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Biomedical researcher with over 8 years of experience in bioinformatics, biostatistics, and epigenetic data analysis, currently affiliated with the Epigenetics and Human Diseases Laboratory at the Algarve Biomedical Center Research Institute (ABC-RI) and ABC Collaborative Laboratory (ABC CoLAB). Pursuing a PhD in Biomedical Sciences at the University of Algarve, focused on the multi-omics of healthy and functional ageing. Holds a BSc in Biomedical Sciences, an MSc in Oncobiology — Molecular Mechanisms of Cancer (University of Algarve), and a Master’s Degree in Bioinformatics and Biostatistics (Universidad Católica San Antonio de Murcia). Skilled in R programming, computational biology, and data visualization, with four peer-reviewed publications in Q1 journals — three as first or co-first author. Maintains active international research collaborations as a research volunteer at the William Osler Health System and Unity Health Toronto (Canada), contributing to projects in epigenetics of critical illness and cancer biomarker discovery.
Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Daniel José Formica Pestana

Nomes de citação

  • Pestana, Daniel

Identificadores de autor

Ciência ID
8110-3E59-7DAE
ORCID iD
0009-0001-9530-6349

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Português (Idioma materno)
Italiano (Idioma materno)
Inglês Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2)
Formação
Grau Classificação
2024/01/01 - 2028
Em curso
Ciências Biomédicas (Doutoramento)
Universidade do Algarve, Portugal
2024 - 2025
Concluído
Bioinformatics and Biostatistics (Master)
Universidad Católica San Antonio de Murcia, Espanha
"Epigenetic Modifications in Ageing: A Bioinformatics Approach" (TESE/DISSERTAÇÃO)
2017 - 2020
Concluído
Oncobiologia - Mecanismos Moleculares do Cancro (Mestrado)
Especialização em Sem especialização
Universidade do Algarve, Portugal
"Epigenetic Hotspots in cancer" (TESE/DISSERTAÇÃO)
18
2014 - 2017
Concluído
Ciências Biomédicas (Licenciatura)
Universidade do Algarve, Portugal
"Polioxometalatos com atividade antibacteriana – Estudo de inibição da ca2+-ATPase do retículo sarcoplasmático por polioxometalato de vanádio (PV14)" (TESE/DISSERTAÇÃO)
16
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento
Empregador
2025/11 - Atual Investigador visitante (Investigação) Unity Health Toronto, Canadá
Unity Health Toronto, Canadá
2024/01 - Atual Investigador (Investigação) Universidade do Algarve Faculdade de Medicina e Ciências Biomédicas, Portugal
Algarve Biomedical Center Research Institute, Portugal
(...)
2021/06 - Atual Investigador visitante (Investigação) William Osler Health System, Canadá
William Osler Health System, Canadá
2023/05 - 2023/12 Investigador (Investigação) Algarve Biomedical Center Research Institute, Portugal
2021/04 - 2023/04 Investigador (Investigação) Universidade do Algarve Centro Académico de Investigação e Formação Biomédica do Algarve, Portugal
Universidade do Algarve Centro Académico de Investigação e Formação Biomédica do Algarve, Portugal
2018/08 - 2020/07 Estagiário de Investigação (Investigação) Algarve Biomedical Center Research Institute, Portugal
Algarve Biomedical Center Research Institute, Portugal
(...)

Outros

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento
Empregador
2021/04 - 2023/12 Data Center Operations Manager Associação para o Desenvolvimento do Centro Académico de Investigação e Formação Biomédica do Algarve, Portugal
Associação para o Desenvolvimento do Centro Académico de Investigação e Formação Biomédica do Algarve, Portugal
Projetos

Bolsa

Designação Financiadores
2024/01/01 - 2027/12/31 Ageing Well in Algarve: A Clinical, Molecular and Geospatial integrative analysis into Elderly Health and Fitness
Bolseiro de Doutoramento
Algarve Biomedical Center Research Institute, Portugal

Laboratório Colaborativo do Algarve Biomedical Center Soluções Integradas para o Envelhecimento e Rejuvenescimento, Portugal

Universidade do Algarve Departamento de Ciências Biomédicas e Medicina, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2026/02/23 - 2027/08/22 THOR-SIGNAL: THOR Methylation signatures in liquid biopsy for breast cancer detection
2024.17709.PEX
Investigador
Universidade do Algarve, Portugal

The Hospital for Sick Children, Canadá
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2025/03 - 2027/02 hTERT Promoter Methylation as a Biomarker for Breast Cancer Detection in Blood
Bolsa de Investigação em Oncologia LPCC-NRS 2025
Investigador
Algarve Biomedical Center Research Institute, Portugal
Liga Portuguesa Contra o Cancro
Em curso
2023/05 - 2023/12/31 ALFA Score - ALgarve Fit Aging Score: uma nova ferramenta integrada para melhorar a qualidade de vida e o envelhecimento saudável
ALG-01-0145-FEDER-072586
Bolseiro de Investigação
Universidade do Algarve Centro Académico de Investigação e Formação Biomédica do Algarve, Portugal
Concluído
Produções

Publicações

Artigo em revista
  1. Pestana, Daniel; Joshi, Divya; Duan, Erick; Fowler, Robert; Tsang, Jennifer; Binnie, Alexandra. "The burden of COVID-19 care in community and academic intensive care units in Ontario, Canada: a retrospective cohort study". Canadian Journal of Anesthesia/Journal canadien d'anesthésie [Q1] (2024): https://doi.org/10.1007/s12630-024-02894-z.
    Publicado • 10.1007/s12630-024-02894-z
  2. Cândida Cardoso; Pestana, Daniel; Sreemol Gokuladhas; Ana D. Marreiros; Justin O'Sullivan; Alexandra Binnie; Mónica T. Fernandes; Castelo-Branco, P. "Identification of Novel DNA Methylation Prognostic Biomarkers for AML With Normal Cytogenetics". JCO Clinical Cancer Informatics [Q1] (2024): http://dx.doi.org/10.1200/cci.23.00265.
    Publicado • 10.1200/cci.23.00265
  3. Pestana, Daniel; Moura, Kyra; Moura, Claire; Mouliakis, Taylor; D’Aragon, Frédérick; Tsang, Jennifer L. Y.; Binnie, Alexandra. "The impact of COVID-19 workload on psychological distress amongst Canadian intensive care unit healthcare workers during the 1st wave of the COVID-19 pandemic: A longitudinal cohort study". PLOS ONE [Q1] 19 3 (2024): e0290749. http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0290749.
    Publicado • 10.1371/journal.pone.0290749
  4. Sharma-Oates, Archana; Sullivan, Jack; Pestana, Daniel; dos Santos, Claudia C.; Binnie, Alexandra; Lord, Janet M.. "Association of Epigenetic Age and Outcome in Critically Ill Patients". Critical Care Explorations [Q1] 6 2 (2024): e1044. http://dx.doi.org/10.1097/cce.0000000000001044.
    Publicado • 10.1097/cce.0000000000001044
Poster em conferência
  1. Pestana, Daniel; Cardoso, Candida; Ramos, Mónica; Rajado, Ana Teresa; Silva, Nádia; Apolónio, Joana ; Nóbrega, Clévio David Rodrigues ; Justin O'Sullivan; Pedro Castelo-Branco. Autor correspondente: Pestana, Daniel. "Ageing Well in Algarve: A Clinical, Molecular and Geospatial integrative analysis into Elderly Health and fitness". Trabalho apresentado em Encontro Ciência 2025, 2025.
  2. Cardoso, Candida; Pestana, Daniel; Apolónio, Joana ; Silva, Nádia; Nunes, Nuno Miguel; Tabori, Uri; Pedro Castelo-Branco. Autor correspondente: Cardoso, Candida. "THOR Methylation signatures in liquid biopsies for early breast cancer detection". Trabalho apresentado em Encontro Ciência 2025, 2025.
  3. Cardoso, Candida; Pestana, Daniel; Apolónio, Joana ; Nunes, Nuno Miguel; Tabori, Uri; Pedro Castelo-Branco. "THOR Methylation signatures in liquid biopsies for early breast cancer detection". Trabalho apresentado em Annual Congress of the European Association for Cancer Research (EACR), 2025.
  4. Cardoso, Candida; Pestana, Daniel; Apolónio, Joana ; Silva, Nádia; Nunes, Nuno Miguel; Komosa, Martin; Tabori, Uri; Pedro Castelo-Branco. Autor correspondente: Cardoso, Candida. "THOR: Tert Hypermethylated Oncologic Region- a novel breast cancer biomarker for liquid biopsy". Trabalho apresentado em 6th ASPIC International Congress, 2024.
  5. Rajado, Ana Teresa; Pestana, Daniel; Silva, Nádia; Apolónio, Joana ; Esteves, Filipa; Brito, David V.C.; Trindade, Marlene; et al. "Algarve fit ageing score project, a multidisciplinary approach to assess healthy ageing status.". Trabalho apresentado em EMBO Workshop "Systems biology: Linking chromatin and epigenetics to disease and development, 2023.
  6. Pestana, Daniel; J. Walsh, C.; Costa, B.; C. Liaw, P.; Dwivedi, D.; L.Y. Tsang, J.; Castelo-Branco, P.; C. dos Santos, C.; Binnie, A.. "DNA Methylation signatures as potential prognostic biomarker in critical illness". Trabalho apresentado em ESICM 34th Annual Congress, Copenhagen, Denmark., 2021.
  7. Cardoso, Candida; Pestana, Daniel; Ramalhete, S.; Mestre, A; Marreiros, A; Castelo-Branco, P; Fernandes, M.. "Identificação de Biomarcadores de Metilação de ADN para Prognóstico em Doentes com Leucemia Mielóde Aguda Apresentando Citogenética Normal". Trabalho apresentado em XIV Congresso Mundial Dos Farmacêuticos De Língua Portuguesa, 2020.
  8. Pestana, Daniel; Cardoso, Candida; Mestre, A; Ramalhete, S; Castelo-Branco, P.. "Epi-Hotspots in cancer initiation". Trabalho apresentado em III Jornadas ABC, 2019.
  9. Cardoso, Candida; Pestana, Daniel; Ramalhete, S.; Mestre, A.; Marreiros, A; Fernandes, M.; Castelo-Branco, P.. "Prognostic Markers in intermediate patients with Acute Myeloid Leukemia". Trabalho apresentado em III Jornadas ABC, 2019.
Resumo em conferência
  1. Cardoso, Candida; Pestana, Daniel; Ramalhete, S.; Mestre, A.; Marreiros, A.; Castelo-Branco, P.; Fernandes, M.. "Identification of DNA Methylation-based Prognostic Biomarkers in Acute Myeloid Leukemia Patients with a Normal Karyotype". Trabalho apresentado em Revista Portuguesa de Farmacoterapia, 2020.
    Publicado

Outros

Software
  1. Pestana, Daniel; Cardoso, Candida; Pedro Castelo-Branco. "SurvIntersectR: Tools for Detecting Survival Curve Intersections". v0.1.0. 2024.
    10.5281/zenodo.11206042
Atividades

Participação em evento

Descrição da atividade
Tipo de evento
Nome do evento
Instituição / Organização
2025/05/23 - 2025/05/23 Importance of Soft Skills Training During the PhD (3h, 0.5 ECTS)
Oficina (workshop)
Conversas Doutorais (Doctoral Talks)
Universidade do Algarve, Portugal
2025/04/16 - 2025/04/16 Simple Linux — An Introduction to Genomic Analysis on Linux (2h)
Outro
Advanced Training
Universidade do Algarve Centro de Ciências do Mar, Portugal
2025/01/09 - 2025/01/09 Research, GDPR and Confidentiality
Oficina (workshop)
UK Research and Innovation Medical Research Council, Reino Unido
2024/10/05 - 2024/10/05 Highlights in Breast Cancer for Clinicians (3h 45min)
Oficina (workshop)
Lusíadas Knowledge Center
Lusíadas ACE, Portugal
2024/06/14 - 2024/06/14 Mental Health: Problems and Challenges (3h, 0.5 ECTS)
Oficina (workshop)
Conversas Doutorais (Doctoral Talks)
Universidade do Algarve, Portugal
2024/01/29 - 2024/01/30 Ready for BioData.pt Management: Intensive Course (2 days)
BioData.pt, Portugal
2021/12 - 2021/12 Introduction to Writing Functions in R (4h)
Oficina (workshop)
DATACAMP, INC., Estados Unidos
2021/12 - 2021/12 Reporting with R Markdown (4h)
Oficina (workshop)
DATACAMP, INC., Estados Unidos
2021/12 - 2021/12 Cleaning Data in R (4h)
Oficina (workshop)
DATACAMP, INC., Estados Unidos
2021/12 - 2021/12 Working with Dates and Times in R (4h)
Oficina (workshop)
DATACAMP, INC., Estados Unidos
2021/11 - 2021/11 Introduction to Data Visualization with ggplot2 (4h)
Oficina (workshop)
DATACAMP, INC., Estados Unidos
2021/11 - 2021/11 Intermediate Data Visualization with ggplot2 (4h)
Oficina (workshop)
DATACAMP, INC., Estados Unidos
2021/10 - 2021/10 Data Manipulation with dplyr (4)
Oficina (workshop)
DATACAMP, INC., Estados Unidos
2021/10 - 2021/10 Joining Data with dplyr (4h)
Oficina (workshop)
DATACAMP, INC., Estados Unidos
2021/07/04 - 2021/07/04 Tri-Council Policy Statement: Ethical Conduct for Research Involving Humans (TCPS 2)
Oficina (workshop)
Government of Canada, Canadá
2019/02 - 2019/02 Intermediate SQL Queries (4h)
Oficina (workshop)
DATACAMP, INC., Estados Unidos
2019/02 - 2019/02 Joining Data in R with dplyr (4h)
Oficina (workshop)
DATACAMP, INC., Estados Unidos
2018/09 - 2018/09 Data Manipulation in R with dplyr (4h)
Oficina (workshop)
DATACAMP, INC., Estados Unidos
2018/07 - 2018/07 Intermediate R (6h)
Oficina (workshop)
DATACAMP, INC., Estados Unidos
2018/07 - 2018/07 Introduction to the Tidyverse (4h)
Oficina (workshop)
DATACAMP, INC., Estados Unidos
2018/07 - 2018/07 Intermediate Importing Data in R (3h)
Oficina (workshop)
DATACAMP, INC., Estados Unidos
2018/07 - 2018/07 Introduction to Importing Data in R (3h)
Oficina (workshop)
DATACAMP, INC., Estados Unidos
2018/07 - 2018/07 Cleaning Data in R (4h)
Oficina (workshop)
DATACAMP, INC., Estados Unidos
2018/07 - 2018/07 Importing & Cleaning Data in R: Case Studies (4h)
Oficina (workshop)
DATACAMP, INC., Estados Unidos
2018/07 - 2018/07 Writing Functions in R (4h)
Oficina (workshop)
DATACAMP, INC., Estados Unidos
2018/05 - 2018/05 Introduction to R (4h)
Oficina (workshop)
DATACAMP, INC., Estados Unidos
2017 - 2017 Nutrition and Health: Micronutrients and Malnutrition (NUTR102x) (42h)
Oficina (workshop)
Wageningen Universiteit en Research, Países Baixos
2017 - 2017 Nutrition and Health: Macronutrients and Overnutrition (NUTR101x) (54h)
Oficina (workshop)
Wageningen Universiteit en Research, Países Baixos
2017 - 2017 Lab Safety: The Interactive Game of “Don’t Endanger the Owls”
Oficina (workshop)
Rice University, Estados Unidos

Curso / Disciplina lecionado

Disciplina Curso (Tipo) Instituição / Organização
2026 - 2026 Teaching Assistant (20 Hours) Fundamentals of Bioinformatics (Class of 2025/2026) (Licenciatura) Universidade do Algarve Faculdade de Medicina e Ciências Biomédicas, Portugal
2026 - 2026 Teaching Assistant (22 Hours) Epigenetics (Class of 2025/2026) (Licenciatura) Universidade do Algarve Faculdade de Medicina e Ciências Biomédicas, Portugal
2025 - 2025 Teaching Assistant (20 Hours) Epignetics (Class of 2024/2025) (Licenciatura) Universidade do Algarve Departamento de Ciências Biomédicas e Medicina, Portugal
2025 - 2025 Teaching Assistant (30 Hours) Fundamentals of Bioinformatics (Class of 2024/2025) (Licenciatura) Universidade do Algarve Faculdade de Medicina e Ciências Biomédicas, Portugal