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Biotechnology Researcher with expertise in metabolic engineering and a passion for synthetic biology. Specialized in manipulating yeast metabolism, particularly in the efficient production of fatty acids and metabolizing xylose. Extensive experience in academic research, complemented by several national and international collaborations with experts in the field. Demonstrated expertise in teaching, mentoring, and scientific writing. Effective communication skills and proactive engagement in outreach activities.
Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Paulo César Silva

Nomes de citação

  • Silva, Paulo César

Identificadores de autor

Ciência ID
021F-4CDA-2630
ORCID iD
0000-0002-0931-8432

Websites

Domínios de atuação

  • Ciências da Engenharia e Tecnologias - Biotecnologia Industrial
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia Molecular
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Bioquímica
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Microbiologia
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Português Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2)
Inglês Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1)
Formação
Grau Classificação
2024/02/26
Concluído
 Biologia (Doutoramento)
Especialização em Sem especialidade
Universidade do Minho, Portugal
"Metabolic engineering of sustainable branched chained unsaturateed fatty acid production in Saccharomyces Cerevisiae" (TESE/DISSERTAÇÃO)
2018
Concluído
 Genética Molecular (Mestrado)
Especialização em Sem especialização
Universidade do Minho, Portugal
"The yeast DEL assay with dominant genetic markers" (TESE/DISSERTAÇÃO)
2015
Concluído
 Biologia Aplicada (Licenciatura)
Universidade do Minho Escola de Ciências, Portugal
"n/a" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 17
Percurso profissional

Docência no Ensino Superior

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2024/09/01 - Atual Professor Auxiliar Convidado (Docente Universitário) Universidade do Minho, Portugal
Universidade do Minho Centro de Biologia Molecular e Ambiental, Portugal
Projetos

Projeto

Designação Financiadores
2018/10/01 - 2022 FatVal: Production of high value fatty acids and derived molecules from inexpensive carbon sources using recombinant robust industrial strain of Saccharomyces cerevisiae.
PTDC/EAM-AMB/32506/2017
Bolseiro de Doutoramento
Universidade do Minho Centro de Biologia Molecular e Ambiental, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
Produções

Publicações

Artigo em conferência
  1. Silva, Paulo César; Ceja-Navarro, Javier A.; Azevedo, Flávio Humberto Torres Dias Feio; Karaoz, Ulas; Brodie, Eoin L.; Johansson, Björn. Autor correspondente: Silva, Paulo César. "A novel D-xylose isomerase: from the gut of a wood feeding beetle for improved conversion in Saccharomyces cerevisiae". Trabalho apresentado em Biocatalysis Open Day, 2020.
Artigo em revista
  1. Paulo César Silva; Björn Johansson. "Cell factories for sustainable production of valuable chemicals – the pivotal role of Saccharomyces cerevisiae". Journal UMinho Science (2024): http://dx.doi.org/10.21814/jus.5268.
    10.21814/jus.5268
  2. Tatiana A. Pozdniakova; João P. Cruz; Paulo César Silva; Flávio Azevedo; Pier Parpot; Maria Rosario Domingues; Magnus Carlquist; Björn Johansson. "Optimization of a hybrid bacterial/Arabidopsis thaliana fatty acid synthase system II in Saccharomyces cerevisiae". Metabolic Engineering Communications (2023): http://dx.doi.org/10.1016/j.mec.2023.e00224.
    10.1016/j.mec.2023.e00224
  3. Nina Muratovska; Paulo Silva; Tatiana Pozdniakova; Humberto Pereira; Carl Grey; Björn Johansson; Magnus Carlquist. "Towards engineered yeast as production platform for capsaicinoids". Biotechnology Advances (2022): http://dx.doi.org/10.1016/j.biotechadv.2022.107989.
    10.1016/j.biotechadv.2022.107989
  4. Silva, Paulo César; Ceja-Navarro, Javier A.; Azevedo, Flávio; Karaoz, Ulas; Brodie, Eoin L.; Johansson, Björn. "A novel d-xylose isomerase from the gut of the wood feeding beetle Odontotaenius disjunctus efficiently expressed in Saccharomyces cerevisiae". Scientific Reports 11 1 (2021): http://dx.doi.org/10.1038/s41598-021-83937-z.
    Publicado • 10.1038/s41598-021-83937-z
  5. Silva, Paulo César; Domingues, Lucília; Collins, Tony; Oliveira, Rui; Johansson, Björn. "Quantitative assessment of DNA damage in the industrial ethanol production strain Saccharomyces cerevisiae PE-2". FEMS Yeast Research 18 8 (2018): http://dx.doi.org/10.1093/femsyr/foy101.
    10.1093/femsyr/foy101
Capítulo de livro
  1. Humberto Pereira; Paulo César Silva; Björn Johansson. "Bacteria and Yeast Colony PCR". 2023.
    10.1007/978-1-0716-3358-8_17
Poster em conferência
  1. Pozdniakova, Tatiana; Azevedo, Flávio; Pereira, Humberto; Silva, Paulo César; Johansson, Björn. "Fatty acid biosynthesis by Saccharomyces cerevisiae with a type II fatty acid synthase". Trabalho apresentado em 3rd BioIberoAmerica, 2022.
  2. Silva, Paulo César; Pereira, Humberto; Johansson, Björn. Autor correspondente: Silva, Paulo César. "Expression of a branched-chain a-ketoacid dehydrogenase (BCKDH) from a non-conventional yeast in Saccharomyces cerevisiae". Trabalho apresentado em 15th International Conference on Yeasts, 2021.
  3. Silva, Paulo César; Ceja-Navarro, Javier A.; Azevedo, Flávio Humberto Torres Dias Feio; Karaoz, Ulas; Brodie, Eoin L.; Johansson, Björn. Autor correspondente: Silva, Paulo César. "Functional screening for novel D-xylose isomerases from the gut of a wood feeding beetle reveals efficient expression in Saccharomyces cerevisiae". 2020.
  4. Silva, Paulo César; Ceja-Navarro, Javier; Azevedo, Flávio Humberto Torres Dias Feio; Karaoz, Ulas; Brodie, Eoin L.; Johansson, Björn. "A novel D-xylose isomerase from the gut of the wood feeding patent-leather beetle Odontotaenius disjunctus". Trabalho apresentado em 7th Conference on Physiology of Yeast and Filamentous Fungi, 2019.
  5. Pereira, Humberto; Silva, Paulo César; Azevedo, Flávio Humberto Torres Dias Feio; Johansson, Björn. "Functional expression of Yarrowia lipolytica acetyl- CoA carboxylase in Saccharomyces cerevisiae". Trabalho apresentado em 5th Applied Synthetic Biology in Europe, 2019.
Pré-impressão
  1. Humberto Pereira; Paulo César Silva; Mikel Davis; Louis Abraham; Gyorgy Babnigg; Henrik Bengtsson; Björn Johansson. "SEGUID v2: Extending SEGUID checksums for circular, linear, single- and double-stranded biological sequences". 2024. http://dx.doi.org/10.1101/2024.02.28.582384.
    10.1101/2024.02.28.582384
Resumo em conferência
  1. Silva, Paulo César; Pereira, Humberto; Pozdniakova, Tatiana; Johansson, Björn. Autor correspondente: Silva, Paulo César. "Bacterial branched-chain a-ketoacid dehydrogenase (BCKDH) expresses efficiently in Saccharomyces cerevisiae". Braga, 2021.
    Publicado
Tese / Dissertação
  1. Silva, Paulo César. "The Yeast DEL Assay With Dominant Genetic Markers". Mestrado, Universidade do Minho Escola de Ciências, 2018. http://repositorium.sdum.uminho.pt/handle/1822/55873.

Propriedade Intelectual

Patente
  1. Silva, Paulo César; Ceja-Navarro, Javier A.; Brodie, Eoin L.; Johansson, Björn. 2020. "A novel xylose isomerase gene and polypeptide and uses".
    Pendente
  2. Ceja-Navarro, Javier A.; Silva, Paulo César; Johansson, Björn; Brodie, Eoin L.. 2020. "A novel xylose isomerase gene and polypeptide and uses thereof". Estados Unidos.
    Pendente
Atividades

Apresentação oral de trabalho

Título da apresentação Nome do evento
Anfitrião (Local do evento)
2020/11/26 A novel D-xylose isomerase: from the gut of a wood feeding beetle for improved conversion in Saccharomyces cerevisiae Biocatalysis Open Day
European Federation of Biotechnology

Orientação

Título / Tema
Papel desempenhado 		Curso (Tipo)
Instituição / Organização
2021/09/01 - 2022/10/30 Metabolic engineering for the production of branched-chain fatty acids from D-xylose in Saccharomyces cerevisiae
Coorientador de Francisco Magalhães
 Genética Molecular (Mestrado)
Universidade do Minho, Portugal
2020/04/01 - 2020/07/31 Development of a sugar quantification method in cultures of Saccharomyces cerevisiae
Coorientador de Francisco Magalhães
 Bioquímica (Licenciatura/Bacharelato)
Universidade do Minho, Portugal
2020/04/01 - 2020/07/31 Yeast DEL assay with a fluorescent genetic marker
Coorientador de Francisca Rodrigues
 Biologia Aplicada (Licenciatura/Bacharelato)
Universidade do Minho, Portugal

Organização de evento

Nome do evento
Tipo de evento (Tipo de participação) 		Instituição / Organização
2014/09/01 - 2015/06/30 Applied Biology Days XVI - a student-organized conference featuring 8 plenary talks, 10 workshops, and a science talk show. (2015/02/17 - 2015/02/18)
Conferência (Presidente da Comissão Organizadora)
 Universidade do Minho, Portugal

Participação em evento

Descrição da atividade
Tipo de evento 		Nome do evento
Instituição / Organização
2019 - Atual Lectures at high schools regarding my field of research and experience as a scientist.
Seminário
 Researchers go back to school
Universidade do Minho, Portugal
2023/05 - 2023/05 Informal science communication entitled "Cell factories for a sustainable society"
Festival
 Pint of Science
2022/09 - 2022/09 Coordination of the hands-on activity "Yeast biotechnology - diversity and applications".
Exposição
 European Researchers’ Night
Universidade do Minho, Portugal
2021/11/17 - 2021/11/18 Joint FEBS/SPB/UMinho Symposium on Evidence Based Teaching in Your Biomolecular Classroom: Catalysing Student Engagement
Oficina (workshop)
Universidade do Minho Centro IDEA, Portugal
2021/10/19 - 2021/10/22 Computational Approaches to Understanding and Engineering Enzyme Catalysis
Oficina (workshop)
Federation of European Biochemical Societies, Reino Unido
2021/09 - 2021/09 Coordination of the hands-on activity "Microbial cell factories towards a sustainable future".
Exposição
Universidade do Minho, Portugal
2019/09 - 2019/09 Coordination of the hands-on activity "Sustainable cities and 3rd generation biofuels".
Exposição
 European Researchers’ Night
Universidade do Minho, Portugal
2018/09 - 2018/09 Coordination of the hands-on activity "Yeast: a biotechnological factory".
Exposição
 European Researchers’ Night
Universidade do Minho, Portugal
2018/04 - 2018/04 Workshop on “Syllabus and course design”
Oficina (workshop)
University of California Berkeley, Estados Unidos
2018/03 - 2018/03 Fulbright Enrichment Seminar – “Building an Innovation Ecosystem in St. Louis”
Seminário
Fulbright Association, Estados Unidos

Entrevista (jornal / revista)

Descrição da atividade Jornal / Forum
2021/03/05 Discovery of a new Xylose Isomerase with the potential for producing biofuels and pharmaceuticals. Correio do Minho
2021/03/04 Industrial potential of the newly discovered Xylose Isomerase. RUM - Rádio Universitária do Minho

Tutoria

Tópico Nome do aluno
2022/09/01 - 2023/10/31 Expression of a discrete, mono-functional FAS type II in industrial Saccharomyces cerevisiae strains Júlio Freire
2021/04/01 - 2021/07/31 Eco-efficiency in the Molecular Genetics Lab: optimization of an agarose gel electrophoresis buffer Tomás Neves
Distinções

Prémio

2022 FEBS Short-term Fellowship
Federation of European Biochemical Societies, Reino Unido
2018 FCT PhD Studentship
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
2017 Fulbright Grant Award
Fulbright Portugal, Portugal
2015 Excellence Scholarship
Universidade do Minho, Portugal