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Pedro Nuno Sousa Sampaio. Concluiu o(a) Doutoramento em Biotecnologia em 2009 pelo(a) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Mestrado em Engenharia Bioquímica - Biotecnologia em 2002 pelo(a) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico e Licenciatura em Bioquímica em 1997 pelo(a) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências. Nas suas atividades profissionais interagiu com 13 colaborador(es) em coautorias de trabalhos científicos. No seu currículo Ciência Vitae os termos mais frequentes na contextualização da produção científica, tecnológica e artístico-cultural são: Infrared spectroscopy; Helicobacter pylori; Gastric adenocarcinoma cells; Biomarkers; Espectroscopia de infravermelho; Células de adenocarcinoma gástrico; Biomarcadores; Bioprocess; FT-MIR spectroscopy; Metabolic pro¿ling; PCA; Cultivation; High-throughput analysis; Mid-infrared spectroscopy; Partial least square regression; Principal components analysis; Recombinant cyprosin; Antibiotic resistance; Infra-red spectroscopy; Photodynamic therapy; Mid infrared spectroscopy; Near infrared spectroscopy; Saccharomyces cerevisiae; Biopharmaceuticals; Bioprocess monitoring; Near-infrared spectroscopy; Partial least squares models; PLS: Process analytical technologies; PAT; .
Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Pedro Nuno Sousa Sampaio

Nomes de citação

  • Sampaio, Pedro

Identificadores de autor

Ciência ID
AF12-6ABA-43D8
ORCID iD
0000-0003-2917-4904

Domínios de atuação

  • Ciências da Engenharia e Tecnologias - Biotecnologia Industrial
  • Ciências da Engenharia e Tecnologias - Biotecnologia Industrial - Fermentação

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Francês Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1)
Inglês Utilizador independente (B1) Utilizador independente (B1) Utilizador independente (B1) Utilizador independente (B1)
Espanhol; Castelhano Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1)
Formação
Grau Classificação
2009
Concluído
Biotecnologia (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
"Processos Integrados para Produção e Recuperação in situ da Ciprosina por Estirpes Transformadas de Saccharomyces cerevisiae " (TESE/DISSERTAÇÃO)
APROVADO
2002
Concluído
Engenharia Bioquímica - Biotecnologia (Mestrado)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
"Produção e Caracterização de Ciprosinas Recombinantes em Bioreactor" (TESE/DISSERTAÇÃO)
15 - APROVADO
1997
Concluído
Bioquímica (Licenciatura)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
"Estudo e Caracterização das Enzimas Proteolíticas de Cynara humilis" (TESE/DISSERTAÇÃO)
14 valores
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento
Empregador
2010/01/01 - 2012/02/28 Investigador Contratado (Investigação) Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal

Docência no Ensino Superior

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento
Empregador
2013/11/01 - Atual Professor Auxiliar (Docente Universitário) Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Centro Interdisciplinar de Desenvolvimento e Investigação em Ambiente Gestão Aplicada e Espaço, Portugal

Outros

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento
Empregador
2013/10/03 - 2019/09/30 Auxiliar Professor Engineering Faculty of Lusophone of Humanities and Technology University Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias, Portugal
2012/09/01 - 2013/08/31 Invited Professor Subjects: Cellular and Molecular Biology Genetic Engineering and Molecular Diagnostic Prosthesis and Artificial Organs (Master course) Universidade Católica Portuguesa Campus Sintra, Portugal
2008/01/01 - 2008/06/30 Research in scientific project: Genotype characterisation of populations of Cynara cardunculus L. var. altilis DC used as a milk clotting plant for Portuguese PDO cheese" - POCI/BIA-BDE/55681/2004 - I Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal
1996/09/01 - 1998/12/31 Fellowship Trainee student (BIC-J/12263/96) FCT-JNICT-PRAXIS XXI - (Gaduation Biochemistry) Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal
Projetos

Bolsa

Designação Financiadores
2016 - 2016/12/31 Pos-doc grant in RECI/AGR-TEC/0285/2012, BEST-RICE-4-LIFE, INIAV
RECI/AGR-TEC/0285/2012
Investigador Pós-doutorado
Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2008 - 2008/12/31 Genotype characterization of populations of Cynara cardunculus L. var. altilis DC used as a milk clotting plant for Portuguese PDO cheese
POCI/BIA-BDE/55681/2004 - FCT
Bolseiro de Investigação
2004 - 2007/12/31 Integrated processes for production and recovery in situ recombinant cyprosin by Saccharomyces cerevisiae transformed strains
PhD student (Biotechnology) - SFRH/BD/8780/2002
Bolseiro de Doutoramento
1999 - 1999/12/31 Production and Characterization of Recombinant Cyprosin in Bioreactor
Praxis XXI/BM/19237/99
Bolseiro de Mestrado
1996 - 1997/12/31 Extraction and purification of cyprosins to Castelões cheese production
(BIC-J/12263/96) FCT-JNICT-PRAXIS XXI
Bolseiro de Investigação

Projeto

Designação Financiadores
2010 - 2011/12/31 ONCOTERA Project “Discovery and development of compound for colon cancer therapy
01 – 0202 – FEDER-001433
Investigador Pós-doutorado
Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal

Outro

Designação Financiadores
2019 - 2019/12/31 Pesquisa de compostos bioactivos em Cynara cardunculus utilizando a Espectroscopia de Infravermelho e algoritmos de machine learning: estudo preliminar.
DREAMS_1
Bolseiro de Iniciação Científica
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Centro Interdisciplinar de Desenvolvimento e Investigação em Ambiente Gestão Aplicada e Espaço, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Produções

Publicações

Artigo em conferência
  1. Sampaio, Pedro N.; Calado, Cecilia R. C.. "Classification of recombinant Saccharomyces cerevisiae cells using PLS-DA modelling based on MIR spectroscopy". 2019.
    10.1109/enbeng.2019.8692463
  2. Cunha, Bernardo R.; Sampaio, Pedro N.; Calado, Cecília R. C.. "Development of a high-throughput monitoring technique of bacteria photodynamic inactivation". 2015.
    10.1109/ENBENG.2015.7088827
  3. Sampaio, Pedro N.; Calado, Cecília R. C.. "Comparative analysis of near and mid-infrared spectroscopy to monitor recombinant cyprosin production". 2015.
    10.1109/ENBENG.2015.7088876
Artigo em jornal
  1. Sampaio, Pedro. "Potential of FTIR-spectroscopy for drugs screening against Helicobacter pylori", 2020
    doi:10.3390/antibiotics9120897
Artigo em revista
  1. Pedro Sousa Sampaio; Cecília R. C. Calado. "Comparison of partial least squares-discriminant analysis and soft independent modeling of class analogy methods for classification of Saccharomyces cerevisiae cells based on mid-infrared spectroscopy". Journal of Chemometrics (2021): https://doi.org/10.1002/cem.3340.
    10.1002/cem.3340
  2. Sampaio, Pedro Sousa; Calado, Cecília R. C.. "Potential of FTIR-Spectroscopy for Drugs Screening against Helicobacter pylori". Antibiotics 9 12 (2020): 897. http://dx.doi.org/10.3390/antibiotics9120897.
    10.3390/antibiotics9120897
  3. Sampaio, Pedro Sousa; Castanho, Ana; Almeida, Ana Sofia; Oliveira, Jorge; Brites, Carla. "Identification of rice flour types with near-infrared spectroscopy associated with PLS-DA and SVM methods". European Food Research and Technology 246 3 (2019): 527-537. http://dx.doi.org/10.1007/s00217-019-03419-5.
    10.1007/s00217-019-03419-5
  4. Sampaio, Pedro. "Characterization of gastric cells infection by diverse Helicobacter pylori strains through Fourier-transform infrared spectroscopy". Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy (2019):
  5. Sampaio, Pedro. "Optimization of rice amylose determination by NIR-spectroscopy using PLS chemometrics algorithms.". Food chemistry (2018): https://doi.org/10.1016/j.foodchem.2017.09.058.
  6. Sampaio, Pedro. "Dataset of Near-infrared spectroscopy measurement for amylose determination using PLS algorithms". Data in Brief (2017):
    10.1016/j.dib.2017.09.077.
  7. Sampaio, Pedro. "Optimization of Clotting Donkey Milk Using an Aspartic Protease fromCynara Cardunculus Flowers". J Adv Dairy Res (2017): https://www.omicsonline.org/open-access/optimization-of-clotting-donkey-milk-using-an-aspartic-protease-fromcynara-cardunculus-flowers-2329-888X-1000190-94188.html.
    10.4172/2329-888X.1000190
  8. Sampaio, Pedro. "In situ near infrared spectroscopy monitoring of cyprosin production by recombinant Saccharomyces cerevisiae strains". Journal of Biotechnology (2014):
    10.1016/j.jbiotec.2014.07.454
  9. Sampaio PN. "A novel fed-batch based strategy for enhancing cell-density and recombinant cyprosin B production in bioreactor.". Bioprocess and Biosystem Engineering (2014):
    10.1007/s00449-014-1229-y
  10. Sampaio, Pedro. "Use of chemometrics in the selection of a Saccharomyces cerevisiae expression system for recombinant cyprosin B production.". Biotechnol Lett (2011):
    10.1007/s10529-011-0678-5
  11. Sampaio, Pedro. "Optimization of the culture medium composition using response surface methodology for new recombinant cyprosin B production in bioreactor for cheese production.". Eur Food Res Technol (2010):
    10.1007/s00217-010-1281-z
  12. Sampaio, Pedro. "Overexpression and characterization of cyprosin B in transformed suspension cells of Cynara cardunculus.". Plant Cell Tiss Organ Cult (2010):
    10.1007/s11240-010-9690-z
  13. Sampaio PN; Fortes AM; Cabral JM; Pais MS; Fonseca LP. "Production and characterization of recombinant cyprosin B in Saccharomyces cerevisiae (W303-1A) strain.". (2008): http://europepmc.org/abstract/med/18499044.
    10.1263/jbb.105.305
  14. Fernández-Salguero J; Prados F; Calixto F; Vioque M; Sampaio P; Tejada L. "Use of recombinant cyprosin in the manufacture of ewe's milk cheese.". (2003): http://europepmc.org/abstract/med/14640594.
    10.1021/jf034573h

Propriedade Intelectual

Patente
  1. Sampaio, Pedro. 2009. "Pharmaceutical composition containing the enzyme cyprosin B an aspartic peptidase from Cynara cardunculus and its inclusion in anti-tumorals formulations".
    Pendente

Outros

Outra produção
  1. Marques, Vanda; Cunha, Bernardo; Couto, Andreia; Sampaio, Pedro; Fonseca, Luís P.; Aleixo, Sandra; Calado, Cecília R. C.. 2019. Characterization of gastric cells infection by diverse Helicobacter pylori strains through Fourier-transform infrared spectroscopy. The infection of Helicobacter pylori, covering 50% of the world-population, leads to diverse gastric diseases as ulcers and cancer along the life-time of the human host. To promote the discovery of biomarkers of bacterial infection, in the present work, Fourier-transform infrared spectra were acquired from adenocarcinoma gastric cells, incubated with H. pylori strains presenting different genotype. http://hdl.handle.net/10400.21/9079.
    https://doi.org/10.1016/j.saa.2018.11.001
  2. Sales, Kevin C.; Rosa, Filipa; Cunha, Bernardo R.; Sampaio, Pedro N.; Lopes, Marta B.; Calado, Cecília R. C.. 2017. Metabolic pro¿ling of recombinant Escherichia coli cultivations based on high-throughput FT-MIR spectroscopic analysis. Escherichia coli is one of the most used host microorganism for the production of recombinant products, such as heterologous proteins and plasmids. However, genetic, physiological and environmental factors in¿uence the plasmid replication and cloned gene expression in a highly complex way. To control and optimize the recombinant expression system performance, it is very important to understand thi. http://hdl.handle.net/10400.21/7460.
    10.1002/btpr.2378
  3. Sampaio, Pedro N.; Sales, Kevin C.; Rosa, Filipa O.; Lopes, Marta B.; Calado, Cecília R. C.. 2017. High-throughput FTIR-based bioprocess analysis of recombinant cyprosin production. To increase the knowledge of the recombinant cyprosin production process in Saccharomyces cerevisiae cultures, it is relevant to implement efficient bioprocess monitoring techniques. The present work focuses on the implementation of a mid-infrared (MIR) spectroscopy-based tool for monitoring the recombinant culture in a rapid, economic, and high-throughput (using a microplate system) mode. Multiva. http://hdl.handle.net/10400.21/6851.
    10.1007/s10295-016-1865-0
  4. Sales, Kevin C.; Rosa, Filipa; Sampaio, Pedro N.; Fonseca, LuÍs P.; Lopes, Marta B.; Calado, Cecília R. C.. 2015. In Situ Near-Infrared (NIR) Versus High-Throughput Mid- Infrared (MIR) Spectroscopy to Monitor Biopharmaceutical Production. The development of biopharmaceutical manufacturing processes presents critical constraints, with the major constraint being that living cells synthesize these molecules, presenting inherent behavior variability due to their high sensitivity to small fluctuations in the cultivation environment. To speed up the development process and to control this critical manufacturing step, it is relevant to de. http://hdl.handle.net/10400.21/6057.
    10.1366/14-07588
Técnica de investigação
  1. Enzymatic additive licenced as GRAS by Food and Drugs Administration (FDA): Cynzime® Milk Clotting Enzyme Preparation Derived from Cynara cardunculus Flowers. Investigador.
Atividades

Orientação

Título / Tema
Papel desempenhado
Curso (Tipo)
Instituição / Organização
2018 - 2018 Preliminary genetic study of the venomous animal of the Malpolon genus
Orientador
Biologia (Licenciatura/Bacharelato)
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal
2018 - 2018 Genetic study of venomous Thamnophis sauritus species
Orientador
Biologia (Licenciatura/Bacharelato)
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal
2017 - 2017 Sampling and preliminary study of Tamnophis sauritus genus toxins
Orientador
Biologia (Licenciatura/Bacharelato)
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal
2015 - 2015 Breaking the wall! Deconstruction of the celullosome – A jorney from Cohesin-dockerin expression to novel carbohydrate binding module structures
Coorientador
Engenharia Biotecnológica (Mestrado)
2012 - 2013 Monitoring of microbial metabolism by FTIR-spectroscopy in recombinant Escherichia coli cultures
Coorientador
Engenharia Biomédica (Mestrado)
Universidade Católica Portuguesa Escola Superior de Biotecnologia, Portugal
2012 - 2013 Increase of Immunization Efficiency of DNA Vaccine against Helicobacter pylori
Coorientador
Engenharia Biomédica (Mestrado)
Universidade Católica Portuguesa Escola Superior de Biotecnologia, Portugal

Júri de grau académico

Tema
Tipo de participação
Nome do candidato (Tipo de grau)
Instituição / Organização
2020/01/29 Produção de lípidos através da levedura Rhodosporidium toruloides NCYC 921 a partir de biomassa lenhocelulósica de Miscanthus sp.
Arguente principal
Joana Isabel Alves Martins. (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2019/12/12 Effect of Source of Mesenchymal Stem Cell Source on the Molecular Profile of Extracellular Vesicles for Cell Therapy
Arguente principal
Filipa Pires (Mestrado)
Instituto Politécnico de Lisboa Instituto Superior de Engenharia de Lisboa, Portugal
2019/12/05 Characterization of bacteria isolated from Portuguese traditional cheeses
Arguente
Patrícia Andrea Bastião Rocha (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2018/12/11 Pesquisa de Biomarcadores de Genotoxicidade em Sangue e Soro por Espectroscopia de Infravermelho por Transformada de Fourier
Arguente principal
Hélder Santos da Paz Teixeira (Mestrado)
Instituto Politécnico de Lisboa Instituto Superior de Engenharia de Lisboa, Portugal
2018/12/03 Screening and Application of Marine Enzymes
Arguente principal
Catarina Alexandra Pereira (Mestrado)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2018/11/05 Caracterização do microbioma de queijos tradicionais Portugueses com DOP
Arguente principal
Margarida Raimundo Raposo Ruivo Baptista (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2017 Caracterização microbiológica e físico-química de queijos tradicionais Portugueses com Denominação de origem Protegida
Arguente principal
Esther Nataly Baptista Batista (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2017 Optimization of a bioassay to evaluate Escherichia coli stress responses
Arguente principal
Ana Lúcia Evaristo Russo (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2016 Development of microfluidic reactors for continuous production of extracellular metabolites
Arguente principal
Eduardo João Silva Brás; (Mestrado)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2015 Optimization of high added-value pigments production by Gordonia alkanivorans strain 1B
Arguente principal
Ana Sofia Freitas Fernandes (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2015 Production of Gordonia alkanivorans strain 1B biomass in bioreactor and further application towards fossil fuels desulfurization
Arguente principal
Marta Sofia Lopes Pacheco (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal

Membro de comissão

Descrição da atividade
Tipo de participação
Instituição / Organização
2020/01/25 - Atual IEEE Engineering in Medicine and Biology Society
Membro