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Hugo Ribeiro (HR) is a BSc (2007) and MSc (2008) in Environmental Sciences and Technology by the Sciences Faculty of the University of Porto. During his MSc dissertation, HR was also a fellowship researcher in the RACEWAYS project at the Interdisciplinary Centre of Marine and Environmental Research (CIIMAR). HR obtained his Ph.D. degree in Biomedical Sciences (2013) from the Biomedical Sciences Institute Abel Salazar (ICBAS) - University of Porto. In 2015, HR was a visiting researcher at the National University of Ireland, Galway under an STSM of a COST Action. Currently, HR is a Postdoctoral Research Assistant at CIIMAR under the scope of the UNNOWN project and visiting researcher at ICBAS. HR has 11 publications as the first (and corresponding) author and 5 publications as co-author in peer-reviewed international journals. HR also has 1 conference paper as co-author; 3 book chapters (1 as the first and corresponding author), and 7 International peer-reviewed proceedings. HR is the inventor of a patent application for the development of a prototype to capture microbiomes. At International conferences, HR has 17 oral communications and 21 posters communications. HR also participated in organizing conferences and worldwide campaigns; supervising and jury of BSc dissertations; Ad-Hoc reviewer; and member of scientific associations. HR was also involved in outreach activities within the BIOMAR project and the University of Porto dissemination activities.
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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Hugo Manuel da Silva Ribeiro

Nomes de citação

  • Ribeiro, Hugo

Identificadores de autor

Ciência ID
BD15-54AD-320A
ORCID iD
0000-0002-2087-8385
Researcher Id
E-6752-2016
Scopus Author Id
36696876300

Endereços de correio eletrónico

  • hribeiro@ciimar.up.pt (Profissional)
  • hribeiro.researcher@gmail.com (Profissional)

Websites

Domínios de atuação

  • Ciências Naturais - Ciências da Terra e do Ambiente - Ciências do Ambiente
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Microbiologia
  • Ciências da Engenharia e Tecnologias - Biotecnologia Ambiental - Biotratamento
  • Ciências da Engenharia e Tecnologias - Engenharia do Ambiente - Engenharia Ambiental

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Português (Idioma materno)
Inglês Utilizador independente (B2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador independente (B2) Utilizador proficiente (C1)
Formação
Grau Classificação
2009 - 2013
Concluído
 Doutoramento em Ciências Biomédicas / PhD in Biomedical Sciences (Doutoramento)
Universidade do Porto Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar, Portugal
"Petroleum Hydrocarbons Bioremediation in a Temperate Salt Marsh: Plant–Microorganisms Interactions" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 Approved with distinction an honor
2008
Concluído
 Environmental Sciences and Technology (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
"Estudos sobre Nitrificação em biofilmes de um biofiltro do tipo MBBR (Moving Bed Biofilm Reactor) operando em água salgada" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 18/20
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2023/01 - 2023/04 Investigador visitante (Investigação) Department of Biochemistry and Biotechnology, University of Thessaly, Grécia
2018/11 - 2021/03 Investigador Contratado (Investigação) Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
2009/01 - 2013/07 Estagiário de Investigação (Investigação) Universidade do Porto Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar, Portugal
Projetos

Bolsa

Designação Financiadores
2019/01/01 - Atual BeachSafe -Emergent microbial pollutants in bathing waters
PTDC/SAU-PUB/31291/2017
Investigador
Universidade do Porto Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2018/12 - Atual UNNOWN - UNdiscovered Nitrogen micrOrganisms for Wastewater iNoculation
POCI-01-0145-FEDER031098
Bolseiro de Pós-Doutoramento
Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2017/02 - 2019/01 SpilLess - First line response to oil spills based on native microorganisms cooperation
EASME/EMFF/2016/1.2.1.4
Investigador Pós-doutorado
Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
 Executive Agency for Small and Medium sized Enterprises
Em curso
2017/07 - 2018/06 CORAL - Sustainable ocean exploitation - tools and sensors
NORTE-01-0145-FEDER-000036
Outra
Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
 Comissao de Coordenacao e Desenvolvimento Regional do Norte
Concluído
2016/01 - 2017/04 MarinEye – A prototype for multitrophic oceanic monitoring
PT02-0037
Bolseiro de Técnico de Investigação
Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
 EEA Grants
Concluído
2015/07 - 2016/07 BioMar PT - Learning to know the marine environment Portugal
PT02-0015
Orientador
Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
 EEA Grants
Concluído
2014/01 - 2015/02 NITROTOX - Interference of Metals and PAHs in Nitrate Removal Biological Processes: Denitrification vs Anammox
grant.Provided by PTCRIS: 113973
PTDC/AAC-AMB/113973/2009
Outra
Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2013/07 - 2013/12 NITROSUL - Novel interaction between marine biogeochemical nitrogen and sulfur cycles: characterization and ecological implications
PTDC/MAR/098914/2008
Outra
Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2010/06 - 2013/11 PHYTOBIO - Phytoremediation and bioremediation of contaminants in salt marshes: plant - microorganisms interactions
PTDC/MAR/099140/2008
Investigador
Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
 Foundation for Science and Technology
Concluído
2009/01 - 2012/12 Hydrocarbon bioremediation in salt marshes: plant-microorganims interactions
SFRH/BD/47631/2008
Investigador responsável
Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia

European Social Fund
Concluído
2007/10 - 2008/04 RACEWAYS - A hyperintensive fish farming concept for lasting competitiveness and superior production
16869
Bolseiro de Investigação
Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
 European Commission Sixth Framework Programme
Concluído
Produções

Publicações

Artigo em conferência
  1. Wijaya I M.W.,; Ribeiro, Hugo; Soedjono E.S.,; Slamet A.; Teixeira, C.; Bordalo, A.A.. "Start-up of the Nitrogen Removal Process in an Anaerobic Up-Flow Reactor Inoculated with Aeration Tank Sludge". 2019.
    Publicado
  2. Ribeiro, Hugo; Soares-Santos V.; Machado, A.; Dias, S. C; Wijaya I M.W.; Salgado P.; Bordalo, A.A.; Teixeira, C.. "UN(K)NOWN Project: Development of Anammox Microbial Inocula to Improve Nitrogen Removal Efficiency in Wastewater Treatment". 2019.
    Publicado
  3. Martins, Alfredo; Dias, Andre; Silva, Eduardo; Ferreira, Hugo; Dias, Ireneu; Almeida, Jose Miguel; Torgo, Luis; et al. "MarinEye — A tool for marine monitoring". Trabalho apresentado em OCEANS 2016 - Shanghai, Shanghai, 2016.
    Publicado • 10.1109/oceansap.2016.7485624
Artigo em revista
  1. Santos, João Pereira; Sousa, António G. G.; Ribeiro, Hugo; Magalhães, Catarina. "The Response of Estuarine Ammonia-Oxidizing Communities to Constant and Fluctuating Salinity Regimes". Frontiers in Microbiology 11 (2020): http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2020.574815.
    10.3389/fmicb.2020.574815
  2. Ribeiro, Hugo; Martins, Alfredo; Gonçalves, Marco; Guedes, Maurício; Tomasino, Maria Paola; Dias, Nuno; Dias, André; et al. "Development of an autonomous biosampler to capture in situ aquatic microbiomes". PLOS ONE 14 5 (2019): e0216882. http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0216882.
    Publicado • 10.1371/journal.pone.0216882
  3. António Gaspar G. de Sousa; Maria Paola Tomasino; Pedro Duarte; Mar Fernández-Méndez; Philipp Assmy; Hugo Ribeiro; Jaroslaw Surkont; et al. "Diversity and Composition of Pelagic Prokaryotic and Protist Communities in a Thin Arctic Sea-Ice Regime". Microbial Ecology (2019): https://doi.org/10.1007%2Fs00248-018-01314-2.
    Publicado • 10.1007/s00248-018-01314-2
  4. Hugo Ribeiro; Joana Gomes da Silva; João Jesus; Catarina Magalhães; Joana M. Dias; Anthony S. Danko. "Biodegradation of biodiesel and toluene under nitrate-reducing conditions and the impact on bacterial community structure". Journal of Soils and Sediments (2019): https://doi.org/10.1007/s11368-018-2079-z.
    Publicado • 10.1007/s11368-018-2079-z
  5. Hugo Ribeiro; Trelita de Sousa; João P. Santos; António G.G. Sousa; Catarina Teixeira; Maria R. Monteiro; Paula Salgado; et al. "Potential of dissimilatory nitrate reduction pathways in polycyclic aromatic hydrocarbon degradation". Chemosphere 199 (2018): 54-67. https://doi.org/10.1016/j.chemosphere.2018.01.171.
    Publicado • 10.1016/j.chemosphere.2018.01.171
  6. J.P. Santos; D. Mendes; M. Monteiro; H. Ribeiro; M.S. Baptista; M.T. Borges; C. Magalhães. "Salinity impact on ammonia oxidizers activity and amoA expression in estuarine sediments". Estuarine, Coastal and Shelf Science (2017): https://doi.org/10.1016%2Fj.ecss.2017.09.001.
    Publicado • 10.1016/j.ecss.2017.09.001
  7. Francisco S. Portugal; Joana M. Dias; Hugo Ribeiro; Catarina Magalhães; Ana P. Mucha; Anthony S. Danko. "Anaerobic Biodegradation of Ethylic and Methylic Biodiesel and Their Impact on Benzene Degradation". CLEAN - Soil, Air, Water 45 6 (2017): 1600264-1600264. https://doi.org/10.1002%2Fclen.201600264.
    Publicado • 10.1002/clen.201600264
  8. Hugo Ribeiro; Ana P. Mucha; Isabel Azevedo; Paula Salgado; Catarina Teixeira; C. Marisa R. Almeida; Samantha B. Joye; Catarina Magalhães. "Differential effects of crude oil on denitrification and anammox, and the impact on N2O production". Environmental Pollution 216 (2016): 391-399. https://doi.org/10.1016/j.envpol.2016.05.045.
    Publicado • 10.1016/j.envpol.2016.05.045
  9. Hugo Ribeiro; C. Marisa R. Almeida; Catarina Magalhães; Adriano A. Bordalo; Ana P. Mucha. "Salt marsh sediment characteristics as key regulators on the efficiency of hydrocarbons bioremediation by Juncus maritimus rhizospheric bacterial community". Environmental Science and Pollution Research 22 1 (2014): 450-462. https://doi.org/10.1007/s11356-014-3388-4.
    Publicado • 10.1007/s11356-014-3388-4
  10. Hugo Ribeiro; Mucha, A.P.; Almeida, C.M.R.; Bordalo, A.A.. "Potential of phytoremediation for the removal of petroleum hydrocarbons in contaminated salt marsh sediments". Journal of Environmental Management 137 (2014): 10-15. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84894654947&partnerID=MN8TOARS.
    Publicado • 10.1016/j.jenvman.2014.01.047
  11. Hugo Ribeiro; Almeida, C. Marisa R.; Mucha, Ana Paula; Bordalo, Adriano A.. "Influence of different salt marsh plants on hydrocarbon degrading microorganisms abundance throughout a phenological cycle". International Journal of Phytoremediation 15 8 (2013): 715-728. http://dx.doi.org/10.1080/15226514.2012.735285.
    Publicado • 10.1080/15226514.2012.735285
  12. Hugo Ribeiro; Almeida, C.M.R.; Mucha, A.P.; Teixeira, C.; Bordalo, A.A.. "Influence of natural rhizosediments characteristics on hydrocarbons degradation potential of microorganisms associated to Juncus maritimus roots". International Biodeterioration and Biodegradation 84 (2013): 86-96. https://doi.org/10.1016/j.ibiod.2012.05.039.
    Publicado • 10.1016/j.ibiod.2012.05.039
  13. Hugo Ribeiro; Mucha, A.P.; Marisa R. Almeida, C.; Bordalo, A.A.. "Bacterial community response to petroleum contamination and nutrient addition in sediments from a temperate salt marsh". Science of the Total Environment 458-460 (2013): 568-576. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84878197462&partnerID=MN8TOARS.
    Publicado • 10.1016/j.scitotenv.2013.04.015
  14. Hugo Ribeiro; Mucha, Ana P.; Almeida, C. Marisa R.; Bordalo, Adriano A.. "Hydrocarbon degradation potential of salt marsh plant–microorganisms associations". Biodegradation 22 4 (2010): 729-739. http://dx.doi.org/10.1007/s10532-010-9446-9.
    Publicado • 10.1007/s10532-010-9446-9
Capítulo de livro
  1. Ribeiro, Hugo; Santos, João P.; Sousa, António G.G.; Salgado, Paula; Tomasino, Maria Paola; Baptista, Mafalda S.; Magalhães, Catarina. "Aerobic ammonia-oxidizing prokaryotes: a perception of their niche segregation across estuarine salinity gradients". In Global inplications of the Nitrogen cycle, editado por de Sousa, Trelita. Newcastle, Reino Unido: Cambridge Scholars Publishing, 2020.
    Publicado
  2. Almeida, C. Marisa R.; Couto, Nazaré; Ribeiro, Hugo; Mucha, Ana Paula; Bordalo, Adriano; Basto, M. Clara; Vasconcelos, M. Teresa S. D.. "Salt Marsh Plants’ Potential for the Remediation of Hydrocarbon-Contaminated Environments". In Phytoremediation, editado por Abid A. Ansari; Sarvajeet Singh Gill; Ritu Gill; Guy R. Lanza; Lee Newman, 323-331. Springer International Publishing, 2015.
    Publicado • 10.1007/978-3-319-10395-2_23
Poster em conferência
  1. Ribeiro, Hugo; Wijaya, I Made; Soares-Santos, Verónica; Santos, Alexandra; Salgado, Paula; Machado, Ana; Costa-Dias, Sérgia; A. Bordalo, Adriano; Teixeira, Catarina. "Exploring microorganism’s ecology to improve anaerobic nitrogen removal in wastewater treatment.". Trabalho apresentado em SIEBM – 20th Iberian Symposium on Marine Biology Studies, 2019.
  2. Mendes, Rafaela P.; Ramos, Sandra; Diogo A. M. Alexandrino; Bôto, Maria; Ribeiro, Hugo; Magalhães, Catarina; Carvalho, Maria F.; Almeida, C. Marisa R.; Mucha, Ana P.. "An innovative approach to help clean oil spills: native microbial consortia with bioremediation capacity". Trabalho apresentado em ECSA 57: Changing estuaries, coasts and shelf systems - Diverse threats and opportunities, Perth, Australia, 2018.
  3. Sousa A.G.G.; Tomasino M.P.; Duarte P.; Fernández-Méndez M.; Assmy P.; Hugo Ribeiro; Surkont J.; et al. "The Arctic microbiome during the winter-spring transition: nitrogen-cycle genes.". Trabalho apresentado em POLAR2018, 2018.
  4. Santos J.P.; Hugo Ribeiro; Sousa A.G.G.; Padeiro A.; Canário J.; Magalhães C.. "Anthropogenic impact on soil prokaryotic communities of Fildes Peninsula". Trabalho apresentado em Polar 2018, 2018.
  5. Hugo Ribeiro; Salgado P.; Almeida C.M.R.; Mucha A.P.; Magalhães C.. "Effects of Crude Oil on microbial denitrification and N2O production in salt marsh sediments". Trabalho apresentado em FEMS 2017, 2017.
  6. Hugo Ribeiro; Sousa T.; Santos J.P.; Teixeira C.; Salgado P.; Mucha A.P.; Almeida C.M.R.; Magalhães C.. "Naphthalene and fluoranthene degradation under nitrate reduction conditions - key shifts on indigenous estuarine microbial consortium". Trabalho apresentado em ECSA 56, 2016.
  7. Hugo Ribeiro; C. Magalhães; A.P. Mucha; M.F. Carvalho; CMR Almeida; I. Azevedo ; S. Ramos ; et al. "Development and validation of an autonomous filtration system for integrated marine monitoring". Trabalho apresentado em ECSA 56, 2016.
Resumo em conferência
  1. Ribeiro, Hugo; da Silva, J.G.; Jesus, J.; Magalhães, C.; Danko, A.S.; Dias, J.M.. "Exploring the biodiesel and toluene anaerobic bioremediation potential in soils". Trabalho apresentado em BioRemid2019 - 2nd International Meeting on New Strategies in Bioremediation Processes, Porto, 2019.
    Publicado
Tese / Dissertação
  1. Ribeiro, Hugo. "Petroleum hydrocarbons bioremediation in a temperate salt marsh: Plant - microorganisms interactions". Doutoramento, Universidade do Porto Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar, 2013. https://sigarra.up.pt/icbas/pt/pub_geral.pub_view?pi_pub_base_id=30763.

Propriedade Intelectual

Patente
  1. Ribeiro, Hugo. 2020. "Device for capturing in situ aquatic microbiomes".
Atividades

Organização de evento

Nome do evento
Tipo de evento (Tipo de participação) 		Instituição / Organização
2014/10 - 2014/10 6th Conference of the Portuguese Polar Program (PROPOLAR) (2014/10 - 2014/10)
Conferência (Membro da Comissão Organizadora)
 Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal

Participação em evento

Descrição da atividade
Tipo de evento 		Nome do evento
Instituição / Organização
2015 - 2015 Participation on the course of Analytical techniques in LC-MS / MS in aquatic environment
Oficina (workshop)
 Course of Analytical techniques in LC-MS / MS in aquatic environment
Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
2014 - 2014 Participation on the advanced course on Bioinformatics of microbial genomes and mobile elements: New perspectives and applications
Oficina (workshop)
Universidade de Aveiro Centro de Estudos do Ambiente e do Mar, Portugal

Tutoria

Tópico Nome do aluno
2015/07 - 2015/07 Training in the application of standardized analytical methods under the scope of the BIOMAR.PT project BSc, MSc, PhDs, post-docs, graduate students, and professionals