???global.info.a_carregar???
João Santos Rebelo.
Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
João Santos Rebelo

Nomes de citação

  • João S. Rebelo
  • Rebelo, J. S.
  • Rebelo, João

Identificadores de autor

Ciência ID
A015-FF75-397C
ORCID iD
0000-0002-8662-7378

Endereços de correio eletrónico

  • joaorebelo_4@hotmail.com (Profissional)

Moradas

  • Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Campo Grnade, 1749-016, Lisboa, Lisboa, Portugal (Profissional)

Domínios de atuação

  • Ciências Exatas - Ciências da Computação e da Informação - Bioinformática
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Microbiologia
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia Molecular

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Português (Idioma materno)
Inglês Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C2)
Formação
Grau Classificação
2021/10/01 - 2025/10/01
Em curso
Biologia (Doutoramento)
Especialização em Bioinformática
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2021/01/18 - 2021/03/20
Concluído
Analyzing Data with Python (Outros)
International Business Machines Corp, Estados Unidos
2020/11/29 - 2020/12/21
Concluído
High-Dimensional Data Analysis (Outros)
Harvard University T H Chan School of Public Health, Estados Unidos
2020/11/29 - 2020/12/18
Concluído
Statistical Inference and Modeling for High-throughput Experiments (Outros)
Harvard University T H Chan School of Public Health, Estados Unidos
2020/10/06 - 2020/11/03
Concluído
Data Science: Inference and Modeling (Outros)
Harvard University T H Chan School of Public Health, Estados Unidos
2017/09/05 - 2019/11/18
Concluído
Bioinformática e Biologia Computacional (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
"Modelling phenotypic resistance to ampicillin in a Petri dish" (TESE/DISSERTAÇÃO)
2017/10/28 - 2017/10/29
Concluído
Introdução à Linguagem de Programação R (Outros)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2013/09/25 - 2017/06/09
Concluído
Biologia (Licenciatura)
Especialização em Biologia Molecular e Genética
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
Projetos

Bolsa

Designação Financiadores
2021/10/01 - 2025/09/30 Plasmid Diversity and Evolution in the Bacterial World
SFRH/BD/04631/2021
Bolseiro de Doutoramento
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
Produções

Publicações

Artigo em revista
  1. Bruno Tiago da Silva Luz; João S. Rebelo; Francisca Monteiro; Francisco Dionisio. "What Is the Impact of Antibiotic Resistance Determinants on the Bacterial Death Rate?". Antibiotics (2025): http://dx.doi.org/10.3390/antibiotics14020201.
    10.3390/antibiotics14020201
  2. Célia P. F. Domingues; João S. Rebelo; Francisco Dionisio; Teresa Nogueira. "Multi-Drug Resistance in Bacterial Genomes—A Comprehensive Bioinformatic Analysis". International Journal of Molecular Sciences (2023): https://doi.org/10.3390/ijms241411438.
    10.3390/ijms241411438
  3. João S. Rebelo; Célia P. F. Domingues; Teresa Nogueira; Francisco Dionisio. "Plasmids Increase the Competitive Ability of Plasmid-Bearing Cells Even When Transconjugants Are Poor Donors, as Shown by Computer Simulations". Microorganisms (2023): https://doi.org/10.3390/microorganisms11051238.
    10.3390/microorganisms11051238
  4. João S. Rebelo; Célia P. F. Domingues; Francisco Dionisio. "Plasmid Costs Explain Plasmid Maintenance, Irrespective of the Nature of Compensatory Mutations". Antibiotics (2023): https://doi.org/10.3390/antibiotics12050841.
    10.3390/antibiotics12050841
  5. Francisco Dionisio; Célia P. F. Domingues; João S. Rebelo; Francisca Monteiro; Teresa Nogueira. "The Impact of Non-Pathogenic Bacteria on the Spread of Virulence and Resistance Genes". International Journal of Molecular Sciences (2023): https://doi.org/10.3390/ijms24031967.
    10.3390/ijms24031967
  6. Helena Darmancier; Célia P. F. Domingues; João S. Rebelo; Ana Amaro; Francisco Dionísio; Joël Pothier; Octávio Serra; Teresa Nogueira. "Are Virulence and Antibiotic Resistance Genes Linked? A Comprehensive Analysis of Bacterial Chromosomes and Plasmids". Antibiotics 11 6 (2022): 706-706. https://doi.org/10.3390/antibiotics11060706.
    Publicado • 10.3390/antibiotics11060706
  7. Célia P. F. Domingues; João S. Rebelo; Francisca Monteiro; Teresa Nogueira; Francisco Dionisio. "Harmful behaviour through plasmid transfer: a successful evolutionary strategy of bacteria harbouring conjugative plasmids". Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences (2022): https://doi.org/10.1098/rstb.2020.0473.
    Acesso aberto • Publicado • 10.1098/rstb.2020.0473
  8. João S. Rebelo; Célia P. F. Domingues; Francisca Monteiro; Teresa Nogueira; Francisco Dionisio. "Bacterial persistence is essential for susceptible cell survival in indirect resistance, mainly for lower cell densities". PLOS ONE (2021): https://doi.org/10.1371/journal.pone.0246500.
    Acesso aberto • Publicado • 10.1371/journal.pone.0246500
  9. João S. Rebelo; Célia P. F. Domingues; Francisco Dionisio; Manuel C. Gomes; Ana Botelho; Teresa Nogueira. "COVID-19 Lockdowns May Reduce Resistance Genes Diversity in the Human Microbiome and the Need for Antibiotics". International Journal of Molecular Sciences (2021): https://doi.org/10.3390/ijms22136891.
    Acesso aberto • Publicado • 10.3390/ijms22136891
  10. Célia P. F. Domingues; João S. Rebelo; Joël Pothier; Francisca Monteiro; Teresa Nogueira; Francisco Dionisio. "The Perfect Condition for the Rising of Superbugs: Person-to-Person Contact and Antibiotic Use Are the Key Factors Responsible for the Positive Correlation between Antibiotic Resistance Gene Diversity and Virulence Gene Diversity in Human Metagenomes". Antibiotics 10 5 (2021): 605. https://doi.org/10.3390/antibiotics10050605.
    Acesso aberto • Publicado • 10.3390/antibiotics10050605
  11. Domingues, Célia P. F.; Rebelo, João S. (A015-FF75-397C); Dionisio, Francisco; Botelho, Ana; Nogueira, Teresa. "The Social Distancing Imposed To Contain COVID-19 Can Affect Our Microbiome: a Double-Edged Sword in Human Health". mSphere 5 5 (2020): http://dx.doi.org/10.1128/msphere.00716-20.
    Acesso aberto • Publicado • 10.1128/msphere.00716-20
Entrada de enciclopédia
  1. Dionisio, Francisco; Célia P. F. Domingues; João S. Rebelo; Francisca Monteiro; Nogueira, Teresa. "The Role of Commensal and other Non-Pathogenic Bacteria". In Scholarly Community Encyclopedia, 2023. https://encyclopedia.pub/entry/40892.
Poster em conferência
  1. Célia P. F. Domingues; João S. Rebelo; Dionisio, Francisco; Nogueira, Teresa. "Co-ocorrência de genes de resistência a antibióticos: localização em plasmídeos nos microorganismos patogénicos prioritários". 2024.
  2. Bruno T. S. Luz; João S. Rebelo; Dionisio, Francisco; Monteiro, Francisca. "Qual é o Efeito da Resistência a Antibióticos na Persistência de uma População Bacteriana?". Trabalho apresentado em Encontro Ciência 2024, 2024.
  3. Silveira, H. D.; Domingues, C. P. F.; Rebelo, J. S.; Amaro, A.; Dionísio, F.; Nogueira, T.. "Genomic dynamics of virulence and antibiotic resistance in bacterial genomes". Trabalho apresentado em 17th Annual Meeting of the Portuguese Association for Evolutionary Biology, 2021.
  4. Domingues, C. P. F. (3416-6299-1379); Rebelo, J. S.; Nogueira, T.; Pothier, J.; Monteiro, F.; Dioinisio, F.. "Why is there a positive correlation between the diversity of virulence and antibiotic-resistance genes?". Trabalho apresentado em RECOMB 2021 - 25th International Conference on Research in Computational Molecular Biology, 2021.
  5. Rebelo, J. S.; Domingues, C. P. F.; Monteiro, F.; Nogueira, T.; Dionisio, F.. "Plasmid transfer as a weapon against plasmid-free cells - a strategy that leads to plasmid maintenance". Trabalho apresentado em RECOMB 2021 - 25th International Conference on Research in Computational Molecular Biology, 2021.
  6. Domingues, C. P. F.; Rebelo, J. S.; Nogueira, T.; Pothier, J.; Monteiro, F.; Dionísio, F.. "Ratio between contagion probability and resistance genes loss rate is key for the emergence of a positive correlation between the diversity of virulence and antibiotic-resistance genes". Trabalho apresentado em Ciências Research Day 2020, 2020.
  7. Rebelo, J. S.; Domingues, C. P. F.; Dionisio, F.; Botelho, A.; Nogueira, T.. "How the measures imposed due to COVID-19 influence the human microbiome?". Trabalho apresentado em Ciências Research Day 2020, 2020.
  8. Rebelo, J. S.; Domingues, C. P. F.; Monteiro, F.; Nogueira, T.; Dionisio, F.. "Long life of persistent cells - faults and errors resulting in a power-law decay". Trabalho apresentado em Ciências Research Day 2020, 2020.
  9. Domingues, C. P. F.; Rebelo, J.S. (A015-FF75-397C); Dionisio, F.; Botelho, A.; Nogueira, T.. "The Distancing Imposed To Contain COVID-19 Can Affect Our Microbiome: a Double-Edged Sword in Human Health". Trabalho apresentado em 6th Annual Meeting 2020 Frontiers in E3, 2020.
  10. Rebelo, J.S.; Domingues, C.P.F.; Dionisio, F.. "Indirect resistance to ampicillin – a computational approach to understand the role of persistence". Trabalho apresentado em VII Jornadas de Investigação em Biologia, 2020.
  11. Domingues, C. P. F.; Rebelo, J.S. (A015-FF75-397C); Nogueira, T.; Pothier, J.; Dionisio, F.. "Correlation between virulence and antibiotic resistance: a study through computational simulations". Trabalho apresentado em VIII Jornadas de Investigação em Biologia, 2020.
  12. Rebelo, J.S. (A015-FF75-397C); Dionisio, F.. "Modelling phenotypic resistance to ampicillin in a Petri dish". Trabalho apresentado em XV Encontro Nacional de Biologia Evolutiva, 2019.
Pré-impressão
  1. João S. Rebelo; Célia P.F. Domingues; Luís Borda-de-Água; Teresa Nogueira; Francisco Dionisio. "The Rare Plasmid Biosphere: A Hidden Reservoir of Genetic Diversity". 2025. https://doi.org/10.1101/2025.07.24.666492.
    10.1101/2025.07.24.666492
  2. Célia P.F. Domingues; João S. Rebelo; Francisco Dionisio; Teresa Nogueira. "Plasmids Across Datasets: Resistance, Virulence, Mobility, and Host Taxonomy". 2025. https://doi.org/10.1101/2025.01.30.635773.
    10.1101/2025.01.30.635773
Tese / Dissertação
  1. Rebelo, João. "Modelling phenotypic resistance to ampicillin in a Petri dish". Mestrado, 2019.
Atividades

Apresentação oral de trabalho

Título da apresentação Nome do evento
Anfitrião (Local do evento)
2025/05/08 The great diversity of the Rare Plasmid Biosphere Encontros Scientia cE3c
(Portugal)
2024/10/24 Conjugative plasmids as biological weapons of donor bacterial cells Evolving Microbes and Global Health
Gulbenkian Institute for Molecular Medicine (Portugal)
2024/10/24 Genomic dynamics and evolution of antibiotic resistance in microbial ecosystems Evolving Microbes and Global Health
Gulbenkian Institute for Molecular Medicine (Portugal)
2022/12/16 Long-term plasmid maintenance - plasmids used as weapons in bacterial competition XVIII National Meeting of Evolutionary
Universidade do Minho (Braga, Portugal)
2022/09/08 The ecology of indirect resistance to antibiotics 5th International Caparica Conference in Antibiotic Resistance 2022
NOVA School of Science and Technology (Portugal)
2022/09/05 Genomic dynamics and evolution of antibiotic resistance and bacterial virulence 5th International Caparica Conference in Antibiotic Resistance 2022
NOVA School of Science and Technology (Portugal)
2022/05/13 Será que a patogenicidade bacteriana e a resistência a antibióticos estão associados? VI Ciclo de Conferências em Biotecnologia
Universidade da Beira Interior (Portugal)
2022/01/13 The plasmid paradox demands a paradoxical solution Encontros Scientia cE3c
(Portugal)
2021/10/28 Bacteria escaping antibiotics - the role of persistence Seminários em Bioinformática e Biologia Computacional
Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa
2021/10/01 Are you sure you know why certain plasmids have the ability to transfer between bacteria? Frontiers in E3 - 7th Annual Meeting
Centre for Ecology, Evolution and Environmental Changes - cE3c (Portugal)
2021/10/01 Impact of COVID-19 measures on resistance genes diversity in the human microbiome and antibiotic administration Frontiers in E3 - 7th Annual Meeting
Centre for Ecology, Evolution and Environmental Changes - cE3c (Portugal)
2021/05/12 The dark side of conjugative plasmids Encontros Scientia cE3c
(Portugal)
2021/02/02 Human connections drive the evolution of metagenomes with virulence and antibiotic-resistance genes Alphy 2021
(França)
2020/12/16 Human microbiome evolution and antibiotic resistance in pandemic times XVI ENBE
Universidade de Aveiro (Aveiro, Portugal)
2020/12/16 Human social interactions shape the distribution of pathogenicity and antibiotic resistance genes XVI ENBE
Universidade de Aveiro (Aveiro, Portugal)
2020/12/16 Bacterial persistence: an evolutionary mechanism or a set of errors in lucky bacteria? XVI ENBE
Universidade de Aveiro (Aveiro, Portugal)
2020/10/21 A journey through the phenomena of persistence and indirect resistance Seminários em Bioinformática e Biologia Computacional
Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa
2020/10/01 The advantage of dying slowly - the impact of persistence in indirect resistance 6th Annual Meeting 2020 Frontiers in E3
2020/10/01 Understanding the correlation between virulence and antibiotic resistance genes in human metagenomes through computational simulations 6th Annual Meeting 2020 Frontiers in E3
2019/10/17 How sensitive bacteria survive under antibiotic exposure? Seminários em Bioinformática e Biologia Computacional
Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa

Orientação

Título / Tema
Papel desempenhado
Curso (Tipo)
Instituição / Organização
2022/02/21 - 2022/05/27 Morte de bactérias suscetíveis a antibióticos
Coorientador
Estudo Orientado em Biologia Molecular e Genética (Iniciação científica)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2022/02/21 - 2022/05/27 Morte de bactérias suscetíveis a antibióticos
Coorientador
Estudo Orientado em Biologia Molecular e Genética (Iniciação científica)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2021/02/08 - 2021/05/07 Simulation of plasmid transfer on solid surfaces
Orientador de Ana Caroço
Estudo Orientado em Biologia Molecular e Genética (Iniciação científica)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2021/02/08 - 2021/05/07 Simulation of plasmid transfer on solid surfaces
Orientador de Luís Marques
Estudo Orientado em Biologia Molecular e Genética (Iniciação científica)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2021/02/08 - 2021/05/07 Estimation of the number of transconjugants using computer simulations
Orientador de Rodrigo Bernardino
Estudo Orientado em Biologia Molecular e Genética (Iniciação científica)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2021/02/08 - 2021/05/07 Estimation of the number of transconjugants using computer simulations
Coorientador de Pedro Silva
Estudo Orientado em Biologia Molecular e Genética (Iniciação científica)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2021/02/08 - 2021/05/07 Computational approach on the dynamics of growth and conjugation in bacteria
Coorientador de Maria Câncio
Estudo Orientado em Biologia Molecular e Genética (Iniciação científica)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2021/02/08 - 2021/05/07 Computational approach on the dynamics of growth and conjugation in bacteria
Coorientador de Martim Geraldes
Estudo Orientado em Biologia Molecular e Genética (Iniciação científica)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal

Organização de evento

Nome do evento
Tipo de evento (Tipo de participação)
Instituição / Organização
2018/07/23 - 2018/07/27 Volunteer on the organizing committee of ECMTB 2018 - The European Conference on Mathematical and Theoretical Biology (ECMTB) (2018/07/23 - 2018/07/27)
Congresso (Membro da Comissão Organizadora)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2018/03/14 - 2018/03/16 7th Bioinformatics Open Days (2018/03/14 - 2018/03/16) Universidade do Minho, Portugal

Participação em evento

Descrição da atividade
Tipo de evento
Nome do evento
Instituição / Organização
2024/05/15 - 2024/05/15 Pontes entre biologia, estatística, informática e matemática
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2024/03/27 - 2024/03/27 Deciphering the Microbiome: Research and Applications in Early Human Development
Simpósio
Applied Microbiology International, Reino Unido
2023/10/26 - 2023/10/27 2nd Microbiome PT Summit
Conferência
Universidade de Lisboa Faculdade de Medicina, Portugal
2023/07/03 - 2023/07/10 Clinical and Environmental Metagenome Analysis Rice Global Paris Center (Paris)
2023/05/10 - 2023/05/10 Pontes entre biologia, estatística, informática e matemática
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2022/12/15 - 2022/12/16 XVIII National Meeting of Evolutionary Biology
Encontro
XVIII ENBE
Universidade do Minho, Portugal
2021/10/27 - 2021/10/27 One Health EJP Dissemination Workshop on Metagenomics
Oficina (workshop)
2021/08/29 - 2021/09/01 25th International Conference on Research in Computational Molecular Biology
Conferência
RECOMB 2021
Università degli Studi di Padova, Itália
2021/02/04 - 2021/02/04 1st Microbiome PT Summit
Encontro
BioData.pt, Portugal
2021/01/26 - 2021/01/27 Inhomogeneous Random Systems
Institut Curie, França

Institut Henri Poincaré, França
2020/11/18 - 2020/11/18 3rd Workshop on Human BioMonitoring in Portugal
Oficina (workshop)
2020/06/22 - 2020/06/25 24th International Conference on Research in Computational Molecular Biology RECOMB 2020
Università degli Studi di Padova, Itália
2018/03/14 - 2018/03/14 Understanding Microbial Dynamics and Interventions with Mathematical Models
Oficina (workshop)
Universidade do Minho, Portugal
2017/10/26 - 2017/11/09 Curso de Persuasão e Influência - Speak and Lead
Outro
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2014/02/24 - 2014/03/06 II Jornadas de Investigação em Biologia
Encontro
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal

Curso / Disciplina lecionado

Disciplina Curso (Tipo) Instituição / Organização
2021/04/08 - 2021/04/09 Fundamentals of R, statistical analysis and data treatment course given to students of the Master in Applied Microbiology (7h duration) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
Distinções

Outra distinção

2020 Most read paper September 2020 - mSphere
American Society for Microbiology, Estados Unidos
2020 Top most read paper October-December 2020 - mSphere
American Society for Microbiology, Estados Unidos