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Daniela Cordeiro is a researcher in the Forest Biotechnology group at the University of Alcalá (Madrid, Spain) and a PhD student at the University of Coimbra (Portugal). Daniela has a degree in Biology (2012) and a Master's in Plant Biodiversity and Biotechnology (2017) from the University of Coimbra. She carried out her Master's thesis at the University of Ghent (Belgium). She has studied aspects of molecular regulation underlying plant regeneration capacity, in particular, in the organogenesis process of Arabidopsis thaliana and in the somatic embryogenesis process in the woody plant Solanum betaceum. Daniela published 7 papers in peer-reviewed journals (6 of which as first author) and has presented her work as oral and poster communications at several international conferences.
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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
DANIELA CORREIA CORDEIRO

Identificadores de autor

Ciência ID
711F-26E3-A442
ORCID iD
0000-0002-0147-0499

Endereços de correio eletrónico

  • danielacordeiro@outlook.pt (Profissional)
  • danielacordeiro@outlook.pt (Profissional)

Domínios de atuação

  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia Molecular
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia do Desenvolvimento
  • Ciências Agrárias - Biotecnologia Agrária e Alimentar - Biotecnologia Agrária e Biotecnologia Alimentar
  • Ciências Exatas - Ciências da Computação e da Informação - Bioinformática
  • Ciências Agrárias - Agricultura, Silvicultura e Pescas - Produção e Proteção de Plantas
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Conservação da Biodiversidade

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Português (Idioma materno)
Inglês Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1)
Espanhol; Castelhano Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador independente (B1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador independente (B2)
Francês Utilizador independente (B1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador independente (B1) Utilizador independente (B1) Utilizador independente (B1)
Formação
Grau Classificação
2018 - 2023
Concluído
 Biosciences (Doutoramento)
Especialização em Biotechnology
Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, Portugal
"Functional characterization of epigenetic markers during micropropagation " (TESE/DISSERTAÇÃO)
2015 - 2017
Concluído
 Biodiversity and plant biotechnology (Mestrado)
Especialização em Plant biotechnology
Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, Portugal

Universiteit Gent Faculteit Bio-Ingenieurswetenschappen, Bélgica
"Natural variation in the response to chemically induced shoot regeneration in Arabidopsis thaliana (L.) Heynh" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 19
2012 - 2015
Concluído
 Biology (Licenciatura)
Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, Portugal
 16
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2023/07 - Atual Investigador (Investigação) Universidad de Alcalá, Espanha
2017 - 2018 Gestão de Ciência e Tecnologia Universidade de Coimbra, Portugal
Herbarium of the University of Coimbra, Portugal

Outros

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2010 - 2020 Empregada de mesa Restaurante O Vizinho, Portugal
Produções

Publicações

Artigo em revista
  1. Daniela Cordeiro; Alexandra Camelo; Ana Carolina Pedrosa; Inês Brandão; Christophe Espírito Santo; Jorge Canhoto; Sandra Correia. "Analysis of the potential involvement of lncRNAs in embryogenic competence of Solanum betaceum Cav. (tamarillo) calli". Plant Cell, Tissue and Organ Culture (PCTOC) (2024): https://doi.org/10.1007/s11240-024-02779-5.
    10.1007/s11240-024-02779-5
  2. Cordeiro, Daniela; Pérez-Pérez, Yolanda; Canhoto, Jorge; Testillano, Pilar; Correia, Sandra. "H3K9 methylation patterns during somatic embryogenic competence expression in tamarillo (Solanum betaceum Cav.)". Scientia Horticulturae 321 (2023): 112259. http://dx.doi.org/10.1016/j.scienta.2023.112259.
    Publicado
  3. António Pereira Coutinho; Santiago Ortiz; António Coutinho; Miguel Serrano; Mónica Zuzarte. "Palynotaxonomy of the subtribe Anisopappinae (Athroismeae, Asteraceae) and the genus Duhaldea (Inuleae, Asteraceae) based on their exine ultrastructure". Palynology (2023): http://dx.doi.org/10.1080/01916122.2023.2261997.
    10.1080/01916122.2023.2261997
  4. Daniela Cordeiro; Alexandra Camelo; Ana Carolina Pedrosa; Inês Brandão; Jorge Canhoto; Christophe Espírito Santo; Sandra Correia. "An efficient method to prepare barcoded cDNA libraries from plant callus for long-read sequencing". Methods and Protocols 6 (2023): 31. https://doi.org/10.3390/mps6020031.
    Publicado • 10.3390/mps6020031
  5. Daniela Cordeiro; Ana Alves; Ricardo Ferraz; Bruno Casimiro; Jorge Canhoto; Sandra Correia. "An efficient Agrobacterium-mediated genetic transformation method for Solanum betaceum Cav. embryogenic callus". Plants 12 (2023): 1202. https://doi.org/10.3390/plants12051202.
    Publicado • 10.3390/plants12051202
  6. Cordeiro, Daniela; Camelo, Alexandra; Pedrosa, Ana; Brandão, Inês; Canhoto, Jorge; Espírito-Santo, Christophe; Correia, Sandra. "Long-read sequencing revealed lncRNAs involved in embryogenesis-related gene expression regulation in Solanum betaceum Cav. cell lines". (2023):
    Submetido
  7. Cordeiro, Daniela; Canhoto, Jorge; Correia, Sandra. "Regulatory role of ncRNAs networks in the expression and maintenance of the embryogenic competence in Solanum betaceum Cav. calli". Acta Horticulturae 1359 (2023): 179-184. https://doi.org/10.17660/ActaHortic.2023.1359.22.
    Publicado
  8. Cordeiro, D.; Pérez-Pérez, Y.; Canhoto, J.; Testillano, P.S.; Correia, S.. "H3K9 methylation patterns during somatic embryogenic competence expression in tamarillo (Solanum betaceum Cav.)". Scientia Horticulturae 321 (2023): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85162252590&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.scienta.2023.112259
  9. Cordeiro, Daniela; Canhoto, Jorge; Correia, Sandra. "Regulatory non-coding RNAs: emerging roles during plant cell reprogramming and in vitro regeneration". Frontiers in Plant Science 13 (2022): 1049631. http://dx.doi.org/10.3389/fpls.2022.1049631.
    Publicado • 10.3389/fpls.2022.1049631
  10. Cordeiro, Daniela; Correia, Sandra; Canhoto, Jorge. "microRNAs". Revista de Ciência Elementar 9 2 (2021): http://dx.doi.org/10.24927/rce2021.030.
    Acesso aberto • Publicado • 10.24927/rce2021.030
  11. Ana Alves; Cordeiro, Daniela; Correia, Sandra; Célia Miguel. "Small non-coding RNAs at the crossroads of regulatory pathways controlling somatic embryogenesis in seed plants". Plants 10 (2021): 504. http://dx.doi.org/10.3390/plants10030504.
    Publicado • 10.3390/plants10030504
  12. Cordeiro, Daniela; Miguel Rito; Filipe Borges; Canhoto, J; Correia, Sandra. "Selection and validation of reference genes for qPCR analysis of miRNAs and their targets during somatic embryogenesis in tamarillo (Solanum betaceum Cav.)". Plant Cell, Tissue and Organ Culture (PCTOC) 143 1 (2020): 109-120. http://dx.doi.org/10.1007/s11240-020-01901-7.
    Publicado • 10.1007/s11240-020-01901-7
Livro
  1. Cordeiro, D.; Canhoto, J.; Correia, S.. Regulatory role of ncRNAs networks in the expression and maintenance of the embryogenic competence in Solanum betaceum Cav. calli. 2023.
    10.17660/ActaHortic.2023.1359.22
Poster em conferência
  1. Cordeiro, Daniela; Camelo, Alexandra; Pedrosa, Ana; Brandão, Inês; Canhoto, Jorge; Christophe Espírito Santo; Correia, Sandra. "Long read sequencing revealed long non coding RNAs involved in induced embryogenic competence in Solanum betaceum cell lines". Trabalho apresentado em Revolutionizing Next Generation Sequencing 5th edition, 2023.
  2. Mariana Neves; Jéssica Batista; Tércia Lopes; Ana Pedrosa; Cordeiro, Daniela; Correia, Sandra; Canhoto, Jorge. "In vitro propagation of the endangered Hibiscus palustris L.". Trabalho apresentado em International symposium on innovations in ornamentals: from breeding to market at the 31st International Horticultural Congress, 2022.
  3. Cordeiro, Daniela; Canhoto, Jorge; Correia, Sandra. "Functional analysis of miR399 and miR827 involved in phosphate and sugar homeostasis during the loss of the embryogenic competence in Solanum betaceum Cav.". Trabalho apresentado em New Phytologist Next Generation Scientists, 2022.
  4. Cordeiro, Daniela; Canhoto, Jorge; Correia, Sandra. "Functional analysis of miR399 and miR827 involved in phosphate and sugar homeostasis during the loss of the embryogenic competence in Solanum betaceum Cav.". Trabalho apresentado em III International Meeting of the Portuguese Society of Genetics, 2022.
  5. Ricardo Ferraz; Bruno Casimiro; Cordeiro, Daniela; Correia, Sandra; Silvia Coimbra; Canhoto, Jorge. "Non-embryogenic cells transformation and identification of NEP-TC RNA targets in tamarillo". Trabalho apresentado em III International Meeting of the Portuguese Society of Genetics, 2022.
  6. Cordeiro, Daniela; Ana Carolina Pedrosa; Canhoto, Jorge; Correia, Sandra. "miRNA-mediated phosphate starvation regulatory mechanisms related to embryogenic competence maintenance in tamarillo". Trabalho apresentado em Epigenetic Mechanisms of Crop Adaptation To Climate Change EPICATCH COST CA19125 Conference, 2021.
  7. Cordeiro, Daniela; Canhoto, Jorge; Correia, Sandra. "miRNA-mediated phosphate starvation mechanisms involved in embryogenic competence maintenance in tamarillo (Solanum betaceum Cav.) calli". Trabalho apresentado em Plant Biology Europe 2021, 2021.
  8. Cordeiro, Daniela; Canhoto, Jorge; Correia, Sandra. "miRNA-target regulatory nodes involved in the loss of embryogenic competence in tamarillo (Solanum betaceum Cav.) calli". Trabalho apresentado em International Plant Systems Biology (EMBO Workshop), 2021.
  9. Correia, Sandra; Cordeiro, Daniela; André Caeiro; Bruno Casimiro; Miguel Rito; Canhoto, Jorge. "Integrative cytological, proteomic and transcriptomic profiling of the molecular events in tamarillo Solanum betaceum Cav auxin induced embryogenic callus". 2021.
  10. Cordeiro, Daniela; Correia, Sandra; Canhoto, Jorge. "Functional validation of candidate miRNAs in the regulation of tamarillo (Solanum betaceum Cav.) regeneration processes". Trabalho apresentado em XIII SECIVTV Meeting of the Spanish Society for Plant Tissue Culture, 2019.
  11. Cordeiro, Daniela; Correia, Sandra; Canhoto, Jorge. "Functional characterization of candidate miRNAs in the regulation of tamarillo (Solanum betaceum Cav.) somatic embryogenesis". Trabalho apresentado em 11th European Plant Science Retreat, 2019.
  12. Sara Amaral; Ana Viegas; Miguel Ferreira; João Cardoso; Cordeiro, Daniela; Fábio Sousa; Ana Carvalho. "1 ano e meio de PubhD Coimbra". Trabalho apresentado em 7º Congresso SciComPT 2019 - Comunicação de Ciência e Inclusão, 2019.
  13. Cordeiro, Daniela; Miguel Rito; Correia, Sandra; Canhoto, Jorge. "The role of miRNAs post-transcriptional regulation during the acquisition of embryogenic competence in tamarillo (Solanum betaceum Cav.)". Trabalho apresentado em Conference Cost action CA 15223 “IPlanta - Modifying plants to produce interfering RNA, 2019.
  14. Jorge Paiva; M.C. Madureira; Cordeiro, Daniela; Sara Bárrios. "Colheitas de Júlio Henriques em S. Tomé". Trabalho apresentado em Centenário da Jubilação de Júlio Henriques: recordar o homem, celebrar a obra, 2018.
Tese / Dissertação
  1. "Functional characterization of epigenetic markers during micropropagation". Doutoramento, Universidade de Coimbra, 2023.
  2. "Natural variation in the response to chemically induced shoot regeneration in Arabidopsis thaliana (L.) Heynh". Mestrado, Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, 2017. http://hdl.handle.net/10316/83326.
Atividades

Apresentação oral de trabalho

Título da apresentação Nome do evento
Anfitrião (Local do evento)
2023/07/01 H3K9 methylation patterns during embryogenic competence expression in tamarillo Solanum betaceum Cav. Epigenetic Mechanisms of Crop Adaptation to Climate Change
EPICATCH Cost Action (Sofia, Bulgária)
2023/04/26 Non-coding RNAs involved in induced embryogenic competence in Solanum betaceum cell lines DCV Talks
Departamento Ciências da Vida (Coimbra, Portugal)
2023/04/17 Long non-coding RNAs involved in embryogenic competence acquisition in tamarillo Solanum betaceum Cav. Innovative Woody Plant Cloning Conference
CopyTree Action Cost (Santiago de Compostela, Espanha)
2023/02/09 ncRNAs networks in the expression and maintenance of the embryogenic competence in Solanum betaceum Cav. calli Geticamente falando com...
Genetic Portuguese Society (Portugal)
2022/11 Genetic transformation - case study in miRNAs functional characterization Plant Breeding Course of the Master's degree in Biodiversity and Vegetal Biotechnology
Departamento Ciências da Vida (Coimbra, Portugal)
2022/08/16 Regulatory role of ncRNAs networks in the expression and maintenance of the embryogenic competence in Solanum betaceum Cav. calli International Symposium on In Vitro Technology and Micropropagated Plants
31st International Horticultural Congress (Angers, França)
2022/01/28 Molecular mechanisms involved in the maintenance of embryogenic competence in tamarillo callus Workshop Tamarillo breeding: better plants for better products
Departamento Ciências da Vida (Portugal)
2021/11/27 Percurso académico VII meet Eco Coimbra
Núcleo de Estudantes de Biologia da Universidade de Coimbra (Coimbra, Portugal)
2021/11/12 Fundamental Science associated with Forest Biotechnology Forest Biodiversity and Biotechnology Course of the Master's degree in Biodiversity and Vegetal Biotechnology
Departamento Ciências da Vida (Coimbra, Portugal)
2021/11/05 Genetic transformation - case study in Solanum betaceum Plant Breeding Course of the Master's degree in Biodiversity and Vegetal Biotechnology
Departamento Ciências da Vida (Coimbra, Portugal)
2021/07/07 miRNA-mediated phosphate starvation mechanisms involved in embryogenic competence maintenance in tamarillo (Solanum betaceum Cav.) calli XXIV Meeting of the Spanish Society of Plant Biology - XVII Spanish-Portuguese Congress of Plant Biology
Spanish Society of Plant Biology (Espanha)
2021/07/06 miRNA-mediated phosphate starvation mechanisms involved in embryogenic competence maintenance in tamarillo (Solanum betaceum Cav.) calli 2nd PhD Meeting in Plant Science
2nd PhD Meeting in Plant Science (Vigo, Espanha)
2020/12/02 Quantification of miRNAs expression and their targets during somatic embryogenesis in tamarillo (Solanum betaceum Cav.) - the need for proper reference genes IV Meeting - Functional Biology and Plant Biotechnology
Faculdade de Ciências da Universidade do Porto (Porto, Portugal)
2019/12 Percurso académico V meet.Eco Coimbra
Núcleo de Estudantes de Biologia da Universidade de Coimbra (Coimbra, Portugal)
2019/11 Genetic Transformation Case study in Solanum betaceum Genetic Transformation and Plant Breeding Course of the Master's degree in Biodiversity and Vegetal Biotechnology
Departamento Ciências da Vida (Coimbra, Portugal)
2019 The miRNAs role in plant regeneration Case study in Solanum betaceum Plant Biotechnology Course of the Bachelor's Degree in Biology
Departamento Ciências da Vida (Coimbra, Portugal)
2018 Genetic Transformation and Plant Breeding -two case studies Genetic Transformation and Plant Breeding Course of the Master's degree in Biodiversity and Vegetal Biotechnology
Departamento Ciências da Vida (Coimbra, Portugal)

Orientação

Título / Tema
Papel desempenhado 		Curso (Tipo)
Instituição / Organização
2019/03 - 2019/06 Somatic Embryogenesis in Solanum betaceum
Coorientador de Inês Teixeira
 Biology (Licenciatura/Bacharelato)
Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, Portugal
2019/03 - 2019/06 Somatic Embryogenesis in Solanum betaceum
Coorientador de Rafael Prazeres
 Biology (Licenciatura/Bacharelato)
Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, Portugal

Organização de evento

Nome do evento
Tipo de evento (Tipo de participação) 		Instituição / Organização
2018 - Atual "Oh! A Casa das Plantas" - Exhibition organization (2018 - 2018)
Exposição (Membro da Comissão Organizadora)
 Herbarium of the University of Coimbra, Portugal
2017 - 2020 PubhD Coimbra (2017 - 2020)
Encontro (Membro da Comissão Organizadora)

Participação em evento

Descrição da atividade
Tipo de evento 		Nome do evento
Instituição / Organização
2023/04/03 - 2023/04/03 Workshop Técnico: conservação e propagação de plantas in vitro
Oficina (workshop)
 Conservação e propagação de plantas in vitro
Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, Portugal
2023/03/25 - 2023/03/25 Workshop in media & campaigning and communicating with stakeholders and the wider public about gene editing and its governance
Oficina (workshop)
 Give Genes a Chance Campaign Event
2022/06/13 - 2022/06/17 Crop Transformation / Genome Editing training school from the PlantEd Cost Action
Oficina (workshop)
 Crop Transformation / Genome Editing training school
John Innes Centre, Reino Unido

COST Association - European Cooperation in Science and Technology, Bélgica
2021/06 - 2021/06 Workshop: Plant Epigenetics: Basics, Applications, Methodologies
Oficina (workshop)
 Plant Epigenetics: Basics, Applications, Methodologies
COST Association - European Cooperation in Science and Technology, Bélgica
2019/09 - 2019/09 European Researchers' Night: Plant Biotechnology Activity
Exposição
 European Researchers' Night
Universidade de Coimbra, Portugal
2017/11 - 2017/11 From Taxonomy to Knowledge of Biodiversity
Oficina (workshop)
Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal

Curso / Disciplina lecionado

Disciplina Curso (Tipo) Instituição / Organização
2022/11/05 - 2022/11/05 Practical class - Plant Genetic Transformation, Plant Breeding Course Biodiversity and Vegetal Biotechnology (Mestrado) Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, Portugal
2022/07/14 - 2022/07/14 Practical class - miRNAs in Plant Biotecnhology (Outros) Centro de Informação de Biotecnologia, Portugal

Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, Portugal
2021/11/05 - 2021/11/05 Practical class - Plant Genetic Transformation, Plant Breeding Course Biodiversity and Vegetal Biotechnology (Mestrado) Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, Portugal
2020/07 - 2020/07 Practical class - miRNAs Summer Course in Plant Biotecnology Ciência (Ciência Viva) (Ensino secundário)
2019/11/21 - 2019/11/21 Practical class - Gene expression analysis, Plant Biotechnology Course Biology (Licenciatura) Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, Portugal
2019/11/12 - 2019/11/12 Practical class - Plant Genetic Transformation, Genetic Transformation and Plant Breeding Course Biodiversity and Vegetal Biotechnology (Mestrado) Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, Portugal
Distinções

Prémio

2022 Travel Grant for the Next Generation Scientists Symposium in Tartu
New Phytologist Foundation, Reino Unido
2022 Financial support from CA18111 for a Training School in Norwich
COST Association - European Cooperation in Science and Technology, Bélgica
2022 Short-Term Scientific Mission Grant from CA 19125 for an internship at CIB Madrid
COST Association - European Cooperation in Science and Technology, Bélgica
2019 Travel Grant for the 11 th European Plant Science Retreat
New Phytologist Foundation, Reino Unido
2018 PhD fellowship
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
2016 Erasmus grant for Internship at the Universiteit Ghent, Belgium
Erasmus Plus, Bélgica
2015 3% Best Students Award in BSc Biology
Universidade de Coimbra, Portugal
2009 Best Student Award
2008 Best Student Award
2007 Best Student Award
2006 Best Student Award
2005 Best Student Award

Outra distinção

2023 Finalist at 3 minute Thesis Competition
Universidade de Coimbra, Portugal
2022 Honorable Mention for oral communication in IHC2022
2012 10 Best Students Award
Rotary Clube, Portugal
2011 10 Best Students Award
Rotary Clube, Portugal