Rita Pires (751A-23D8-FCBD)

Curriculum Vitae

Rita Pires

Currently enrolled in a PhD programme in Agricultural and Environmental Sciences at the University of Évora, with research focused on elucidating the signalling pathways involved in somatic embryogenesis. Particular emphasis is placed on the role of extracellular molecules in modulating embryogenic efficiency. The project, entitled “Unravelling the Signalling Pathways of Somatic Embryogenesis – The Role of Extracellular Molecules as Efficiency Modulators”, introduces an innovative strategy for propagating recalcitrant Portuguese olive cultivars, which have shown limited success using conventional methods such as semi-hardwood cuttings. Graduated with a degree in Agronomy from the University of Évora (2013–2016), where I acquired a solid foundation in agricultural sciences and technologies. During my studies, I developed a growing interest in Plant Biotechnology while assisting MSc students with their dissertation projects at the Plant Breeding and Biotechnology Laboratory. Following the completion of my undergraduate degree, I pursued a Master’s in Agronomic Engineering (2016–2018) at the same institution, with a thesis focused on somatic embryogenesis in olive trees. This work was conducted under the OLEAVALOR project, through which I successfully established in vitro embryogenic cultures of the ‘Galega vulgar’ cultivar. During this period, I also gained valuable experience in micropropagation and micrografting techniques in walnut, as part of the VALREGIA project. In addition, I had the opportunity to work in a professional setting dedicated to the in vitro production of high-value plants, where I was responsible for the development of new products and for supervising grafting activities in the nursery sector. This experience enabled me to apply the knowledge gained throughout my academic training in a business-oriented setting, while deepening my understanding of the technical and operational aspects of plant propagation. In 2019, I was awarded a research grant within the FERTIPINEA project, which focused on the nutrition of stone pine (Pinus pinea) in both rainfed and irrigated production systems. I am currently focused on the practical aspects of my research, applying my expertise in Plant Biotechnology to contribute to advances in the field.

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Identification

Personal identification

Full name: Rita Pires

Citation names

Pires, R

Author identifiers

Ciência ID: 751A-23D8-FCBD
ORCID iD: 0000-0002-8166-7733

Email addresses

ritapires88@hotmail.com (Personal)

Telephones

Mobile phone

963494438 (Personal)

Knowledge fields

Agrarian Sciences

Languages

Language	Speaking	Reading	Writing	Listening	Peer-review
Portuguese (Mother tongue)
English	Intermediate (B1)	Upper intermediate (B2)		Upper intermediate (B2)	Intermediate (B1)
Spanish; Castilian	Intermediate (B1)	Intermediate (B1)	Beginner (A1)	Elementary (A2)	Beginner (A1)

Education

	Degree	Classification
2023/11/27 - 2023/12/06 Concluded	Análise de dados com SPSS em projetos de investigação (Outros) Gades Training Lda, Portugal
2023/04/17 - 2023/04/21 Concluded	Proteomics Approaches in Life Sciences (Curso Técnico Superior Profissional) Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal
2019 - 2023 Ongoing	Doutoramento em Ciências Agrárias e Ambientais (Doutoramento) Universidade de Évora, Portugal
2016/09 - 2018/12 Concluded	Mestrado em Engenharia Agronómica (Mestrado) Universidade de Évora, Portugal "Ensaios com vista à embriogénese somática em oliveira (Olea europaea L.)" (THESIS/DISSERTATION)	15
2013/09 - 2016/09 Concluded	Agronomia (Licenciatura) Universidade de Évora, Portugal

Affiliation

Science

	Category Host institution	Employer
2019/10 - 2021/06	Research Trainee (Research)	Universidade de Évora, Portugal
	Universidade de Évora Instituto de Ciências Agrárias e Ambientais Mediterrânicas, Portugal
2017/05 - 2018/05	Research Trainee (Research)	Universidade de Évora, Portugal
	Universidade de Évora Instituto de Ciências Agrárias e Ambientais Mediterrânicas, Portugal

Other Careers

	Category Host institution	Employer
2018/07 - 2019/07	Técnico Superior (Técnico Superior)	Despertafolia Lda, Portugal

2015/06/30 - 2015/09/03	Assistente Técnico (Assistente Técnico)	Fruteco - Fruticultura Integrada, Lda, Portugal

Projects

Grant

	Designation	Funders
2019/10 - 2020/10	FERTIPINEA - Nutrição e fertilização do pinheiro manso em sequeiro e regadio PDR 2020 - 101 - 031334 Research Fellow Universidade de Évora Instituto de Ciências Agrárias e Ambientais Mediterrânicas, Portugal	Ongoing
2017/05 - 2018/05	VALREGIA - Viabilização da cultura da nogueira no regadiodo Alentejo ALT20-03-0246-FEDER-000002 Research Fellow Instituto Mediterrâneo para a Agricultura, Ambiente e Desenvolvimento da Universidade de Évora, Portugal	Concluded

Other

	Designation	Funders
2025/01/01 - Current	ALCAROB – Aplicabilidade da cultura da alfarrobeira na sustentabilidade da agricultura no Alentejo PD24-00024 Colaborador Instituto Mediterrâneo para a Agricultura, Ambiente e Desenvolvimento da Universidade de Évora, Portugal	Ongoing
2016 - 2018	OLEAVALOR - Valorização das Variedades de Oliveira Portuguesas ALT20-03-0145-FEDER-000014 Colaborador	Concluded

Outputs

Publications

Book chapter	Rodrigues, Lénia; Estêvão, Catarina; Garcia, Raquel; Rato, Ana Elisa; Campos, Catarina; Marques, Mónica; Pires, Rita; Peixe, Augusto; Cardoso, Hélia. "Metabolomics Connecting Genomes and Phenomes in Plant Molecular Breeding—A Special Focus on Mediterranean Agronomical Important Tree Species". In Plant Molecular Breeding in Genomics Era, 283-319. Springer Nature Switzerland, 2024. Published • 10.1007/978-3-031-68586-6_11 Cardoso, H.; Figueiredo, A.; Serrazina, S.; Pires, R.; Peixe, A.. "Genome modification approaches to improve performance, quality, and stress tolerance of important mediterranean fruit species (Olea europaea L., Vitis vinifera L., and Quercus suber L.)". 273-312. 2019.
Conference abstract	Estêvão, Catarina; Marques, Mónica; Pires, R; Campos, Catarina; Rodrigues, Lénia; Cardoso, Hélia. Corresponding author: Cardoso, Hélia. "Somatic embryogenesis in Portuguese grapevine (Vitis vinifera L.) cultivars – a focus on the induction phase". Évora, 2024. Published Pires, R; Cardoso, H. "Estabelecimento de um protocolo de embriogénese somática a partir de embriões zigóticos de Olea europaea L., 'Galega vulgar'.". Paper presented in IX Simpósio Nacional de Olivicultura, Oeiras, 2022. Accepted Pires, Rita. "Enraizamento ex-vitro de plantas micropropagada de oliveira “Olea europaea L.”". Paper presented in VIII Congresso Ibérico de Ciências Hortícolas, Coimbra, 2017.
Conference paper	Pires, R; Cardoso, H; Ribeiro, A; Cordeiro, A; Peixe, A.. "Estabelecimento de um protocolo de embriogénese somática a partir de embriões zigóticos de Olea europaea L., cv. 'Galega vulgar'". Paper presented in IX Simpósio Nacional de Olivicultura, Oeiras, 2021. Accepted
Conference poster	Marques, Mónica; Pires, R; Rodrigues, Lénia; Maria, Campos; Estêvão, Catarina; Augusto Peixe; Cardoso, Hélia. "Carob tree: A Green Solution to support a Sustainable Agriculture". 2024. Ustymenko, Valeriya; Campos, Catarina; Rodrigues, Lénia; Pires, Rita; Melo, Paula; Cardoso, Hélia. "Exploring the involvement of YUCCA-mediated auxin biosynthesis in Olea europaea L. somatic embryogenesis". 2024. Marques, Mónica; Pires, R; Estêvão, Catarina; Rodrigues, Lénia; Ustymenko, Valeriya; Campos, Catarina; Peixe, Augusto; Cardoso, Hélia. "Genome-wide identification and expression analysis of PIN gene family during adventitious rooting of Juglans regia L. microcuttings". 2024. Pires, R; Rodrigues, Lénia; Cardoso, Hélia; Peixe, Augusto. Corresponding author: Pires, R. "Somatic Embryogenesis as a Plant Regeneration System: A comparative study considering the cvs. ‘Galega vulgar', 'Cobrançosa' and 'Arbequina'". Paper presented in VIII PhD Students Meeting in Environmental and Agriculture, 2023. Tavares, Pedro; Pires, R; Rodrigues, Lénia; Cardoso, Hélia; Peixe, Augusto. "Micrografting of in vitro produced walnut (Juglans sp.) rootstocks". Paper presented in VIII PhD Students Meeting in Environmental and Agriculture, 2023. Santos, Rafaela; Pires, R; Marques, Mónica; Rodrigues, Lénia; Campos, Catarina; Rato, Ana Elisa; Peixe, Augusto; Cardoso, Hélia. Corresponding author: Cardoso, Hélia. "Exploring the crosstalk between signalling molecules and auxin metabolism during adventitious root formation in walnut tree (Juglans spp.)". Paper presented in VIII PhD Students Meeting in Environmental and Agriculture, 2023. Pires, R; Marques, Mónica; Rodrigues, Lénia; Peixe, Augusto; Cardoso, Hélia. "Establishment of a callogenesis protocol of Ceratonia siliqua L. to further explore its applicability for metabolites production.". Paper presented in VIII PhD Students Meeting in Environmental and Agriculture, 2023. Mendes, C; Pires, R; Rodrigues, Lénia; Cardoso, Hélia. "Transcript analysis of Plastid Terminal Oxidase (PTOX) reveals a putative role in adventious roots and somatic embryos development in Olea europaea L.". 2022. Pires, Rita; Marques, Diogo; Campos, Catarina; Peixe, A; Cardoso, H. "Exploring the involvement of the somatic embryogenesis receptor kitinase (SERK) gene family on olive somatic embryogenesis efficiency". Paper presented in III International Meeting of the Portuguese Society of Genetics, 2022. Pires, Rita; Marques, Diogo; Peixe, A; Cardoso, H. "Studies on genetic transformation of Olea europaea L. somatic embryos mediated by Agrobacterium tumefaciens". Paper presented in III International Meeting of the Portuguese Society of Genetics, 2022. Marques, D; Rodrigues, L; Pires, Rita; Peixe, A; Cardoso, H. "Exploring the involvment of Alternative oxidase 1 subfamily members on somatic embryogenesis in Olea europaea". Paper presented in III International Meeting of the Portuguese Society of Genetics, 2022. Pires, Rita; Rodrigues, L; Santos, F.M.; Ciordia, S; Peixe, A; Cardoso, H. Corresponding author: Cardoso, H. "Exploring the role of secretome on somatic embryogenesis efficiency in Olea europaea L.". Paper presented in ProteoVilamoura, 2022. Pires, R; Rodrigues, L; Duarte, IF; Santos,F; Peixe, A; Cardoso, H. "The role of apoplastic fluid in driven somatic embryogenesis efficiency - establishment of a workflow allowing proteome and metabolome analysis". Paper presented in VI PhD Students Meeting in Environment and Agriculture, 2021. Pires, Rita; Cardoso, H; Ribeiro, A; Cordeiro, A; Peixe, A.. Corresponding author: Peixe, A.. "Indução e manutenção de embriogénese somática a partir de embriões zigóticos maduros de Olea europaea L., cv. 'Galega vulgar'". Paper presented in 9º Simpósio de Olivicultura, 2021. Silvério, M; Pires, R; Campos, C; Peixe, A.; Cardoso, H. "Identification of endophyte of microbial communities in long-term in vitro-cultured olive and walnut plantlets and evaluation of isolated olive endophytes in walnut rooting". Paper presented in XXI SPB National Congress of Biochemistry 2020, 2021. Pires, Rita; Peixe, A.; Santos, F.M.; Cardoso H. "Unraveling somatic embryogenesis signaling pathways - the role of extracellular molecules as efficiency modulators". Paper presented in V PhD Students Meeting in Environment and Agriculture, 2020. Cruz, J.M; Coelho, D. J.; Ribeiro, A; Ribeiro, H; Pires, Rita; Botas, D; Peixe, A.; Baptista, F. J. "Using LED light in plant growth chambers: Evaluation of the equipment efficiency and plant development parameters". Paper presented in IV Encontro de Estudantes de Doutoramento em Ambiente e Agricultura, 2019. Pires, Rita. "Establishement of a somatic embryogenesis protocol for in vitro olive plant propagation - a focus on the valorization of the portuguese cv. 'Galega vulgar'". Paper presented in IV Encontro de Estudantes de Doutoramento em Ambiente e Agricultura, 2019. Pires, Rita; Peixe, Augusto; Cardoso, Hélia. "Indução e controlo da embriogénese somática a partir de embriões zigóticos maduros em oliveira (Olea europaea L.) cv. 'Galega vulgar'". Paper presented in III Congresso Luso-Extremadurense de Ciências e Tecnologia, 2019. Pires, Rita. "Embriogénese somática e organogénese na variedade de oliveira 'Galega vulgar'". Paper presented in VIII Simpósio Nacional de Olivicultura, 2018. Pires, Rita. "Determination of the Leaf Area Index (LAI) of an old olive tree". Paper presented in VIII Congresso Ibérico de Ciências Hortícolas, 2017.
Journal article	Rita Pires; Lénia Rodrigues; Fátima Milhano Santos; Iola F. Duarte; Sergio Ciordia; Augusto Peixe; Hélia Cardoso. "Establishment of a Protocol for the Characterization of Secreted Biomolecules in Somatic Embryogenic Cultures of Olea europaea L.". Horticulturae (2025): https://doi.org/10.3390/horticulturae11030331. 10.3390/horticulturae11030331 Gonçalves, Ana Cristina; Alexandre, Carlos; Andrade, José; Pires, Rita. "Effects of Chemical Soil Characteristics, Air Temperature and Precipitation on Pinus pinea Growth in Southern Inland Portugal". Forests 14 11 (2023): 2160. http://dx.doi.org/10.3390/f14112160. Published • 10.3390/f14112160 Ribeiro, Hugo; Ribeiro, Augusto; Pires, Rita; Cruz, João; Cardoso, Hélia; Barroso, João Mota; Peixe, Augusto. "Ex Vitro Rooting and Simultaneous Micrografting of the Walnut Hybrid Rootstock ‘Paradox’ (Juglans hindsi × Juglans regia) cl. ‘Vlach’". Agronomy 12 3 (2022): 595. http://dx.doi.org/10.3390/agronomy12030595. 10.3390/agronomy12030595 Pires, Rita; Cardoso, Hélia; Ribeiro, Augusto; Peixe, Augusto; Cordeiro, António. Corresponding author: Peixe, Augusto. "Somatic Embryogenesis from Mature Embryos of Olea europaea L. cv. ‘Galega Vulgar’ and Long-Term Management of Calli Morphogenic Capacity". Plants 9 6 (2020): 758. http://dx.doi.org/10.3390/plants9060758. 10.3390/plants9060758
Magazine article	Pires, Rita. "Batata-doce de Aljezur IGP: Podem conseguir-se produções próximas das 30 t/ha com a variedade ‘Lira’", VidaRural, 2019

Activities

Oral presentation

	Presentation title	Event name Host (Event location)
2023/02/09	Técnicas de propagação in vitro (cultura de microestacas e embriogénese somática) aplicadas à regeneração de plantas de oliveira isentas de vírus	(Évora, Portugal)
2020/05/07	Aula sobre embriogénese somática na unidade curricular Melhoramento e Biotecnologia Vegetal lecionada aos alunos do Mestrado em Engenharia Rural da Universidade de Évora.	Aula sobre embriogénese somática (Évora, Portugal)
2020/04/28	Aula de embriogénese somática na unidade curricular Genética e Melhoramento de Plantas da licenciatura em Agronomia da Universidade de Évora.	Genética e Melhoramento de Plantas (Portugal)
2020/03/11	Aula sobre embriogénese somática na unidade curricular Biotecnologia de Plantas, disciplina obrigatória da licenciatura em Biotecnologia e optativa no curso de Agronomia da Universidade de Évora.	Biotecnologia de Plantas Universidade de Évora (Évora, Portugal)

Supervision

	Thesis Title Role	Degree Subject (Type) Institution / Organization
2024/02/23 - Current	Propagação in vitro de espécies vegetais. Supervisor	Biologia (Other) Universidade de Évora, Portugal
2024/02/23 - Current	Propagação in vitro de espécies vegetais. Co-supervisor	Biologia (Other) Universidade de Évora, Portugal
2024/02/23 - Current	Propagação in vitro de espécies vegetais. Co-supervisor	Biologia (Other) Universidade de Évora, Portugal
2023/11/06 - Current	Estabelecimento e multiplicação in vitro de espécies de interesse agronómico. Co-supervisor	Mestrado em Engenharia Agronómico (Other) Universidade de Évora, Portugal
2023/09/01 - Current	Estudo da interação entre a resposta ao stress e o metabolismo do AIB (ácido indole-3-butírico) no enraizamento adventício da nogueira (Juglans spp.). Co-supervisor	Mestrado em Engenharia Agronómica (Master) Universidade de Évora, Portugal
2022/09/15 - 2023/12/04	Microenxertia de plantas de nogueira (Juglans sp.) produzidas in vitro Co-supervisor	Engenharia Agronómica (Master) Universidade de Évora, Portugal
2023/03/24 - 2023/05/26	Propagação in vitro de oliveira por indução de embriogénese somática e estudos de variabilidade genética do gene SAD2 Co-supervisor	Biologia (Other) Universidade de Évora, Portugal
2023/03/24 - 2023/05/26	Propagação in vitro de oliveira por indução de embriogénese somática e estudos de variabilidade genética do gene SAD2 Co-supervisor	Biologia (Other) Universidade de Évora, Portugal
2022/02/01 - 2022/07/12	Caraterização histológica de calli obtidos durante as fases de indução e expressão de embriogénese somática em Olea europaea L. (oliveira) Co-supervisor	Biologia (Degree) Universidade de Évora, Portugal
2022/02/01 - 2022/07	Estabelecimento de um protocolo de propagação vegetativa de Solanum lycopersicum L. (tomateiro) por indução de embriogénese somática Co-supervisor	Biologia (Degree) Universidade de Évora, Portugal

Event organisation

	Event name Type of event (Role)	Institution / Organization
2018/05 - 2018/05	Participação da organização no Simpósio Nacional de Frutos Secos realizado como comclusão do projeto: VALREGIA – Viabilização da cultura da nogueira no regadio do Alentejo”. (2018/05 - 2018/05) Symposium (Co-organisor)	Universidade de Évora Instituto de Ciências Agrárias e Ambientais Mediterrânicas, Portugal

Event participation

	Activity description Type of event	Event name Institution / Organization
2025/04/03 - 2025/04/03	Workshop de Fenotipagem ferramenta estratégica numa agricultura sustentável Workshop	Universidade de Évora, Portugal
2024/09/27 - 2024/09/27	O contributo da biotecnologia no desenvolvimento de “Super” Plantas. Other	European research night - Science for global challenges
2024/04/17 - 2024/04/17	O Festival de Ciência 24” Dia da ECT- Open Days UÉ 2024, que decorreu no dia 17 de abril 2024. A sua realização aconteceu no Pólo da Mitra e no Colégio Luís António Verney e outros locais da Universidade de Évora e englobou um conjunto de visitas/circuitos e atividades de cariz científico, pedagógico e de lazer. Other	Universidade de Évora, Portugal
2023/09/29 - 2023/09/29	A Noite Europeia dos Investigadores - European Researchers’ Night - é uma iniciativa lançada em 2005, financiada pela Comissão Europeia, no âmbito das Ações Marie Curie. Esta atividade tem o objetivo de celebrar a Ciência e de aproximar investigadores e cidadãos com atividades preparatórias e durante a noite da última sexta-feira de setembro. Exhibition	Universidade de Évora, Portugal
2023/07/03 - 2023/07/04	MED meeting 23 - Healthy soils for food for life and for the future. Meeting	Healthy soils for food for life and for the future Universidade de Évora Instituto de Ciências Agrárias e Ambientais Mediterrânicas, Portugal
2023/02/09 - 2023/02/09	Workshop final Gescertolive, com o objetivo de promover a transferência para o setor produtivo do conhecimento adquirido sobre propagação da oliveira e técnicas de condução sustentável de olivais. Técnicas de rastreabilidade varietal e sanitária das plantas e do azeite, para que possam ser utilizadas pelos produtores, viveiristas e serviços oficiais de certificação. Workshop	II. Produção e certificação sanitária de cultivares de oliveira. Técnicas de propagação in vitro (cultura de microestacas e embriogénese somática) aplicadas à regeneração de plantas de oliveira isentas de vírus. Universidade de Évora Instituto de Ciências Agrárias e Ambientais Mediterrânicas, Portugal
2022/08/29 - 2022/09/02	A multiplicação in vitro tem sido amplamente utilizada para a propagação de diversas espécies de plantas. No entanto, o sucesso destas metodologias pode ser comprometido pela ocorrência de contaminações no meio de cultura, normalmente provocadas pelo crescimento de bactérias que colonizam internamente os tecidos da planta (endófitas). Na presente ação os alunos participaram nos trabalhos de cultura in vitro envolvendo várias atividades relacionadas com o tema. Other	Ciência Viva no Laboratório 26.º edição
2022/07/11 - 2022/07/15	Cursos para todos: estudantes universitários de Instituições de Ensino Superior portuguesas, estudantes universitários de instituições de ensino superior internacionais, estudantes do ensino secundário, profissionais em várias áreas, investigadores e público em geral. Other	Junior Summer School`22 Universidade de Évora, Portugal
2021/11/30 - 2021/11/30	Workshop final do Projeto GO FERTIPINEA. Participação em poster. Workshop	Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal UNAC União da Floresta Mediterrânica, Portugal
2018/07/09 - 2018/07/13	A biotecnologia na multiplicação vegetativa de plantas – Cultura in vitro e expressão génica. Workshop	Ciência Viva no Laboratório – Ocupação Ciêntífica de Jovens nas Férias, 22ª Edição Universidade de Évora Instituto de Ciências Agrárias e Ambientais Mediterrânicas, Portugal

Course / Discipline taught

	Academic session	Degree Subject (Type)	Institution / Organization
2025/02/01 - 2025/07	Biotecnologia das Plantas (FIT13557L)	Agronomia (cód. 774); Biotecnologia (cód. 729) (Licenciatura)	Universidade de Évora, Portugal
2025/02/01 - 2025/07	Melhoramento e Biotecnologia Vegetal (FIT10439M)	Mestrado em Engenharia Agronómica (Mestrado)	Universidade de Évora, Portugal
2024/02/14 - 2024/07/15	Melhoramento e Biotecnologia Vegetal (FIT10439M)	Mestrado em Engenharia Agronómica (Mestrado)
2024/02/14 - 2024/07/15	Biotecnologia das Plantas (FIT13557L)	Licenciatura em Agronomia (cód. 774), Licenciatura em Biotecnologia (cód. 729) (Licenciatura)	Universidade de Évora, Portugal

Distinctions

Award

2023	Best poster prize Instituto Mediterrâneo para a Agricultura, Ambiente e Desenvolvimento da Universidade de Évora, Portugal
2022	Best poster prize Instituto Mediterrâneo para a Agricultura, Ambiente e Desenvolvimento da Universidade de Évora, Portugal
2019	Best Poster Prize Universidade de Évora Instituto de Ciências Agrárias e Ambientais Mediterrânicas, Portugal