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I am currently a PhD student in Biology and Ecology of Global Changes at University of Aveiro and NOVA University of Lisbon (Portugal) and Université du Québec à Rimouski (Canada). My PhD project focuses on the comparison of amphipods¿ responses to global change drivers between different climatic regions and generations using a systems biology approach. I have completed the Bachelor in Biology and Geology in 2017 (University of Trás-os-Montes e Alto Douro), with one semester at Universitatea din Bucuresti in Romania by ERASMUS+ Mobility Program. Subsequently, I had completed a Master in Marine Biology at the University of Aveiro where I studied the thermal tolerance and acclimation capacity of the ragworm Hediste diversicolor under global change scenarios. After the master, I worked as research fellow under a Canadian project at University of Aveiro. I have been and I am involved in more than five projects, three of them international ones. I did two volunteer internships, one of which was an international project. I have five article published, four poster presented at an international conference, and two oral communications at an international conference too. Moreover, I participated in several conferences and workshops. Additionally I co-organized two scientific events. Besides my academic career, I am currently member of the Communication Team Committee in OYSTER (Orienting Young ScienTists of EuromaRine). I have been enrolled as Main Coordinator of Board Assembly of Biology and Geology Students Association (NEBIG-UTAD). My research interests include: Global Changes, Marine Ecophysiology, Multi-Omics and Multiple Stressors.
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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Joana Filipa da Cunha Fernandes

Nomes de citação

  • Fernandes, J. F.
  • Fernandes, Joana F.

Identificadores de autor

Ciência ID
7B1E-3ABF-1EA3
ORCID iD
0000-0001-6767-4737

Endereços de correio eletrónico

  • joanafcf@ua.pt (Profissional)
  • joana12fcf@gmail.com (Pessoal)

Telefones

Telemóvel
  • 965434198 (Pessoal)

Moradas

  • Rua de Chielos, nº6 , 4925-341, Cardielos, Viana do Castelo, Portugal (Pessoal)

Websites

Domínios de atuação

  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Ecologia
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia Marinha
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia Molecular

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Português (Idioma materno)
Inglês Utilizador independente (B2) Utilizador independente (B2) Utilizador independente (B2) Utilizador independente (B2)
Espanhol; Castelhano Utilizador elementar (A2) Utilizador elementar (A2) Utilizador elementar (A2) Utilizador independente (B1)
Formação
Grau Classificação
2021/10 - 2025/10
Em curso
 PhD in Biology and Ecology of Global Changes (Doutoramento)
Especialização em Specialization area: Marine Biology and Ecology
Universidade de Aveiro Centro de Estudos do Ambiente e do Mar, Portugal

Université du Québec à Rimouski, Canadá

REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
"Vulnerability or Tolerance: Amphipods' responses to global change drivers across different climatic regions and generations" (TESE/DISSERTAÇÃO)
2022/10 - 2022/11
Frequentou
 Advanced course with funded scholarship by OA-ICC, IAEA on "Basic training course on Multiple Stressors and Ocean Acidification", at IAEA Marine Environment Laboratories in Monaco (Curso de doutoramento (conclusão de unidades curriculares))
International Atomic Energy Agency Marine Environment Laboratories, Mónaco
2022/09 - 2022/09
Frequentou
 Marine LC-MS Metabolomics Workshop Sorbonne Université, Jussieu Campus, Paris, France (Curso de doutoramento (conclusão de unidades curriculares))
Marie Currie Actions , França
2022/07 - 2022/07
Frequentou
 Advanced course with funded scholarship by SIB on "The Evolution of Enzymes and Metabolic Pathways in Marine Organisms", at Stazione Zoologica Anton Dohrn, Naples, Italy (Curso de doutoramento (conclusão de unidades curriculares))
Società Italiana di Biochimica e Biologia Molecolare, Itália
2022/03 - 2022/03
Frequentou
 Advanced course with funded scholarship by OA-ICC, IAEA on "Basic training course on ocean acidification", at Kristineberg Marine Research Station, Fiskebäckskil, Sweden (Curso de doutoramento (conclusão de unidades curriculares))
International Atomic Energy Agency Marine Environment Laboratories, Mónaco
2021 - 2021
Concluído
 Advanced course on "Data Analysis using R" (Outros)
Universidade de Aveiro Centro de Estudos do Ambiente e do Mar, Portugal
 18/20
2017 - 2019
Concluído
 Biologia Marinha (Mestrado)
Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal

Universidade de Aveiro Centro de Estudos do Ambiente e do Mar, Portugal
"Thermal tolerance and acclimation capacity of the ragworm Hediste diversicolor under global change scenarios" - 19/20 - https://ria.ua.pt/handle/10773/28486" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 18/20
2018/11/28 - 2018/11/30
Concluído
 Advanced course "Molecular biotechnology: transcriptomic and proteomic" (Outros)
Universidade de Vigo, Espanha
 18/20
2018/06/14 - 2018/06/16
Concluído
 Primeiros Socorros em Situações (Potencialmente) Urgentes (Curso de Especialização Tecnológica)
UNAVE - Associação para a Formação Profissional e Investigação da Universidade de Aveiro , Portugal
 8/10
2017/07/10 - 2017/07/14
Concluído
 Summer Course - Tools for Aquatic Ecosystems Research (2ª edition) (Outros)
Centro de Ciências do Mar e do Ambiente, Portugal
2013/09 - 2017/07
Concluído
 Biologia e Geologia (Licenciatura)
Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro Escola de Ciências da Vida e do Ambiente, Portugal
 13/20
2016/09 - 2017/02
Concluído
 ERASMUS+ Mobility Program - Bachelor in Biology and Geology (Bachelor)
Universitatea din Bucuresti Facultatea de Biologie, Roménia
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2020/11 - 2021/11 Investigador Contratado (Investigação) DFO, Ouranos, Merinov, MITACS, UQAR, Canadá
Universidade de Aveiro Centro de Estudos do Ambiente e do Mar, Portugal
(...)
2017/05 - 2017/09 Estagiário de Investigação (Investigação) Centro de Ciências do Mar e do Ambiente, Portugal
Centro de Ciências do Mar e do Ambiente, Portugal

Outros

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2021 - 2025 PhD student Universidade de Aveiro Centro de Estudos do Ambiente e do Mar, Portugal
Universidade de Aveiro Centro de Estudos do Ambiente e do Mar, Portugal
(...)
2017 - 2019 MSc student Universidade de Aveiro Centro de Estudos do Ambiente e do Mar, Portugal
2013/09 - 2017/07 BSc student Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro Escola de Ciências da Vida e do Ambiente, Portugal
Projetos

Bolsa

Designação Financiadores
2023 - Atual OCEAN SHELTERS - Impacts of ocean warming on the capacity of macroalgae to be a natural shelter for calcifiers under future acidified ocean
TAL-NAML20230421-002
Investigador
International Atomic Energy Agency Marine Environment Laboratories, Mónaco
Em curso
2021/10 - 2025/10 Vulnerability or Tolerance: Amphipods' responses to global change drivers across different climatic regions and generations
2021.04675.BD
Bolseiro de Doutoramento
Universidade de Aveiro Centro de Estudos do Ambiente e do Mar, Portugal

REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal

Université du Québec à Rimouski, Canadá
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2023 - 2025 PUFApods - Merging blue and green food systems - Using marine amphipods supplied with plant food processing side streams to produce n-3 LC-PUFA - Role: Team member
2022.01620.PTDC
Investigador
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
2021 - 2024 ExtremeOceans - Unravelling evolutionary physiology landscapes of coastal and marine fauna under extreme temperatures through systems biology - Role: Team member
PTDC/BIA-BMA/1494/2020
Investigador
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal

Projeto

Designação Financiadores
2020/11 - 2021/11 Vulnerability of northern shrimp (Pandalus borealis) populations to climate and global change along the east coast of Canada: from natural resource to coastal communities
Projet # 550027
Bolseiro de Investigação
DFO, Ouranos, Merinov, MITACS, UQAR, Canadá

Universidade de Aveiro Centro de Estudos do Ambiente e do Mar, Portugal
DFO, Ouranos, Merinov, MITACS, UQAR

Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada

Reseau Québec Maritime
Concluído

Outro

Designação Financiadores
2022 - 2023 AQUATROPHYS - Marine molecular networks for sustainable fisheries and AQUAculture: modelling TROpical fish nutritional quality and PHYSiology under global change
2021.09718.CBM
Investigador
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2017/04 - 2017/05 LIFE+ Berlengas by SPEA, Portuguese Society for the Study of Birds in Berlenga Island, Peniche, Portugal
(LIFE13 NAT/PT/000458)
Outra
LIFE programme
Em curso
Produções

Publicações

Artigo em revista
  1. Joana Filipa Fernandes; Ricardo Calado; Daniel Jerónimo; Diana Madeira. "Thermal tolerance limits and physiological traits as indicators of Hediste diversicolor's acclimation capacity to global and local change drivers". Journal of Thermal Biology (2023): https://doi.org/10.1016/j.jtherbio.2023.103577.
    10.1016/j.jtherbio.2023.103577
  2. Madalena Missionário; Joana Filipa Fernandes; Margarida Travesso; Eduardo Freitas; Ricardo Calado; Diana Madeira. "Sex-specific thermal tolerance limits in the ditch shrimp Palaemon varians: Eco-evolutionary implications under a warming ocean". Journal of Thermal Biology (2022): 103151-103151. https://doi.org/10.1016/j.jtherbio.2021.103151.
    10.1016/j.jtherbio.2021.103151
  3. Madeira, D.; Fernandes, J. F.; Jerónimo, D.; Martins, P.; Ricardo, F.; Santos, A.; Domingues, M. R.; Diniz, M. S.; Calado, R.. "Salinity shapes the stress responses and energy reserves of marine polychaetes exposed to warming: From molecular to functional phenotypes". Science of The Total Environment 795 (2021): 148634. http://dx.doi.org/10.1016/j.scitotenv.2021.148634.
    Publicado • 10.1016/j.scitotenv.2021.148634
  4. Fernandes, J. F.; Ricardo, F.; Jerónimo, D.; Santos, A.; Domingues, M. R.; Calado, R.; Madeira, D.. "Modulation of fatty acid profiles by global and local ocean change drivers in the ragworm Hediste diversicolor: implications for aquaculture production". Aquaculture 542 (2021): 736871. http://dx.doi.org/10.1016/j.aquaculture.2021.736871.
    Publicado • 10.1016/j.aquaculture.2021.736871
  5. Madeira, D.; Fernandes, J.F.; Jerónimo, D.; Ricardo, F.; Domingues, M. R.; Calado, R.. "Calcium homeostasis and stable fatty acid composition underpin heatwave tolerance of the keystone polychaete Hediste diversicolor". Environmental Research 195 (2021): 110885. http://dx.doi.org/10.1016/j.envres.2021.110885.
    Publicado • 10.1016/j.envres.2021.110885
Poster em conferência
  1. Madeira, Carolina; Missionário, M.; Almeida, Célia; Cabral, Inês Moutinho; Nunes, Miguel; Fernandes, Joana F.; Travesso, Margarida; et al. "Molecular and phenotypic plasticity of temperate gobies in response to ocean warming and marine heatwaves.". Trabalho apresentado em Ciência 2023 - Encontro com a Ciência e Tecnologia em Portugal: Ciência e Oceano para Além do Horizonte, 2023.
  2. Cabral, Inês Moutinho; Missionário, M; Nunes, Miguel; Mendonça, Vanessa; Fernandes, Joana F.; Travesso, Margarida; Vinagre, Catarina; et al. "How ocean warming is modulating marine host-parasite dynamics in the Anthropocene: Evidence for higher parasite incidence and effects in nonwarm adapted intertidal fish population". Trabalho apresentado em EcoSummit 2023 Building a sustainable and desirable future: Adapting to a changing land and sea-scape, 13-17 June 2023 | Gold Coast, Australia, 2023.
  3. Nunes, Miguel; Moutinho Cabral, Inês; Cátia Gonçalves; Missionário, M.; Fernandes, Joana F.; Travesso, M. ; Madeira, Diana; Costa, Pedro M.; Madeira, Carolina. Autor correspondente: Nunes, Miguel. "Transcriptome profiling of the common goby Pomatoschistus microps exposed to seasonal warming reveals gene downregulation as an energy-saving mechanism to cope with thermal stress.". Trabalho apresentado em 1st Egas Moniz One Health Symposium: Teaming up for a better Public Health, 2022.
  4. Fernandes, J. F.; Calosi, Piero; Diniz, Mário; Madeira, Diana. "Vulnerability or Tolerance: Amphipods' responses to global change drivers across different climatic regions and generations". Trabalho apresentado em Basic training course on ocean acidification at the Kristineberg Marine Research, Sweden, 2022.
  5. Fernandes, J.F.; Jerónimo, D.; Diniz, M.S.; Calado, R.; Madeira, D.. "Cellular stress response and thermal tolerance limits of the ragworm Hediste diversicolor under global change scenarios". Trabalho apresentado em ICYMARE - International Conference for Young Marine Researchers - 24th-27th September, Bremen, Germany DOI: 10.13140/RG.2.2.17590.24648 https://www.icymare.com/wp-content/uploads/2019/09/ICYMARE2019BREMEN_Book_of_Abstracts.pdf, 2019.
Recurso online
  1. Madeira, Diana; Fernandes, Joana F.; Jerónimo, Daniel; Martins, Patrícia; Ricardo, Fernando; Santos, Andreia; Domingues, Maria Rosário; Diniz, Mário; Calado, Ricardo. Influence of temperature and salinity on the cellular stress response and energy reserves of Hediste diversicolor [Dataset].. 2021. http://doi.org/10.5281/zenodo.4601024.
    10.5281/zenodo.4601024
  2. Madeira, Diana; Fernandes, Joana F.; Jerónimo, Daniel; Ricardo, Fernando; Santos, Andreia; Domingues, Maria Rosário; Calado, Ricardo. Heatwave tolerance of a marine polychaete (Hediste diversicolor): physiological and molecular data archive [Data set]. 2020. https://doi.org/10.5281/zenodo.3965975.
    10.5281/zenodo.3965975
  3. Madeira, Diana; Fernandes, Joana F.; Jerónimo, Daniel; Ricardo, Fernando; Santos, Andreia; Domingues, Maria Rosário; Calado, Ricardo. Whole-body proteome of the marine annelid Hediste diversicolor LC-MSMS [Data set].. 2020. http://proteomecentral.proteomexchange.org/cgi/GetDataset?ID=PXD020635.
Relatório
  1. Hany Alonso; Joaquim Teodósio; Joana Andrade; Domingos Leitão. 2019. O estado das aves em Portugal 2019.
    Pessoal de suporte
  2. Nuno Oliveira; Mariano Paracuellos; José R. Garrido; Juan C. Nevado; Paloma Peón Torre; Teresa Sánchez Corominas; Víctor M. Vásquez; et al. 2019. El Cormorán Moñudo en la Península Ibérica - Población reproductora en 2017 y método de censo.
    Pessoal de suporte
Resumo em conferência
  1. Nunes, Miguel; Moutinho Cabral, Inês; Cátia Gonçalves; Fernandes, Joana F.; Missionário, M.; Travesso, M. ; Grosso, Ana Rita; et al. Autor correspondente: Nunes, Miguel. "Goby fish populations in intertidal environments: gene networks and epigenetic regulators modulating energy metabolism in response to seasonal warming and local climate regimes.". Trabalho apresentado em International Conference for YOUNG Marine Researchers (ICYMARE), Bremerhaven, 2022.
Tese / Dissertação
  1. Fernandes, J. F.. "Thermal tolerance and acclimation capacity of the ragworm Hediste diversicolor under global change scenarios". Mestrado, Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, 2019. https://ria.ua.pt/handle/10773/28486.

Outros

Conjunto de dados
  1. Missionário, M. ; Fernandes, J. F.; Travesso, M. ; Freitas, E.; Calado, R.; Madeira, D.. Critical thermal maximum of male and female ditch shrimps (Palaemon varians) (2021). Zenodo.
    https://doi.org/10.5281/zenodo.5747164
Atividades

Apresentação oral de trabalho

Título da apresentação Nome do evento
Anfitrião (Local do evento)
2023/11/06 Profil lipidomique de la crevette nordique Pandalus borealis en réponse à l'acidification et le réchauffement océanique combinés dans plusieurs populations de l'Atlantique Nord-Ouest Réunion Annuelle du Réseau Aquatique Québec Fonds de Recherche Nature et Tecnologies Québec (FRQNT)
(Québec, Canadá)
2023/06 Ocean warming induces thermal tolerance plasticity but reduces reproductive output of marine amphipods: eco-evolutionary implications in a changing ocean EcoSummit 2023 Building a sustainable and desirable future: Adapting to a changing land and sea-scape, 13-17 June 2023 | Gold Coast, Australia
Elsevier (Gold Coast, Austrália)
2023/06 Multilayer molecular networks in fish adaptation to labile environments EcoSummit 2023 Building a sustainable and desirable future: Adapting to a changing land and sea-scape, 13-17 June 2023 | Gold Coast, Australia
Elsevier (Gold Coast, Austrália)
2022/09/16 Goby fish populations in intertidal environments: gene networks and epigenetic regulators modulating energy metabolism in response to seasonal warming and local climate regimes ICYMARE - International Conference for YOUNG Marine Researchers
(Bremerhaven, Alemanha)
2022/03/30 Polar lipidome of the commercial shrimp Pandalus borealis under a changing ocean 10th Workshop in Lipidomics – “Marine Lipidomics”
Mass Spectrometry Centre of the University of Aveiro, Portugal (Aveiro, Portugal)
2021/09/24 In depth characterization of the polar lipidome of the commercial shrimp Pandalus borealis ICYMARE - International Conference for YOUNG Marine Researchers
Bremen Society for Natural Sciences (Berlin, Alemanha)

Organização de evento

Nome do evento
Tipo de evento (Tipo de participação) 		Instituição / Organização
2022/09/28 - 2022/10/01 Main and local organizer of 3rd OYSTER EuroMarine Workshop at University of Aveiro, Portugal (2022/09/28)
Encontro (Presidente da Comissão Organizadora)
 EuroMarine - OYSTER (Orienting Young ScienTists of EuromaRine), França
2018 - 2018 Monitor at "Summer Academy" (2018) Universidade de Aveiro, Portugal
2016 - 2016 I National Meeting of Biology and Geology Students in University of Trás-os-Montes e Alto Douro (2016/04/15 - 2016/04/17)
Encontro (Membro da Comissão Organizadora)
 Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro, Portugal

Participação em evento

Descrição da atividade
Tipo de evento 		Nome do evento
Instituição / Organização
2021/09/20 - 2021/09/24 ICYMARE (International Conference for Young Marine Researchers), Berlin, Germany
Conferência
 ICYMARE (International Conference for Young Marine Researchers)
Bremen Society for Natural Sciences NWV, Alemanha
2019/09/24 - 2019/09/27 ICYMARE (International Conference for Young Marine Researchers) - Bremen, Germany
Conferência
Bremen Society for Natural Sciences NWV, Alemanha
2019/03/20 - 2019/03/20 Workshop in Lipidomics - Marine Lipids (8th edition)
Oficina (workshop)
Universidade de Aveiro, Portugal
2014 - 2016 Monitor at "Junior University"
Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro, Portugal
2015/03/26 - 2015/03/28 VII Genetics and Biotechnology Conference
Conferência
Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro, Portugal

Membro de associação

Nome da associação Tipo de participação
2023 - Atual ICONEC: International Carbon Ocean Network for Early Career Researchers from Global Ocean Acidification Observing Network Member
2015 - 2016 Biology and Geology Students Association (NEBIG-UTAD), University of Trás-os-Montes e Alto Douro Main coordinator of Board Assembly

Membro de comissão

Descrição da atividade
Tipo de participação 		Instituição / Organização
2022/01 - Atual Member of the Communication Team Committee in OYSTER (Orienting Young ScienTists of EuromaRine). OYSTER is an independent working group funded by the EuroMarine network. OYSTER is dedicated to promoting and supporting opportunities for Early Career Researchers (ECRs) in marine science.
Membro
 EuroMarine - OYSTER (Orienting Young ScienTists of EuromaRine), França

Tutoria

Tópico Nome do aluno
2016/09 - 2017/05 Voluntary program as mentor "Tutoring program of UTAD" Students from 1st year of Biology and Geology (UTAD)
Distinções

Prémio

2023 Conséquences de l'adaptation locale pour la tolérance physiologique et les réponses transgénérationnelles aux moteurs du changement global dans plusieurs populations le long d'un gradient sud-nord - 12,000 CAD$
Fonds de recherche du Québec Nature et technologies, Canadá
2023 Travel grant for the conference EcoSummit 2023 - Building a sustainable and desirable future: Adapting to a changing land and sea-scape, 13-17 June 2023 | Gold Coast, Australia, 500 euros.
Flying Sharks Consultoria e Inovação Lda, Portugal