Identification
            Personal identification
- Full name
 - FILIPE JOSÉ MENEZES MERGULHÃO
 
Citation names
- Mergulhão, Filipe
 
Author identifiers
- Ciência ID
 - E310-ABDE-8A70
 - ORCID iD
 - 0000-0001-5233-1037
 - Scopus Author Id
 - 6506782617
 
Websites
- https://sigarra.up.pt/feup/pt/func_geral.formview?p_codigo=403865 (Scholar)
 - lepabe.fe.up.pt/f_mergulhão (Professional)
 
Knowledge fields
- Natural sciences - Biological Sciences - Microbiology
 - Medical and Health Sciences - Medical Biotechnology - Biomaterials
 - Engineering and Technology - Industrial Biotechnology - Bioproducts Biomaterials
 
Languages
| Language | Speaking | Reading | Writing | Listening | Peer-review | 
|---|---|---|---|---|---|
| English | Intermediate (B1) | Intermediate (B1) | Intermediate (B1) | Intermediate (B1) | 
Education
            | Degree | Classification | |
|---|---|---|
| 
                                  2002 
                                 Concluded 
                               | 
                              Engenharia Química (Doutoramento)
                                  Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal 
                                 "Design of bacterial vector systems for the secretion of recombinant proteins" (THESIS/DISSERTATION) 
                               | 
                              Approved (maximum classification) | 
| 
                                  1998 
                                 Concluded 
                               | 
                              Engenharia Química (Licenciatura)
                                  Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal 
                               | 
                              16/20 | 
Affiliation
            Science
| Category Host institution  | 
                              Employer | |
|---|---|---|
| 2007 - Current | Researcher (Research) | Universidade do Porto Laboratorio de Engenharia de Processos Ambiente Biotecnologia e Energia, Portugal | 
Teaching in Higher Education
| Category Host institution  | 
                              Employer | |
|---|---|---|
| 2022/02/03 - Current | Associate Professor (University Teacher) | Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal | 
| 2005 - 2022 | Assistant Professor (University Teacher) | Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal | 
| 2016 - 2019 | Assistant Professor (University Teacher) | Universidade do Porto, Portugal | 
| 2013 - 2016 | Assistant Professor (University Teacher) | Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal | 
| 2012/02/15 - 2012/07/30 | Invited Assistant Professor (University Teacher) | Stanford University Department of Microbiology and Immunology, United States | 
| 2002 - 2003 | Assistant Professor (University Teacher) | Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias, Portugal | 
| 1998 - 1999 | Assistant (University Teacher) | Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal | 
Others
| Category Host institution  | 
                              Employer | |
|---|---|---|
| 2002 - 2005 | Post-doctoral fellow | Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal | 
| 2003 - 2003 | Post-doctoral fellow | Massachusetts Institute of Technology Department of Chemistry, United States | 
| 2003 - 2003 | Post-doctoral fellow | University of Cambridge, United Kingdom | 
| 1998 - 2002 | PhD fellow | Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal | 
| 2000 - 2000 | PhD fellow | Kungliga Tekniska Högskolan, Sweden | 
| 1997 - 1997 | Erasmus fellow | University of St Andrews School of Biology, United Kingdom | 
Projects
            Grant
| Designation | Funders | |
|---|---|---|
| 2010/06 - 2013/11 | Bioresist - The influence of biofilm phenotype on its resilience and resistance
                                 
                                  PTDC/EBB-EBI/105085/2008 
                                 Researcher
                                     
                              Universidade do Porto Laboratorio de Engenharia de Processos Ambiente Biotecnologia e Energia, Portugal 
                                 Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal  | 
                              Fundação para a Ciência e a Tecnologia
                                  Concluded 
                               | 
                           
| 2010/05 - 2013/11 | SYNBIOBACTHER - Synthetic biology approaches to engineer "therapeutic" bacteria
                                 
                                  PTDC/EBB-BIO/102863/2008 
                                 Researcher
                                     
                              Instituto de Biotecnologia e Bioengenharia, Portugal 
                                 Universidade do Minho, Portugal Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal  | 
                              Fundação para a Ciência e a Tecnologia
                                  Concluded 
                               | 
                           
| 2010/05 - 2013/10 | Filmstart - Initial conditions controlling the onset of biofilms
                                 
                                  PTDC/EBB-BIO/104940/2008 
                                 Principal investigator
                                     
                              Universidade do Porto Laboratorio de Engenharia de Processos Ambiente Biotecnologia e Energia, Portugal 
                                 Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal  | 
                              Fundação para a Ciência e a Tecnologia
                                  Concluded 
                               | 
                           
| 2007/07 - 2010/09 | The interaction between recombinant protein secretion and biofilm formation and stability
                                 
                                  PTDC/BIO/69092/2006 
                                 Principal investigator
                                     
                              Universidade do Porto Laboratorio de Engenharia de Processos Ambiente Biotecnologia e Energia, Portugal 
                                 Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal  | 
                              Fundação para a Ciência e a Tecnologia
                                  Concluded 
                               | 
                           
Contract
| Designation | Funders | |
|---|---|---|
| 2018/08/01 - Current | DelNam - Strengthening the Research Area of Delivery of Nucleic acid mimics (NAMS) into bacteria to fight the antibiotic crisis
                                   810685 
                                 810685 
                                 Researcher
                                     
                              Universidade do Porto Laboratorio de Engenharia de Processos Ambiente Biotecnologia e Energia, Portugal 
                                  | 
                              N/A
                                  Ongoing 
                               | 
                           
| 2017/01/01 - Current | PRINT-AID - Multidisciplinary european training network for development of personalized anti-infective medical devices combining
                                 printing technologies and antimicrobial functionality
                                  722467 
                                 Researcher
                                     
                              Universidade do Porto Laboratorio de Engenharia de Processos Ambiente Biotecnologia e Energia, Portugal 
                                  | 
                              
                                  Ongoing 
                               | 
                           
| 2023/03/01 - 2026/02/28 | Controlling bacteria and allergen contamination in the food industry using biomimetic surfaces
                                  2022.05314.PTDC 
                                 Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal 
                                  | 
                              Fundação para a Ciência e a Tecnologia
                                  Ongoing 
                               | 
                           
| 2023/03/01 - 2026/02/28 | Nanoengineered systems tailored with natural phytochemicals for biofouling mitigation on industrial surfaces
                                  2022.06149.PTDC 
                                 
                                 FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal 
                                 Associação do Instituto Superior Técnico para a Investigação e Desenvolvimento, Portugal Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal  | 
                              Fundação para a Ciência e a Tecnologia
                                  Ongoing 
                               | 
                           
| 2023/03/12 - 2024/09/11 | Análogo do sangue multidimensional para testes in vitro
                                  2022.08598.PTDC 
                                 
                                 Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal 
                                  | 
                              Fundação para a Ciência e a Tecnologia
                                  Ongoing 
                               | 
                           
| 2021/03/01 - 2024/02/29 | NanoCAT - Using modified carbon nanotubes to prevent biofilm formation in urinary catheters and stents
                                  PTDC/CTM-COM/4844/2020 
                                 
                                 Universidade do Porto Laboratorio de Engenharia de Processos Ambiente Biotecnologia e Energia, Portugal 
                                 Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal Universidade do Porto Laboratório de Processos de Separação e Reacção Laboratório de Catálise e Materiais, Portugal  | 
                              Fundação para a Ciência e a Tecnologia
                                  Ongoing 
                               | 
                           
| 2020/01/01 - 2023/12/31 | Laboratory for Process Engineering, Environment, Biotechnology and Energy
                                  UIDB/00511/2020 
                                 
                                 10.54499/UIDP/00511/2020 
                                 UIDP/00511/2020 
                                 Universidade do Porto Laboratorio de Engenharia de Processos Ambiente Biotecnologia e Energia, Portugal 
                                 Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal  | 
                              Fundação para a Ciência e a Tecnologia
                                  Concluded 
                               | 
                           
| 2020/03 - 2023/12 | SurfSafe - Surface modification to increase microbial SAFEty in the food industry
                                  952471 
                                 Principal investigator
                                     
                              Universidade do Porto Laboratorio de Engenharia de Processos Ambiente Biotecnologia e Energia, Portugal 
                                  | 
                              
                                  Ongoing 
                               | 
                           
| 2018/10/01 - 2022/05/31 | FIlmprot - The use of Escherichia coli biofilms for the production of recombinant proteins and other added-value compounds
                                  POCI-01-0145-FEDER-029589 
                                 PTDC/BII-BIO/29589/2017 
                                 Principal investigator
                                     
                              Universidade do Porto Laboratorio de Engenharia de Processos Ambiente Biotecnologia e Energia, Portugal 
                                 Universidade do Porto, Portugal Associação do Instituto Superior Técnico para a Investigação e Desenvolvimento, Portugal  | 
                              Fundação para a Ciência e a Tecnologia
                                  Ongoing 
                               | 
                           
| 2015/10/01 - 2020/06/30 | CVMar+i - Inovação industrial através de colaborações específicas entre empresas e centros de investigação no contexto de
                                 valorização biotecnológica marinha
                                  0302_CVMAR_I_1_P 
                                 Researcher
                                     
                              Universidade do Porto Laboratorio de Engenharia de Processos Ambiente Biotecnologia e Energia, Portugal 
                                  | 
                              
                                  Ongoing 
                               | 
                           
| 2019/01/01 - 2019/12/31 | Projeto Estratégico do LEPABE - Laboratório de Engenharia de Processos, Ambiente, Biotecnologia e Energia - Coordinator of
                                 the Biotechnology group
                                  UID/EQU/00511/2019  
                                 UID/EQU/00511/2019 
                                 Researcher
                                     
                              Universidade do Porto Laboratorio de Engenharia de Processos Ambiente Biotecnologia e Energia, Portugal 
                                  | 
                              N/A
                                  Concluded 
                               | 
                           
| 2016/04/01 - 2019/09/30 | LEPABE-2-ECO-INNOVATION - Coordinator of the Biotechnology group
                                  NORTE-01-0145-FEDER-000005 
                                 Researcher
                                     
                              Universidade do Porto Laboratorio de Engenharia de Processos Ambiente Biotecnologia e Energia, Portugal 
                                  | 
                              
                                  Concluded 
                               | 
                           
| 2015/10/02 - 2019/01/31 | Pomacea - Tecnologias económicas para controlo de (bio)fouling em membranas através da otimização de métodos de pré-tratamentos
                                 de limpeza
                                  INN-INDIGO/0001/2014 
                                 Researcher
                                    
                                  
                               | 
                              
                                  Concluded 
                               | 
                           
| 2015/10/02 - 2019/01/31 | Affordable technology for mitigation of membrane biofouling through optimization of pre-treatment and cleaning methods
                                  Inn-INDIGO/0001/2014 
                                 Universidade do Porto Laboratorio de Engenharia de Processos Ambiente Biotecnologia e Energia, Portugal 
                                 Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal  | 
                              Fundação para a Ciência e a Tecnologia
                                  Concluded 
                               | 
                           
| 2015/01/01 - 2018/12/31 | Projeto Estratégico - UID/EQU/00511/2013 - Coordinator of the Biotechnology group
                                  UID/EQU/00511/2013 - POCI-01-0145-FEDER-006939 
                                 Researcher
                                     
                              Universidade do Porto Laboratorio de Engenharia de Processos Ambiente Biotecnologia e Energia, Portugal 
                                  | 
                              
                                  Concluded 
                               | 
                           
| 2014/01/01 - 2015/12/31 | Programa Incentivo/EQB/UI0511/2014 - Coordinator of the Biotechnology group
                                  Incentivo/EQB/UI0511/2014 
                                 Researcher
                                     
                              Universidade do Porto Laboratorio de Engenharia de Processos Ambiente Biotecnologia e Energia, Portugal 
                                  | 
                              
                                  Concluded 
                               | 
                           
| 2013/07/01 - 2015/10/31 | Novomar - Consolidação do Centro Multipolar de Valorização de Recursos Marinhos visando novos usos do mar
                                  0687_NOVOMAR_1_P 
                                 Researcher
                                     
                              Universidade do Porto Laboratorio de Engenharia de Processos Ambiente Biotecnologia e Energia, Portugal 
                                  | 
                              
                                  Concluded 
                               | 
                           
| 2013/07 - 2015/08 | Phytodisinfectants - Disinfection of planktonic bacteria and biofilms in hospital settings with phytochemical products
                                 
                                  PTDC/DTP-SAP/1078/2012 
                                 Researcher
                                     
                              Universidade do Porto Laboratorio de Engenharia de Processos Ambiente Biotecnologia e Energia, Portugal 
                                 Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro, Portugal  | 
                              Fundação para a Ciência e a Tecnologia
                                  Concluded 
                               | 
                           
| 2014/01/01 - 2015/06/30 | (Bio) Chemical Engineering: Multi-Scale Approaches for Sustainable Environment and Health - Coordinator of the Biotechnology
                                 group
                                  NORTE-07-0124-FEDER-000025 
                                 Researcher
                                     
                              Universidade do Porto Laboratorio de Engenharia de Processos Ambiente Biotecnologia e Energia, Portugal 
                                  | 
                              
                                  Concluded 
                               | 
                           
| 2014/01/01 - 2015/06/30 | Chemical Engineering: Process Optimization and Energy Conversion - Coordinator of the Biotechnology Group
                                  NORTE-07-0124-FEDER-000026 
                                 Researcher
                                     
                              Universidade do Porto Laboratorio de Engenharia de Processos Ambiente Biotecnologia e Energia, Portugal 
                                  | 
                              
                                  Concluded 
                               | 
                           
| 2013/01/01 - 2014/12/31 | PROJECTO ESTRATÉGICO - UI 511 - 2013-2014 - Coordinator of the Biotechnology Group
                                  PEst-C/EQB/UI0511/2013 
                                 Researcher
                                     
                              Universidade do Porto Laboratorio de Engenharia de Processos Ambiente Biotecnologia e Energia, Portugal 
                                  | 
                              
                                  Concluded 
                               | 
                           
| 2012/01/01 - 2014/12/31 | Susclean - Sustainable Cleaning and Disinfection in Fresh-Cut Food Industries
                                  287514 
                                 Researcher
                                     
                              Universidade do Porto Laboratorio de Engenharia de Processos Ambiente Biotecnologia e Energia, Portugal 
                                  | 
                              
                                  Concluded 
                               | 
                           
| 2011/01/01 - 2013/12/31 | Strategic Project - UI 528 - 2011-2012
                                  PEst-OE/AGR/UI0528/2011 
                                 PEst-C/EQB/UI0511/2011 
                                 Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal 
                                 Universidade de Lisboa Centro de Investigação em Agronomia Alimentos Ambiente e Paisagem, Portugal Universidade do Porto Laboratorio de Engenharia de Processos Ambiente Biotecnologia e Energia, Portugal Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal  | 
                              Fundação para a Ciência e a Tecnologia
                                  Concluded 
                               | 
                           
| 2010/05/01 - 2013/10/30 | Fouling and cleaning of micro channels
                                  PTDC/EQU-FTT/105535/2008 
                                 
                                 Researcher
                                     
                              Universidade do Porto Centro de Estudos de Fenómenos de Transporte, Portugal 
                                 Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal  | 
                              Fundação para a Ciência e a Tecnologia
                                  Concluded 
                               | 
                           
| 2011/01/01 - 2012/12/31 | PROJECTO ESTRATÉGICO - UI 511 - 2011-2012
                                  FCOMP-01-0124-FEDER-022677 
                                 Researcher
                                     
                              Universidade do Porto Laboratorio de Engenharia de Processos Ambiente Biotecnologia e Energia, Portugal 
                                  | 
                              
                                  Concluded 
                               | 
                           
| 2009/04/01 - 2012/09/30 | Bridging Systems and Synthetic Biology for the development of Improved Microbial Cell Factories
                                  MIT-Pt/BS-BB/0082/2008 
                                 
                                 Researcher
                                     
                              Universidade do Minho, Portugal 
                                 Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal Instituto de Biologia Experimental e Tecnológica, Portugal Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal  | 
                              Fundação para a Ciência e a Tecnologia
                                  Concluded 
                               | 
                           
| 2002/10/01 - 2005/08/31 | PHYSIOLOGICAL ENGINEERING OF ESCHERICHIA COLI: APPLICATIONS IN GENE THERAPY AND RECOMBINANT PROTEIN PRODUCTION
                                  SFRH/BPD/9428/2002 
                                 University of Cambridge, United Kingdom 
                                  | 
                              Fundação para a Ciência e a Tecnologia
                                  Concluded 
                               | 
                           
| 1998/06/01 - 2002/05/31 | DESIGN DE SISTEMAS DE EXPRESSÃO GENÉTICA BACTERIANOS PARA A OPTIMIZAÇÃO DE PROCESSOS DE PURIFICAÇÃO DE PROTEÍNAS HUMANAS RECOMBINADAS
                                  PRAXIS XXI/BD/15841/98 
                               | 
                              Fundação para a Ciência e a Tecnologia
                                  Concluded 
                               | 
                           
Outputs
            Publications
| Book | 
                                 
  | 
                           
| Book chapter | 
                                 
  | 
                           
| Conference abstract | 
                                 
  | 
                           
| Conference poster | 
                                 
  | 
                           
| Journal article | 
                                 
  | 
                           
Other
| Other output | 
                                 
  | 
                           
Activities
            Supervision
| Thesis Title Role  | 
                              Degree Subject (Type) Institution / Organization  | 
                           |
|---|---|---|
| 2013/07/22 - Current | Evaluation of bacterial adhesion on carbon nanotube-poly (dimethysiloxane) composite materials 
                                  Supervisor 
                               | 
                              Bioengenharia (Master)
                                  Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal 
                               | 
                           
| 2013/07/08 - Current | Biofouling and cleaning of microchannels 
                                  Co-supervisor 
                               | 
                              Engenharia Química e Biológica (PhD)
                                  Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal 
                               | 
                           
| 2011/10/09 - Current | Biofilm control with antimicrobial agents: the role of the exopolymeric matrix 
                                  Co-supervisor 
                               | 
                              Engenharia Química e Biológica (PhD)
                                  Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal 
                               | 
                           
| 2019 - 2019 | Optimizing Recombinant Protein Production in Escherichia coli biofilms
                                  Supervisor 
                               | 
                              Engenharia Química e Biológica (PhD)
                                  Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal 
                               | 
                           
| 2019 - 2019 | Marine biofilm formed by coccoid cyanobacteria: Development and Control
                                  Supervisor 
                               | 
                              Engenharia Química e Biológica (PhD)
                                  Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal 
                               | 
                           
| 2019 - 2019 | Effects of Dedicated Yeasts as Starter Culture Candidates on the Microbial Community and Metabolite Profiles of Cocoa Pulp-Bean
                                 Mass Fermentation Processes
                                  Supervisor 
                               | 
                              Bioengenharia (Master)
                                  Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal 
                               | 
                           
| 2017 - 2017 | Estudo Comparativo de Métodos de Doseamento de Proteína em Preparações de Imunoglobulina Humana Intravenosa
                                  Supervisor 
                               | 
                              Engenharia Química (Master)
                                  Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal 
                               | 
                           
| 2017 - 2017 | Characterization of marine biofilms formed by filamentous cyanobacteria
                                  Supervisor 
                               | 
                              Engenharia Química e Biológica (PhD)
                                  Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal 
                               | 
                           
| 2017 - 2017 | Evaluation of Escherichia coli biofilms in controlled hydrodynamic conditions using flow cells
                                  Supervisor 
                               | 
                              Engenharia Química e Biológica (PhD)
                                  Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal 
                               | 
                           
| 2016 - 2016 | Cloning and expression of a new ketoreductase from the marine bacteria Virgibacillus pantothenticus
                                  Supervisor 
                               | 
                              Bioengenharia (Master)
                                  Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal 
                               | 
                           
| 2015 - 2015 | Avaliação da influência de células humanas e não-humanas no desenvolvimento de linhas celulares estáveis para produção de
                                 TribodyTM5
                                  Supervisor 
                               | 
                              Engenharia Química (Master)
                                  Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal 
                               | 
                           
| 2015 - 2015 | Marine biofilms - how do they start?
                                  Supervisor 
                               | 
                              Bioengenharia (Master)
                                  Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal 
                               | 
                           
| 2013 - 2013 | The effect of biofilm formation on recombinant protein expression 
                                  Supervisor 
                               | 
                              Engenharia Química e Biológica (PhD)
                                  Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal 
                               | 
                           
| 2012 - 2012 | Analysis of factors controlling the onset of bacterial biofilms 
                                  Supervisor 
                               | 
                              Engenharia Química e Biológica (PhD)
                                  Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal 
                               | 
                           
| 2011 - 2011 | The interaction between recombinant protein production and biofilm formation and stability 
                                  Supervisor 
                               | 
                              Engenharia Química e Biológica (PhD)
                                  Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal 
                               | 
                           
Distinctions
            Award
| 2011 | Fulbright Scholar Program
                                  Fulbright Association, United States 
                               | 
                           
