Identification
Personal identification
- Full name
- António Marcos Ramos
Citation names
- Ramos, António Marcos
Author identifiers
- Ciência ID
- 4816-E6A3-A818
- ORCID iD
- 0000-0003-3450-0970
Knowledge fields
- Agrarian Sciences
Languages
Language | Speaking | Reading | Writing | Listening | Peer-review |
---|---|---|---|---|---|
Portuguese | Proficiency (C2) | Proficiency (C2) | Proficiency (C2) | Proficiency (C2) | |
English | Proficiency (C2) | Proficiency (C2) | Proficiency (C2) | Proficiency (C2) | |
Spanish; Castilian | Upper intermediate (B2) | Proficiency (C2) | Upper intermediate (B2) | Proficiency (C2) | |
French | Beginner (A1) | Intermediate (B1) | Beginner (A1) | Beginner (A1) | |
Dutch | Elementary (A2) | Elementary (A2) | Beginner (A1) | Elementary (A2) |
Education
Degree | Classification | |
---|---|---|
2006
Concluded
|
Animal Breeding and Genetics (Doctor of Philosophy)
Iowa State University, United States
"Molecular dissection of genomic regions influencing important economic traits in the pig" (THESIS/DISSERTATION)
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Honor and Distinction |
2002
Concluded
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Mestrado em Producao Animal (Mestrado)
Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro, Portugal
"Effect of the prolactin, ß-lactoglobulin and alpha-s1-casein variants on milk production traits of three Portuguese sheep
breeds" (THESIS/DISSERTATION)
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Muito Bom |
1998
Concluded
|
Engenharia Zootecnica (Licenciatura)
Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro, Portugal
"Analysis of polymorphisms at the alpha-s1-casein locus in the Serra da Estrela sheep breed" (THESIS/DISSERTATION)
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14 |
Affiliation
Science
Category Host institution |
Employer | |
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2015/01/01 - Current | Principal Investigator (Research) | Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal |
2013/07/01 - 2014/12/31 | Researcher (Research) | Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal |
2008/03/01 - 2010/08/31 | Researcher (Research) | Wageningen University & Research, Netherlands |
2006/07/01 - 2008/02/29 | Postdoc (Research) | Michigan State University, United States |
2002/07/01 - 2006/06/30 | Research Trainee (Research) | Iowa State University, United States |
1997/10/01 - 2002/06/30 | Research Trainee (Research) | Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro, Portugal |
Others
Category Host institution |
Employer | |
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2010/09/01 - 2012/08/31 | Scientist, Department of Bioinformatics | Keygene NV, Netherlands |
Projects
Grant
Designation | Funders | |
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1997 - 2000 | Estudo da Diversidade em Raças Autóctones Bovinas e Ovinas Pela Análise do DNA
PRAXIS/3/3.2/CA/2005/95
Research Fellow
Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia |
Contract
Designation | Funders | |
---|---|---|
2017/07/01 - Current | INNOACE – Innovación abierta e inteligente en la EUROACE (POCTEP). Atividade 3.2.8 "Identificación y desarrollo de marcadores
moleculares para la selección genómica en el cerdo Ibérico"
0049_INNOACE_4_E
Researcher
|
European Regional Development Fund
Ongoing
|
2017 - Current | Biodata.pt – Infraestrutura Portuguesa de Dados Biológicos
Projeto nº 22231
Researcher
Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia |
2016/09/01 - Current | SelectPorAl - Marker development for genomic selection in the Alentejano pig breed
ALT20-03-0145-FEDER-000032
Principal investigator
Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal
|
European Regional Development Fund |
2016/09/01 - Current | SelectPinea - Development of genetic markers for economic traits of interest in stone pine (Pinus pinea)
ALT20-03-0145-FEDER-000041
Principal investigator
Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal
|
European Regional Development Fund
Ongoing
|
2016 - Current | SelecTEcoli - Seleção e caracterização de estirpes de E. coli com tolerância acrescida a multi-inibidores derivados dos processos
de pré-tratamento da biomassa lenhocelulósica
ALT20-03-0145-FEDER-000034
Researcher
Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal
|
European Regional Development Fund |
2016 - Current | FASTBREED - implementação de um programa de melhoramento de variedades de trigo com base em seleção genómica
ALT20-03-0145-FEDER-000018
Researcher
|
European Regional Development Fund |
2016 - Current | Gen-Res-Alentejo – Utilização de Genómica na Seleção de ovinos resistentes a Parasitas e Peeira no alentejo
ALT20-03-0145-FEDER-000037
Researcher
Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal
|
European Regional Development Fund |
2015 - 2019 | LENTIDEV - uma abordagem molecular à porosidade da cortiça
ALT20-03-0145-FEDER-000020
Researcher
|
European Regional Development Fund |
2013 - 2018 | Genetic characterization of national animal and plant resources using next-generation sequencing
IF/00574/2012/CP1209/CT0001
Principal investigator
Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
|
2012 - 2015 | Genosuber - Sequenciação do genoma do sobreiro
ALENT-07-0224-FEDER-001754
Researcher
Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal
|
European Regional Development Fund |
2002 - 2005 | Selecção para a Produção de Leite da Raça Caprina Serpentina com Base na Utilização de Marcadores Moleculares
Agro 077/2001
Researcher
Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro, Portugal
|
Ministério da Agricultura Florestas e Desenvolvimento Rural |
2002 - 2005 | Programa de Conservação Genética para as raças ovinas Merina Preta e Campaniça e para a raça caprina Serpentina
Agro 076/2001
Researcher
Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro, Portugal
|
Ministério da Agricultura Florestas e Desenvolvimento Rural |
1999 - 2002 | Associações entre o polimorfismo de proteínas do leite e parâmetros de produção e qualidade do queijo, em raças Portuguesas
de ovinos
POCTI/CVT/34664/1999
Researcher
Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
|
1999 - 2000 | Caracterização quantitativa e qualitativa do leite e queijo de ovelha produzidos na região demarcada do Queijo Serpa
PAMAF 7145
Researcher
Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro, Portugal
|
Ministério da Agricultura Florestas e Desenvolvimento Rural |
1998 - 2000 | Characterization of genetic variation in the European pig to facilitate the maintenance and exploitation of biodiversity
Researcher
Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro, Portugal
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European Commission
Concluded
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Outputs
Publications
Book chapter |
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Conference abstract |
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Conference poster |
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Journal article |
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Thesis / Dissertation |
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Intellectual property
Patent |
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Activities
Supervision
Thesis Title Role |
Degree Subject (Type) Institution / Organization |
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2020 - Current | Variation detection and assembly of organelle genomes in Quercus species
Supervisor of Rita Ferreira
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Bioinformática e Aplicações às Ciências da Vida (Master)
Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal
Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro, Portugal |
2018 - Current | Genomic and bioinformatics methodologies for the identification of genetic markers in sheep
Supervisor of Daniel Gaspar
|
Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal
Universidade do Porto Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Portugal |
2017 - 2018 | Alternative splicing detection across different tissues in cork oak
Co-supervisor
|
Bioinformática e Biologia Computacional (Master)
Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal |
2017 - 2017 | Identification and characterization of structural variation in the cork oak genome
Supervisor of Hugo Magalhães
|
Bioinformática (Master)
Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal
Universidade do Minho, Portugal |
2015 - 2016 | Transcriptomic analysis of maritime pine response to infection with Bursaphelenchus xylophilus, the causing agent of pine
wilt disease
Supervisor of Daniel Gaspar
|
Bioinformática e Biologia Computacional (Master)
Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal |
2009 - 2010 | Efficiency and performance of different short read alignment tools for SNP detection using next generation sequencing technology
Co-supervisor of Zhao Zhen Sun
|
Wageningen Universiteit Departement Dierwetenschappen, Netherlands
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