???global.info.a_carregar???
Francisco Daniel de Oliveira Pascoal holds a Master of Science degree in Microbiology from Instituto Superior Técnico, and a Bachelor degree in Cell and Molecular Biology from Faculty of Science and Technology from NOVA University of Lisbon. Francisco is currently finishing is PhD in Biology from Faculty of Sciences of University of Porto. Francisco Pascoal has expertise on the analysis of microbiome DNA sequencing data, metagenomics, bioinformatics, machine learning and the rare biosphere.
Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Francisco Daniel de Oliveira Pascoal
Data de nascimento
1996/09/20
Género
Masculino

Nomes de citação

  • Pascoal, Francisco

Identificadores de autor

Ciência ID
8B1E-8CB5-C47C
ORCID iD
0000-0003-2315-358X

Endereços de correio eletrónico

  • up202010522@g.uporto.pt (Profissional)
  • fpascoal1996@gmail.com (Pessoal)

Websites

  • pascoalf.wordpress.com (Pessoal)

Domínios de atuação

  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Microbiologia

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Português (Idioma materno)
Inglês Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1)
Formação
Grau Classificação
2020/09 - 2025/03/30
Em curso
 Biologia (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
"Novel Insights into the Ecology of the Microbial Rare Biosphere using Microbiome DNA Sequencing and Machine Learning" (TESE/DISSERTAÇÃO)
2017/09 - 2019/11/26
Concluído
 Microbiologia (Mestrado)
Especialização em Microbiologia
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
"Tackling the diversity of the marine microbial rare biosphere: methodological chalenges and ecological insights" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 16,65
2014/09 - 2017/07/05
Concluído
 Biologia Celular e Molecular (Licenciatura)
Especialização em Biologia Celular e Molecular
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
 15.03
2016/07/25 - 2016/07/29
Concluído
 SummerScience@ITQB NOVA (Outros)
Especialização em microbiologia
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
 19
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2025/02/21 - Atual Investigador Contratado (Investigação) Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
2020/02/01 - 2025/01/31 Investigador (Investigação) Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
(...)
2019/06/01 - 2020/01/15 Investigador (Investigação) Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
2019/09 - 2019/11 Estagiário de Investigação (Investigação) Dalhousie University - Faculty of Computer Science, Canadá
Dalhousie University - Faculty of Computer Science, Canadá
2014/06/30 - 2014/07/06 Estagiário de Investigação (Investigação) Ciência Viva, Portugal
Universidade do Porto Centro de Investigação em Química, Portugal
2013/07 - 2013/07 Estagiário de Investigação (Investigação) Ciência Viva, Portugal
Universidade de Évora Instituto de Ciências Agrárias e Ambientais Mediterrânicas, Portugal
2012/07/15 - 2012/07/31 Estagiário de Investigação (Investigação) Ciência Viva, Portugal
Centro de Ciências do Mar, Portugal
Projetos

Bolsa

Designação Financiadores
2021/02/01 - 2025/01/31 Deciphering the roles of the prokaryotic rare biosphere in the Arctic Ocean under climate change
2020.04453.BD
Bolseiro de Doutoramento
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2019/03/01 - 2020/12 NITROLIMIT - Life at the edge: define the boundaries of the Nitrogen Cycle in the Extreme Antarctic Terrestrial Environments
PTDC/CTA-AMB/30997/2017
Bolseiro de Investigação
Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental da Madeira, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso

Projeto

Designação Financiadores
2021/07/01 - Atual CONNECT2OCEANS - Connecting Atlantic and Arctic Oceans to Decipher Climate Change Impact on Plankton Microbiome Functions.
PTDC/CTA-AMB/4946/2020
Bolseiro de Doutoramento
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2021/07/01 - Atual Mercury Biogeochemistry, Fate and Impact in Permafrost Thaw Ecosystems
PTDC/CTA-AMB/4744/2020
Bolseiro de Doutoramento
Fundação para a Ciência e a Tecnologia

Outro

Designação Financiadores
2023/03/12 - 2026/03/11 Nitrogen Microbiome in the Changing Arctic
2022.02983.PTDC
10.54499/2022.02983.PTDC
Universidade do Porto Faculdade de Desporto, Portugal

Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Tecnologia e Ciência, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
Produções

Publicações

Artigo em revista
  1. Pascoal, Francisco; Duarte, Pedro; Assmy, Philipp; Costa, Rodrigo; Magalhães, Catarina. "Full-length 16S rRNA gene sequencing combined with adequate database selection improves the description of Arctic marine prokaryotic communities". Annals of Microbiology 74 1 (2024): http://dx.doi.org/10.1186/s13213-024-01767-6.
    10.1186/s13213-024-01767-6
  2. Francisco Pascoal; Maria Paola Tomasino; Roberta Piredda; Grazia Marina Quero; Luís Torgo; Julie Poulain; Pierre E Galand; et al. "Inter-comparison of marine microbiome sampling protocols". ISME Communications (2023): https://doi.org/10.1038/s43705-023-00278-w.
    10.1038/s43705-023-00278-w
  3. Carneiro, João; Pascoal, Francisco; Semedo, Miguel; Pratas, Diogo; Tomasino, Maria Paola; Rego, Adriana; Carvalho, Maria de Fátima; Mucha, Ana Paula; Magalhães, Catarina. "Mapping human pathogens in wastewater using a metatranscriptomic approach". Environmental Research 231 (2023): 116040. http://dx.doi.org/10.1016/j.envres.2023.116040.
    10.1016/j.envres.2023.116040
  4. Pascoal, Francisco; Areosa, Inês; Torgo, Luís; Branco, Paula; Baptista, Mafalda S.; Lee, Charles K.; Cary, S. Craig; Magalhães, Catarina. "The spatial distribution and biogeochemical drivers of nitrogen cycle genes in an Antarctic desert". Frontiers in Microbiology 13 (2022): http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2022.927129.
    10.3389/fmicb.2022.927129
  5. Francisco Pascoal; Rodrigo Costa; Philipp Assmy; Pedro Duarte; Catarina Magalhães. "Exploration of the Types of Rarity in the Arctic Ocean from the Perspective of Multiple Methodologies". Microbial Ecology (2021): https://doi.org/10.1007/s00248-021-01821-9.
    10.1007/s00248-021-01821-9
  6. Pascoal, Francisco; Costa, Rodrigo; Magalhães, Catarina. "The microbial rare biosphere: current concepts, methods and ecological principles". FEMS Microbiology Ecology (2020): http://dx.doi.org/10.1093/femsec/fiaa227.
    10.1093/femsec/fiaa227
  7. Pascoal, Francisco; Magalhães, Catarina; Costa, Rodrigo. "The Link Between the Ecology of the Prokaryotic Rare Biosphere and Its Biotechnological Potential". Frontiers in Microbiology 11 (2020): http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2020.00231.
    10.3389/fmicb.2020.00231
  8. Rego, Adriana; Sousa, António G. G.; Santos, João P.; Pascoal, Francisco; Canário, João; Leão, Pedro N.; Magalhães, Catarina. "Diversity of Bacterial Biosynthetic Genes in Maritime Antarctica". Microorganisms 8 2 (2020): 279. http://dx.doi.org/10.3390/microorganisms8020279.
    10.3390/microorganisms8020279
Poster em conferência
  1. Pascoal, Francisco; Costa, Rodrigo; Branco, Paula; Torgo, Luis; Assmy, Philipp; Magalhães, Catarina. "Construction of a long-term dataset of prokaryotic diversity from two transects of the MOSJ program". Trabalho apresentado em XV Conferência Portuguesa de Ciências Polares, 2023.
  2. Pascoal, Francisco; Branco, Paula; Costa, Rodrigo; Magalhães, Catarina. "Unsupervised learning based definition of the microbial rare biosphere". Trabalho apresentado em BTC - Blue Think Conference, 2023.
  3. Pascoal, Francisco; Costa, Rodrigo; Torgo, Luis; Duarte, Pedro; Assmy, Philipp; Magalhães, Catarina. "Full-length 16S rRNA gene sequencing combined with GTDB database improved the description of microbial communities from marine polar environments". Trabalho apresentado em BAGECO - Bacterial Genomics and Ecology, 2023.
  4. Pascoal, Francisco; Costa, Rodrigo; Magalhãe, Catarina. "The types of prokaryotic rarity in the Arctic ocean". Trabalho apresentado em Arctic Science Summit Week, 2021.
  5. Pascoal, Francisco; Costa, Rodrigo; Magalhães, Catarina. "The prokaryotic rare biosphere is sensible to environmental heterogeinity in the Arctic ocean". Trabalho apresentado em Portuguese Polar Sciences Conference, 2020.
  6. Pascoal, Francisco; Magalhães, Catarina; Costa, Rodrigo. "Thinking microbial rarity". Trabalho apresentado em Halifax Mini Symposium on marine microbiology, 2019.
Tese / Dissertação
  1. Pascoal, Francisco. "Tackling the diversity of the marine microbial rare biosphere: methodological chalenges and ecological insights". Mestrado, Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, 2019.
Website
  1. Pascoal, Francisco; Branco, Paula; Luís Torgo; Costa, Rodrigo; Magalhães, Catarina. Autor correspondente: Pascoal, Francisco. ulrb - Unsupervised Learning based Definition of the Microbial Rare Biosphere. 2024. https://pascoalf.github.io/ulrb/.

Outros

Conjunto de dados
  1. Pascoal, Francisco; Magalhães, Catarina. Arctic microbiome along Svalbard Cross Shelf transects (2017-2020 Campaign)..
Software
  1. Pascoal, Francisco; Paula Branco; Luís Torgo; Costa, Rodrigo; Catarina Magalhães. "ulrb - Unsupervised Learning based Definition of the Microbial Rare Biosphere". 0.1.5. Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental. R. 2024.
Atividades

Apresentação oral de trabalho

Título da apresentação Nome do evento
Anfitrião (Local do evento)
2024/10/25 Impact of Temperature on the diversity of rare prokaryotes in the Arctic Ocean XVI Conferência Portuguesa de Ciências Polares
Universidade da Beira Interior (Almeida, Portugal)
2024/09/10 Identification of rare microorganisms employing unsupervised machine learning. BTC - Blue Think Conference
Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental da Universidade do Porto (Matosinhos, Portugal)
2022/11/18 The spatial distribution and biogeochemical drivers of nitrogen cycle genes in an Antarctic desert XIV Conferência Portuguesa de Ciências Polares
Universidade do Algarve (Faro, Portugal)

Organização de evento

Nome do evento
Tipo de evento (Tipo de participação) 		Instituição / Organização
2023/07/04 - 2033/07/05 Instructor at the Workshop "Meta_Microbial". (2023/07/04 - 2023/07/05)
Oficina (workshop) (Outra)
 Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental da Madeira, Portugal
2024/09/04 - 2024/09/06 Instructor at the Workshop "Meta_Microbial", second edition (2024). (2024/09/04 - 2024/09/06)
Oficina (workshop) (Coorganizador)
 Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental da Madeira, Portugal

Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2021/11/26 - 2021/11/27 XIII Portuguese Polar Sciences Conference (2021/11/26 - 2021/11/27)
Conferência (Outra)

Membro de associação

Nome da associação Tipo de participação
2017/07/01 - 2018/06 Associação Nacional de Estudantes de Biologia. Presidente da Direção
2016/07/01 - 2017/06/30 Associação Nacional de Estudantes de Biologia. Vice Presidente da Direção
2015/09/01 - 2016/06/30 Associação Nacional de Estudantes de Biologia Delegado representativo dos estudantes de Biologia Celular e Molecular da FCT-NOVA

Revisão ad hoc de artigos em revista

Nome da revista (ISSN) Editora
2024/02/07 - 2024/02/14 Annals of Microbiology BMC
2021 - 2022 ISME Communications ( 2730-6151) Nature Publishing groups
2020/04/21 - 2021 Scientific Reports (2045-2322) Nature Publishing groups
2020 - 2020 Environmental Microbiology (1462-2920) Wiley

Tutoria

Tópico Nome do aluno
2022/11/01 - 2023/06/30 Capacitação e Sucesso Escolar Leonardo Vasconcelos
2022/11/01 - 2023/06/30 Capacitação e Sucesso Escolar Rodrigo Carvalho
Distinções

Prémio

2024 Best Oral Presentation at Global Changes and Ecosystem Services BTC
Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal