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I have completed the PhD in Physics in 1999, Instituto Superior Técnico (University of Lisbon - UL), in the area of plasma physics, obtained the Master's Degree in Particle Physics in 1995 by the Faculty od Sciences at UL and graduated in Physics in 1991 also at UL. I belong to the teaching staff of the Physics Department at the University of Algarve (UAlg) since 1996 and I am currently the coordinator of CEOT (Center for Electronics, Optoeletronics and Telecommunications), also based at UAlg, until the end of 2024. I am currently engaged in developing a research line in optical diagnostics, with emphasis on light scattering and biological applications. Specifically, I am particularly interested in the application of the concepts of light scattering in turbid media to the non-invasive determination of fruit internal quality parameters. The research has a strong focus in industry applications, since our group is presently collaborating with the industry on a prototype for fruit sorting by internal quality attributes. We have also started a line of research for early detection of phyto-pathology symptoms in plant leaves through visible/near infrared spectroscopy. However, my work relies also on fundamental studies on diffuse reflectance spectroscopy, chemometrics, models for light propagation and instrumentation issues, which allowed us to apply these techniques in other fields, such as led illumination in aquaculture, honey characterization and infrared spectroscopy. Complimentary areas are diode laser spectroscopy (experience through the post-doc in Umea) and light scattering in plasmas (Ph.D.)
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Identification

Personal identification

Full name
Rui Guerra

Citation names

  • Guerra, Rui Manuel Farinha das Neves

Author identifiers

Ciência ID
3D16-5067-D6BB
ORCID iD
0000-0002-8642-5792

Addresses

  • Universidade do Algarve. Departamento de Física, Fac. Ciências e Tecnologia, Universidade do Algarve, Campus de Gambelas, 8005-139, Faro, Faro, Portugal (Professional)

Knowledge fields

  • Exact Sciences - Physical Sciences - Optics
  • Exact Sciences - Chemical Sciences
  • Exact Sciences - Computer and Information Sciences
  • Agrarian Sciences - Agriculture, Forestry and Fisheries - Agronomy

Languages

Language Speaking Reading Writing Listening Peer-review
English Proficiency (C2) Proficiency (C2) Proficiency (C2) Proficiency (C2) Proficiency (C2)
French Advanced (C1) Proficiency (C2) Advanced (C1) Advanced (C1) Advanced (C1)
Spanish; Castilian Intermediate (B1) Upper intermediate (B2) Intermediate (B1) Upper intermediate (B2) Intermediate (B1)
Education
Degree Classification
1994/06/01 - 1999/12/15
Concluded
 Física (Doutoramento)
Major in Física de Plasmas
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
"Electromagnetic wave scattering in turbulent and dusty plasmas" (THESIS/DISSERTATION)
 Aprovado
1995
Concluded
 Mestrado em Altas Energias e Gravitação (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
"Coulomb effects in the reaction e+e- -> W+W-" (THESIS/DISSERTATION)
 A
1991
Concluded
 Física (Licenciatura)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
"n/a" (THESIS/DISSERTATION)
 16
Affiliation

Science

Category
Host institution 		Employer
2000/02 - 2001/02 Visiting Researcher (Research) Universidade do Algarve, Portugal
Umea Universitet Institutionen for fysik, Sweden

Teaching in Higher Education

Category
Host institution 		Employer
2000/01/01 - Current Assistant Professor (University Teacher) Universidade do Algarve - Campus de Gambelas, Portugal
1996/12/16 - 2000/01/04 Assistant (University Teacher) Universidade do Algarve, Portugal

Positions / Appointments

Category
Host institution 		Employer
2013 - Current Conselho científico/técnico-científico ou orgão correspondente Universidade do Algarve Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
Universidade do Algarve, Portugal
2013 - Current Manager of Laboratory, Institute, Museum, Centre or Observatory Universidade do Algarve Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
Universidade do Algarve Centro de Electronica Optoelectrônica e Telecomunicacoes, Portugal

Others

Category
Host institution 		Employer
1993 - 1996 Bolseiro de doutoramento Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
1992 - 1993 Bolseiro de mestrado Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
Projects

Contract

Designation Funders
2023/02/01 - 2024/07/31 Desfasamento intervarietal no amadurecimento de citrinos: o papel das vias metabólicas da sacarose e do ácido cítrico em laranja
2022.05252.PTDC
10.54499/2022.05252.PTDC
Universidade do Algarve, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Ongoing
2020/01/01 - 2023/12/31 Centro de Electrónica, Optoelectrónica e Telecomunicações
UIDB/00631/2020
Universidade do Algarve, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Ongoing
2020/01/01 - 2023/12/31 Centro de Electrónica, Optoelectrónica e Telecomunicações
UIDP/00631/2020
Universidade do Algarve, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Ongoing
2018/10/15 - 2021/10/14 NIBAP - Núcleo de Investigação em Biotecnologia e Agricultura de Precisão
ALG-01-0247-FEDER-037303
Principal investigator
Universidade do Algarve Centro de Electronica Optoelectrônica e Telecomunicacoes, Portugal
 Comissão de Coordenação e Desenvolvimento Regional do Algarve

Agência Nacional de Inovação SA
Ongoing
2018/09/01 - 2021/08/31 OtiCalFrut - Calibração Ótica de Frutos (Optical Calibration of Fruits)
ALG-01-0247-FEDER-033652
Principal investigator
Universidade do Algarve Centro de Electronica Optoelectrônica e Telecomunicacoes, Portugal
 Comissão de Coordenação e Desenvolvimento Regional do Algarve

Agência Nacional de Inovação SA
Ongoing
2019/01/01 - 2019/12/31 Centro de Electrónica, Optoelectrónica e Telecomunicações
UID/Multi/00631/2019
Universidade do Algarve, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2015/01/01 - 2018/12/31 Centro de Electrónica, Optoelectrónica e Telecomunicações
UID/Multi/00631/2013
Universidade do Algarve, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2017/06/01 - 2018/05/31 Modelo de otimização de fatores biológicos na gestão da Pêra 'Rocha' na pré e pós-colheita (Optimization of biological factors in the management of 'Rocha' pear in pre- and post-harvest)
POCI-01-0247-FEDER-022596
Principal investigator
Universidade do Algarve Centro de Electronica Optoelectrônica e Telecomunicacoes, Portugal
 Comissão de Coordenação e Desenvolvimento Regional do Centro
Concluded
2014/01/01 - 2014/12/31 Projecto Estratégico - UI 631 - 2014
PEst-OE/EEI/UI0631/2014
Universidade do Algarve, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2011/01/01 - 2013/12/31 Projecto Estratégico - UI 631 - 2011-2012
PEst-OE/EEI/UI0631/2011
Universidade do Algarve, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2012/12/04 - 2013/12/03 CalBrix - Calibração automática e não destrutiva do o Brix de frutos [CalBrix - automated non-destructive grading of fruit Brix]]
Vale Inovação 2012/24092
Principal investigator
Universidade do Algarve Centro de Electronica Optoelectrônica e Telecomunicacoes, Portugal
 Comissão de Coordenação e Desenvolvimento Regional do Algarve
Concluded
2003/01/01 - 2006/12/31 Espectroscopia e imagiologia de tecidos biológicos com luz laser" [Spectroscopy and imagiology of biological tissues with laser light]
POCTI/FAT/42850/2001
Principal investigator
Universidade do Algarve, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2004/04/01 - 2006/03/31 "Espalhamento de luz em meios biológicos túrbidos: uma abordagem fractal" [Light scattering in turbid biological media: a fractal approach]
POCTI/FAT/45690/2002
Principal investigator
Universidade do Algarve Centro de Electronica Optoelectrônica e Telecomunicacoes, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2000/03/01 - 2001/02/28 DEVELOPMENT OF DIODE-LASAER-BASED SPECTROSCOPIC MODULATION TECHNIQUES FOR ULTRA-SENSITIVE TRACE SPECIES DETECTION
PRAXIS XXI/BPD/22073/99
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded

Other

Designation Funders
2015/01/01 - 2015/06/30 Desenvolvimento de modelos matemáticos aplicados à determinação óptica de defeitos internos de fruta em calibradores automáticos'' [Development of mathematical models applied to the optical determination of fruit internal defects in automated grading machines]
PS-Calibrafruta
Principal investigator
Universidade do Algarve Centro de Electronica Optoelectrônica e Telecomunicacoes, Portugal
 Calibrafruta Lda.
Concluded
Outputs

Publications

Book
  1. Guerreiro, A.; Gago, C.; Veloso, F.; Freitas, L.; Guerra, R.; Antunes, M.D.. Evaluation of storage temperature on quality attributes of red-fleshed kiwifruit (Actinidia chinensis var. chinensis). 2022.
    10.17660/ActaHortic.2022.1332.49
  2. Afonso, A.M.; Guerra, R.; Freitas, L.; Veloso, F.; Cavaco, A.M.; Antunes, M.D.. Ripening evolution of 'Hayward' kiwifruit orchards. 2022.
    10.17660/ActaHortic.2022.1332.50
  3. Guerreiro, A.; Gago, C.; Veloso, F.; Freitas, L.; Guerra, R.; Antunes, M.D.. Storage temperature effect on kiwiberry (Actinidia arguta ‘Ken’s Red’) shelf-life. 2021.
    10.17660/ActaHortic.2021.1327.74
  4. Vieira, A.I.; Guerreiro, A.C.; Gago, C.L.; Brázio, A.; Guerra, R.; Cavaco, A.M.; Panagopoulos, T.; Veloso, F.; Antunes, M.D.. An attempt to find a non-destructive method to determine ripeness of kiwifruit (Actinidia chinensis Planch. ‘Jintao’). 2018.
    10.17660/ActaHortic.2018.1218.67
  5. Cavaco, A.M.; Miguel, G.; Antunes, D.; Guerra, R.. Determination of geographical and botanical origin of honey: From sensory evaluation to the state of the art of non-invasive technology. 2012.
  6. Cavaco, A.M.; Antunes, M.D.C.; Marques Da Silva, J.; Guerra, R.. A preliminary approach to the Prediction of 'Rocha' pear skin Pigments by Vis/NIR reflectance spectroscopy. 2010.
Book chapter
  1. Guerra, Rui Manuel Farinha das Neves; Almeida, Sandro; Cavaco, A. M.; Antunes, Maria Dulce. "On the application of spatially resolved reflectance and diffuse light backscattering goniometry to the prediction of firmness in apple ¿bravo de esmolfe¿". Universidade do Algarve, 2010.
Conference paper
  1. Adriana C Guerreiro; Gago, Custodia; Veloso, F.; Guerra, Rui Manuel Farinha das Neves; Antunes, Maria Dulce Carlos. Corresponding author: Adriana C Guerreiro. "Application of edible coating to increase storage time in red-fleshed kiwifruit (Actinidia chinensis var. chinensis)". Zaragoza, 2022.
    Published
  2. Adriana C Guerreiro; Gago, Custodia; Antunes, Maria Dulce Carlos; Guerra, Rui Manuel Farinha das Neves. "Determination of the temperature effect on storability on yellow kiwifruit using destructive and nondestructive methods.". Zaragoza, 2022.
    Published
  3. Monteiro, J A S; Duarte, A.; Silva, Melina; Pedras, Celestina M. G.; Guerra, Rui Manuel Farinha das Neves. "Efeito da infeção pelo Citrus tristeza vírus na taxa fotossintética, concentração interna de CO2, condutância estomática à água e transpiração, em plantas de Citrus macrophylla". Paper presented in 4º Simpósio Nacional de Fruticultura, 2018.
  4. Guerra, Rui Manuel Farinha das Neves. "Preliminary results on the non-invasive diagnosis of superfi- cial scald in ‘Rocha’ pear by fluorescence imaging". 2009.
  5. Guerra, Rui Manuel Farinha das Neves. "A First Approach to the Optical and Antioxidant Properties of Propolis Collected at Different Sites of Algarve Region". 2008.
  6. Resendes, D.P.; Mendonça, J.T.; Guerra, R.; Shukla, P.K.. "Multiple scattering of electromagnetic waves by large amplitude drift turbulent vortex streets in a plasma". 1996.
Conference poster
  1. Vicente, Patrícia; Ana Margarida Vicente Cavaco; Guerra, Rui Manuel Farinha das Neves; Claudia Sánchez. "From Farm to Fork: a comprehensive quality assessment of "Rubin Fuji" apple from two orchards under different cultural practices". Paper presented in Iberian Plant Biology Congress 2023, 2023.
  2. A.Guerreiro; Custódia Gago; Fernão Veloso; Antunes, Dulce; Guerra, Rui Manuel Farinha das Neves. Corresponding author: A.Guerreiro. "Harvest date impact on preservability and quality of red- fleshed kiwifruit". Paper presented in 5º Simpósio Nacional de Fruticultura, 2023.
  3. Vicente, Patrícia; Claudia Sánchez; Guerra, Rui Manuel Farinha das Neves; Ana Margarida Vicente Cavaco. "Avaliação da qualidade da Maçã de Alcobaça IGP "Rubin Fuji" em dois pomares com práticas culturais distintas: o primeiro passo na construção de modelos de espetroscopia de Vis-NIR". Paper presented in 5º Simpósio Nacional de Fruticultura, 2023.
  4. Vicente, Patrícia; Claudia Sánchez; Guerra, Rui Manuel Farinha das Neves; Ana Margarida Vicente Cavaco. "Ripening of Maçã de Alcobaça PGI "Rubin Fuji" from two orchards with different cultural practices: assessment of the optimal harvest date". Paper presented in VII Encontro de Estudantes de Doutoramento em Ambiente e Agricultura, 2022.
  5. Pires, Rosa; Guerra, Rui Manuel Farinha das Neves; Cruz, Sandra P.; Antunes, M. Dulce; Brázio, António; Afonso, Andreia M.; Daniel, Mariana; et al. "Smart tools for citrus ripening monitoring on-tree: modelling maturity index for orchard management". Paper presented in XV Portuguese-Spanish Symposium on Plant Water Relations: Water Relations under climate change: from genes to ecosystems, 2022.
  6. da Silva, Melina; Pinto, Patricia; Dandlen, Susana; Guerra, Rui Manuel Farinha das Neves; Deborah M. Power; Natália Tomás Marques. "Transcriptome analysis and gene expression profile in response to drought stress in Citrus macrophylla stem tissues". Paper presented in 16th Congress of the Mediterranean Phytopathological Union, 4-8 April 2022, Limassol, Cyprus., 2022.
  7. Pires, Rosa; Guerra, Rui Manuel Farinha das Neves; Antunes, M. Dulce; Cruz, Sandra P.; Brázio, António; Afonso, Andreia M.; Panagopoulos, Thomas; Daniel, Mariana; Cavaco, Ana M.. Corresponding author: Cavaco, Ana M.. "Recalibration as a major tool to improve Vis-NIR spectroscopy-based calibration models performance in the non-destructive assessment of ¿Ortanique¿ ripening on-tree". Paper presented in 1st sensorFINT International Workshop of the COST Action 19145 ¿EuropeanNetwork for assuring food integrity using non-destructive spectral sensors¿ dedicated to ¿Smart Spectral Sensors for Agri-Food Quality and Process Control¿, 2021.
  8. Ana M. Cavaco; Pires, Rosa; Guerra, Rui Manuel Farinha das Neves; Antunes, M. Dulce; Cruz, Sandra P.; Panagopoulos, Thomas; Brázio, António; et al. Corresponding author: Ana M. Cavaco. "The perks and ills of Vis-NIR spectroscopy in the assessment of ¿Algarve Citrus¿ ripening on-tree". Paper presented in 1st sensorFINT International Workshop of the COST Action 19145 ¿EuropeanNetwork for assuring food integrity using non-destructive spectral sensors¿ dedicated to ¿Smart Spectral Sensors for Agri-Food Quality and Process Control¿, 2021.
  9. Guerra, Rui Manuel Farinha das Neves; Ana M Cavaco; Passos, Dário; Afonso, Andreia; Pires, Rosa; Cruz, Sandra; Jaime Afonso Martins; et al. "Overview of applications of VIS/NIR spectroscopy developed in CEOT for monitoring fruits and plants". Paper presented in Sensor FINT'21 ¿ Smart Spectral Sensors for Agri-food Quality and Process Control, 2021.
  10. José A. Monteiro; Amílcar Duarte; Melina Silva; Celestina Pedras; Guerra, Rui Manuel Farinha das Neves; Natália Tomás Marques. "Efeito da infeção com Citrus tristeza virus na taxa fotossíntética, concentração interna de CO2, condutância estomática à água e transpiração, em plantas de Citrus macrophylla.". Paper presented in Simpósio Nacional em Fruticultura, 2018.
Journal article
  1. Rui Guerra; Rosa Pires; António Brázio; Ana Margarida Cavaco; Gabriela Schütz; Ana Cristina Coelho. "Spectral Analysis, Biocompounds, and Physiological Assessment of Cork Oak Leaves: Unveiling the Interaction with Phytophthora cinnamomi and Beyond". Forests (2023): https://doi.org/10.3390/f14081663.
    10.3390/f14081663
  2. Andreia M. Afonso; Rui Guerra; Sandra Cruz; Maria D. Antunes. "Sensory Evaluation and Spectra Evolution of Two Kiwifruit Cultivars during Cold Storage". Horticulturae (2023): https://doi.org/10.3390/horticulturae9070772.
    10.3390/horticulturae9070772
  3. da Silva, M.C.; Pinto, P.I.S.; Guerra, R.; Duarte, A.; Power, D.M.; Marques, N.T.. "Gene transcripts responsive to drought stress identified in Citrus macrophylla bark tissue transcriptome have a modified response in plants infected by Citrus tristeza virus". Scientia Horticulturae 307 (2023): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85138161050&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.scienta.2022.111526
  4. Martins, J. A; Rodrigues, Daniela; Cavaco, A. M.; Antunes, Maria Dulce; Guerra, Rui Manuel Farinha das Neves. "Estimation of soluble solids content and fruit temperature in 'rocha' pear using Vis-NIR spectroscopy and the spectraNet¿32 deep learning architecture". (2023): http://hdl.handle.net/10400.1/19722.
    10.1016/j.postharvbio.2023.112281
  5. Pedro M. C. Inácio; Rui Guerra; Peter Stallinga. "An Ultra-Low-Cost RCL-Meter". Sensors 22 6 (2022): 2227-2227. https://doi.org/10.3390/s22062227.
    10.3390/s22062227
  6. Ana M. Cavaco; Andrei B. Utkin; Jorge Marques da Silva; Rui Guerra. "Making Sense of Light: The Use of Optical Spectroscopy Techniques in Plant Sciences and Agriculture". Applied Sciences (2022): https://doi.org/10.3390/app12030997.
    10.3390/app12030997
  7. Rosa Pires; Rui Guerra; Sandra P. Cruz; M. Dulce Antunes; António Brázio; Andreia M. Afonso; Mariana Daniel; et al. "Ripening assessment of ‘Ortanique’ (Citrus reticulata Blanco x Citrus sinensis (L) Osbeck) on tree by SW-NIR reflectance spectroscopy-based calibration models". Postharvest Biology and Technology 183 (2022): 111750-111750. https://doi.org/10.1016/j.postharvbio.2021.111750.
    10.1016/j.postharvbio.2021.111750
  8. Afonso, A.M.; Antunes, M.D.; Cruz, S.; Cavaco, A.M.; Guerra, R.. "Non-destructive follow-up of ‘Jintao’ kiwifruit ripening through VIS-NIR spectroscopy – individual vs. average calibration model's predictions". Postharvest Biology and Technology 188 (2022): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85126544891&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.postharvbio.2022.111895
  9. Martins, J.A.; Guerra, R.; Pires, R.; Antunes, M.D.; Panagopoulos, T.; Brázio, A.; Afonso, A.M.; et al. "SpectraNet–53: A deep residual learning architecture for predicting soluble solids content with VIS–NIR spectroscopy". Computers and Electronics in Agriculture 197 (2022): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85128737131&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.compag.2022.106945
  10. Sandra Cruz; Rui Guerra; António Brazio; Ana M. Cavaco; Dulce Antunes; Dário Passos. "Nondestructive simultaneous prediction of internal browning disorder and quality attributes in ‘Rocha’ pear (Pyrus communis L.) using VIS-NIR spectroscopy". Postharvest Biology and Technology 179 (2021): 111562-111562. https://doi.org/10.1016/j.postharvbio.2021.111562.
    10.1016/j.postharvbio.2021.111562
  11. Cavaco, A.M.; Cruz, S.P.; Antunes, M.D.; Guerra, R.; Pires, R.; Afonso, A.M.; Brázio, A.; et al. "Spatiotemporal modelling of the quality and ripening of two cultivars of “Algarve Citrus” orchards at different edaphoclimatic conditions". Postharvest Biology and Technology 172 (2021): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85095743105&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.postharvbio.2020.111386
  12. Daniel, M.; Guerra, R.; Brázio, A.; Rodrigues, D.; Cavaco, A.M.; Antunes, M.D.; Valente de Oliveira, J.. "Feature discovery in NIR spectroscopy based Rocha pear classification". Expert Systems with Applications 177 (2021): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85104281310&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.eswa.2021.114949
  13. Dário Passos; Daniela Rodrigues; Ana Cavaco; Maria Antunes; Rui Guerra. "Non-Destructive Soluble Solids Content Determination for ‘Rocha’ Pear Based on VIS-SWNIR Spectroscopy under ‘Real World’ Sorting Facility Conditions". Sensors 19 23 (2019): 5165-5165. https://doi.org/10.3390/s19235165.
    10.3390/s19235165
  14. Guerreiro, A.C.; Gago, C.L.; Vieira, A.I.; Brázio, A.; Cavaco, A.M.; Antunes, M.D.; Panagopoulos, T.; Veloso, F.; Guerra, R.. "Quality characterization of kiwifruit Actinidia chinensis var. deliciosa ‘Hayward’ using destructive and nondestructive methods during storage". Acta Horticulturae 1218 (2018): 497-502. http://dx.doi.org/10.17660/actahortic.2018.1218.68.
    Published • 10.17660/actahortic.2018.1218.68
  15. Cavaco, A.M.; Antunes, M.D.; Guerra, R.; Rosendo, M.; Pires, R.; Brázio, A.; Silva, L.; Afonso, A.M.; Panagopoulos, T.. "Fruit quality survey techniques to optimize crop management in citrus orchards". Acta Horticulturae 1194 (2018): 135-142. http://dx.doi.org/10.17660/actahortic.2018.1194.21.
    Published • 10.17660/actahortic.2018.1194.21
  16. Cavaco, A.M.; Antunes, M.D.; Panagopoulos, T.; Rosendo, M.; Pires, R.; Brázio, A.; Silva, L.; Afonso, A.M.; Guerra, R.. "Upgrading current practices in Vis/NIR spectroscopy for in situ orchard monitoring". Acta Horticulturae 1194 (2018): 745-752.
    Published • 10.17660/ActaHortic.2018.1194.106
  17. Cavaco, Ana M.; Pires, Rosa; Antunes, M. Dulce; Panagopoulos, Thomas; Brázio, António; Afonso, Andreia M.; Silva, Leonardo; et al. "Validation of short wave near infrared calibration models for the quality and ripening of ‘Newhall’ orange on tree across years and orchards". Postharvest Biology and Technology 141 (2018): 86-97. http://gateway.webofknowledge.com/gateway/Gateway.cgi?GWVersion=2&SrcAuth=ORCID&SrcApp=OrcidOrg&DestLinkType=FullRecord&DestApp=WOS_CPL&KeyUT=WOS:000429259800012&KeyUID=WOS:000429259800012.
    10.1016/j.postharvbio.2018.03.013
  18. Bexiga, F.; Rodrigues, D.; Guerra, R.; Brázio, A.; Balegas, T.; Cavaco, A.M.; Antunes, M.D.; Valente de Oliveira, J.. "A TSS classification study of ‘Rocha’ pear (Pyrus communis L.) based on non-invasive visible/near infra-red reflectance spectra". Postharvest Biology and Technology 132 (2017): 23-30. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85020234235&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.postharvbio.2017.05.014
  19. Schulze, P.S.C.; Guerra, R.; Pereira, H.; Schüler, L.M.; Varela, J.C.S.. "Flashing LEDs for Microalgal Production". Trends in Biotechnology (2017): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85028611496&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.tibtech.2017.07.011
  20. Canário, D.V.P.; Figueiredo, E.; Franco, J.C.; Guerra, R.. "Detecting early mealybug infestation stages on tomato plants using optical spectroscopy". European Journal of Horticultural Science 82 3 (2017): 141-148. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85026192360&partnerID=MN8TOARS.
    10.17660/eJHS.2017/82.3.4
  21. Afonso, A.M.; Guerra, R.; Cavaco, A.M.; Pinto, P.; Andrade, A.; Duarte, A.; Power, D.M.; Marques, N.T.. "Identification of asymptomatic plants infected with Citrus tristeza virus from a time series of leaf spectral characteristics". Computers and Electronics in Agriculture 141 (2017): 340-350. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85027589041&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.compag.2017.08.001
  22. Peter S.C. Schulze; Hugo G.C. Pereira; Tamára F.C. Santos; Lisa Schueler; Rui Guerra; Luísa A. Barreira; José A. Perales; João C.S. Varela. "Effect of light quality supplied by light emitting diodes (LEDs) on growth and biochemical profiles of Nannochloropsis oculata and Tetraselmis chuii". Algal Research 16 (2016): 387-398. https://doi.org/10.1016%2Fj.algal.2016.03.034.
    10.1016/j.algal.2016.03.034
  23. Guerra, Rui Manuel Farinha das Neves. "Temporal metabolic profiling of the Quercus suber–Phytophthora cinnamomi system by middle-infrared spectroscopy". Forest Pathology (2016):
    10.1111/efp.12229
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  36. Guerra, R.; Mendonça, J.T.; Shukla, P.K.. "Stimulated Raman, Brillouin and dust-Brillouin scattering in dusty plasmas". Journal of Plasma Physics 59 2 (1998): 343-365. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0032002874&partnerID=MN8TOARS.
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    10.1063/1.872162
  38. Guerra, R; Shukla, P K. "Nonlinear coupling between Langmuir and dust-acoustic waves in dusty plasmas with dust charge perturbations". Physica Scripta T63 (1996): 272-274. http://dx.doi.org/10.1088/0031-8949/1996/t63/049.
    10.1088/0031-8949/1996/t63/049
  39. Resendes, D P; Mendonça, J T; Guerra, R; Shukla, P K. "Multiple scattering of electromagnetic waves by large amplitude drift turbulent vortex streets in a plasma". Physica Scripta T63 (1996): 87-90. http://dx.doi.org/10.1088/0031-8949/1996/t63/013.
    10.1088/0031-8949/1996/t63/013
  40. Guerra, R.; Mendonça, J.T.; Dendy, R.O.; Shukla, P.K.. "Scattering of electromagnetic waves by counter-rotating vortex streets in plasmas". Physics of Plasmas 3 3 (1996): 901-905. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-5844308490&partnerID=MN8TOARS.
    10.1063/1.871793
Preprint
  1. Rui Guerra; Rosa Pires; António Brázio; Ana Maria Cavaco; Gabriela Schütz; Ana Cristina Coelho. "First Attempt to Find Spectral Patterns in Cork Oak Leaves Revealing the Interaction of the Plant with Phytophthora cinnamomi". 2023. https://doi.org/10.20944/preprints202307.1385.v1.
    10.20944/preprints202307.1385.v1
  2. Adriana Guerreiro; Custódia Gago; Dário Passos; J. A. Martins; Sandra P. Cruz; Fernão Veloso; Rui Guerra; Maria Dulce Antunes. "Enhancing the Storability of Hardy Kiwifruit (Actinidia arguta cv. ‘Ken´s Red’) with Edible Coatings during Postharvest Handling". 2023. https://doi.org/10.20944/preprints202310.2028.v1.
    10.20944/preprints202310.2028.v1

Other

Other output
  1. Transcriptome Profiling of Citrus Macrophylla Bark Tissues Under Drought Stress. 2022. da Silva, M.C.; Pinto, P.I.S.; Guerra, R.; Duarte, A.; Power, D.M.; Marques, N.T.. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85126096470&partnerID=MN8TOARS.
Activities

Supervision

Thesis Title
Role 		Degree Subject (Type)
Institution / Organization
2022/06/30 - 2026/06/29 Gestão não-destrutiva da qualidade da Maçã de Alcobaça IGP (Malus domestica Borkh.) “Rubin Fuji”, “Farm to Fork”, por espectroscopia de visível e infravermelho próximo
Supervisor
 Ciências Agrárias e Ambientais (PhD)
Universidade do Algarve, Portugal
2022/03/01 - 2026/02/28 Estudo da robustez de técnicas espetroscópicas não destrutivas na monitorização do amadurecimento e qualidade de frutos
Supervisor
 Ciências Agrárias e Ambientais (PhD)
Universidade do Algarve, Portugal
2019/07/01 - 2023/12/31 Desenvolvimento de sensores biocompativeis para a medição da capacitância de folhas de plantas [Development of biocompatible sensors for measuring the capacitance of plant leaves.]
Co-supervisor of Pedro Miguel Cavaco Carrilho dos Santos Inácio
Universidade do Algarve Centro de Electronica Optoelectrônica e Telecomunicacoes, Portugal
2017/10/01 - 2023/07/13 Non-invasive monitoring of kiwifruit ripening
Supervisor of Andreia Melissa Guedes da Silva Afonso
 Ciências Agrárias e Ambientais (PhD)
Universidade do Algarve, Portugal
2017/10/01 - 2022/09/30 Desenvolvimento de um sistema óptico robusto para calibração automática e não destrutiva da qualidade interna de fruta
Supervisor of António Manuel Valente do Rosário Brázio
 Ciências Agrárias (PhD)
Universidade do Algarve, Portugal
2017/10/01 - 2019/04/04 Determinação Não Destrutiva da Qualidade Interna de "Ortanique" (Citrus reticulata Blanco x Citrus sinensis (L) Osbeck)
Supervisor of ROSA MARIA RAMOS PIRES
 Hortofruticultura (Master)
Universidade do Algarve Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2015/07/01 - 2019/01/31 Smart tools for optimizing management in precision agriculture of citrus orchards (FCT post-doctoral grant)
Co-supervisor of Ana Margarida Vicente Cavaco
Universidade do Algarve Centro de Electronica Optoelectrônica e Telecomunicacoes, Portugal
2017/09/04 - 2018/07/03 Desenvolvimento de um sistema de medição de reflexão difusa resolvida espacialmente (Development of a spatially resolved diffuse reflection measurement system) - post doctoral grant attributed by CEOT
Supervisor of Dário Manuel da Conceição Passos
Universidade do Algarve Centro de Electronica Optoelectrônica e Telecomunicacoes, Portugal
2017/10/01 - 2018/03/31 Estatística avançada para o tratamento dos dados de qualidade interna obtidos em amostragens de pomares de citrinos. (post doctoral grant attributed by CEOT)
Supervisor
Universidade do Algarve Centro de Electronica Optoelectrônica e Telecomunicacoes, Portugal
2015/09 - 2016/07 A descoberta do Universo – uma contribuição para o ensino de Física e Química
Co-supervisor
 Ensino de Matemática/Biologia e de Geologia/Física e Química no 3.º Ciclo do Ensino Básico e Ensino Secundário (Master)
Universidade do Algarve Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2015/09/01 - 2016/01/15 Utilização de sensores óticos na deteção de agentes patogénicos nas plantas
Supervisor
 Engenharia Biológica (Master)
Universidade do Algarve Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2011/10/01 - 2013/01 Development of a data acquisition system for the non - destructive determination of fruit internal quality in an automated calibration line equipped with a visible/near infrared spectrometer
Supervisor
 Engenharia Eletrónica e Telecomunicações (Master)
Universidade do Algarve Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2007/01/01 - 2009/10/31 Early diagnosis of superficial scald in pear (Pyrus communis ) var. ’Rocha’ by non-destructive near infrared reflectance spectroscopy and hyperspectral imaging techniques (FCT post-doctoral grant)
Co-supervisor of Ana Margarida Vicente Cavaco
Universidade do Algarve Centro de Electronica Optoelectrônica e Telecomunicacoes, Portugal
2008/09/01 - 2009/07 Construção de fantomas sólidos com funções de fase realistas para aplicações em tomografia óptica difusa
Supervisor
 Física e Química (Degree)
Universidade do Algarve Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2008/09 - 2009/07 Aplicação de medições de reflectância resolvida espacialmente e de goniometria de retro-espalhamento à medição da firmeza de maçãs ’Bravo de Esmolfe
Supervisor
 Física e Química (Degree)
Universidade do Algarve Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2008/09 - 2009/07 Construção e teste de um sistema para medir ondas de densidade de fotões difusos
Supervisor
 Engenharia Física Tecnológica (Degree)
Universidade do Algarve Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2008/09 - 2009/07 Aplicação de medições de reflectância resolvida espacialmente a de goniometria de retro-espalhamento à determinação do amadurecimento de pêra ’Rocha’ (Pyrus communis L.).
Supervisor
 Engenharia Física (Degree)
Universidade do Algarve Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2006/04/01 - 2007/03/31 Aplicação do formalismo do integral de caminho aos problemas de propagalção de luz em meios túrbidos (Translation: Application of the path integral formalism to light propagation problems in turbid media.) - post-doctoral grant attributed by CEOT
Supervisor
Universidade do Algarve Centro de Electronica Optoelectrônica e Telecomunicacoes, Portugal
2003/09/01 - 2004/07 Introdução a novos processos de produção de energias renováveis no ensino secundário: célula fotovoltaica orgânica e pilha de combustível.
Supervisor
 Mestrado em Ensino de Física e Química (Master)
Universidade do Algarve Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2003/09 - 2004/07 Aplicabilidade dos díodos laser em medições de espalhamento da luz [Applicability of laser diodes in light scattering measurements.]
Supervisor
 Física e Química (Degree)
Universidade do Algarve Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2002/09 - 2003/07 Espalhamento de luz em meios túrbidos - uma abordagem fractal [Light scattering in turbid media - a fractal approach]
Supervisor
 Engenharia Física (Degree)
Universidade do Algarve Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal