???global.info.a_carregar???
Miguel Pessanha Pais concluded the Licenciatura in Marine Environmental Biology in 2006, MSc in Ecology and Environmental Management in 2008 and the PhD in Marine Biology in 2013. He is a postdoctoral researcher at MARE - Marine and Environmental Sciences Centre and Faculty of Sciences, University of Lisbon. His research focuses on applied marine ecology, conservation and environmental management, particularly with coastal reef organisms (fish, invertebrates and algae). Research interests include marine conservation, environmental monitoring methods, ecological indicators and ecological modelling, particularly statistical models and agent-based models (spatial and networks).
Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Miguel Pessanha Freitas Branco Pais
Data de nascimento
1984/03/19
Género
Masculino

Nomes de citação

  • Pais, Miguel Pessanha
  • Miguel Pais
  • Miguel P Pais
  • Miguel P. Pais

Identificadores de autor

Ciência ID
461C-D5D5-E02C
ORCID iD
0000-0003-4282-9995
Google Scholar ID
TVhrcnYAAAAJ
Researcher Id
B-1537-2012
Scopus Author Id
15049708400

Endereços de correio eletrónico

  • mppais@fc.ul.pt (Profissional)

Telefones

Telefone
  • (+351) 217500000 Ext.: 22576 (Profissional)

Moradas

  • MARE - Centro de Ciências do Mar e do Ambiente. Faculdade de Ciências, Universidade de Lisboa, Campo Grande, 1749-016, Lisboa, Lisboa, Portugal (Profissional)

Websites

Domínios de atuação

  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia Marinha

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Português (Idioma materno)
Inglês Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2)
Espanhol; Castelhano Utilizador independente (B1) Utilizador independente (B1) Utilizador elementar (A2) Utilizador independente (B1) Utilizador elementar (A2)
Francês Utilizador elementar (A1) Utilizador independente (B1) Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A2) Utilizador elementar (A1)
Formação
Grau Classificação
2019 - 2019
Concluído
SSI Master diver (Outros)
Scuba Schools International (SSI), Estados Unidos
2019
Concluído
Workshop on Ecological Network Analysis (Outros)
International Society for Ecological Modelling (ISEM), Estados Unidos

Universität Salzburg, Áustria
2019
Concluído
Open Water SCUBA Instructor (Outros)
Scuba Schools International (SSI), Estados Unidos
2018/01/02 - 2018/01/07
Concluído
Winter School on Agent-based modelling for social-ecological systems (Outros)
Arizona State University, Estados Unidos
2018 - 2018
Concluído
Workshop on Baited Remote Underwater Stereo Video calibration and analysis using EventMeasure (Outros)
Instituto Superior de Psicologia Aplicada, Portugal

SeaGIS, Austrália
2018 - 2018
Concluído
Workshop on Marine Protected Area classification (Outros)
Sociedade Ibérica de Ictiologia (SIBIC), Espanha
2018 - 2018
Concluído
Dynamic Energy Budgets. Massive Open Online Course (Outros)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2017
Concluído
Online Course - Introduction to Agent-based modelling (Outros)
Santa Fe Institute, Estados Unidos
2013
Concluído
Biologia Marinha e Aquacultura (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
"Dealing with uncertainty and heterogeneity in the assessment of structural and functional integrity in marine fish assemblages." (TESE/DISSERTAÇÃO)
Distinção e louvor por unanimidade (maximum grade)
2012
Concluído
Short course on Modelling qualitative information with rule-based fuzzy cognitive maps (Outros)
Instituto Português do Mar e da Atmosfera, Portugal
2011
Concluído
Workshop on Biogeography and Phylogeography of Atlantic Fishes (Outros)
Instituto Superior de Psicologia Aplicada, Portugal

Centro de Ciências do Mar, Portugal
2011
Concluído
Workshop on Mapping Seabed Habitats: GIS data management (Outros)
Universidade de Aveiro, Portugal
2010
Concluído
Course on Geographic Information Systems Applied to Earth Sciences (SIGAIA V) (Outros)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2008
Concluído
Ecologia e Gestão Ambiental (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
"Marine Fish Assemblage Typologies for the Portuguese Coast in the Context of the European Marine Strategy Directive" (TESE/DISSERTAÇÃO)
19/20
2007
Concluído
Short course "Introduction to Geographic Information Systems" (Outros)
Liga para a Protecção da Natureza (LPN), Portugal

ESRI Portugal, Portugal
2006
Concluído
Biologia Ambiental - Variante Marinha (Licenciatura)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
"n/a" (TESE/DISSERTAÇÃO)
16/20
2000
Concluído
Certificate in Advanced English (CAE) (Outros)
Cambridge School, Portugal
B
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento
Empregador
2019/07/01 - Atual Investigador Contratado (Investigação) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
Centro de Ciências do Mar e do Ambiente, Portugal
2014/02/01 - 2019/06/30 Pós-doutorado (Investigação) Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
Centro de Ciências do Mar e do Ambiente, Portugal
2013/10/01 - 2014/01/31 Investigador (Investigação) Universidade de Lisboa Centro de Oceanografia, Portugal
Universidade de Lisboa Centro de Oceanografia, Portugal
2008/03/01 - 2009/02/01 Estagiário de Investigação (Investigação) Universidade de Lisboa Centro de Oceanografia, Portugal

Outros

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento
Empregador
2009/03/01 - 2013/09/16 PhD student Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
Universidade de Lisboa Centro de Oceanografia, Portugal
Projetos

Bolsa

Designação Financiadores
2014/02 - 2019/06 Spatially-explicit individual-based models as a decision-support tool for the study and monitoring of temperate reef fish assemblages
SFRH/BPD/94638/2013
Bolseiro de Pós-Doutoramento
Centro de Ciências do Mar e do Ambiente, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2013 - 2014 BioConnect - Connectivity among estuarine and coastal fish populations: Natural tags as a tool for management and conservation
Bolseiro de Investigação
Universidade de Lisboa Centro de Oceanografia, Portugal
Universidade do Algarve Faculdade de Ciências e Tecnologia
Concluído
2009/03 - 2013/09 Dealing with Uncertainty and Heterogeneity in the Assessment of Structural and Functional Integrity in Marine Fish Assemblages
SFRH/BD/46639/2008
Bolseiro de Doutoramento
Universidade de Lisboa Centro de Oceanografia, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2010 - 2010 Aves invernantes e migradoras como indicadores da qualidade de ambientes estuarinos (MIGRATAGIS)
PTDC/MAR/66319/2006
Investigador
Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2008 - 2008 Study for the requalification of the Melides Lagoon - Monitoring services
NA
Investigador
Universidade de Lisboa Centro de Oceanografia, Portugal

Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
Concluído

Projeto

Designação Financiadores
2018 - Atual FindRayShark: Applying innovative technologies to the conservation of rays and sharks
NA
Investigador
Centro de Ciências do Mar e do Ambiente, Portugal

Instituto Português do Mar e da Atmosfera, Portugal

Universidade do Porto Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Portugal

Universidade dos Açores Departamento de Oceanografia e Pescas, Portugal
Oceanário de Lisboa / Oceano Azul Foundation
Em curso
2020 - 2022/02 SCI-DIVE: Specialization on Scientific Diving
NA
Investigador
Instituto Politécnico de Leiria, Portugal

JustDive - Underwater experiences, Portugal
Em curso
2019/09/03 - 2021/02/28 Collection of georeferenced information on the diversity and abundance of macrofauna and flora in the Cascais maritime area (AquaSig 3)
359/DCOP/2019
Investigador responsável
Centro de Ciências do Mar e do Ambiente, Portugal

Instituto Superior de Psicologia Aplicada, Portugal

FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal
Câmara Municipal de Cascais
Concluído
2018 - 2021 REEFNETS: Using ecological networks to predict marine ecosystem responses to human threats
PTDC/BIA-ECO/28687/2017
Investigador
Centro de Ciências do Mar e do Ambiente, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2019 - 2020 Improve and complement water bodies classification for coastal and transitional waters (MESCLA)
POSEUR-03-2013-FC-000001
Investigador
Centro de Ciências do Mar e do Ambiente, Portugal

Agência Portuguesa do Ambiente, Portugal
Em curso
2016/07/01 - 2019/07/31 BIOPHARMA: Medicating the environment: individual and population-level effects of long-term exposure to pharmaceuticals in estuaries
PTDC/MAR-EST/3048/2014
Investigador
Centro de Ciências do Mar e do Ambiente, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2013 - 2014 Sensitivity and potential of the Cascais coastal area and its monitoring program: Marine fauna component (AquaSig 2)
NA
Investigador
Centro de Ciências do Mar e do Ambiente, Portugal

Cascais Ambiente, Portugal
Cascais Ambiente
Concluído
2012 - 2014 Seagrass and seahorses of the Sado estuary
NA
Investigador
Centro de Ciências do Mar e do Ambiente, Portugal

Instituto da Conservação da Natureza e das Florestas, Portugal
Instituto da Conservação da Natureza e das Florestas
Concluído
2008/08 - 2011/07 Spatial and temporal variablity of fish assemblages in different estuarine habitats: dependence, adaptive plasticity and resilience (FISHEST) Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Concluído
2010/07 - 2010/08 EMEPC/M@rBis Expedition to the Selvagens Islands, Portugal
NA
Investigador
Centro de Ciências do Mar e do Ambiente, Portugal

Estrutura de Missão para a Extensão da Plataforma Continental, Portugal
Concluído
2009 - 2010 Sensitivity and potential of the Cascais coastal area and its monitoring program: Marine fauna component (AquaSig)
NA
Investigador
Universidade de Lisboa Centro de Oceanografia, Portugal

Agência Cascais Atlântico, Portugal
Concluído
2008 - 2008 Characterization and monitoring beach seine fisheries and bivalve dredging in the coastal area of the city of Almada
NA
Investigador
Universidade de Lisboa Centro de Oceanografia, Portugal
Concluído
2007 - 2008 Evaluation of the impact of the Arrábida Marine Protected Area constraints on the commercial and recreational fisheries and recreational boating.
NA
Investigador
Universidade de Lisboa Centro de Oceanografia, Portugal
Câmara Municipal de Sesimbra
Concluído

Outro

Designação Financiadores
2007 - 2008 Programa de monitorização dos ecossistemas terrestre e estuarino, na envolvente à CTRSU de S. João da Talha
NA
Investigador
Universidade de Lisboa Centro de Oceanografia, Portugal
Valorsul
Concluído
2006 - 2006 Plano de Valorização e Gestão de Zonas Húmidas – Algarve (componente Ecologia Aquática)
NA
Investigador
Comissão de Coordenação e Desenvolvimento Regional do Algarve
Concluído
Produções

Publicações

Artigo em revista
  1. "Setting Performance Indicators for Coastal Marine Protected Areas: An Expert-Based Methodology". Frontiers in Marine Science 9 (2022): http://dx.doi.org/10.3389/fmars.2022.848039.
    10.3389/fmars.2022.848039
  2. Sahar Chebaane; João Canning-Clode; Patrício Ramalhosa; Janina Belz; Nuno Castro; Inês Órfão; Juan Sempere-Valverde; et al. "From Plates to Baits: Using a Remote Video Foraging System to Study the Impact of Foraging on Fouling Non-Indigenous Species". Journal of Marine Science and Engineering 10 5 (2022): 611-611. https://doi.org/10.3390/jmse10050611.
    10.3390/jmse10050611
  3. McIvor, Ashlie J.; Collin T Williams; Filipe Alves; Ana Dinis; Pais, Miguel Pessanha; Canning-Clode, João. "The Status of Marine Megafauna Research in Macaronesia: A Systematic Review". Frontiers in Marine Science (2022): https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmars.2022.819581/abstract.
    No prelo
  4. Fonseca, V.F.; Reis-Santos, P.; Duarte, B.; Cabral, H.N.; Caçador, M.I.; Vaz, N.; Dias, J.M.; Pais, M.P.. "Roving pharmacies: Modelling the dispersion of pharmaceutical contamination in estuaries". Ecological Indicators 115 (2020): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85083804142&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.ecolind.2020.106437
  5. Irina A. Duarte; Miguel P. Pais; Patrick Reis-Santos; Henrique N. Cabral; Vanessa F. Fonseca. "Biomarker and behavioural responses of an estuarine fish following acute exposure to fluoxetine". Marine Environmental Research 147 (2019): 24-31. https://doi.org/10.1016/j.marenvres.2019.04.002.
    10.1016/j.marenvres.2019.04.002
  6. Reis-Santos, Patrick; Pais, Miguel; Duarte, Bernardo; Caçador, Isabel; Freitas, Andreia; Vila Pouca, Ana S.; Barbosa, Jorge; et al. "Screening of human and veterinary pharmaceuticals in estuarine waters: A baseline assessment for the Tejo estuary". Marine Pollution Bulletin 135 (2018): 1079-1084. http://dx.doi.org/10.1016/j.marpolbul.2018.08.036.
    Publicado • 10.1016/j.marpolbul.2018.08.036
  7. Pais, Miguel. "Effect of underwater visual survey methodology on bias and precision of fish counts: a simulation approach". PeerJ 6 (2018): e5378-e5378. https://peerj.com/articles/5378.
    10.7717/peerj.5378
  8. Pais, M.P.; Cabral, H.N.. "Fish behaviour effects on the accuracy and precision of underwater visual census surveys. A virtual ecologist approach using an individual-based model". Ecological Modelling 346 (2017): 58-69. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85007529949&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.ecolmodel.2016.12.011
  9. Pais, Miguel. "From a local observation to a European-wide phenomenon: Amphibian deformities at Serra da Estrela Natural Park, Portugal". Basic and Applied Herpetology (2016):
    10.11160/bah.15003
  10. Marisa I. Batista; Sofia Henriques; Miguel P. Pais; Henrique N. Cabral. "A framework for the assessment of MPA effectiveness based on life history of fishes". Ocean & Coastal Management 118 (2015): 75-87. http://dx.doi.org/10.1016/j.ocecoaman.2015.11.010.
    10.1016/j.ocecoaman.2015.11.010
  11. Almada, F.; Abecasis, D.; Villegas-Ríos, D.; Henriques, S.; Pais, M.P.; Batista, M.; Costa, B.H.; et al. "Ichthyofauna of the Selvagens Islands. Do small coastal areas show high species richness in the northeastern Atlantic?". Marine Biology Research 11 1 (2015): 49-61. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84911445262&partnerID=MN8TOARS.
    10.1080/17451000.2014.889306
  12. Pais, Miguel. "Conservation beyond science: Scientists as storytellers". Journal of Threatened Taxa (2014): http://dx.doi.org/10.11609/JoTT.o4103.6529-33.
    10.11609/JoTT.o4103.6529-33
  13. Pais, Miguel. "Topographic complexity and the power to detect structural and functional changes in temperate reef fish assemblages: The need for habitat-independent sample sizes". Ecological Indicators (2014):
    10.1016/j.ecolind.2014.03.018
  14. Henriques, S.; Pais, M.P.; Vasconcelos, R.P.; Murta, A.; Azevedo, M.; Costa, M.J.; Cabral, H.N.. "Structural and functional trends indicate fishing pressure on marine fish assemblages". Journal of Applied Ecology 51 3 (2014): 623-631. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84900553658&partnerID=MN8TOARS.
    10.1111/1365-2664.12235
  15. Batista, M.I.; Henriques, S.; Pais, M.P.; Cabral, H.N.. "Assessment of cumulative human pressures on a coastal area: Integrating information for MPA planning and management". Ocean and Coastal Management 102 PA (2014): 248-257. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84908314796&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.ocecoaman.2014.09.020
  16. Henriques, S.; Pais, M.P.; Batista, M.I.; Teixeira, C.M.; Costa, M.J.; Cabral, H.. "Can different biological indicators detect similar trends of marine ecosystem degradation?". Ecological Indicators 37 PART A (2014): 105-118. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84888373885&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.ecolind.2013.10.017
  17. Pais, M.P.; Henriques, S.; Murta, A.G.; Azevedo, M.; Costa, M.J.; Cabral, H.N.. "Identifying functional homogeneity in a dynamic environment: Application to soft-substrate fish assemblages off the Portuguese coast". Journal of Sea Research 89 (2014): 30-43. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84895748115&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.seares.2014.02.004
  18. Pais, M.P.; Henriques, S.; Batista, M.I.; Costa, M.J.; Cabral, H.. "Seeking functional homogeneity: A framework for definition and classification of fish assemblage types to support assessment tools on temperate reefs". Ecological Indicators 34 (2013): 231-245. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84879118403&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.ecolind.2013.05.006
  19. Henriques, S.; Pais, M.P.; Costa, M.J.; Cabral, H.N.. "Seasonal variability of rocky reef fish assemblages: Detecting functional and structural changes due to fishing effects". Journal of Sea Research 79 (2013): 50-59. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84875584453&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.seares.2013.02.004
  20. Pais, M.P.. "Ecosystems: Marine monitoring is hard and costly". Nature 495 7440 (2013): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84874996886&partnerID=MN8TOARS.
    10.1038/495174d
  21. Henriques, S.; Pais, M.P.; Batista, M.I.; Costa, M.J.; Cabral, H.N.. "Response of fish-based metrics to anthropogenic pressures in temperate rocky reefs". Ecological Indicators 25 (2013): 65-76. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84866841914&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.ecolind.2012.09.003
  22. Pais, M.P.; Henriques, S.; Costa, M.J.; Cabral, H.N.. "Improving the "chain and tape" method: A combined topography index for marine fish ecology studies". Ecological Indicators 25 (2013): 250-255. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84868330074&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.ecolind.2012.10.010
  23. Pais, M.P.; Henriques, S.; Costa, M.J.; Cabral, H.N.. "A critical approach to the use of published data for baseline characterisation of marine fish assemblages: An exercise on Portuguese coastal waters". Ocean and Coastal Management 69 (2012): 173-184. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84866879713&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.ocecoaman.2012.06.009
  24. Cardoso, I.; França, S.; Pais, M.P.; Henriques, S.; Cancela da Fonseca, L.; Cabral, H.N.. "Fish assemblages of small estuaries of the Portuguese coast: A functional approach". Estuarine, Coastal and Shelf Science 93 1 (2011): 40-46. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-79955954226&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.ecss.2011.03.016
  25. Cardoso, I.; Pais, M.P.; Henriques, S.; da Fonseca, L.C.; Cabral, H.N.. "Ecological quality assessment of small estuaries from the Portuguese coast based on fish assemblages indices". Marine Pollution Bulletin 62 5 (2011): 992-1001. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-79955633399&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.marpolbul.2011.02.037
  26. Henriques, S.; Pais, M.P.; Costa, M.J.; Cabral, H.. "Development of a fish-based multimetric index to assess the ecological quality of marine habitats: the Marine Fish Community Index". Marine Pollution Bulletin 56 11 (2008): 1913-1934. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-54549127041&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.marpolbul.2008.07.009
  27. Henriques, S.; Pais, M.P.; Costa, M.J.; Cabral, H.. "Efficacy of adapted estuarine fish-based multimetric indices as tools for evaluating ecological status of the marine environment". Marine Pollution Bulletin 56 10 (2008): 1696-1713. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-52949148554&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.marpolbul.2008.07.008
Livro
  1. Pais, Miguel. BIOgrafias. Vidas de quem estuda a vida.. Portugal. 2014.
Poster em conferência
  1. Luca Caminiti; Ana Veríssimo; Pais, Miguel Pessanha; Jorge Fontes; Rita P. Vasconcelos; Sofia Henriques. "Development and validation of an eDNA metabarcoding protocol to survey Elasmobranch diversity". Trabalho apresentado em European Elasmobranch Association 23rd Annual Conference, 2019.
  2. Pais, Miguel Pessanha; Rita P. Vasconcelos; Susanne E. Tanner; Ferenc Jordan; Marta Coll; Hilmar Hinz; M. Hidalgo; Emanuel J. Gonçalves; Sofia Henriques. "ReefNets project: Disentangling anthropogenic effects in temperate reef networks". Trabalho apresentado em International Society for Ecological Modelling Global Conference 2019, 2019.
  3. Pais, Miguel Pessanha; Ana Veríssimo; Rita P. Vasconcelos; Jorge Fontes; Sofia Henriques. "FindRayShark Project: testing non-invasive technologies to monitor sharks and rays". Trabalho apresentado em European Elasmobranch Association Annual Conference, 2018.
  4. Irina A. Duarte; Pais, Miguel Pessanha; Patrick Reis-Santos; Henrique Nogueira Cabral; Vanessa F. Fonseca. "Effects of pharmaceuticals in estuarine fish: the BIOPHARMA project". Trabalho apresentado em 11th Iberian and 8th Ibero-American Congress of Pollution and Environmental Toxicology, 2018.
  5. Ana Veríssimo; Jorge Fontes; Pais, Miguel Pessanha; Rita P. Vasconcelos; Sofia Henriques. "FindRayShark – Applying innovative technologies to the conservation of rays and sharks". Trabalho apresentado em VII Iberian Congress of Ichthyology, 2018.
  6. Irina A. Duarte; Pais, Miguel Pessanha; Patrick Reis-Santos; Henrique Nogueira Cabral; Vanessa F. Fonseca. "Biomarker and behavioural responses of an estuarine fish following short-term exposure to fluoxetine". Trabalho apresentado em SETAC Europe Annual Meeting, 2018.
  7. Sara Leston; A. Freitas; A.S. Vila Pouca; J. Rosa; J. Barbosa; F. Ramos; Patrick Reis-Santos; et al. "Environmental assessment of multi-class antibiotic residues in a temperate estuary". Trabalho apresentado em SETAC Europe Annual Meeting, 2018.
  8. Sara Leston; A. Freitas; A.S. Vila Pouca; J. Rosa; J. Barbosa; F. Ramos; Patrick Reis-Santos; et al. "Occurrence of selected pharmaceuticals in the Tejo Estuary". Trabalho apresentado em 8th International Symposium on Recent Advances in Food Analysis - RAFA 2017, 2017.
  9. Pais, Miguel Pessanha; Patrick Reis-Santos; Henrique Nogueira Cabral; Vanessa F. Fonseca. "Population effects of pharmaceuticals in estuarine fish: the BIOPHARMA project". Trabalho apresentado em International Society for Ecological Modelling Global Conference 2017, 2017.
  10. David Jacinto; Sofia Henriques; Pais, Miguel Pessanha; Henrique Nogueira Cabral. "Scientific diving at MARE - Marine and Environmental Sciences Centre (Portugal): Overview of current status and commitment to European standards for safer and collaborative scientific diving operations". Trabalho apresentado em 2nd European Conference on Scientific Diving, 2016.
  11. Pais, Miguel Pessanha; Henrique Nogueira Cabral. "FishCensus: An individual-based simulation of underwater visual census of fish populations with realistic behavior". Trabalho apresentado em International Society for Ecological Modelling Global Conference 2016, 2016.
  12. Henrique Nogueira Cabral; Susana França; Vera Sequeira; Susanne E. Tanner; Vanessa F. Fonseca; Patrick Reis-Santos; Rita P. Vasconcelos; et al. "Researchers and public perspectives on the effectiveness of marine science communication tools and subjects". Trabalho apresentado em 1st International Marine Science Communication Conference (IMSCC 2014), 2014.
  13. Sofia Henriques; Pais, Miguel Pessanha; Rita P. Vasconcelos; Alberto Murta; Manuela Azevedo; Maria José Costa; Henrique Nogueira Cabral. "Structural and functional trends indicate fishing pressure on marine fish assemblages". Trabalho apresentado em ECSA 54, 2014.
  14. Marisa I. Batista; Sofia Henriques; Pais, Miguel Pessanha; Henrique Nogueira Cabral. "Anthropogenic Pressures along the Portuguese Coast: Integrating Information for MPA Planning". Trabalho apresentado em Simpósio de Ciências Marinhas, 2014.
  15. Pais, Miguel Pessanha; Sofia Henriques; Marisa I. Batista; Maria José Costa; Henrique Nogueira Cabral. "Seasonal variation and monitoring designs in quality assessment of temperate reef fish assemblages". Trabalho apresentado em 9th International Temperate Reefs Symposium, 2011.
  16. Sofia Henriques; Pais, Miguel Pessanha; Marisa I. Batista; Maria José Costa; Henrique Nogueira Cabral. "The establishment of reference values in a multimetric approach to the assessment of temperate reef fish assemblages". Trabalho apresentado em 9th International Temperate Reefs Symposium, 2011.
  17. Pais, Miguel Pessanha; Sofia Henriques; Maria José Costa; Henrique Nogueira Cabral. "Implications of sampling designs in the assessment of marine fish assemblages for management and conservation purposes". Trabalho apresentado em International Conference of Coastal Conservation and Management ICCCM10, 2010.
  18. Sofia Henriques; Pais, Miguel Pessanha; Ana Margarida Ferreira; M. J. Faria; Maria José Costa; Henrique Nogueira Cabral. "Influence of habitat complexity in the assessment of environmental quality at the fish community level". Trabalho apresentado em International Conference of Coastal Conservation and Management ICCCM10, 2010.
  19. Pais, Miguel Pessanha; Rita Castro; Vanessa F. Fonseca; Catarina Vinagre; Henrique Nogueira Cabral. "Behaviour of the Senegalese sole, Solea senegalensis Kaup, 1858, in experimental conditions". Trabalho apresentado em VI Congresso Nacional de Etologia, 2004.
Relatório
  1. Pais, Miguel Pessanha; Frederico Almada; Inês Carneiro; Carlos Rius Errando; Pedro Duarte-Coelho; Sofia Henriques; Marisa I. Batista; et al. 2021. AquaSig 3 Final Report: Recolha de informação georreferenciada sobre a diversidade e abundância de macrofauna e flora no espaço marítimo de Cascais.
Tese / Dissertação
  1. Pais, Miguel Pessanha. "Dealing with Uncertainty and Heterogeneity in the Assessment of Structural and Functional Integrity in Marine Fish Assemblages". Doutoramento, Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, 2013. http://hdl.handle.net/10451/9616.
  2. Pais, Miguel Pessanha. "Marine fish assemblage typologies for the Portuguese coast in the context of the European Marine Strategy Directives". Mestrado, Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, 2008. http://hdl.handle.net/10451/1396.

Outros

Outra produção
  1. Model - "AnimDens NetLogo". CoMSES Computational Model Library. This is a model that simulates surveyors counting aninmals while deploying belt-transect, stationary-point-count and roving (random path) techniques. The model demonstrates how non-instantaneous sampling techniques produce bias by overestimating the number of counted animals, when they move relative to the surveyor.. 2020. Pais, Miguel Pessanha; Christine Ward-Paige. https://www.comses.net/codebases/5445/.
  2. Model - "Estuaryscape". Modeling Commons Model Library. 2018. Pais, Miguel Pessanha. http://modelingcommons.org/browse/one_model/4812.
  3. Model - "FishCensus”. CoMSES Computational Model Library.. FishCensus is an agent-based model that simulates underwater visual census of fish populations, a method used worldwide to survey shallow marine and freshwater habitats that involves a diver counting fish species to estimate their density. It can help estimate sampling bias, apply correction factors to field surveys and decide on the best method to survey a particular species.. 2017. Pais, Miguel Pessanha. https://www.comses.net/codebases/5305/.
Atividades

Apresentação oral de trabalho

Título da apresentação Nome do evento
Anfitrião (Local do evento)
2019/10/01 Pharmaceuticals on estuarine fish populations: modelling potential effects from the organism to the ecosystem International Society for Ecological Modelling Global Conference 2019
International Society for Ecological Modelling (ISEM) (Salzburg, Áustria)
2019/07/15 Testing non-invasive technologies to monitor sharks and rays – a combined approach using eDNA metabarcoding and BRUV FSBI Symposium 2019
Fisheries Society of the British Isles (FSBI) (Hull, Reino Unido)
2018/09/20 FishCensus: A simulation to improve underwater visual surveys of fish populations. Ocean Business 2018
(Lisbon, Portugal)
2018/07/11 Biomarker responses of an estuarine fish following acute exposure to an antidepressant 11th Iberian and 8th Ibero-American Congress of Pollution and Environmental Toxicology
(Madrid, Espanha)
2018/06/12 Visual surveys: spatial modelling of fish behaviour helps understand our mistakes. VII Iberian Congress of Ichthyology
Iberian Society of Ichthyology (Faro, Portugal)
2018/05/22 Analytical approach to assess environmental contamination by UHPLC-TOF-MS 8th International Symposium on Hormone and Veterinary Drug Residue Analysis
(Ghent, Bélgica)
2017/10/02 A model to simulate underwater visual surveys of fish populations Computational Modelling for Socioecological Science (CoMSES) Virtual Conference 2017
Computational Modelling for Socioecological Science (CoMSES) (Online peer-reviewed international conference)
2017/09/17 The quest for the perfect method: Optimizing fish visual census techniques with an individual-based simulation model International Society for Ecological Modelling Global Conference 2017
International Society for Ecological Modelling (ISEM) (Jeju, Coreia do Sul)
2017/03/22 FishCensus: A simulation model to quantify precision, bias and support sampling design in underwater visual census of fish European Conference on Scientific Diving
European Scientific Diving Panel (Funchal, Portugal)
2016/05/08 Influence of fish behavior on the accuracy and precision of underwater visual census surveys. A virtual ecologist approach using an individual-based model International Society for Ecological Modelling Global Conference 2016
International Society for Ecological Modelling (ISEM) (Towson, MD, Estados Unidos)
2014/05/12 Functional homogeneity in marine fish assemblages: letting the data speak for themselves ECSA 54
Centro de Ciências do Mar e do Ambiente (Sesimbra, Portugal)
2013/07/17 Influence of habitat complexity on the statistical power to detect structural and functional changes in reef fish assemblages along the Portuguese coast Simpósio de Ciências Marinhas
Centro de Oceanografia (Lisboa, Portugal)
2011/06/30 Anthropogenic pressures along the Portuguese coast: integrating information for MPA planning 9th International Temperate Reefs Symposium
Marine Biological Association of the United Kingdom (Plymouth, Reino Unido)
2011/06/30 Evaluating the integrity of fish communities in temperate reefs 9th International Temperate Reefs Symposium
Marine Biological Association of the United Kingdom (Plymouth, Reino Unido)
2008/02/25 Marine fish assemblage typologies for the Portuguese continental shelf in the context of the Marine Strategy Framework Directive. Bioeconomia, III Congresso da Ordem dos Biólogos
Universidade de Lisboa (Lisboa, Portugal)
2008/02/25 “Marine Fish Community Index”: Challenges of assessing ecological status in the context of the Marine Strategy Framework Directive Bioeconomia, III Congresso da Ordem dos Biólogos
Universidade de Lisboa (Lisboa, Portugal)
2007/03/30 Metrics evaluation and proposal of reference limits for assessing the ecological status of estuarine fish communities. Technical workshop - Intercalibration for fish community metrics in estuarine systems in the context of the Water Framework Directive
INAG - Instituto da água (Lisboa, Portugal)
2006/12/15 Anthropogenic impacts on fish fauna and metrics for their assessment. Technical workshop: Assessment of ecological and/or chemical impacts from anthropogenic pressures in coastal and transitional waters in the context of the Water Framework Directive
INAG - Instituto da Água (Lisboa, Portugal)

Orientação

Título / Tema
Papel desempenhado
Curso (Tipo)
Instituição / Organização
2021/07 - Atual Leveraging Artificial Intelligence for Image Classification in Marine Ecology Studies
Coorientador
Ciências do Mar (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2021/01/01 - Atual Understanding how the occurrence of marine apex predators are impacted by anthropogenic pressures in a remote, insular habitat
Coorientador
Ciências do Mar (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2020/10 - Atual Integrating video and acoustic recorders to monitor the Professor Luiz Saldanha Marine Park (PMPLS)
Coorientador
Instituto Superior de Psicologia Aplicada, Portugal
2019/12/01 - Atual Non-indigenous marine species proliferation: underlying impacts on ecological processes and potential socioeconomic consequences
Coorientador
Ciências do Mar (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2019 - Atual Influência do micro-habitat nas características das comunidades bentónicas em recifes rochosos
Coorientador
Ecologia Marinha (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2019 - 2021/02/04 Preliminary assessment of elasmobranch occurrence, and mapping of potential overlap with human activities, using non-invasive methods: the case study of the berlengas natural reserve
Coorientador
Biologia marinha e conservação (Mestrado)
Instituto Superior de Psicologia Aplicada, Portugal

Organização de evento

Nome do evento
Tipo de evento (Tipo de participação)
Instituição / Organização
2019 - Atual Outreach: awareness-raising activities for the FindRayShark project in schools for students and teachers, including presentations about shark conservation and self-produced VR video: Over 15 schools reached, more than 1000 students and teachers from kindergarten to high school. (2019)
Outro (Coorganizador)
Centro de Ciências do Mar e do Ambiente, Portugal
2019 - 2020 Outreach: Scientific consulting and content production for the ocean section of the permanent exhibition "Natural Variations" in the National Museu of Natural History (2020 - 2030)
Exposição (Membro da Comissão Científica)
Universidade de Lisboa Museu Nacional de História Natural, Portugal
2019/07/12 - 2019/07/12 Workshop "Virtual Dive" with 70 teachers split into 2 sessions, using our VR video footage and goggles. COASTWATCH Seminar 2019, Peniche. (2019/07/12 - 2019/07/12)
Oficina (workshop) (Coorganizador)
Instituto Politécnico de Leiria Escola Superior de Turismo e Tecnologia do Mar de Peniche, Portugal
2014/06 - 2014/06 Organisation of the “MARE Day” in Sesimbra, Portugal with the participation of local students and SCUBA divers. Included research demonstrations, a boat trip and an underwater photography contest. (2014/06 - 2014/06)
Exposição (Membro da Comissão Organizadora)
Centro de Ciências do Mar e do Ambiente, Portugal
2014 - 2014 ECSA 54 Conference - Coastal systems under change: tuning assessments and management tools in Sesimbra, Portugal (2014 - 2014)
Conferência (Membro da Comissão Organizadora)
Centro de Ciências do Mar e do Ambiente, Portugal
2013 - 2014 Organised and ran a successful online crowdfunding campaign to fund the publication of science storytelling book by 18 Portuguese biologists, which I also co-authored and co-edited (https://ppl.com.pt/prj/biografias). 500 books were printed and the edition sold out. The book is now available for free at Google Books. (2013 - 2014)
Outro (Coorganizador)
Escola de Mar, Portugal

Participação em evento

Descrição da atividade
Tipo de evento
Nome do evento
Instituição / Organização
2019/10/01 - 2019/10/05 Member of the Poster Award evaluation panel
Conferência
ISEM Global Conference 2019, Salzburg
International Society for Ecological Modelling (ISEM), Estados Unidos
2019/10/01 - 2019/10/05 Session chair for three sessions of the Marine Ecology theme
Conferência
ISEM Global Conference 2019, Salzburg.
International Society for Ecological Modelling (ISEM), Estados Unidos

Júri de grau académico

Tema
Tipo de participação
Nome do candidato (Tipo de grau)
Instituição / Organização
2019/10/01 Effects of pharmaceuticals on the reproduction of aquatic organisms: a meta-analysis
Arguente principal
David Gil Valente Lopes (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2018/12/17 Environmental factors influencing the settlement of Diplodus spp. juveniles in a temperate marine rocky shore
Arguente principal
Pedro Miguel Janeiro Duarte Coelho (Mestrado)
Universidade de Évora, Portugal
2016/11/18 Caraterização do mergulho recreativo no Parque Marinho Professor Luiz Saldanha: desafios para a gestão da área
Arguente principal
Luísa Lopes Pereira Jorge Paulos (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal

Arbitragem científica em revista

Nome da revista (ISSN) Editora
2020 - Atual Mediterranean Marine Science (1791-6763) National Documentation Centre (EKT)
2019 - Atual Marine Biology Research (1745-1019) Informa UK (Taylor & Francis)
2019 - Atual Marine Ecology (1439-0485) Wiley (Blackwell Publishing)
2019 - Atual Ecological Modelling (0304-3800) Elsevier
2018 - Atual Ecological Modelling (0304-3800) Elsevier
2018 - Atual Fisheries Research (0165-7836) Elsevier
2018 - Atual PeerJ (2167-8359) PeerJ
2018 - Atual The Science of The Total Environment (0048-9697) Elsevier
2018 - Atual Scientific Reports (2045-2322) Nature Publishing Group
2016 - Atual Marine Pollution Bulletin (0025-326X) Elsevier
2014 - Atual Ecological Indicators (1470-160X) Elsevier
2013 - Atual Marine Environmental Research (0141-1136) Elsevier
2012 - Atual Ocean & Coastal Management (0964-5691) Elsevier

Consultoria / Parecer

Descrição da atividade Instituição / Organização
2014 - 2015 Participation as a consultant in the workshops that led to support elaboration of monitoring plans and plans of measures for the Marine Strategy Framework Directive (MSFD) in collaboration with the coordinating institutions for Portugal. Instituto Português do Mar e da Atmosfera, Portugal

Direção-Geral de Recursos Naturais, Segurança e Serviços Marítimos (DGRM), Portugal
2008 - 2008 Collaboration as a scientific adviser in the project “Aquário Virtual para o Centro de Monitorização e Interpretação Ambiental da Costa da Caparica” (Interactive Virtual Aquarium Exhibition) YDreams, Portugal

Câmara Municipal de Almada, Portugal

Curso / Disciplina lecionado

Disciplina Curso (Tipo) Instituição / Organização
2020/03/01 - Atual Lecturer in the MSc discipline "Advanced Studies in Marine Ecology" Ecologia Marinha (Mestrado) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2019/05/01 - Atual Lecturer in the MSc discipline "Marine Biodiversity" Marine Ecology Masters (Mestrado) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2018 - Atual 3-hour invited lecture on Agent-based modelling, as part of the "Ecological Modelling" MSc discipline (repeats yearly) Ecologia Marinha (Mestrado) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2017 - 2017 2-hour workshop “Population census: Can virtual fish help?” - Using FishCensus model to understand and calculate sampling bias in fish population census. (Outros) Universidade do Porto Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar, Portugal
2017 - 2017 Workshop on Demersal and pelagic fish identification and underwater sampling methods. - Including a 1 hour theory session and 1 dive. (Outros) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal

Entrevista / Programa (rádio / tv)

Programa Tema
2019 - Atual Our research was featured in the documentary "Mar: A Última Fronteira" ("Ocean: The Last Frontier") by Nuno Sá in national TV channel RTP 1, including footage of shark diving and water collection for eDNA analysis. Ocean research in Portugal, particularly shark research and eDNA.

Membro de associação

Nome da associação Tipo de participação
2017 - Atual CoMSES Network (COmputational Modeling for SocioEcological Science) Full Member
2016 - Atual International Society for Ecological Modelling (ISEM) Member
2012 - Atual Associação Portuguesa de Mergulho Científico (Portuguese Scientific Diving Association) - APorMC Board member

Membro de comissão

Descrição da atividade
Tipo de participação
Instituição / Organização
2015 - Atual Marine Strategy Framework Directive (MSFD) National Monitoring Committee
Membro
Centro de Ciências do Mar e do Ambiente, Portugal

Outro júri / avaliação

Descrição da atividade Instituição / Organização
2019 - Atual Model reviewer for the CoMSES Net Computational Model Library, checking models for documentation, ability to run as intended and cleanness of code.
Distinções

Prémio

2017 ISEM Biennial Best Young Researcher Paper Award - 3rd Prize
International Society for Ecological Modelling (ISEM), Estados Unidos
2017 ISEM Global Conference 2017 Best Poster Award - 1st Prize
International Society for Ecological Modelling (ISEM), Estados Unidos
2016 ISEM Global Conference 2016 Best Poster Award - 2nd Prize
International Society for Ecological Modelling (ISEM), Estados Unidos
2005 Academic Merit Grant
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal