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Amílcar Duque Prata is a PhD candidate in Chemistry at the University of Coimbra, where he bridges the molecular and macroscopic worlds through a unique blend of computational chemistry, organic synthesis, and ultrafast spectroscopy. His research journey includes a significant specialization in photochemistry at EPFL in Switzerland, focusing on intramolecular electron transfer reactions and utilizing femtosecond laser systems for time-resolved measurements. With eight peer-reviewed publications and a book chapter on DFT applications, he has established himself as a prolific contributor to the field, notably developing a user-friendly pKa prediction protocol and the CBR-DETS protocol for designing electron transfer systems. His academic path is marked by consistent excellence, evidenced by his 18/20 MSc grade and multiple "3% Best Students" awards. The impact extends far beyond the laboratory through his leadership as the former CEO of Molecular JE and President of the National Association of Chemistry Students. A passionate science communicator, he authored the book O Mundo Que Não Sabemos Ver and has hosted the radio segment "Tudo É Ciência" for over three years. Whether mentoring 18 high school students or managing international research beam-time at XFEL facilities, he balances technical rigor with a creative flair for audiovisual editing and photography. Proficient in a wide range of software, Amílcar approaches science as a holistic endeavor, combining deep technical expertise with a commitment to education and public engagement.
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Identification

Personal identification

Full name
Amílcar Duque Prata
Date of birth
1997/11/14
Gender
Male

Citation names

  • Prata, Amílcar
  • Amílcar D. Prata
  • Amilcar Duque-Prata
  • A. Duque-Prata

Author identifiers

Ciência ID
0712-8D43-614A
ORCID iD
0000-0002-0512-3443
Google Scholar ID
c-rDaaUAAAAJ&hl

Email addresses

  • adp@uc.pt (Professional)

Telephones

Mobile phone
  • 916488628 (Personal)

Knowledge fields

  • Exact Sciences - Chemical Sciences
  • Exact Sciences - Chemical Sciences

Languages

Language Speaking Reading Writing Listening Peer-review
Portuguese (Mother tongue)
English Intermediate (B1) Upper intermediate (B2) Upper intermediate (B2) Upper intermediate (B2) Upper intermediate (B2)
French Beginner (A1) Elementary (A2) Beginner (A1) Elementary (A2)
Spanish; Castilian Elementary (A2) Elementary (A2) Elementary (A2) Beginner (A1)
Education
Degree Classification
2021/01 - 2026/04
Ongoing
 Chemistry (Doutoramento)
Major in Photochemistry
Universidade de Coimbra, Portugal
"Moving Electrons and Displacing Atoms in Electron Transfer Reactions" (THESIS/DISSERTATION)
2018/08/22 - 2020/07
Concluded
 Chemistry (Mestrado)
Major in Advanced and Industrial Chemistry
Universidade de Coimbra, Portugal
"Fotoquímica de Tetrazolonas: Um Estudo Teórico" (THESIS/DISSERTATION)
 18
2017/10 - 2019/09
Concluded
 Treinador de Desporto - Grau I (Outros)
Major in Karaté
Federação Nacional de Karaté - Portugal, Portugal
 Aprovado
2015/09 - 2018/07/06
Concluded
 Chemistry (Licenciatura)
Major in Fotoquímica e Espectroscopia
Universidade de Coimbra, Portugal
"Estudo Fotofísico de Porfirinas e Utilização de Metaloftalocianinas para Materiais de Limitação Ótica" (THESIS/DISSERTATION)
 16
Affiliation

Science

Category
Host institution 		Employer
2022/04/01 - 2026/03/31 Researcher (Research) Universidade de Coimbra Centro de Química de Coimbra, Portugal
2022/09 - 2023/08 Visiting Researcher (Research) École Polytechnique Fédérale de Lausanne, Switzerland
2021/04/11 - 2022/11/03 Researcher (Research) Universidade de Coimbra, Portugal
Universidade de Coimbra Centro de Química de Coimbra, Portugal
2020/08/04 - 2020/11/03 Researcher (Research) Universidade de Coimbra, Portugal
Universidade de Coimbra Centro de Química de Coimbra, Portugal
2019/07/01 - 2019/12/31 Researcher (Research) Universidade de Coimbra, Portugal
Universidade de Coimbra Centro de Química de Coimbra, Portugal

Others

Category
Host institution 		Employer
2016/12 - 2021/07 Treinador de Karaté Associação Escola de Karaté Shotokan de Souselas, Portugal
Projects

Grant

Designation Funders
2021/04 - 2022/03 Como administrar macromolecules a células-alvo e ativar terapias para o cancro: Deliver-Detect-Defeat (DDD)
PTDC/QUI-OUT/0303/2021
Research Fellow
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Ongoing
Outputs

Publications

Book
  1. Amilcar Duque-Prata; João A. V. Santos. O Mundo Que Não Sabemos Ver. Portugal. 2025.
Book chapter
  1. Amilcar Duque-Prata; Serpa, Carlos; CARIDADE, PEDRO. "Properties of charge-transfer states based on (TD-)DFT: Defying accuracy". In Theoretical and Computational Chemistry. Elsevier, 2025.
    Published
Conference abstract
  1. Amilcar Duque-Prata; Serpa, Carlos; Arnaut, Luis G.. "When Surprises Emerge: A Call to Rethink Electron Transfer Theory". Paper presented in XXIX Encontro Nacional da SPQ, 2025.
  2. Amilcar Duque-Prata; Serpa, Carlos; CARIDADE, PEDRO. Corresponding author: Amilcar Duque-Prata. "How to predict pKa and redox potentials of novel organic compounds". Paper presented in 1st PhD Talks, 2025.
  3. Amilcar Duque-Prata; Serpa, Carlos; CARIDADE, PEDRO. Corresponding author: Amilcar Duque-Prata. "Como usar a DFT para Determinar Potenciais Redox de Compostos Orgânicos". Paper presented in X Encontro Nacional de Estudantes de Química, 2024.
  4. Amilcar Duque-Prata; Serpa, Carlos; CARIDADE, PEDRO. Corresponding author: Amilcar Duque-Prata. "CBR-DETS: Um Protocolo Holístico Para O Design De Sistemas De Transferência De Eletrão". Paper presented in IX Encontro Científico do NEQ/AAC, 2023.
    Published
  5. Amilcar Duque-Prata; Serpa, Carlos; CARIDADE, PEDRO. Corresponding author: Amilcar Duque-Prata. "Redox Potentials as a Tool for Designing Innovative Electron Transfer Systems: A Computational Approach". Paper presented in XXV Meeting of the Portuguese Electrochemical Society, 2023.
    Published
  6. Amilcar Duque-Prata; Tiago B. Pinto; Serpa, Carlos; CARIDADE, PEDRO. Corresponding author: CARIDADE, PEDRO. "Using DFT to Design New Organic Electron Transfer Systems: Redox Potentials and Free Energy Calculations". Paper presented in 15º Encontro Nacional de Química Física, 2023.
  7. Nogueira, Bernardo; Pereira, Diogo A.. "Escola Molecular: Uma Porta De Entrada Na Química". Paper presented in IX Encontro da Divisão de Ensino e Divulgação da Química, Cascais, 2021.
  8. A. Duque-Prata; Serpa, Carlos; CARIDADE, PEDRO. "How the structure of intermediate species influences selectivity in the photoreaction of 1-allyl-4-aryltetrazolones in solution". Paper presented in 14º Encontro de Química Física, 2021.
    Published
  9. A. Duque-Prata; Serpa, Carlos; Bernardo A Iglesias. "Through-bond intramolecular excitation energy transfer in tetrapyrenylporphyrins". Paper presented in VI Encontro Científico do NEQ/AAC, Coimbra, 2021.
    Published
  10. A. Duque-Prata; César A. Henriques; Calvete, Mário J. F. ; Serpa, Carlos. "Propriedades de limitação ótica de uma metaloftalocianina de alumínio e do seu composto com uma nanopartícula de óxido de ferro". Paper presented in IV Encontro Científico do NEQ/AAC, Coimbra, 2019.
    Published
Conference paper
  1. Ionut Radu Tigoianu; Serpa Carlos; Prata Amilcar; Pina Joao; Mihaela Avadanei; Dorel Ursu; Mirela Fernanda Zaltariov. "Applications and Properties by Using Time-Resolved Fluorescence and Transient Absorption Spectroscopy". Paper presented in The First International Conference on “Green” Polymer Materials 2020, 2020.
    Published • 10.3390/CGPM2020-07163
Conference poster
  1. Amilcar Duque-Prata; Serpa, Carlos; CARIDADE, PEDRO. "Predicting pKa: A Dive into Electronic Structure Calculations". Paper presented in X Encontro Científico do NEQ/AAC, 2024.
  2. Amilcar Duque-Prata; Arnaut, Luis G.; Serpa, Carlos. "Pushing the Boundaries of Electron Transfer Reactions". Paper presented in VIII Jornadas Ibéricas de Fotoquímica, 2024.
  3. Amilcar Duque-Prata; Serpa, Carlos; Arnaut, Luis G.. "The Endless Surprises of Free-Energy Dependences of Electron Transfers". Paper presented in GRC - Enabling New Functionality by Charge and Energy Transfer, 2024.
  4. Amilcar Duque-Prata; Serpa, Carlos; CARIDADE, PEDRO. "CBR-DETS - A Protocol to Design Electron Transfer Systems". Paper presented in RCS Poster, 2024.
  5. Amilcar Duque-Prata; Serpa, Carlos; CARIDADE, PEDRO. Corresponding author: Amilcar Duque-Prata. "Resazurin derivatives for in vivo studies: spectroscopy, electrochemical and structural properties". Paper presented in Virtual Winter School for Computational Chemistry, 2024.
  6. Amilcar Duque-Prata; KK Mentel; Pedro J. S. B. Caridade; Carlos Serpa; Arnaut, Luis G.. "Intramolecular electron transfer reactions: what happens in polar solvents". Paper presented in Electron Donor-Acceptor Interactions - Gordon Research Conference, 2022.
  7. Amilcar Duque-Prata; Carlos Serpa; Pedro J. S. B. Caridade. "Delving into an user-friendly method to calculate redox potentials of organic compounds". Paper presented in Electron Donor-Acceptor Interactions (GRS) Gordon Research Seminar, 2022.
  8. Tiago B. Pinto; Serpa, Carlos. "Spectroscopic Characterization of NIR absorbing Charge-Transfer Complexes". Paper presented in Iberian Symposium of Young Photochemists, 2021.
  9. A. Duque-Prata; Serpa, Carlos; CARIDADE, PEDRO. "Photochemistry of 1-phenyl-4-allyl-tetrazol-5-one: A theoretical study contribution towards mechanism elucidation". Paper presented in 7th Portuguese Young Chemists Meeting, 2021.
  10. Prata, Amílcar; César A. Henriques; Calvete, Mário J. F. ; Serpa, Carlos. "Propriedades de limitação ótica de uma ftalocianina de alumínio e do seu composto com uma nanoparícula de óxido de ferro". Paper presented in VII Encontro Nacional de Estudantes de Química, 2019.
  11. Prata, Amílcar; César A. Henriques; Calvete, Mário J. F. ; Serpa, Carlos. "Optical limiting properties in the femtosecond regime of an aluminum phthalocyanine and its iron oxide nanoparticle composite". Paper presented in 6 Jornadas Ibéricas de Fotoquímica, 2018.
Journal article
  1. Duque-Prata, Amílcar; Serpa, Carlos; Caridade, Pedro J. S. B.. "Calibrating the gap: a user-friendly aqueous pKa prediction protocol for organic acids, alcohols, and amines". Journal of Computer-Aided Molecular Design 40 1 (2025): https://doi.org/10.1007/s10822-025-00708-y.
    10.1007/s10822-025-00708-y
  2. Marta Warszynska; Barbara Pucelik; Carolina S. Vinagreiro; Pawel Repetowski; Agata Barzowska; Dominik Barczyk; Fábio A. Schaberle; et al. "Better in the Near Infrared: Sulfonamide Perfluorinated-Phenyl Photosensitizers for Improved Simultaneous Targeted Photodynamic Therapy and Real-Time Fluorescence Imaging". ACS Applied Materials & Interfaces (2024): http://dx.doi.org/10.1021/acsami.4c11171.
    10.1021/acsami.4c11171
  3. Amílcar Duque-Prata; Carlos Serpa; Pedro J. S. B. Caridade. "Theoretical Evaluation of Fluorinated Resazurin Derivatives for In Vivo Applications". Molecules (2024): https://doi.org/10.3390/molecules29071507.
    10.3390/molecules29071507
  4. Amílcar Duque-Prata; Tiago B. Pinto; Carlos Serpa; Pedro J. S. B. Caridade. "Performance of Functionals and Basis Sets in Calculating Redox Potentials of Nitrile Alkenes and Aromatic Molecules using Density Functional Theory". ChemistrySelect (2023): https://doi.org/10.1002/slct.202300205.
    10.1002/slct.202300205
  5. Nogueira, Bernardo A.; Tavares, Nélia C.T.; Mendes, Maria Inês P.; Pereira, Diogo A.; Duque-Prata, Amílcar; Schaberle, Fábio A.. "A Preuniversity Initiative to Motivate Students to Pursue Chemistry Higher Education". Journal of Chemical Education 100 3 (2023): 1189-1196. https://doi.org/10.1021/acs.jchemed.2c01095.
    10.1021/acs.jchemed.2c01095
  6. Amílcar Duque Prata; Carlos Serpa; Pedro JSB Caridade. "Full Theoretical Protocol for the Design of Metal-Free Organic Electron Donor-Spacer-Acceptor Systems". Physical Chemistry Chemical Physics (2023): http://dx.doi.org/10.1039/d3cp03323f.
    10.1039/d3cp03323f
  7. Sara M.A. Pinto; Sara F.F. Almeida; Vanessa A. Tomé; Amilcar D. Prata; Mário J.F. Calvete; Carlos Serpa; Mariette M. Pereira. "Water soluble near infrared dyes based on PEGylated-Tetrapyrrolic macrocycles". Dyes and Pigments 195 (2021): 109677-109677. https://doi.org/10.1016/j.dyepig.2021.109677.
    10.1016/j.dyepig.2021.109677
  8. Amilcar Duque-Prata; Carlos Serpa; Pedro J. S. B. Caridade. "Photochemistry of 1-Phenyl-4-Allyl-Tetrazol-5-One: A Theoretical Study Contribution towards Mechanism Elucidation". Applied Sciences 11 9 (2021): 4045-4045. https://doi.org/10.3390/app11094045.
    10.3390/app11094045
Thesis / Dissertation
  1. Prata, Amílcar. "Fotoquímica de Tetrazolonas: Um Estudo Teórico". Master, Universidade de Coimbra, 2020. https://estudogeral.sib.uc.pt/handle/10316/92491.
  2. Prata, Amílcar. "Estudo Fotofísico de Porfirinas e Utilização de Metaloftalocianinas para Materiais de Limitação Ótica". Degree, Universidade de Coimbra, 2018.

Artistic / Performance

Visual artwork
  1. Prata, Amílcar. Outside Front Cover: (Biotechnology Journal 1/2021).
  2. Outside Front Cover: (CrystEngComm 07 February 2022, Issue 5).
Activities

Event organisation

Event name
Type of event (Role) 		Institution / Organization
2023/01 - Current 22nd International Conference on Photoacoustic and Photothermal Phenomena (2024/07)
Conference (Member of the Organising Committee)
 Universidade de Coimbra Centro de Química de Coimbra, Portugal
2021/06 - 2022/06 VIII Encontro Nacional de Estudantes de Química (2022/04/08 - 2022/04/10)
Congress (President of the Organising Committee)
2020/10 - 2021/04 Colóquio Digital de Estudantes de Química em Portugal 2021 (2021/03/26 - 2021/03/28)
Congress (President of the Organising Committee)
 Associação Nacional de Estudantes de Química, Portugal
2017/01 - 2017/04 V Encontro Nacional de Estudantes de Química (2017/04/04 - 2017/04/07)
Congress (Member of the Organising Committee)
 Associação Nacional de Estudantes de Química, Portugal
2016/06 - 2016/11 II Encontro Científico do NEQ/AAC (2016/11 - 2016/11)
Meeting (Member of the Organising Committee)
 Núcleo de Estudantes de Química da Associação Académica de Coimbra, Portugal

Event participation

Activity description
Type of event 		Event name
Institution / Organization
2021/11/11 - 2021/11/13 VII Encontro Científico do NEQ/AAC
Meeting
 VII Encontro Científico do NEQ/AAC
Núcleo de Estudantes de Química da Associação Académica de Coimbra, Portugal
2021/03/28 - 2021/03/28 Química, uma Ciência em Portugal (Moderador)
Round table
 Colóquio Digital de Estudantes de Química em Portugal 2021
Associação Nacional de Estudantes de Química, Portugal
2021/03 - 2021/03 VI Encontro Científico do NEQ/AAC
Meeting
 VI Encontro Científico do NEQ/AAC
Núcleo de Estudantes de Química da Associação Académica de Coimbra, Portugal
2021/01 - 2021/01 Curso Online
Other
 Introduction to Molecular Spectroscopy
The University of Manchester School of Chemistry, United Kingdom
2020/08 - 2020/11 Escola de Verão Química Medicinal Experimental - da Academia à Indústria
Universidade de Coimbra Centro de Química de Coimbra, Portugal
2020/02 - 2020/02 V Encontro Científico do NEQ/AAC
Meeting
 V Encontro Científico do NEQ/AAC
Núcleo de Estudantes de Química da Associação Académica de Coimbra, Portugal
2019/10/27 - 2019/10/29 Light & Matter - Lasers in the Year of the Periodic Table
Meeting
 LaserLab Europe Users Meeting
Universidade de Coimbra Centro de Química de Coimbra, Portugal
2019/03/29 - 2019/04/01 VII Encontro Nacional de Estudantes de Química
Congress
 VII Encontro Nacional de Estudantes de Química
Associação Nacional de Estudantes de Química, Portugal
2019/04 - 2019/04 Workshop de HPCL
Workshop
 Workshop de HPCL
Universidade de Coimbra Centro de Química de Coimbra, Portugal
2019/02 - 2019/02 IV Encontro Científico do NEQ/AAC
Meeting
 IV Encontro Científico do NEQ/AAC
Núcleo de Estudantes de Química da Associação Académica de Coimbra, Portugal
2018/09 - 2018/09 6 Jornadas Ibéricas da Fotoquímica
Congress
 6 Jornadas Ibéricas da Fotoquímica
Sociedade Portuguesa de Química, Portugal
2018/03/30 - 2018/04/02 VI Encontro Nacional de Estudantes de Química
Congress
 VI Encontro Nacional de Estudantes de Química
Associação Nacional de Estudantes de Química, Portugal
2018/02 - 2018/02 III Encontro Científico do NEQ/AAC
Meeting
 III Encontro Científico do NEQ/AAC
Núcleo de Estudantes de Química da Associação Académica de Coimbra, Portugal
2016/03/18 - 2016/03/20 IV Encontro Nacional de Estudantes de Química
Congress
 IV Encontro Nacional de Estudantes de Química
Associação Nacional de Estudantes de Química, Portugal
2015/11 - 2015/11 I Encontro Científico do NEQ/AAC
Meeting
 I Encontro Científico do NEQ/AAC
Núcleo de Estudantes de Química da Associação Académica de Coimbra, Portugal

Association member

Society Organization name Role
2021/10 - 2024/05 Molecular JE Presidente
2019/09 - 2024/05 Molecular JE Divulgador de Ciência, Ilustrador, Editor de Multimédia, Explicador de Física e Química
2019/06 - 2021/10 Casa do Povo de Souselas Tesoureiro
2018/01 - 2021/08 Associação Escola de Karaté Shotokan de Souselas Diretor Desportivo
2019/03 - 2021/05 Associação Nacional de Estudantes de Química Presidente
2018/03 - 2019/03 Associação Nacional de Estudantes de Química Vice-Presidente
2018/01 - 2018/12 Associação Académica de Coimbra Coordenador
2016/05 - 2017/12 Núcleo de Estudantes de Química da Associação Académica de Coimbra Colaborador; Administrador

Committee member

Activity description
Role 		Institution / Organization
2019/08 - 2021/08 Grupo de Jovens
President / Vice-president
 Souselas AGosto, Portugal
2016/05 - 2018/05 Presidente da Comissão do Carro de Química e Química Medicinal na Queima das Fitas de 2018
President / Vice-president
Distinctions

Award

2019 Prémio 3% dos Melhores Estudantes 2017/2018
Universidade de Coimbra, Portugal
2019 Melhor Comunicação Oral
Núcleo de Estudantes de Química da Associação Académica de Coimbra, Portugal
2018 Prémio 3% dos Melhores Estudantes 2016/2017
Universidade de Coimbra, Portugal
2018 Prémio Dinamismo
Núcleo de Estudantes de Química da Associação Académica de Coimbra, Portugal
2016 Prémio 3% dos Melhores Estudantes 2015/2016
Universidade de Coimbra, Portugal
2016 Melhores Colocados no Concurso Nacional de Acesso
Sociedade Portuguesa de Química, Portugal