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Natália Aniceto has a degree in Pharmaceutical Sciences (completed in 2012) and has developed her Master thesis in pharmaceutical sciences and drug delivery (Henri Poincare University, France, 2012). She did her PhD in cheminformatics (University of Kent, 2018), working on the QSAR modelling of volume of distribution and ATP-Binding Cassette drug transporters. During her PhD she spent 6 months in Novatis (Basel, Switzerland) where she worked on methods to improve screening efficiency, and screening methods to screen for compounds that exhibit a gene expression profile of interest. She then joined the Bender group (University of Cambridge, UK) for year as a post-doc where she worked on modelling compound synergy. She also worked as a hired consultant in project for AstraZeneca (Cambridge, UK). She is currently a junior researcher at the medicinal chemistry group in Faculty of Pharmacy, University of Lisbon (Lisbon, Portugal), which she joined in 2019.
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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Natália Luísa de Moura Aniceto

Nomes de citação

  • Aniceto, Natália

Identificadores de autor

Ciência ID
9F18-67B4-9442
ORCID iD
0000-0001-7039-0022

Endereços de correio eletrónico

  • nataliaaniceto@ff.ul.pt (Profissional)
  • nataliaaniceto@ff.ulisboa.pt (Profissional)

Moradas

  • Av. Prof. Gama Pinto, 1649-003, Lisbon, Lisbon, Portugal (Profissional)

Domínios de atuação

  • Ciências Médicas e da Saúde - Medicina Básica - Química Médica
  • Ciências Exatas - Ciências da Computação e da Informação - Bioinformática
  • Ciências Exatas - Ciências da Computação e da Informação

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Português (Idioma materno)
Inglês Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2)
Formação
Grau Classificação
2014/10/01 - 2018/05/01
Concluído
 PhD in Cheminformatics (Doctor of Philosophy)
Especialização em Cheminformatics
Medway School of Pharmacy, Reino Unido
 Approved with minor corrections
2007 - 2012
Concluído
 Integrated Master's in Pharmaceutical Sciences (Mestrado)
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias, Portugal
"Physicochemical properties and cyclodextrin inclusion processes of two organoarsenical drugs for oral delivery" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 15/20
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2019/12/18 - 2023/03/01 Investigador Contratado (Investigação) Universidade de Lisboa Instituto de Investigação do Medicamento, Portugal
Universidade de Lisboa Instituto de Investigação do Medicamento, Portugal
2019/02/01 - 2019/12/17 Pós-doutorado (Investigação) Universidade de Lisboa Instituto de Investigação do Medicamento, Portugal
Universidade de Lisboa Instituto de Investigação do Medicamento, Portugal
2017/11/01 - 2019/01/31 Pós-doutorado (Investigação) University of Cambridge, Reino Unido
University of Cambridge, Reino Unido
2013 - 2014 Assistente de Investigação (carreira) (Investigação) Associação para a Investigação e Desenvolvimento da Faculdade de Medicina, Portugal
Universidade de Lisboa Faculdade de Medicina, Portugal
(...)

Docência no Ensino Superior

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2023/03/02 - Atual Professor Auxiliar (Docente Universitário) Universidade de Lisboa Faculdade de Farmácia, Portugal
2013/03/01 - 2013/09/30 Assistente (Docente Universitário) Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias, Portugal
2012/10/01 - 2013/02/28 Assistente (Docente Universitário) Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias, Portugal
Projetos

Bolsa

Designação Financiadores
2022/01/01 - 2025/01/31 AntibacML: Harnessing shared chemical and activity patterns in antimicrobial compounds to build improved computational models for the discovery of new antibiotics
2022.03752.PTDC
Investigador responsável
Universidade de Lisboa Instituto de Investigação do Medicamento, Portugal
Em curso
2022/01/17 - 2023/07/16 ChemSlotProtein: Expanding the druggable universe to unlock chemists´ creativity
EXPL/QUI-OUT/1288/2021
Co-Investigador Responsável (Co-IR)
Universidade de Lisboa Instituto de Investigação do Medicamento, Portugal

FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2022/01/10 - 2022/06/10 Using a Genetic Algorithm to design new urease inhibitors
CPCA/A1/407814/2021
Investigador responsável
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2020 - 2021 Expanding the druggable target space
CPCA/A2/6972/2020
Co-Investigador Responsável (Co-IR)
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
Produções

Publicações

Artigo em revista
  1. Aniceto, Natália; Martinho, Nuno; Rufino, Ismael; Guedes, Rita C. "LigExtract: Large-scale Automated Identification of Ligands from Protein Structures in the Protein Data Bank". Genomics, Proteomics & Bioinformatics (2025): https://doi.org/10.1093/gpbjnl/qzaf018.
    10.1093/gpbjnl/qzaf018
  2. Sílvia Rocha; Carina Proença; Alberto N. Araújo; Marisa Freitas; Ismael Rufino; Natália Aniceto; Artur M. S. Silva; et al. "Flavonoids as Potential Modulators of Pancreatic Lipase Catalytic Activity". Pharmaceutics (2025): https://doi.org/10.3390/pharmaceutics17020163.
    10.3390/pharmaceutics17020163
  3. Natália Aniceto; Tânia S. Albuquerque; Vasco D. B. Bonifácio; Rita C. Guedes; Nuno Martinho. "Using Machine Learning and Molecular Docking to Leverage Urease Inhibition Data for Virtual Screening". International Journal of Molecular Sciences (2023): https://doi.org/10.3390/ijms24098180.
    10.3390/ijms24098180
  4. Natália Aniceto; Vasco D. B. Bonifácio; Rita C. Guedes; Nuno Martinho. "Exploring the Chemical Space of Urease Inhibitors to Extract Meaningful Trends and Drivers of Activity". Journal of Chemical Information and Modeling (2022): https://doi.org/10.1021/acs.jcim.2c00150.
    10.1021/acs.jcim.2c00150
  5. Natália Aniceto; Vanda Marques; Joana D. Amaral; Patrícia A. Serra; Rui Moreira; Cecília M. P. Rodrigues; Rita C. Guedes. "Harnessing Protein-Ligand Interaction Fingerprints to Predict New Scaffolds of RIPK1 Inhibitors". Molecules (2022): https://doi.org/10.3390/molecules27154718.
    10.3390/molecules27154718
  6. Carlota Leonardo-Sousa; Andreia Neves Carvalho; Romina A. Guedes; Pedro M. P. Fernandes; Natália Aniceto; Jorge A. R. Salvador; Maria João Gama; Rita C. Guedes. "Revisiting Proteasome Inhibitors: Molecular Underpinnings of Their Development, Mechanisms of Resistance and Strategies to Overcome Anti-Cancer Drug Resistance". Molecules 27 7 (2022): 2201-2201. https://doi.org/10.3390/molecules27072201.
    10.3390/molecules27072201
  7. Rocha, Sónia; Aniceto, Natália; Guedes, Rita C.; Albuquerque, Hélio M. T.; Silva, Vera L. M.; Silva, Artur M. S.; Corvo, Maria Luísa; Fernandes, Eduarda; Freitas, Marisa. "An In Silico and an In Vitro Inhibition Analysis of Glycogen Phosphorylase by Flavonoids, Styrylchromones, and Pyrazoles". Nutrients 14 2 (2022): 306. http://dx.doi.org/10.3390/nu14020306.
    10.3390/nu14020306
  8. Filipe G. A. Estrada; Silvia Miccoli; Natalia Aniceto; Alfonso T. García-Sosa; R. C. Guedes. "Exploring EZH2-Proteasome Dual-Targeting Drug Discovery through a Computational Strategy to Fight Multiple Myeloma". Molecules (2021): https://www.mdpi.com/1420-3049/26/18/5574.
    10.3390/molecules26185574
  9. Rocha, Sónia; Lucas, Mariana; Silva, Vera L.M.; Gomes, Pedro M.O.; Silva, Artur M.S.; Araújo, Alberto N.; Aniceto, Natália; et al. "Pyrazoles as novel protein tyrosine phosphatase 1B (PTP1B) inhibitors: An in vitro and in silico study". International Journal of Biological Macromolecules 181 (2021): 1171-1182. http://dx.doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2021.04.061.
    10.1016/j.ijbiomac.2021.04.061
  10. Brito, H.; Marques, V.; Afonso, M.B.; Brown, D.G.; Börjesson, U.; Selmi, N.; Smith, D.M.; et al. "Phenotypic high-throughput screening platform identifies novel chemotypes for necroptosis inhibition". Cell Death Discovery 6 1 (2020): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85079729058&partnerID=MN8TOARS.
    10.1038/s41420-020-0240-0
  11. Vlot, Anna H.C.; Aniceto, Natália; Menden, Michael P.; Ulrich-Merzenich, Gudrun; Bender, Andreas. "Applying synergy metrics to combination screening data: agreements, disagreements and pitfalls". Drug Discovery Today 24 12 (2019): 2286-2298. http://dx.doi.org/10.1016/j.drudis.2019.09.002.
    10.1016/j.drudis.2019.09.002
  12. Guedes, R.A.; Aniceto, N.; Andrade, M.A.P.; Salvador, J.A.R.; Guedes, R.C.. "Chemical patterns of proteasome inhibitors: Lessons learned from two decades of drug design". International Journal of Molecular Sciences 20 21 (2019): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85074392958&partnerID=MN8TOARS.
    10.3390/ijms20215326
  13. Svensson, Fredrik; Aniceto, Natalia; Norinder, Ulf; Cortes-Ciriano, Isidro; Spjuth, Ola; Carlsson, Lars; Bender, Andreas. "Conformal Regression for Quantitative Structure–Activity Relationship Modeling—Quantifying Prediction Uncertainty". Journal of Chemical Information and Modeling 58 5 (2018): 1132-1140. http://dx.doi.org/10.1021/acs.jcim.8b00054.
    10.1021/acs.jcim.8b00054
  14. Duarte, H.; Cruz, J.P.; Aniceto, N.; Ribeiro, A.C.; Fernandes, A.; Paixão, P.; Antunes, F.; Morais, J.. "Population Approach to Efavirenz Therapy". Journal of Pharmaceutical Sciences 106 10 (2017): 3161-3166. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85026645839&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.xphs.2017.06.004
  15. Aniceto, Natália; Freitas, Alex A.; Bender, Andreas; Ghafourian, Taravat. "A novel applicability domain technique for mapping predictive reliability across the chemical space of a QSAR: reliability-density neighbourhood". Journal of Cheminformatics 8 1 (2016): http://dx.doi.org/10.1186/s13321-016-0182-y.
    10.1186/s13321-016-0182-y
  16. Aniceto, Natália; Freitas, Alex A.; Bender, Andreas; Ghafourian, Taravat. "Simultaneous Prediction of four ATP-binding Cassette Transporters’ Substrates Using Multi-label QSAR". Molecular Informatics 35 10 (2016): 514-528. http://dx.doi.org/10.1002/minf.201600036.
    10.1002/minf.201600036
  17. Michaelis, Martin; Rothweiler, Florian; Wurglics, Mario; Aniceto, Natália; Dittrich, Michaela; Zettl, Heiko; Wiese, Michael; et al. "Substrate-specific effects of pirinixic acid derivatives on ABCB1-mediated drug transport". Oncotarget 7 10 (2016): 11664-11676. http://dx.doi.org/10.18632/oncotarget.7345.
    10.18632/oncotarget.7345
  18. Paixão, P.; Aniceto, N.; Gouveia, L.F.; Morais, J.A.G.. "Prediction of drug distribution in rat and humans using an artificial neural networks ensemble and a PBPK model". Pharmaceutical Research 31 12 (2014): 3313-3322. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84936100946&partnerID=MN8TOARS.
    10.1007/s11095-014-1421-4
  19. Catarina Pinto Reis; João Pinto Ferreira; Sara Candeias; Cátia Fernandes; Martinho, Nuno; Aniceto, Natália; António Silvério Cabrita; Isabel V. Figueiredo. "Ibuprofen Nanoparticles for Oral Delivery: Proof of Concept". Journal of Nanomedicine & Biotherapeutic Discovery 04 01 (2014): http://dx.doi.org/10.4172/2155-983x.1000119.
    10.4172/2155-983x.1000119
  20. Paixão, P.; Aniceto, N.; Gouveia, L.F.; Morais, J.A.G.. "Tissue-to-blood distribution coefficients in the rat: Utility for estimation of the volume of distribution in man". European Journal of Pharmaceutical Sciences 50 3-4 (2013): 526-543. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84883721885&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.ejps.2013.08.020
  21. Becherirat, S.; Lanhers, M.-C.; Socha, M.; Yemloul, M.; Astier, A.; Loboda, C.; Aniceto, N.; Gibaud, S.. "The antitumor effects of an arsthinol-cyclodextrin complex in a heterotopic mouse model of glioma". European Journal of Pharmaceutics and Biopharmaceutics 85 3 PART A (2013): 560-568. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84888370315&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.ejpb.2013.06.021
Capítulo de livro
  1. Harry Yang; Natalia Aniceto; Chad Allen; Krishna C. Bulusu; Siu Lun Tsang. "Predicting Anticancer Synergistic Activity through Machine Learning and Natural Language Processing". 2022.
    10.1201/9781003150886-5
  2. Catarina Oliveira Silva; Nuno Martinho; Aniceto, Natália; Catarina Pinto Reis. "Melanoma Prevention: Challenges and Progresses in Nanotechnology for Melanoma Prevention and Treatment". In CRC Concise Encyclopedia of Nanotechnology. CRC Press, 2016.
    Publicado
Poster em conferência
  1. Rufino, Ismael; Gomes, Bruno; Aniceto, Natália; Guedes, Rita. "Decoding Drug Targets: An Innovative Strategy for Protein Binding Pocket Exploration.". Trabalho apresentado em 8th National Medicinal Chemistry Meeting (8ENQT), 15ENQO, 2024.
  2. Ledesma-Martín, Vicente; Assis, Diana; Martinho, Nuno; Aniceto, Natália; Decker, Michael; Prof. Dr. Rita Guedes. Autor correspondente: Ledesma-Martín, Vicente. "Structure and Ligand-Based Strategies to Discover Novel Orexin Receptor Modulators: Targeting the Circadian Clock and Alzheimer’s Disease". Trabalho apresentado em 15th National Organic Chemistry Meeting (15ENQO) and 8th National Medicinal Chemistry Meeting (8ENQT), 2024.
  3. V. Ledesma-Martin; Diana L. Assis; Martinho, Nuno; Aniceto, Natália; M. Decker; Guedes, Rita C.. "Analysis of receptor-ligand interactions to discover orexin receptor photoswitches". Trabalho apresentado em XV iMed.ULisboa Postgraduate Students Meeting., 2024.
  4. Diana L. Assis; V. Ledesma-Martin; Martinho, Nuno; Aniceto, Natália; Guedes, Rita C.. "The Neurological Clock is ticking: Advanced Computational exploration of Photoswitchable Molecules in Alzheimer's Treatment". Trabalho apresentado em XV iMed.ULisboa Postgraduate Students Meeting, 2024.
  5. Martinho, Nuno; Aniceto, Natália; Rita C. Guedes. "Cracking the Code of Antibiotics Through the Application of Multilabel Machine Learning". Trabalho apresentado em XV iMed.ULisboa Postgraduate Students Meeting, 2024.
  6. Filipe G. A. Estrada; Martinho, Nuno; Aniceto, Natália; Guedes, Rita C.. "A well-informed in silico approach to achieve significant improvements in the challenging battle against lung cancer". Trabalho apresentado em 4th Biophysics Festival, 2024.
  7. Rufino, Ismael.; Gomes, Bruno; Aniceto, Natália; Guedes, Rita. "Drugging the Undruggable: Exploring New Analysis of Protein Binding Pockets to Discover New Interesting Drug Targets". Trabalho apresentado em XXVIII Encontro Nacional da Sociedade Portuguesa de Química, 2023.
  8. Rufino, Ismael; Gomes, Bruno; Aniceto, Natália; Guedes, Rita. "Investigating the Binding Side Pocket in Druggable and Undruggable Proteins: Gateway to New Drug Targets.". Trabalho apresentado em 14th iMed.ULisboa Postgraduate Students Meeting, 2023.
  9. Gomes, Bruno F. A.; Aniceto, Natália; Rita Guedes. "Pocket similarity between druggable and undruggable proteins: a new method for drug design". Trabalho apresentado em 14thiMed.Ulisboa Meeting, 2023.
  10. Gomes, Bruno F. A.; Aniceto, Natália; Guedes, Rita. "Exploring a new drug design strategy based on pocket similarity between druggable and undruggable proteins". Trabalho apresentado em 5th MCQUL, 2022.
  11. Gomes, Bruno F. A.; Aniceto, Natália; Rita Guedes. "Pocket similarity analysis between druggable and undruggable proteins to foster innovative drug design". Trabalho apresentado em 13th iMed.ULisboa meeting, 2022.
  12. Andre F. S. Luz; Andreia Sofia da Costa Vieira; Marques, Vanda; Aniceto, Natália; Rodrigues, CMP; Rita C. Guedes; Lígia Catarina Gomes da Silva; Moreira, Rui. "Novel Class of Necroptotic Cell Death Inhibitors: Synthetic Approach and In Vitro Assays". Trabalho apresentado em European Federation for Medicinal Chemistry – International Symposium on Medicinal Chemistry, 2021.
  13. Andre F. S. Luz; Andreia Sofia da Costa Vieira; Marques, Vanda; Aniceto, Natália; Rodrigues, CMP; Rita C. Guedes; Lígia Catarina Gomes da Silva; Moreira, Rui. "Targeting Necroptosis: Discovery and Optimization of Novel RIPK1 Inhibitors". Trabalho apresentado em European School of Medicinal Chemistry, 2021.
  14. Rocha, Sónia; Lucas, Mariana; Silva, Vera L.M.; Silva, Artur M.S.; Araújo, Alberto N.; Aniceto, Natália; Guedes, Rita C.; et al. "Antidiabetic Potential of Pyrazoles: Exploring the Structure-Activity Relationship against Protein Tyrosine Phosphatase 1B and Glycogen Phosphorylase". Trabalho apresentado em iMed.ULisboa Meeting 2021, 2021.
  15. Aniceto, Natália; Cruz, JP; Carvalho, C; Valadas, E; Paixão, Paulo; Marinho, R; Antunes, F; Morais, José A. G.. "IMPACT OF HEPATITIS C VIRUS ON THE HIV DISEASE PROGRESSION IN THE PORTUGUESE POPULATION". Trabalho apresentado em 9TH WORLD MEETING on Pharmaceutics, Biopharmaceuticsand Pharmaceutical Technology, 2014.
  16. Aniceto, Natália; Gouveia, Luís F.; Morais, José A. G.; Paixão, Paulo. "ANNE for estimation of rat tissue-to-blood coefficients". Trabalho apresentado em 9TH WORLD MEETING on Pharmaceutics, Biopharmaceuticsand Pharmaceutical Technology, 2014.
  17. Cruz, JP; Aniceto, Natália; Ribeiro, AC; Paixão, Paulo; Morais, José A. G.. "Population Pharmacokinetics-Pharmacogenetics of Efavirenz using Non-Linear Mixed Effects Modeling and Bayesian Estimation". Trabalho apresentado em PAGE 2014, 2014.
  18. Paixão, Paulo; Aniceto, Natália; Morais, José A. G.; Gouveia, Luís F.; Natália Aniceto; Luis F Gouveia; José Morais. "In silico prediction of the tissue:blood partition coefficients in the rat". Trabalho apresentado em NEW TRENDS IN PHARMACEUTICAL SCIENCES, 2011.

Outros

Software
  1. Aniceto, Natália; Martinho, Nuno; Guedes, Rita C.. "LigExtract: Automated Ligand Indentification and Extraction from PDB Structures". https://github.com/comp-medchem/LigExtract. 2024.