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Nícia Rosário-Ferreira, PURR.AI's Chief Scientific Officer, boasts a distinguished academic background with top honors from Portugal's leading universities. Transitioning from experimental to computational research during her PhD, she delved into protein interactions and GPCRs. Her involvement in various research projects and entrepreneurship programs, coupled with her role at PURR.AI, showcases her expertise in employing AI and computational techniques for groundbreaking discoveries in bioinformatics.
Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Nicia Filipa Rosário Ferreira

Nomes de citação

  • Rosário-Ferreira, Nicia

Identificadores de autor

Ciência ID
6D10-1944-94E3
ORCID iD
0000-0002-7225-9287

Endereços de correio eletrónico

  • nfferreira@cnc.uc.pt (Profissional)
  • nirferreira@gmail.com (Pessoal)

Websites

Domínios de atuação

  • Ciências Exatas - Ciências da Computação e da Informação - Bioinformática
  • Ciências Médicas e da Saúde - Biotecnologia Médica
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Bioquímica
  • Ciências Médicas e da Saúde - Medicina Básica - Toxicologia
  • Ciências Médicas e da Saúde - Outras Ciências Médicas - Ciência Forense

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Inglês Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1)
Português (Idioma materno)
Formação
Grau Classificação
2017/06/01 - 2023/04/16
Concluído
Química (Doutoramento)
Especialização em Química Biológica
Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal
"EXPLORING PROTEIN-PROTEIN AND PROTEIN-RNA INTERACTIONS IN INFLUENZA VIRUS’ NONSTRUCTURAL PROTEIN 1 (NS1)" (TESE/DISSERTAÇÃO)
2016
Concluído
Toxicologia Analítica, Clínica e Forense (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Farmácia, Portugal
"Hair Metabolomics Applied to Sex Differentiation" (TESE/DISSERTAÇÃO)
17
2016
Concluído
Toxicologia Analítica Clínica e Forense (Mestrado)
Especialização em Sem especialização
Universidade do Porto Faculdade de Farmácia, Portugal
"Hair Metabolomics Applied to Gender Differentiation" (TESE/DISSERTAÇÃO)
2014
Concluído
Ciências Forenses e Criminais (Licenciatura)
Instituto Universitário de Ciências da Saúde, Portugal
"Análise Diferencial Por Sexo em Cabelo: Abordagens Passadas e Perspetivas Futuras" (TESE/DISSERTAÇÃO)
14
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento
Empregador
2023/06/15 - Atual Investigador Contratado (Investigação) Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal
2021/08/05 - 2022/11/04 Investigador Contratado (Investigação) Universidade de Coimbra Centro de Inovação em Biomedicina e Biotecnologia, Portugal

Cargos e Funções

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento
Empregador
2023/08/17 - Atual CSO PURR.AI, Portugal
Projetos

Projeto

Designação Financiadores
2021/02/01 - 2024/01/31 Descoberta do Interactoma vírus-hospedeiro: uma abordagem guiada por AI e dados multi-ómicos <br>
DSAIPA/DS/0118/2020
Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal

CNC.IBILI, Portugal

Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal

Associação do Instituto Superior Técnico para a Investigação e Desenvolvimento, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2018/09/03 - 2022/03/04 Proteínas Membranares - desenvolvimento de novas técnicas de modelação computacional e sua aplicação ao estudo dos recetores acoplados a proteína G
PTDC/QUI-OUT/32243/2017
Associação do Instituto Superior Técnico para a Investigação e Desenvolvimento, Portugal

Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2018/06/15 - 2021/12/14 Aplicação de Deep Learning ao processo de investigação de novas drogas anticancerígenas
PTDC/CCI-BIO/31356/2017
Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal

Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Tecnologia e Ciência, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2018/08/01 - 2021/07/31 Novos antivirais contra Influenza: validação do alvo NS1 e descoberta de compostos líder
PTDC/QUI-OUT/32572/2017
Universidade de Coimbra, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído

Outro

Designação Financiadores
2022/12/01 - 2023/11/30 Molecular-level understanding of receptor binding of engineered high-density lipoprotein particles that chaperone bioactive lipid mediator sphingosine 1-phosphate (S1P)
MCB220005P
Investigador
Em curso
Produções

Publicações

Artigo em revista
  1. Catarina Marques-Pereira; Manuel N. Pires; Raquel P. Gouveia; Nádia N. Pereira; Ana B. Caniceiro; Nícia Rosário-Ferreira; Irina S. Moreira. "SARS-CoV-2 Membrane Protein: From Genomic Data to Structural New Insights". International Journal of Molecular Sciences 23 6 (2022): 2986-2986. https://doi.org/10.3390/ijms23062986.
    10.3390/ijms23062986
  2. Nícia Rosário-Ferreira; Alexandre M. J. J. Bonvin; Irina S. Moreira. "Using machine-learning-driven approaches to boost hot-spot's knowledge". WIREs Computational Molecular Science (2022): https://doi.org/10.1002/wcms.1602.
    10.1002/wcms.1602
  3. Bueschbell, Beatriz; Caniceiro, Ana Beatriz; Suzano, Pedro M.S.; Machuqueiro, Miguel; Rosário-Ferreira, Nícia; Moreira, Irina S.. "Network biology and artificial intelligence drive the understanding of the multidrug resistance phenotype in cancer". Drug Resistance Updates 60 (2022): 100811. http://dx.doi.org/10.1016/j.drup.2022.100811.
    10.1016/j.drup.2022.100811
  4. Nícia Rosário-Ferreira; Salete J. Baptista; Carlos A. V. Barreto; Filipe E. P. Rodrigues; Tomás F. D. Silva; Sara G. F. Ferreira; João N. M. Vitorino; et al. "In Silico End-to-End Protein–Ligand Interaction Characterization Pipeline: The Case of SARS-CoV-2". ACS Synthetic Biology (2021): https://doi.org/10.1021/acssynbio.1c00368.
    10.1021/acssynbio.1c00368
  5. Rosário-Ferreira, Nícia; Guimarães, Victor; Costa, Vítor S.; Moreira, Irina S.. "SicknessMiner: a deep-learning-driven text-mining tool to abridge disease-disease associations". BMC Bioinformatics 22 1 (2021): http://dx.doi.org/10.1186/s12859-021-04397-w.
    10.1186/s12859-021-04397-w
  6. Nícia Rosário-Ferreira; Catarina Marques-Pereira; Manuel Pires; Daniel Ramalhão; Nádia Pereira; Victor Guimarães; Vítor Santos Costa; Irina Sousa Moreira. "The Treasury Chest of Text Mining: Piling Available Resources for Powerful Biomedical Text Mining". BioChem 1 2 (2021): 60-80. https://doi.org/10.3390/biochem1020007.
    10.3390/biochem1020007
  7. Nícia Rosário-Ferreira; António J. Preto; Melo R.; Irina Moreira; Rui M. M. Brito. "The Central Role of Non-Structural Protein 1 (NS1) in Influenza Biology and Infection". International Journal of Molecular Sciences (2020): https://www.mdpi.com/1422-0067/21/4/1511.
    10.3390/ijms21041511
Capítulo de livro
  1. Piochi, L.F.; Gaspar, A.T.; Rosário-Ferreira, N.; Preto, A.J.; Moreira, I.S.. "From single-omics to interactomics: How can ligand-induced perturbations modulate single-cell phenotypes?". In Advances in Protein Chemistry and Structural Biology, 45-83. Elsevier, 2022.
    10.1016/bs.apcsb.2022.05.006
  2. Rosário-Ferreira, Nícia; Marques-Pereira, Catarina; Gouveia, Raquel P.; Mourão, Joana; Moreira, Irina S.. "Guardians of the Cell: State-of-the-Art of Membrane Proteins from a Computational Point-of-View". In Computational Design of Membrane Proteins, 3-28. Springer US, 2021.
    10.1007/978-1-0716-1468-6_1
  3. Preto, A.J.; Marques-Pereira, C; Baptista, Salete J.; Bueschbell, B.; Barreto, Carlos A.V.; Gaspar, A.T.; Pinheiro, I.; et al. "Targeting GPCRs Via Multi-Platforms Arrays and AI". In Reference Module in Biomedical Sciences. Elsevier, 2021.
    10.1016/b978-0-12-820472-6.00048-7
Poster em conferência
  1. Rosário-Ferreira, Nicia; Melo, Rita; Moreira, Irina S; Rui M M Brito. "NS1 dimer behavior through a Molecular Dynamics lens". Trabalho apresentado em Coimbra Chemistry Centre Day, 2021.
  2. Rosário-Ferreira, Nicia; Guimarães, Victor; Costa, Vítor; Moreira, Irina S. "Boosting network biology using a cutting-edge text-mining approach". Trabalho apresentado em Network Biology, 2021.
  3. Rosário-Ferreira, Nicia; Melo, Rita; Moreira, Irina S; Rui M M Brito. "A molecular Dynamics study of non-structural protein1 (NS1)". Trabalho apresentado em Encontro de Jovens Investigadores de Biologia Computacional Estrutural, 2019.
  4. Rosário-Ferreira, Nicia; Melo, Rita; Moreira, Irina S; Rui M M Brito. "A molecular Dynamics study of non-structural protein1 (NS1)". Trabalho apresentado em Advances in Computational Biology Conference – Fostering Collaboration Among Women Scientists, 2019.
  5. Rosário-Ferreira, Nicia; Melo, Rita; Moreira, Irina S; Rui M M Brito. "Understanding the role of the non-structural protein I in the pathogenicity of influenza virus using a computational approach". Trabalho apresentado em Structural Bioinformatics Course, 2019.
  6. Rosário-Ferreira, Nicia; Melo, Rita; Moreira, Irina S; Rui M M Brito. "An integrative approach to understand protein plasticity – The case of non-structural protein 1 from the influenza virus". Trabalho apresentado em PTNMR Satellite Meeting, 2019.
  7. Rosário-Ferreira, Nicia; Melo, Rita; Moreira, Irina S; Rui M M Brito. "A Molecular Dynamics Insight to Non-Structural Protein 1 (NS1) – A Hub Protein Essential for Influenza Infection.". Trabalho apresentado em 4th Instruct Biennial Structural Biology Conference, 2019.
  8. Rosário-Ferreira, Nicia; Melo, Rita; Moreira, Irina S; Rui M M Brito. "Outline of a Molecular Dynamics Approach to Non- Structural Protein 1 (NS1) – A Hub Protein essential for Influenza Infection". Trabalho apresentado em Encontro de Jovens Investigadores de Biologia Computacional Estrutural, 2018.
Tese / Dissertação
  1. Nícia Filipa Rosário Ferreira. "Hair Metabolomics Applied to Gender Differentiation". Mestrado, 2016. https://repositorio-aberto.up.pt/handle/10216/86299.

Outros

Outra produção
  1. Arrestin and G Protein Interactions with GPCRs: A Structural Perspective. 2022. Carlos A.V. Barreto; Salete J. Baptista; Beatriz Bueschbell; Pedro R. Magalhães; António J. Preto; Agostinho Lemos; Nícia Rosário-Ferreira; et al. http://dx.doi.org/10.1002/9781119564782.ch5.
    10.1002/9781119564782.ch5
Atividades

Curso / Disciplina lecionado

Disciplina Curso (Tipo) Instituição / Organização
2021 - Atual Network and System Biology Biologia Celular e Molecular (Mestrado integrado) Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal
2020/02 - Atual Biomedical Text-Mining Biologia Celular e Molecular (Mestrado integrado) CNC.IBILI, Portugal
2020 - Atual Biomedical Text-Mining PDBBEB - PhD Programme in Experimental Biology and Biomedicine (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal

CNC.IBILI, Portugal

Entrevista (jornal / revista)

Descrição da atividade Jornal / Forum
2022/01 Proteína de membrana SARS-CoV-2: de dados genómicos a novos conhecimentos estruturais EuroCC Portugal
2021/10 Projeto sobre doenças neurológicas vence prémio da Agência Nacional de Inovação
Distinções

Prémio

2023 RCE+ awards five awards to young entrepreneurship projects
Região de Coimbra Empreende+, Portugal, Portugal
2023 Ineo start Acceleration Program
Instituto Pedro Nunes, Portugal
2021 Born from Knowledge 2021 "Health and Wellbeing"
Agência Nacional de Inovação SA, Portugal
2017 PhD Fellowship
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
2014 Melhor Aluna da Licenciatura 2014
Instituto Universitário de Ciências da Saúde, Portugal

Outra distinção

2024 InvestEU Portal e-Pitch – Women entrepreneurs – one of the five selected at the European level.
Bpifrance, França
2022 BfK Acceleration Program: INNOV@RISE
Agência Nacional de Inovação SA, Portugal
2022 Selected for HiTech 2022 program