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Pedro Miguel R. Barros completed the Ph.D. in Molecular Biology in 2012 from the U. Nova de Lisboa (ITQB NOVA). He graduated in Biology in 2005 from the U. Évora and in 2018 he obtained the Master's degree in Bioinformatics and Computational Biology from U. Lisboa (Faculdade de Ciências). Presently, Pedro Barros is a Contracted Researcher at ITQB NOVA, in the Plant Functional Genomics Lab. Pedro Barros's domain of specialization is plant molecular biology and bioinformatics. His research interests focus on the molecular mechanisms regulating plant's adaptation to environmental challenges, with a focus on secondary growth and woody plants. Pedro is studying the effect of drought and heat stress in cork development, targeting gene regulatory networks involved in suberin biosynthesis. Pedro actively participated in the Cork Oak Genome Sequencing project and is involved in the maintenance and improvement of the CorkOakDB web portal (for genome browsing and data visualization), within Biodata.pt. Pedro is the National Coordinator of the Plant Sciences Community at ELIXIR, and is engaged in promoting FAIR data management practices. Pedro published over 20 original peer-reviewed articles in journals from Plant Science field, including Molecular Plant (2020), Environmental and Experimental Botany (2019), Tree Physiology (2021 and 2012) and Journal of Experimental Botany (2016 and 2012). He also authored 3 book chapters. Pedro Barros is presently supervising 3 PhD students and 1 MSc student. He supervise(d) 6 MSc dissertation(s), co-supervised 1 and mentored other 4 young researchers. Pedro has been also enrolled in teaching activities at M.Sc. and Ph.D. levels at ITQB NOVA. He is a coordinator of the Bioinformatics and Biostatistics platform of GREEN-It BioResources for Sustainability Research Unit. Since 2021 he is Invited Adjunct Professor at Inst. Politécnico de Setúbal. In his curriculum Ciência Vitae, the most frequent terms in the context of scientific, and technological outputs are: Cork oak; Suberin; Genomics; Transcriptomics; Bioinformatics; Molecular Biology; Drought; Almond; Biotechnology; Tissue Culture; Phylogenetics; Arabidopsis; Biostatistics.
Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Pedro Miguel Rodrigues de Barros
Data de nascimento
1982/06/05

Nomes de citação

  • Barros, Pedro
  • Barros, P.M.
  • Barros, Pedro M.

Identificadores de autor

Ciência ID
661B-B069-AF90
ORCID iD
0000-0001-5626-0619
Google Scholar ID
https://scholar.google.com/citations?user=FFn4aUUAAAAJ&hl=en
Researcher Id
J-3613-2013
Scopus Author Id
55307829400

Endereços de correio eletrónico

  • pbarros@itqb.unl.pt (Profissional)

Telefones

Telefone
  • 214469660 (Profissional)

Moradas

  • ITQB-UNL and IBET. Av. da República, Estação Agronómica Nacional, 2780-157, Oeiras, Oeiras, Portugal (Profissional)

Websites

Domínios de atuação

  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Fitologia
  • Ciências Agrárias - Agricultura, Silvicultura e Pescas - Silvicultura
  • Ciências Exatas - Ciências da Computação e da Informação - Bioinformática

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Inglês Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1)
Francês Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1)
Espanhol; Castelhano Utilizador independente (B1) Utilizador independente (B1) Utilizador elementar (A1) Utilizador independente (B1)
Português (Idioma materno)
Formação
Grau Classificação
2018/01
Concluído
Bioinformatics and Computational Biology (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
"Alternative splicing detection across different tissues in cork oak" (TESE/DISSERTAÇÃO)
17
2012
Concluído
Molecular Biology (Doutoramento)
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
"Insights into the role of almond CBF transcription factors in the environmental control of cold acclimation and dormancy break" (TESE/DISSERTAÇÃO)
Aprovado, por unanimidade
2005
Concluído
Biology (Licenciatura)
Universidade de Évora, Portugal
"Development of CAPS markers associated to tolerance/susceptibility to Fusicoccum amygdali and search for resistance genes in almond (Prunus dulcis Mill.)" (TESE/DISSERTAÇÃO)
16
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento
Empregador
2019/01/02 - Atual Investigador Contratado (Investigação) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2013/01/01 - 2018/12/31 Pós-doutorado (Investigação) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2012/06/15 - 2013/12/15 Pós-doutorado (Investigação) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2011/10/01 - 2012/05/31 Investigador (Investigação) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2006/01/02 - 2006/11/30 Investigador (Investigação) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2005/01/03 - 2005/12/30 Estagiário de Investigação (Investigação) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal

Docência no Ensino Superior

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento
Empregador
2021/11/02 - Atual Professor Adjunto Convidado (Docente Ensino Superior Politécnico) Instituto Politécnico de Setúbal, Portugal
Instituto Politécnico de Setúbal Escola Superior de Saúde, Portugal

Outros

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento
Empregador
2016/11/01 - 2017/02/28 Invited researcher, within the Cork Oak Genome Sequencing consortium (GENOSUBER). Bioinformatic analysis of RNA-seq data and transcriptome annotation. Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal
2007/04/02 - 2011/03/31 PhD student (fellowship SFRH/BD/31594/2006 from FCT). Functional characterization of two transcription factors from almond, responsive to cold stress and involved in seasonal development (with focus o Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2005/04/22 - 2005/05/26 Diploma student (training period under supervision of Prof. Ma Rongcai). Sequencing and phylogenetic analysis of NBS-LRR genes involved in biotic stress in almond. Beijing Agro-Biotechnology Research Center, China
Projetos

Projeto

Designação Financiadores
2023/03/01 - Atual Durable resistance against the causal agent of powdery mildew (Erysiphe pisi) in grass pea (Lathyrus sativus L.): Exploring transcriptomic variation to develop molecular breeding tools for legumes
2022.08266.PTDC
Investigador
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2023/01/01 - Atual Rice2B: Modelling vitamins B1 and B2 biosynthesis and biofortification in rice
2022.02916.PTDC
Co-Investigador Responsável (Co-IR)
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2023/01/01 - Atual SONG: Suberin Production and exploitation for mOdulating fuNGal development
2022.06750.PTDC
Investigador
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2021/07/01 - Atual EpiCork: Unveiling the role of DNA methylation in periderm and lenticel formation
PTDC/ASP-SIL/1717/2020
Investigador
FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2021/06/01 - Atual Increasing Plant data findability and reuse beyond ELIXIR
Investigador
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
European Commission

ELIXIR
Em curso
2020/09/01 - Atual TRACE-RICE: Tracing rice and valorizing side streams along Mediterranean blockchain
1934
Investigador
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
Partnership for Research and Innovation in the Mediterranean Area
Em curso
2021/01/01 - 2025/12/31 Life Sciences for a Healthy and Sustainable Future
LA/P/0087/2020
Universidade Nova de Lisboa Microbiologia Molecular Estrutural e Celular, Portugal

Instituto Português de Oncologia de Lisboa Francisco Gentil EPE, Portugal

Fundação Calouste Gulbenkian, Portugal

Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal

Instituto de Biologia Experimental e Tecnológica, Portugal

BioResources 4 Sustainability, Portugal

Universidade NOVA de Lisboa, Portugal

iNOVA4Health, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2022/01/03 - 2024/01/02 CorkREMODEL: Unveiling genetic REgulatory MOdules acting on the crosstalk between cork Development and EnvironmentaL factors
Investigador responsável
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal

Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal

BioResources 4 Sustainability, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2018/10/12 - 2022/09/30 Cork formation and suberin deposition: the role of water and heat stress (SuberInStress)
PTDC/BIA-FBT/29704/2017
Investigador
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2019/01/01 - 2022/03/31 RicePIFs - How do Phytocrome Interacting Factors mediate the cross-talk between light and temperature signaling in rice
PTDC/BIA-FBT/31070/2017
Investigador
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2017/06/01 - 2021/06/01 Biodata.pt - Infraestrutura Portuguesa de Dados Biológicos - Portuguese Biological Data Network
Investigador
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2019/01/01 - 2019/12/31 Bioresources 4 Sustainability
UID/Multi/04551/2019
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal

Fundação Calouste Gulbenkian, Portugal

Instituto de Biologia Experimental e Tecnológica, Portugal

BioResources 4 Sustainability, Portugal

Universidade NOVA de Lisboa, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2012/03 - 2015/09 An integrated approach to identify stress-related regulatory genes in cork oak (SuberStress)
Bolseiro de Investigação
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2013 - 2015 GENOSUBER: Cork oak genome sequencing project
INALENTEJO 2007.2013
Investigador
Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal

Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
INALENTEJO - Programa Operacional Regional do Alentejo 2007/2013
Concluído
2011/01/01 - 2012/12/31 Strategic Project - LA 4 - 2011-2012
PEst-OE/EQB/LA0004/2011
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal

Fundação Calouste Gulbenkian, Portugal

Instituto de Biologia Experimental e Tecnológica, Portugal

Universidade NOVA de Lisboa NOVA Medical School, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2008/02/15 - 2012/02/14 Chromatin remodelling and abiotic stresses responses in rice.
PTDC/BIA-BCM/64215/2006
Bolseiro de Investigação
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2006/01/01 - 2006/11/30 Transcription factors regulating abiotic stress responses in rice (Oryza sativa L.): a transgenic approach to improve tolerance, and search for novel players.
Bolseiro de Investigação
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
Produções

Publicações

Artigo em revista
  1. Usié, A.; Serra, Octávio; Barros, Pedro M.; Barbosa, Pedro; Leão, Célia; Capote, Tiago; Almeida, Tânia; et al. Autor correspondente: Barros, Pedro M.. "An improved reference genome and first organelle genomes of Quercus suber". Tree Genetics & Genomes 19 54 (2023): https://doi.org/10.1007/s11295-023-01624-8.
    Acesso aberto • Publicado • 10.1007/s11295-023-01624-8
  2. Misra, Chandra Shekhar; Sousa, António G G; Barros, Pedro M.; Kermanov, Anton; Becker, J. Autor correspondente: Becker, J. "Cell-type-specific alternative splicing in the Arabidopsis germline". Plant Physiology (2022): https://doi.org/10.1093/plphys/kiac574.
    Publicado • 10.1093/plphys/kiac574
  3. Ana Rita Leal; Joana Belo; Tom Beeckman; Barros, Pedro M.; M. Margarida Oliveira. Autor correspondente: Barros, Pedro M.. "The Combined Effect of Heat and Osmotic Stress on Suberization of Arabidopsis Roots". Cells (2022): https://doi.org/10.3390/cells11152341.
    10.3390/cells11152341
  4. Dias, M.C.; Santos, C.; Araújo, M.; Barros, P.M.; Oliveira, M.M.; Ferreira de Oliveira, José Miguel P.. "Quercus suber Roots Activate Antioxidant and Membrane Protective Processes in Response to High Salinity". Plants 11 4 (2022): 557. https://www.mdpi.com/2223-7747/11/4/557/htm.
    Publicado • 10.3390/plants11040557
  5. Leal, Ana; Barros, Pedro M.; Parizot, Boris; Sapeta, Helena; Vangheluwe, Nick; Andersen, Tonni Grube; Beeckman, Tom; Oliveira, M.Margarida. "Translational profile of developing phellem cells in Arabidopsis thaliana roots". The Plant Journal (2022): http://dx.doi.org/10.1111/tpj.15691.
    Publicado • 10.1111/tpj.15691
  6. Leal, Ana; Sapeta, H.; Tom Beeckman; Barros, Pedro M.; Oliveira, M.Margarida. Autor correspondente: Barros, Pedro M.. "Spatio-temporal development of suberized barriers in cork oak taproots". Tree Physiology (2021): https://doi.org/10.1093/treephys/tpab176.
    Publicado • 10.1093/treephys/tpab176
  7. Arias-Baldrich, Cirenia; Silva, Marta Contreiras; Bergeretti, Filippo; Chaves, Inês; Miguel, Célia; Saibo, Nelson J M; Sobral, Daniel; Faria, Daniel; Barros, Pedro M. Autor correspondente: Barros, Pedro M. "CorkOakDB - The Cork Oak Genome Database Portal". Database 2020 (2020): http://dx.doi.org/10.1093/database/baaa114.
    Acesso aberto • Publicado • 10.1093/database/baaa114
  8. Amaral, Marcelo Nogueira; Auler, Priscila Ariane; Rossatto, Tatiana; Barros, Pedro M.; Oliveira, M. Margarida; Braga, Eugenia Jacira Bolacel. "Long-term somatic memory of salinity unveiled from physiological, biochemical and epigenetic responses in two contrasting rice genotypes". Physiologia Plantarum 170 2 (2020): 248-268. http://dx.doi.org/10.1111/ppl.13149.
    Acesso aberto • Publicado • 10.1111/ppl.13149
  9. Fonini, Leila Spagnolo; Lazzarotto, Fernanda; Barros, Pedro M.; Cabreira-Cagliari, Caroline; Martins, Marcelo Affonso Begossi; Saibo, Nelson J.M.; Turchetto-Zolet, Andreia Carina; Margis-Pinheiro, Marcia. "Molecular evolution and diversification of the GRF transcription factor family". Genetics and Molecular Biology 43 3 (2020): http://dx.doi.org/10.1590/1678-4685-gmb-2020-0080.
    Publicado • 10.1590/1678-4685-gmb-2020-0080
  10. Niño-González, María; Novo-Uzal, Esther; Richardson, Dale N.; Barros, Pedro M.; Duque, Paula. "More Transporters, More Substrates: The Arabidopsis Major Facilitator Superfamily Revisited". Molecular Plant 12 9 (2019): 1182-1202. http://dx.doi.org/10.1016/j.molp.2019.07.003.
    Publicado • 10.1016/j.molp.2019.07.003
  11. Ferreira, Liliana J.; Donoghue, Mark T. A.; Barros, Pedro; Saibo, Nelson J.; Santos, Ana Paula; Oliveira, M. Margarida. "Uncovering Differentially Methylated Regions (DMRs) in a Salt-Tolerant Rice Variety under Stress: One Step towards New Regulatory Regions for Enhanced Salt Tolerance". Epigenomes 3 1 (2019): 4. http://dx.doi.org/10.3390/epigenomes3010004.
    Publicado • 10.3390/epigenomes3010004
  12. Borba, Ana Rita; Serra, Tânia S; Górska, Alicja; Gouveia, Paulo; Cordeiro, André M; Reyna-Llorens, Ivan; Knerová, Jana; et al. "Synergistic Binding of bHLH Transcription Factors to the Promoter of the Maize NADP-ME Gene Used in C4 Photosynthesis Is Based on an Ancient Code Found in the Ancestral C3 State". Molecular Biology and Evolution 35 7 (2018): 1690-1705. http://dx.doi.org/10.1093/molbev/msy060.
    Publicado • 10.1093/molbev/msy060
  13. Chander, S.; Almeida, D.M.; Serra, T.S.; Jardim-Messeder, D.; Barros, P.M.; Lourenço, T.F.; Figueiredo, D.D.; et al. "OsICE1 transcription factor improves photosynthetic performance and reduces grain losses in rice plants subjected to drought". Environmental and Experimental Botany 150 (2018): 88-98. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85044649688&partnerID=MN8TOARS.
    Publicado • 10.1016/j.envexpbot.2018.02.004
  14. Ramos, A.M.; Usié, A.; Barbosa, P.; Barros, P.M.; Capote, T.; Chaves, I.; Simões, F.; et al. "The draft genome sequence of cork oak". Scientific Data 5 (2018): https://www.nature.com/articles/sdata201869.
    Publicado • 10.1038/sdata.2018.69
  15. Barros, P.M.; Inácio, V.; Costa, A.; Roussado, C.; Gonçalves, E.; Costa, R.; Graça, J.; Oliveira, M.M.; Morais-Cecílio, L.. "Differential DNA methylation patterns are related to phellogen origin and quality of Quercus suber cork". PLoS ONE 12 1 (2017): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85008186367&partnerID=MN8TOARS.
    Publicado • 10.1371/journal.pone.0169018
  16. Barros, P.M.; Cherian, S.; Costa, M.; Sapeta, H.; Saibo, N.J.M.; Oliveira, M.M.. "The identification of almond GIGANTEA gene and its expression under cold stress, variable photoperiod, and seasonal dormancy". Biologia Plantarum 61 4 (2017): 631-640. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85011286681&partnerID=MN8TOARS.
    Publicado • 10.1007/s10535-017-0711-1
  17. Sapeta, H.; Lourenço, T.; Lorenz, S.; Grumaz, C.; Kirstahler, P.; Barros, P.M.; Costa, J.M.; Sohn, K.; Oliveira, M.M.. "Transcriptomics and physiological analyses reveal co-ordinated alteration of metabolic pathways in Jatropha curcas drought tolerance". Journal of Experimental Botany 67 3 (2016): 845-860. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84964403705&partnerID=MN8TOARS.
    Publicado • 10.1093/jxb/erv499
  18. Figueiredo, D.D.; Barros, P.M.; Cordeiro, A.M.; Serra, T.S.; Lourenço, T.; Chander, S.; Oliveira, M.M.; Saibo, N.J.M.. "Seven zinc-finger transcription factors are novel regulators of the stress responsive gene OsDREB1B". Journal of Experimental Botany 63 10 (2012): 3643-3656. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84863699966&partnerID=MN8TOARS.
    Publicado • 10.1093/jxb/ers035
  19. Barros, P.M.; Gonçalves, N.; Saibo, N.J.M.; Oliveira, M.M.. "Cold acclimation and floral development in almond bud break: Insights into the regulatory pathways". Journal of Experimental Botany 63 12 (2012): 4585-4596. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84866427070&partnerID=MN8TOARS.
    Publicado • 10.1093/jxb/ers144
  20. Barros, P.M.; Gonçalves, N.; Saibo, N.J.M.; Margarida Oliveira, M.. "Functional characterization of two almond C-repeat-binding factors involved in cold response". Tree Physiology 32 9 (2012): 1113-1128. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84866390475&partnerID=MN8TOARS.
    Publicado • 10.1093/treephys/tps067
  21. Santos, A.P.; Serra, T.; Figueiredo, D.D.; Barros, P.; Lourenço, T.; Chander, S.; Oliveira, M.M.; Saibo, N.J.M.. "Transcription regulation of abiotic stress responses in rice: A combined action of transcription factors and epigenetic mechanisms". OMICS A Journal of Integrative Biology 15 12 (2011): 839-857. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84055193729&partnerID=MN8TOARS.
    Publicado • 10.1089/omi.2011.0095
Artigo em revista (magazine)
  1. Barros, Pedro M.; Oliveira, M.Margarida. "Ferramentas moleculares para compreender a formação da cortiça", Vida Rural, 2023, https://www.vidarural.pt/premium/ferramentas-compreender-formacao-cortica/.
Capítulo de livro
  1. Barros, Pedro M.; Sapeta, H.; Belo, Joana; Leal, Ana; Oliveira, M.Margarida. Autor correspondente: Barros, Pedro M.. "The root periderm". In Plant Roots: The Hidden Half, editado por Beeckman, T; Eshel, Amram. Boca Raton, Estados Unidos: CRC Press - Taylor & Francis Group, 2023.
    No prelo
  2. Barros, Pedro M.; Martinez-­Gomez, P.; Kodad, O.; Farinha, A.P.; Oliveira, M. Margarida. "Prunus dulcis syn. Prunus amygdalus Almond". In Biotechnology of fruit and nut crops, editado por Litz, Richard E.; Pliego-Alfaro, Fernando; Hormoza, Jose Ignacio, 561-580. Wallingford, Reino Unido: CABI, 2020.
    Publicado • 10.1079/9781780648279.0561
  3. Lourenço, Tiago F.; Barros, Pedro M.; Saibo, Nelson J. M.; Abreu, Isabel A.; Santos, Ana Paula; António, Carla; Pereira, João S.; Oliveira, M. Margarida. "Genomics of Drought". In Plant Genomics and Climate Change, editado por Edwards, David; Batley, Jacqueline, 85-135. Springer New York, 2016.
    Publicado • 10.1007/978-1-4939-3536-9_5
Poster em conferência
  1. Vieira, Maria Beatriz; Barros, Pedro M.; Lourenço, Tiago Filipe; Oliveira, M.Margarida. "Tackling Rice Fraudulent Variety Claims: Identification of Molecular Markers with Discriminating Potential". Trabalho apresentado em 20th International Symposium on Rice Functional Genomics (ISRFG2023), 2023.
  2. Belo, J.; Barros, P.M.; Castrillo, G.; Oliveira, M.M.. "Cork oak endophytic bacteria: Potential for plant growth promotion". Trabalho apresentado em 2nd Microbiome PT Summit, 2023.
  3. Rita Maravilha Marques; Barros, Pedro; Leitão, Susana T.; Diego Rubiales; Maria Carlota Vaz Patto; Santos, Carmen. "Comparative transcriptomics reveals accession and time-point-specific Gene expression patterns in grass pea (Lathyrus sativus) upon Erysiphe pisi infection..". Trabalho apresentado em 4th International Legume Society Conference., 2023.
  4. Belo, J; Barros, Pedro M.; Castrillo, G; Oliveira, M.Margarida. "Cork oak acorns, a promising source of plant growth-promoting bacteria". Trabalho apresentado em Plant Biology 2023 | XVIII Portuguese-Spanish Congress of Plant Biology, 2023.
  5. Bergeretti, Filippo; Barros, Pedro M.; Oliveira, M.Margarida. "A comparative genomics approach to assess interspecific variability associated with cork development". Trabalho apresentado em Plant Biology 2023 | XVIII Portuguese-Spanish Congress of Plant Biology, 2023.
  6. Vieira, M. Beatriz; Barros, Pedro M.; Lourenço, Tiago F.; Oliveira, M.Margarida. Autor correspondente: Oliveira, M.Margarida. "Workflow for identification of InDel markers for rice (Oryza sativa) varietal discrimination". Trabalho apresentado em Bioinformatics Open Days XII Edition, 2023.
  7. Santos, Raquel; Prazeres, Rafael; Ana Milhinhos; Barros, Pedro; Graça, José; Morais-Cecílio, Leonor; Miguel, Célia; Inácio, Vera. "EpiCORK: Unveiling the role of DNA methylation in periderm formation". Trabalho apresentado em Ciências Research Day 2022, 2022.
  8. Barros, Pedro M.; Chaves, Inês; Costa, Bruno Vasques; Faria, Daniel; Marum, Liliana; Miguel, Célia M.; Saibo, Nelson; et al. "Data management in Plant Sciences: update on the BioData.pt Plant Sciences community". Trabalho apresentado em 1st All Hands / 3rd Technical Meeting of BIODATA.PT | ELIXIR PT, 2022.
    10.5281/zenodo.7181784
  9. Cordeiro, A.M.; Luís Andrade; Vicente Thiago Candido Barros Alencar; Catarina C. Monteiro; Sofia Neves; Ayrton Markos da Silva; Yunlong Lu; et al. "Phytochromes and Phytochrome Interacting Factors regulate rice development from seed to seed". Trabalho apresentado em I Ibero-latinamerican Congress of Plant Biology, 2022.
  10. Barros, Pedro M.; Sapeta, H.; Lucas, D.; Rodrigues, Hugo; Oliveira, M.M.. Autor correspondente: Barros, Pedro M.. "Identification of cork oak genetic modules regulating phellem development in response to drought". Trabalho apresentado em 20th IUFRO Tree Biotech and 2nd Forest Tree Molecular Biology and Biotechnology Conference, 2022.
    10.5281/zenodo.7225240
  11. Belo, J.; Barros, Pedro M.; Castrillo, G; Oliveira, M.Margarida. "Unveiling the impact of endophytic microbiome on cork development and suberin biosynthesis". Trabalho apresentado em 20th IUFRO Tree Biotech and 2nd Forest Tree Molecular Biology and Biotechnology Conference, 2022.
  12. Prazeres, Rafael; Ana Milhinhos; Barros, Pedro; Graça, José; Morais-Cecílio, Leonor; Miguel, Célia; Inácio, Vera. "Unravelling the role of DNA methylation in cork formation". Trabalho apresentado em The 20th IUFRO Tree Biotech and the 2nd FTMB (Forest Tree Molecular Biology and Biotechnology) Conference, 2022.
  13. Belo, Joana; Barros, Pedro M.; Castrillo, G; Oliveira, M.Margarida. "Unveiling the impact of endophytic microbiome on cork development and suberin biosynthesis". Trabalho apresentado em Encontro Ciência 2022, Lisbon, Portugal, 2022.
  14. Sapeta, H.; Barros, P.M.; Lucas, D.; Leal, Ana; Oliveira, M.M.. "Impact of different irrigation regimes on the regulation of suberin synthesis and cork development". Trabalho apresentado em FESPB/EPSO Plant Biology Europe 2021, Torino, Italy, 2021.
  15. Cordeiro, A.M.; Catarina C. Monteiro; Guilherme Leitão; João Costa; Barros, Pedro; Lourenço, Tiago; Saibo, Nelson J.M.. "OsPIL15 and OsPIL16 are key inducers of coleoptile growth in rice". Trabalho apresentado em Plant Biology Europe 2021, 2021.
  16. Leal, A.R.; Barros, P.M.; Parizot, B.; Belo, J.; Vangheluwe, N.; Beeckman, T.; Oliveira, M.M.. "Understanding the molecular regulation of periderm suberization in root secondary growth". Trabalho apresentado em Plant Apoplastic Diffusion Barriers - Bonn (Germany), 2019.
  17. Leal, A.; Barros, Pedro; Parizot, B.; Belo, Joana; Vangheluwe, N.; Beeckman, T; Oliveira, M.Margarida. "Revealing the mechanisms underlying peridermis suberization in Arabidopsis and Cork Oak". Trabalho apresentado em XVI Spanish-Portuguese Congress of Plant Physiology, 2019.
  18. Barros, P.M.; Usié, A.; Barbosa, P.; Arias-Baldrich, C.; Silva, M.C.; Saibo, N.J.M.; Chaves, I.; et al. "The cork oak genome assembly project". Trabalho apresentado em IUFRO Tree Biotechnology 2019 - Raleigh (USA), 2019.
  19. Leal, A.R.; Barros, P.M.; Parizot, B.; Belo, J.; Vangheluwe, N.; Beeckman, T.; Oliveira, M.M.. "Revealing the mechanisms underlying peridermis suberization in Arabidopsis and Cork Oak". Trabalho apresentado em At the Forefront of Plant Research - Barcelona (Spain), 2019.
  20. Barros, P.M.; Barbosa, P.; Usié, A.; Pesquita, C.; Ramos, A.M.. "Alternative splicing detection across different tissues in cork oak". Trabalho apresentado em Bioinformatics Open Days - Braga (Portugal), 2017.
  21. Sapeta, Helena; Lourenço, Tiago Filipe; Lorenz, S.; Grumaz, C.; Kirstahler, P.; Barros, Pedro M.; Miguel, JM; Sohn, K.; Oliveira, M.Margarida. "Drought and subsequent recovery behaviour of the biodiesel plant Jatropha curcas: Integrating transcriptomics and physiology". Trabalho apresentado em Ciência 2016 - Science and Technology in Portugal Meeting, 2016.
  22. Inácio, V.; Barros, P.M.; Roussado, C.; Costa, A.; Gonçalves, E.; Costa, R.; Graça, J.; Oliveira, M.M.; Morais-Cecílio, L.. "Differential DNA methylation patterns in Quercus suber are related to cork quality". Trabalho apresentado em IUFRO Genomics and Forest Tree Genetics - Arcachon (France), 2016.
  23. Barros, P.M.; Leal, A.R.; Vieira, N.; Lourenço, T.; Saibo, N.; Oliveira, M.M. "Uncovering molecular regulators of cork oak stress response and cork differentiation". Trabalho apresentado em 11th International congress of Plant Molecular Biology, Iguazú Falls, Brazil, 2015.
  24. Barros, P.M.; Leal, A.; Vieira, N.; Reis, F; Hardoim, P.; Coelho, A.C.; Tavares, R.M.; et al. "SuberStress - An integrated approach to identify regulatory genes in the crosstalk between abiotic and biotic stress response in cork oak". Trabalho apresentado em IUFRO Tree Biotechnology, Florence, Italy, 2015.
  25. Leal, A.R.; Vieira, N.; Barros, P.M.; Lourenço, T.; Saibo, N.; Oliveira, M.M.. "Assessing the role of a Quercus suber Omega-3 fatty acid desaturase in the response to biotic and abiotic stresses". Trabalho apresentado em IUFRO Tree Biotechnology, Florence, Italy, 2015.
  26. Leal, A.; Vieira, N.; Reis, F.; Hardoim, P.R.; Barros, Pedro M.; Coelho, A.C.; Tavares, T.M.; et al. "Searching for cork oak genes involved in the cross-talk between different stresses - the O3FAD omega 3 fatty acid desnaturase.". Trabalho apresentado em XVIII Congress of the Portuguese Biochemical Society, 2014.
  27. Chander, S.; Costa, J.M.; Serra, T.; Barros, P.M.; Oliveira, M.M.; Saibo, N.J.M.. "Over-expression of OsICE1 improves photosynthesis performance in rice plants under drought stress". Trabalho apresentado em International Congress on Photosynthesis Research (16th), St. Louis, USA, 2013.
  28. Barros, P.M.; Gonçalves, N.; Saibo, N.J.M.; Oliveira, M.M.. "Two cold-responsive CBF genes are repressed after winter bud break in a fruit tree species.". Trabalho apresentado em Society for Experimental Biology (SEB) Annual Meeting, Salzburg, Austria, 2012.
  29. Barros, P.M.; Gonçalves, N.; Santos, A.P.; Saibo, N.J.M.; Oliveira, M.M.. "Differential regulation of two cold-responsive CBF transcription factors during early blooming in almond (Prunus dulcis Mill.).". Trabalho apresentado em XII Congreso Hispano-Luso de Fisiologi´a Vegetal, Castello´ de La Plana, Spain, 2011.
  30. Figueiredo, D.; Cordeiro, A.M.; Barros, Pedro; Serra, T.S.; Lourenço, Tiago; Tepperman, J.; Quail, P.H.; Oliveira, M.M.; Saibo, N.J.M. "The rice Phytochrome Interacting Factor 7 is a novel transcription factor mediating cold and light signaling responses". Trabalho apresentado em XVII National Congress of Biochemistry, 2010.
  31. Barros, P.M.; Saibo, N.J.M; Oliveira, M.M.. "Searching for upstream elements involved in the regulation of two almond CBF transcription factors". Trabalho apresentado em 28th International Horticultural Congress, Lisbon, Portugal, 2010.
  32. Barros, P.M.; Saibo, N.J.M.; Oliveira, M.M.. "Functional analysis of two CBF transcription factors involved in low temperature signaling in almond". Trabalho apresentado em 8th PlantGEM, Plant Genomics European Meeting, Lisbon, Portugal, 2009.
  33. Barros, P.M.; Saibo, N.J.M.; Oliveira, M.M.. "Functional analysis of two almond CBF transcription factors during abiotic stress response and flower development". Trabalho apresentado em 34th FEBS Congress, Prague Czech Republic, 2009.
  34. Barros, P.M.; Saibo, N.J.M.; Martins, M.; Ma, R.-C.; Oliveira, M.M.. "The CBF and R genes as key elements to study the molecular response to abiotic and biotic stress in almond". Trabalho apresentado em Biotechfruit, International Symposium on Biotechnology of Fruit Species, Dresden, Germany, 2008.
  35. Barros, P.M.; Martins, M.; Ma, R.-C.; Arús, P.; Oliveira, M.M.. "Cloning and linkage mapping of new NBS-LRR resistant gene candidates and identification of markers associated to susceptibility to Fusicoccum canker in almond (Prunus dulcis Mill.)". Trabalho apresentado em III International Rosaceae Genomics Conference, Napier, New Zealand, 2006.
Pré-impressão
  1. Barros, Pedro M.; Sapeta, Helena; Lucas, Diogo A.; Oliveira, M.Margarida. "Drought impact on phellem development: identification of novel gene regulators and evidence of photosynthetic activity". 2023. http://dx.doi.org/10.1101/2023.12.26.573371.
    10.1101/2023.12.26.573371
  2. Leal, Ana Rita; Barros, Pedro M.; Parizot, Boris; Sapeta, Helena; Vangheluwe, Nick; Andersen, Tonni Grube; Beeckman, Tom; Oliveira, M.Margarida. "Phellem translational landscape throughout secondary development in Arabidopsis roots". 2021. http://dx.doi.org/10.1101/2021.02.08.429142.
    10.1101/2021.02.08.429142
  3. Gonçalves, Nuno M.; Fernandes, Telma; Nunes, Cátia; Rosa, Margarida T. G.; Matiolli, Cleverson; Rodrigues, Mafalda A. A.; Barros, Pedro M.; Oliveira, M.Margarida; Abreu, Isabel A.. "SUMOylation of rice DELLA SLR1 modulates transcriptional responses and improves yield under salt stress". 2020. http://dx.doi.org/10.1101/2020.03.10.986224.
    10.1101/2020.03.10.986224
Tese / Dissertação
  1. Barros, P.M.. "Alternative splicing detection across different tissues in cork oak". Mestrado, Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, 2018. http://hdl.handle.net/10451/31981.
  2. Barros, P.M.. "Insights into the role of almond CBF transcription factors in the environmental control of cold acclimation and dormancy break". Doutoramento, Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, 2012. http://hdl.handle.net/10362/8584.

Outros

Conjunto de dados
  1. Barros, Pedro; Sapeta, Helena. Morpho-physiological changes imposed by water deficit in cork oak saplings. DMPortal. 2024.
    https://doi.org/10.34636/DMPortal/D8LBXX
Outra produção
  1. CorkOakDB website. CorkOakDB aims to integrate the knowledge generated from fundamental and applied studies about Quercus suber, with a focus on genetics. CorkOakDB features the first draft genome of Quercus suber, released in 2018 by the GENOSUBER consortium, and allows genome browsing and gene search. It also incorporates other types of data from cork oak scientific research, including gene expression data.. 2019. Barias-Aldrich, C; Silva, Marta C.; Barros, P.M.; Faria, Daniel; Sobral, Daniel. http://corkoakdb.org/.
Atividades

Apresentação oral de trabalho

Título da apresentação Nome do evento
Anfitrião (Local do evento)
2024/02/21 Molecular Tools To Study The Environmental Impact on Plant Development - rice and cork oak cases Genomics and Systems Biology XII
NYU Abu Dhabi (Abu Dhabi, Emiratos Árabes Unidos)
2023/07/12 Genetic networks regulating cork production: from theoretical prediction to functional validation (Invited Talk) Plant Biology 2023 | XVIII Portuguese-Spanish Congress of Plant Biology
Universidade do Minho (Braga, Portugal)
2023/07/09 OsPIF15 and OsPIF16 are key inducers of stokomorphogenesis in rice Plant Biology 2023 & XVIII Portuguese-Spanish Congress of Plant Biology
Universidade do Minho (Braga, Portugal)
2023/03/17 Identification of gene regulatory modules acting in the interaction between cork development and environmental variables XII Bioinformatics Open Days 2023
Universidade do Minho (Braga, Portugal)
2023/03/16 A comparative genomics approach to assess interspecific variability associated with cork development. XII Bioinformatics Open Days 2023
Universidade do Minho (Braga, Portugal)
2022/11/24 Impacto da seca na produção de cortiça: identificação de fatores genéticos e sua regulação Um Futuro Sustentável – cientistas do LS4FUTURE de mãos dadas pela saúde humana e ambiental
LS4Future (Oeiras, Portugal)
2022/09/13 The impact of drought on phellem development: assessing morpho-physiological adaptations and gene expression dynamics in cork oak stems 5th Plant Apoplastic Diffusion Barriers (PADiBa) International Symposium
University of Dundee / The James Hutton Institute (Dundee, Reino Unido)
2022/09/06 Functional genomics and plant stress: abiotic stress modulation of cork oak development & suberin deposition XVIII Brazilian Congress of Plant Physiology / I Ibero-latinamerican Congress of Plant Biology
Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (Porto Alegre, Brasil)
2022/07/07 Heat and osmotic stress have contrasting effects on periderm and endodermis suberization of cork oak roots 20th IUFRO Tree Biotech and 2nd Forest Tree Molecular Biology and Biotechnology Conference
IUFRO (Harbin, China)
2022/01/27 Heat and Osmotic stress have contrasting effects on periderm suberization of cork oak roots XV Portuguese-Spanish Symposium On Plant Water Relations
Instituto Superior de Agronomia (Lisboa, Portugal)
2022/01/27 Impact of drought on cork development and suberization in Quercus suber XV Portuguese-Spanish Symposium On Plant Water Relations
Instituto Superior de Agronomia (Lisboa, Portugal)
2021/06/28 Conserved regulatory networks acting during phellem development in Arabidopsis and cork oak roots FESPB/EPSO Plant Biology Europe 2021, Torino, Italy
FESPB/EPSO (Torino, Itália)
2020/10/22 The BioDta.pt Plant Sciences Community Webinar series BioData.pt Talks (Webinar)
BioData.pt (Oeiras, Portugal)
2019/07/09 Decoding the role of environmental signals in cork development: a transcriptomic approach Encontro Ciência 2019
Fundação para a Ciência e a Tecnologia (Lisboa, Portugal)
2019/06/24 Decoding the role of drought and heat stress in cork oak peridermis suberization (lightning talk) IUFRO Tree Biotechnology 2019
North Carolina State University (Raleigh, Estados Unidos)
2019/05/31 Estratégias de adaptação das plantas num clima em mudança Cortiça, alterações climáticas e soluções mitigadoras
Centro de Competências do Sobreiro e da Cortiça (Coruche, Portugal)
2014/06/24 An integrated approach to identify regulatory genes in the crosstalk between abiotic and biotic stress response in cork oak (Quercus suber). Plant Biology Europe FESPB/EPSO Congress,
FESPB/EPSO (Dublin, Irlanda)
2013/07/24 SuberStress – An integrated approach to identify stress-related regulatory genes in cork oak. XIII Congresso Luso-Espanhol de Fisiologia Vegetal (FV2013)
Faculdade de Ciências Universidade de Lisboa (Lisboa, Portugal)
2011/06/01 Two cold-responsive CBF transcription factors are repressed in flower buds from early blooming almond trees during winter XXXVI Jornadas Portuguesas de Genética
Universidade de Coimbra (Coimbra, Portugal)
2008/04/02 Identification of candidate genes involved in the response to biotic and abiotic stress in almond. XIV Meeting of the Mediterranean Research Group for Almond and Pistachio (GREMPA)
(Athens, Grécia)

Orientação

Título / Tema
Papel desempenhado
Curso (Tipo)
Instituição / Organização
2022/07/01 - Atual Unveiling genetic modules acting on the crosstalk between cork development and environmental factors
Orientador de Diogo José Nina Antunes
Biologia Molecular e Genética (Mestrado)
Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal

Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2021/10/01 - Atual Genome-wide characterization of plant resistance genes in cork oak (Quercus suber)
Orientador de Luis Miguel Gonçalves
Biologia de Plantas - Plantas para a Vida (Doutoramento)
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2021/01/02 - Atual Molecular regulation of cork development: the role of nutrients and microbiome
Orientador de Joana Belo
Biologia de Plantas - Plantas para a Vida (Doutoramento)
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2020/12/02 - Atual A comparative genomics approach to assess interspecific variability associated with cork development
Orientador de Filippo Bergeretti
Biologia de Plantas - Plantas para a Vida (Doutoramento)
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2021/09/01 - 2023/04/17 Identification of gene regulation modules that act in the interaction between cork development and environmental variables
Orientador de Hugo Miguel Costa Rodrigues
Bioinformática e Biologia Computacional (Mestrado)
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal

Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal
2020/10/01 - 2022/02/01 Histochemical and molecular perspectives on the impact of drought on cork development and suberization in Quercus suber
Orientador de Diogo Lucas
Biotecnologia para a Sustentabilidade (Mestrado)
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2018/10/01 - 2019/12/05 Osmotic and combined heat and osmotic stresses have distinct effects on suberization of Quercus suber roots
Orientador de Joana Belo
Biotecnologia para a Sustentabilidade (Mestrado)
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2015 - 2017 Identification of transcription factors regulating cork oak (Quercus suber) QsUNK1 gene during abiotic and biotic stress response
Orientador de Natacha Vieira
Engenharia Agronómica - Ramo Protecção de Plantas (Mestrado)
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2010/09/01 - 2011/11/11 Análise funcional de dois CBFs de Prunus dulcis por expressão heteróloga em A. thaliana e expressão sazonal em plantas de campo
Coorientador de Nuno Gonçalves
Biologia Molecular e Genética (Mestrado)
Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal

Organização de evento

Nome do evento
Tipo de evento (Tipo de participação)
Instituição / Organização
2023/01 - 2023/12 13th ITQB NOVA PhD Students' Meeting (2023/10/18 - 2023/10/20)
Congresso (Membro da Comissão Científica)
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal
2023/01/02 - 2023/10/06 Resources for Plant Sciences - online seminar, ELIXIR Europe, Plant Sciences Community, 5-6 October 2023. Coordinator and host of the Session "Plant Orthology bundle". https://elixir.mf.uni-lj.si/course/view.php?id=107 (2023/10/05 - 2033/10/06)
Oficina (workshop) (Coorganizador)
ELIXIR, Reino Unido
2022/01/05 - 2022/07/22 ITQB NOVA Summer Science, is a Summer School directed to undergraduate students, and provides the opportunity to experience science at ITQB during one week, including participation in laboratory work, round tables and workshops. (2022/07/18 - 2032/07/22)
Encontro (Presidente da Comissão Organizadora)
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2021/07/19 - 2021/07/30 ITQB NOVA Summer Science, is a Summer School directed to undergraduate students, and provides the opportunity to experience science at ITQB during one week, including participation in laboratory work, round tables and workshops. (2021/07/19 - 2021/07/30)
Encontro (Membro da Comissão Organizadora)
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2017/01/24 - 2017/07/28 ITQB NOVA Summer Science, is a Summer School directed to undergraduate students, and provides the opportunity to experience science at ITQB during one week, including participation in laboratory work, round tables and workshops. (2017/07/24 - 2017/07/28)
Encontro (Membro da Comissão Organizadora)
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2015/05/02 - 2015/10/10 ITQB NOVA Open Day. Development and organization of science outreach activities for children and adults. I was in charge of the organization of the photography competition, under the theme “The illuminated life”. (2015/10/10 - 2015/10/10)
Outro (Membro da Comissão Organizadora)
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal

Participação em evento

Descrição da atividade
Tipo de evento
Nome do evento
Instituição / Organização
2021/09/24 - 2021/09/24 European Researchers Night. Planned an outreach activity highlighting the role of cork oak forests in mitigating the effects of climate change.
Exposição
European Researchers Night 2021
Ciência Viva, Portugal

Júri de grau académico

Tema
Tipo de participação
Nome do candidato (Tipo de grau)
Instituição / Organização
2024/02/28 In vitro effects of titanium dioxide nanoparticles on genome-wide methylation
Arguente principal
Ana Catarina da Silva Valente (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2023/07/13 Análise de dados de RNA-seq para estudo de biofilmes bacterianos
Arguente principal
Gonçalo Filipe Martins Alves (Outro)
Instituto Politécnico de Setúbal Escola Superior de Tecnologia do Barreiro, Portugal
2022/01/19 Assessment and implementation of novel annotation platforms for the reconstruction of Genome-Scale Metabolic Models in merlin
Arguente principal
Ana Catarina Costa Barbosa (Mestrado)
Universidade do Minho, Portugal
2019/12/12 Characterization of flower induction and fertilization of Quercus suber
Arguente principal
Helena Sofia Gomes da Silva (Doutoramento)
Universidade do Minho, Portugal
2017/05/29 Molecular analysis of microRNA-target gene interactions in the pine seed
Arguente principal
Sónia Cristina Heleno Correia (Mestrado)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2017/03/22 Identification of transcription factors regulating cork oak UNK1 gene during abiotic stress response
Orientador
Natacha Cristiana dos Santos Vieira (Mestrado)
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal

Arbitragem científica em revista

Nome da revista (ISSN) Editora
2022/05 - Atual Frontiers in Plant Science (1664-462X) Frontiers
2022 - Atual Biologia (1336-9563) Springer
2022 - Atual Tree Physiology (1758-4469) Oxford University Press
2022 - Atual Trees (0931-1890) Springer
2021 - Atual PLoS ONE (1932-6203) PLOS
2020 - Atual Forests (1999-4907) MDPI
2020 - Atual Genes (2073-4425) MDPI
2020 - Atual Plants (2223-7747) MDPI
2020 - Atual Scientific Reports (2045-2322)
2019/08 - Atual Nucleic Acids Research (1362-4962) Oxford University Press
2018/12 - Atual Molecules (1420-3049) MDPI AG
2017/12 - Atual Plant Cell Tissue and Organ Culture (PCTOC) (1573-5044) Springer-Verlag
2017/09 - Atual Journal of Experimental Botany (1460-2431) Oxford University Press
2016/12 - Atual Plant Science (0168-9452) Elsevier
2015/07 - Atual BMC Plant Biology (1471-2229) Springer (Biomed Central Ltd.)
2014/04 - Atual Plant Cell Reports (1432-203X) Springer-Verlag
2014/03 - Atual International Journal of Molecular Sciences (1422-0067) MDPI AG

Comissão de avaliação

Descrição da atividade
Tipo de assessoria
Instituição / Organização Entidade financiadora
2022/01 - 2022/03 Evaluator in SONATA-17 program: Proposals for funding of a research project carried out by a person who has been awarded a doctorate within 2-7 years
Avaliador
Narodowe Centrum Nauki, Polónia Narodowe Centrum Nauki

Curso / Disciplina lecionado

Disciplina Curso (Tipo) Instituição / Organização
2023/10/01 - 2024/03/31 Genómica Estrutural e Evolutiva Bioinformática (Licenciatura) Instituto Politécnico de Setúbal, Portugal

Instituto Politécnico de Setúbal Escola Superior de Tecnologia do Barreiro, Portugal
2023/05/25 - 2023/05/25 Engineering Secondary Growth Biologia de Plantas - Plantas para a Vida (Doutoramento) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal
2023/05/24 - 2023/05/24 Genomic approaches to study the Portuguese emblematic tree - Cork oak Biologia de Plantas - Plantas para a Vida (Doutoramento) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal
2023/04/18 - 2023/04/18 Introduction to Phylogenetic analysis Biologia de Plantas - Plantas para a Vida (Curso de doutoramento (conclusão de unidades curriculares)) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal
2022/10/06 - 2023/03/30 Genómica Estrutural e Evolutiva Bioinformática (Licenciatura) Instituto Politécnico de Setúbal Escola Superior de Tecnologia do Barreiro, Portugal
2022/09/05 - 2022/09/07 Workshop - Introduction to R (Outros) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2021/11/02 - 2022/04/30 Genómica Estrutural e Evolutiva Bioinformática (Licenciatura) Instituto Politécnico de Setúbal, Portugal

Instituto Politécnico de Setúbal Escola Superior de Tecnologia do Barreiro, Portugal
2021/06/14 - 2021/06/17 Workshop - Introduction to R Postdoc Programme 3rd Edition (Outros) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2021/04/22 - 2021/04/22 Introduction to Phylogenetic analysis Biologia de Plantas - Plantas para a Vida (Doutoramento) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2021/04/15 - 2021/04/15 Engineering secondary growth Biologia de Plantas - Plantas para a Vida (Doutoramento) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2021/04/14 - 2021/04/14 Genomic approaches to study the Portuguese emblematic tree - Cork oak Biologia de Plantas - Plantas para a Vida (Doutoramento) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2021/02/01 - 2021/02/12 Genome scale technologies, Biostatistics and Bioinformatics Biotecnologia para a Sustentabilidade (Mestrado integrado) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2019/10/14 - 2019/10/14 Workshop Biostatistics using R Postdoc Programme 2nd Edition (Outros) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2019/05/23 - 2019/05/23 Engineering secondary growth Biologia de Plantas - Plantas para a Vida (Doutoramento) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2019/05/22 - 2019/05/22 Genomic approaches to study the Portuguese emblematic tree - Cork oak Biologia de Plantas - Plantas para a Vida (Doutoramento) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2019/03/28 - 2019/03/28 Workshop - Data handling and basic statistical analysis (Outros) BioResources 4 Sustainability, Portugal
2019/01/31 - 2019/02/07 Workshop - Introduction to R (Outros) BioResources 4 Sustainability, Portugal
2018/04/11 - 2018/04/11 Genomic approaches to study the Portuguese emblematic tree - Cork oak Biologia de Plantas - Plantas para a Vida (Doutoramento) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal

Entrevista (jornal / revista)

Descrição da atividade Jornal / Forum
2018/05/23 Commentary to the public release of the first draft genome sequence of cork oak. Público
2013/12 "Secrets of overwintering plants", article written by Jared Bernard. The results of my PhD research on this topic were highlighted. The Gardener Magazine

Membro de associação

Nome da associação Tipo de participação
2021/10/01 - 2023/02/01 ITQB NOVA & iBET Post-Doctoral Association Secretary
2016/11 - 2017/11 ITQB NOVA & iBET Post-Doctoral Association Secretary
2015/11 - 2016/11 ITQB & iBET Post-Doctoral Association. The ITQB NOVA Post-Doc Association aims to represent and support the specific interests of the Post-doctoral fellows working at ITQB NOVA and iBET, promote their sense of community, organize professional enrichment and career development activities, as well as networking events. This was a pos-doc initiative implemented in 2015. Vice-chair

Membro de comissão

Descrição da atividade
Tipo de participação
Instituição / Organização
2023/09 - Atual PhD Thesis Committee - Diogo Lucas: PhD Plants For Life; Thesis title: The role of splicing factors during sexual plant reproduction in Arabidopsis thaliana
Consultor
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal
2019/09 - Atual PhD Thesis Committee - Ângela Pinheiro: Ref. SFRH/BD/144593/2019; Thesis title: Dissecting potential roles of Resin diterpene derivatives formed by fungi colonising Pinus pinaster as chemical upholders against phytopathogens
Consultor
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal
2019/05 - Atual PhD Thesis Committee - Bárbara Rebelo: PhD Plants For Life; Thesis title: Challenges in metabolic responses and carotenoid biosynthesis in algae and angiosperms: searching for an alternative production system.
Consultor
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal
2019/01/01 - Atual Coordinator of the Bioinformatics and Biostatistics platform of Green-it BioResources for Sustainability research Unit. The Goal of this platform is to bring together in-house experience and contribute for training of Green-it researchers on bioinformatics tools and biostatistics (in-house workshops and invited trainers)
Coordenador
BioResources 4 Sustainability, Portugal

Tutoria

Tópico Nome do aluno
2019/01 - 2021/05/31 Tutor in the work developed for Biodata.pt Marta C. Silva
2020/02 - 2020/11/30 Tutor in the work developed for Biodata.pt Filippo Bergeretti
2016/06/01 - 2019/05/31 Mentor in laboratory work. Ana Rita Leal
2018/05/02 - 2018/10/26 Mentor in laboratory work. Marcelo Amaral
Distinções

Prémio

2019 Papers@USA - Travel grant
Fundação Luso-Americana, Portugal
2013 Short Term Scientific Mission (STSM, COST action FP1202)
European Cooperation in Science and Technology, Bélgica