/2021
Post-doc Fellow
International Iberian Nanotechnology Laboratory, Portugal
Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro, Portugal |
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Ongoing
|
2018/10 - 2023/07 | NAM4toxins - De novo selection of toxin-specific aptamers using nucleic acid mimics
POCI-01-0145-FEDER- 028659
PhD Student Fellow
Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal |
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
|
2023/02/01 - 2023/05/31 | FLUDS - Desenvolvimento de sistemas baseados em espectroscopia de fluorescência para deteção microbiana
NORTE-01-0247-FEDER-046970
Research Fellow
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
|
2018/10 - 2022/10 | Locked nucleic acid (LNA) aptamers for the detection of Staphylococcal Enterotoxins
SFRH/BD/138883/2018
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
|
2018/02 - 2018/09 | Coded-FISH: Development of a novel colour-coded RING FISH method: an innovative tool for the detection of antibiotic resistant
clinical pathogens
PTDC/DTP-PIC/4562/2014
Master Student Fellow
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal |
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
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Other
Designation | Funders | |
---|---|---|
2023/09 - Current | BeSafeBeeHoney - BEekeeping products valorization and biomonitoring for the SAFEty of BEEs and HONEY
CA22105
Researcher
Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal
|
European Cooperation in Science and Technology
Ongoing
|
2022/09 - Current | EURESTOP - European Network for diagnosis and treatment of antibiotic-resistant bacterial infections
CA21145
Researcher
Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal
|
European Cooperation in Science and Technology
Ongoing
|
2022/05 - Current | BETTER - Biosecurity Enhanced Through Training Evaluation and Raising Awareness
CA20103
Researcher
Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal
|
European Cooperation in Science and Technology
Ongoing
|
2022/01 - 2023/06 | NAMShield - Controlo de Salmonella spp, na indústria pecuária, através de aptâmeros nanoensapsulados
POCI-01-0247-FEDER-069756
Researcher
Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
|
2020/05 - 2020/12 | NAM4Covid19 - Nucleic acid mimic lateral flow assay (NAM-LFA) for the detection of Covid19
19128_596771122
Researcher
Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, Portugal |
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
|
Outputs
Publications
Book chapter |
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Conference abstract |
|
Conference paper |
|
Conference poster |
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Journal article |
|
Magazine article |
|
Thesis / Dissertation |
|
Artistic / Performance
Visual artwork |
|
Activities
Oral presentation
Presentation title | Event name Host (Event location) |
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2024/10/23 | Action Tank "Food Security" | BIN@PORTO 2024 ‘Innovation for Resilience"
Faculty of Engineering, University of Porto (Porto, Portugal)
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2022/11/08 | Selection of DNA aptamers for the detection of foodborne toxins | 36th EFFoST International Conference 2022
European Federation of Food Science and Technology (Dublin, Ireland)
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2022/10/18 | Prevalência e diversidade de Staphylococcus aureus e enterotoxinas estafilocócicas em leite cru na região norte de Portugal | Microbiologia 2022
Sociedade Portuguesa de Microbiologia (Portugal)
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2022/01/20 | Staphylococcal enterotoxins and mycotoxins in raw milk: a combined risk? | SciMonday
National Institute for Agricultural and Veterinary Research (INIAV) (Vairão, Portugal)
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2021/11/25 | Surveillance study of Staphylococcus aureus in raw milk from Northern Portugal: Enterotoxins and resistance genetic profiles. | Microbiotec'21
NOVA University of Lisbon (Lisboa, Portugal)
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2021/06/28 | In silico prediction of three-dimensional structure and docking of aptamers containing nucleic acid mimics (NAMs) | 4th Doctoral Congress in Engineering
Faculty of Engineering, University of Porto (Porto, Portugal)
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2020/06/26 | NAM4Covid19 – What if you could know the test results in less than 1 hour? | LEPABE talks
Faculty of Engineering, University of Porto (Porto, Portugal)
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2019/12 | Application of nucleic acid mimics in the selection of aptamers against staphylococcal enterotoxins | Microbiotec'19 - Congress of Microbiology and Biotechnology 2019
Faculdade de Ciências da Universidade de Coimbra (Coimbra, Portugal)
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Supervision
Thesis Title Role |
Degree Subject (Type) Institution / Organization |
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2024/09/09 - 2024/09/27 | Characterisation of Staphylococcus sp. isolates from animals in the INIAV collection using culturomics methods.
Supervisor
|
Ciências Biomédicas Laboratoriais (Scientific initiation)
Instituto Politécnico do Porto Escola Superior de Saúde, Portugal
|
2024/04/29 - 2024/06/17 | Própolis português e infeções bacterianas de animais domésticos: que potencial?
Co-supervisor of Rui Francisco Sousa Almeida
|
Licenciatura em Bioquímica (Degree)
Universidade do Minho Departamento de Biologia, Portugal
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2024/01/08 - 2024/01/27 | Selection and characterization of aptamers against enterotoxigenic E. coli
Supervisor of Denise Marques
|
Ciências Biomédicas Laboratoriais (Degree)
Instituto Politécnico do Porto Escola Superior de Saúde, Portugal
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2021/01 - 2021/07 | Aptamers for Staphylococcal enterotoxin A: effects on incorporating nucleic acid mimics
Co-supervisor of Roberto Pinto
|
Biotecnologia Medicinal (Degree)
Instituto Politécnico do Porto Escola Superior de Saúde, Portugal
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Event organisation
Event name Type of event (Role) |
Institution / Organization | |
---|---|---|
2024/11/27 - Current | 2º Simpósio INIAV para a Segurança Alimentar- “Sistemas Alimentares Sustentáveis e Seguros (2024/11/27)
Symposium (Member of the Organising Committee)
|
Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária - Polo de Vairão, Portugal |
2023/03/17 - Current | Co-organização da visita de estudo ao INIAV dedicada a alunos do secundário (escolas secundárias de Viana do Castelo e da
Galícia), no tema “Papel da PAC na promoção da inovação”, 17 de Março de 2023. Total de 40 alunos. Breve seminário seguido
de atividades laboratoriais: identificação de agentes patogénicos em amostras alimentares; pesquisa de antibióticos em alimentos;
modelo larvar para estudo de citotoxicidade. (2023/03/17)
Other (Co-organisor)
|
Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária - Polo de Vairão, Portugal |
2024/04/03 - 2024/04/03 | Co-organização da visita de estudo ao INIAV, alunos da Licenciatura de Ciências Biomédicas (Escola Universitária Vasco da
Gama, Coimbra), 3 de Abril de 2024. Total de 15 alunos. Atividades: visita aos laboratórios de Segurança Alimentar e Saúde
Animal; avaliação de toxicidade em modelo animal. (2024/04/03)
Other (Co-organisor)
|
Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária - Polo de Vairão, Portugal |
2023/07/13 - 2023/07/13 | Co-organização da visita de estudo ao INIAV de alunos da escola primária e pré-escolar da escola de Vairão e Fornelo, 13 de
Julho de 2023, com organização de 4 atividades de ciência dedicadas as crianças dos 4 aos 11 anos. Total de 51 alunos. Atividades
de ciência organizadas: (1) O ciclo de vida das larvas; (2) Morfologia de bactérias e os fungos; (3) O vulcão: conceito de
reação química; (4) A família dos coronavírus. (2023/07/13)
Other (Co-organisor)
|
Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária - Polo de Vairão, Portugal |
2023/04/04 - 2023/04/04 | Co-organização da visita de estudo ao INIAV dedicada a alunos do ensino primário (1º ao 4º ano), das freguesias de Vairão
e Fornelo (Vila do Conde), 4 de Abril de 2023. Total de 20 alunos. Vista ao polo com atividades de ciência dedicadas às crianças:
formação de arco-íris com soluções salinas, crescimento de larvas, morfologia das bactérias no microscópio, moldagem da morfologia
de bactérias com plasticina. (2024/04/04)
Other (Co-organisor)
|
Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária - Polo de Vairão, Portugal |
2023/02/01 - 2023/02/01 | Co-organização da visita de estudo ao INIAV, alunos do secundário (Curso Profissional de Análises Laboratoriais), da escola
Oliveira Júnior, de S. João da Madeira, 1 de fevereiro de 2023. Total de 13 alunos. Atividades: analise de contaminantes por
cromatografia fina; deteção de patogénicos por PCR em tempo real, avaliação de toxicidade em modelo animal. (2023/02/01)
Other (Co-organisor)
|
Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária - Polo de Vairão, Portugal |
Event participation
Activity description Type of event |
Event name Institution / Organization |
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2024/09/02 - 2024/09/10 | Climate Change: Challenges and Influence on Microbial Safety of Water and Food
Meeting
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FEMS Summer School for Postdocs 2024
Mediterranean Institute for Life Sciences, Croatia
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2024/05/28 - 2024/05/29 | BEekeeping products valorization and biomonitoring for the SAFEty of BEEs and HONEY
Conference
|
1st International Conference - BeSafeBeeHoney
Panepistemio Thessalias - Larisa, Greece
|
2024/04/09 - 2024/04/24 | e.Biofilm Training School - Fundamentals of Biofilm Engineering
Workshop
|
e.Biofilm Training School - Fundamentals of Biofilm Engineering
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
|
2023/09/06 - 2023/09/07 | COST Academy Leadership Workshop
Workshop
|
European Cooperation in Science and Technology, Belgium
|
2020/08/27 - 2020/08/28 | Antimicrobial drugs, drug delivery vectors, bio-barriers and characterization assays.
Workshop
|
DelNAM’s Workshop 3 - “Drug Delivery meets Bacteria"
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
|
2019/05 - 2019/06 | Radiation Protection Training for Use of Radiation-Producing Materials
Workshop
|
University of Maryland at College Park, United States
|
2019/03/21 - 2019/03/22 | Design and Synthesis of Nucleic Acids Mimics
Workshop
|
Syddansk Universitet, Denmark
|
2018/11/21 - 2018/11/23 | XXIV Encontro Luso-Galego de Química
Meeting
|
XXIV Encontro Luso-Galego de Química
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
|
Jury of academic degree
Topic Role |
Candidate name (Type of degree) Institution / Organization |
|
---|---|---|
2024/07/12 | Characterization of pathogenicity and virulence factors of Staphylococcus spp. recovered from company animals
(Thesis) Main arguer
|
Rodrigo Miranda Magalhães (Other)
Instituto Politécnico do Porto Escola Superior de Saúde, Portugal
|
2022 | Development and optimization of a PCR methodology for the detection of the main virulence factors (i.e., toxins and fimbriae)
of enterotoxigenic E. coli (ETEC)
Supervisor
|
Ana Campos (Other)
Instituto Politécnico do Porto Escola Superior de Saúde, Portugal
|
Association member
Society Organization name | Role | |
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2024/01/19 - Current | Gonditrilhos - Associação de Ciclismo de Gondifelos | President |
2019 - Current | Portuguese Society of Microbiology | Member |
Committee member
Activity description Role |
Institution / Organization | |
---|---|---|
2024/09 - Current | Topic Coordinator for the Research Topic ‘Perspectives in Clinical Infectious Diseases: 2024’ in Frontiers in Cellular and
Infection Microbiology
Coordinator
|
Course / Discipline taught
Academic session | Degree Subject (Type) | Institution / Organization | |
---|---|---|---|
2024/12 - Current | Engenharia Metabólica e Celular | Mestrado em Bioengenharia (Mestrado) | Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal |
2018/11 - 2018/12 | Engenharia Metabólica e Celular | Bioengenharia (Mestrado integrado) | Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal |
Journal scientific committee
Journal title (ISSN) | Publisher | |
---|---|---|
2024/07 - Current | Frontiers in Microbiology (1664-302X) | Frontiers Media |
2024/06 - Current | Molecular and cellular probes (0890-8508) | Elsevier Editorial |
2024/06 - Current | PloS one (1932-6203) | PLOS |
2024/02 - Current | Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (2235-2988) | Frontiers Media |
2023/08 - Current | Frontiers in Antibiotics (2813-2467) | Frontiers Media |
Mentoring / Tutoring
Topic | Student name | |
---|---|---|
2024/01 - Current | Aptamers for blocking Escherichia coli Shiga-toxins | Ana Campos |
2022/07 - Current | Aptamers to control colibacillosis in piglets | Maria Margarida Barros |
2022/09 - 2024/11 | Aptamers for blocking enterotoxigenic Escherichia coli | Ana Campos |
2023/07/03 - 2023/07/23 | Previsão da afinidade de aptâmeros para a enterotoxina A de Staphylococcus aureus | Catarina Machado Rebelo |
2022/04/26 - 2022/07/14 | Desenvolvimento de uma metodologia molecular para deteção de fatores de virulência de Escherichia coli enterotoxigénica em suínos de explorações portuguesas. | Ana Maria da Silva Campos |
2022/04 - 2022/05 | Development and optimization of a PCR methodology for the detection of the main virulence factors (i.e., toxins and fimbriae) of enterotoxigenic E. coli (ETEC) | Ana Ferraz |
2021/09/06 - 2021/09/24 | Characterization of resistance/virulence genes by PCR of Staphylococcus aureus isolates obtained from raw milk samples. | Ana Campos |
2021/01 - 2021/07 | Aptamers for Staphylococcal enterotoxin A: effects on incorporating nucleic acid mimics | Roberto Miguel Pais Pinto |
Distinctions
Award
2024 | Best Project Proposal at 5th FEMS Summer School for Postdocs 2024
Federation Of European Microbiological Societies, Netherlands
|
2023 | FEMS Early Career Scientist Meeting Grant - Microbiotec'23
Federation Of European Microbiological Societies, Netherlands
|
2023 | 5ª edição do concurso comunicação de ciência em microbiologia - Vencedor na categorial geral
Sociedade Portuguesa de Microbiologia, Portugal
|
2021 | Best Oral Presentation Award - LEPABE Talks
Universidade do Porto Laboratorio de Engenharia de Processos Ambiente Biotecnologia e Energia, Portugal
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal |
2017 | 2nd Best Scientific Poster Award - V AEICBAS Biomedical Congress
Universidade do Porto Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar, Portugal
|
2015 | Prize Prof. Doutor Fernando Serrão
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
|
Other distinction
2024 | Top 20 of the most talented and promising researchers from across the world - Invitation to FEMS Summer School for Postdocs
2024
Federation Of European Microbiological Societies, Netherlands
|
2018 | FCT PhD Studentship - SFRH/BD/138883/2018
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
|
2015 | Erasmus+ Scholarship - Stockholm University, Sweden
Universidade do Porto Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar, Portugal
|