Identificação pessoal

Nome completo

Sofia Lopes Mendes

Nomes de citação

• Mendes, Sofia L

Identificadores de autor

Ciência ID

C314-9608-1B22

ORCID iD

0000-0001-8915-701X

Google Scholar ID

fZJmUfYAAAAJ&hl

Researcher Id

IYT-0496-2023

Endereços de correio eletrónico

• slmendes@fc.ul.pt (Profissional)

Moradas

• Centre for Ecology, Evolution and Environmental Changes, Campo Grande, 1749-016, Lisboa, Lisboa, Portugal (Profissional)

Websites

• https://www.ce3c.pt/research/research-groups/evolutionary-perspectives-in-a-changing-world/evolutionary-genomics-and-bioinformatics/sofia-l-mendes (Académico)

Domínios de atuação

• Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia da Evolução das Espécies

Idiomas

Idioma	Conversação	Leitura	Escrita	Compreensão	Peer-review
Inglês	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)
Português (Idioma materno)

	Grau	Classificação
2019/12/01 - 2024 Em curso	Biologia (Doutoramento) Especialização em Biologia Evolutiva Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2022/07/19 - 2022/07/22 Concluído	Curso Prático em Experimentação Animal (Vertebrados) (Outros) Órgão Responsável pelo Bem-Estar dos Animais da FCUL, Portugal	Approved
2019/10/22 Concluído	Theoretical Course on Laboratory Animal Sciences (Outros) Sociedade Portuguesa de Ciências em Animais de Laboratório, Portugal	Approved
2018 Concluído	Biologia Evolutiva e do Desenvolvimento (Mestrado) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal "The population genomics of western Iberian Squalius freshwater fish species: a genotyping by sequencing approach" (TESE/DISSERTAÇÃO)	18
2016 Concluído	Biologia - Ramo de Biologia Evolutiva e do Desenvolvimento (Licenciatura) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal "n/a" (TESE/DISSERTAÇÃO)	16

Outros

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2019/12/01 - Atual	PhD student	Centro de Ecologia Evolução e Alterações Ambientais, Portugal
2019/05/07 - 2019/11/06	Grant researcher	FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal
	Centro de Ciências do Mar e do Ambiente, Portugal
2019/01 - 2019/05	Volunteer	Centro de Ecologia Evolução e Alterações Ambientais, Portugal
2017/09 - 2018/12	MSc student	Centro de Ecologia Evolução e Alterações Ambientais, Portugal

Bolsa

	Designação	Financiadores
2019/12/01 - 2024/01/31	The role of hybridization in speciation and adaptation: insights from Iberian freshwater fish species SFRH/BD/145153/2019 Bolseiro de Doutoramento Centro de Ecologia Evolução e Alterações Ambientais, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído

Projeto

	Designação	Financiadores
2022/01/01 - 2024/12/31	HYBRIDOMICS: Pode a hibridação facilitar a adaptação e resposta a alterações ambientais? Genómica e proteómica de espécies de peixe de água doce endémicas PTDC/BIA-EVL/4345/2021 10.54499/PTDC/BIA-EVL/4345/2021 Bolseiro de Doutoramento FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal Universidade de Lisboa Centro de Ecologia Evolução e Alterações Ambientais, Portugal Instituto Universitário de Ciências Psicológicas Sociais e da Vida, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Em curso
2019/05/07 - 2019/11/06	MUSSELFLOW: Host-dependent evolution, ecology and conservation of freshwater mussels under varying hydrological conditions: consequences of climate change PTDC/BIA-EVL/29199/2017 Bolseiro de Técnico de Investigação Centro de Ciências do Mar e do Ambiente, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído

Publicações

Artigo em revista	Sofia L. Mendes; Silvia Perea; Vitor C. Sousa; Carla Sousa Santos; Ignacio Doadrio. "A new species of the genus Squalius (Leuciscidae, Actinopterygii) from the Sado River basin in Portugal". Limnetica (2024): https://doi.org/10.23818/limn.44.19. 10.23818/limn.44.19 Mc Cartney, Ann M.; Formenti, Giulio; Mouton, Alice; De Panis, Diego; Marins, Luísa S.; Leitão, Henrique G.; Diedericks, Genevieve; et al. "The European Reference Genome Atlas: piloting a decentralised approach to equitable biodiversity genomics". npj Biodiversity 3 1 (2024): http://dx.doi.org/10.1038/s44185-024-00054-6. 10.1038/s44185-024-00054-6 Marques, João P.; Alves, Paulo C.; Amorim, Isabel R.; Lopes, Ricardo J.; Moura, Monica; Myers, Eugene; Sim-sim, Manuela; et al. "Building a Portuguese coalition for biodiversity genomics". npj Biodiversity 3 1 (2024): http://dx.doi.org/10.1038/s44185-024-00061-7. 10.1038/s44185-024-00061-7 Joaquim Reis; Silvia Perea; Mafalda Gama; Sofia L. Mendes; Vitor C. Sousa; Cristina Lima; Filipe Banha; et al. "Conservation Challenges Imposed by Evolutionary History and Habitat Suitability Shifts of Endangered Freshwater Mussels under a Global Climate Change Scenario". Diversity (2024): https://doi.org/10.3390/d16040209. 10.3390/d16040209 Perea, S.; Mendes, Sofia L; Sousa-Santos, C.; Ondina, P.; Amaro, R.; Castro, J.; San-Miguel, E.; et al. "Applying genomic approaches to delineate conservation strategies using the freshwater mussel Margaritifera margaritifera in the Iberian Peninsula as a model". Scientific Reports 12 1 (2022): http://dx.doi.org/10.1038/s41598-022-20947-5. Publicado • 10.1038/s41598-022-20947-5 Mendes, Sofia L; Miguel P. Machado; Maria M. Coelho; Vitor C. Sousa. "Genomic data and multi-species demographic modelling uncover past hybridization between currently allopatric freshwater species". Heredity (2021): https://doi.org/10.1038/s41437-021-00466-1. Publicado • 10.1038/s41437-021-00466-1 De-Kayne, Rishi; Frei, David; Greenway, Ryan; Mendes, Sofia L; Retel, Cas; Feulner, Philine G.D.. "Sequencing platform shifts provide opportunities but pose challenges for combining genomic datasets". Molecular Ecology Resources (2020): http://dx.doi.org/10.1111/1755-0998.13309. Publicado • 10.1111/1755-0998.13309
Poster em conferência	Mendes, Sofia L; Sousa Santos, Carla; Feulner, Philine G.D.; Sousa, Vitor C.. "Multiple outcomes of hybridization in Iberian chubs inferred from whole genome data". Trabalho apresentado em Society for Molecular Biology and Evolution (SMBE) 2023 Meeting, 2023. Mendes, Sofia L; Sousa Santos, Carla; Feulner, Philine G.D.; Sousa, Vitor C.. "Evidence for ancient and ongoing hybridization in Iberian freshwater fish from whole genome data". Trabalho apresentado em ESEB2022: Congress of the European Society for Evolutionary Biology, 2022. Moreno, João M; Mendes, Sofia L; Sousa, Vitor; Coelho, Maria M.. "Demographic history and molecular adaptation in western Iberian freshwater fish". Trabalho apresentado em 8th Congress of the Italian Society for Evolutionary Biology, 2019. Mendes, Sofia L; Coelho, Maria M.; Sousa, Vitor. "Multi-species demographic modelling uncovers past introgression between currently allopatric freshwater species". Trabalho apresentado em Society for Molecular Biology and Evolution (SMBE) 2019 Meeting, 2019. Mendes, Sofia L; Coelho, Maria M.; Sousa, Vitor. "Evidence for past introgression between western Iberian freshwater fish species". Trabalho apresentado em Fronteirs in E3: 5th cE3c Annual Meeting, 2019. Mendes, Sofia L; Coelho, Maria M.; Sousa, Vitor. "Exploring the construction of a SNP dataset based on Genotyping by Sequencing (GBS) for four Iberian freshwater fish species". Trabalho apresentado em Frontiers in E3: 4th cE3c Annual Meeting, 2018.
Tese / Dissertação	Mendes, Sofia L. "The population genomics of western Iberian Squalius freshwater fish species: a genotyping by sequencing approach". Mestrado, Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, 2018. http://hdl.handle.net/10451/36870.

Prémio

2023	Best Student Talk XIX ENBE - Annual Meeting of the Portuguese Association for Evolutionary Biology, Portugal
2018	Diploma de Mérito Académico Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2016	Best Animal Behaviour project (FCUL) Sociedade Portuguesa de Etologia, Portugal
2015	Diploma de Mérito Académico Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal