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Biologist and researcher in the field of Systems Biology. Holds a Bachelor of Science degree in Biology (branch of Molecular Biology and Genetics, with a minor in Informatics) from the Faculty of Sciences of the University of Lisbon and a Master of Science degree in Biotechnology from the NOVA School of Science and Technology of NOVA University Lisbon. His scientific interests concern the usage of molecular and computational tools in the modelling of complex biological systems and the study of their relation with human health and heredity. Has research experience in the field of epigenetics and gene regulation, and metabolomics, and has collaborated with the private sector in the improvement of vaccine production through biochemical modelling and deep learning techniques.
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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
MÁRIO GIL POIARES RODRIGUES DE OLIVEIRA

Nomes de citação

  • Gil P. Oliveira
  • Mário Gil Poiares Rodrigues de Oliveira
  • Gil Poiares-Oliveira

Identificadores de autor

Ciência ID
D019-5596-42E2
ORCID iD
0000-0003-4638-2879
Google Scholar ID
IvGHLzkAAAAJ
Researcher Id
AAE-9440-2021
Scopus Author Id
57932405100

Endereços de correio eletrónico

  • gil.oliveira@tecnico.ulisboa.pt (Profissional)

Telefones

Telefone
  • (+351) 213100300 Ext.: 2318 (Profissional)

Moradas

  • Room 401, INESC-ID, Rua Alves Redol, 9, 1000-029, Lisboa, Lisboa, Portugal (Profissional)

Websites

Domínios de atuação

  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia Molecular
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Genética e Hereditariedade
  • Ciências da Engenharia e Tecnologias - Biotecnologia Industrial
  • Ciências Médicas e da Saúde - Biotecnologia Médica
  • Ciências Exatas - Ciências da Computação e da Informação - Bioinformática
  • Ciências Médicas e da Saúde - Biotecnologia Médica - Diagnóstico e Terapias de Base Genética
  • Ciências Médicas e da Saúde - Medicina Básica - Genética Humana
  • Ciências Médicas e da Saúde - Biotecnologia Médica - Tecnologias que envolvem a Manipulação de Células,Tecidos,Órgãos ou todo o Organismo

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Português (Idioma materno)
Inglês Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1)
Espanhol; Castelhano Utilizador independente (B1) Utilizador independente (B1) Utilizador independente (B1) Utilizador independente (B1) Utilizador independente (B1)
Francês Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1)
Formação
Grau Classificação
2019/09 - 2022/06/28
Concluído
 Biotecnologia (Mestrado)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
"Development of a novel hybrid genome-scale modelling method and showcase with HEK293 cell cultures" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 16
2016/09 - 2019/06/21
Concluído
 Biologia (Licenciatura)
Especialização em Biologia Molecular e Genética com Minor em Informática
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
 14
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2022/09/07 - 2023/03/31 Estagiário de Investigação (Investigação) Universidade de Lisboa Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas, Portugal
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2021/01 - 2022/07/31 Investigador (Investigação) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
Rede de Química e Tecnologia Laboratório Associado para a Química Verde, Portugal
2020/08/25 - 2020/12 Estagiário de Investigação (Investigação) Universidade de Lisboa Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes, Portugal
Universidade de Lisboa Faculdade de Medicina, Portugal

Outras Carreiras

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2023/06/05 - Atual Técnico Superior (Técnico Superior) Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
(...)

Outros

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2017 - 2018/01 Membro do Departamento de Gestão de Projetos - Ciências da Vida Júnior Empresa Ciências, Portugal
Projetos

Bolsa

Designação Financiadores
2021/10/01 - 2022/03/31 SILICOMEDIA - In silico culture or feed media design based on prior metabolic knowledge: Application to the Production phase of a mammalian cell line
LAQV/BI/006/2021
Bolseiro de Investigação
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal

Rede de Química e Tecnologia Laboratório Associado para a Química Verde, Portugal

Universidade Nova de Lisboa Departamento de Química, Portugal
GlaxoSmithKline Biologicals SA
Concluído
Produções

Publicações

Artigo em revista
  1. Ramos, João R. C.; Gil P. Oliveira; Dumas, Patrick; Oliveira, Rui. "Genome-scale modeling of Chinese hamster ovary cells by hybrid semi-parametric flux balance analysis". Bioprocess and Biosystems Engineering (2022): http://dx.doi.org/10.1007/s00449-022-02795-9.
    10.1007/s00449-022-02795-9
Poster em conferência
  1. Estima, Cláudia; Marques, Madalena; Gil Poiares-Oliveira; Ana Espada de Sousa; Gama-Carvalho, Margarida. Autor correspondente: Estima, Cláudia. "Dissecting the role of miR-34c-5p in Human CD4+ T cells". Trabalho apresentado em XLVIII Annual Meeting of the Portuguese Society for Immunology, 2023.
  2. Estima, Cláudia; Marques, Madalena; Gil Poiares-Oliveira; B. Farias, Guilherme; Ana E Sousa; Gama-Carvalho, Margarida. Autor correspondente: Estima, Cláudia. "The impact of miR-34c-5p on the transcriptome of Human CD4+ T cells". Trabalho apresentado em RNA in Disease - IX ptRNA Meeting, 2023.
Pré-impressão
  1. Ramos, João R. C.; Gil Poiares-Oliveira; José Pinto; Ludovic Peeters; Dumas, Patrick; Rui Manuel Freitas Oliveira. Autor correspondente: Rui Manuel Freitas Oliveira. "Deep hybrid modeling of a HEK293 process: combining Long Short-Term Memory (LSTM) networks with first principles equations". 2023. https://doi.org/10.22541/au.169280650.01297299/v1.
    10.22541/au.169280650.01297299/v1
Tese / Dissertação
  1. "Development of a HEK293 Cell-line Digital Twin Based on Hybrid Semi-Parametric Modeling at the Genome-Scale". Mestrado, Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, 2022. https://hdl.handle.net/10362/142477.
Atividades

Apresentação oral de trabalho

Título da apresentação Nome do evento
Anfitrião (Local do evento)
2022/09/13 Development of a HEK293 Cell-line Digital Twin Based on Hybrid Semi-Parametric Modeling at the Genome-Scale GSK Vaccines Staff Meeting
GlaxoSmithKline Biologicals SA (Rixensart, Bélgica)
2022/02 Development of a HEK293 Cell-line Digital Twin Based on Hybrid Semi-Parametric Modeling at the Genome-Scale Jornadas de Investigação do DQ e DCV
Departamentos de Química e Ciências da Vida da NOVA School of Science and Technology (Caparica, Portugal)

Membro de associação

Nome da associação Tipo de participação
2017 - 2019/06 AEFCL - Associação dos Estudantes da Faculdade de Ciências de Lisboa Membro da Direção

Membro de comissão

Descrição da atividade
Tipo de participação 		Instituição / Organização
2016 - 2019/09 Conselho Pedagógico da Licenciatura em Biologia
Membro
 Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2016/09 - 2019/06 Comissão de Curso da Licenciatura em Biologia
Membro
 Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2018 - 2019 Conselho de Escola
Membro
 Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2018 - 2019 Comissão ad-hoc de Boas Práticas Pedagógicas
Membro
 Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2018 - 2018 Conselho Pedagógico
Membro
 Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
Distinções

Outra distinção

2019 Membro Graduado da Ordem dos Biólogos
Ordem dos Biólogos, Portugal