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O meu nome é Ana Beatriz Ramos Caniceiro e sou apaixonada pela ciência e desenvolvimento de soluções para problemas no setor da biomedicina, com especial interesse em Química Computacional. Concluí a Licenciatura em Química Medicinal em 2017/07/12 (classificação 13/20), o Mestrado em Química Medicinal em 2019/09/25 (classificação 19/20), e o Mestrado em Biologia Computacional em 2023/07/11, todos pela Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade de Coimbra. Para além destes cursos académicos, já realizei mais 6 cursos de treino ou avançados, e participei na Summer School da BioExcel em 2023, na área de Biologia Computacional, em Sardenha. Durante o meu percurso académico também fiz parte do Núcleo de Estudantes de Química da Associação Académica de Coimbra enquanto colaboradora, coordenadora do pelouro da cultura e secretária da mesa de plenário. Com esta experiência adquiri competências a nível da organização de atividade e tempo e trabalho de equipa. Até ao dia de hoje, já participei como Bolseiro de Investigação em 3 projetos (UID/QUI/00313/2019, PTDC/QUI-OUT/32243/2017 e DSAIPA/DS/0118/2020). Já organizei 4 eventos e participei em 28 eventos, incluindo conferências, encontros científicos e workshops. Atualmente frequento o Programa Doutoral em Biociências do Departamento de Ciências da Vida da Universidade de Coimbra, com bolsa da FCT (2022.12479.BD). Já publiquei 5 artigos em revistas especializadas, fiz duas comunicações orais em dois congressos em 2023, e já fiz um total de 3 comunicações em poster. Atuo, por isso, nas áreas de Ciências Exatas com ênfase em Bioinformática e Ciências Exatas com ênfase em Química. O meu interesse notório fez com que tivesse conhecimentos em várias metodologias, incluindo: estrutura de proteínas, programação em linguagem R, ferramentas de linha de comandos, análise de grandes dados (Big-data), programação em Python, visualização molecular (Pymol e UCSF Chimera), docking molecular, simulações de dinâmica molecular, descoberta computacional de fármacos, construção de bases de dados, "G protein-coupled receptors" (GPCRs), análise de mutações, doenças neurodegenerativas, inteligência artificial.
Identification

Personal identification

Full name
Ana Beatriz Ramos Caniceiro

Citation names

  • Caniceiro, Ana B.

Author identifiers

Ciência ID
431E-AE00-8296
ORCID iD
0000-0002-4074-9142

Email addresses

  • abcaniceiro@cnc.uc.pt (Professional)

Telephones

Mobile phone
  • 967565875 (Personal)

Websites

Knowledge fields

  • Exact Sciences - Computer and Information Sciences - Bioinformatics
  • Exact Sciences - Chemical Sciences

Languages

Language Speaking Reading Writing Listening Peer-review
Portuguese (Mother tongue)
English Upper intermediate (B2) Upper intermediate (B2) Upper intermediate (B2) Upper intermediate (B2) Upper intermediate (B2)
Education
Degree Classification
2021/10/29 - 2024
Ongoing
Programa Doutoral em Biociências (Doutoramento)
Major in Bioquímica
Universidade de Coimbra, Portugal
2020 - 2023/07/11
Concluded
Biologia Computacional (Mestrado)
Major in Biologia Computacional
Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal
"A big data approach to understand mutagenesis effect on the GPCR subfamily A17" (THESIS/DISSERTATION)
17 valores
2022/02/28 - 2022/03/04
Concluded
Experimental design and analysis of multivariate data (Curso de doutoramento (conclusão de unidades curriculares))
Major in Biologia
Universidade de Aveiro Centro de Estudos do Ambiente e do Mar, Portugal
19 valores
2021/02/18 - 2021/05/27
Concluded
Curso de Formação de Inglês para Fins Académicos II (nível intermédio/avançado) (Outros)
Universidade de Coimbra Centro de Línguas da Faculdade de Letras, Portugal
16 valores
2021/03/17 - 2021/05/25
Concluded
Metodologia Qualitativa de Investigação Científica (Outros)
Universidade de Coimbra, Portugal
15 valores
2021/02/22 - 2021/02/26
Concluded
Computational Biology advanced course (Curso de doutoramento (conclusão de unidades curriculares))
Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal
18 valores
2020/09/21 - 2021/01/12
Concluded
Curso de Formação de Inglês para Fins Académicos I (Outros)
Universidade de Coimbra Centro de Línguas da Faculdade de Letras, Portugal
17 valores
2017 - 2019/09/25
Concluded
Química Medicinal (Mestrado)
Major in Química Biológica
Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal
"O papel dos halogénios no desenho de fármacos. O caso da ligação de pequenos ligantes à Transtirretina." (THESIS/DISSERTATION)
17 valores
2014 - 2017/07/12
Concluded
Química Medicinal (Licenciatura)
Major in Química Medicinal
Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal
13 valores
2017
Concluded
Curso de Formação Profissional de Inglês Pré-intermédio B1 (Outros)
Tecnisign Coimbra, Portugal
18 valores
Affiliation

Science

Category
Host institution
Employer
2022/05/01 - 2022/10/31 Researcher (Research) Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal
Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal
2021/04/12 - 2022/04/11 Researcher (Research) Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal
Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal
2019/09/01 - 2020/12/31 Researcher (Research) Universidade de Coimbra Centro de Química de Coimbra, Portugal
Universidade de Coimbra Departamento de Química, Portugal
Projects

Grant

Designation Funders
2022/05/01 - 2022/10/31 Descoberta do Interactoma vírus-hospedeiro: uma abordagem guiada por AI e dados multi-ómicos
DSAIPA/DS/0118/2020
Research Fellow
Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal
Ongoing
2021/04/12 - 2022/04/11 Membrane proteins - development of new computational approaches and its application to G-Protein Coupled Receptors
PTDC/QUI-OUT/32243/2017
Research Fellow
Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal
Concluded
2019/09/01 - 2020/12/31 Characterization of the interaction of bioactive compounds with proteins using experimental methodologies, namely nuclear magnetic resonance and isothermal titration calorimetry
UID/QUI/00313/2019
Research Fellow
Universidade de Coimbra Centro de Química de Coimbra, Portugal
Concluded
Outputs

Publications

Conference poster
  1. Caniceiro, Ana B.; Bueschbell, Beatriz; Preto, António J.; Barreto, Carlos A.V.; Moreira, Irina S.. "MUG Database: mutational landscape of GPCR subfamily A17 receptors". Paper presented in BioExcel Summer School 2023, 2023.
  2. Caniceiro, Ana B.; Bueschbell, Beatriz; A. J. Preto; Barreto, Carlos A.V.; Moreira, Irina S. "MUTPROT database: a mutation overview of GPCR sub-family A17 receptors". Paper presented in VIII Encontro de Jovens Investigadores de Biologia Computacional Estrutural, 2021.
  3. Pires, Manuel N.; Catarina Marques-Pereira; Pereira, Nádia N.; Caniceiro, Ana B.; Gouveia, Raquel P.; Rosário-Ferreira, Nicia; Moreira, Irina S.. "SARS-CoV-2 membrane protein: from genomic data to structural new insights". Paper presented in VIII Encontro de Jovens Investigadores de Biologia Computacional Estrutural, 2021.
Journal article
  1. Preto, António J.; Caniceiro, Ana B.; Duarte, Francisco; Fernandes, Hugo; Ferreira, Lino; Mourão, Joana; Moreira, Irina S.. "POSEIDON: Peptidic Objects SEquence-based Interaction with cellular DOmaiNs: a new database and predictor". Journal of Cheminformatics 16 1 (2024): http://dx.doi.org/10.1186/s13321-024-00810-7.
    10.1186/s13321-024-00810-7
  2. Caniceiro, Ana B.; Bueschbell, Beatriz; Barreto, Carlos A.V.; Preto, António J.; Moreira, Irina S.. "MUG: A mutation overview of GPCR subfamily A17 receptors". Computational and Structural Biotechnology Journal 21 (2023): 586-600. http://dx.doi.org/10.1016/j.csbj.2022.12.031.
    Published • 10.1016/j.csbj.2022.12.031
  3. Caniceiro, Ana B.; Bueschbell, Beatriz; Schiedel, Anke C.; Moreira, Irina S.. "Class A and C GPCR dimers in neurodegenerative diseases". Current Neuropharmacology 20 (2022): http://dx.doi.org/10.2174/1570159x20666220327221830.
    Published • 10.2174/1570159x20666220327221830
  4. Marques-Pereira, Catarina; Pires, Manuel N.; Gouveia, Raquel P.; Pereira, Nádia N.; Caniceiro, Ana B.; Rosário-Ferreira, Nícia; Moreira, Irina S.. "SARS-CoV-2 Membrane Protein: From Genomic Data to Structural New Insights". International Journal of Molecular Sciences 23 6 (2022): 2986. http://dx.doi.org/10.3390/ijms23062986.
    Published • 10.3390/ijms23062986
  5. Bueschbell, Beatriz; Caniceiro, Ana B.; Suzano, Pedro M.S.; Machuqueiro, Miguel; Rosário-Ferreira, Nícia; Moreira, Irina S.. "Network biology and artificial intelligence drive the understanding of the multidrug resistance phenotype in cancer". Drug Resistance Updates 60 (2022): 100811. http://dx.doi.org/10.1016/j.drup.2022.100811.
    Published • 10.1016/j.drup.2022.100811
Thesis / Dissertation
  1. "A big data approach to understand mutagenesis effect on the GPCR subfamily A17". Master, Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, 2022.
  2. Caniceiro, Ana Beatriz Ramos. "O papel dos halogénios no desenho de fármacos. O caso da ligação de pequenos ligantes à Transtirretina.". Master, 2019. http://hdl.handle.net/10316/87875.
Activities

Oral presentation

Presentation title Event name
Host (Event location)
2023/12/18 Bridging Quantitative Database Insights with Machine Learning for CPPs 3D-BioInfo-PT Annual Meeting 2023
3D-BioInfo-PT The Portuguese Community of Structural Bioinformatics Researches (Coimbra, Portugal)
2023/03/16 MUG: A mutation overview of GPCR subfamily A17 receptors XII Bioinformatics Open Days
(Braga, Portugal)
2022/05/04 An overview of mutations distribution within GPCR sub-family A17 in one database - MUG database BioData.pt TALKS
BioData.pt (Portugal)

Event organisation

Event name
Type of event (Role)
Institution / Organization
2023/06/15 - 2023/12/19 Evento constituído por 3 workshops e 1 encontro anual. Um dos eventos em destaque é o 2º Encontro Anual 3D-BioInfo-PT, que se baseia no sucesso do anterior Encontro de Jovens Investigadores em Biologia Computacional Estrutural (EJIBCE), tendo tido 8 edições desde 2013. O nosso primeiro workshop está agendado para os dias 15 e 16 de junho, seguido pelo segundo workshop em setembro e culminando com o terceiro workshop e o encontro anual em dezembro deste ano, totalizando 5 dias de atividades. (2023/12/18 - 2023/12/18)
Meeting (Member of the Organising Committee)
Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, Portugal
2018/09/09 - 2018/09/14 Colaboração na organização e dinamização do XXVI Congresso Ibero-Americano de Catálise, durante os dias em que este decorreu. (2018/09/09 - 2018/09/14)
Congress (Member of the Organising Committee)
Sociedade Portuguesa de Química, Portugal

Universidade de Coimbra, Portugal
2017/04/22 - 2017/04/22 Em 2017, colaborei com a equipa organizadora na dinamização e organização das "Olimpíadas de Química Junior", durante o dia do concurso. (2017/04/22 - 2017/04/22)
Call (Member of the Organising Committee)
Sociedade Portuguesa de Química, Portugal

Universidade de Coimbra Departamento de Química, Portugal
2017/04/07 - 2017/04/10 Colaboração na organização do V Encontro Nacional de Estudantes de Química (V ENEQUI), organizado pelo Núcleo de Estudantes de Química da Associação Académica de Coimbra (NEQ/AAC), com a colaboração da Associação Nacional de Estudantes de Química (ANEQ). (2017/04/07 - 2017/04/10)
Meeting (Co-organisor)
Universidade de Coimbra, Portugal

Event participation

Activity description
Type of event
Event name
Institution / Organization
2023/09/10 - 2023/09/15 Participação na BioExcel Summer School 2023, com apresentação de um poster científico.
Other
BioExcel Summer School 2023
Sardegna Ricerche, Italy
2023/05/15 - 2023/05/15 Leccionei um workshop para os alunos do Departamento de Ciências da Vida da Universidade de Coimbra.
Workshop
Ciclo de Workshops na Área da Biologia Computacional
Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, Portugal
2023/02/11 - 2023/02/11 Participação no MAKE IT.
Call
MAKE IT
Millennium bcp, Portugal
2022/12/20 - 2022/12/20 Leccionei um workshop de nível intermédio para a comunidade 3D-BioInfo-PT.
Workshop
3D-BioInfo-PT
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal
2021/12/21 - 2021/12/22 Workshop em "Computational Structural Biology Tools". Workshop de dois dias, que consistiu numa pipeline robusta de métodos de caracterização de ligantes de proteínas in silico, para resolver um dos maiores problemas biológicos da atualidade (SARS-CoV-2).
Workshop
Computational Structural Biology Tools workshop
BioData.pt, Portugal
2021/12/20 - 2021/12/20 Participação no VIII Encontro de Jovens Investigadores de Biologia Computacional Estrutural.
Conference
VIII EJIBCE
BioData.pt, Portugal
2021/11/23 - 2021/11/23 Formação sobre o uso do software PyMOL.
Workshop
Formação de PyMOL
Núcleo de Bioquímica do Porto, Portugal
2021/11/17 - 2021/11/17 Webinar sobre como usar Python para aceder ao UniProt de forma programática.
Seminar
Programmatic access to UniProt using Python webinar
European Bioinformatics Institute, United Kingdom
2021/10/19 - 2021/10/19 Workshop de GROMACS, que é um software dedicado à dinâmica molecular.
Workshop
GROMACS Workshop
BioData.pt, Portugal
2021/05/05 - 2021/05/08 Participação no congresso X Bioinformatics Open Days.
Congress
X Bioinformatics Open Days
Universidade do Minho, Portugal
2021/04/12 - 2021/04/14 Participação na conferência "4th Ernest".
Conference
4th European Research Network on Signal Transduction Conference
2021/03/31 - 2021/03/31 Minicurso de métodos computacionais para estudo de proteínas
Symposium
I Simpósio Online Maranhense de Bioinformática
Universidade Estadual do Maranhão, Brazil
2020/11/25 - 2020/11/25 Webinar sobre oportunidades e desafios apresentados pelos grandes sistemas biológicos, como as propriedades atómicas se manifestam nos espectros de NMR, utilizando o flúor como exemplo, como utilizar a rotulagem seletiva 19F, 13C e 2H para mapear características estruturais, o que é que se entende por CSA e o efeito TROSY, e novas abordagens experimentais 19F-NMR para desvendar a função biomolecular.
Seminar
Harnessing 19F as an agent in bio-NMR of large systems
SelectScience, United Kingdom
2019/12/18 - 2019/12/19 Workshop HADDOCK, sobre modelação baseada em informações de complexos biomoleculares. Workshop satélite do Encontro de Jovens Investigadores de Biologia Computacional Estrutural de 2019. Workshop conduzido pelo Professor Alexandre Bonvin, da Universidade de Utrecht, na Holanda, e consistiu em palestras e sessões práticas computacionais, durante as quais aprendemos a usar o HADDOCK e outras ferramentas relacionadas à modelação de complexos biomoleculares.
Workshop
Workshop Haddock
Universidade de Coimbra, Portugal
2019/11/06 - 2019/11/07 Evento constituído por apresentações de empresas da área da Química e Química Medicinal, bem como palestras com exemplos de empreendedorismo, sobre investigação científica, sobre currículo e entrevistas de emprego, sobre currículo científico e palestras motivacionais. Participação enquanto ouvinte e interveniente.
Congress
VII Feira de Emprego e Empreendedorismo do Departamento de Química
Núcleo de Estudantes de Química da Associação Académica de Coimbra, Portugal

Universidade de Coimbra Departamento de Química, Portugal
2019/10/18 - 2019/10/18 O professor Hartmut Luecke, da Universidade de Oslo, falou sobre o Cryo-EM e como usá-lo para estudar grandes complexos de proteínas. Nos últimos anos, o Cryo-EM testemunhou um progresso surpreendente na metodologia e aplicações, culminando com o Prémio Nobel em Química em 2017.
Seminar
Cryo-EM: What´s all the fuss about?
Universidade de Coimbra Departamento de Química, Portugal
2019/04/29 - 2019/04/29 Workshop em Mestrenova, um software de análise de dados espectrais.
Workshop
Workshop em Mestrenova
Molecular JE, Portugal
2019/02/20 - 2019/02/21 Participação no IV Encontro Científico do NEQ/AAC, cujo tema principal se baseou na Química Verde. Evento constituído por comunicações convidadas, comunicações orais, plenárias e palestras motivacionais. Têm como objetivo dar a conhecer projetos científicos realizados em diversas Universidades portugueses e institutos de investigação.
Meeting
IV Encontro Científico do NEQ/AAC - Química Verde: um repensar da Química
Núcleo de Estudantes de Química da Associação Académica de Coimbra, Portugal
2019/01/29 - 2019/01/29 Workshop em Estratégias de Descoberta de Fármacos, composto por cinco palestras sobre diferentes áreas de atuação na Química Medicinal, nas quais mostraram projetos de investigação realizados e resultados.
Workshop
Estratégias de Descoberta de Fármacos
Universidade de Coimbra Departamento de Química, Portugal
2018/11/13 - 2018/11/14 Evento constituído por apresentações de empresas da área da Química e Química Medicinal, bem como palestras com exemplos de empreendedorismo, sobre patentes, sobre currículo e entrevistas de emprego e motivacionais. Participação enquanto ouvinte e interveniente.
Congress
VI Feira de Emprego e Empreendedorismo do Departamento de Química
Núcleo de Estudantes de Química da Associação Académica de Coimbra, Portugal

Universidade de Coimbra Departamento de Química, Portugal
2018/04/10 - 2018/04/10 Participação no evento "A Química do Empreendedorismo", que consistiu num programa dividido em três painéis com diferentes pequenas e grandes empresas, que são exemplos de empreendedorismo. No evento foi possível partilhar conhecimento e trocar ideias.
Conference
A Química do Empreendedorismo
Núcleo de Estudantes de Química da Associação Académica de Coimbra, Portugal

Académica Start UC, Portugal
2018/02/21 - 2018/02/22 Participação no III Encontro Científico do NEQ/AAC. Evento constituído por comunicações convidadas, comunicações orais, plenárias e palestras motivacionais. Têm como objetivo dar a conhecer projetos científicos realizados em diversas Universidades portugueses e institutos de investigação.
Meeting
III Encontro Científico do NEQ/AAC - Encontra-te com a Química!
Núcleo de Estudantes de Química da Associação Académica de Coimbra, Portugal
2017/10/25 - 2017/10/26 Evento constituído por apresentações de empresas da área da Química e Química Medicinal, bem como palestras com exemplos de empreendedorismo, sobre currículo e entrevistas de emprego e motivacionais. Participação enquanto ouvinte e interveniente.
Congress
V Feira de Emprego e Empreendedorismo do Departamento de Química
Núcleo de Estudantes de Química da Associação Académica de Coimbra, Portugal

Universidade de Coimbra Departamento de Química, Portugal
2017/02/15 - 2017/02/16 Evento constituído por apresentações de empresas da área da Química e Química Medicinal, bem como palestras com exemplos de empreendedorismo, sobre patentes, sobre currículo e entrevistas de emprego e motivacionais. Participação enquanto ouvinte e interveniente.
Congress
IV Feira de Emprego e Empreendedorismo do Departamento de Química
Núcleo de Estudantes de Química da Associação Académica de Coimbra, Portugal

Universidade de Coimbra Departamento de Química, Portugal
2016/03/18 - 2016/03/20 Participação no IV Encontro Nacional de Estudantes de Química, realizado na Universidade do Porto.
Meeting
IV Encontro Nacional de Estudantes de Química
Universidade do Porto - Núcleo de Química do Porto, Portugal
2016/02/25 - 2016/02/26 Evento constituído por apresentações de empresas da área da Química, Bioquímica e Química Medicinal, bem como palestras com exemplos de empreendedorismo e palestras motivacionais. Participação enquanto ouvinte e interveniente.
Congress
III Feira de Emprego e Empreendedorismo do Departamento de Química
Núcleo de Estudantes de Química da Associação Académica de Coimbra, Portugal

Universidade de Coimbra Departamento de Química, Portugal
2015/10/20 - 2015/10/20 Curso extracurricular de Chemdraw. O chemdraw é um software que permite desenhar estruturas de moléculas e mecanismos e saber propriedades químicas de uma vasta gama de compostos, entre outras vantagens.
Workshop
Workshop de Chemdraw
Núcleo de Estudantes de Química da Associação Académica de Coimbra, Portugal
2015/02/25 - 2015/02/25 Evento focado em palestras sobre o papel dos Químicos no setor empresarial e industrial, palestras de conhecimento e palestras motivacionais. Participação enquanto ouvinte e interveniente.
Congress
II Feira de Emprego e Empreendedorismo do Departamento de Química
Núcleo de Estudantes de Química da Associação Académica de Coimbra, Portugal

Universidade de Coimbra Departamento de Química, Portugal
2011/04/02 - 2011/04/02 Participação no concurso "Olimpíadas de Química Junior" de 2011, em conjunto com mais duas colegas.
Call
Olimpíadas de Química Junior
Sociedade Portuguesa de Química, Portugal

Universidade de Coimbra Departamento de Química, Portugal

Association member

Society Organization name Role
2018 - 2019 Núcleo de Estudantes de Química da Associação Académica de Coimbra Secretária da Mesa de Plenário
2016 - 2018 Núcleo de Estudantes de Química da Associação Académica de Coimbra Coordenadora do pelouro da cultura
2015 - 2016 Núcleo de Estudantes de Química da Associação Académica de Coimbra Colaboradora do pelouro da cultura