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Helena Manuela Gil Azinheira. Concluiu o(a) Doutoramento em Engenharia Agronómica em 2005 pelo(a) Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia. É Investigador Auxiliar (carreira) no(a) Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia e Professor Auxiliar no(a) Universidade de Lisboa. Publicou 18 artigos em revistas especializadas. Possui 1 livro(s). Atua na(s) área(s) de Ciências Agrárias. Nas suas atividades profissionais interagiu com 89 colaborador(es) em coautorias de trabalhos científicos. No seu currículo Ciência Vitae os termos mais frequentes na contextualização da produção científica, tecnológica e artístico-cultural são: coffee berry disease; anthracnose; Colletotrichum taxonomy; Colletotrichum gloesporioides species complex; Colletotrichum kahawae subsp. kahawae; Colletotrichum kahawae subsp. ciggaro; .
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Identification

Personal identification

Full name
Helena Manuela Gil Azinheira

Citation names

  • Azinheira, Helena
  • Helena Gil Azinheira

Author identifiers

Ciência ID
D715-40A1-E13D
ORCID iD
0000-0002-9007-0082

Telephones

Telephone
  • 3653100 Ext.: 3441 (Professional)
  • 3653515 (Professional)

Addresses

  • Centro de Investigação das Ferrugens do Cafeeiro - Quinta do Marquês, 2784-505 , Oeiras, Oeiras, Portugal (Professional)
  • Instituto Superior de Agronomia - Tapada da Ajuda , 1349-017, Lisboa, Lisboa, Portugal (Professional)

Knowledge fields

  • Agrarian Sciences
  • Natural sciences - Biological Sciences - Mycology

Languages

Language Speaking Reading Writing Listening Peer-review
Portuguese (Mother tongue)
English Upper intermediate (B2) Upper intermediate (B2) Upper intermediate (B2) Upper intermediate (B2) Upper intermediate (B2)
Education
Degree Classification
2005
Concluded
 Engenharia Agronómica (Doutoramento)
Major in Sem especialidade
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
"Estudos Celulares, Bioquímicos e Moleculares da Diferenciação de Hemileia Vastatrix Berk & Br" (THESIS/DISSERTATION)
1985/10/19 - 1991/12/03
Concluded
 Bioquímica (Licenciatura)
Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal
"Poliósidos elucidação de vias metabólicas relacionadas" (THESIS/DISSERTATION)
 14
Affiliation

Science

Category
Host institution 		Employer
2005/12/19 - Current Auxiliary Researcher (Research) Instituto de Investigação Científica Tropical, Portugal
Instituto de Investigação Científica Tropical, Portugal
1996/10/20 - 2005/12/18 Research Assistant (Research) Instituto de Investigação Científica Tropical, Portugal
Instituto de Investigação Científica Tropical, Portugal
1993/04/12 - 1996/10/19 Research Trainee (Research) Instituto de Investigação Científica Tropical, Portugal
Instituto de Investigação Científica Tropical, Portugal

Teaching in Higher Education

Category
Host institution 		Employer
2015/09/01 - 2024/02/14 Assistant Professor (University Teacher) Universidade de Lisboa, Portugal

Other Careers

Category
Host institution 		Employer
1992/10/23 - 1993/04/11 Professor do ensino básico e secundário (Professor do ensino básico e secundário) Republica Portuguesa Ministério da Educação, Portugal
Escola Básica Nun' Álvares, Portugal

Others

Category
Host institution 		Employer
1992/01/06 - 1992/10/22 Técnico Comercial Labometer, Portugal
Labometer, Portugal
1989/10/01 - 1991/12/31 Bolseira de Investigação Laboratório Nacional de Engenharia e Tecnologia Industrial , Portugal
Laboratório Nacional de Engenharia e Tecnologia Industrial , Portugal
Projects

Grant

Designation Funders
2011/04 - 2014/12 Search for candidate protein biomarkers of Coffea arabica resistance to Hemileia vastatrix (leaf rust)
grant.Provided by PTCRIS: 109990
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2011/04 - 2014/12 Unravelling defence mechanisms underlying coffee resistance to Colletotrichum kahawae
grant.Provided by PTCRIS: 112217
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2011/01 - 2014/06 The pathogen's perspective of molecular plant-microbe interactions: genes expressed during the infection process of coffee leaf rust - Hemileia vastatrix
grant.Provided by PTCRIS: 114949
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2007/06 - 2011/03 An interdisciplinary approach to characterize sources of potential durable resistance in coffee (Coffea spp.) to orange rust (Hemileia vastatrix).
grant.Provided by PTCRIS: 71866
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia

Contract

Designation Funders
2021/01/01 - 2025/12/31 Laboratório para a Sustentabilidade do Uso da Terra e dos Serviços dos Ecossistemas
LA/P/0092/2020
10.54499/LA/P/0092/2020
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal

Universidade de Lisboa Centro de Estudos Florestais, Portugal

Universidade de Coimbra Centre for Functional Ecology - Science for People & the Planet, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto de Geografia e Ordenamento do Território, Portugal

Universidade de Coimbra, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto de Saúde Ambiental, Portugal

Universidade de Lisboa Centro de Estudos Geográficos, Portugal

Universidade de Lisboa Centro de Investigação em Agronomia Alimentos Ambiente e Paisagem, Portugal

Associação para a Investigação e Desenvolvimento da Faculdade de Medicina, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Ongoing
2022 - 2025 Saving the intra-varietal diversity of autochthonous grapevine varieties
Contrato PRR-C05-i03-|-000016
Researcher
Ongoing
2022 - 2025 Use of grapevine and microbiome diversity for sustainable production
Projeto n.º C644866286-011 - PRR – Agendas Mobilizadoras
Researcher
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
Ongoing
2019/01/01 - 2023/12/31 Pesquisa de novas fontes de resistência do cafeeiro à ferrugem (Hemileia vastatrix)
PTDC/ASP-PLA/29779/2017
10.54499/PTDC/ASP-PLA/29779/2017
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal

FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal

Universidade do Porto Instituto de Ciências Tecnologias e Agroambiente, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Ongoing
2018/10/01 - 2022/09/30 HDT-Coffee - Map da resistencia no hibrido de
PTDC/ASP-PLA/32429/2017
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal

Universidade do Porto Instituto de Ciências Tecnologias e Agroambiente, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Ongoing
2018/10/01 - 2022/09/30 Estudo e modelação das respostas de cultivares de oliveira a populações de patogénios da gafa, sob diferentes condições agroecológicas e estádios de maturação do fruto,visando a melhoria da sustentabilidade da produção e da qualidade do azeite virgem
PTDC/ASP-PLA/28547/2017
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal

Instituto Politécnico de Castelo Branco, Portugal

Instituto Politécnico de Castelo Branco, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Ongoing
2018/07/01 - 2022/06/30 Patogenómica da ferrugem do cafeeiro para descobrir mecanismos de virulência e marcadores de diagnóstico
PTDC/ASP-PLA/29189/2017
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal

FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Ongoing
2019/01/01 - 2019/12/31 Centro de Investigação em Agronomia, Alimentos, Ambiente e Paisagem
UID/AGR/04129/2019
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal

Universidade de Lisboa Centro de Investigação em Agronomia Alimentos Ambiente e Paisagem, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2016/07/01 - 2019/12/31 Um novo paradigma em ciclos nucleares de fungos? Uma investigação à abundante ocorrência de núcleos diplóides ao longo do ciclo de vida de ferrugens e comparação com outros Pucciniomycetes
PTDC/BIA-MIC/1716/2014
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal

Universidade de Lisboa Centro de Investigação em Agronomia Alimentos Ambiente e Paisagem, Portugal

Universidade de Coimbra Centre for Functional Ecology - Science for People & the Planet, Portugal

Fundação Calouste Gulbenkian, Portugal

Instituto de Investigação Científica Tropical, Portugal

Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal

Universidade de Coimbra, Portugal

Universidade Nova de Lisboa Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT, Portugal

Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal

Universidade de Coimbra, Portugal

Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2011/04/01 - 2014/12/31 Pesquisa de proteínas candidatas a marcadores para a resistência de Coffea arabica a Hemileia vastatrix (ferrugem alaranjada)
PTDC/AGR-GPL/109990/2009
Instituto de Investigação Científica Tropical, Portugal

Universidade Nova de Lisboa Instituto de Higiene e Medicina Tropical, Portugal

Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal

Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2011/04/01 - 2014/12/31 Pesquisa dos mecanismos de defesa do cafeeiro associados à sua resistência a Colletotrichum kahawae
PTDC/AGR-GPL/112217/2009
Instituto de Investigação Científica Tropical, Portugal

Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2011/01/01 - 2014/06/30 A perspectiva do patogénio das interacções moleculares planta-microorganismo: genes expressos durante o processo de infecção da ferrugem alaranjada do cafeeiro - Hemileia vastatrix
PTDC/AGR-GPL/114949/2009
Instituto de Investigação Científica Tropical, Portugal

Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal

Universität Konstanz Fachbereich Biologie, Germany

Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2007/06/01 - 2011/03/31 Abordagem interdisciplinar para a caracterização de potenciais fontes de resistência durável do cafeeiro (Coffea spp.) à ferrugem alaranjada (Hemileia vastatrix).
PTDC/AGR-AAM/71866/2006
Instituto de Investigação Científica Tropical, Portugal

Institut de recherche pour le développement, France

Instituto de Biologia Experimental e Tecnológica, Portugal

Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
Outputs

Publications

Book chapter
  1. Guerra-Guimarães, Leonor; Diniz, Inês; Azinheira, Helena Gil; Loureiro, Andreia; Pereira, Ana Paula; Tavares, Sílvia; Batista, Dora; Varzea, Vitor; Silva, Maria do Céu Lavado da. "Coffee Leaf Rust Resistance: An Overview". Springer, 2023.
    10.1007/978-3-662-67273-0_2
  2. Inácio, Lurdes; Henriques, Joana; Guerra-Guimarães, Leonor; Azinheira, Helena; Lima, Arlindo; Sousa, Edmundo. "Platypus cylindrus Fab. (Coleoptera: Platypodidae) transports Biscogniauxia mediterranea, agent of cork oak charcoal canker". In Boletin de Sanidade Vegetal. Plagas, 181-186. Spain, 2011.
    Published
  3. Varzea, Vitor; Silva, Maria (3A1D-FDA1-6D8E); Guerra-Guimarães, Leonor; Ribeiro, Ana; Gouveia, Manuela; Azinheira, Helena; Rodrigues Jr, CJ. "A ferrugem do cafeeiro: uma revisão.". In Biologia Vegetal e Agro-Industrial, 87-102. Lisboa, Portugal: Edições Sílabo, 2004.
    Published
  4. Nunes, M. A.; Matos, M. C.; Azinheira, Helena; Quartin, V. L.. "Indirect effects of aluminium on photosynthesis and mineral concentration in triticales". In Photosynthesis: from Light to Biosphere, 3677-3680. Springer Netherlands, 1995.
    10.1007/978-94-009-0173-5_867
Conference abstract
  1. Talhinhas, P.; Loureiro, Andreia; Azinheira, H; A. Cabral; NASCIMENTO, T; Conceição, Nuno; OLIVEIRA, H. "Geographic and temporal population dynamics of the olive anthracnose pathogens". Paper presented in ” Plenary lesson in 9th IOBC – WPRS (International Organisation for Biological Control – West Paleartic Region Section), LISBOA, 2022.
    Accepted
  2. Nascimento, Teresa; Cabral, Ana; Azinheira, Helena; Oliveira, Maria Helena. "Fungos do género Colletotrichum isolados do lenho da videira: endófitos ou patogénicos?". Paper presented in 2º Simpósio SCAP de Proteção das Plantas; 8º Congresso da Sociedade Portuguesa de Fitopatologia e 11º Encontro Nacional de Proteção Integrada, Santarém, 2017.
    Published
Conference paper
  1. Azinheira, Helena Gil; Santos, Marina do Rosário; Guerra-Guimarães, Leonor; Pinheiro, Carla; Diniz, Inês; Ferrari, Valentina; Loureiro, Andreia; Tavares, Silvia; Silva, Maria do Céu. "Exploring the role of sugars in the Kawisari coffee resistance to Hemileia vastatrix". 2023.
  2. Barros, Danielle Ribeiro de; Diniz, Inês; Guerra-Guimarães, Leonor; Azinheira, Helena Gil; Silva, Maria do Céu; Batista, Dora. "Evaluation of virus-induced gene silencing (VIGS) in coffee plants". 2023.
  3. Cabral, Ana; Carvalho, Jessica; Talhinhas, Pedro; Baroncelli, Riccardo; Shittu, Taiwo; Loureiro, Andreia; Varzea, Vitor; et al. "First report of a genome sequence resource of Colletotrichum kahawae, the causal agent of coffee berry disease". 2023.
  4. Azevedo, Herlander; Diniz, Inês; Figueiredo, Andreia; Guedes, Fernanda Alves Freitas; Sebastiana, Mónica Guita; Azinheira, Helena Gil; Barros, Danielle; et al. "Characterization of the transcriptional signatures associated with resistance and susceptibility to Hemileia vastatrix in the Kawisari coffee hybrid". 2023.
  5. Guerra-Guimarães, Leonor; Azevedo, Herlander; Diniz, Inês; Carrera, Jéfyne; Guedes, Fernanda A.F.; Pinheiro, Carla; Azinheira, Helena Gil; et al. "Integrative transcriptomic and metabolomic approaches to unravel the resistance profile of Kawisari coffee against Hemileia vastatrix". 2023.
  6. Guerra-Guimarães, Leonor; Carrera, Jéfyne; Santos, Marina do Rosário; Pinheiro, Carla; E-MohsinaFerdous, Manzur; Diniz, Inês; Loureiro, Andreia; et al. "Assessment of carbon metabolism of Coffee Kawisari hybrid challenged by Hemileia vastatrix, the causal agent of Coffee Leaf Rust.". 2023.
  7. Azinheira, Helena. "Fracção proteica de “feijões” de Cabo Verde. Caracterização da fracção solúvel em soluções salinas". Paper presented in 2ª Jornadas das Indústrias Agro-Alimentares, Lisboa, 1996.
    Published
Conference poster
  1. Talhinhas, P.; Loureiro, Andreia; Azinheira, H; Ana Cabral (9313-EC61-442C); NASCIMENTO, T; OLIVEIRA, H. "A gafa vai mudar? Espécies de Colletotrichum em Portugal". Paper presented in IX Simpósio Nacional de Olivicultura, 2021.
  2. Tavares, Silvia; Link, T.; Azinheira, H; Voegele, R.T.; THORDAL-CHRISTENSEN, H; SILVA, M.C; Pedro Talhinhas. "Identification of Hemileia vastatrix candidate effectors reveals new ways of promoting pathogen variability through alternative splicing". Paper presented in 28th International Conference on Coffee Science (ASIC), 2021.
  3. Cabral, A.; CARVALHO, J.; OLIVEIRA, H; Azinheira, H. Corresponding author: Azinheira, H. "Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation revealed an alkaline phytoceramidase that is required in pathogenicity of Colletotrichum kahawae to Coffea arabica". Paper presented in 28th International Conference on Coffee Science (ASIC), 2021.
  4. Diniz, I; A. Figueiredo; Sebastiana, Mónica; MUNOZ-PAJARES, J; Valverde, Javier; Azevedo, Herlander; RODRIGUES A.S.; et al. "First steps on the resistance profiling of Kawisari coffee hybrid through cytological and gene expression analyses". Paper presented in 28th International Conference on Coffee Science (ASIC), 2021.
  5. TAVARES, S; Azinheira, H; SANTOS, D.; Batista, Dora; Várzea, V.; Pedro Talhinhas; Silva, Maria (3A1D-FDA1-6D8E). "Identification of NLR proteins in the coffee genotype HDT 8232/2 challenged with Hemileia vastatrix (host resistance) and Uromyces vignae (nonhost resistance)". Paper presented in 28th International Conference on Coffee Science (ASIC), 2021.
  6. Azinheira, Helena; Ana Cabral (9313-EC61-442C); Pedro Talhinhas; Maria do Céu Silva; Maria Teresa Nascimento; Maria Helena Oliveira; Vitor Várzea. "Agrobacterium tumefaciens-Mediated Transformation: an efficient tool for pathogenicity studies on Colletotrichum kahawae". Paper presented in International Conference on Coffee Science (ASIC), 13-19 November 2016, Kunming, China. Association for Science and Information on Coffee., 2016.
  7. Azinheira, Helena; Silva, Maria (3A1D-FDA1-6D8E); Diniz, Inês; Figueiredo, A.; Guerra-Guimarães, Leonor; Batista, Dora. "Unveiling the coffee defence mechanisms against Colletotrichum kahawae". Paper presented in 26th International Conference on Coffee Science (ASIC), 13-19 November 2016, Kunming, China. Association for Science and Information on Coffee, 2016.
Journal article
  1. Tavares, Sílvia; Azinheira, Helena; Valverde, Javier; Muñoz-Pajares, A. Jesus; Talhinhas, Pedro; Silva, Maria do Céu. "Identification of HIR, EDS1 and PAD4 genes reveals differences between Coffea species that may impact disease resistance". (2023): http://hdl.handle.net/10400.5/28017.
  2. Talhinhas, Pedro; Carvalho, Rita; Tavares, Sílvia; Ribeiro, Teresa; Azinheira, Helena; Ramos, Ana Paula; Silva, Maria do Céu; et al. "Diploid Nuclei Occur throughout the Life Cycles of Pucciniales Fungi". (2023): http://hdl.handle.net/10400.5/28714.
    10.1128/spectrum.01532-23
  3. Maria do Céu Silva; Leonor Guerra-Guimarães; Inês Diniz; Andreia Loureiro; Helena Azinheira; Ana P. Pereira; Sílvia Tavares; Dora Batista; Vítor Várzea. "An Overview of the Mechanisms Involved in Coffee-Hemileia vastatrix Interactions: Plant and Pathogen Perspectives". Agronomy 12 2 (2022): 326-326. https://doi.org/10.3390/agronomy12020326.
    10.3390/agronomy12020326
  4. Guilengue, Norberto; Azinheira, Helena G.; Alves, Sofia; Neves-Martins, João; Talhinhas, Pedro; Morais-Cecilio, Leonor. "The Analysis of Partial Sequences of the Flavonone 3 Hydroxylase Gene in Lupinus mutabilis Reveals Differential Expression of Two Paralogues Potentially Related to Seed Coat Colour". (2022): http://hdl.handle.net/10400.5/23455.
  5. Cabral, Ana; Azinheira, Helena G.; Talhinhas, Pedro; Batista, Dora; Ramos, Ana Paula; Silva, Maria do Céu; Oliveira, Helena; Várzea, Vítor; Azinheira, Helena. "Pathological, Morphological, Cytogenomic, Biochemical and Molecular Data Support the Distinction between Colletotrichum cigarro comb. et stat. nov. and Colletotrichum kahawae". Plants 9 4 (2020): 502. http://dx.doi.org/10.3390/plants9040502.
    10.3390/plants9040502
  6. Monteiro, Ângelo; Colomban, Silvia; Azinheira, Helena; Guerra-Guimarães, Leonor; Silva, Maria do Céu; Navarini, Luciano; Resmini, Marina. "Dietary antioxidants in coffee leaves: impact of botanical origin and maturity on chlorogenic acids and xanthones". (2020): http://hdl.handle.net/10400.5/19345.
    10.3390/antiox9010006
  7. I. Diniz; H. Azinheira; A. Figueiredo; E. Gichuru; H. Oliveira; L. Guerra-Guimarães; M.C. Silva. "Fungal penetration associated with recognition, signaling and defence-related genes and peroxidase activity during the resistance response of coffee to Colletotrichum kahawae". Physiological and Molecular Plant Pathology 105 (2019): 119-127. https://doi.org/10.1016%2Fj.pmpp.2017.12.005.
    10.1016/j.pmpp.2017.12.005
  8. Diniz I; Figueiredo A; Loureiro A; Batista D; Azinheira H; Várzea V; Pereira AP; et al. "A first insight into the involvement of phytohormones pathways in coffee resistance and susceptibility to Colletotrichum kahawae.". PloS one (2017): http://europepmc.org/abstract/med/28542545.
    10.1371/journal.pone.0178159
  9. Batista, Dora; Silva, Diogo N.; Cabral, Ana; Pires, Ana S.; Loureiro, Andreia; Guerra-Guimarães, Leonor; Pereira, Ana P.; et al. "Legitimacy and implications of reducing Colletotrichum kahawae to subspecies in plant pathology". (2017): http://hdl.handle.net/10400.5/13717.
    10.3389/fpls.2016.0251
  10. Talhinhas P; Batista D; Diniz I; Vieira A; Silva DN; Loureiro A; Tavares S; et al. "The coffee leaf rust pathogen Hemileia vastatrix: one and a half centuries around the tropics.". (2016): http://europepmc.org/abstract/med/27885775.
    10.1111/mpp.12512
  11. Vieira A; Cabral A; Fino J; Azinheira HG; Loureiro A; Talhinhas P; Pires AS; et al. "Comparative Validation of Conventional and RNA-Seq Data-Derived Reference Genes for qPCR Expression Studies of Colletotrichum kahawae.". (2016): http://europepmc.org/abstract/med/26950697.
    10.1371/journal.pone.0150651
  12. Andreia Loureiro; Helena Gil Azinheira; Maria do Céu Silva; Pedro Talhinhas. "A method for obtaining RNA from Hemileia vastatrix appressoria produced in planta , suitable for transcriptomic analyses". Fungal Biology 119 11 (2015): 1093-1099. https://doi.org/10.1016%2Fj.funbio.2015.08.008.
    10.1016/j.funbio.2015.08.008
  13. Silva DN; Duplessis S; Talhinhas P; Azinheira H; Paulo OS; Batista D. "Genomic Patterns of Positive Selection at the Origin of Rust Fungi.". (2015): http://europepmc.org/abstract/med/26632820.
    10.1371/journal.pone.0143959
  14. A. S. Pires; H. G. Azinheira; A. Cabral; S. Tavares; D. Tavares; M. Castro; V. Várzea; et al. "Cytogenomic characterization ofColletotrichum kahawae, the causal agent of coffee berry disease, reveals diversity in minichromosome profiles and genome size expansion". Plant Pathology 65 6 (2015): 968-977. https://doi.org/10.1111%2Fppa.12479.
    10.1111/ppa.12479
  15. Tavares, S.; Ramos, A.P.; Pires, A.S.; Azinheira, H.G.; Caldeirinha, P.; Link, T.; Abranches, R.; et al. "Genome size analyses of Pucciniales reveal the largest fungal genomes". Frontiers in Plant Science 5 AUG (2014): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84907339465&partnerID=MN8TOARS.
    10.3389/fpls.2014.00422
  16. Talhinhas, P.; Azinheira, H.G.; Vieira, B.; Loureiro, A.; Tavares, S.; Batista, D.; Morin, E.; et al. "Overview of the functional virulent genome of the coffee leaf rust pathogen Hemileia vastatrix with an emphasis on early stages of infection". Frontiers in Plant Science 5 MAR (2014): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84901033492&partnerID=MN8TOARS.
    10.3389/fpls.2014.00088
  17. Diniz, I.; Talhinhas, P.; Azinheira, H.G.; Várzea, V.; Medeira, C.; Maia, I.; Petitot, A.-S.; et al. "Cellular and molecular analyses of coffee resistance to Hemileia vastatrix and nonhost resistance to Uromyces vignae in the resistance-donor genotype HDT832/2". European Journal of Plant Pathology 133 1 (2012): 141-157. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84859100627&partnerID=MN8TOARS.
    10.1007/s10658-011-9925-9
  18. Vieira, A.; Talhinhas, P.; Loureiro, A.; Thürich, J.; Duplessis, S.; Fernandez, D.; do Céu Silva, M.; Paulo, O.S.; Azinheira, H.G.. "Expression profiling of genes involved in the biotrophic colonisation of Coffea arabica leaves by Hemileia vastatrix". European Journal of Plant Pathology 133 1 (2012): 261-277. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84859110416&partnerID=MN8TOARS.
    10.1007/s10658-011-9864-5
  19. Fernandez, D.; Tisserant, E.; Talhinhas, P.; Azinheira, H.; Vieira, A.; Petitot, A.-S.; Loureiro, A.; et al. "454-pyrosequencing of Coffea arabica leaves infected by the rust fungus Hemileia vastatrix reveals in planta-expressed pathogen-secreted proteins and plant functions in a late compatible plant-rust interaction". Molecular Plant Pathology 13 1 (2012): 17-37. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-83055173107&partnerID=MN8TOARS.
    10.1111/j.1364-3703.2011.00723.x
  20. Vieira, A.; Talhinhas, P.; Loureiro, A.; Duplessis, S.; Fernandez, D.; Silva, M.D.C.; Paulo, O.S.; Azinheira, H.G.. "Validation of RT-qPCR reference genes for in planta expression studies in Hemileia vastatrix, the causal agent of coffee leaf rust". Fungal Biology 115 9 (2011): 891-901. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-80052029845&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.funbio.2011.07.002
  21. Azinheira, H.G.; do Silva, M.C.; Talhinhas, P.; Medeira, C.; Maia, I.; Petitot, A.-S.; Fernandez, D.. "Non-host resistance responses of Arabidopsis thaliana to the coffee leaf rust fungus (Hemileia vastatrix)". Botany 88 7 (2010): 621-629. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-77954913755&partnerID=MN8TOARS.
    10.1139/B10-039
  22. Silva, M.D.C.; Várzea, V.; Guerra-Guimarães, L.; Azinheira, H.G.; Fernandez, D.; Petitot, A.-S.; Bertrand, B.; Lashermes, P.; Nicole, M.. "Coffee resistance to the main diseases: Leaf rust and coffee berry disease". Brazilian Journal of Plant Physiology 18 1 (2006): 119-147. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-33745474076&partnerID=MN8TOARS.
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    Published
  24. Quartin, V.L.; Azinheira, H.G.; Nunes, M.A.. "Phosphorus deficiency is responsible for biomass reduction of triticale in nutrient solution with aluminum". Journal of Plant Nutrition 24 12 (2001): 1901-1911. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0035665494&partnerID=MN8TOARS.
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  25. Alarcão-E-Silva, M.L.C.M.M.; Leitão, A.E.B.; Azinheira, H.G.; Leitão, M.C.A.. "The Arbutus Berry: Studies on its Color and Chemical Characteristics at Two Mature Stages". Journal of Food Composition and Analysis 14 1 (2001): 27-35. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0035742166&partnerID=MN8TOARS.
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  26. Gi´rio, F.M; Amaro, C; Azinheira, H; Pelica, F; Amaral-Collaço, M.T. "Polyols production during single and mixed substrate fermentations in Debaryomyces hansenii". Bioresource Technology 71 3 (2000): 245-251. http://dx.doi.org/10.1016/s0960-8524(99)00078-4.
    10.1016/s0960-8524(99)00078-4
  27. Ramalho, J.C.; Pons, T.L.; Groeneveld, H.W.; Azinheira, H.G.; Nunes, M.A.. "Photosynthetic acclimation to high light conditions in mature leaves of Coffea arabica L.: Role of xanthophylls, quenching mechanisms and nitrogen nutrition". Australian Journal of Plant Physiology 27 1 (2000): 43-51. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0034010488&partnerID=MN8TOARS.
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    10.1080/01904160009382005
  29. Martins, Luisa Louro; Azinheira, Helena; MOURATO, MIGUEL; Cabral, Fernanda; Bruno sousa, RX. "Electrophoretic changes by heat of isoperoxidases from green bean". Agronomia Lusitana 47 (1999): 317-325.
  30. Azinheira, H.G.; Louro Martins, Luisa; Sousa, Raul Bruno; Carvalho, I.; Sousa, M.M.. "Caracterização da fracção de albuminas de algumas variedades de feijões de Cabo Verde". (1997): http://hdl.handle.net/10400.5/16178.
  31. Alarcão-Silva, M.L.; Gil Azinheira, H.; Januário, M.I.N.; Leitão, M.C.A.; Curado, T.C.; Alarcão-e-Silva, M.L.; Azinheira, H.G.. "Production of hypocaloric jellies of grape juice with sunflower pectin". Progress in Biotechnology 14 C (1996): 931-939. https://doi.org/10.1016/S0921-0423(96)80336-4.
    Published • 10.1016/S0921-0423(96)80336-4
  32. Leitão, M.C.A.; Silva, M.L.A.; Januário, M.I.N.; Azinheira, H.G.. "Galacturonic acid in pectic substances of sunflower head residues: quantitative determination by HPLC". Carbohydrate Polymers 26 3 (1995): 165-169. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0344022410&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/0144-8617(95)00003-P
Thesis / Dissertation
  1. Carvalho, Rita Maria Domingues. "Cytogenomics and cytological approaches disclose the occurrence of diploid nuclei throughout the life cycles of Pucciniales fungi and reveal a unique heterokaryotic system". Master, 2021. http://hdl.handle.net/10400.5/23532.
  2. Carvalho, Jessica Pereira. "Identificação e caracterização de genes de patogenicidade do fungo Colletotrichum kahawae, agente causal da antracnose dos frutos verdes do cafeeiro". Master, 2021. http://hdl.handle.net/10400.5/23522.
Activities

Oral presentation

Presentation title Event name
Host (Event location)
2019/10/17 Cytogenomic analyses reveal nuclear content variation along the life cycles of the Pucciniales fungi and enable the distinction of heterokaryotic nuclei 18th Congress of European Mycologists, 16-21 October 2019, Warsaw-Bialowieza. Poland
Polish Mycological Society and European Mycological Association. (Warsaw-Bialowieza, Poland)

Supervision

Thesis Title
Role 		Degree Subject (Type)
Institution / Organization
2023/03 - Current Identificação e caracterização de genes de patogenicidade do fungo Hemileia vastatrix, agente causal da ferrugem nas folhas do cafeeiro
Co-supervisor
 Engenharia Agronómica, especialização em Hortofruticultura e Viticultura (Master)
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2020/04/01 - 2021/03/18 Identificação e caracterização de genes de patogenicidade do fungo Colletotrichum kahawae, agente causal da antracnose dos frutos verdes do cafeeiro
Co-supervisor
 Engenharia Agronómica (Master)
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2021 - 2021 Cytogenomics and cytological approaches disclose the occurrence of diploid nuclei throughout the life cycles of Pucciniales fungi and reveal a unique heterokaryotic system
Co-supervisor
 Biologia dos Recursos Vegetais (Master)
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2019/09/15 - 2020/10/25 Characterisation of mating type loci in Pucciniales fungi based on a unique heterokaryotic system
Co-supervisor
 Mestrado em Biologia dos Recursos Vegetais, (Master)
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2019/03/25 - 2019/12/19 Análise da interação Coffea arabica – Hemileia vastatrix e estudo do tamanho do genoma de Coffea spp
Co-supervisor
 Licenciatura em Biotecnologia
2019/02/01 - 2019/11/18 ANÁLISE DA INTERAÇÃO COFFEA ARABICA – HEMILEIA VASTATRIX e ESTUDO DO TAMANHO DO GENOMA DE COFFEA SPP.
Co-supervisor
 Biotecnologia (Degree)
Instituto Politécnico de Setúbal, Portugal
2018/04/01 - 2019/11/05 Actividade antifungica de extratos de Baccharis glutinosa Pers. sobre la roya (Hemileia vastratix) del cafeto: Enfoque metabolómico y génico
Co-supervisor
 Doctora en Ciencias de los Alimentos y Biotecnología (PhD)
Instituto Tecnológico de Tuxtla Gutiérrez, Mexico
2017/03/01 - 2017/06/30 Variação do nível de ploidia ao longo do ciclo celular de Hemileia vastatrix
Co-supervisor
 Biologia (Other)
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2017/01/03 - 2017/06/30 Identificação e caracterização de mutantes de fungos fitopatogénicos gerados por transformação mediada por Agrobacterium tumefaciens
Co-supervisor
 Biologia
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2017/03/01 - 2017/06/28 Estudo da expressão de genes envolvidos no desenvolvimento sexual de Colletotrichum kahawae
Co-supervisor
 Biologia
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal

Jury of academic degree

Topic
Role 		Candidate name (Type of degree)
Institution / Organization
2019/11/05 Actividade antifungica de extratos de Baccharis glutinosa Pers. sobre la roya (Hemileia vastratix) del cafeto: Enfoque metabolómico y génico
Supervisor
 Anayancy Lam Gutiérrez (PhD)
Instituto Tecnológico de Tuxtla Gutiérrez, Mexico
2018/04/19 Taylor-made plant cell cultures for the improved production of recombinant proteins
(Thesis) Arguer
 Ana Rita Basílio Santos (PhD)
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2017/06/28 Estudo da expressão de genes envolvidos no desenvolvimento sexual de Colletotrichum kahawae Sofia Pereira (Other)
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal

Course / Discipline taught

Academic session Degree Subject (Type) Institution / Organization
2019/09/15 - Current Biotecnologia Vegetal Engenharia Agronómica (Mestrado) Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2017/09/15 - Current Técnica Laboratoriais em Química e Bioquímica Engenharia Alimentar (Mestrado integrado) Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2016/03/01 - Current Química Orgânica e Bioquímica Ciências de Engenharia - Engenharia Agronómica (Licenciatura) Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2015/09/15 - Current Microbiologia e Bioquímica dos Alimentos Engenharia Alimentar (Mestrado integrado) Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal

Evaluation committee

Activity description
Role 		Institution / Organization Funding entity
2020/11/15 - 2022/06 Guest Editor in the Special Issue "Plant Pathogens in a Global Change Context" of the Journal of Microorganisms (ISSN 2076-2607).
Evaluator
 MDPI AG, Switzerland
Distinctions

Other distinction

2012 Fellowship in IRD - Montpellier
2011 Fellowship in IRD Montpellier
2010 Fellowship in IRD - Montpellier France and INRA - Nancy
2008 Fellowship in Rostock University
2008 Fellowship in IRD - Montpellier France
2007 Fellowship in Rostock University
2007 Fellowship in IRD Montpellier - France
2004 Fellowship Programa de Cooperação Científica e Técnica Luso Alemã
2003 Fellowship Programa de Cooperação Científica e Técnica Luso Alemã
2000 Fellowship in Konstanz University
1997 Fellowship
Mediterranean Agronomic Institute of Chania, Greece