???global.info.a_carregar???
Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Raquel Linheiro

Nomes de citação

  • Linheiro, Raquel

Identificadores de autor

Ciência ID
8711-0C39-124B

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Inglês Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1)
Francês Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1)
Português Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1)
Formação
Grau Classificação
2011/04
Concluído
 Biomolecular Science (Doutoramento)
The University of Manchester, Reino Unido
"COMPUTATIONAL ANALYSIS OF TRANSPOSABLE ELEMENT TARGET SITE PREFERENCES IN DROSOPHILA MELANOGASTER" (TESE/DISSERTAÇÃO)
Projetos

Bolsa

Designação Financiadores
2009/10/01 - 2012/09/30 BIOINFORMATICS ANALYSIS OF P ELEMENT INSERTIONS IN DROSOPHILA MELANOGASTER
SFRH/BD/60600/2009
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído

Projeto

Designação Financiadores
2019/08/01 - 2021/04/30 De Novo based sequence assembly of next generation sequence data without chimeras: improved annotation, gene expression profiles and haplotype reconstruction
PTDC/BIA-EVL/29115/2017
Investigador Pós-doutorado
Universidade do Porto Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Portugal
Concluído
2019/01/01 - 2019/12/31 Centre for Biotechnology and Fine Chemistry
UID/Multi/50016/2019
Universidade Católica Portuguesa, Portugal

Universidade Católica Portuguesa Portuguesa Centro de Biotecnologia e Química Fina, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
Produções

Publicações

Artigo em revista
  1. Linheiro, Raquel; Sabatino, Stephen; Lobo, Diana; Archer, John. "CView: A network based tool for enhanced alignment visualization". PLOS ONE 17 6 (2022): e0259726. http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0259726.
    10.1371/journal.pone.0259726
  2. Linheiro, Raquel; Archer, John. "Quantification of the effects of chimerism on read mapping, differential expression and annotation following short-read de novo assembly.". F1000Research 11 (2022): 120. http://dx.doi.org/10.12688/f1000research.108489.1.
    10.12688/f1000research.108489.1
  3. Catarina Ferreira; Diana Bogas; Santosh K. Bikarolla; Ana Rita Varela; Karolin Frykholm; Raquel Linheiro; Olga C. Nunes; Fredrik Westerlund; Célia M. Manaia. "Genetic variation in the conjugative plasmidome of a hospital effluent multidrug resistant Escherichia coli strain". (2019): https://hdl.handle.net/10216/123532.
    10.1016/j.chemosphere.2018.12.130
  4. Ferreira, Catarina; Bogas, Diana; Bikarolla, Santosh K.; Varela, Ana Rita; Frykholm, Karolin; Linheiro, Raquel; Nunes, Olga C.; Westerlund, Fredrik; Manaia, Célia M.. "Genetic variation in the conjugative plasmidome of a hospital effluent multidrug resistant Escherichia coli strain". (2019): http://hdl.handle.net/10400.14/26620.
    10.1016/j.chemosphere.2018.12.130
  5. Macieira, Ariana; Albano, Helena; Pinto, Miguel; Linheiro, Raquel; Barbosa, Joana; Teixeira, Paula. "Evaluation of a bacteriocinogenic Lactobacillus plantarum strain on the microbiological characteristics of “Alheira de Vitela”". (2019): http://hdl.handle.net/10400.14/28413.
    10.3934/agrfood.2019.2.223
  6. Nelson, Michael G.; Linheiro, Raquel S.; Bergman, Casey M.. "McClintock: an integrated pipeline for detecting transposable element insertions in whole-genome shotgun sequencing data". (2017): http://hdl.handle.net/10400.14/26009.
    10.1534/g3.117.043893

Outros

Software
  1. Linheiro, Raquel; Sabatino, Stephen; Lobo, Diana; Archer, John. "CView". https://sourceforge.net/projects/cview/. Associação BIOPOLIS - Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva. 2022.