Identification
Personal identification
- Full name
- Isabel Maria Soeiro Tomás de Oliveira
Citation names
- Oliveira, Isabel
- Tomás-Oliveira, I
- Tomás Oliveira, I
Author identifiers
- Ciência ID
- 4817-B072-50ED
- ORCID iD
- 0000-0001-6045-4213
- Google Scholar ID
- https://scholar.google.com/citations?user=NhbmSmEAAAAJ&hl=en
Telephones
- Mobile phone
-
- 967542314 (Personal)
Knowledge fields
- Exact Sciences - Computer and Information Sciences - Bioinformatics
- Exact Sciences - Mathematics - Statistics and Probability
Languages
Language | Speaking | Reading | Writing | Listening | Peer-review |
---|---|---|---|---|---|
Portuguese (Mother tongue) | |||||
English | Advanced (C1) | Advanced (C1) | Advanced (C1) | Advanced (C1) | Proficiency (C2) |
French | Advanced (C1) | Advanced (C1) | Proficiency (C2) | Advanced (C1) | Advanced (C1) |
Spanish; Castilian | Advanced (C1) | Proficiency (C2) | Intermediate (B1) | Proficiency (C2) | Advanced (C1) |
Education
Degree | Classification | |
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2013 - 2014
Attended
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Bioestatística (Pós-Graduação)
Universidade de Lisboa Departamento de Estatística e Investigação Operacional, Portugal
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17 |
1996/11 - 2001/03
Concluded
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Doctorat en Sciences (Doctorat)
Major in Doctorat en Sciences
Université Libre de Bruxelles, Belgium
"Packing and distribution of empty space in liquids, proteins and protein:DNA interfaces" (THESIS/DISSERTATION)
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1994 - 1995
Concluded
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Biologie Moléculaire et Biotechnologie (DEA)
Université Libre de Bruxelles, Belgium
|
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1993/10 - 1995
Concluded
|
Biofísica (Mestrado)
Major in Física Médica
Universidade de Lisboa Instituto de Biofísica e Engenharia Biomédica, Portugal
Université Libre de Bruxelles Laboratoire de Bioinformatique des Génomes et des Réseaux, Belgium "Free Energy of cavity formation inside a Protein: a theoretical analysis using Molecular dynamics simulations" (THESIS/DISSERTATION)
|
Muito Bom |
1987/11 - 1992/01
Concluded
|
Bioquímica (Licenciatura)
Universidade de Lisboa Departamento de Química e Bioquímica, Portugal
"I. Localização magnetoencefalográfica da actividade Cerebral " (THESIS/DISSERTATION)
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17 valores |
Affiliation
Science
Category Host institution |
Employer | |
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2019 - 2021 | Contracted Researcher (Research) | Universidade da Beira Interior, Portugal |
Universidade da Beira Interior Centro de Investigação em Ciências da Saúde, Portugal (...) |
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2016/03 - 2017/09 | Science and Technology Management | Universidade da Beira Interior Instituto Coordenador da Investigação, Portugal |
Universidade da Beira Interior, Portugal | ||
2007 - 2013 | Auxiliary Researcher (Research) | Universidade Atlântica Centro de Estudos Sociedade Organizações e Bem-Estar, Portugal |
Universidade Altântica, Portugal | ||
2005/09 - 2006/06 | Postdoc (Research) | Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal |
Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal | ||
2005/04 - 2005/07 | Visiting Researcher (Research) | Medical University of South Carolina, United States |
Medical University of South Carolina Hollings Cancer Center, United States | ||
2001/03 - 2005/06 | Postdoc (Research) | European Molecular Biology Laboratory, Germany |
European Molecular Biology Laboratory, Germany | ||
2001/03 - 2001/10 | Visiting Researcher (Research) | Heidelberger Institut für Theoretische Studien, Germany |
European Molecular Biology Laboratory, Germany | ||
1999/04 - 1999/07 | Visiting Researcher (Research) | European Bioinformatics Institute, United Kingdom |
European Bioinformatics Institute, United Kingdom |
Teaching in Higher Education
Category Host institution |
Employer | |
---|---|---|
2007 - 2013 | Assistant Professor (University Teacher) | Universidade Atlântica Escola Superior de Saúde Atlântica, Portugal |
Universidade Atlântica Escola Superior de Saúde Atlântica, Portugal | ||
2007 - 2013 | Assistant Professor (University Teacher) | Atlântica Escola Universitária de Ciências Empresariais Saúde Tecnologias e Engenharia, Portugal |
Atlântica Escola Universitária de Ciências Empresariais Saúde Tecnologias e Engenharia, Portugal |
Positions / Appointments
Category Host institution |
Employer | |
---|---|---|
2021/09 - 2022/02 | Executive Director C- Cloud Computing Competence Center | Universidade da Beira Interior Departamento de Informática, Portugal |
Universidade da Beira Interior, Portugal |
Others
Category Host institution |
Employer | |
---|---|---|
2022/05 - Current | Tutor and Research Development Specialist | Self-Employed, Portugal |
2014/05 - 2019/06 | Tutor and Research Development Specialist | Parque de Ciência e Tecnologia da Covilhã SA, Portugal |
Projects
Grant
Designation | Funders | |
---|---|---|
2002 - 2005 | Stochastic simulations of reactions inside the Cell
SFRH/BPD/11643/2002
Post-doc Fellow
European Molecular Biology Laboratory, Germany
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
|
1995 - 1999 | Defeitos de empacotamento e estabilidade de proteínas
PraxisXXI/BD/5697/95
PhD Student Fellow
Université Libre de Bruxelles, Belgium
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
|
1994 - 1995 | Free Energy of cavity formation in liquid water and non-polar solvents
95/01-211
Research Fellow
Université Libre de Bruxelles, Belgium
|
Fédération Wallonie-Bruxelles Ministère de la Communauté Française
Concluded
|
1992 - 1994 | Bolsa de Mestrado em Biofísica - especialização Física Médica
BM/2913/92-RM
Master Student Fellow
Universidade de Lisboa Departamento de Física, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
|
Contract
Designation | Funders | |
---|---|---|
2019/07 - 2021/07 | C4 - Centro de Competências em Cloud Computing
Project Centro-01-0145-FEDER-000019—C4
Post-doc
Universidade da Beira Interior, Portugal
|
Concluded
|
2002 - 2003 | Diseño de dominios funcionales en proteinas
FAA-XXXXX
Post-doc Fellow
European Molecular Biology Laboratory, Germany
|
Fundación Ramon Areces
Concluded
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2001 - 2002 | Cooperative interactions of aromatic residues and the stability of ww domains
HFSP RG0234/2000-M
Researcher
European Molecular Biology Laboratory, Germany
Heidelberger Institut für Theoretische Studien, Germany |
Human Frontier Science Program
Concluded
|
2000/01/01 - 2001/04 | Bioinformatics and Computational Biology
EU Grant BIO4 CT97-2086
Post-doc
Université Libre de Bruxelles, Belgium
|
National Institutes of Health
Concluded
|
1991 - 1992 | Programa de Investigação e Formação Avançada em Física Médica
CERN/P/CA/7/90
Research Fellow
Universidade de Lisboa Departamento de Física, Portugal
|
European Organization for Nuclear Research
Concluded
|
Outputs
Publications
Conference abstract |
|
Conference paper |
|
Conference poster |
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Journal article |
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Report |
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Thesis / Dissertation |
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Activities
Oral presentation
Presentation title | Event name Host (Event location) |
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2019 | From omics to in silico molecular modelling and drug design | C4 - Cloud Computing Competence Center (Workshop I)
C4 - Cloud Computing Competence Centre (Hugo Torres Vieira) (Covilhã, Portugal)
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2003 | EnVivoCell: a framework to simulate cellular processes with stochastic approach Conference | New Horizons in Molecular Science & systems
Okinawa institute of science and technology (Onna (okinawa), Japan)
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2001 | Women in Science – the Portuguese case | EMBL Science and Society Program (plenary talk)
EMBL Science and Society Program (plenary talk, Halldor Stefansson) (Heidelberg, Germany)
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2000 | Packing and Compressibility of protein regions: comparison with liquids and solids | EMBL Plenary lecture
Rebecca Wade (EMBL) (Heidelberg, Germany)
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1998 | Free energy cost and hydration process of internal cavities in proteins | Conference: Computational Chemistry and the living World: from sequence to function
French, British, Italian, German Chemical Societies (Chamberry, France)
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Supervision
Thesis Title Role |
Degree Subject (Type) Institution / Organization |
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2012/04 - 2013/09 | Associação entre os padrões de sono, o estado nutricional, os hábitos alimentares, e o estilo de vida, em utentes da UCSP
de Agualva
http://hdl.handle.net/10884/765
Co-supervisor of Célia Yonsuk Chung Rodrigues
|
Ciências da Nutrição (Degree)
Atlântica Escola Universitária de Ciências Empresariais Saúde Tecnologias e Engenharia, Portugal
|
2011/12 - 2012/06 | Vacinação contra o Vírus do Papiloma Humano em Jovens do Concelho de Oeiras
https://repositorio-cientifico.essatla.pt/bitstream/20.500.12253/810/1/Trabalho%20Final%20de%20Curso%20-%20Raquel%20Silva.pdf
Co-supervisor of Raquel Silva
|
Análises Clínicas e de Saúde Pública (Scientific initiation)
Universidade Atlântica Escola Superior de Saúde Atlântica, Portugal
|
2011/12 - 2012/06 | Educação para a sexualidade em adolescentes e prevenção do VIH/SIDA
Co-supervisor of Pedro Oliveira
|
Análises Clínicas e de Saúde Pública (Scientific initiation)
Universidade Atlântica Escola Superior de Saúde Atlântica, Portugal
|
2011/11 - 2012/06 | O treino de equilibrio na prevenção de quedas em utentes no estado inicial da doença de Huntington
http://hdl.handle.net/10884/877
Co-supervisor of Ana Patrícia Ramalho Alves
|
Fisioterapia (Scientific initiation)
Universidade Atlântica Escola Superior de Saúde Atlântica, Portugal
|
2011/11 - 2012/06 | O efeito da exploração visual na negligência unilateral espacial e na funcionalidade em utentes após um acidente vascular
cerebral
http://hdl.handle.net/10884/876
Co-supervisor of Maria Alexandra Chança Patriarca
|
Fisioterapia (Scientific initiation)
Universidade Atlântica Escola Superior de Saúde Atlântica, Portugal
|
2011/11 - 2012/06 | Perceção dos cuidadores informais de utentes com sequelas de AVC face ao papel do fisioterapeuta como educador
Co-supervisor of Ana Filipa Jorge
|
Fisioterapia (Scientific initiation)
Universidade Atlântica Escola Superior de Saúde Atlântica, Portugal
|
2011/03 - 2012/06 | Prevalência de lombalgias nos alunos da licenciatura de fisioterapia da Escola Superior de Saúde Atlântica
Co-supervisor of Cristina Robalo
|
Fisioterapia (Degree)
Universidade Atlântica Escola Superior de Saúde Atlântica, Portugal
|
2010/11 - 2011/09 | Influência da Fisioterapia na Funcionalidade dos Utentes Internados em Unidades de Cuidados Intensivos por Enfarte Agudo do
Miocárdio
Co-supervisor of Mafalda Ortis Teixeira
|
Fisioterapia (Degree)
Universidade Atlântica Escola Superior de Saúde Atlântica, Portugal
|
2011/02 - 2011/07 | Os Efeitos da Fisioterapia em Meio Aquático nas Grávidas
http://hdl.handle.net/10884/570
Co-supervisor of Raquel Maria Gaudêncio Freire
|
Fisioterapia (Scientific initiation)
Universidade Atlântica Escola Superior de Saúde Atlântica, Portugal
|
2011/02 - 2011/07 | Grau de auto-confiança das mães no período da amamentação
http://hdl.handle.net/10884/705
Co-supervisor of Marisa Andreia Ruivo Costa
|
Fisioterapia (Scientific initiation)
Universidade Atlântica Escola Superior de Saúde Atlântica, Portugal
|
2011/02 - 2011/06 | Prevalência de lombalgias nos alunos da licenciatura de fisioterapia da Escola Superior de Saúde Atlântica
http://hdl.handle.net/10884/432
Co-supervisor of Cristina Robalo
|
Fisioterapia (Scientific initiation)
Universidade Atlântica Escola Superior de Saúde Atlântica, Portugal
|
2011/01 - 2011/06 | Cálculo do Coeficiente de Difusão Aparente (ADC), em Neoplasias Gástricas
https://repositorio-cientifico.essatla.pt/bitstream/20.500.12253/756/3/Monografia%20-%20Final.pdf
Co-supervisor of Mariana Pires Duarte Fernandes; Liliana Filipa Ribeiro Almeida
|
Radiologia (Degree)
Universidade Atlântica Escola Superior de Saúde Atlântica, Portugal
|
2011/01 - 2011/06 | Alterações na qualidade de vida de utentes internados numa U.C.I. por enfarte agudo de miocárdio- influência da fisioterapia
Co-supervisor of Andreia Ferreira
|
Fisioterapia (Degree)
Universidade Atlântica Escola Superior de Saúde Atlântica, Portugal
|
2011/01 - 2011/06 | O conhecimento sobre fisioterapia de alunos do 12º ano do Agrupamento de Ciências e Tecnologias do concelho de Oeiras
Co-supervisor
|
Fisioterapia (Degree)
Universidade Atlântica Escola Superior de Saúde Atlântica, Portugal
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2011/01 - 2011/06 | A realidade dos fisioterapeutas portugueses nas UCIs pediátrica
Co-supervisor of Mário Jorge Ambrósio
|
Fisioterapia (Degree)
Universidade Atlântica Escola Superior de Saúde Atlântica, Portugal
|
2011/01 - 2011/06 | Avaliação da qualidade de vida de mulheres com incontinência urinária através da aplicação do King’s Health Questionnaire
Co-supervisor
|
Fisioterapia (Degree)
Universidade Atlântica Escola Superior de Saúde Atlântica, Portugal
|
2010/11 - 2011/06 | O controlo de infecção na prática clínica dos fisioterapeutas
Co-supervisor
|
Fisioterapia (Degree)
Universidade Atlântica Escola Superior de Saúde Atlântica, Portugal
|
2010/11 - 2011/06 | Nível de conhecimento dos profissionais de saúde sobre a ICF
Co-supervisor of Rita Alves
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Fisioterapia (Degree)
Universidade Atlântica Escola Superior de Saúde Atlântica, Portugal
|
2010/11 - 2011/06 | Caracterização da População Utente da Unidade de Saúde da AJPAS no Casal da Mira
http://hdl.handle.net/10884/609
Co-supervisor
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Análises Clínicas e de Saúde Pública (Scientific initiation)
Universidade Atlântica Escola Superior de Saúde Atlântica, Portugal
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2011/01 - 2011 | O conhecimento sobre fisioterapia de alunos do 12º ano do Agrupamento de Ciências e Tecnologias do concelho de Oeiras
Co-supervisor of Maria Mega
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Fisioterapia (Degree)
Universidade Atlântica Escola Superior de Saúde Atlântica, Portugal
|
2010/11 - 2011 | Influência da Fisioterapia na Funcionalidade dos Utentes Internados em Unidades de Cuidados Intensivos por Enfarte Agudo do
Miocárdio http://hdl.handle.net/10884/869
Co-supervisor
|
Fisioterapia (Scientific initiation)
Universidade Atlântica Escola Superior de Saúde Atlântica, Portugal
|
Event organisation
Event name Type of event (Role) |
Institution / Organization | |
---|---|---|
2002 - 2002 | Building protein-protein interaction networks in Heidelberg (organizing member) (2002)
Conference (Member of the Organising Committee)
|
European Molecular Biology Laboratory, Germany Heidelberger Institut für Theoretische Studien, Germany |
Association member
Society Organization name | Role | |
---|---|---|
1998 - 2002 | Protein Society | Member |
Consulting
Activity description | Institution / Organization | |
---|---|---|
2015 - 2023 | Translations of technical and Scientific texts (portuguese to English) | Parque de Ciência e Tecnologia da Covilhã SA, Portugal |
2014 - 2019 | Tutor (Mathematics and Statistics) Research Development Specialist: Consultacy in various type of statistical treatment of data | Parque de Ciência e Tecnologia da Covilhã SA, Portugal Hospital Pêro da Covilhã, Portugal |
2016 - 2016 | Technical support/dissemination (to researchers and civil society), concerning preparation, development and submission of projects to national and international funding bodies. Preparation of public presentations and summaries. Experience with the following programs: PORTUGAL2020, CENTRO2020, HORIZON2020. Preparation of a H2020 manual (RIA, IA and CSA actions) with discussion of: (1) eligibility conditions; (2) proposal evaluation (3) submission process (4) legal aspects of result dissemination (5) Budget: eligible expenses. | Universidade da Beira Interior Instituto Coordenador da Investigação, Portugal |
1999 - 1999 | co- developement of a sofware to compute free energies of cavity formation in proteins | Université Libre de Bruxelles, Belgium |
Course / Discipline taught
Academic session | Degree Subject (Type) | Institution / Organization | |
---|---|---|---|
2010 - 2013 | Investigação Aplicada | Análises Clínicas e de Saúde Pública (Licenciatura) | Universidade Atlântica Escola Superior de Saúde Atlântica, Portugal |
2007 - 2013 | Estatística | Ciências da Nutrição (Licenciatura) | Atlântica Escola Universitária de Ciências Empresariais Saúde Tecnologias e Engenharia, Portugal |
2007 - 2013 | Estatística Aplicada à saúde | Fisioterapia (Licenciatura) | Universidade Atlântica Escola Superior de Saúde Atlântica, Portugal |
2007 - 2013 | Estatística | Enfermagem (Licenciatura) | Universidade Atlântica Escola Superior de Saúde Atlântica, Portugal |
2011 - 2012 | Biomatemática | Análises Clínicas e de Saúde Pública (Licenciatura) | Universidade Atlântica Escola Superior de Saúde Atlântica, Portugal |
2007 - 2009 | Epidemiologia | Enfermagem (Licenciatura) | Universidade Atlântica Escola Superior de Saúde Atlântica, Portugal |
Evaluation committee
Activity description Role |
Institution / Organization | Funding entity | |
---|---|---|---|
2004/04 - 2004/06 | Seleccionado para avaliador externo de projectos científicos no ambito do 6° Programa Quadro da União Europeia
Evaluator
|
European Commission, Belgium | European Commission Sixth Framework Programme |