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Salomé Fernandes Pinheiro de Almeida is a biologist with Ph'D (doutoramento) in Biology. She's Assistant Professor at the Biology Department in the University of Aveiro. She is the Director of the BSc (licenciatura) in Biology and Geology and in past years was the Director of the BSc in Biology. She was Member of the Executive Committee of the Department of Biology for 4 years. She has also been involved in the Quality Assurance System for doctoral programs (Ph’D) in the Biology Department. Over the past five years she has participated in 5 national projects (FCT and Portuguese Environmental Agency) and established partnerships through services provision with national and international private companies. Currently, she is PI of the project CRESCERIO (Growing and taking care of city rivers) at GeoBioTec-UA. She recently participated in two EU COST Actions (CA15219 - DNAaqua-Net: Developing new genetic tools for bioassessment of aquatic ecosystems in Europe; CA15113 - SMIRES: Science and Management of Intermittent Rivers and Ephemeral Streams). She has been actively involved in the implementation of the WFD in Portugal and at the European level, having coordinated the intercalibration of phytobenthos biological methods for the Mediterranean Member States, coordinated the Intercalibration of Phytobenthos method for Large Portuguese Rivers, and updated the national Manual for sampling, analysis and classification of Phytobenthos. She has supervised 3 Ph’D, 18 MSc, and more than 30 BSc students, all concluded. Published more than 70 scientific papers in indexed journals (27 between 2018 and 2023). Wrote 3 book chapters. Scopus source: h index=26; 1900 citations. She is Review Editor for Frontiers in Environmental Sciences, section Freshwater and belongs to the Editorial Board of Taxonomy (an Open access journal MDPI) and is Associate Editor for Limnetica.
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Identification

Personal identification

Full name
Salomé Fernandes Pinheiro de Almeida

Citation names

  • Almeida SFP
  • Almeida, S.
  • de Almeida, S.
  • de Almeida, SFP

Author identifiers

Ciência ID
E41F-DAD1-E8ED
ORCID iD
0000-0001-7240-7967
Scopus Author Id
191016-013261

Knowledge fields

  • Natural sciences - Biological Sciences - Freshwater Biology
  • Natural sciences - Biological Sciences - Ecology
  • Natural sciences - Biological Sciences - Biodiversity Conservation
  • Natural sciences - Biological Sciences - Other Biological Topics
  • Natural sciences - Biological Sciences - Other Biological Topics
  • Natural sciences - Biological Sciences - Other Biological Topics

Languages

Language Speaking Reading Writing Listening Peer-review
English Intermediate (B1) Intermediate (B1) Intermediate (B1) Intermediate (B1)
French Beginner (A1) Intermediate (B1) Beginner (A1) Beginner (A1)
Portuguese Intermediate (B1) Intermediate (B1) Intermediate (B1) Intermediate (B1)
Education
Degree Classification
1998/11/24
Concluded
 Biology (Doutoramento)
Universidade de Aveiro, Portugal
"Utilização das diatomáceas na avaliação da qualidade das águas doces.(Use of diatoms for freshwater quality evaluation), 524 pp. (In Portuguese)" (THESIS/DISSERTATION)
 Aprovada
1998/11/24
Concluded
 Biologia (Doutoramento)
Major in Não Aplicável
Universidade de Aveiro, Portugal
1998
Concluded
 Biologia (Doutoramento)
Major in Sem especialidade
Universidade de Aveiro, Portugal
"Utilização das Diatomáceas na Avaliação da Qualidade das Águas Doces" (THESIS/DISSERTATION)
1992/06/30
Concluded
 Biologia (Licenciatura)
Major in Não Aplicável
Universidade de Aveiro, Portugal
1991
Concluded
 Biology (Licenciatura)
Universidade de Aveiro, Portugal
"Determinação da qualidade biológica da água da Lagoa das Braças (trabalho de final de curso)" (THESIS/DISSERTATION)
 16 valores
Affiliation

Teaching in Higher Education

Category
Host institution 		Employer
1999/07 - Current Assistant Professor (University Teacher) Universidade de Aveiro, Portugal
Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
1994/09 - 1999/06 Invited Assistant (University Teacher) Universidade de Aveiro, Portugal
Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
Projects

Grant

Designation Funders
1995/01/01 - 1995/12/31 DIATOMÁCEAS COMO BIOINDICADORES; SUA UTILIZAÇÃO NA AVALIAÇÃO DA QUALIDADE DAS ÁGUAS CORRENTES
PRAXIS XXI/BD/2950/94
Universidade de Aveiro, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded

Contract

Designation Funders
2018/05/01 - 2021 AQUAFIRE – Integrated assessment of wildfires impacts to aquatic ecosystems and human health (Avaliação integrada do impacto dos incêndios nos ecossistemas aquáticos e saúde humana)
C492082189-00085989
PTDC/CTA-AMB/28936/2017
Researcher
Universidade de Aveiro Departamento de Ambiente e Ordenamento, Portugal

Universidade de Aveiro, Portugal

Universidade do Minho, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Ongoing
2018 - 2020 RIVEAL - RIver and riparian forest Values and Ecosystem services in uncertain freshwater futures and Altered Landscapes (Valores e serviços dos ecossistemas de florestas ripárias em paisagens fluviais alteradas e futuros climáticos incertos)
C493374162-00090218; 02/SAICT/2017
PTDC/CTA-AMB/29790/2017
Researcher
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal

Universidade de Aveiro, Portugal

Universidade de Coimbra, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto de Ciências Sociais, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Ongoing
2019/01/01 - 2019/12/31 GeoBioSciences, GeoTechnologies and GeoEngineering
UID/GEO/04035/2019
Universidade de Aveiro, Portugal

Universidade da Beira Interior, Portugal

Universidade Nova de Lisboa Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2014 - 2016 Chlamy4future: Melhoramento da produção de biocombustível via regulação do metabolismo primário pela simulação de stress abiótico. Serão as quatro novas quinases dependentes do cAMP potenciais alvos para engenharia genética em estirpes de Chlamydomonas?
EXPL/AAG-TEC/2056/2013
Researcher
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2014/03/03 - 2015/06/02 Chlamy4Future: Improving biofuel production by the regulation of central metabolism through abiotic stress mimicking. Are four novel cAMP-dependant kinases suitable as targets for Chlamydomonas strain engineering?
EXPL/AAG-TEC/2056/2013
Universidade de Aveiro, Portugal

Universidade de Aveiro Centro de Estudos do Ambiente e do Mar, Portugal

Universidad Nacional de Córdoba Departamento de Físicoquímica, Argentina
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2010/05/01 - 2014/03/31 AQUAWEB - Assessment of rivers biological QUAlity through a WEB platform
PTDC/AAC-AMB/105297/2008
Instituto do Mar, Portugal

Universidad CES, Colombia

Universidade de Aveiro, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2011/01/01 - 2013/12/31 Strategic Project - UI 4035 - 2011-2012
PEst-C/CTE/UI4035/2011
Universidad CES, Colombia

Universidade de Aveiro, Portugal

Instituto Politécnico de Beja, Portugal

Instituto Politécnico de Coimbra, Portugal

Instituto Politécnico de Tomar, Portugal

Instituto Politécnico do Porto Instituto Superior de Engenharia do Porto, Portugal

Universidade de Évora, Portugal

Universidade do Minho Laboratório de Paisagens Património e Território, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2010/06/01 - 2013/12/31 FRAMEFFECTIVE - Can bioassays be cost-effectively integrated in a predictive model approach for rivers in compliance with the Water Framework Directive?
PTDC/AAC-AMB/105411/2008
Instituto do Mar, Portugal

Universidade de Aveiro GeoBioTec Geobiociências Geotecnologias e Geo-engenharias, Portugal

Universidade de Aveiro, Portugal

Universidade de Aveiro Centro de Estudos do Ambiente e do Mar, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2010 - 2013 FRAMEFFECTIVE – Poderão bioensaios ser integrados eficientemente numa abordagem com modelos preditivos para rios no âmbito da Directiva Quadro da Água?
PTDC/AAC-AMB/105411/2008
Researcher
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2010 - 2013 AQUAWEB – Avaliação da Qualidade da Água através de uma plataforma Web
PTDC/AAC-AMB/105297/2008
Researcher
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded

Other

Designation Funders
2019 - 2020 Aquisição de serviços para melhorar e complementar os critérios de classificação do estado das massas de água superficiais interiores
7/2009
Researcher
Agência Portuguesa do Ambiente, Portugal
Ongoing
2017 - 2018 Monitorização do estado das massas de água, rios e albufeiras
000004-DFIN.DALP/2017
Researcher
Agência Portuguesa do Ambiente, Portugal
Concluded
2016 - 2017 studo de amostras de diatomáceas perifíticas no âmbito do estudo de monitorização ambiental em Chipre
I.A.CO
Principal investigator
IACO, Ltd Environmental & Water consultants, Cyprus
Concluded
2015 - 2015 Study of diatom samples from mining areas in Greece
ENVECO
Principal investigator
ENVECO SA., Greece
Concluded
2008 - 2011 2nd phase of the Intercalibration Exercise in Rivers. Phytobenthos
2008/017/INAG
Researcher
Instituto Nacional da Água (INAG), Portugal
Concluded
2003 - 2006 Qualidade Ecológica nas Bacias Hidrográficas dos Rios Mondego, Vouga e Lis
2000/60/CE
Researcher
Instituto Nacional da Água (INAG), Portugal
Concluded
Outputs

Publications

Book chapter
  1. Almeida SFP; Feio, MJ. Corresponding author: Almeida SFP. "Present and future perspectives for bioassessment of running water using diatoms". In Diatom Photosynthesis – From High Value Molecules to Primary Production, edited by Goessling J; Lavaud J; Serôdio, João. USA: Wiley-Scrivener, 2024.
    In press
  2. Almeida, SFP (E41F-DAD1-E8ED); Luís, A; Elias CL; Novais MH; Santos LMA; Vasconcelos V; Craveiro SC; Calado AJ. "Capitulo 4. Algas". In Rios de Portugal: comunidades, processos e alterações, edited by Feio, MJ; Ferreira, V, 75-96. Portugal: Imprensa da Universidade de Coimbra, 2019.
    Published • 10.14195/978-989-26-1624-7
  3. Feio, MJ; Almeida SFP; Aguiar FC; Oliveira JM; Hughes SJ. "Capítulo 14. Monitorização ecológica dos rios portugueses". In Rios de Portugal: comunidades, processos e alterações, edited by Feio, MJ; Ferreira, V, 335-358. Portugal: Imprensa da Universidade de Coimbra, 2019.
    Published • https://doi.org/10.14195/978-989-26-1624-7
  4. Delgado C; Feio, MJ; Gonçalves V.; Raposeiro P; Almeida SFP. "Capítulo 17. Fontes Termais – Norte de Portugal e Açores". In Rios de Portugal: comunidades, processos e alterações, edited by Feio, MJ; Ferreira, V, 423-441. Portugal: Imprensa da Universidade de Coimbra, 2019.
    Published • https://doi.org/10.14195/978-989-26-1624-7
Conference abstract
  1. Luis AT; Teixeira, Manuela; Durães, N; Pinto, Raquel; Almeida SFP; Ferreira da Silva, Eduardo; Figueira, Etelvina. "Extreme acid environments: biogeochemical effects on algal biofilms". Paper presented in 25th International Diatom Symposium, Berlim, 2018.
    Published
  2. Luis AT; Durães, N; Almeida SFP; Ferreira da Silva, Eduardo. "Integrating geochemical (surface waters, stream sediments) and biological (diatoms) approaches to assess AMD environmental impact in a pyritic mining area: Aljustrel (Alentejo, Portugal).". Paper presented in XII Congreso Nacional y XI Ibérico de Geoquímica, Linares, 2017.
    Published
  3. Rivera MJ; Grande JA; De La Torre ML; Valente T; Almeida SFP; Delgado C; Santisteban M; Barrio-Parra F; Izquierdo M. "Papel de las diatomeas como indicadores del grado de afección de embalses receptores de AMD: Influencia del pH en el modo de ocurrencia.". Paper presented in XII Congreso Nacional y XI Ibérico de Geoquímica, Linares, 2017.
    Published
  4. Valente Teresa; Rivera MJ; Almeida SFP; Delgado, C.; Grande JA; De La Torre ML; Santisteban M. "Distribution and role of benthic diatoms as indicators of acid mine drainage in affected water dams.". Paper presented in E2KW2014, Energy and Environment Knowledge Week, Toledo, 2014.
    Published
  5. Santisteban M; Valente Teresa; Grande JA; De La Torre ML; Almeida SFP; Pérezostalé E; Garciaperez M. "Proposal of a model of the horizontal moving of pollutants in a water reservoir receiving acid mine drainage in the Iberian Pyrite Belt (SW Spain).". Paper presented in E2KW2014, Energy and Environment Knowledge Week, Toledo, 2014.
    Published
  6. Quintela, Ana; Terroso D; Costa, C.; Almeida SFP; Sá H.; Nunes JC; Rocha, Fernando. "Composição mineralógica e diatomológica dos sedimentos argilosos existentes no tanque das Caldeiras da Ribeira Grande: evidências de maturação in situ.". Paper presented in III CONGRESO IBEROAMERICANO DE PELOIDES, Açores, 2013.
    Published
  7. Almeida SFP; Mendes T.; Serra, S.R.Q.; Feio, M.J.. "AQUAWEB – un outil en ligne pour des études écologiques de rivières Portugaises à partir des diatomées et des macroinvertébrés.". Paper presented in 7th Central European diatom Meeting (CE-Diatom) and the 32nd Conference of the French Speaking diatomists Association (ADLaF), Thonon-les-Bains, 2013.
    Published
  8. Almeida SFP; Delgado C; Novais, M.Helena; Blanco, Saúl. "Morphological diversity of Fragilaria s. str. in central Portugal.". Paper presented in no 7th Central European diatom Meeting (CE-Diatom) and the 32nd Conference of the French Speaking diatomists Association (ADLaF), Thonon-les-Bains, 2013.
    Published
  9. Quintela, Ana; Almeida SFP; Terroso, Denise; Ferreira da Silva, E. A.; Rocha F.; Forjaz, Victor. "Microalgas colonizadoras de lamas vulcânicas açorianas durante a maturação.". Paper presented in Encontro Internacional de Termalismo e Turismo Termal/III Fórum Ibérico de Águas Engarrafadas e Termalismo, Furnas - Ilha São Miguel, Açores, 2009.
    Published
  10. Rocha F.; Quintela A.; Terroso, Denise; Almeida SFP; Ferreira da Silva EA; Forjaz, Victor. "Caracterização das lamas vulcânicas açorianas.". Paper presented in Encontro Internacional de Termalismo e Turismo Termal/III Fórum Ibérico de Águas Engarrafadas e Termalismo, Furnas - Ilha de são Miguel, Açores, 2009.
    Published
  11. Luís, Ana T.; Ferreira da Silva EA; Almeida SFP. "Efeitos da drenagem ácida mineira nas comunidades de diatomáceas perifíticas (Aljustrel, Portugal).". Paper presented in VI Congresso Ibérico de Geoquímica / XV Semana de Geoquímica, Vila Real Trás-os-Montes, 2007.
    Published
  12. Teixeira, P.; Almeida SFP; Ferreira da Silva EA; Patinha, Carla. "Impacto da Drenagem Ácida Mineira na Diversidade das Comunidades de Diatomáceas nas Minas do Lousal.". Paper presented in VI Congresso Ibérico de Geoquímica / XV Semana de Geoquímica,, Vila Real Trás-os-Montes, 2007.
    Published
  13. Serôdio J; Barroso F.; Almeida SFP. "Assessing species diversity of estuarine microphytobenthos: short-term variability and limitations of the ‘lens tissue’ method.". Paper presented in 38th EMBS - European Marine Biology Symposium, Aveiro, 2003.
    Published
  14. Castro C.; Almeida SFP. "Influence de la Ville de Viseu sur la qualité de l'eau de la rivière Pavia (Centre-Nord du Portugal).". Paper presented in 21ème Colloque de l'ADLaF, Nantes, 2003.
    Published
Conference paper
  1. Almeida SFP; Pereira MJ; Gil MC; Rino JA. "Freshwater algae in Portugal and their use for environmental monitoring". Paper presented in 3rd European Workshop – Use of Algae for Monitoring Rivers, Douai, 1997.
    Published
Journal article
  1. Valentim, Helena I. L.; Feio, Maria João; Almeida, Salomé F. P.. "Fluvial protected areas as a strategy to preserve riverine ecosystems—a review". Biodiversity and Conservation 33 2 (2024): 439-462. http://dx.doi.org/10.1007/s10531-023-02774-w.
    Open access • Published • 10.1007/s10531-023-02774-w
  2. Diana Matos; Salomé F. P. Almeida; Paula A. A. P. Marques; Sofia Pinto; Etelvina Figueira. "Effects of Graphene Oxide Nanosheets in Freshwater Biofilms". Molecules (2023): https://doi.org/10.3390/molecules28124577.
    10.3390/molecules28124577
  3. Raquel Calapez, Ana; Serra, Sónia R.Q.; Mortágua, Andreia; Almeida, Salomé F.P.; João Feio, Maria. "Unveiling relationships between ecosystem services and aquatic communities in urban streams". (2023): http://hdl.handle.net/10773/38064.
    10.1016/j.ecolind.2023.110433
  4. LORENA GONZÁLEZ-PAZ; SALOMÉ F.P. ALMEIDA; SAÚL BLANCO; CRISTINA DELGADO. "A new species of an unexplored diatom genus: Gomphosphenia minima sp. nov. (Cymbellales, Rhoicospheniaceae)". Phytotaxa (2022): https://doi.org/10.11646/phytotaxa.554.2.3.
    10.11646/phytotaxa.554.2.3
  5. Maria João Feio; Luiz Ubiratan Hepp; Ana Isabel Mantas; Sónia R. Q. Serra; Ana Raquel Calapez; Salomé F. P. Almeida; Manuela C. Sales; Mário Montenegro; Francisca Moreira. "Effect of environmental education on the knowledge of aquatic ecosystems and reconnection with nature in early childhood". PLOS ONE (2022): https://doi.org/10.1371/journal.pone.0266776.
    10.1371/journal.pone.0266776
  6. Fernández-Moreno, David; Sánchez-Castillo, Pedro M.; Delgado, Cristina; Almeida, Salomé F. P.. "Diatom Species that Characterize Saline Ponds (Southern Spain) with the Description of a New Navicula Species". Wetlands 42 1 (2022): http://dx.doi.org/10.1007/s13157-021-01529-z.
    10.1007/s13157-021-01529-z
  7. Rivaes, Rui Pedro; Feio, Maria João; Almeida, Salomé F.P.; Calapez, Ana R.; Sales, Manuela; Gebler, Daniel; Lozanovska, Ivana; Aguiar, Francisca C.. "River ecosystem endangerment from climate change-driven regulated flow regimes". Science of The Total Environment (2021): 151857. http://dx.doi.org/10.1016/j.scitotenv.2021.151857.
    10.1016/j.scitotenv.2021.151857
  8. Rivaes, Rui Pedro; Feio, Maria João; Almeida, Salomé F.P.; Vieira, Cristiana; Calapez, Ana R.; Mortágua, Andreia; Gebler, Daniel; Lozanovska, Ivana; Aguiar, Francisca C.. "Multi-biologic group analysis for an ecosystem response to longitudinal river regulation gradients". Science of The Total Environment 767 (2021): 144327. http://dx.doi.org/10.1016/j.scitotenv.2020.144327.
    10.1016/j.scitotenv.2020.144327
  9. Valentin Vasselon; Éva Ács; Salomé Almeida; Karl Andree; Laure Apothéloz-Perret-Gentil; Bonnie Bailet; Ana Baricevic; et al. "The Fellowship of the Ring Test: DNAqua-Net WG2 initiative to compare diatom metabarcoding protocols used in routine freshwater biomonitoring for standardisation". ARPHA Conference Abstracts (2021): https://doi.org/10.3897/aca.4.e65142.
    10.3897/aca.4.e65142
  10. Marco Teixeira; Salomé Almeida; Maria Feio; Andreia Mortágua; Manuela Sales. "Effects of anthropogenic pressures on diatom communities using morphological and molecular approaches". ARPHA Conference Abstracts (2021): https://doi.org/10.3897/aca.4.e64998.
    10.3897/aca.4.e64998
  11. Andreia Mortágua; Marco Teixeira; Manuela Sales; Maria Feio; Salomé Almeida. "Validation of river typologies using molecular information from diatoms". ARPHA Conference Abstracts (2021): https://doi.org/10.3897/aca.4.e64726.
    10.3897/aca.4.e64726
  12. Maria João Feio; Robert M. Hughes; Marcos Callisto; Susan J. Nichols; Oghenekaro N. Odume; Bernardo R. Quintella; Mathias Kuemmerlen; et al. "The Biological Assessment and Rehabilitation of the World’s Rivers: An Overview". Water 13 3 (2021): 371-371. https://doi.org/10.3390/w13030371.
    10.3390/w13030371
  13. LORENA GONZÁLEZ-PAZ; SALOMÉ F.P. ALMEIDA; SAÚL BLANCO; CRISTINA DELGADO. "

    Gomphonema alavariense sp. nov. (Cymbellales, Gomphonemataceae) from an urban pond

    ". Phytotaxa (2020): https://doi.org/10.11646/phytotaxa.471.1.2.
    10.11646/phytotaxa.471.1.2
  14. Cristina Delgado; Vitor Gonçalves; Saúl Blanco; Salomé F.P. Almeida. "A new diatom (Bacillariophyceae) species from a thermal spring in Azores archipelago (São Miguel island, Atlantic Ocean)". Botanical Sciences (2020): https://doi.org/10.17129/botsci.2680.
    10.17129/botsci.2680
  15. Feio, Maria João; Serra, Sónia R.Q.; Mortágua, Andreia; Bouchez, Agnès; Rimet, Frédéric; Vasselon, Valentin; Almeida, Salomé F.P.. "A taxonomy-free approach based on machine learning to assess the quality of rivers with diatoms". Science of The Total Environment 722 (2020): 137900. http://dx.doi.org/10.1016/j.scitotenv.2020.137900.
    10.1016/j.scitotenv.2020.137900
  16. Calapez, Ana R.; Elias, Carmen L.; Alves, Artur; Almeida, Salomé F.P.; Brito, António G.; Feio, Maria João. "Shifts in biofilms’ composition induced by flow stagnation, sewage contamination and grazing". Ecological Indicators 111 (2020): 106006. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecolind.2019.106006.
    10.1016/j.ecolind.2019.106006
  17. Delgado C; Feio, MJ; Pardo I; Almeida, Salomé. "Benthic diatom communities from springs’ thermal gradients: insights of water temperature effects". Plant Ecology & Diversity. (2020):
    Accepted
  18. Feio, MJ; Filipe AF; Aina Garcia-Raventós A; Ardura A; Calapez AR; Pujante AM; Mortágua A; et al. "Advances in the use of molecular tools in ecological and biodiversity assessment of aquatic ecosystems". Limnetica 39 1 (2020): 419-440. DOI: 10.23818/limn.39.27.
    Published
  19. Pinto R.; Mortágua A; Almeida, Salomé; Serra SRQ. "Diatom plasticity at regional and global spatial scales". Limnetica 39 1 (2020): 387-403.
    Published
  20. González-Paz, Lorena; de Almeida, Salomé F.P.; Pardo, Isabel; Delgado, Cristina. "Periphyton colonization and changes in the diatom assemblages of an artificial urban pond". Fundamental and Applied Limnology / Archiv für Hydrobiologie (2020): http://dx.doi.org/10.1127/fal/2020/1282.
    Published • 10.1127/fal/2020/1282
  21. Delgado C; Feio MJ; Pardo I; Almeida SFP; Cristina Delgado; Maria J. Feio; Isabel Pardo; Salomé F.P. Almeida. "Effects of water temperature over benthic diatom communities: insights from thermal springs.". Plant Ecology & Diversity (2020): 1-13. https://doi.org/10.1080/17550874.2020.1762133.
    Accepted • 10.1080/17550874.2020.1762133
  22. Mortágua, Andreia; Vasselon, Valentin; Oliveira, Ricardo; Elias, Carmen; Chardon, Cécile; Bouchez, Agnès; Rimet, Frédéric; João Feio, Maria; F.P. Almeida, Salomé. "Applicability of DNA metabarcoding approach in the bioassessment of Portuguese rivers using diatoms". Ecological Indicators 106 (2019): 105470. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecolind.2019.105470.
    Published • 10.1016/j.ecolind.2019.105470
  23. Luís, Ana Teresa; Teixeira, Manuela; Durães, Nuno; Pinto, Raquel; Almeida, Salomé F.P.; da Silva, Eduardo Ferreira; Figueira, Etelvina. "Extremely acidic environment: Biogeochemical effects on algal biofilms". Ecotoxicology and Environmental Safety 177 (2019): 124-132. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecoenv.2019.04.001.
    10.1016/j.ecoenv.2019.04.001
  24. Calapez, Ana Raquel; Elias, Carmen L.; Almeida, Salomé F. P.; Brito, António G.; Feio, Maria João. "Sewage contamination under water scarcity effects on stream biota: biofilm, grazers, and their interaction". Environmental Science and Pollution Research 26 26 (2019): 26636-26645. http://dx.doi.org/10.1007/s11356-019-05876-7.
    Published • 10.1007/s11356-019-05876-7
  25. Gonçalves, Sara; Almeida, Salomé F.P.; Figueira, Etelvina; Kahlert, Maria. "Valve teratologies and Chl c in the freshwater diatom Tabellaria flocculosa as biomarkers for metal contamination". Ecological Indicators 101 (2019): 476-485. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecolind.2019.01.032.
    10.1016/j.ecolind.2019.01.032
  26. Luís, A.T.; Durães, N.; Ferreira da Silva, E.; Ribeiro, S.; Silva, A.J.F.; Patinha, C.; Almeida, S.F.P.; Azevedo, M.R.. "Tracking multiple Sr sources through variations in 87Sr/86Sr ratios of surface waters from the Aljustrel massive sulphide mining area: Geological versus anthropogenic inputs". Applied Geochemistry 102 (2019): 108-120. http://dx.doi.org/10.1016/j.apgeochem.2019.01.016.
    10.1016/j.apgeochem.2019.01.016
  27. Luís, Ana T.; Grande, José António; Durães, Nuno; Dávila, José Miguel; Santisteban, María; Almeida, Salomé F. P.; Sarmiento, Aguasanta M.; et al. "Biogeochemical characterization of surface waters in the Aljustrel mining area (South Portugal)". Environmental Geochemistry and Health 41 5 (2019): 1909-1921. http://dx.doi.org/10.1007/s10653-019-00249-y.
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    Published
  81. Almeida, Salomé; Morais, M.; Novais, M.H; Nunes, S.; Craveiro, S.C.; Rodrigues, A.M.F; Castro, L.; Caldas, F.B. "Desenvolvimento de um sistema de avaliação ecológica para rios baseado nas diatomáceas bentónicas – Implementação da Directiva Quadro da Água em Portugal Continental.". Recursos Hídricos 30 2 (2009): 55-63.
  82. Luís, A. T.; Teixeira, P.; Almeida, S. F. P.; Ector, L.; Matos, J. X.; Ferreira da Silva, E. A.. "Impact of Acid Mine Drainage (AMD) on Water Quality, Stream Sediments and Periphytic Diatom Communities in the Surrounding Streams of Aljustrel Mining Area (Portugal)". Water, Air, and Soil Pollution 200 1-4 (2008): 147-167. http://dx.doi.org/10.1007/s11270-008-9900-z.
    10.1007/s11270-008-9900-z
  83. Luis AT; Almeida SFP; Teixeira, Paula; Ferreira da Silva, Eduardo. "Effects of Acid Mine Drainage on Benthic Diatom Communities, Stream Sediments and Surface Waters of Lousal and Aljustrel Áreas". Macla 10 (2008): 1345-134.
    Published • 10.1016/s0269-7491(02)00106-9
  84. Feio, Maria J.; Almeida, Salomé F. P.; Craveiro, Sandra C.; Calado, António J.. "Diatoms and macroinvertebrates provide consistent and complementary information on environmental quality". Fundamental and Applied Limnology / Archiv für Hydrobiologie 169 3 (2007): 247-258. http://dx.doi.org/10.1127/1863-9135/2007/0169-0247.
    10.1127/1863-9135/2007/0169-0247
  85. Calado AJ; Almeida, Salomé; Craveiro S C. "Phycological surveys and monitoring in Portugal – a summary". Boletin de la Sociedad Española de Ficologia (2005): 36-40.
    Published
  86. Almeida, Salomé; Nunes, M.L; Silva, E. F. "Caracterização e avaliação do impacto químico causados por antigas minas abandonadas na bacia hidrográfica do rio Caima – Portugal". Geochimica Brasiliensis 19 2 (2005): 98-102.
    Published
  87. Almeida, Salomé. "Les communautés de diatomées aux environs d'une ancienne mine de plomb (Coval da Mó - Centre Nord du Portugal)". Bulletin de la Société des Sciences Naturelles de l'Ouest de la France. (2003): 166-186.
  88. Almeida, Salomé; Nunes, M.L; Ferreira da Silva, E; Nunes, M.L.; Ferreira Da Silva, E.; De Almeida, S.F.P.. "Assessment of water quality in the Caima and Mau River basins (Portugal) using geochemical and biological Indices". Water, Air, and Soil Pollution 149 1-4 (2003): 227-250. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0141961610&partnerID=MN8TOARS.
    Published • 10.1023/A:1025636106890
  89. Almeida, Salomé; Almeida, S.F.P.. "Use of diatoms for freshwater quality evaluation in Portugal". Limnetica 20 2 (2002): 205-213. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0141905438&partnerID=MN8TOARS.
    Published
  90. Prygiel, J.; Carpentier, P.; Almeida, S.; Coste, M.; Druart, J.-C.; Ector, L.; Guillard, D.; et al. "Determination of the biological diatom index (IBD NF T 90-354): Results of an intercomparison exercise". Journal of Applied Phycology 14 1 (2002): 27-39. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0036106198&partnerID=MN8TOARS.
    Published • 10.1023/A:1015277207328
  91. Almeida, Salomé; Gil, M.C.P. "Ecology of freshwater diatoms from the central region of Portugal". Cryptogamie Algologie 22 1 (2001): 109-126.
    Published
  92. De Almeida, S.F.P.; Gil, M.C.P.. "Ecology of freshwater diatoms from the central region of Portugal | dÉcologie des diatomées d'eau douce de la région centrale du Portugal". Cryptogamie, Algologie 22 1 (2001): 109-126. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0009649586&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/S0181-1568(01)01053-4
  93. Almeida, Salomé; GIL, M.C.P.. "As diatomáceas e a qualidade das águas na Bacia do Vouga". Revista Biol. (Lisboa) 18 (2000): 157-165.
    Published
  94. Almeida, Salomé; Gil, M.C.P. "Diatomáceas – Avaliação biológica da qualidade das águas doces.". Actas da 6ª Conferência Nacional sobre a Qualidade do Ambiente 2 891 (2000): 896.
    Published
  95. Almeida, Salomé; GIL, M.C.P.. "As diatomáceas na avaliação biológica da qualidade das águas doces superficiais". Revista Biol. (Lisboa) 16 (1998): 169-175.
    Published
  96. Almeida SFP; Pereira MJ; Gil MC; Rino JA. "Ecology of Freshwater Algae with relevance to Euglenophyta and Bacillariophyceae.". Phycologia 36 (4-supl (1997): 2-2.
    Published
  97. Pereira MJ; Almeida SFP; Rino JA; Gil MC. "Chemical Characteristics of Freshwater and Elemental Composition of Trachelomonas (Euglenophyta) and Bacillariophyceae.". Phycologia 36 (4-supl (1997): 86-86.
    Published
  98. GIL, M.C.P.; Almeida, Salomé. "Colonização de substratos artificiais: Diatomáceas Perifíticas.". Bol. UCA. U Algarve, UCTRA 1 (1993): 543-557.
    Published
Online resource
  1. de Almeida, SFP; Calado AJ; Craveiro SC. 1. Laboratório de Ultrastrutura, Evolução e Ecologia de Microalgas (Lab-UEEMa). 2023. https://www.ua.pt/dbio/biossintese/.
  2. Almeida SFP; Mortágua, Andreia. RIVEAL PROJECT. Riparian forest values and ecosystem services - Diatoms RIVEAL Factsheet #8. 2021. https://www.doi.org/10.5281/zenodo.4734272 http://www.riveal.pt/files/Factsheet_08_RIVEAL_diatoms.pdf.
  3. Almeida SFP; Mortágua, Andreia. PROJETO RIVEAL. Valores e serviços dos ecossistemas das florestas ribeirinhas – diatomáceas. Ficha informativa RIVEAL #8.. 2021. https://www.doi.org/10.5281/zenodo.4740610 http://www.riveal.pt/files/Factsheet_08_RIVEAL_diatoms_pt.pdf.
Report
  1. Almeida SFP; Mortágua, Andreia; Manuela Sales. Corresponding author: Almeida SFP. 2021. Template for reporting on Intercalibration of new or revised ecological assessment methods according to finalised Intercalibration results (Gap 2). Portugal – Phytobenthos – Large Rivers.

Other

Other output
  1. Papel de las diatomeas como indicadores del grado de afección de embalses receptores de AMD: influencia del PH en el modo de ocurrencia. Este trabajo se basa en el estudio de 23 embalses ubicados en la Faja Pirítica Ibérica para llevar a cabo una clasificación ambiental basada en las comunidades de Diatomeas, con especial interés en aquellas acidófilas o ácido tolerantes, para definer la relación de estas comunidades con la físico-química de las aguas. Para ello, la distribución de diatomeas bentónicas se ha caracterizado, en parti. 2017. G. Rivera, María José; Grande, José Antonio; de la Torre, María Luisa; Valente, Teresa Maria Fernandes; Almeida, Salomé F.P; Delgado Cristina; Santisteban, María; Barrio-Parra, Fernándo; Izquierdo, Miguel. http://hdl.handle.net/1822/73082.
Technical standard
  1. Manual para a avaliação biológica da qualidade da água em sistemas fluviais Segundo a Directiva Quadro da Água. Protocolo de amostragem e análise para o fitobentos-diatomáceas.. INAG (Instituto Nacional da Água). Ministério do Ambiente, Ordenamento do Território e do Desenvolvimento Regional. Instituto da Água, I.P., Lisboa, Portugal (grupo de trabalho: Maria Manuela Morais, Helena Novais, Ana Pedro, Susana Nunes, Teresa Rafael, Salomé Almeida, Sandra Craveiro, Francisco Barreto Caldas, António Rodrigues, Luísa Castro). 2008. Almeida SFP.
  2. Tipologia de rios em Portugal Continental no âmbito da implementação da Directiva Quadro da Água.. Ministério do Ambiente, Ordenamento do Território e do Desenvolvimento Regional. Instituto da Água, I.P., Lisboa Portugal (Colaboraram neste documento: Maria Helena Alves, João Ferreira, João Pádua, João Pedro Martins, Teresa Rafael, Gonçalo Tomaz, Hélio Figueiredo, João Manuel Bernardo, Paulo Pinto, Manuela Morais, Maria Ilhéu, Paula Matono, Pedro Raposo de Almeida, Maria Teresa Ferreira, Francis. 2008. Almeida SFP.
Activities

Oral presentation

Presentation title Event name
Host (Event location)
2023/11 Theatre to promote public awareness for therehabilitation of urban streams. International Conference Theatre about Science
University of Coimbra (Coimbra, Portugal)
2023/11 Macrophytes in uncertain freshwater futures: effects of climate change in a Mediterranean regulated river 16th International Symposium on Aquatic Plants
(Antwerp, Belgium)
2023/07 Using Diatoms to Investigate the Role of Protected Areas in the Conservation of Rivers. Research Summit
University of Aveiro (Aveiro, Portugal)
2023/06 Urban streams: effects on diatom community diversity and structure. 13th Symposium for European Freshwater Sciences
Freshwater Biological Association (Newcastle upon Tyne, United Kingdom)
2023/06 Does the biodiversity of urban freshwaters matter? 13th Symposium for European Freshwater Sciences
Freshwater Biological Association (Newcastle upon Tyne, United Kingdom)
2022/09 Theatre to promote public awareness for the rehabilitation of urban streams 13th European Conference on Ecological Restoration
(Alicante, Spain)
2022/09 River regulation induces functional alterations in the aquatic communities 13th European Conference on Ecological Restoration
(Alicante, Spain)
2022/07 The riverine Iberian Observatory (RIO): a collaborative project to explore global change impacts on Iberian river biodiversity and ecosystem functions 2nd Meeting of the Iberian Ecological Society (SIBECOL), XXI conference of the Iberian Association of Limnology (AIL), 21st National Congress of the Portuguese Ecological Society (SPECO)
(Aveiro, Portugal)
2022/07 The effects of urbanization on rivers. What do diatoms say? 2nd Meeting of the Iberian Ecological Society (SIBECOL), XXI conference of the Iberian Association of Limnology (AIL), 21st National Congress of the Portuguese Ecological Society (SPECO)
(Aveiro, Portugal)
2022/07 Unveiling relations between urban rivers’ ecosystem services and bioindicators’ diversity 2nd Meeting of the Iberian Ecological Society (SIBECOL), XXI conference of the Iberian Association of Limnology (AIL), 21st National Congress of the Portuguese Ecological Society (SPECO)
(Aveiro, Portugal)
2022/07 Increased awareness of stream ecosystems and reconection with nature: the effects of an environmental project on children from cities. 2nd Meeting of the Iberian Ecological Society (SIBECOL), XXI conference of the Iberian Association of Limnology (AIL), 21st National Congress of the Portuguese Ecological Society (SPECO)
(Aveiro, Portugal)
2019/02 Effects of climate change on a freshwater food chain: how does temperature affect primary producers and consumers 1st Meeting of the Iberian Ecological Society & XIV AEET Meeting
SIBECOL - Iberian Society of Ecology (Barcelona, Spain)
2018/06 Molecular evidences of biofilm responses to multiple-stressors: community shifts induced by flow stagnation, organic loads and grazing XIX Conference of the Iberian Association of Limnology
AIL - Iberian Association of Limnology (Coimbra, Portugal)
2018/06 DNA metabarcoding approach as a complementary technique for assessment of Portuguese rivers using diatoms. XIX Conference of the Iberian Association of Limnology
AIL - Iberian Association of Limnology (Coimbra, Portugal)
2018/06 Succession of biofilm colonization during na experimente in a eutrophic urban pond XIX Conference of the Iberian Association of Limnology
AIL - Iberian Association of Limnology (Coimbra, Portugal)
2018/06 Plastricity of the diatom species size (life history trait) at the large (world) and regional (river type) spatial scale XIX Conference of the Iberian Association of Limnology
AIL - Iberian Association of Limnology (Coimbra, Portugal)
2018/06 Assessing Zn and Cu impacts on freshwater diatoms: physiological, biochemical and metabolomics responses of Tabellaria flocculosa (Roth) Kützing XIX Conference of the Iberian Association of Limnology
AIL - Iberian Association of Limnology (Coimbra, Portugal)
2016/07 Organic load and water scarcity combined effects on Mediterranean stream communities: biofilm, grazers and their interaction XVIII Congress of the Iberian Society of Limnology
AIL - Iberian Society of Limnology (Tortosa, Spain)
2016/07 Do similar climatic patterns in different continents lead to similar benthic diatom assemblages?” XVIII Congress of the Iberian Society of Limnology
AIL - Iberian Society of Limnology (Tortosa, Spain)
2016/02 Effects of metal contamination on diatoms: the volatile metabolome and biochemical status of Achnanthidium minutissimum when exposed to zinc 5th Young Environmental Scientists (YES) Meeting, SETAC
SETAC (Gainsville, United States)
2015/09 Freshwater diatoms as indicators of environmental change: from the community to the cell level 13º EEF (European Ecological Federation)/SItE (Società Italiana di Ecologia) joint conference
(Roma, Italy)
2015/07 Benthic diatoms in temperate Atlantic streams: temporal and spatial variation 9th Symposium for European Freshwater Sciences (SEFS9)
SEF (Genebra, Switzerland)
2013/05 An INCREASE IN WATER TEMPERATURE IN OLIGORTROPHIC TEMPERATE mountain STREAMS? An in situ experiment. Society for Freshwater Science – 61st Annual Meeting, Energy Production and Aquatic Biodiversity: Understanding the threats, planning for ecosystem management
SFS (Jacksonville, United States)
2012/05 MEDITERRANEAN DIATOM ASSEMBLAGES: A CHARACTERIZATION BASED ON REFERENCE SITES OF 7 COUNTRIES Society for Freshwater Science – 60th Annual Meeting, Freshwater Stewardship: Challenges and Solutions
SFS (Louisville, United States)
2010/03 Diatoms as indicators of environmental change: from the cell to the community level 1ª Workshop Anual Bioplant
(Porto, Portugal)
2001/09 Diatomées benthiques et qualité biologique du “lac” “Pateira de Fermentelos” (Portugal). 20ème Colloque de l’ADLaF (Association des Diatomistes de Langue Française)
ADLaF (Antuérpia, Belgium)
2000/12 A toxicidade de metais em algumas espécies de diatomáceas Segundo Encontro Nacional de Ficologia
(Coimbra, Portugal)
2000/11 As algas como indicadores de poluição II Jornadas de Biologia Aplicada
Universidade do Minho (Braga, Portugal)
1993 Metodologia estatística multivariada no estudo da composição química de diatomáceas I Jornadas de Classificação e Análise de Dados
(Lisboa, Portugal)

Supervision

Thesis Title
Role 		Degree Subject (Type)
Institution / Organization
2020/10 - 2021/12/15 The effect of urbanization on the aquatic and terrestrial biodiversity of urban streams
Co-supervisor
 Applied Biology (Master)
Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2019/10 - 2021/10/29 Effects of radioactivity and other variables on aquatic microorganisms: case study in springwaters of Auvergne
Supervisor
 Microbiology (Master)
Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2019/12 - 2021/02/04 Diatom and waters from Coval da Mó (Portugal) and Sidi Driss (Tunisia mines: a biogeochemical approach)
Co-supervisor
 Applied Ecology (Master)
Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2019/10 - 2021/02/01 Biomonitoring of Ferreira and Sousa rivers using diatoms: comparison between morphological and molecular approaches
Supervisor
 Applied Ecology (Master)
Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2018 - 2019/12/17 Impacto de cinzas de incêndios florestais em diatomáceas. (Impact of wildfire ashes on aquatic diatoms)
Supervisor
 Mestrado em Ecotoxicologia e Análise de Risco (Master)
Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2017 - 2018/12/14 Abordagem de Metabarcoding de DNA na avaliação dos rios Portugueses usando diatomáceas. (DNA metabarcoding approach for assessment of Portuguese rivers using diatoms)
Supervisor
 Mestrado em Biologia Aplicada (Master)
Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2017 - 2018 Monitorização do estado das massas de água, rios e albufeiras
Supervisor
Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2015 - 2018 Estudo das comunidades de diatomeas, de fontes termais e de zonas fluviais de influencia, na predición de efectos do cambio climático
Supervisor
 Formação pos-doutoral do plano Galego de Investigação, inovação e crescimento 2011-2015 (plano 12C) para o ano 2014 (Other)
Universidade de Vigo, Spain
2016 - 2017/09/22 Impactos do Zinco e do Cobre em diatomáceas de água doce: resposta fisiológica, bioquímica e metabolómica de Tabellaria flocculosa (Zinc and copper impacts on freshwater diatoms: physiological, biochemical and metabolomic response of Tabellaria flocculosa)
Co-supervisor
 Mestrado em Biologia Molecular e Celular (Master)
Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2015 - 2016/12/07 Sensitivity of Freshwater Diatoms to herbicides and metals:geography, phylogeny and Biochemistry
Co-supervisor
 Mestrado em toxicologia e ecotoxicologia (Master)
Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2011 - 2016/10/28 Efeito das alterações globais e escala espacial nas comunidades de diatomáceas dos rios temperados. Implicação na biomonitorização
Supervisor
 Programa doutoral em Biologia (PhD)
Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2012 - 2013/12/20 Contributo à avaliação ecológica das ribeiras do Algarve – diatomáceas
Supervisor
 Mestrado em Biologia Aplicada (Master)
Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2008 - 2013/11/08 Integração de modificações geoquímicas e biológicas em áreas mineiras: águas, sedimentos e diatomáceas
Co-supervisor
 Doutoramento em Geociências - Geoquímica Ambiental (PhD)
Universidade de Aveiro Departamento de Geociências, Portugal
2012 - 2013/10/29 Diatomáceas no contexto da investigação das mortes por afogamento
Co-supervisor
 Mestrado em Medicina Legal e Ciências Forenses (Master)
Universidade de Coimbra Faculdade de Medicina, Portugal
2011 - 2012/09/21 Combined assessment of streams based on diatoms and macroinvertebrates
Supervisor
 Mestrado em Biologia Aplicada (Ecologia, Biodiversidade e Gestão de Ecossistemas) (Master)
Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2009 - 2010/07/12 Cadmium effects in Nitzschia palea frustule proteins
Co-supervisor
 Mestrado em toxicologia e ecotoxicologia (Master)
Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2008 - 2009/12/17 Utilização das Diatomáceas na Avaliação da Qualidade da Água no Rio Febros
Supervisor
 Mestrado em Biologia e Gestão da Qualidade da Água (Master)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2001 - 2007/11/22 Diagnóstico da qualidade ambiental das bacias do rio Mau e Caima. Estudo da dinâmica dos processos naturais e antrópicos e definição de zonas vulneráveis
Co-supervisor
 Doutoramento em Geociências (PhD)
Universidade de Aveiro Departamento de Geociências, Portugal
2006 - 2007/10/04 Caracterização físico-química e ecológica (diatomáceas) das linhas de água de Aveiro
Supervisor
 Mestrado em Microbiologia Molecular (Master)
Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2006 - 2007/09/26 Efeito da drenagem ácida nos cursos de água da envolvente è zona mineira de Aljustrel
Co-supervisor
 Mestrado em Geoquímica (Master)
Universidade de Aveiro Departamento de Geociências, Portugal
2006 - 2007/03/30 Efeito da drenagem ácida da mina do Lousal nas comunidades de diatomáceas
Co-supervisor
 Mestrado em Geoquímica (Master)
Universidade de Aveiro Departamento de Geociências, Portugal
2003 - 2004/12/13 Utilização das Diatomáceas na avaliação da qualidade das águas do rio Pavia – Região Centro de Portugal Continental
Supervisor
 Mestrado em Hidrobiologia (Master)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal

Event organisation

Event name
Type of event (Role) 		Institution / Organization
2022/07 - Current Organization and moderation with Maria João Feio of special Session in the 2nd Meeting of the Iberian Ecological Society (SIBECOL), XXI conferene of the Iberian Association of Limnology (AIL), 21st National Congress of the Portuguese Ecological Society (SPECO), 3-8 July. Title: Aquatic ecosystems in urban context benefits and costs for biodiversity and people. (2022/07 - 2022/07)
Other (Co-organisor)
 Universidade de Aveiro, Portugal
2023/06 - 2023/06 Organization and moderation of Special session with Maria João Feio in the meeting, 13th Symposium for European Freshwater Sciences (SEFS 13), from 18-23 June, 2023 – Newcastle, England. special session: Freshwater ecosystems and urbanization, is the sustainable development of cities really possible? (2023/06 - 2023/06)
Other (Co-organisor)
 Northumbria University, United Kingdom
2018 - 2018 Sessão espaecial: The use of molecular tools in ecological and biodiversity assessment of aquatic ecosystems.” Organização em conjunto com Maria João Feio e Ana Filipa Filipe no congresso XIX Conference of the Iberian Association of Limnology de 24 a 29 de junho de 2018 - Coimbra, Portugal. (2018 - 2018)
Workshop
 Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, Portugal
2012/07/02 - 2012/07/06 Organização e participação no processo de seleção das melhores apresentações orais e posters apresentados por alunos no congresso Limnologia 2012 - XVI Congress of the Iberian Association of Limnology de 2 a 6 de julho de 2012 – Universidade do Minho, Guimarães, Portugal (2012/07/02 - 2012/07/06)
Congress (Other)
 Universidade do Minho, Portugal

Event participation

Activity description
Type of event 		Event name
Institution / Organization
2010 - 2010 Palestra na Fábrica, Centro de Ciência Viva, Aveiro: Impaciências – com o título “Diatomáceas – As algas e o seu papel na biodiversidade”, dia 18 de Setembro das 15h às 16h30.
Seminar
 Impaciências

Jury of academic degree

Topic
Role 		Candidate name (Type of degree)
Institution / Organization
2023/12/11 Estudo da qualidade da água da Lagoa da Vela segundo parâmetros químicos e biológicos.
(Thesis) Main arguer
 1. Mónica Raquel Silva Pinheiro (Master)
Universidade de Aveiro, Portugal
2021/11/03 Reconstruction of past environmental changes in the Azores based on lacustrine diatom sedimentar records
(Thesis) Arguer
 Helena Margarida Araújo de Sousa Marques (PhD)
Universidade dos Açores, Portugal
2021/02/01 Biomonitorização dos rios Ferreira e Sousa usando diatomáceas: comparação entre metodologias morfológica e molecular
Supervisor
 2. Marco José Neto Teixeira (Master)
Universidade de Aveiro, Portugal
2019/12/17 Impacto de cinzas de incêndios florestais em diatomáceas
Supervisor
 3. Elsa Patrícia Ribeiro Pereira (Master)
Universidade de Aveiro, Portugal
2018/12/14 Abordagem de Metabarcoding de DNA na avaliação dos rios Portugueses usando diatomáceas
Supervisor
 4. Andreia Filipa Henriques Mortágua (Master)
Universidade de Aveiro, Portugal
2018/11/05 Indução de carotenogénese em Chlorella sp. para alteração da cor da biomassa
(Thesis) Main arguer
 Joana Raquel Almeida Galante (Master)
Instituto Politécnico de Leiria Escola Superior de Turismo e Tecnologia do Mar de Peniche, Portugal
2018/05/25 Organização e dinâmica de comunidades aquáticas em riachos no Cerrado
(Thesis) Arguer
 Gustavo Figueiredo Marques Leite (PhD)
Universidade de Brasília, Brazil
2018/01/09 Fotoproteção, stress oxidativo e fotoinibição no microfitobentos estuarino” (Photoprotection, oxidative stress and photoinhibition in estuarine microphytobenthos)
(Thesis) Arguer
 João Paulo Ferreira Ezequiel (PhD)
Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2016/09/14 Cultivo de Vischeria helvética e Asterococcus korschikoffii em sistema unialgal e misto e determinação do seu conteúdo lipídico
(Thesis) Main arguer
 Maria João Alves Correia (Master)
Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, Portugal
2014/09/12 Potencial biotecnológico de Haematococcus pluvialis Flotow
(Thesis) Main arguer
 Clara Sofia Baeta Martins (Master)
Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, Portugal
2013/07/24 Avaliação Ecológica do Efeito Combinado de Contaminantes Ambientais
(Thesis) Arguer
 Tânia Daniela da Silva Vidal (PhD)
Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2012/02/20 The use of pulse amplitude modulated fluorescence techniques for metal toxicity assessment in fluvial biofilms
(Thesis) Arguer
 Natàlia Corcoll i Cornet (PhD)
Universidade de Girona - Instituto de Ecologia Aquática, Spain
2011/12/20 Avaliação da qualidade da água superficial do concelho de Mira
(Thesis) Main arguer
 Inácio Manuel dos Santos Gonçalves (Master)
Universidade de Aveiro Departamento de Ambiente e Ordenamento, Portugal
2011/12/07 Maturação de lamas vulcânicas açorianas e sua aplicação em peloterapia
Thesis Member
 Ana Carina Quintela dos Santos (PhD)
Universidade de Aveiro Departamento de Geociências, Portugal
2011/07/22 Estudo das diatomáceas bênticas em sistemas lóticos de Portugal Continental
(Thesis) Main arguer
 Maria Helena Batista Costa Guerreiro de Novais (PhD)
Universidade de Évora Departamento de Biologia, Portugal
2011/02/28 Screening, isolation and characterisation of bioactive substances of estuarine cyanobacteria
(Thesis) Arguer
 Viviana Raquel Vieira da Silva Lopes (PhD)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2011 Benthic diatoms of Atlantic and Mediterranean Spanish Rivers: Ecology and Bioindication
(Thesis) Arguer
 Cristina Delgado Nunez (PhD)
Universidade de Vigo, Spain
2010/07/15 Monitorização de qualidade da água na Bacia hidrográfica do Vouga
(Thesis) Main arguer
 Vera Lúcia da Silva Henriques (Master)
Universidade de Aveiro Departamento de Ambiente e Ordenamento, Portugal
2009/04/04 Distributional patterns of diatom communities in Mediterranean Rivers
(Thesis) Arguer
 Elisabet Tornes Bes (PhD)
Universidade de Girona - Instituto de Ecologia Aquática, Spain
2008/07/30 Ocorrência e Ecotoxicologia de Cianobactérias Marinhas
(Thesis) Main arguer
 Bárbara Bilreiro de Mendoça Frazão (Master)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2007/12 Algicidas Naturais Contra Microalgas Nocivas: avaliação do potencial da bacilamida como meio de prevenção de florescências de cianobactérias
(Thesis) Main arguer
 Catarina Isabel Prata Pereira Leitão Churro (Master)
Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2007/02/27 Criopreservação de espécies de Staurastrum Meyen e o uso de microalgas no ensino dos novos programas de Biologia do Ensino Secundário
(Thesis) Main arguer
 José Fernando Cancela da Costa (Master)
Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal
2006/10/10 Uso de Macrófitas Aquáticas na Remoção de Nutrientes num Lago Urbano (Lago dos Jardins do Palácio de Cristal)
(Thesis) Main arguer
 Marlene Patrícia Santos Ferreira Soares (Master)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2004/12/17 Relação entre a presença de diatomáceas e a erosão dos sedimentos no estuário do rio Cávado
(Thesis) Main arguer
 Ana Sofia Godinho Barbosa Pinto Soares (Master)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2004/07/07 Flora diatomológica marinha do Norte de Portugal
(Thesis) Main arguer
 Isilda de Lemos Sampaio Amorim (Master)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal

Ad Hoc journal article review

Journal title (ISSN) Publisher
2011 - Current Ecological Indicators
2019 - 2019 PeerJ (2167-8359) PeerJ
2017 - 2017 Journal of Environmental Sciences (1001-0742) Elsevier
2016 - 2016 African Journal of Environmental Science and Technology (1996-0786) Academic Journals

Association member

Society Organization name Role
2019 - Current SIBECOL – Sociedade Ibérica de Ecologia Membro por inerência (membro da AIL)
2019 - Current PROAQUA – Associação para a promoção do conhecimento em Ecologia Aquática Presidente do Conselho Fiscal
2010 - Current Associação Ibérica de Limnologia (AIL) Membro
2001 - Current Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF) Membro
1994 - Current International Society for Diatom Research (ISDR) Membro
1992 - Current Ordem dos Biólogos Membro
2016 - 2019 PROAQUA – Associação para a promoção do conhecimento em Ecologia Aquática Secretária da mesa da Assembleia Geral
2011 - 2019 Phycological Society of America (PSA) Membro

Committee member

Activity description
Role 		Institution / Organization
2021 - Current director of the BSc In Biology and Geology
Director
 Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2016 - Current Comissão de Análise da Fase C (Garantia) do sistema de Garantia de Qualidade (SGQ) para 1º e 2º ciclos
Member
 Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2016 - 2020 EU COST Action CA15219 - DNAaqua-Net: Developing new genetic tools for bioassessment of aquatic ecosystems in Europe. WG2 – Biotic Indices & Metrics.
Member
2016 - 2020 EU COST Action CA15113 – SMIRES: Science and Management of Intermittent Rivers and Ephemeral Streams. WG4 – Biomonitoring of IRES
Member
2015 - 2019 Vogal da Comissão Executiva do Departamento de Biologia
Member
 Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2013 - 2017 membro da comissão de acompanhamento do programa doutoral “Marine Science, Technology and Management” (Do*Mar)
Advisor / Consultant
 Universidade de Santiago de Compostela, Spain
2011 - 2016 Diretora do Curso de Licenciatura em Biologia e Geologia
Director
 Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2007 - 2010 Diretora do Curso de Licenciatura em Biologia
Director
 Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2006 - 2007 Vice-diretora da Comissão do Curso de Biologia
Member
 Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2001 - 2003 Coordenadora da Prática Pedagógica do curso de Licenciatura em Biologia e Geologia (ensino de)
Coordinator
 Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
1999 - 2000 Coordenadora adjunta da Prática Pedagógica do curso de licenciatura de Biologia e geologia (ensino de)
Member
 Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal

Course / Discipline taught

Academic session Degree Subject (Type) Institution / Organization
2014 - Current Poluição, Diagnóstico e Ecologia Aplicada (Mestrado) Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2008 - Current Indicadores Biológicos de Poluição (Mestrado) Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2007/09 - Current Biologia Celular (Licenciatura) Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2007/02 - Current Biologia, Evolução e Diversidade II (Licenciatura) Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2012/06/18 - 2012/06/18 Lecionação em curso: Aquatic primary producers: environmental monitoring, ecotoxicity testing and toxic blooms” no IMAR-CMA, Departamento de Ciencias da Vida da Faculdade de Ciências e Tecnonlogia da Universidade de Coimbra, dia 18 de junho de 2012, a convite de Matilde Moreira. (Outros) Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, Portugal
2012/03/20 - 2012/03/20 Lecionação em curso: “Biodiversidade e cultivo de algas, conservação, bio-reactores, biotecnonlogia” no âmbito do curso avançado “biotecnonlogia Algal” no departamento de Ciências da Vida da Faculdade de Ciências e Tecnonlogia da Universidade de Coimbra, dia 20 de Março de 2012, a convite da Lília Santos. (Outros) Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, Portugal
2011 - 2012 Fundamentos de Ecologia (Licenciatura) Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2011/04/11 - 2011/04/15 Lecionação em curso: “Intensive course on Stream Ecology Module 1: Freshwaters bioassessment according to the Water Framework Directive, 11-15 April 2011”, no Departamento de Zoologia da Universidade de Coimbra e IMAR em Coimbra. Organizado por Manuel Graça, Cristina Canhoto e Maria João Feio. (Outros) Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, Portugal
2011 - 2011 Ecologia e Conservação dos Recursos Naturais (Licenciatura) Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2011 - 2011 Lecionação na Academia de Verão: Biodiversidade de microalgas em águas doces. Sua utilização para avaliação da qualidade da água (Lísia Lopes/Salomé Almeida/Ana Teresa Luís/Carmen Elias) - 11 e 18 de Julho. (Ensino secundário) Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2010/07/19 - 2010/07/20 Lecionação em curso: “Assessment of Freshwater Ecosystem Condition”, de 19 a 23 de Julho (19 e 20 de Julho para fitobentos), no Departamento de Biologia da Universidade do Minho em Braga. Organizado por Fernanda Cássio, Cláudia Pascoal, Sahadevan Seena, Sofia Duarte. (Outros) Universidade do Minho, Portugal
2010 - 2010 Biologia e Diversidade Marinha (Licenciatura) Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2010 - 2010 Lecionação na Academia de Verão: Biodiversidade de microalgas em águas doces. Sua utilização para avaliação da qualidade da água (Lísia Lopes/Salomé Almeida) - 12 e 19 de Julho. (Ensino secundário) Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2009/04/06 - 2009/04/09 Curso de curta duração (organização e lecionação): “Curso de Formação em Amostragem e Análise de Macroinvertebrados e Diatomáceas” de 6 a 9 de Abril, IMAR, Coimbra. O curso foi frequentado por 21 alunos. Organizadores: Maria João Feio, Manuel Augusto Graça do IMAR, Salomé Almeida da UI GeoBioTec e Universidade de Aveiro, João Ferreira e João Pádua do INAG. (Outros) Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, Portugal
2008 - 2009 Biodiversidade e Ecologia Aquática (Licenciatura) Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2008/04/14 - 2008/04/25 Lecionação em curso: “Evaluation of environmental quality of freshwaters using biological methods”, de 14 a 25 de Abril, no Departamento de Zoologia da Universidade de Coimbra e IMAR em Coimbra. Organizado por Manuel Graça, Cristina Canhoto e Maria João Feio. (Outros) Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, Portugal
2007/06/25 - 2007/06/29 Lecionação em curso: “Directiva-Quadro da Água: Diatomáceas bentónicas e sua utilização para a avaliação da qualidade da água em rios de Portugal Continental”, de 25 a 29 de Junho, na Universidade de Évora. Organizado por Manuela Morais e Helena Novais. (Outros) Universidade de Évora Departamento de Biologia, Portugal
2004 - 2006 Biodiversidade Vegetal I (Licenciatura) Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2005/10/03 - 2005/10/14 Lecionação em curso: “Evaluation of environmental quality of aquatic systems using biological methods”, de 3 a 14 de Outubro, no Departamento de Zoologia da Universidade de Coimbra e IMAR em Coimbra. Organizado por Manuel Augusto Graça e Maria João Feio. Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, Portugal
2004 - 2005 Biodiversidade Vegetal II (Licenciatura) Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2003 - 2005 Biodiversidade II (Licenciatura) Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2001 - 2005 Prática Pedagógica (Licenciatura) Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2002 - 2004 Seminário de Biologia/Geologia (Licenciatura) Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2002/06/27 - 2002/06/27 Lecionação em curso: “Amostragem de perifíton”, 27 de Junho, na Direcção Regional do Ambiente e Ordenamento do Território do Norte (DRAOT/Norte). Organizado pelo Instituto da Água (INAG) do Ministério das Cidades, Ordenamento do Território e Ambiente. O curso incluiu uma aula teórica e uma componente prática com demonstração no campo. (Outros) Instituto Nacional da Água (INAG), Portugal
2002/06/05 - 2002/06/05 Algas como indicadoras de poluição (Licenciatura) Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, Portugal
1999 - 2002 Seminário I / Seminário II (Licenciatura) Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
1998 - 2002 Botânica Geral (Licenciatura) Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2001/06/25 - 2001/06/30 Curso de curta duração (organização e lecionação): “Algal identification and monitoring: using the freshwater algae for water quality assessment” de 25 a 30 de Junho, no Departamento de Biologia da Universidade de Aveiro. O curso foi frequentado por 15 alunos. Organizadores: António Calado, Salomé Almeida e Sandra Craveiro. Colaboraram como professores convidados, Jørgen Kristiansen (Department of Phycology, University of Copenhagen) e Luc Ector (Centre de Recherche G. Lippmann, Cellule de Recherche en Environnement et Biotechnologies, Luxembourg). (Outros) Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
1994 - 1999 Ecologia I (Licenciatura) Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
1997 - 1997 Talófitos (Licenciatura) Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
1994 - 1996 Citologia e Histologia dos Vegetais (Licenciatura) Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal

Journal scientific committee

Journal title (ISSN) Publisher
2015 - Current Recent Patents on Biotechnology (1872-2083) Bentham Science
2015 - Current Marine and Freshwater Research (1323-1650) CSIRO Publishing
2014 - Current Journal of Integrated Coastal Zone Management (1646-8872)
2013 - Current New Zealand Journal of Marine and Freshwater Research (1175-8805) Informa UK (Taylor & Francis)
2013 - Current Bioprocess and Biosystems Engineering (1615-7605) Springer-Verlag
2012 - Current Estuarine Coastal and Shelf Science (1096-0015) Elsevier
2012 - Current Journal of Phycology (1529-8817) Wiley (Blackwell Publishing)
2008 - Current Acta Botânica Croatica (1847-8476)
2013 - 2020 The Science of The Total Environment (0048-9697) Elsevier
2011 - 2020 Ecological Indicators (1470-160X) Elsevier
2015 - 2018 Environmental Science and Pollution Research (1614-7499) Springer-Verlag
2014 - 2018 Limnetica (0213-8409) Associação Ibérica de Limnologia
2016 - 2016 Knowledge and Management of Aquatic Ecosystems (1961-9502) EDP Sciences
2004 - 2016 Water Research (0043-1354) Elsevier
2012 - 2013 Diatom Research (2159-8347) Informa UK (Taylor & Francis)
2010 - 2013 Hydrobiologia (1573-5117) Springer-Verlag
2001 - 2001 European Journal of Phycology (1469-4433) Informa UK (Taylor & Francis)
2001 - 2001 Acta Oecologica (1146-609X) Elsevier

Other jury / evaluation

Activity description Institution / Organization
2018 - 2018 Concurso Ref.ª CDL -CTTRI -77 -ARH/2018, de âmbito internacional, para recrutamento de um lugar de Doutorado de nível inicial para o exercício de atividades de investigação científica na área científica das Ciências e Engenharia do Ambiente, para o Centro de Estudos do Ambiente e do Mar (CESAM) e Departamento de Ambiente e Ordenamento da Universidade de Aveiro. Universidade de Aveiro Departamento de Ambiente e Ordenamento, Portugal
2018 - 2018 2 lugares de doutorado para o exercício de atividades de investigação na Unidade de Investigação de Geobiociências, GeoTecnologias e de cada lugar e os critérios de avaliação. Universidade de Aveiro, Unidade de Investigação de Geobiociências, GeoTecnologias, Portugal
2016/07/22 - 2016/07/22 participação em júri do projeto de final de Licenciatura em Ciências do Mar com o título: “Vertical distribution of cholophyll a in estuarine sediments: sub-millimetric scale” Universidade de Aveiro Departamento de Física, Portugal