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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
RUI CARLOS CAMACHO DE SOUSA FERREIRA DA SILVA

Nomes de citação

  • Rui Camacho

Identificadores de autor

Ciência ID
DB15-5E4E-60A4
ORCID iD
0000-0003-0940-3554

Moradas

  • Faculdade de Engenharia da Universidade do Porto. Rua Dr Roberto Frias, s/n, 4200-465, Porto, Porto, Portugal (Profissional)

Websites

Formação
Grau Classificação
2000/07/31
Concluído
 Engenharia Electrotécnica e de Computadores (Doutoramento)
Especialização em Não Aplicável
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2000/07/31
Concluído
 Doutoramento em Engenharai Electrotécnica e de Computadores (Doutoramento)
Especialização em Outra:Sem especialidade
Universidade do Porto, Portugal
"Utilização de Algoritmos de Aprendizagem na Construção de Modelos da Aptidão Humana para Controlo de Sistemas" (TESE/DISSERTAÇÃO)
2000
Concluído
 Doutoramento em Engenharia Electrotécnica e de Computadores (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
"Inducing Models of Human Control Skills using Machine Learning Algorithms" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 unanimidade
1989
Concluído
 Mestrado em Engenharia Electrotécnica e Computadores (Mestrado)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
"Sistema Pericial com perspectivas de Aprendizagem Simbolica Automatica" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 Muito Bom
1984/06
Concluído
 Engenharia Electrotécnica (Licenciatura)
Especialização em Não Aplicável
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
Projetos

Projeto

Designação Financiadores
2019/01/01 - Atual A federated FAIR platform enabling large-scale analysis of high-value cohort data connecting Europe and Canada in personalized health
824989
Investigador
Universitair Medisch Centrum Groningen, Países Baixos
 European Commission Seventh Framework Programme for Research and Technological Development Science in Society
Em curso
2017/01/01 - Atual RECAP preterm: Research on European Children and Adults born Preterm
info:eu-repo/grantAgreement/EC/H2020/733280/EU
Investigador responsável
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Tecnologia e Ciência Center for Research in Advanced Computing Systems, Portugal
European Commission
Em curso
2021/01/01 - 2025/12/31 INESC TEC - Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores, Tecnologia e Ciência (INESC TEC)
LA/P/0063/2020
10.54499/LA/P/0063/2020
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Tecnologia e Ciência, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2019/01/01 - 2019/12/31 Centro de Investigação em Tecnologias e Serviços de Saúde
UID/IC/04255/2019
Universidade do Porto Faculdade de Medicina, Portugal

Centro de Investigação em Tecnologias e Serviços de Saúde, Portugal

Universidade do Porto Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar, Portugal

Escola Superior de Enfermagem do Porto, Portugal

Universidade de Aveiro, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2019/01/01 - 2019/12/31 INESC TEC – INESC Tecnologia e Ciência
UID/EEA/50014/2019
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores, Portugal

Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Tecnologia e Ciência, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2012/03/01 - 2015/08/31 ADE - Detecção de Efeitos Adversos de Drogas
PTDC/EIA-EIA/121686/2010
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2010/04/01 - 2013/03/31 Horus: Representações de Horn para Sistemas com Incerteza
PTDC/EIA-EIA/100897/2008
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores, Portugal

Universidade do Porto Instituto de Biologia Molecular e Celular, Portugal

Universidade Nova de Lisboa Laboratório para a Ciência da Computação e Informática, Portugal

Universidade de Évora, Portugal

Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal

Universidade de Évora, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2008/04/01 - 2011/09/30 A evolução de genes ecologicamente relevantes
PTDC/BIA-BDE/66765/2006
Instituto de Biologia Molecular e Celular, Portugal

Universidade do Porto Instituto de Biologia Molecular e Celular, Portugal

Universidade do Porto Instituto de Biologia Molecular e Celular, Portugal

Veterinärmedizinische Universität Wien Institut für Tierzucht und Genetik, Áustria
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2008/01/01 - 2011/03/31 ILP-Web-Service: Um Serviço Web baseado num Sistema de Indução de Programas em Lógica
PTDC/EIA/70841/2006
Universidade do Porto Laboratório de Inteligência Artificial e Ciência de Computadores, Portugal

Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal

Universidade do Porto Instituto de Biologia Molecular e Celular, Portugal

Universidade Nova de Lisboa Instituto de Higiene e Medicina Tropical, Portugal

Universidade do Porto Instituto de Ciências Tecnologias e Agroambiente, Portugal

Instituto de Biologia Molecular e Celular, Portugal

Universidade do Porto Instituto de Ciências e Tecnologias Agrárias e Agro-Alimentares, Portugal

Universidade do Porto Instituto de Biologia Molecular e Celular, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2008/01/01 - 2011/01/31 STAMPA - Mecanismos Sofisticados de Tabelação para Prolog e suas Aplicações
PTDC/EIA/67738/2006
Universidade do Porto Laboratório de Inteligência Artificial e Ciência de Computadores, Portugal

Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal

Universidade de Évora, Portugal

Universidade de Évora, Portugal

Universidade do Porto, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2008/01/01 - 2010/12/31 Procura de regras de alto nível em dobragem e desdobragem de proteínas: das doenças amiloidogénicas à previsão da estrutura proteica
PTDC/BIA-PRO/72838/2006
Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal

Universidade do Minho, Portugal

Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal

Ulster University School of Biomedical Sciences, Reino Unido

Universidade do Minho, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2007/06/01 - 2010/12/31 P-found: computação GRID e armazenamento distribuído de dados de simulações de dobragem e desdobragem de proteínas
GRID/GRI/81809/2006
Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal

Ulster University School of Biomedical Sciences, Reino Unido

Universidade do Minho, Portugal

Universidade de Coimbra, Portugal

Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal

Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal

Universidade do Minho, Portugal

Universidade de Coimbra, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
1995/02/01 - 1995/09/30 INTELIGÊNCIA ARTIFICIAL MACHINE LEARNING
PRAXIS XXI/BD/2972/94
Columbia University, Estados Unidos
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
Produções

Publicações

Artigo em conferência
  1. Mendes, D; Camacho, R. "A Platform for the Study of Drug Interactions and Adverse Effects Prediction". 2023.
    10.1007/978-3-031-34953-9_32
  2. Freitas, H; Camacho, R; Silva, DC. "Performing Aerobatic Maneuver with Imitation Learning". 2023.
    10.1007/978-3-031-35995-8_15
  3. Leao, G; Camacho, R; Sousa, A; Veiga, G. "An Inductive Logic Programming Approach for Entangled Tube Modeling in Bin Picking". 2023.
    10.1007/978-3-031-21062-4_7
  4. SILVA, RUI. "A Multi-spot Murmur Sound Detection Algorithm and Its Application to a Pediatric and Neonate Population". 2021.
    10.5220/0010262502280234
  5. Vazquez, N; Rocha, S; Lopez Fernandez, H; Torres, A; Camacho, R; Fdez Riverola, F; Vieira, J; et al. "EvoPPI: A Web Application to Compare Protein-Protein Interactions (PPIs) from Different Databases and Species". Trabalho apresentado em Practical Applications of Computational Biology and Bioinformatics, 12th International Conference, PACBB 2018, Toledo, 2019.
    Publicado • 10.1007/978-3-319-98702-6_18
  6. Gonçalves, CA; Iglesias, EL; Borrajo, L; Camacho, R; Vieira, AS; Gonçalves, CT; SILVA, RUI. "Comparative Study of Feature Selection Methods for Medical Full Text Classification". Trabalho apresentado em Bioinformatics and Biomedical Engineering - 7th International Work-Conference, IWBBIO 2019,, 2019.
    Publicado • 10.1007/978-3-030-17935-9_49
  7. Ferreira, MF; Camacho, R; Teixeira, LF. "Autoencoders as Weight Initialization of Deep Classification Networks Applied to Papillary Thyroid Carcinoma". 2018.
    10.1109/BIBM.2018.8621356
  8. Goncalves, C; Iglesias, EL; Borrajo, L; Camacho, R; Vieira, AS; Goncalves, CT; SILVA, RUI; Abreu, P; Soares, C. "LearnSec: A Framework for Full Text Analysis". Trabalho apresentado em 13th International Conference on Hybrid Artificial Intelligent Systems (HAIS), 2018.
    Publicado • 10.1007/978-3-319-92639-1_42
  9. SILVA, RUI; Almeida, J; Ferreira, J; Camacho, R; Pereira, L; Almeida,J; Ferreira,J; Rui Camacho; Pereira,L. "Co-expression networks between protein encoding mitochondrial genes and all the remaining genes in human tissues". Trabalho apresentado em 2017 IEEE INTERNATIONAL CONFERENCE ON BIOINFORMATICS AND BIOMEDICINE (BIBM), 2017.
    Publicado • 10.1109/BIBM.2017.8217626
  10. Teixeira,V; Rui Camacho; Ferreira,PG; Teixeira, V; Camacho, R; Ferreira, PG; SILVA, RUI. "Learning influential genes on cancer gene expression data with stacked denoising autoencoders". Trabalho apresentado em Learning influential genes on cancer gene expression data with stacked denoising autoencoders, 2017.
    Publicado • http://dx.doi.org/10.1109/BIBM.2017.8217828
  11. Cavadas,B; Ferreira,J; Rui Camacho; Nuno Fonseca; Pereira,L; SILVA, RUI; Cavadas, B; et al. "QmihR: Pipeline for Quantification of Microbiome in Human RNA-seq". Trabalho apresentado em 11th International Conference on Practical Applications of Computational Biology and Bioinformatics, PACBB 2017, 2017.
    Publicado • 10.1007/978-3-319-60816-7_21
  12. Pinto,D; Costa,P; Rui Camacho; Vítor Santos Costa; SILVA, RUI; Pinto, D; Costa, P; Camacho, R; Costa, VS. "Predicting Drugs Adverse Side-Effects Using a Recommender-System". Trabalho apresentado em Discovery Science 2015, 2015.
    Publicado • http://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-24282-8_17
  13. SILVA, RUI. "Resource Management for Big Data Platforms - Algorithms, Modelling, and High-Performance Computing Techniques". Trabalho apresentado em 14th International Conference on Computational Science and Its Applications (ICCSA), 2014.
    Publicado
  14. Camacho, R; Ramos, R; Fonseca, NA. "AND Parallelism for ILP: The APIS System". 2014.
    10.1007/978-3-662-44923-3_7
  15. Rui Camacho; Ramos,R; Nuno Fonseca. "AND Parallelism for ILP: The APIS System". 2014.
    http://dx.doi.org/10.1007/978-3-662-44923-3_7
  16. Rui Camacho; Ramos,R; Nuno Fonseca. "AND Parallelism for ILP: The APIS System". 2014.
    http://dx.doi.org/10.1007/978-3-662-44923-3_7
  17. Abreu,P; Carlos Manuel Soares; Rui Camacho. "Distributed Enviroment Framework for Optimization Experiments". 2014.
    http://dx.doi.org/10.1109/iccsa.2014.59
  18. SILVA, RUI. "AND Parallelism for ILP: The APIS System". Trabalho apresentado em Inductive Logic Programming - 23rd International Conference, ILP 2013,, Rio de Janeiro, 2013.
    Publicado • 10.1007/978-3-662-44923-3_7
  19. Nabuco, M.; Paiva, A.C.R.; Camacho, R.; Faria, J.P.. "Inferring UI patterns with Inductive Logic Programming". Trabalho apresentado em International Symposium on Practical Aspects of Declarative Languages (PADL 2013), 2013.
    Publicado
  20. SILVA, RUI; Loureiro, T.; Camacho, R.; Vieira, J.; Fonseca, N.A.. "Boosting the Detection of Transposable Elements Using Machine Learning". Trabalho apresentado em 7th International Conference on Practical Applications of Computational Biology & Bioinformatics, 2013.
    Publicado • 10.1007/978-3-319-00578-2_12
  21. Nabuco,M; Ana Cristina Paiva; Rui Camacho; João Pascoal Faria. "Inferring UI Patterns with Inductive Logic Programming". 2013.
  22. Nabuco,M; Ana Cristina Paiva; Rui Camacho; João Pascoal Faria. "Inferring UI Patterns with Inductive Logic Programming". 2013.
  23. Angelopoulos,N; Vítor Santos Costa; Azevedo,J; Wielemaker,J; Rui Camacho; Wessels,L; Angelopoulos, N.; et al. "Integrative functional statistics in logic programming". Trabalho apresentado em International Symposium on Practical Aspects of Declarative Languages, 2013.
    http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-45284-0_13
  24. Eric Tousset; Pepijn van de Ven; Elaine McGovern; Thibaut Gauthier; Artur Rocha; Ricardo Henriques; João Correia Lopes; et al. "ICT4Depression: service oriented architecture applied to the treatment of depression". 2012.
  25. Morgado, I.C.; Paiva, A.C.R.; Faria, J.P.; Camacho, R.. "GUI reverse engineering with machine learning". 2012.
    10.1109/RAISE.2012.6227966
  26. Gonçalves, C.T.; Camacho, R.; Oliveira, E.. "From sequences to papers: An information retrieval exercise". 2011.
    10.1109/icdmw.2011.184
  27. Camacho, R; Ferreira, R; Rosa, N; Guimaraes, V; Fonseca, NA; Costa, VS; de Sousa, M; Magalhaes, A. "Predicting the Start of Protein alpha-Helices Using Machine Learning Algorithms". 2010.
    10.1007/978-3-642-13214-8_5
  28. Ramos, R; Camacho, R; Ruy Ramos; Rui Camacho. "A step up with the HARVARD system: the HARVARD-g system". 2007.
  29. Camacho, R; Alves, A; da Costa, JP; Azevedo, P. "CMB'05: Workshop on Computational Methods in Bioinformatics". 2005.
    10.1109/epia.2005.341279
  30. Alves, A.; Camacho, R.; Oliveira, E.; Alexessander Alves; Rui Camacho; Eugénio Oliveira. "Discovery of functional relationships in multi-relational data using inductive logic programming". 2004.
    10.1109/ICDM.2004.10053
  31. Camacho, R; Brazdil, P; Camacho, R.; Brazdil, P.. "Improving the Robustness and Encoding Complexity of Behavioural Clones". 2001.
    10.1007/3-540-44795-4_4
  32. Camacho, R. "Inducing models of human control skills". 2001.
  33. Costa, VS; Srinivasan, A; Camacho, R. "A Note on Two Simple Transformations for Improving the Efficiency of an ILP System". 2000.
    10.1007/3-540-44960-4_14
  34. Michie, D; Camacho, R. "Building symbolic representations of intuitive real-time skills from performance data". 1994.
  35. OLIVEIRA, E; CAMACHO, R. "A TOOL FOR COOPERATIVE EXPERT SYSTEMS". 1991.
Artigo em revista
  1. Freitas, H; Camacho, R; Silva, DC. "Imitation learning for aerobatic maneuvering in fixed-wing aircraft". JOURNAL OF COMPUTATIONAL SCIENCE (2024): https://www.authenticus.pt/P-010-P57.
    10.1016/j.jocs.2024.102343
  2. Carlos A. Gonçalves; Adrián Seara Vieira; Célia Talma Gonçalves; Rui Camacho; Eva Lorenzo-Iglesias; Lourdes Borrajo Diz. "A Novel Multi-View Ensemble Learning Architecture to Improve the Structured Text Classification". Information (2022): https://www.mdpi.com/2078-2489/13/6/283.
    10.3390/info13060283
  3. Teixeira, R; Rodrigues, C; Moreira, C; Barros, H; Camacho, R. "Machine learning methods to predict attrition in a population-based cohort of very preterm infants". SCIENTIFIC REPORTS (2022):
    10.1038/s41598-022-13946-z
  4. Goncalves M.; Henriques A.; Costa A.R.; Correia D.; Severo M.; Lucas R.; Barros H.; et al. "Insomnia and nightmare profiles during the COVID-19 pandemic in Portugal: characterization and associated factors". SLEEP MEDICINE (2022):
    10.1016/j.sleep.2021.12.018
  5. Pedro, N; Brucato, N; Cavadas, B; Lisant, V; Camacho, R; Kinipi, C; Leavesley, M; Pereira, L; Ricaut, FX. "First insight into oral microbiome diversity in Papua New Guineans reveals a specific regional signature". MOLECULAR ECOLOGY (2022):
    10.1111/mec.16702
  6. Oliveira Gonçalves, CA; Camacho, R; Gonçalves, CT; Seara Vieira, A; Borrajo Diz, L; Lorenzo Iglesias, E. "Classification of Full Text Biomedical Documents: Sections Importance Assessment". Applied Sciences (2021):
    10.3390/app11062674
  7. Cavadas, B; Leite, M; Pedro, N; Magalhaes, AC; Melo, J; Correia, M; Maximo, V; et al. "Shedding Light on the African Enigma: In Vitro Testing of Homo sapiens-Helicobacter pylori Coevolution". MICROORGANISMS (2021):
    10.3390/microorganisms9020240
  8. Domingues, MAP; Camacho, R; Rodrigues, PP. "CMIID: A comprehensive medical information identifier for clinical search harmonization in Data Safe Havens". Journal of Biomedical Informatics (2020):
    10.1016/j.jbi.2020.103669
  9. Cavadas, B; Camacho, R; Ferreira, JC; Ferreira, RM; Figueiredo, C; Brazma, A; Fonseca, NA; Pereira, L. "Gastric Microbiome Diversities in Gastric Cancer Patients from Europe and Asia Mimic the Human Population Structure and Are Partly Driven by Microbiome Quantitative Trait Loci". MICROORGANISMS (2020):
    10.3390/microorganisms8081196
  10. Ferreira, MF; Camacho, R; Teixeira, LF. "Using autoencoders as a weight initialization method on deep neural networks for disease detection". BMC MEDICAL INFORMATICS AND DECISION MAKING (2020):
    10.1186/s12911-020-01150-w
  11. SILVA, RUI; Rocha, A; Ornelas, JP; Lopes, JC; Camacho, R. "Empowering Distributed Analysis Across Federated Cohort Data Repositories Adhering to FAIR Principles". ERCIM NEWS (2019): 118.
    Publicado
  12. Vazquez, N; Rocha, S; Lopez Fernandez, H; Torres, A; Camacho, R; Fdez Riverola, F; Vieira, J; Vieira, CP; Reboiro Jato, M. "EvoPPI 1.0: a Web Platform for Within- and Between-Species Multiple Interactome Comparisons and Application to Nine PolyQ Proteins Determining Neurodegenerative Diseases". INTERDISCIPLINARY SCIENCES-COMPUTATIONAL LIFE SCIENCES (2019):
    10.1007/s12539-019-00317-y
  13. Rocha, A; Camacho, R; Ruwaard, J; Riper, H; SILVA, RUI. "Using multi-relational data mining to discriminate blended therapy efficiency on patients based on log data". INTERNET INTERVENTIONS-THE APPLICATION OF INFORMATION TECHNOLOGY IN MENTAL AND BEHAVIOURAL HEALTH 12 (2018): 176-180.
    Publicado • 10.1016/j.invent.2018.03.003
  14. Cavadas, B; Soares, P; Camacho, R; Brandao, A; Costa, MD; Fernandes, V; Pereira, JB; et al. "Fine Time Scaling of Purifying Selection on Human Nonsynonymous mtDNA Mutations Based on the Worldwide Population Tree and Mother-Child Pairs". HUMAN MUTATION (2015): http://repositorio.inesctec.pt/handle/123456789/7152.
    10.1002/humu.22849
  15. Cavadas, Bruno; Soares, Pedro; Camacho, Rui; Brandão, Andreia; Costa, Marta D; Fernandes, Verónica; Pereira, Joana B; et al. "Fine time scaling of purifying selection on human nonsynonymous mtDNA mutations based on the worldwide population tree and mother-child pairs". (2015): http://hdl.handle.net/1822/40675.
    10.1002/humu.22849
  16. SILVA, RUI. "AND Parallelism for ILP: The APIS System". 20 1 (2014): 1-16.
    Publicado
  17. SILVA, RUI. "Ranking MEDLINE documents". 20 1 (2014): 13:1-13:16.
    Publicado
  18. Gonçalves, CT; Camacho, R; Oliveira, EC. "Ranking MEDLINE documents". J. Braz. Comp. Soc. (2014):
    10.1186/1678-4804-20-13
  19. Loureiro, Tiago; Camacho, Rui; Vieira, Jorge; Fonseca, Nuno A.; Loureiro, T; Camacho, R; Vieira, J; Fonseca, NA. "Improving the performance of Transposable Elements detection tools". Journal of Integrative Bioinformatics 10 3 (2013): 40-50. http://dx.doi.org/10.1515/jib-2013-231.
    Acesso aberto • Publicado • 10.1515/jib-2013-231
  20. Loureiro,T; Rui Camacho; Vieira,J; Nuno Fonseca. "Improving the performance of Transposable Elements detection tools". (2013): http://repositorio.inesctec.pt/handle/123456789/7070.
    http://dx.doi.org/10.2390/biecoll-jib-2013-231
  21. Loureiro,T; Rui Camacho; Vieira,J; Nuno Fonseca. "Boosting the Detection of Transposable Elements Using Machine Learning". (2013): http://repositorio.inesctec.pt/handle/123456789/7068.
    http://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-00578-2_12
  22. Loureiro,T; Rui Camacho; Vieira,J; Nuno Fonseca. "Boosting the Detection of Transposable Elements Using Machine Learning". (2013): http://repositorio.inesctec.pt/handle/123456789/7068.
    http://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-00578-2_12
  23. Rocha, A.; Henriques, M.R.; Lopes, J.C.; Camacho, R.; Klein, M.; Modena, G.; De Ven, P.V.; et al. "ICT4Depression: Service oriented architecture applied to the treatment of depression". Proceedings - IEEE Symposium on Computer-Based Medical Systems (2012): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84867320801&partnerID=MN8TOARS.
    10.1109/CBMS.2012.6266379
  24. Fonseca, N.A.; Santos Costa, V.; Camacho, R.. "Conceptual clustering of multi-relational data". Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics) 7207 LNAI (2012): 145-159. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84864862749&partnerID=MN8TOARS.
    10.1007/978-3-642-31951-8_16
  25. Alves, M.; Alves, J.; Camacho, R.; Soares, P.; Pereira, L.. "From networks to trees". Advances in Intelligent and Soft Computing 154 AISC (2012): 129-136. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84861211051&partnerID=MN8TOARS.
    10.1007/978-3-642-28839-5_15
  26. Nuno Fonseca; Vítor Santos Costa; Alexandre Magalhães; Miguel de Sousa; Vânia Guimarães; Natacha Rosa; Rui Camacho; et al. "Predicting the secondary structure of proteins using Machine Learning algorithms". International Journal of Data Mining and Bioinformatics 6 6 (2012): 571-584. http://repositorio.inesctec.pt/handle/123456789/2925.
    http://dx.doi.org/10.1504/IJDMB.2012.050265
  27. Santos, A.; Camacho, R.. "ILP made easy". Proceedings of the IADIS European Conference on Data Mining 2011, Part of the IADIS Multi Conference on Computer Science and Information Systems 2011, MCCSIS 2011 (2011): 175-180. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84865089796&partnerID=MN8TOARS.
  28. Camacho, R.; Pereira, M.; Costa, V.S.; Fonseca, N.A.; Simões, C.J.V.; Brito, R.M.M.. "Assessing the effect of 2D fingerprint filtering on ilp-based structure-activity relationships toxicity studies in drug design". Advances in Intelligent and Soft Computing 93 (2011): 355-363. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-80052957010&partnerID=MN8TOARS.
    10.1007/978-3-642-19914-1_46
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  3. Konstantopoulos, S; Camacho, R; Fonseca, NA; Costa, VS; Rui Camacho. "Induction as a search procedure". 2008.
    10.4018/978-1-59904-705-8.ch007
Edição de livro
  1. SILVA, RUI. 12th International Conference High Performance Computing for Computational Science – VECPAR 2016. Springer. 2016.
    Publicado
  2. SILVA, RUI. Inductive Logic Programming: 14th International Conference, ILP 2004, Porto. Sptinger. 2015.
    Publicado • Editor
  3. SILVA, RUI; Gama, J; Camacho, R; Brazdil, P; Jorge, A; Torgo, L. Machine Learning: ECML 2005: 16th European Conference on Machine Learning. Springer. 2005.
    Publicado
  4. SILVA, RUI. PKDD 2005: 9th European Conference on Knowledge Discovery in Databases. Springer. 2005.
    Publicado
  5. Jorge, A; Torgo, L; Brazdil, P; Camacho, R; Gama, J. Knowledge Discovery in Databases: PKDD 2005, 9th European Conference on Principles and Practice of Knowledge Discovery in Databases, Porto, Portugal, October 3-7, 2005, Proceedings. 2005.
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Edição de número de revista
  1. SILVA, RUI. "Machine Learning". Machine Learning 64 (2006):
    Publicado • Co-editor
Livro
  1. Adriano Gonçalves, C.; Lorenzo Iglesias, E.; Borrajo, L.; Camacho, R.; Seara Vieira, A.; Talma Gonçalves, C.. Comparative Study of Feature Selection Methods for Medical Full Text Classification. 2019.
    10.1007/978-3-030-17935-9_49
  2. Barbosa, J.; Camacho, R.; Dutra, I.; Marques, O.; King, R.; Srinivasan, A.. Preface. 2017.
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    Publicado • 10.1007/978-3-319-44881-7_16
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  31. Alexessander Alves; Rui Carlos Camacho de Sousa Ferreira da Silva; Eugénio da Costa Oliveira. Learning time series models with inductive logic programming. 2003.
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  35. Rui Camacho. Inducing models of human control skills. 1998.
    10.1007/s13928716
Tese / Dissertação
  1. Camacho, Benedita. "Design e avaliação de pictogramas farmacêuticos". Doutoramento, 2013. http://hdl.handle.net/10773/12260.
  2. Seabra, Paulo Tiago Ferreira. "Graph mining para concepção racional de novos fármacos". Mestrado, 2011. http://hdl.handle.net/10216/63316.
  3. Alves, Marco Alexandre do Nascimento. "Biblioteca de programas para análise de genética populacional". Mestrado, 2011. http://hdl.handle.net/10216/66389.
  4. Ferreira, Hugo Miguel Mendes. "Automatic plan generation and adaptation by observation : supporting complex human planning". Doutoramento, 2011. http://hdl.handle.net/10216/65324.
  5. Costa, Celso Ricardo Martins Maia. "Implementation of a knowledge discovery and enhancement module from structured information gained from unstructured sources of information". Mestrado, 2010. http://hdl.handle.net/10216/71332.
  6. Reinaldo, Francisco Antonio Fernandes. "AFRANCI : multi-layer architecture for cognitive agents". Doutoramento, 2010. http://hdl.handle.net/10216/59607.
  7. Azevedo, João de Campos. "A workbench to develop ILP systems". Mestrado, 2010. http://hdl.handle.net/10216/59776.
  8. Lima, João Norberto Fernandes da Costa. "Towards gathering and mining last.fm user-generated data". Mestrado, 2009. http://hdl.handle.net/10216/61912.
  9. Marques, David de Almeida. "Implementação de um mecanismo de extracção e carregamento de dados para o Alert Data Warehouse a partir do Alert Private Practice". Mestrado, 2008. http://hdl.handle.net/10216/69453.
  10. Garcia, Jorge Manuel Esparteira. "Assistente Web para Análise Automática e Colaborativa de Dados - WebCAD". Mestrado, 2007. http://hdl.handle.net/10216/11423.
  11. Rui Carlos Camacho de Sousa Ferreira da Silva. "Inducing Models of Human Control Skills using Machine Learning Algorithms". Doutoramento, 2000. https://hdl.handle.net/10216/129290.
  12. Rui Carlos Camacho de Sousa Ferreira da Silva. "Inducing models of human control skills using machine learning algorithms". Doutoramento, 2000. https://repositorio-aberto.up.pt/handle/10216/599.
  13. Silva, Rui Carlos Camacho de Sousa Ferreira da. "Representação de conhecimento num sistema pericial com perspectivas de aprendizagem simbólica automática". Mestrado, 1988. http://hdl.handle.net/10216/12011.

Outros

Outra produção
  1. Autoencoders as Weight Initialization of Deep Classification Networks for Cancer versus Cancer Studies. 2020. Ferreira, MF; Camacho, R; Teixeira, LF.
  2. High Performance Computing for Computational Science - VECPAR 2016 - 12th International Conference, Porto, Portugal, June 28-30, 2016, Revised Selected Papers. 2017. Inês Dutra; Rui Camacho; Barbosa,JG; Marques,O; Dutra, I; Camacho, R; Barbosa, JG; Marques, O. http://repositorio.inesctec.pt/handle/123456789/6984.
  3. Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics): Preface. 2005. Gama, J; Camacho, R; Brazdil, P; Jorge, A; Torgo, L.
Atividades

Orientação

Título / Tema
Papel desempenhado 		Curso (Tipo)
Instituição / Organização
2020 - 2020 Extracção de Informação dos Boletins de Saúde Infantil e Juvenil
Orientador
 Engenharia Informática e Computação (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2020 - 2020 Análise de som cardíaco pediátrico para identificação de sopro
Orientador
 Engenharia Informática e Computação (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2020 - 2020 Bioinformatic Tools to Decipher Biological Patterns in the Cytoskeleton of Nervous System Cells
Orientador
 Engenharia Informática e Computação (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2019 - 2019 A Toolbox for Genomic Studies
Orientador
 Engenharia Informática e Computação (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2019 - 2019 Framework for genomic based cancer studies using Machine Learning algorithms
Orientador
 Engenharia Informática e Computação (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2019 - 2019 Deep Learning for identification and quantification of oncocytic cells in microscopic images
Orientador
 Engenharia Informática e Computação (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2018 - 2018 Predicting drug effectiveness in Cancer Cell Lines using Machine Learning and Graph Mining
Orientador
 Engenharia Informática e Computação (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2018 - 2018 Extracting medical information from personal child health records
Orientador
 Engenharia Informática e Computação (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2018 - 2018 Hybrid coding taxonomy for clinical search harmonization in Safe Havens
Orientador
 Engenharia Informática (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2018 - 2018 Plataforma para Data Mining Colaborativo
Orientador
 Engenharia Informática e Computação (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2018 - 2018 Data Mining techniques for Prediction of secondary and 3D structures of proteins
Orientador
 Engenharia Informática e Computação (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2018 - 2018 Data Mining para estudos de interacção entre fármacos e previsão de Efeitos Adversos de Fármacos
Orientador
 Engenharia Informática e Computação (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2018 - 2018 Identificação Patogénica em Células Humanas Cancerígenas
Orientador
 Engenharia Informática e Computação (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2018 - 2018 Text Mining para Identificação de Bioprocessos
Orientador
 Engenharia Informática e Computação (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2018 - 2018 Gene prediction using Deep Learning
Orientador
 Engenharia Informática e Computação (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2017 - 2017 Data Mining para análise dos resultados de Gene Expression
Orientador
 Engenharia Informática e Computação (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2017 - 2017 Deep Learning for genomic data analysis
Orientador
 Engenharia Informática e Computação (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2017 - 2017 Identificação de Bioprocessos em textos
Orientador
 Engenharia Informática e Computação (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2017 - 2017 Predicting Adverse Effects of Drugs
Orientador
 Engenharia Biomédica (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2017 - 2017 Location Aware Product Recommendations
Orientador
 Engenharia Informática e Computação (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2017 - 2017 Gait Analysis and Rehabilitation using Inertial Sensors
Orientador
 Bioengenharia (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2017 - 2017 Previsão da evolução de doença oncológica a partir da análise de imagens de PET scan
Orientador
 Engenharia Informática e Computação (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2017 - 2017 Daily Activity Patterns Recognition
Orientador
 Engenharia Informática e Computação (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2017 - 2017 Data Mining for Rational Drug Design
Orientador
 Engenharia Biomédica (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2017 - 2017 Portal Web para enriquecimento de informação Genómica e Proteómica
Orientador
 Engenharia Informática e Computação (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2017 - 2017 Data Mining em aplicações de Desenho racional de Fármacos
Orientador
 Engenharia Informática e Computação (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2017 - 2017 Automatic comparison of interactomes
Orientador
 Engenharia Informática e Computação (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2017 - 2017 Previsão de efeitos adversos de medicamentos
Orientador
 Engenharia Informática e Computação (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2016 - 2016 Identificação Patogénica em Células Humanas Cancerígenas
Orientador
 Engenharia Informática e Computação (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2016 - 2016 Assessing the impact of alternative splicing in thyroid cancer
Orientador
 Engenharia Informática e Computação (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2016 - 2016 Ferramenta para Text Mining em Textos completos
Orientador
 Engenharia Informática e Computação (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2015 - 2015 Previsão de respostas a tratamentos de linhas celulares cancerígenas
Orientador
 Engenharia Informática e Computação (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2015 - 2015 Data Mining em aplicações de Desenho Racional de Fármacos
Orientador
 Engenharia Informática e Computação (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2015 - 2015 Assessing the impact of alternative splicing in cancer
Orientador
 Engenharia Informática e Computação (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2014 - 2014 A Computational Platform for Assessing the Impact of Alternative Splicing in Cancer
Orientador
 Engenharia Informática e Computação (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2014 - 2014 Identificação e Quantificação de Células Oncocíticas em Imagens Microscópicas
Orientador
 Engenharia Informática e Computação (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2014 - 2014 Metodologias de aprendizagem automática na descoberta de interações entre genes em doenças complexas
Orientador
 Engenharia Informática e Computação (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2014 - 2014 Identificação e quantificação de células oncocíticas em imagens microscópicas
Orientador
 Engenharia Electrotécnica e de Computadores (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2014 - 2014 A Computational Platform for Gene Expression Analysis
Orientador
 Engenharia Informática e Computação (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2010 - 2010 Automatic Plan Generation and Adaptation by Observation: Supporting Complex Human Planning
Orientador
 Engenharia Informática (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2006 - 2006 Afranci: a Multi-layer Architecture for Cognitive Agents
Orientador
 Engenharia Electrotécnica e de Computadores (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2006 - 2006 HARVARD - Um sistema para extracção automática de conhecimento
Orientador
 Engenharia Electrotécnica e de Computadores (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal

Arbitragem científica em conferência

Nome da conferência Local da conferência
2018/07/13 - 2018/07/19 IJCAI-ECAI 2018, the 27th International Joint Conference on Artificial Intelligence and the 23rd European Conference on Artificial Intelligenc Estocolmo, Suécia

Arbitragem científica em revista

Nome da revista (ISSN) Editora
2012/07/01 - 2012/07/19 The Computer Journal OXFORD Academic