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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Maria João Pereira e Sousa

Nomes de citação

  • Sousa, Maria J. P.

Identificadores de autor

Ciência ID
5D11-BFBD-E0C4
ORCID iD
0009-0005-1372-9348

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Português (Idioma materno)
Inglês Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2)
Francês Utilizador elementar (A2) Utilizador elementar (A2) Utilizador elementar (A2) Utilizador elementar (A2)
Formação
Grau Classificação
2023/09/05 - 2027/09/01
Em curso
 Informática (Doutoramento)
Universidade de Aveiro, Portugal

Universidade do Porto, Portugal

Universidade do Minho, Portugal
2021/10/01 - 2023/07/10
Concluído
 Engenharia Informática (Mestrado)
Universidade de Aveiro, Portugal
2018/09/17 - 2021/07/03
Concluído
 Engenharia Informática (Licenciatura)
ISCTE-Instituto Universitário de Lisboa, Portugal
Produções

Publicações

Artigo em conferência
  1. Sousa, Maria J. P.; Armando J Pinho; Pratas, Diogo. "Improving the generation of viral consensus sequences using adaptive models". Trabalho apresentado em 32nd European Signal Processing Conference, EUSIPCO 2024, Lyon, 2024.
  2. Sousa, Maria J. P.; Armando J Pinho; Pratas, Diogo. "A sensitive compression-based method for filtering targeted FASTQ sequencing reads". Trabalho apresentado em 32nd European Signal Processing Conference, EUSIPCO 2024, Lyon, 2024.
  3. Fonseca, Tiago; Sousa, Maria J. P.; Armando J Pinho; Pratas, Diogo. "A sorting tool for improving FASTA data compression tools". Trabalho apresentado em 32nd European Signal Processing Conference, EUSIPCO 2024, Lyon, 2024.
  4. Sousa, Maria J. P.; Pratas, Diogo. "A method for improving the generation of consensus sequences". Trabalho apresentado em 19th Workshop on Informatics Engineering Research, WIER 2024, Porto, 2024.
    Publicado
  5. Sousa, Maria J. P.; Pratas, Diogo. "A method for accurate reconstruction of persistent human viral sequences". Trabalho apresentado em 29th Portuguese Conference on Pattern Recognition, RecPad 2023, Coimbra, 2023.
    Publicado
  6. Sousa, Maria J. P.; Pratas, Diogo. "A survey on computational tools for human viral genomes reconstruction". Trabalho apresentado em 28th Portuguese Conference on Pattern Recognition, RecPad 2022, Leiria, 2022.
    Publicado
  7. Sousa, Maria J. P.; Ferrolho, Rita; Fonseca, Tiago; Pinho, Armando J.; Pratas, Diogo. "Improving the compression of a complete Telomere-to-Telomere (T2T) human genome sequence". Trabalho apresentado em 28th Portuguese Conference on Pattern Recognition, RecPad 2022, Leiria, 2022.
    Publicado
Artigo em revista
  1. Sousa, Maria J. P.; Armando J Pinho; Pratas, Diogo. Autor correspondente: Pratas, Diogo. "JARVIS3: an efficient encoder for genomic data". Bioinformatics 40 12 (2024):
    Publicado
Poster em conferência
  1. Sousa, Maria J. P.; Pinho, Armando J.; Pratas, Diogo. "Improving the generation of viral consensus sequences using adaptive models". Trabalho apresentado em 32nd European Signal Processing Conference, EUSIPCO 2024, 2024.
  2. Sousa, Maria J. P.; Pinho, Armando J.; Pratas, Diogo. "A sensitive compression-based method for filtering targeted FASTQ sequencing reads". Trabalho apresentado em 32nd European Signal Processing Conference, EUSIPCO 2024, 2024.
  3. Fonseca, Tiago; Sousa, Maria J. P.; Armando J Pinho; Pratas, Diogo. "A sorting tool for improving FASTA data compression tools". Trabalho apresentado em 32nd European Signal Processing Conference, EUSIPCO 2024, 2024.
  4. Sousa, Maria J. P.; Pratas, Diogo. "A method for improving the generation of viral consensus sequences using adaptive models". Trabalho apresentado em 6th Statistics on Health Decision Making: Artificial Intelligence, SHDM 2024, 2024.
  5. Sousa, Maria J. P.; Pratas, Diogo. "A method for accurate reconstruction of persistent human viral sequences". Trabalho apresentado em 29th Portuguese Conference on Pattern Recognition, RecPad 2023, 2023.
  6. Sousa, Maria J. P.; Ferrolho, Rita; Fonseca, Tiago; Pinho, Armando J.; Pratas, Diogo. "Improving the compression of a complete Telomere-to-Telomere (T2T) human genome sequence". Trabalho apresentado em 28th Portuguese Conference on Pattern Recognition, RecPad 2022, 2022.
  7. Sousa, Maria J. P.; Pratas, Diogo. "A survey on computational tools for human viral genomes reconstruction". Trabalho apresentado em 28th Portuguese Conference on Pattern Recognition, RecPad 2022, 2022.
Resumo em conferência
  1. Sousa, Maria J. P.; Pratas, Diogo. "A method to reconstruct persistent human viral sequences cooperatively". Trabalho apresentado em Research Summit 2024, Aveiro, 2024.
    Publicado
  2. Sousa, Maria J. P.; Pratas, Diogo. "A method for improving the generation of viral consensus sequences using adaptive models". Trabalho apresentado em 6th Statistics on Health Decision Making: Artificial Intelligence, SHDM 2024, Aveiro, 2024.
    Publicado
  3. Sousa, Maria J. P.; Pratas, Diogo. "A cooperative method to reconstruct persistent human viral sequences". Trabalho apresentado em The 20th Portugaliæ Genetica: DNA - Ancient and New, Porto, 2024.
    Publicado
Tese / Dissertação
  1. "Automatic reconstruction of persistent human virus sequences". Mestrado, Universidade de Aveiro, 2023. http://hdl.handle.net/10773/40666.
Atividades

Apresentação oral de trabalho

Título da apresentação Nome do evento
Anfitrião (Local do evento)
2024/07/19 A method to reconstruct persistent human viral sequences cooperatively Research Summit 2024
2024/04/24 A method for improving the generation of consensus sequences 19th Workshop on Informatics Engineering Research, WIER 2024
2024/03/21 A cooperative method to reconstruct persistent human viral sequences The 20th Portugaliæ Genetica: DNA - Ancient and New
Distinções

Outra distinção

2024 Honorable mention at 6th Statistics on Health Decision Making: Artificial Intelligence