Identificação
Identificação pessoal
- Nome completo
- Daniel Vieira Noro e Silva Sobral
Nomes de citação
- Sobral, Daniel
Identificadores de autor
- Ciência ID
- 5C13-14D8-F5A4
- ORCID iD
- 0000-0003-3955-0117
- Google Scholar ID
- ihHfSkUAAAAJ
Endereços de correio eletrónico
- dv.sobral@fct.unl.pt (Profissional)
Moradas
- Departamento Ciências da Vida, Faculdade de Ciências e Tecnologia – Universidade Nova de Lisboa, Campus de Caparica, 2829-516, Caparica, Almada, Portugal (Profissional)
Websites
- https://comics.dcv.fct.unl.pt/daniel-sobral/ (Profissional)
Domínios de atuação
- Ciências Exatas - Ciências da Computação e da Informação - Bioinformática
- Ciências Naturais - Ciências Biológicas
Idiomas
| Idioma | Conversação | Leitura | Escrita | Compreensão | Peer-review |
|---|---|---|---|---|---|
| Inglês | Utilizador proficiente (C1) | Utilizador proficiente (C1) | Utilizador proficiente (C1) | Utilizador proficiente (C1) | Utilizador proficiente (C1) |
| Francês | Utilizador independente (B1) | Utilizador proficiente (C1) | Utilizador independente (B1) | Utilizador independente (B2) |
Formação
| Grau | Classificação | |
|---|---|---|
|
2009
Concluído
|
Doctorat en Biologie - Spécialité Génomique et Bioinformatique (Doutoramento)
Aix-Marseille Université Ecole Doctorale des Sciences de la Vie et de la Santé, França
"Biological Data Integration: Towards a Global Understanding of Ascidian Development" (TESE/DISSERTAÇÃO)
|
Mention Trés Honorable |
|
2006
Concluído
|
Mestrado em Engenharia Informática e de Computadores (Mestrado)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
"Multi-Level Control For Interactive Narratives - A Proposal for a Narrative Authoring Framework" (TESE/DISSERTAÇÃO)
|
Aprovado |
|
2002
Concluído
|
Engenharia Informática e de Computadores (Licenciatura)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
|
16 |
Percurso profissional
Ciência
| 2019/04/01 - Atual | Pós-doutorado (Investigação)
UCIBIO - FCT NOVA, Portugal
|
| 2015 - 2019/03/31 | Investigador principal (carreira) (Investigação)
Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal
|
| 2011/12/31 - 2015 | Pós-doutorado (Investigação)
Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal
|
| 2009/12/01 - 2011/12/30 | Investigador Contratado (Investigação)
European Bioinformatics Institute, Reino Unido
|
Docência no Ensino Superior
| 2002/10/01 - 2004/08/31 | Monitor (Docente Universitário)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
|
Outros
| 2005/01/01 - 2009/09/30 | Gulbenkian PhD Fellow
Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal
|
Projetos
Projeto
| Designação | Financiadores | |
|---|---|---|
| 2019 - 2021/09/30 | Targeting Intra-Tumor Heterogeneity as a promising therapeutic strategy for cancer
PTDC/MED-ONC/28660/2017
Bolseiro de Pós-Doutoramento
REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia |
| 2017 - 2019/02/28 | BioData.pt - Rede Portuguesa de Dados Biologicos
01/SAICT/2016
Investigador
Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal
|
Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT European Regional Development Fund |
| 2017 - 2019/02/28 | ONEIDA - An Omics Network to Prevent and Control Infectious Diseases and Antimicrobial Resistance
03/SAICT/2015
Investigador
Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal
|
Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT European Regional Development Fund |
| 2015 - 2019/02/28 | ELIXIR-EXCELERATE: Fast-track ELIXIR implementation and drive early user exploitation across the life-sciences.
info:eu-repo/grantAgreement/EC/Horizon 2020 Framework Programme/676559/EU
Investigador
Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal
|
European Commission |
| 2009 - 2012/01/29 | CISSTEM - Cis-regulatory logic of the transcriptional control in neural stem cells
FP7 – 223210
Investigador
European Bioinformatics Institute, Reino Unido
|
|
| 2005 - 2008 | TRANSCODE - Novel tool for high-throughput characterization of genomic elements regulating gene expression in chordates.
511990
Investigador
Institut de Biologie du Développement de Marseille, França
|
|
| 2002 - 2003 | Victec (Virtual ICT with Empathic Characters)
IST-2001-33310
Investigador
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal
|
Outro
| Designação | Financiadores | |
|---|---|---|
| 2017 - 2020/09/07 | Gene Regulation Ensemble Effort for the Knowledge Commons
CA15205
Investigador
Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal
|
Produções
Publicações
| Artigo em revista |
|
| Capítulo de livro |
|
Outros
| Outra produção |
|
Atividades
Orientação
| Título / Tema Papel desempenhado |
Curso (Tipo) Instituição / Organização |
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|---|---|---|
| 2019/09 - 2020/09 | Supervision of MsC Thesis: Deciphering mechanisms underlying tumour heterogeneity using Multi-Omics approaches
Coorientador
|
Biotecnologia (Engenharia Bioquímica) (Mestrado)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
|
Organização de evento
| Nome do evento Tipo de evento (Tipo de participação) |
Instituição / Organização | |
|---|---|---|
| 2020/07/06 - 2020/07/10 | EMBO Practical Course on "Deciphering tumour heterogeneity and evolution by integration of multi-omics data". This course
aims to provide practical insights for cancer researchers regarding the potentials and challenges of using high throughput
sequencing to estimate intra-tumoral diversity in its multiple facets. This will include the detection of mutational patterns,
selection pressures and driver mutations, as well as techniques for the determination of subclonal diversity and clonal evolution.
(2020/07/06 - 2020/07/10)
Oficina (workshop) (Coorganizador)
|
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal |
| 2019/06/03 - 2019/06/07 | GTPB Workshop: Analysis of Differential Expression using RNAseq (2019/06/03 - 2019/06/07)
Oficina (workshop) (Coorganizador)
|
Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal |
| 2019/02/07 - 2019/02/08 | GTPB Workshop: Introduction to Bioinformatics (2019/02/04 - 2019/02/08)
Oficina (workshop) (Coorganizador)
|
Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal |
| 2018/10/08 - 2018/10/12 | GTPB Workshop: Analysis of Differential Expression using RNAseq (2018/10/08 - 2018/10/12)
Oficina (workshop) (Coorganizador)
|
Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal |
| 2018/05/07 - 2018/05/11 | Elixir Excelerate Workshop on Marine Metagenomics (2018/05/07 - 2018/05/11)
Oficina (workshop) (Coorganizador)
|
Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal |
| 2018/05/03 - 2018/05/03 | ONEIDA Workshop: Bioinformatics Applications (2018/05/02 - 2018/05/04)
Oficina (workshop) (Coorganizador)
|
Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal |
| 2018/04/09 - 2018/04/13 | GTPB Workshop: Analysis of Differential Expression using RNAseq (2018/04/09 - 2018/04/13)
Oficina (workshop) (Coorganizador)
|
Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal |
| 2018/02/22 - 2018/02/23 | GTPB Workshop: Introduction to Bioinformatics (2018/02/19 - 2018/02/23)
Oficina (workshop) (Coorganizador)
|
Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal |
| 2017/12/04 - 2017/12/07 | GTPB Workshop: Analysis of Differential Expression using RNAseq (2017/12/04 - 2017/12/07)
Oficina (workshop) (Coorganizador)
|
Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal |
| 2017/11/09 - 2017/11/10 | GTPB Workshop: Introduction to Bioinformatics (2017/11/06 - 2017/11/10)
Oficina (workshop) (Coorganizador)
|
Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal |
| 2017/10/23 - 2017/10/27 | Elixir Excelerate Workshop on Genome Assembly and Annotation (2017/10/23 - 2017/10/27)
Oficina (workshop) (Coorganizador)
|
Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal |
| 2017/09/21 - 2017/09/22 | COST Course Molecular Biology meets Bioadhesion Research (2017/09/18 - 2017/09/22)
Oficina (workshop) (Coorganizador)
|
Universität Innsbruck, Áustria |
| 2017/05/11 - 2017/05/12 | GTPB Workshop: Introduction to Bioinformatics (2017/05/08 - 2017/05/11)
Oficina (workshop) (Coorganizador)
|
Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal |
| 2017/04/17 - 2017/04/20 | GTPB Workshop: Analysis of Differential Expression using RNA-Seq (2017/04/17 - 2017/04/20)
Oficina (workshop) (Coorganizador)
|
Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal |
| 2015/07/27 - 2015/07/31 | EMBO Practical Course on Measuring intra-species diversity using high-throughput sequencing. This EMBO Practical Course aimed
to show evolutionary biologists and population geneticists potentials and perils of using high throughput sequencing to estimate
intra-specific genetic diversity, from individuals to populations. 20 selected participants had the opportunity to interact
with experienced researchers that successfully applied the technology in a wide variety of high impact studies, and learn
from their successes as well as from their failures. (2015/07/27 - 2015/07/31)
Oficina (workshop) (Coorganizador)
|
Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal |
Júri de grau académico
| Tema Tipo de participação |
Nome do candidato (Tipo de grau) Instituição / Organização |
|
|---|---|---|
| 2019/11/26 | Jury of MsC Thesis: Optimizing Data Selection for Contact Prediction in Proteins
Arguente principal
|
Guilherme José Gago Fial (Mestrado)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
|
| 2018/04/06 | Jury of PhD Thesis: Analyses of the genomic variation to study cork oak evolution and adaptation: from past to future climatic
changes
Arguente
|
Francisco Rente de Pina Martins (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
|
| 2018/03/22 | Jury of MsC Thesis: Bioinformatics analyses and approaches to RNA-Seq Data
Arguente principal
|
Eric Serafim Ramos De Sousa (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
|
| 2016/10/24 | Jury of MsC Thesis: Post-transcriptional circadian gene expression regulation in Trypanosoma brucei
Arguente principal
|
Daniel Pinto de Oliveira Gonçalves Neves (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
|
| 2016/07/21 | Jury of MSc Thesis: Transcriptomic analysis of maritime pine response to infection with Bursaphelenchus Xylophilus, the causing
agent of pine wilt disease
Arguente principal
|
Daniel Filipe Branco Gaspar (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
|
| 2013/12/02 | Jury of MsC Thesis: Evaluating differential gene expression using RNA-sequencing data: a case study in host-pathogen interaction
upon Listeria monocytogenes infection
Arguente principal
|
Joana Rita Gonçalves da Cruz (Mestrado)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
|
Comissão de avaliação
| Descrição da atividade Tipo de assessoria |
Instituição / Organização | Entidade financiadora | |
|---|---|---|---|
| 2017 - Atual | Member of Evaluation Committee for PhD Thesis of Catarina Isabel Ventura Pereira: Systems-Wide Identification of Cystic Fibrosis
Disease Map
Avaliador
|
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal |
Curso / Disciplina lecionado
| Disciplina | Curso (Tipo) | Instituição / Organização | |
|---|---|---|---|
| 2018/03/28 - 2018/04/04 | Investigação em Bioinformática | Mestrado em Bioinformática e Biologia Computacional (Mestrado) | Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal |
| 2018/03/01 - 2018/03/02 | Introduction to Bioinformatics, IGC PhD Program | Introduction to Bioinformatics (Curso de doutoramento (conclusão de unidades curriculares)) | Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal |
Tutoria
| Tópico | Nome do aluno | |
|---|---|---|
| 2018/02 - 2018/09 | Mentorship of MsC student in Bioinformatics. | Cirenia Baldrich |
| 2017 - 2018 | Member of PhD Thesis Committee. | Ana Paula Aguiar |
| 2016/09 - 2017/02 | Mentorship of MsC student in Bioinformatics. | Pedro Perdiguero |
| 2015/09/01 - 2016/09/30 | Mentorship of MsC student in Bioinformatics. | Samuel Dias Rosa Viana |
| 2015/01 - 2015/06 | Mentorship of MsC student in Bioinformatics. | David M. F. Francisco |
| 2014/05/01 - 2014/12/28 | Mentorship of MsC student in Bioinformatics. | Patrícia Alexandra Silva Santos |
Distinções
Prémio
| 2015 | PLOS Genetics Research Prize 2015
Public Library of Science, Estados Unidos
|
