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Juliane Fonseca de Oliveira. Completed the PhD also in Mathematics in 2017/01/17 by University of Porto and University of Coimbra. Completed Bachelor in Mathematics in 2011/07/01 by Federal University of Bahia. Over the last 5 years, I researched, worked on 16 publications and expanded my knowledge toward data architecture and analysis, statistical inference, epidemiology of infectious diseases and their related factors, including healthcare systems structures and social-economic inequities. In addition, I have been committed to science communication and public engagement activities, collaborating with medical practitioners, policy-makers and media in Brazil (https://pamepi.rondonia.fiocruz.br/news.html#midia). I developed technologies that integrate data processes, modelling, visualisation, and scientific communication to solve health problems and improve population life conditions. I completed two post-doctoral fellowships (PF), one research grant, collaborated on four projects and currently, I am a principal investigator of a project funded by the Bill & Melinda Gates and Minderoo Foundations HDR-UK (July/2021 to July/2022).
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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Juliane Fonseca de Oliveira

Nomes de citação

  • Oliveira, Juliane F

Identificadores de autor

Ciência ID
FA1C-E6B0-88DE
ORCID iD
0000-0002-7167-8754

Websites

Domínios de atuação

  • Ciências Exatas - Matemática
  • Ciências Exatas - Matemática - Matemática Aplicada
  • Ciências Exatas - Matemática - Estatística e Probabilidades

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Inglês Utilizador independente (B2) Utilizador independente (B2) Utilizador independente (B2) Utilizador proficiente (C1)
Italiano Utilizador elementar (A2) Utilizador elementar (A2) Utilizador elementar (A2) Utilizador independente (B2)
Português (Idioma materno)
Formação
Grau Classificação
2011/09/12 - 2017/01/17
Concluído
 Matemática (Doutoramento)
Especialização em Sem especialidade
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
"Bifurcation of Projected Patterns" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 Aprovado com distinção
2008/02/01 - 2011/07/01
Concluído
 B.S. Mathematics (Bachelor)
Especialização em Mathematics
Universidade Federal da Bahia, Brasil
"The Einstein Equation in Flag Manifolds F(3) and F(4)" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 8.1
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2021/07/01 - Atual Investigador principal (carreira) (Investigação) Centro de Integração de Dados e Conhecimentos para a Saúde, Brasil
Centro de Integração de Dados e Conhecimentos para Saúde, Brasil
(...)
2020/11/01 - 2021/11/30 Investigador principal convidado (carreira) (Investigação) Fundação Oswaldo Cruz Rondonia , Brasil
Fundação Oswaldo Cruz Rondonia , Brasil
(...)
2020 - 2021 Investigador principal convidado (carreira) (Investigação) Center of Data and Knowledge Integration for Health, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz, Brasil
Projetos

Bolsa

Designação Financiadores
2020/10/07 - 2021/11/30 FIOCRUZ PROGRAM FOR INNOVATION FOSTERING - INNOVATIVE IDEAS AND PRODUCTS - COVID 19 STRATEGIC ORDERS
VPPIS-005-FIO-20-2-40
Bolseiro de Investigação
Fundação Oswaldo Cruz Rondonia , Brasil
 Fundação Oswaldo Cruz
Concluído
2018/07/01 - 2020/10/30 Long-term surveillance platform for Zika and Microcephaly under the Unified Health System of Brazil (SUS)
DIREB-009-FIO-16/SUBP 01
Bolseiro de Pós-Doutoramento
Fundação Oswaldo Cruz, Brasil

Center of Data and Knowledge Integration for Health, Brasil

Brazilian Ministry of Health, Brasil
Brazilian Ministry of Health

Center of Data and Knowledge Integration for Health

Fundação Oswaldo Cruz
Em curso
2018/02/01 - 2018/03/31 TB Research Investment Case coordinated by the World Health Organization
OPP1131404
Bolseiro de Pós-Doutoramento
Liverpool School of Tropical Medicine, Reino Unido

World Health Organisation EDM Documentation Centre, Suiça
Instituto Gulbenkian de Ciência

Bill and Melinda Gates Foundation US

Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2016/01/01 - 2017/12/31 Singularities and Algebraic Theory in Dynamical Systems
CAPES-FCT 039/2014
Investigador
Universidade do Porto Centro de Matemática, Portugal

Universidade de São Paulo Câmpus de São Carlos, Brasil
Fundação para a Ciência e a Tecnologia

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Concluído
2017/04/17 - 2017/12/16 Modelling and inference for the population and ecosystem health
IF/01346/2014
Bolseiro de Pós-Doutoramento
Universidade do Porto Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Portugal

Liverpool School of Tropical Medicine, Reino Unido
Governo da República Portuguesa Ministério da Ciência Tecnologia e Ensino Superior

Fundo Europeu de Desenvolvimento Regional

Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído

Projeto

Designação Financiadores
2021/07/05 - 2022/07/31 Routine assessment of infections, prevention and control of SARS-COV-2 on unequal populations.
2021.0097
Investigador responsável
Center of Data and Knowledge Integration for Health, Brasil

Centro de Matemática da Universidade do Porto, Portugal

Fundação Oswaldo Cruz, Brasil
Bill and Melinda Gates Foundation US

Minderoo Foundation
Em curso

Outro

Designação Financiadores
2020/08/01 - 2021/08/31 Cohort of 100 Million Brazilians: Social determination and impact of public policies on the occurrence of infectious diseases
213589/Z/18/Z
Investigador
Center of Data and Knowledge Integration for Health, Brasil

Fundação Oswaldo Cruz, Brasil
Brazilian Ministry of Health
Concluído
2020/01/01 - 2020/01/01 The Impact of Primary Health Care on Tuberculosis Incidence, Cure Rate and Mortality: an Integrated Retrospective and Forecasting Study Based on a Cohort of 100 Million Brazilians
VPGDI-003-FIO-44519
Investigador
Centro de Integração de Dados e Conhecimentos para Saúde, Brasil

Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Brasil

Fundação Oswaldo Cruz, Brasil

Instituto de Salud Global Barcelona, Espanha
Bill and Melinda Gates Foundation US

Brazilian Ministry of Health
Em curso
Produções

Publicações

Artigo em revista
  1. Pereira, Felipe A.C.; Filho, Fábio M.H.S.; de Azevedo, Arthur R.; de Oliveira, Guilherme L.; Flores-Ortiz, Renzo; Valencia, Luis Iván O.; Rodrigues, Moreno M. S.; et al. "Profile of COVID-19 in Brazil: Risk Factors and Socioeconomic Vulnerability Associated with Disease Outcome". SSRN Electronic Journal (2022): http://dx.doi.org/10.2139/ssrn.4081979.
    10.2139/ssrn.4081979
  2. Juliane F. Oliveira; Daniel C. P. Jorge; Rafael V. Veiga; Moreno S. Rodrigues; Matheus F. Torquato; Nivea B. da Silva; Rosemeire L. Fiaccone; et al. Autor correspondente: Juliane F. Oliveira. "Mathematical modeling of COVID-19 in 14.8 million individuals in Bahia, Brazil". Nature Communications (2021): https://doi.org/10.1038/s41467-020-19798-3.
    10.1038/s41467-020-19798-3
  3. Guilherme L. de Oliveira; Juliane F. Oliveira; Júlia M. Pescarini; Roberto F. S. Andrade; Joilda S. Nery; Maria Y. Ichihara; Liam Smeeth; et al. Autor correspondente: Juliane F. Oliveira. "Estimating underreporting of leprosy in Brazil using a Bayesian approach". PLOS Neglected Tropical Diseases 15 8 (2021): e0009700-e0009700. https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0009700.
    10.1371/journal.pntd.0009700
  4. Pataro, Igor M. L.; Oliveira, Juliane F.; Morato, Marcelo M.; Amad, Alan A. S.; Ramos, Pablo I. P.; Pereira, Felipe A. C.; Silva, Mateus S.; et al. Autor correspondente: Oliveira, Juliane F.. "A control framework to optimize public health policies in the course of the COVID-19 pandemic". Scientific Reports 11 1 (2021): http://dx.doi.org/10.1038/s41598-021-92636-8.
    10.1038/s41598-021-92636-8
  5. Jorge, Daniel C.P.; Rodrigues, Moreno S.; Silva, Mateus S.; Cardim, Luciana L.; da Silva, Nívea B.; Silveira, Ismael H.; Silva, Vivian A.F.; et al. Autor correspondente: Oliveira, Juliane F.. "Assessing the nationwide impact of COVID-19 mitigation policies on the transmission rate of SARS-CoV-2 in Brazil". Epidemics 35 (2021): 100465. http://dx.doi.org/10.1016/j.epidem.2021.100465.
    10.1016/j.epidem.2021.100465
  6. Ximenes, Ricardo Arraes de Alencar; Albuquerque, Maria de Fatima Pessoa Militão de; Martelli, Celina Maria Turchi; Araújo, Thália Velho Barreto de; Miranda Filho, Demócrito de Barros; Souza, Wayner Vieira de; Ichihara, Maria Yury Travassos; et al. "Covid-19 no nordeste do Brasil: entre o lockdown e o relaxamento das medidas de distanciamento social". Ciência & Saúde Coletiva 26 4 (2021): 1441-1456. http://dx.doi.org/10.1590/1413-81232021264.39422020.
    10.1590/1413-81232021264.39422020
  7. Veiga, Rafael V.; Schuler-Faccini, Lavinia; França, Giovanny V. A.; Andrade, Roberto F. S.; Teixeira, Maria Glória; Costa, Larissa C.; Paixão, Enny S.; et al. Autor correspondente: Veiga, Rafael V.. "Classification algorithm for congenital Zika Syndrome: characterizations, diagnosis and validation". Scientific Reports 11 1 (2021): http://dx.doi.org/10.1038/s41598-021-86361-5.
    10.1038/s41598-021-86361-5
  8. Miranda, José Garcia Vivas; Silva, Mateus Souza; Bertolino, José Gabriel; Vasconcelos, Rodrigo Nogueira; Cambui, Elaine Cristina Barbosa; Araújo, Marcio Luis Valença; Saba, Hugo; et al. Autor correspondente: Miranda, José Garcia Vivas. "Scaling effect in COVID-19 spreading: The role of heterogeneity in a hybrid ODE-network model with restrictions on the inter-cities flow". Physica D: Nonlinear Phenomena 415 (2021): 132792. http://dx.doi.org/10.1016/j.physd.2020.132792.
    10.1016/j.physd.2020.132792
  9. Larissa Catharina Costa; Rafael Valente Veiga; Juliane Fonseca Oliveira; Moreno S. Rodrigues; Roberto F. S. Andrade; Enny S. Paixão; Maria Glória Teixeira; et al. "New Insights on the Zika Virus Arrival in the Americas and Spatiotemporal Reconstruction of the Epidemic Dynamics in Brazil". Viruses 13 1 (2020): 12-12. https://doi.org/10.3390/v13010012.
    10.3390/v13010012
  10. N. Costa, Maria Conceição; Cardim, Luciana Lobato; Teixeira, Maria Gloria; Barreto, Mauricio L.; Carvalho-Sauer, Rita de Cassia Oliveira de; Barreto, Florisneide R.; Carvalho, Martha Suely Itaparica; et al. "Case Fatality Rate Related to Microcephaly Congenital Zika Syndrome and Associated Factors: A Nationwide Retrospective Study in Brazil †". Viruses 12 11 (2020): 1228. http://dx.doi.org/10.3390/v12111228.
    10.3390/v12111228
  11. Ligia Kerr; Carl Kendall; Antônio Augusto Moura da Silva; Estela Maria L Aquino; Julia M Pescarini; Rosa Lívia Freitas de Almeida; Maria Yury Ichihara; et al. "COVID-19 no Nordeste brasileiro: sucessos e limitações nas respostas dos governos dos estados". Ciência & Saúde Coletiva 25 suppl 2 (2020): 4099-4120. https://doi.org/10.1590/1413-812320202510.2.28642020.
    10.1590/1413-812320202510.2.28642020
  12. Oliveira, Juliane F.; Rodrigues, Moreno S.; Skalinski, Lacita M.; Santos, Aline E. S.; Costa, Larissa C.; Cardim, Luciana L.; Paixão, Enny S.; et al. Autor correspondente: Oliveira, Juliane F.. "Interdependence between confirmed and discarded cases of dengue, chikungunya and Zika viruses in Brazil: A multivariate time-series analysis". PLOS ONE 15 2 (2020): e0228347. http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0228347.
    10.1371/journal.pone.0228347
  13. de Oliveira, Juliane Fonseca; Pescarini, Julia Moreira; Rodrigues, Moreno de Souza; Almeida, Bethania de Araujo; Pessanha Henriques, Claudio Maierovitch; Gouveia, Fabio Castro; Rabello, Elaine Teixeira; et al. Autor correspondente: de Oliveira, Juliane Fonseca. "The global scientific research response to the public health emergency of Zika virus infection". Plos One (2020): https://publons.com/publon/33946059/.
    10.1371/JOURNAL.PONE.0229790
  14. M. Gabriela M. Gomes; Juliane F. Oliveira; Adelmo Bertolde; Diepreye Ayabina; Tuan Anh Nguyen; Ethel L. Maciel; Raquel Duarte; et al. "Introducing risk inequality metrics in tuberculosis policy development". Nature Communications (2019): https://doi.org/10.1038/s41467-019-10447-y.
    10.1038/s41467-019-10447-y
  15. Paixão, Enny S.; Rodrigues, Moreno S.; Cardim, Luciana L.; Oliveira, Juliane F.; L. C., Catharina; Costa, Maria da Conceição N.; Barreto, Maurício L.; et al. "Impact evaluation of Zika epidemic on congenital anomalies registration in Brazil: An interrupted time series analysis". PLOS Neglected Tropical Diseases 13 9 (2019): e0007721. http://dx.doi.org/10.1371/journal.pntd.0007721.
    10.1371/journal.pntd.0007721
  16. Castro, S.B.S.D.; Labouriau, I.S.; Oliveira, J.F.. "Projections of patterns and mode interactions". Dynamical Systems 33 4 (2018): 547-564. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85036644686&partnerID=MN8TOARS.
    10.1080/14689367.2017.1401590
  17. Oliveira, J.F.; Castro, S.B.S.D.; Labouriau, I.S.. "Hexagonal projected symmetries". Acta Crystallographica Section A: Foundations and Advances 71 (2015): 549-558. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84940667834&partnerID=MN8TOARS.
    10.1107/S2053273315012905
Recurso online
  1. Brazilian COVID-19 data streaming. 2022. https://doi.org/10.48550/arXiv.2205.05032.
  2. Impact of the COVID19-related economic crisis and mitigation effects of social protection on HIV/AIDS and Tuberculosis: an integrated economic, mathematical and epidemiological modelling study. 2022. https://www.researchsquare.com/article/rs-1316131/v1.
  3. Daniel C. P. Jorge; Juliane F. Oliveira; Jose G. V. Miranda; Roberto F. S. Andrade; Suani T. R. Pinho. Autor correspondente: Daniel C. P. Jorge. Estimating the effective reproduction number for heterogeneous models using incidence data. 2021. https://arxiv.org/abs/2102.12637.
Tese / Dissertação
  1. Juliane Fonseca de Oliveira. "Bifurcation of Projected Patterns". Doutoramento, 2017. https://repositorio-aberto.up.pt/handle/10216/90850.
Atividades

Apresentação oral de trabalho

Título da apresentação Nome do evento
Anfitrião (Local do evento)
2019/10/29 Disease risk inequalities in mathematical models for infectious disease transmission Link: https://www.youtube.com/watch?v=5Bgj8FS_4NQ&t=135s Café Científico (Scientific divulgation event)
Cidacs/Fiocruz Bahia (Salvador, Brasil)
2018/11 Mathematical modelling of epidemics: the challenge of using big data in the dissemination of Zika, Dengue and Chikungunya viruses Big Data Science Bahia 2018. Link http://www.bigdatascienceba2018.ufba.br/
Federal University of Bahia and Centro de Integração de Dados e Conhecimentos para Saúde (Salvador, Brasil)
2017/10/16 Projections of Patterns and Mode Interactions Symmetry 2017 - The First International Conference on Symmetry
MDPI journal Symmetry (Barcelona, Espanha)
2016 Bifurcation of Projected Patterns Post-Graduate Seminar Group, ICMC, University of São Paulo - São Carlos
University of São Paulo - São Carlos (São Paulo, Brasil)
2016 Bifurcation of Projected Patterns Dynamical Systems Seminar
University of Porto (Porto, Portugal)
2016 Dimensionality of Pattern Formation in Reaction Diffusion Systems Dynamical Systems Seminar
Department of Mathematics, University of Porto (Porto, Portugal)
2015 Dimensionality of Pattern Formation in Reaction Diffusion Systems Research Seminar Program (UC-UP Math PhD program)
Department of Mathematics, University of Coimbra (Coimbra, Portugal)
2015 Hexagonal projected Symmetries Algebra and Combinatorics Seminar
Universidade de Coimbra (Coimbra, Portugal)
2014 Hexagonal projected Symmetries Dynamical Systems Seminar
Department of Mathematics, University of Porto (Porto, Portugal)
2012 Spatial Hidden Symmetries in Pattern Formation Seminar of the Mathematics PhD Program of UP-UC
Department of Mathematics, University of Porto (Porto, Portugal)

Organização de evento

Nome do evento
Tipo de evento (Tipo de participação) 		Instituição / Organização
2015 - 2015 Intentional Meeting of the American, European and Portuguese Mathematical Societies. University of Porto, Portugal, 2015 (2016/06 - 2016/06)
Encontro (Membro da Comissão Organizadora)

Participação em evento

Descrição da atividade
Tipo de evento 		Nome do evento
Instituição / Organização
2022/01/21 - 2022/01/22 Invited Speaker
Oficina (workshop)
 COVID-19: Looking ahead
University of Hyderabad, Índia
2021/11/16 - 2021/11/17 Invited Speaker
Mesa-redonda
 Ki GC Annual Meeting: Data Visualizations and Scientific Communications
Health Data Research UK, Reino Unido
2016 - 2016 Seminar: Dimensionality of Pattern Formation in Reaction Diffusion Systems Workshop dynamics in Networks with special properties
Mathematical Bioscience Institute, Ohio State University, The USA, Estados Unidos
2015 - 2015 Intentional Meeting of the American, European and Portuguese Mathematical Societies. University of Porto, Portugal, 2015
Conferência
 Intentional Meeting of the American, European and Portuguese Mathematical Societies. University of Porto, Portugal, 2015
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2015 - 2015 Presentation of research: Hexagonal projected Symmetries
Oficina (workshop)
 Workshop on topics in applied dynamical systems: equivariance and beyond
Mathematical Bioscience Institute, Ohio State University, The USA, Estados Unidos
2010 - 2010 Presentation of research work: Smooth Structures on Projective Spaces and Grassmann Manifolds
Encontro
 I Encontro Baiano de Pesquisa em Matemática
Universidade estadual de Santa Cruz, Departamento de Matemática, Brasil
2010 - 2010 Presentation of research: Lie Theory and the Topology of Homogeneous Spaces
Conferência
 XI Seminário de Pesquisa e Pós- Graduação
Universidade Federal da Bahia, Brasil
2009 - 2009 Presentation of research: Smooth structures on the Real Projective Space
Conferência
 XXVII Seminário Estudantil de Pesquisa, X Seminário de Pesquisa e Pós-Graduação
Universidade Federal da Bahia, Brasil
2009 - 2009 Presentation of research: Applications in Winplot for Medium Education
Encontro
 XII Encontro de Matemática da Universidade Federal da Bahia
Universidade Federal da Bahia - Campus Ondina, Brasil
2008 - 2008 Exhibition of Mathematical Objects for Teaching - LEMA/UFBA
Simpósio
 I International Symposium on Mathematics Teaching
Universidade Federal da Bahia - Campus Ondina, Brasil

Membro de associação

Nome da associação Tipo de participação
2011/09/12 - Atual Centro de Matemática da Universidade do Porto

Processo legal

Descrição da atividade Caso
2018 - 2018 Oliveira, J.F.D., 2018. Projections of Periodic Functions and Mode Interactions. Multidisciplinary Digital Publishing Institute Proceedings, 2(1), p.88.

Revisão ad hoc de artigos em revista

Nome da revista (ISSN) Editora
2021/05 - Atual Epidemics (1755-4365) Elsevier
2021/04 - Atual F1000Research ( 2046-1402) F1000Research
2020/08 - Atual Wellcome open research (2398-502X) Wellcome Open Research
2020 - Atual PLOS Computational Biology (1553-7358) PLOS
Distinções

Prémio

2018 Postdoctoral Researcher Fellowship
Brazilian Ministry of Health, Brasil
2018 Researcher fellowship
Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal
2017 Symmetry 2017 Conference Award
MDPI journal Symmetry, Espanha
2017 Postdoctoral Researcher fellowship
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
2012 PhD fellowship
Brazilian National Council for Scientific and Technological Development, Brasil
2009 Institutional Scholarship Program of Scientific Initiation fellowship
Brazilian National Council for Scientific and Technological Development, Brasil
2009 Institutional Scholarship Program of Teaching Initiation fellowship
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, Brasil
2008 Graduated scholarship
Center of Afro-Oriental Studies, Brasil

Universidade Federal da Bahia - Campus Ondina, Brasil
2006 Honorable Mention and Bronze Medal in the Brazilian Mathematical Olympiad
Instituto Nacional de Matemática Pura e Aplicada, Brasil

Sociedade Brasileira de Matemática, Brasil