Jorge Henrique Santos Oliveira Oliveira (881A-9CFF-2E1E)

Curriculum Vitae

Jorge Henrique Santos Oliveira Oliveira

Jorge Oliveira is currently an Assistant Professor at Portucalense University Infante D. Henrique, located in Porto, Portugal, teaching courses in the field of exact sciences. He finished 3 post-Docs research activities as Research Fellow, in the fields of biomedical signal processing, cybersecurity and machine learning. One R&D project co-funded by the FCT (DigiScope2) at Instituto de Telecomunicações, one R&D ITEA European project (CyberFactory#1) and one R&D Horizon2020 project (Seccoia) at Research Group on Intelligent Engineering and Computing for Advanced Innovation and Development. He concluded his PhD. degree in Informatics, in 2018, at University of Porto, Braga and Aveiro. He is an Author or Co-Author of 7 journal manuscripts, and more than 17 international conference proceedings, all with international referees and indexed at SCOPUS or IEEE platforms. He has (co)supervised 6 MSc activities, having some active roles running. His domains are in the areas of Engineering Sciences and Technologies, Other Engineering Sciences, with an emphasis on signal and image processing. He was a member of the organization committee of RECPAD 2019 (Conferência Nacional de Reconhecimentos de Padrão) conference. He co-organized the prestigious The George B. Moody PhysioNet Challenge 2022 entitled Heart Murmur Detection from Phonocardiogram Recordings. He co-founded VisitPlann company. He is currently the Chief-Executive Office of VisitPlann.

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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo: Jorge Henrique Santos Oliveira Oliveira

Nomes de citação

Oliveira, Jorge

Identificadores de autor

Ciência ID: 881A-9CFF-2E1E
ORCID iD: 0000-0002-3190-8367

Endereços de correio eletrónico

jhs@isep.ipp.pt (Profissional)
jho@isep.ipp.pt (Pessoal)

Telefones

Telemóvel

931847916 (Pessoal)

Moradas

Rua de Casal Maria, 90, 4480-284, Vila do Conde, Vila do Conde, Portugal (Pessoal)

Domínios de atuação

Ciências da Engenharia e Tecnologias - Engenharia Eletrotécnica, Eletrónica e Informática
Ciências da Engenharia e Tecnologias - Engenharia Eletrotécnica, Eletrónica e Informática
Ciências da Engenharia e Tecnologias - Engenharia Eletrotécnica, Eletrónica e Informática

Idiomas

Idioma	Conversação	Leitura	Escrita	Compreensão	Peer-review
Inglês	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador proficiente (C2)

Formação

	Grau	Classificação
2014/02/01 - 2018/09/11 Concluído	Ciências dos Computadores (Doutoramento) Universidade do Porto, Portugal "Subject-driven supervised and unsupervised Hidden Markov Models for heart sound segmentation in real noisy environments" (TESE/DISSERTAÇÃO)
2011/10/01 - 2013/10/01 Concluído	Engenharia Matemática (Mestrado) Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal "Desenvolvimento de sistemas para o reconhecimento automático de padrões biológicos para as diversas plataformas móveis Smartphone" (TESE/DISSERTAÇÃO)	15
2007/10/01 - 2011/10/01 Concluído	Física (Licenciatura) Especialização em Química Universidade do Porto, Portugal	12

Percurso profissional

Ciência

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2020/05/27 - 2021/08/31	Investigador Contratado (Investigação)	Instituto Politécnico do Porto Grupo de Investigação em Engenharia e Computação Inteligente para a Inovação e o Desenvolvimento, Portugal
	Instituto Politécnico do Porto Grupo de Investigação em Engenharia e Computação Inteligente para a Inovação e o Desenvolvimento, Portugal
2019/01/01 - 2020/05/21	Investigador Contratado (Investigação)	Instituto de Telecomunicações, Portugal
	Instituto de Telecomunicações, Portugal
2013/12/01 - 2018/12/01	Investigador (Investigação)	Instituto de Telecomunicações, Portugal
	Instituto de Telecomunicações, Portugal

Docência no Ensino Superior

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2021/09/01 - Atual	Professor Auxiliar (Docente Universitário)	Universidade Portucalense Infante Dom Henrique, Portugal

2019/02/01 - 2023/02/24	Assistente convidado (Docente Ensino Superior Politécnico)	Instituto Politécnico do Porto Instituto Superior de Engenharia do Porto, Portugal

Outros

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2022/02/22 - Atual	Entrepreneur	VisitPlann, Portugal

Projetos

Projeto

	Designação	Financiadores
2022/10/01 - Atual	SNAP + \| Photogrammetry Aided Surveying in Heritage Management 2022-1-PT01-KA220-ADU-000087890 Bolseiro de Cientista Convidado Research on Economics, Management and Information Technologies, Portugal	Em curso
2020/05/27 - Atual	CyberFactory#1 17032 Investigador	Em curso
2020/05/27 - Atual	Secure Collaborative Intelligent Industrial Assets 871967 Bolseiro de Investigação Instituto Politécnico do Porto Instituto Superior de Engenharia do Porto, Portugal	Em curso
2019/01/01 - 2020/05/21	DigiScope2 POCI-01-0145-FEDER-029200 Investigador Pós-doutorado Instituto de Telecomunicações, Portugal	Em curso
2019/08/01 - 2019/10/31	UID/EEA/50008/2019 UID/EEA/50008/2019 Orientador Instituto de Telecomunicações, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2015/09/01 - 2018/12/31	NanoSTIMA. NORTE-01-0145-FEDER-000016 Bolseiro de Investigação
2015/10/01 - 2016/03/31	RHEUMUS n/a Bolseiro de Investigação Instituto de Telecomunicações, Portugal	Concluído
2013/12/01 - 2015/06/30	HeartSafe - Assessing Heart Function for Unsupervised Homecare Applications through Multi-Channel Auscultation PTDC/EEI-PRO/2857/2012 Bolseiro de Investigação

Produções

Publicações

Artigo em conferência

Nogueira, Marcelo; Oliveira, Jorge; Ferreira, Carlos Gomes; Coimbra, Miguel T.; Jorge, Alipio M.. "Can Multi-channel Heart Sounds Analysis improve Murmur Detection?". 2022.
10.1109/bhi56158.2022.9926792
Oliveira, Jorge; Nogueira, Diogo; Ferreira, Carlos; Jorge, Alipio M.; Coimbra, Miguel. "The robustness of Random Forest and Support Vector Machine Algorithms to a Faulty Heart Sound Segmentation". 2022.
10.1109/embc48229.2022.9871111
Faustino, Pedro; Oliveira, Jorge; Coimbra, Miguel. "Crackle and wheeze detection in lung sound signals using convolutional neural networks". 2021.
10.1109/embc46164.2021.9630391
Oliveira, Jorge; Nogueira, Diogo; Renna, Francesco; Ferreira, Carlos; Jorge, Alipio M.; Coimbra, Miguel. "Do we really need a segmentation step in heart sound classification algorithms?". 2021.
10.1109/embc46164.2021.9630559
Oliveira, Nuno; Sousa, Norberto; Oliveira, Jorge; Praca, Isabel. "Anomaly Detection in Cyber-Physical Systems: Reconstruction of a Prediction Error Feature Space". 2021.
10.1109/sin54109.2021.9699339
Oliveira, Marisa; Oliveira, Jorge; Camacho, Rui; Ferreira, Carlos. "A Multi-spot Murmur Sound Detection Algorithm and Its Application to a Pediatric and Neonate Population". 2021.
10.5220/0010262502280234
Oliveira, Jorge; Nogueira, Marcelo; Ramos, Cleber; Renna, Francesco; Ferreira, Carlos; Coimbra, Miguel. "Using Soft Attention Mechanisms to Classify Heart Sounds". 2019.
10.1109/embc.2019.8856748
Renna, Francesco; Illanes, Alfredo; Oliveira, Jorge; Esmaeili, Nazila; Friebe, Michael; Coimbra, Miguel T.. "Assessment of Sound Features for Needle Perforation Event Detection". 2019.
10.1109/embc.2019.8857098
Renna, Francesco; Oliveira, Jorge; Coimbra, Miguel T.. "Convolutional Neural Networks for Heart Sound Segmentation". Trabalho apresentado em EUSIPCO, 2018.
10.23919/eusipco.2018.8553120
Oliveira, Jorge; Mantadelis, Theofrastos; Renna, Francesco; Gomes, Pedro; Coimbra, Miguel. "On modifying the temporal modeling of HSMMs for pediatric heart sound segmentation". 2017.
10.1109/sips.2017.8110004
Oliveira, Jorge; Sousa, Catarina; Coimbra, Miguel T.. "Coupled hidden Markov model for automatic ECG and PCG segmentation". 2017.
10.1109/icassp.2017.7952311
Oliveira, Jorge. "Exploratory study of the cardiac dynamic trajectory in the embedding space". Trabalho apresentado em 2016 Computing in Cardiology Conference (CinC), 2017.
Renna, Francesco; Oliveira, Jorge; Coimbra, Miguel. "A Data-Driven Feature Extraction Method for Enhanced Phonocardiogram Segmentation". 2017.
10.22489/cinc.2017.183-281
Oliveira, Jorge; Mantadelis, Theofrastos; Coimbra, Miguel. "Why should you model time when you use Markov models for heart sound analysis". 2016.
10.1109/embc.2016.7591470
Oliveira, Jorge; Oliveira, Cristina; Cardoso, Bruna; Sultan, Malik Saad; Tavares Coimbra, Miguel. "A multi-spot exploration of the topological structures of the reconstructed phase-space for the detection of cardiac murmurs". 2015.
10.1109/embc.2015.7319319
H. Oliveira, J.; Ferreira, V.; Coimbra, M.. "Can We Find Deterministic Signatures in ECG and PCG Signals?". 2015.
10.5220/0005205201840189
Haghighi-Mood, A.; Torry, J.N.. "Most Probable Explanation for MetaProbLog and its application in Heart Sound Segmentation". Trabalho apresentado em ICLP 2015, 2015.
10.1109/cic.1995.482711
Oliveira, Jorge; Castro, Ana; Coimbra, Miguel. "Exploring embedding matrices and the entropy gradient for the segmentation of heart sounds in real noisy environments". 2014.
10.1109/embc.2014.6944314

Artigo em revista

Elola, Andoni; Aramendi, Elisabete; Oliveira, Jorge; Renna, Francesco; Coimbra, Miguel T.; Reyna, Matthew A.; Sameni, Reza; Clifford, Gari D.; Rad, Ali Bahrami. "Beyond Heart Murmur Detection: Automatic Murmur Grading from Phonocardiogram". IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics (2023): 1-11. http://dx.doi.org/10.1109/jbhi.2023.3275039.
10.1109/jbhi.2023.3275039
Oliveira, Jorge; Renna, Francesco; Costa, Paulo Dias; Nogueira, Marcelo; Oliveira, Cristina; Ferreira, Carlos; Jorge, Alipio; et al. "The CirCor DigiScope Dataset: From Murmur Detection to Murmur Classification". IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics 26 6 (2022): 2524-2535. http://dx.doi.org/10.1109/jbhi.2021.3137048.
10.1109/jbhi.2021.3137048
Oliveira, Jorge; Carvalho, Margarida; Nogueira, Diogo; Coimbra, Miguel. "The selection of an optimal segmentation region in physiological signals". International Transactions in Operational Research (2022): http://dx.doi.org/10.1111/itor.13138.
10.1111/itor.13138
Oliveira, Jorge; Praca, Isabel. "On the Usage of Pre-Trained Speech Recognition Deep Layers to Detect Emotions". IEEE Access (2021): 1-1. http://dx.doi.org/10.1109/access.2021.3051083.
10.1109/access.2021.3051083
Renna, Francesco; Oliveira, Jorge; Coimbra, Miguel T.. "Deep Convolutional Neural Networks for Heart Sound Segmentation". IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics 23 6 (2019): 2435-2445. http://dx.doi.org/10.1109/jbhi.2019.2894222.
10.1109/jbhi.2019.2894222
Oliveira, Jorge; Renna, Francesco; Coimbra, Miguel. "A Subject-Driven Unsupervised Hidden Semi-Markov Model and Gaussian Mixture Model for Heart Sound Segmentation". IEEE Journal of Selected Topics in Signal Processing 13 2 (2019): 323-331. http://dx.doi.org/10.1109/jstsp.2019.2908723.
10.1109/jstsp.2019.2908723
Oliveira, Jorge; Renna, Francesco; Mantadelis, Theofrastos; Coimbra, Miguel. "Adaptive Sojourn Time HSMM for Heart Sound Segmentation". IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics 23 2 (2019): 642-649. http://dx.doi.org/10.1109/jbhi.2018.2841197.
10.1109/jbhi.2018.2841197

Outros

Conjunto de dados

Oliveira, Jorge. The CirCor DigiScope Phonocardiogram Dataset.
https://doi.org/10.13026/cy60-yn18

Atividades

Apresentação oral de trabalho

	Título da apresentação	Nome do evento Anfitrião (Local do evento)
2014/11/14	Studying the Second Heart Sound	Ciclo de Palestras em Imagem Médica - Mestrado em Informática Médica. Faculdade de Medicina da Universidade do Porto

Orientação

	Título / Tema Papel desempenhado	Curso (Tipo) Instituição / Organização
2021 - 2022	Desenvolvimento de Aplicação em Visão Computacional para a Deteção e Classificação de Obras de Arte e Património. Coorientador	Instituto Politécnico de Bragança Escola Superior de Tecnologia e de Gestão de Bragança Mirandela, Portugal
2021 - 2022	Detection of cardiac pathology using machine learning Coorientador
2021 - 2022	Detection of Misuse and Malicious Behaviors through a Dialogue Analysis System Coorientador	Mestrado Integrado em Engenharia Eletrotécnica e de Computadores
2021 - 2022	A Deep Learning approach to infer morphological characteristics of the heart from cardiac sound analysis Coorientador	Mestrado Integrado em Engenharia Eletrotécnica e de Computadores Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2020 - 2021	Deteção de patologia em sons cardíacos usando deep learning Coorientador	Engenharia Informática Instituto Politécnico do Porto Instituto Superior de Engenharia do Porto, Portugal
2020/01/30 - 2020/10/23	Análise de som cardíaco pediátrico para identificação de sopro Coorientador	MESTRADO INTEGRADO EM ENGENHARIA INFORMÁTICA E COMPUTAÇÃO (Mestrado) Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal

Organização de evento

	Nome do evento Tipo de evento (Tipo de participação)	Instituição / Organização
2022 - 2023	Heart Murmur Detection from Phonocardiogram Recordings: The George B. Moody PhysioNet Challenge 2022 (2022/09/04 - 2022/09/07) Outro (Coorganizador)	Emory University, Estados Unidos
2019/10 - 2019/10	Member of the Organization Committee of RECPAD 2019 (Conferência Nacional de Reconhecimentos de Padrão) conference. (2019/09)	Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal

Júri de grau académico

	Tema Tipo de participação	Nome do candidato (Tipo de grau) Instituição / Organização
2022/12/13	Phishing Detection with a Machine Learning Net " Arguente principal	Ana Luís Carvalho Matos Bezerra (Mestrado) Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2020/03/27	Identificação automática de aves a partir de áudio Arguente principal	Silvestre Daniel Dias Carvalho (Mestrado) Instituto Politécnico do Porto Instituto Superior de Engenharia do Porto, Portugal
2018/09/03	NeuroMov: Multimodal approach for epileptic seizure detection and prediction Arguente principal	Paulo Manuel de Carvalho Branco Maia (Mestrado) Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal

Curso / Disciplina lecionado

	Disciplina	Curso (Tipo)	Instituição / Organização
2022/09/01 - 2023/02/28	Bases de Dados	Engenharia Informática	Instituto Politécnico do Porto Instituto Superior de Engenharia do Porto, Portugal
2022/09/01 - 2023/02/28	Laboratório / Projecto I	Engenharia Informática	Instituto Politécnico do Porto Instituto Superior de Engenharia do Porto, Portugal
2022/09/01 - 2023/02/28	Princípios da Computação	Engenharia Informática	Instituto Politécnico do Porto Instituto Superior de Engenharia do Porto, Portugal
2022/09 - 2023/02	Análise Matemática (Regent)	Engenharia Informática	Universidade Portucalense Infante Dom Henrique, Portugal
2022/09 - 2023/02	Análise Matemática (Regent)	Engenharia e Gestão Industrial	Universidade Portucalense Infante Dom Henrique, Portugal
2022 - 2023	Sociedade da Informação e do Conhecimento (Regent)	Economia	Universidade Portucalense Infante Dom Henrique, Portugal
2022 - 2023	Laboratório de Aplicações Móveis	Engenharia Informática	Universidade Portucalense Infante Dom Henrique, Portugal
2022 - 2023	Visão por Computador (Regent)	Informática	Universidade Portucalense Infante Dom Henrique, Portugal
2022 - 2023	Visão por Computador (Regent)	Engenharia Informática	Universidade Portucalense Infante Dom Henrique, Portugal
2022 - 2023	Sociedade da Informação e do Conhecimento	Gestão	Universidade Portucalense Infante Dom Henrique, Portugal
2022/03/01 - 2022/07/01	Laboratório / Projecto II	Engenharia Informática	Instituto Politécnico do Porto Instituto Superior de Engenharia do Porto, Portugal
2022/03/01 - 2022/07/01	Paradigmas da Programação	Engenharia Informática	Instituto Politécnico do Porto Instituto Superior de Engenharia do Porto, Portugal
2022/03/01 - 2022/07/01	Programação Orientada a Objetos	Informática	Universidade Portucalense Infante Dom Henrique, Portugal
2022/02/01 - 2022/07/01	Algoritmia Aplicada (Regent)	Informática	Universidade Portucalense Infante Dom Henrique, Portugal
2021/09/01 - 2022/02/28	Laboratório / Projecto III	Engenharia Informática	Instituto Politécnico do Porto Instituto Superior de Engenharia do Porto, Portugal
2021/09/01 - 2022/02/28	Arquiteturas e Sistemas Operativos (Regent)	Informática	Universidade Portucalense Infante Dom Henrique, Portugal
2021/09/01 - 2022/02/28	Estruturas de Dados (Regent)	Informática	Universidade Portucalense Infante Dom Henrique, Portugal
2021/09/01 - 2022/02/27	Estruturas da Informação (Regent)	Engenharia Informática	Instituto Politécnico do Porto Instituto Superior de Engenharia do Porto, Portugal
2021 - 2022	Programação Orientada a Objetos	Engenharia e Gestão Industrial	Universidade Portucalense Infante Dom Henrique, Portugal
2021 - 2022	Sociedade da Informação e do Conhecimento	Gestão	Universidade Portucalense Infante Dom Henrique, Portugal
2020/09/01 - 2021/02/28	AAUT1IA Aprendizagem Automática 1	MESTRADO EM INTELIGÊNCIA ARTIFICIAL	Instituto Politécnico do Porto Instituto Superior de Engenharia do Porto, Portugal
2019/02/18 - 2021	LPROG Linguagens e Programação	LICENCIATURA EM ENGENHARIA INFORMÁTICA	Instituto Politécnico do Porto Instituto Superior de Engenharia do Porto, Portugal
2019/09/01 - 2020/02/01	APROG algoritmia e programação	LICENCIATURA EM ENGENHARIA ELETROTÉCNICA	Instituto Politécnico do Porto Instituto Superior de Engenharia do Porto, Portugal

Tutoria

	Tópico	Nome do aluno
2023/02/14 - Atual	PESTI Internship at VisitPlann	Xavier Costa
2022/11/23 - Atual	IEFP Internship at Vontade Radical	Paulo Gabriel Figueiredo
2023/02/01 - 2033/10/31	IEFP Internship at Vontade Radical	Mário Sá Carneiro
2023/01/03 - 2023/10/10	IEFP Internship at Vontade Radical	João Pedro Almeida da Silva
2022/08 - 2022/10	Erasmus+ Traineeship at VisitPlann	Vasilis photiou