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Biologist with Emphasis on Genetics from Universidad del Valle (Colombia), carried out master and PhD studies at the Laboratory of Genome Structure and Function at Tokyo Institute of Technology in Japan, and a Doctoral internship at The Japanese Foundation for Cancer Research. In 2013 receives the International Fellowship for Women in Science from UNESCO and L’Oreal Foundation, with which conducted postdoc studies at the Laboratory of Chromosome Biology at Instituto Gulbenkian de Ciência and at the Laboratory of Disease Transcriptomics at Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes in Portugal. In 2017 is selected as finalist for the Innovation Boot Camp: RNA Splicing in Cancer organized by BioMed X Institute in Heidelberg, Germany, and invited to participate in a 4-year funded research team sponsored by the pharmaceutical Merck. Currently continue her association to BioMed X, Merck and iMM as consultant bioinformatics researcher. Lina Marcela Gallego-Paez published 5 articles in peer-reviewed journals, one review for the Encyclopedia of Life Sciences and three online computational resources in the field of cancer transcriptomics.
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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Lina Marcela Gallego Páez

Nomes de citação

  • Páez, Lina
  • Lina Marcela Gallego-Paez

Identificadores de autor

Ciência ID
5C1E-0C03-E7F4
ORCID iD
0000-0003-0255-8131

Endereços de correio eletrónico

  • lina.paez@nms.unl.pt (Profissional)

Telefones

Telefone
  • 218 803 00 Ext.: 26058 (Profissional)

Moradas

  • Campo dos Mártires da Pátria 130, 1169-056, Lisboa, Lisboa, Portugal (Profissional)

Websites

Domínios de atuação

  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia Molecular

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Espanhol; Castelhano (Idioma materno)
Português Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2)
Inglês Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2)
Alemão Utilizador elementar (A2) Utilizador elementar (A2) Utilizador elementar (A2) Utilizador elementar (A2) Utilizador elementar (A2)
Japonês Utilizador elementar (A2) Utilizador elementar (A2) Utilizador elementar (A2) Utilizador elementar (A2) Utilizador elementar (A2)
Formação
Grau Classificação
2014/06/01 - 2015/12/15
Concluído
 Environmental, Medical and Scientific Communication (Master Universitario)
Especialização em Science Communication
Universitat Pompeu Fabra, Espanha
 Do not apply (studies abroad)
2009/04/01 - 2014/03/26
Concluído
 Biological Sciences (Doctor of Philosophy)
Especialização em Genome Structure And Function - Tokyo Institute of Technology
Tokyo Kogyo Daigaku - Suzukakedai Gakuen, Japão
"Functional analysis of Smc5/6 Complex in Human cells" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 Do not apply (studies abroad)
2007/10/01 - 2009/03/31
Concluído
 Biological Sciences (Master)
Especialização em Genome Structure And Function - Tokyo Institute of Technology
Tokyo Kogyo Daigaku - Suzukakedai Gakuen, Japão
"Chromosomal localization of the condensin complex in Drosophila melanogaster" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 Do not apply (studies abroad)
2006/02/18 - 2006/08/19
Concluído
 University Pedagogy (Postgraduate Certificate)
Universidad Libre - Campus Cali, Colômbia
 Do not apply (studies abroad)
2000/08/01 - 2005/12/15
Concluído
 Biologia (Bachelor)
Especialização em Genética
Universidad del Valle, Colômbia
"Frequency of microdeletions in the long arm of Y-chromosome in idiopathic oligozoospermia and azoospermia patients in South-West Colombia" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 Do not apply (studies abroad)
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2023/03/01 - Atual Gestão de Ciência e Tecnologia Universidade NOVA de Lisboa NOVA Medical School, Portugal
Universidade NOVA de Lisboa NOVA Medical School, Portugal
2022/03/01 - 2023/02/28 Investigador Contratado (Investigação) BioMed X GmbH, Alemanha
BioMed X GmbH, Alemanha
2022/02/01 - 2023/02/28 Investigador Contratado (Investigação) Universidade de Lisboa Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes, Portugal
Universidade de Lisboa Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes, Portugal
2022/01/03 - 2023/01/31 Investigador Contratado (Investigação) Merck KGaA, Alemanha
Merck KGaA, Alemanha
2018/04/01 - 2021/11/26 Investigador Contratado (Investigação) BioMed X GmbH, Alemanha
BioMed X GmbH, Alemanha
2015/06/15 - 2018/03/20 Pós-doutorado (Investigação) Universidade de Lisboa Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes, Portugal
Universidade de Lisboa Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes, Portugal
2014/04/01 - 2015/05/31 Pós-doutorado (Investigação) Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal
Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal
2013/04/01 - 2014/03/31 Assistente de Investigação (carreira) (Investigação) Ganken Ariake Byoin Masuika, Japão
Ganken Ariake Byoin Masuika, Japão
2012/04/01 - 2013/03/31 Assistente de Investigação (carreira) (Investigação) Tokyo Daigaku, Japão
Tokyo Daigaku, Japão
Produções

Publicações

Artigo em revista
  1. Esperança-Martins, Miguel; Melo-Alvim, Cecília; Dâmaso, Sara; Lopes-Brás, Raquel; Peniche, Tânia; Nogueira-Costa, Gonçalo; Abreu, Catarina; et al. "Breast Sarcomas, Phyllodes Tumors, and Desmoid Tumors: Turning the Magnifying Glass on Rare and Aggressive Entities". Cancers 15 15 (2023): 3933. http://dx.doi.org/10.3390/cancers15153933.
    Publicado • 10.3390/cancers15153933
  2. Gomes, Inês; Gallego-Paez, Lina M.; Jiménez, Maria; Santamaria, Patricia G.; Mansinho, André; Sousa, Rita; Abreu, Catarina; et al. "Co-targeting RANK pathway treats and prevents acquired resistance to CDK4/6 inhibitors in luminal breast cancer". Cell Reports Medicine 4 8 (2023): 101120. http://dx.doi.org/10.1016/j.xcrm.2023.101120.
    10.1016/j.xcrm.2023.101120
  3. Lina M. Gallego-Paez; William J.S. Edwards; Manasa Chanduri; Yanyu Guo; Thijs Koorman; Chieh-Yu Lee; Nina Grexa; et al. "TLN1 contains a cancer-associated cassette exon that alters talin-1 mechanosensitivity". Journal of Cell Biology (2023): https://doi.org/10.1083/jcb.202209010.
    10.1083/jcb.202209010
  4. Raquel Lopes-Brás; Dolores Lopez-Presa; Miguel Esperança-Martins; Cecília Melo-Alvim; Lina Gallego; Luís Costa; Isabel Fernandes. "Genomic Profiling of Sarcomas: A Promising Weapon in the Therapeutic Arsenal". International Journal of Molecular Sciences (2022): https://doi.org/10.3390/ijms232214227.
    10.3390/ijms232214227
  5. Lina M. Gallego-Paez; Jan Mauer. Autor correspondente: Lina M. Gallego-Paez. "DJExpress: An integrated application for differential splicing analysis and visualization". Frontiers in Bioinformatics (2022): https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fbinf.2022.786898/full.
    Publicado
  6. Raquel Cruz-Duarte; Catia Rebelo de Almeida; Magda Negrao; Afonso Fernandes; Paula Borralho; Daniel Sobral; Lina M. Gallego-Paez; et al. Autor correspondente: Marta Martins. "Predictive and Therapeutic Implications of a Novel PLCg1/SHP2-Driven Mechanism of Cetuximab Resistance in Metastatic Colorectal Cancer". CLINICAL CANCER RESEARCH | TRANSLATIONAL CANCER MECHANISMS AND THERAPY (2021):
    Acesso aberto • Publicado
  7. Gallego-Paez LM; Bordone MC; Leote AC; Saraiva-Agostinho N; Ascensão-Ferreira M; Barbosa-Morais NL. "Alternative splicing: the pledge, the turn, and the prestige : The key role of alternative splicing in human biological systems.". (2017): http://europepmc.org/abstract/med/28374191.
    10.1007/s00439-017-1790-y
  8. Sreerama Chaitanya Sridhara; Sílvia Carvalho; Ana Rita Grosso; Lina Marcela Gallego-Paez; Maria Carmo-Fonseca; Sérgio Fernandes de Almeida. "Transcription Dynamics Prevent RNA-Mediated Genomic Instability through SRPK2-Dependent DDX23 Phosphorylation". Cell Reports 18 2 (2017): 334-343. https://doi.org/10.1016%2Fj.celrep.2016.12.050.
    10.1016/j.celrep.2016.12.050
  9. Gallego-Paez LM; Tanaka H; Bando M; Takahashi M; Nozaki N; Nakato R; Shirahige K; Hirota T. "Smc5/6-mediated regulation of replication progression contributes to chromosome assembly during mitosis in human cells.". (2014): http://europepmc.org/abstract/med/24258023.
    10.1091/mbc.e13-01-0020
Recurso online
  1. Lina Marcela Gallego-Paez; Jan Mauer. Autor correspondente: Lina Marcela Gallego-Paez. DJExpress R package. 2021. https://github.com/MauerLab/DJExpress.
  2. Lina Marcela Gallego-Paez; Jan Mauer. Autor correspondente: Lina Marcela Gallego-Paez. DJEC DB. 2021. https://gitlab.com/mauerlabrsc/djecdb.
  3. Saraiva-Agostinho, Nuno; Nuno Luís Barbosa-Morais; André Falcão; Lina Marcela Gallego-Paez; Marie Bordone; Teresa Maia; Mariana Ferreira; Ana Carolina Leote; Bernardo de Almeida. Autor correspondente: Saraiva-Agostinho, Nuno. psichomics: graphical Interface for Alternative Splicing Quantification, Analysis and Visualisation. 2018. https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/psichomics.html.

Outros

Outra produção
  1. Mitosis and Meiosis: Molecular Control of Chromosome Separation. 2001. Kota Nagasaka; Lina M Gallego-Paez; Toru Hirota. http://dx.doi.org/10.1002/9780470015902.a0005917.pub2.
    10.1002/9780470015902.a0005917.pub2
Atividades

Orientação

Título / Tema
Papel desempenhado 		Curso (Tipo)
Instituição / Organização
2021 - 2021 Functional characterization of cancer splicing aberrations
Coorientador
 Master program in Molecular Biosciences (Mestrado)
Universität Heidelberg Zentrum für Molekulare Biologie, Alemanha

BioMed X GmbH, Alemanha
2018 - 2021 Pharmacological inhibition of RNA splicing promotes presentation of cryptic neoepitopes
Coorientador
BioMed X GmbH, Alemanha

Universität Heidelberg Zentrum für Molekulare Biologie, Alemanha
2019/09/16 - 2020/01/31 Reporter model to investigate mTORC1-mediated translation of the mis-spliced ribosomal protein isoforms
Coorientador
 Internship for the Master program in Molecular Biosciences (Iniciação científica)
Universität Heidelberg Zentrum für Molekulare Biologie, Alemanha

BioMed X GmbH, Alemanha
2017 - 2018 Alternative Splicing of EXOC7 in Colorectal Cancer Development
Coorientador
 Mestrado em Genética Molecular e Biomedicina (Mestrado)
Faculdade de Ciência e Tecnologias da Universidade Nova de Lisboa, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes, Portugal

Organização de evento

Nome do evento
Tipo de evento (Tipo de participação) 		Instituição / Organização
2017/01/16 - 2017/01/16 Gender Balance in Science Debate: Inside research, around researchers (2017/01/16 - 2017/01/16)
Mesa-redonda (Membro da Comissão Organizadora)
 Universidade de Lisboa Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes, Portugal

Participação em evento

Descrição da atividade
Tipo de evento 		Nome do evento
Instituição / Organização
2015/11/26 - 2015/11/26 Talk on Biotech Research in Japan and Europe at "Heroes Fest 2015". This is the most important festival of entrepreneurship and innovation in Colombia, organised by the Ministry of Commerce, Industry and Tourism.
Festival
 Heroes Fest
Colombian Ministry of Commerce, Industry and Tourism., Colômbia

Entrevista / Programa (rádio / tv)

Programa Tema
2021/01/30 - 2021/01/30 Interview for the podcast: Success Across Boundaries . The podcast features stories of expats who have successfully worked up the ladder while navigating foreign countries and systems. Their success stories serve as the learning for those who aspire to become global citizens. Women in STEM
Distinções

Prémio

2013 UNESCO-L'Oreal International Fellowship “For Women in Science”
United Nations Educational Scientific and Cultural Organization, França

Fondation L'Oréal, França
2012 Dean's Poster Award at The Research Achievements of GCOE (Global Center of Excellence) Program
Tokyo Daigaku, Japão
2011 Best Oral Presentation at the Annual Meeting of the Institute of Molecular and Cellular Biosciences
Tokyo Daigaku, Japão
2011 Prize for the PLOS Genetics Young Scientist Prize for Best Poster Presentation at the 18th International Chromosome Conference
The University of Manchester, Reino Unido
2008 DCW Award for outstanding results at the “Directed Collaboration Works” Course, Graduate School of Bioscience and Biotechnology
Tokyo Kogyo Daigaku - Suzukakedai Gakuen, Japão
2007 National Prize of Genetics and Biotechnology, for the research “Factores Genéticos Asociados a Infertilidad Masculina: Microdeleciones del Cromosoma Y, Mutación F508 (Genetic factors associated to Male Infertility: Microdeletions on the Y-Chromosome and F
Asociación Colombiana de Ciencias Biológicas, Colômbia

Outra distinção

2017 Selected Candidate from the Innovation boot camp: RNA Splicing in Cancer
BioMed X GmbH, Alemanha

Merck KGaA, Alemanha