???global.info.a_carregar???
Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Catarina Inês Marques de Sousa Mendes

Nomes de citação

  • Mendes, Catarina

Identificadores de autor

Ciência ID
BC17-7B4F-737C
ORCID iD
0000-0002-3090-7426

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Inglês Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1)
Português Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1)
Formação
Grau Classificação
2022/06/01
Em curso
 Doutoramento Bolonha em Programa Doutoral do Centro Académico de Medicina de Lisboa (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Faculdade de Medicina, Portugal
"TRACI: Towards Accreditation in Metagenomics for Clinical Microbiology" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 n/a
2017
Em curso
 Ciências e Tecnologias da Saúde (Doutoramento)
Especialização em Especialidade: Biologia Computacional
Universidade de Lisboa Faculdade de Medicina, Portugal
"TRACI: Towards accreditation in metagenomics for clinical microbiology" (TESE/DISSERTAÇÃO)
2016/11/04
Concluído
 Mestrado em Bioinformática e Biologia computacional (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
"Pan-genome comparison between Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis isolates from human and animal sources" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 17
2016
Concluído
 Bioinformática e Biologia Computacional (Mestrado)
Especialização em Área de especialização: Bioinformática
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
"Pan-genome comparison between Streptococcus dysgalactiae subs.equisimilis isolates from human and animal sources" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 17 valores
2014/06/14
Concluído
 Licenciatura em Biologia Celular e Molecular (Licenciatura)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
"n/a" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 15
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2016 - 2018 Investigador (Investigação) Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes, Portugal
2016/09/21 - 2017/12/31 Investigador (Investigação) Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes, Portugal
2015 - 2015 Investigador (Investigação) Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes, Portugal

Outros

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2015/09/01 - 2016/09/20 Estudante de Mestrado Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes, Portugal
2014/06/23 - 2014/07/11 Estágio no âmbito do Programa de Introdução à Prática Profissional Hospital SAMS, Portugal
Projetos

Bolsa

Designação Financiadores
2018/01 - 2021/12 TRACI: Towards Accreditation in Metagenomics for Clinical Microbiology
SFRH/BD/129483/2017
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia

Projeto

Designação Financiadores
2016/12/01 - 2019/11/30 BacGenTrack – An integrated system for Bacterial Genome Tracking using high throughput sequencing technology: from identification to visualization<br>
TUBITAK/0004/2014
Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes, Portugal

Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
Produções

Publicações

Artigo em revista
  1. Catarina I. Mendes; Erley Lizarazo; Miguel P. Machado; Diogo N. Silva; Adriana Tami; Mário Ramirez; Natacha Couto; John W. A. Rossen; João A. Carriço. "DEN-IM: dengue virus genotyping from amplicon and shotgun metagenomic sequencing". Microbial Genomics (2020): https://doi.org/10.1099/mgen.0.000328.
    10.1099/mgen.0.000328
  2. Giuseppe Fleres; Natacha Couto; Leonard Schuele; Monika A Chlebowicz; Catarina I Mendes; Luc W M van der Sluis; John W A Rossen; Alex W Friedrich; Silvia García-Cobos. "Detection of a novel mcr-5.4 gene variant in hospital tap water by shotgun metagenomic sequencing". Journal of Antimicrobial Chemotherapy (2019): https://doi.org/10.1093/jac/dkz363.
    10.1093/jac/dkz363
  3. Mendes, Catarina. "Streptococcus pneumoniae Serotype 3 in Mexico (1994 to 2017): Decrease of the Unusual Clonal Complex 4909 Lineage following PCV13 Introduction". (2018): http://dx.doi.org/10.1128/jcm.01354-18.
    10.1128/jcm.01354-18
  4. Mendes, Catarina. "Critical steps in clinical shotgun metagenomics for the concomitant detection and typing of microbial pathogens.". Scientific reports (2018): http://europepmc.org/articles/PMC6137123.
    10.1038/s41598-018-31873-w
  5. Pinho MD; Erol E; Ribeiro-Gonçalves B; Mendes CI; Carriço JA; Matos SC; Preziuso S; et al. "Beta-hemolytic Streptococcus dysgalactiae strains isolated from horses are a genetically distinct population within the Streptococcus dysgalactiae taxon.". (2016): http://europepmc.org/abstract/med/27530432.
    10.1038/srep31736
Tese / Dissertação
  1. Mendes, Catarina Inês Marques de Sousa. "Pan-genome comparison between Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis isolates from human and animal sources". Mestrado, 2016. http://hdl.handle.net/10451/25958.

Outros

Outra produção
  1. DEN-IM: Dengue Virus identification from shotgun and targeted metagenomics. 2019. C I Mendes; E Lizarazo; M P Machado; D N Silva; A Tami; M Ramirez; N Couto; J W A Rossen; J A Carriço. https://doi.org/10.1101/628073.
    10.1101/628073
Distinções

Prémio

2017 Melhor Poster | Best Poster
Sociedade Portuguesa de Microbiolgia, Portugal
2017 Melhor poster | Best poster
Universidade do Minho, Portugal