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Identification

Personal identification

Full name
Cláudia Oliveira

Citation names

  • Oliveira, Cláudia

Author identifiers

Ciência ID
AA15-5A84-244A
ORCID iD
0000-0002-5947-4361

Telephones

Telephone
  • 234370774 (Professional)

Addresses

  • Biology Department, university of Aveiro, 3810-193 A, Aveiro, Aveiro, Portugal (Professional)

Websites

  • www.cesam.ua.pt/csoliveira (Scholar)
Education
Degree Classification
2007/07/01
Concluded
Biologia (Doutoramento)
Major in Não Aplicável
Universidade de Aveiro, Portugal
2001/07/01
Concluded
Microbiologia Molecular (Mestrado)
Major in Não Aplicável
Universidade de Aveiro, Portugal
1996/07/01
Concluded
Biologia (Licenciatura)
Major in Não Aplicável
Universidade de Aveiro, Portugal
Affiliation

Science

2010/03/01 - 2016/06/30 Postdoc (Research)
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
2007/03/01 - 2010/02/28 Postdoc (Research)
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal

Teaching in Higher Education

2016/09/15 - 2020/09/14 Invited Assistant Professor (University Teacher)
Universidade de Aveiro, Portugal
2013/09/15 - 2016/09/14 Invited Assistant Professor (University Teacher)
Universidade de Aveiro, Portugal

Other Careers

1997/09/01 - 1999/03/01 Professor do ensino básico e secundário (Professor do ensino básico e secundário)
Ministério da Educação, Portugal

Others

2010/04/11 - 2010/07/12 Licença de maternidade
Universidade de Aveiro, Portugal
Projects

Contract

Designation Funders
2012 - 2015/09/30 PhytoMarsh - A Fitosfera de plantas de sapal: um "hot-spot" microbiano pouco explorado
PTDC/AAC-AMB/118873/2010
Researcher
Universidade de Aveiro, Portugal

Universidade de Aveiro Centro de Estudos do Ambiente e do Mar, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2013 - 2014/12/02 Genes em movimento: Como capturar os genes móveis em comunidades microbianas?
EXPL/BIA-MIC/1567/2012
Principal investigator
Universidade de Aveiro, Portugal

Universidade de Aveiro Centro de Estudos do Ambiente e do Mar, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2010 - 2013/10/05 SEAGULL - Identificação de fontes difusas de poluição fecal em ambientes naturais: dados para avaliação do risco.
PTDC/AAC-AMB/109155/2008
Researcher
Universidade de Aveiro, Portugal

Universidade de Aveiro Centro de Estudos do Ambiente e do Mar, Portugal

Instituto Politécnico de Leiria, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2005 - 2007/07/01 Estabilidade conformacional de proteinases aspárticas com importãnci biotecnológica e médica - O unfolding/refolding de proteínas diméricas e monoméricas
POCI/QUI/60791/2004
Researcher
Universidade Católica Portuguesa, Portugal

Universidade de Aveiro, Portugal

Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
1999 - 2001 How do Organic Solvents Affect Cardosin A and Cardosin B Activity and Structure. The use of Cardosins in New Strategies and New Tactics for Routine Peptide Synthesis.
Praxis/P/QUI/10131/98
Scientific Initiation Fellow
Universidade de Aveiro, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Outputs

Publications

Conference abstract
  1. Oliveira, Cláudia; Ana Cristina Esteves; Marlene Maria Tourais de Barros; David Pina; Enrique Villar. "Structural stability characterisation of cardosin A from Cynara cardunculus L.: enzymic, spectroscopic and calorimetric studies.". Paper presented in 27th FEBS Congress, Lisboa, 2001.
    Published
Conference paper
  1. Oliveira, Cláudia; Ana Cristina Esteves; Henrique lopes; Rui Miguel Pinheiro Vitorino; Euclides Manuel Vieira Pires; Maria do Rosário Domingues; Marlene Maria Tourais de Barros. "Purification and characterisation of aspartic proteinases from C. cardunculus L". Paper presented in 30th FEBS Congress and the 9th IUBMB Conference., Budapeste, 2005.
    Accepted
Conference poster
  1. Maria Elisabete Costa; Hugo Almeida; Oliveira, Cláudia; Maria Helena V. Fernandes. "Antibacterial Nanostructured Polyurethane Composite Membranes". Paper presented in 29th European Conference on Biomaterials, 2018.
  2. Diana Salvador; Inês Roxo; Oliveira, Cláudia; Elmano Ramalheira; Sonia Ferreira; Isabel da Silva Henriques. "Molecular analysis of 3rd generation cephalosporin-resistant Enterobacteriaceae in Centro Hospitalar do Baixo Vouga, Aveiro.". Paper presented in Microbiotech, 2017.
  3. Susana Araújo; Laura Leite; Marta Tacão; Oliveira, Cláudia; Artur Alves; Isabel da Silva Henriques. "Effect of metal contamination on antibiotic resistance traits in epiphytic bacteria". Paper presented in 3rd International Symposium on the Environmental Dimension of Antibiotic Resistance, 2015.
  4. Marinélia Capela; Oliveira, Cláudia; António Carlos Matias Correia; Maria Helena Fernandes. "Sol-gel bioactive glasses modified with silver: processing and properties". Paper presented in XIIISBPMMat (Sociedade Portuguesa de Materiais), 2014.
  5. Diogo Almeida; Oliveira, Cláudia; António Carlos Matias Correia; Maria Helena Fernandes. "The role of nanoZnO on the bioactive and antibacterial properties of Polyurethane – ZnO composites". Paper presented in 5th International Conference on Advanced Nano Materials (ANM2014), 2014.
  6. Sónia Martins; Alexandra Moura; Oliveira, Cláudia; António Carlos Matias Correia. "The gene pool of sequenced plasmids – what can we learn?". Paper presented in MICROBIOTEC’13, 2013.
  7. Oliveira, Cláudia; Anabela de Oliveira Pereira; Isabel da Silva Henriques; António Carlos Matias Correia. "Conjugative plasmids from seagull feces are diverse in their molecular structure and carry resistance to last resort antibiotics.". Paper presented in FEMS 2013, 2013.
  8. Oliveira, Cláudia; Alexandra Moura; Isabel da Silva Henriques; Linda rogers; Eva Top; António Carlos Matias Correia. "Comparative genomics and resistance phenotypes of IncP-1epsilon plasmids from estuarine waters". Paper presented in International Plasmid Biology Conference, 2012.
  9. Julina Azevedo; Isabel Ramos; Oliveira, Cláudia; Isabel da Silva Henriques; António Carlos Matias Correia. "Unraveling differences between bacterioplankton and bacterioneuston: universal or specific primers?". Paper presented in 10th International Symposium on Bacterial Genetics and Ecology (BAGECO10 2009), 2009.
  10. Oliveira, Cláudia; Valentina Bresciani; Adelaide Almeida; António Carlos Matias Correia. "Conjugative gene transfer and BHR plasmids from the SML and subsurface waters: an estuary from Portugal as a case study". Paper presented in 10th International Symposium on Bacterial Genetics and Ecology, 2009.
  11. Ana Cristina Esteves Sarmento; Oliveira, Cláudia; Anabela de Oliveira Pereira; Euclides Manuel Vieira Pires; Marlene Maria Tourais de Barros. "A case study: cardosin A as a model for aspartic proteinases conformational stability". Paper presented in 7th International Conference on Mobile Data Management - Copyright, 2007.
    10.1109/mdm.2006.3
  12. Ana sofia Fraga; Ana Cristina Esteves Sarmento; Oliveira, Cláudia; Euclides Manuel Vieira Pires; Marlene Maria Tourais de Barros. "Unfolding of cardosin A, an aspartic protease, in the presence of TFE/water mixtures". Paper presented in 7th International Conference on Protein Stabilisation, 2007.
Journal article
  1. Capela, M.N.; Tobaldi, D.M.; Oliveira, C.; Pereira, A.; Duarte, A.S.; Seabra, M.P.; Fernandes, M.H.V.. "Bioactivity and antibacterial activity against E-coli of calcium-phosphate-based glasses: Effect of silver content and crystallinity". Ceramics International 43 16 (2017): 13800-13809. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85024832652&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.ceramint.2017.07.100
  2. Henriques, I.; Tacão, M.; Leite, L.; Fidalgo, C.; Araújo, S.; Oliveira, C.; Alves, A.. "Co-selection of antibiotic and metal(loid) resistance in gram-negative epiphytic bacteria from contaminated salt marshes". Marine Pollution Bulletin 109 1 (2016): 427-434. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84975509592&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.marpolbul.2016.05.031
  3. Oliveira, Cláudia. "Porcelain stoneware with antimicrobial action". Ceramics International (2014): http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0272884213015113.
    10.1016/j.ceramint.2013.11.056
  4. Oliveira, C.S.; Moura, A.; Henriques, I.; Brown, C.J.; Rogers, L.M.; Top, E.M.; Correia, A.. "Comparative genomics of IncP-1e plasmids from water environments reveals diverse and unique accessory genetic elements". Plasmid (2013): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84880608081&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.plasmid.2013.06.002
  5. Azevedo, J.S.N.; Araújo, S.; Oliveira, C.S.; Correia, A.; Henriques, I.. "Analysis of antibiotic resistance in bacteria isolated from the surface microlayer and underlying water of an estuarine environment". Microbial Drug Resistance 19 1 (2013): 64-71. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84872972885&partnerID=MN8TOARS.
    10.1089/mdr.2012.0084
  6. Oliveira, C.S.; Lázaro, B.; Azevedo, J.S.N.; Henriques, I.; Almeida, A.; Correia, A.. "New molecular variants of epsilon and beta IncP-1 plasmids are present in estuarine waters". Plasmid 67 3 (2012): 252-258. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84859896762&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.plasmid.2011.11.002
  7. Azevedo, J.S.N.; Ramos, I.; Araújo, S.; Oliveira, C.S.; Correia, A.; Henriques, I.S.. "Spatial and temporal analysis of estuarine bacterioneuston and bacterioplankton using culture-dependent and culture-independent methodologies". Antonie van Leeuwenhoek, International Journal of General and Molecular Microbiology 101 4 (2012): 819-835. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84862651668&partnerID=MN8TOARS.
    10.1007/s10482-012-9697-z
  8. Moura, A.; Oliveira, C.; Henriques, I.; Smalla, K.; Correia, A.. "Broad diversity of conjugative plasmids in integron-carrying bacteria from wastewater environments". FEMS Microbiology Letters 330 2 (2012): 157-164. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84859439313&partnerID=MN8TOARS.
    10.1111/j.1574-6968.2012.02544.x
  9. Cardoso, T.; Oliveira, C.; Sarmento, A.C.; Pereira, A.; Nutley, M.A.; Jess, T.; Kelly, S.M.; et al. "Acetonitrile-induced unfolding of porcine pepsin A. A proposal for a critical role of hydration structures in conformational stability". International Journal of Biological Macromolecules 45 3 (2009): 213-220. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-67651036201&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.ijbiomac.2009.05.006
  10. Sarmento, A.C.; Lopes, H.; Oliveira, C.S.; Vitorino, R.; Samyn, B.; Sergeant, K.; Debyser, G.; et al. "Multiplicity of aspartic proteinases from Cynara cardunculus L.". Planta 230 2 (2009): 429-439. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-67649470404&partnerID=MN8TOARS.
    10.1007/s00425-009-0948-9
  11. Sarmento, A.C.; Oliveira, C.S.; Pereira, A.; Esteves, V.I.; Moir, A.J.G.; Saraiva, J.; Pires, E.; Barros, M.. "Unfolding of cardosin A in organic solvents and detection of intermediaries". Journal of Molecular Catalysis B: Enzymatic 57 1-4 (2009): 115-122. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-64049089681&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.molcatb.2008.08.004
  12. Oliveira, C.S.; Sarmento, A.C.; Pereira, A.; Correia, I.; Pessoa, J.C.; Esteves, V.I.; Fonseca, H.M.A.C.; Pires, E.; Barros, M.T.. "Non-native states of cardosin A induced by acetonitrile: Activity modulation via polypeptide chains rearrangements". Journal of Molecular Catalysis B: Enzymatic 61 3-4 (2009): 274-278. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-72149096808&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.molcatb.2009.08.003
  13. Sarmento, A.C.; Oliveira, C.S.; Duarte, A.S.; Pires, E.; Barros, M.T.. "Evaluation of cardosin A as a probe for limited proteolysis in non-aqueous environments - Complex substrates hydrolysis". Enzyme and Microbial Technology 38 3-4 (2006): 415-421. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-28844503160&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.enzmictec.2005.06.010
  14. Shnyrova, A.V.; Oliveira, C.S.; Sarmento, A.C.; Barros, M.T.; Zhadan, G.G.; Roig, M.G.; Shnyrov, V.L.. "Effect of acetonitrile on Cynara cardunculus L. cardosin A stability". International Journal of Biological Macromolecules 39 4-5 (2006): 273-279. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-33750181319&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.ijbiomac.2006.04.007
  15. Sarmento, A.C.; Oliveira, C.S.; Pires, E.M.; Halling, P.J.; Barros, M.T.. "Evaluation of cardosin A as a proteolytic probe in the presence of organic solvents". Journal of Molecular Catalysis B: Enzymatic 31 4-6 (2004): 137-141. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-8644265982&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.molcatb.2004.09.001
  16. Sarmento, A.C.; Oliveira, C.; Pires, E.; Amado, F.; Barros, M.. "Reverse hydrolysis by cardosin A: Specificity considerations". Journal of Molecular Catalysis B: Enzymatic 28 1 (2004): 33-37. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-1842535399&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.molcatb.2004.02.001
  17. Pina, D.G.; Oliveira, C.S.; Sarmento, A.C.; Barros, M.; Pires, E.; Zhadan, G.G.; Villar, E.; Gavilanes, F.; Shnyrov, V.L.. "Thermostability of cardosin A from Cynara cardunculus L.". Thermochimica Acta 402 1-2 (2003): 123-134. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0038206893&partnerID=MN8TOARS.
  18. Sarmento, A.C.; Oliveira, C.; Pires, E.; Halling, P.; Barros, M.. "Cardosin A as a model aspartic proteinase for the study of organic solvent effects: An overview on catalytic and structural aspects". Journal of Molecular Catalysis B: Enzymatic 21 1-2 (2003): 19-23. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0037413445&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/S1381-1177(02)00127-3
Thesis / Dissertation
  1. Oliveira, Cláudia. "Staphylococcus spp. presentes em cateteres intravenosos periféricos, seus fatores de virulência e resistência a antibióticos". Master, Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, 2019. http://hdl.handle.net/10773/26900.
  2. Oliveira, Cláudia. "Development of a web tool for the in silico characterization of plasmid data". Master, Universidade do Minho Escola de Engenharia, 2017. http://hdl.handle.net/1822/56109.
  3. Oliveira, Cláudia. "Diversidade de plasmídeos no ambiente e desenvolvimento de ferramentas moleculares para a sua caracterização". Master, Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, 2017. http://hdl.handle.net/10773/18630.
  4. Oliveira, Cláudia. "Molecular characterization of drug resistant clinical isolates". Master, Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, 2017. http://hdl.handle.net/10773/22609.
  5. Oliveira, Cláudia. "Plasmídeos com gama alargada de hospedeiros em ambientes estuarinos.". Master, Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, 2010. http://hdl.handle.net/10773/3515.
  6. Cortez, Maria Teresa de Sousa Coelho. "Abordagem molecular na resolução de problemas com biocorrosão". Master, Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, 2009. http://hdl.handle.net/10773/845.
  7. Oliveira, Cláudia. "Estados Conformacionais da cardosina A". PhD, Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, 2007. http://hdl.handle.net/10773/927.
  8. Oliveira, Cláudia. "Efeito dos solventes orgânicos na estrutura da cardosina A". Master, Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, 2001. http://hdl.handle.net/10773/25754.
Activities

Oral presentation

Presentation title Event name
Host (Event location)
2015/04/23 Plasmids: progresses and challenges Where are we now? SEMINARS IN BIODIVERSITY AND EVOLUTION
Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos (porto, Portugal)
2010/09/20 Does the surface microlayer environment select for specific microbial communities? Investigating the role of horizontal gene transfer. Biosphere-Atmosphere Interaction in a Changing Environment: from Local to Global Scale
Centre for Environmental and Marine Studies (CESAM), University of Aveiro (Aveiro, Portugal)
2008/09/03 Bacterioneuston versus bacterioplankton: culture independent approach to screen for broad host range plasmids, antibiotic resistance and integron gene sequences. International Plasmid Biology Conference (IPBC 2008)
The International Society for Plasmid Biology and other Mobile Genetic Elements (ISPB) (Gdansk, Poland)
2005/05/01 Old techniques with nowadays applications and promising perspectives IV Post-Graduation Symposium in Biosciences
Universidade de Aveiro (Aveiro, Portugal)
2004 A conformational and functional approach: effects of acetonitrile and chemical denaturants on an aspartic proteinase, cardosin A. ProtStab, 6th International Conference on Protein Stabilization
Applied Biocatalysis of the European Federation of Biotechnology (EFB-ESAB) (Bratislava, Slovakia)
2002/04/30 Studies of enzyme behaviour in non-conventional environments. I Post-Graduation Symposium in Biosciences
Departamento de Biologia, Universidade de Aveiro (Aveiro, Portugal)
2002/04/30 Limited proteolysis in mixed organic-aqueous solvent systems. A new tool for protein structure assessment. I Post-Graduation Symposium in Biosciences
Departamento de Biologia, Universidade de Aveiro (aveiro, Portugal)
2001/06/20 Cardosin A as a model aspartic proteinase for studies of enzyme behaviour in the presence of organic solvents. Applied Biocatalysis 1980-2020: The future impact of modelling proteins and thermodynamics
EFB European Section on Applied Biocatalysis (Trondheim, Norway)
2001 An overview of structural stability studies of proteins: cardosin A a plant aspartic proteinase with antifibrotic potential VIth International Symposium on Experimental Technics
Universidade Católica Portuguesa (viseu, Portugal)
2001 Limited Proteolysis, a tool for structural characterization of proteins. VI International Symposium on Experimental Technics
Centro Regional das Beiras da Universidade Católica Portuguesa (viseu, Portugal)
1997 Peptides with antimicrobiual activity. III International Symposium on Experimental Technics
Universidade de Trás os Montes e Alto Douro (Vila Real, Portugal)

Supervision

Thesis Title
Role
Degree Subject (Type)
Institution / Organization
2020/12/07 - 2021/07/02 Ironing Mycobacterial Infections: the identification and modulation of iron related mechanisms as part of new host-directed therapies
Co-supervisor of Rodrigo de Jesus Eusébio
Estágio de Licenciatura em Biologia (Other)
Universidade de Aveiro Centro de Estudos do Ambiente e do Mar, Portugal
2019/10/01 - 2020/12/21 Plasmídeos IncP-1 em Enterobacteriaceae resistentes a antibióticos
Supervisor of Sekerani Benedito Chidiamassamba
Mestrado em Microbiologia (Master)
Universidade de Aveiro Centro de Estudos do Ambiente e do Mar, Portugal
2018/07/19 - 2019/10/01 Staphylococcus spp. present in peripheral intravenous catheters, their virulence factors and antibiotic resistance
Co-supervisor of Vânia Silva Oliveira
Microbiologia (Master)
Universidade de Aveiro, Portugal
2019 - 2019 Resistência Bacteriana a Antibióticos Clinicamente relevantes em Meios Aquáticos Urbanos
Co-supervisor of Laura Pereira
Projeto (Licenciatura em Biotecnologia) (Degree)
Universidade de Aveiro, Portugal
2016/09/12 - 2017/10/01 Desenvolvimento de uma base de dados e ferramenta web para caracterização in silico de plasmídeos
Co-supervisor
Bioinformática (Master)
Universidade do Minho, Portugal
2016/10/01 - 2017/07/01 Molecular characterization of antibiotic resistant clinical isolates
Co-supervisor
Biologia Molecular e Celular (Master)
Universidade de Aveiro, Portugal
2015/10/01 - 2017/07/01 Diversidade de plasmídeos no ambiente e desenvolvimento de ferramentas moleculares para a sua caracterização.
Supervisor
Microbiologia (Master)
Universidade de Aveiro, Portugal
2016 - 2017 A review and an update about PCR plasmid typing schemes; IncP-1 plasmids and their relevance in dissemination of antibiotic resistance.
Supervisor of Sekerani Chidimiamassamba
Pesquisa (Other)
Universidade de Aveiro, Portugal
2016 - 2017 Analysis of microbial communities associated with roots of salt marshes plants involved in metal bioremediation.
Supervisor
Pesquisa (Degree)
2015 - 2016 Echinocandin resistance and promoted virulence: unveiling its blockade in invasive fungal infections
Supervisor
Estágio (Degree)
Universidade de Aveiro, Portugal
2015 - 2016 Meta analysis of plasmid genomes
Supervisor of Rui Nunes
Pesquisa (Degree)
Universidade de Aveiro, Portugal
2014 - 2015 Caracterização de comunidades microbianas associadas a Diopatra neapolitana
Supervisor
Pesquisa (Degree)
Universidade de Aveiro, Portugal
2013 - 2014 GEMOVE: Genes em movimento: Como capturar os genes móveis em comunidades microbianas?
Supervisor of Sónia Cristina Santos Martins
orientação pós doutoramento
Universidade de Aveiro, Portugal
2009/10/01 - 2010 Plasmídeos com gama alargada de hospedeiros em ambientes estuarinos
Supervisor of Beatriz Lázaro Pinto
Biotecnologia (Master)
Universidade de Aveiro, Portugal
2008/10/01 - 2009/07/01 Abordagem molecular na resolução de problemas com biocorrosão
Supervisor of Maria Teresa de Sousa Coelho Cortez
Microbiologia (Master)
Universidade de Aveiro, Portugal
2007 - 2008 Susceptibilidade a metais pesados de uma população de bacterioneuston resistente a mercúrio.
Supervisor
Pesquisa (Degree)
Universidade de Aveiro, Portugal
2007 - 2008 Genetic typing and virulence factors in Escherichia coli.
Co-supervisor of Ana Teresa Pinto
Pesquisa (Degree)
Universidade de Aveiro, Portugal

Event organisation

Event name
Type of event (Role)
Institution / Organization
2018/07/09 - 2018/07/13 curso avançado “Bioinformatics for microbiologists" (2018/07/09 - 2018/07/13)
Other (Co-organisor)
Universidade de Aveiro, Portugal
2016/09/12 - 2016/09/16 curso avançado “Bioinformatics for microbiologists" (2016/09/12 - 2016/09/16)
Other (Co-organisor)
Universidade de Aveiro, Portugal
2013 - 2015 Academia de Verão Participação e organização de atividades. (2013 - 2015)
Other
2014/06/23 - 2014/06/26 Curso Avançado: Bioinformatics, microbial genomes and mobile elements: New perspectives and applications. (2014/06/23 - 2014/06/26)
Other (Co-organisor)
Universidade de Aveiro, Portugal
2008/01/21 - 2008/01/25 1st MCoMiC. Molecular methods to study complex microbial communities. International Course (2008/01/21 - 2008/01/25)
Other (Member of the Organising Committee)
Universidade de Aveiro, Portugal
2007/04/01 - 2007/04/01 Descriminação molecular de microorganismos (2007/03/30 - 2007/04/02)
Symposium (Member of the Organising Committee)
Universidade de Aveiro, Portugal
2006/05/02 - 2006/05/04 I Encontro Nacional de Pós-Graduação em Ciências Biológicas & V Simpósio de Pós-Graduação do Departamento de Biologia da Universidade de Aveiro (2006/05/02 - 2006/05/04)
Symposium (Co-organisor)
Universidade de Aveiro, Portugal

Event participation

Activity description
Type of event
Event name
Institution / Organization
2019/04/29 - 2019/04/30 Actividade de Disseminação Científica: "Microbiologia no dia-a-dia"
Exhibition
xperimenta2019
Universidade de Aveiro, Portugal
2010 - 2015 Atividades de Disseminação de Ciência no âmbito da academia de Verão (anual)
Workshop
Academia de Verão
2012 - 2012 Atividade desenvolvida: Porque as bactérias evoluem mais rápido do que nós. DBio vai às escolas (divulgação nas escolas secundárias do distrito de Aveiro)

Jury of academic degree

Topic
Role
Candidate name (Type of degree)
Institution / Organization
2021/02/26 Profiling the volatile exometabolome of Pedobacter lusitanus NL19
(Thesis) Main arguer
Gonçalo André Henriques Figueiredo (Master)
Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2021/02/17 Potencial bioativo dos hidrolisados de Mytilus galloprovincialis: efeito das condições de hidrólise e processamento de amostras
(Thesis) Main arguer
Maria Eduarda Nogueira Moura (Master)
Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal
2019/12 Terapia Fotodinâmica na Inativação de Bacteriófagos com Porfirina e Potenciadores em Águas Residuais
(Thesis) Arguer
Cristiana Paula Martins da Silva Oliveira (Master)
Universidade de Aveiro, Portugal
2019 Phage therapy with phage cocktails in the inactivation of pathogenic bacteria
President of the jury
Patrícia da Silva Santos (Master)
Universidade de Aveiro, Portugal
2019 Porfirinas catiónicas na fotoinativação de vírus no sangue.
President of the jury
Patrícia da Silva Santos (Master)
Universidade de Aveiro, Portugal
2018 Priming events and development of tolerance upon influenza A virus and Staphylococcus aureus infection
(Thesis) Arguer
Diogo Filipe Rocha Ferreira (Master)
Universidade de Aveiro, Portugal
2018 Efficiency of single phage cocktails in the activation of puré and mixed cultures of Salmonella Typhimurium
(Thesis) Arguer
Pedro Miguel Morgado Rodrigues dos Santos (Master)
Universidade de Aveiro, Portugal
2017 Investigating the antibacterial activity of Pedobacter lusitanus NL19
(Thesis) Arguer
Beatriz Luciana Tavares de Almeida (Master)
Universidade de Aveiro, Portugal
2016 Análise in silico de transcriptomas de medula espinal regenerativa
(Thesis) Arguer
Susana Duarte Barros Lopes Ferreira (Master)
Universidade de Aveiro, Portugal
2015 Enzimas extracelulares de Botryosphaeriaceae”
(Thesis) Arguer
Ana Rita Almeida Pinheiro (Master)
Universidade de Aveiro, Portugal
2012 Lichenicidina: Regulação, expressão e bioengenharia em E. coli.
(Thesis) Arguer
Joana Cristina Pacheco Barbosa (Master)
Universidade de Aveiro, Portugal
2012 Bactéria, Archaea e genes de proteorrodopsinas em neuston estuarino
(Thesis) Arguer
Veronika Lykholat (Master)
Universidade de Aveiro, Portugal
2011 Acinetobacter baumannii em meio hospitalar
(Thesis) Arguer
Maria José da Costa Pinho Silveira (Master)
Universidade de Aveiro, Portugal
2011 Emergent viruses in the marine environment Mestrado em Microbiologia
(Thesis) Arguer
Sónia de Fátima Félix Ferreira de Sousa (Master)
Universidade de Aveiro, Portugal
2011 Plano de controlo interno do laboratório de microbiologia
(Thesis) Arguer
Soraia Pereira Mortágua (Master)
Universidade de Aveiro, Portugal
2011 Prevalência da Infecção por Citomegalovírus numa População Obstétrica
(Thesis) Arguer
Maria Adélia Machado Fernandes Reis (Master)
Universidade de Aveiro, Portugal
2011 A citologia e a pesquisa de DNA no diagnóstico da infeção por HPV
(Thesis) Arguer
Liliana Patrícia Silva Vieira (Master)
Universidade de Aveiro, Portugal
2010 Perfil de resistência a antibióticos em isolados de doentes oncológicos
(Thesis) Arguer
Joana Isabel Ferreira Alexandre (Master)
Universidade de Aveiro, Portugal
2010 Prevalência de colonização por MRSA no Centro Hospitalar P. Varzim/V.Conde
(Thesis) Arguer
Marta Maria Bezerra Valadas (Master)
Universidade de Aveiro, Portugal
2009 Pesquisa de integrões classe 1 em isolados clínicos de Gram-negativo
(Thesis) Arguer
Cátia Raquel Talhas Santos (Master)
Universidade de Aveiro, Portugal
2009 Prevalência e resistência de Escherichia coli em ambulatório
(Thesis) Arguer
Raquel Catarina Saraiva Diaz (Master)
Universidade de Aveiro, Portugal
2008 Disseminação de determinantes genéticos de resistência a antibióticos em isolados clínicos de E.coli
(Thesis) Arguer
Ana Margarida Barata Moreira Paradela (Master)
Universidade de Aveiro, Portugal
2007 Infeção hospitalar: resistência a antibióticos
(Thesis) Arguer
Ivelina da Silva (Master)
Universidade de Aveiro, Portugal

Committee member

Activity description
Role
Institution / Organization
2020/07/07 - Current Conselho Científico da Universidade de Aveiro (Representante dos restantes docentes e investigadores) Comissão permanente para os recursos humanos
Member
Universidade de Aveiro, Portugal
2019/09/01 - Current Vice-Direção do curso de Mestrado Biologia Molecular & Celular
Director
Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal

Course / Discipline taught

Academic session Degree Subject (Type) Institution / Organization
2018/07/09 - 2018/07/13 Hands on session “Sequence alignments and search methods" Bioinformatics for microbiologists (Outros) Universidade de Aveiro, Portugal
2018/07/09 - 2018/07/13 Microbiologic web resources curso avançado bioinformatics for microbiologists (Outros) Universidade de Aveiro, Portugal
2016/09/12 - 2016/09/16 Hands on session “An overview of sequence databases & Sequence alignments” Bioinformatics for microbiologists (Outros) Universidade de Aveiro, Portugal
2014/07/21 - 2014/07/25 Mobile genetic elements: tools and case studies Bioinformatics of microbial genomes and mobile elements: New perspectives and applications Universidade de Aveiro, Portugal
2012/06/18 - 2012/06/22 Mobile genetic elements: tools and case studies Advanced Course Antibiotic Resistance in the Environment (Outros) Universidade de Aveiro, Portugal

Evaluation committee

Activity description
Role
Institution / Organization Funding entity
2019/06/25 - 2020/06/25 Avaliador externo do Subsistema para a Garantia da Qualidade dos Programas Doutorais (SubGQ_PD) 9204 PROGRAMA DOUTORAL EM BIOLOGIA (3º CICLO)
Evaluator
Universidade de Aveiro Departamento de Biologia, Portugal

Journal scientific committee

Journal title (ISSN) Publisher
2019 - 2019 Diversity (1424-2818) MDPI AG
2019 - 2019 Coatings (2079-6412) MDPI AG
2019 - 2019 Plasmid (1095-9890) Elsevier
2018 - 2018 BMC Genomics (1471-2164) Springer (Biomed Central Ltd.)
2017 - 2017 Molecular Ecology (1365-294X) Wiley (Blackwell Publishing)
2014/09/30 - 2015/03/12 Frontiers in Microbiology (1664-302X) Frontiers Media SA
2015 - 2015 FEMS Microbiology Letters (1574-6968) Oxford University Press

Other jury / evaluation

Activity description Institution / Organization
2018/04/20 - 2019/06/14 Júri de Avaliação de Candidaturas a Bolsas de Investigação Universidade de Aveiro, Portugal
2019 - 2019 Avaliação de Projetos de Dissertação no âmbito de cursos do 2º ciclo de estudos Universidade de Aveiro, Portugal
2016 - 2018 Avaliação de Relatórios de Estágio Curricular no âmbito de cursos do 1º ciclo de estudos Universidade de Aveiro, Portugal
2015 - 2018 Avaliação de Relatórios da unidade curricular Projeto no âmbito de cursos do 1º ciclo de estudos Universidade de Aveiro, Portugal
2012/07/12 - 2012/07/12 Avaliação de Projetos de Tese de Doutoramento Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, Portugal