???global.info.a_carregar???
Dr Rui Figueira is the GBIF node manager for Portugal since 2013 and an Associate Professor of the Instituto Superior de Agronomia (ISA). After completing his PhD in Ecology by the University of Lisbon in 2002, he was Invited Assistant Professor of Instituto Superior Técnico, University of Lisbon (2004-2010). His research interests are on species¿ distribution modelling and biodiversity informatics, with integration of ecological niche modelling, geostatistics and multivariate data analysis. He was involved in 29 research projects, (four as coordinator). He published a total of 70 scientific papers, including 42 per-reviewed papers in international scientific journals. His experience in biodiversity informatics includes the development and management of information facilities (hardware and software) to support biodiversity data, installation and use of standards and protocols for biodiversity data mobilizing, integration and sharing (Darwin Core, GBIF IPT, Platform ALA, Specify 6) and training. In its professional activities, he co-authored scientific publications with 67 researchers.
Identification

Personal identification

Full name
Rui Figueira

Citation names

  • Figueira, Rui

Author identifiers

Ciência ID
9D1D-412C-2FFF
ORCID iD
0000-0002-8351-4028
Google Scholar ID
OISJfdkAAAAJ
Researcher Id
C-4977-2009
Scopus Author Id
36051668100

Websites

Knowledge fields

  • Exact Sciences - Computer and Information Sciences - Bioinformatics
  • Natural sciences - Biological Sciences - Ecology

Languages

Language Speaking Reading Writing Listening Peer-review
Portuguese (Mother tongue)
English Advanced (C1) Advanced (C1) Advanced (C1) Advanced (C1)
French Elementary (A2) Elementary (A2) Elementary (A2) Elementary (A2) Elementary (A2)
Spanish; Castilian Advanced (C1) Advanced (C1) Beginner (A1) Advanced (C1) Beginner (A1)
Education
Degree Classification
1997/01/01 - 2002/07/06
Concluded
Biologia (Doutoramento)
Major in Biologia. Ecologia e Biossistemática
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
"Desenvolvimento de um Sistema de Biomonitorização Ambiental" (THESIS/DISSERTATION)
Aprovado com Louvor e Distinção
1993 - 1996
Concluded
Mineralurgia e Planeamento Mineiro (Mestrado)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
"Modelação Geoestatística de um Sistema de Biomonitorização de Salinidade" (THESIS/DISSERTATION)
Aprovado
1988 - 1992
Concluded
Biologia (Licenciatura)
Major in Ramo Científico Vegetal
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
14
Affiliation

Science

Category
Host institution
Employer
2015/08/01 - 2020/12/30 Invited Auxiliary Researcher (Research) Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2013/09/01 - 2015/07/31 Auxiliary Researcher (Research) Instituto de Investigação Científica Tropical, Portugal
2013/01/01 - 2013/08/31 Science and Technology Management Instituto de Investigação Científica Tropical, Portugal
2008/01/01 - 2012/12/31 Auxiliary Researcher (Research) Instituto de Investigação Científica Tropical, Portugal

Teaching in Higher Education

Category
Host institution
Employer
2024/12/11 - Current Associate Professor (University Teacher) Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2020/12/31 - 2024/12/10 Assistant Professor (University Teacher) Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2004/04/15 - 2010/04/14 Invited Assistant Professor (University Teacher) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal

Positions / Appointments

Category
Host institution
Employer
2013/01/01 - Current Coordenador do Nó Português do GBIF Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
Projects

Grant

Designation Funders
2012/02 - 2015/01 Cashew in West Africa: socio-economic and environmental challenges of an expanding cash crop Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
2010/02 - 2013/07 Maerua - Motivation and results of "Missão Botânica de Moçambique" Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
2008/01 - 2011/12 IMBAMBA - Implementing Biodiversity Data Access and Management of Botanical Collections in Angola Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
2008/01 - 2011/06 URBSOIL-LISBON_Geochemical survey of Lisbon urban soils: a baseline for future human health studies Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
2008/01 - 2011/03 Recovering the past, recording the present, and preparing the future of zoological collections in Portugal. Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
2007/01 - 2010/03 History of the scientific expeditions in S. Tomé Islands. Biodiversity characterisation based in the inventory bryophyte herbarium collections. Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
2007/01 - 2009/11 Biomonitoring of tropospheric ozone and assessment of the ozone sensitivity of Medterranean vegetation Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
2005/09 - 2008/07 Foetal exposure to lead as determined by human and environmental biomarkers - investigation of influence on human reproductive outcomes and autonomic nervous system in rats Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.

Contract

Designation Funders
2024/04/01 - 2027/03/31 Harmonização de pipelines de metabarcoding de plantas na Europa para apoiar atividades de monitorização no domínio das plantas e das suas redes funcionais
BiodivMon/0005/2022
Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal

Universidade de Lisboa Centro de Investigação em Agronomia Alimentos Ambiente e Paisagem, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Ongoing
2023/06/01 - 2025/06/30 Portuguese Biodiversity Data Portal and associated services to PORBIOTA RI user community
2022.15827.CPCA.A2
Universidade de Lisboa, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Ongoing
2022/01/01 - 2024/12/31 Dammed Fish: Impact of structural and functional river network connectivity losses on fish biodiversity – Optimising management solutions
PTDC/CTA-AMB/4086/2021
Researcher
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Ongoing
2020/01/01 - 2023/12/31 Research Network in Biodiversity and Evolutionary Biology
UIDB/50027/2020
UID/BIA/50027/2019
LA/P/0048/2020
UIDP/50027/2020
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal

Fundação Gaspar Frutuoso, Portugal

Universidade do Porto Instituto de Ciências Tecnologias e Agroambiente, Portugal

Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal

Universidade dos Açores, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2020/01/01 - 2023/12/31 Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal

Fundação Gaspar Frutuoso, Portugal

Universidade do Porto Instituto de Ciências Tecnologias e Agroambiente, Portugal

Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2018/10/19 - 2021/10/18 Impactos do comércio global de animais no estabelecimento de espécies invasoras
PTDC/BIA-ECO/30931/2017
Universidade de Évora, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Ongoing
2016/07/01 - 2019/12/31 O COMÉRCIO GLOBAL DE AVES COMO UM FACTOR DETERMINANTE PARA AS INVASÕES BIOLÓGICAS NA EUROPA
PTDC/AAG-GLO/0463/2014
Universidade de Évora, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2017/11/17 - 2019/05/16 Characterizing and monitoring cashew economically important diseases in West Africa as a prospective measure for sustainable production: a case study on Guinea-Bissau
PTDC/AGR-PRO/5727/2014
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Ongoing
2012/02/01 - 2015/07/31 CAJU - Cashew in West-Africa: socioeconomic and environmental challenges of an expanding cash crop
PTDC/AFR/117785/2010
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal

Universidade do Porto Instituto de Ciências Tecnologias e Agroambiente, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2013/07 - 2015/07 ECOLOGICALLY SCALED EDGE RESPONSES: PATTERNS, MECHANISMS AND PREDICTIVE MODELLING
PTDC/BIA-BIC/2203/2012
Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal

Universidade do Porto Instituto de Ciências Tecnologias e Agroambiente, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2011/01/01 - 2013/12/31 Strategic Project - UI 4028 - 2011-2012
PEst-OE/CTE/UI4028/2011
Associação do Instituto Superior Técnico para a Investigação e Desenvolvimento, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal

Centro de Recursos Naturais e Ambiente, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2010/02/01 - 2013/07/31 Maerua - Motivações e resultados da Missão Botânica de Moçambique
HC/0046/2009
Universidade do Porto Instituto de Ciências Tecnologias e Agroambiente, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2009/03/01 - 2012/12/31 Biogeoquimica do ouro: da prospecção biogeoquimica à fitomineração
PTDC/CTE-GEX/66710/2006
Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal

Universidade de Coimbra, Portugal

Universidade de Coimbra Centro de Geociências, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
Outputs

Publications

Book
  1. Sérgio, Cecília; Sim-Sim, Manuela; Figueira, Rui. Quantificação da deposição de metais pesados em Portugal, através da análise de briófitos.. Lisboa, Portugal: DGQA. 1993.
    Published
Book chapter
  1. Costa, J. Miguel; Carvalho, Luísa; Figueira, Rui; Shimono, Hiroyuki; Marques da Silva, Jorge. "Molecular, Morpho-Functional, and Agronomic Phenotyping Tools for Grapevine Selection and Breeding". In Plant Speed Breeding and High-throughput Technologies, 294-317. CRC Press, 2024.
    10.1201/b23372-15
  2. Figueira, Rui; Lages, Fernanda; Figueira, R.; Lages, F.. "Museum and Herbarium Collections for Biodiversity Research in Angola". In Biodiversity of Angola, 513-542. Springer International Publishing, 2019.
    10.1007/978-3-030-03083-4_19
  3. Sérgio, Cecília; Figueira, Rui; Menezes, Rui; Tuba, Zoltan; Slack, Nancy G.; Stark, Lloyd R.. "Modeling the Distribution of Sematophyllum substrumulosum (Hampe) E. Britton as a Signal of Climatic Changes in Europe". In Bryophyte Ecology and Climate Change, 427-440. Cambridge University Press, 2011.
    10.1017/cbo9780511779701.022
  4. Sérgio, Cecilia; Sim-Sim, Maria; Fontinha, Susana; Figueira, Rui. "The bryophytes (Bryophyta) of the Madeira and Selvagens archipelagos.". In A list of the terrestrial fungi, flora and fauna of Madeira and Selvagens archipelagos., edited by Borges, P.A.V., Abreu, C., Aguiar, A.M.F., Carvalho, P., Jardim, R., Melo, I., Oliveira, P., Sérgio, C., Serrano, A.R.M., 123-142. angra do heroismo, Portugal: Direcção Regional do Ambiente da Madeira and Universidade dos Açores, Funchal and Angra do Heroísmo., 2008.
    Published
  5. Sergio, Cecilia; Sim-Sim, Maria; Fontinha, Susana; Figueira, Rui. "List of bryophytes (Bryophyta).". In A list of the terrestrial fungi, flora and fauna of Madeira and Selvagens archipelagos., edited by Borges, Paulo A. V., Abreu, Cristina, Aguiar Franquinho, A.M., Carvalho,P., Jardim, R., Melo, I., Oliveira, P., et al., 143-156. angra heroismo, Portugal: Direcção Regional do Ambiente da Madeira and Universidade dos Açores, Funchal and Angra do Heroísmo., 2008.
    Published
  6. Sérgio, Cecília; Sim-Sim, Manuela; Fontinha, Susana; Figueira, Rui. "Os briófitos (Bryophyta) dos arquipélagos da Madeira e das Selvagens/ The bryophytes (Bryophyta) of the Madeira and Selvagens archipelagos". In Listagem dos fungos, flora e fauna terrestres dos arquipélagos da Madeira e Selvagens, 123-141. Portugal: Direcção Regional do Ambiente da Madeira and Universidade dos Açores, Funchal and Angra do Heroísmo, 2008.
    Published
Conference abstract
  1. Marie-Elise Lecoq; Anne-Sophie Archambeau; Rui Figueira; David Martin; Sophie Pamerlon; Tim Robertson; Régine Vignes Lebbe; Cristina Villaverde. "The Living Atlases Community of Practice". 2019.
    10.3897/biss.3.35779
  2. Villaverde, Cristina; Lecoq, Marie-Elise; Martin, David; Figueira, Rui; Robertson, Tim; García, Katia Cezón; Pamerlon, Sophie; Vignes Lebbe, Régine. "Improving The Documentation For End Users Of Living Atlases Around The World". 2019.
    10.3897/biss.3.37071
Conference paper
  1. Paulo Branco; Florian Borgwardt; Jesse O’Hanley; Rui Figueira; Gonçalo Duarte; José Maria Santos; Pedro Segurado; Tamara Leite; Maria T. Ferreira. "Dammed Fish: Impact of Structural and Functional River Network Connectivity Losses on Fish Biodiversity—Optimizing Management Solutions". 2022.
    10.3390/blsf2022013119
  2. Patinha, Carla; Reis, Amélia; Silva, Eduardo Ferreira da; Dias, Ana; Bartolomeu, Sofia; Sousa, António; Cachada, Anabela; et al. "Introducing "UrbanEnviron@Lisbon 2008" a GIS-platform for environmental and human health data management". 2011.
  3. Reis, Amélia; Patinha, Carla; Silva, Eduardo Ferreira da; Dias, Ana; Bartolomeu, Sofia; Sousa, António; Cachada, Anabela; et al. "Environmental assessment of Ni and Cd in topsoil and ground-level dust from urban playgrounds, public gardens and parks from Lisbon, Portugal". 2011.
  4. Draper, David; Figueira, Rui; Sérgio, Cecília; Menezes, Rui; Sousa, AJ; Silva, A.. "Predicting bryophytes distribution for conservation purposes: Use of Ecological Niche Factor Analysis, Kriging with External Drift and GIS for Habitat characterization". Paper presented in GIS PLANET 2005, Estoril, 2005.
    Published
  5. Figueria, R.; Pacheco, A.M.G.; Sousa, A.J.; Branquinho, C.; Catarino, F.. "First studies in assessing cryptogamic epiphytes as biomonitors of sea-salt deposition density". 1995.
Conference poster
  1. Catarino, Sílvia; Romeiras, Maria; Pereira, José Miguel Cardoso; Figueira, Rui. "Assessing the conservation of Miombo timber species in Angola". Paper presented in Encontro Ciência 2022, 2022.
  2. Catarino, Silvia; Romeiras, Maria; Figueira, Rui; Aubard, Valentine; Silva, João; Pereira, José M. C.. "Spatial and Temporal Trends of Burnt Area in Angola.". Paper presented in Encontro Ciência 2021, Lisbon, Portugal., 2021.
  3. Carvalho, Palmira; Figueira, Rui; López de Silanes, María Eugenia; Paz-Bermúdez, Graciela; Marques, Joana; Álvarez, Josefina. "Preliminary checklist of lichens and lichenicolous fungi of Portugal". Paper presented in XXII Symposium of Cryptogamic Botany, Lisbon (Portugal), 2019.
  4. Catarino, Sílvia; Figueira, Rui; Pereira, José M. C.; Costa, Esperança; Romeiras, Maria M.. "Assessing the potential distribution of native trees in Angola as a tool for conservation planning". Paper presented in X Conferência Científica da UEM. Maputo., 2018.
  5. Monteiro, Filipa; Catarino, Luís; Balde ,Aladje; Duarte, Maria Cristina; Figueiredo, Andreia ; Diniz, Inês; Pena, Ana Rita ; et al. "Disease assessment and modelling for sustainable production as a prospective measure of cashew in Guinea-Bissau". Paper presented in 4th Annual Conference, “Actions for a Sustainable World: from theory to practice” (ISDRS 2018), 2018.
  6. Frazão, Raquel; Catarino, Sílvia; Figueira, Rui; Magalhães, M. Filomena; Romeiras, Maria M.. "Species richness and endemism of the genus Euphorbia (family Euphorbiaceae) in Angola". Paper presented in European Meeting of Phytosociology, Biogeography and Syntaxonomy of the Atlantic Regions. Praia, Cabo Verde., 2017.
  7. Catarino, Sílvia; Figueira, Rui; Pereira, José M. C.; Romeiras, Maria M.. "Patterns of diversity between Leguminosae timber species from tropical wet and dry forests of Angola". Paper presented in Phytosociology, Biogeography and Syntaxonomy of the Eastern Atlantic Regions. Praia, Cabo Verde., 2017.
  8. Romeiras, Maria M.; Costa, José C. P.; Figueira, Rui; Duarte, Maria C.; Arsénio, Pedro; Catarino, Luís; Catarino, Sílvia; et al. "Flora and Vegetation of African Portuguese-speaking countries: the long-term collaborations and scientific legacy of the University of Lisbon". Paper presented in European Meeting of Phytosociology, Biogeography and Syntaxonomy of the Atlantic Regions. Praia, Cabo Verde., 2017.
  9. Carvalho, Rita; Elsa, Silva; Figueira, Rui; Ramos, Ana Paula; Talhinhas, Pedro. "Inventariação das espécies de Pucciniales em Portugal.". Paper presented in 2º Simpósio SCAP de Proteção das Plantas; 8º Congresso da Sociedade Portuguesa de Fitopatologia e 11º Encontro Nacional de Proteção Integrada, 2017.
  10. Catarino, Luís; Figueira, Rui; ana isabel correia; joana A. Abreu; Sousa, Filipe; dulce ferreira; joão tavares; et al. "Valuing and giving access to the botanical collections of Angola: The IMBAMBA project". Paper presented in Iº Encontro Nacional sobre a Flora e Vegetação de Angola, 2011.
  11. Catarino, Luís; Figueira, Rui; Ana Isabel Vasconcelos Dias Correia; Abreu, Joana A.; Silva, M. Inês; Filipe de Portugal da Silveira Teixeira de Sousa; Ferreira, Dulce; et al. "Valorização e acesso às colecções botânicas de Angola - o projecto IMBAMBA". Paper presented in I.° Encontro Nacional sobre a Flora e Vegetação de Angola, 2011.
  12. Sérgio, Cecília; Figueira, Rui; Menezes, Rui; Sousa, AJ; Draper, David. "Contribution of herbarium collection data to model bryophyte distribution in Portugal based on ecological information". Paper presented in Bryoplanet 2005, 2005.
Journal article
  1. Benali, Akli; Baldassarre, Giuseppe; Loureiro, Carlos; Briquemont, Florian; Fernandes, Paulo M.; Rossa, Carlos; Figueira, Rui. "A Near-Real-Time Operational Live Fuel Moisture Content (LFMC) Product to Support Decision-Making at the National Level". Fire 8 5 (2025): 178. https://doi.org/10.3390/fire8050178.
    10.3390/fire8050178
  2. Mameri, Daniel; Duarte, Gonçalo; Cabo, João; Figueira, Rui; Segurado, Pedro; Santos, J.M.; Ferreira, Maria Teresa; Branco, Paulo. "Fishspotting: freshwater fish species presence in European river basins – RivFISH database". Knowledge & Management of Aquatic Ecosystems 426 (2025): 7. https://doi.org/10.1051/kmae/2025002.
    Published • 10.1051/kmae/2025002
  3. João Canilho Santos; Paula Paes; Pedro Arsénio; Rui Figueira; José Carlos Costa; Margarida Dionísio Lopes; Helena Cotrim; Dalila Espírito-Santo. "The Marine Macroalgae Collection from Herbarium João de Carvalho e Vasconcellos (LISI)—140 Years of History". Diversity (2024): https://doi.org/10.3390/d16080478.
    10.3390/d16080478
  4. SÉRGIO, CECÍLIA; SIM-SIM, MANUELA; GARCIA, CÉSAR AUGUSTO; PORLEY, RONALD; FIGUEIRA, RUI. "A morphological-taxonomic study of Frullania calcarifera Steph. (Frullaniaceae) in Portugal". Bryophyte Diversity and Evolution 47 1 (2024): 159-170. https://doi.org/10.11646/bde.47.1.11.
    10.11646/bde.47.1.11
  5. Quentin Groom; Mathias Dillen; Wouter Addink; Arturo H. Ariño; Christian Bölling; Pierre Bonnet; Lorenzo Cecchi; et al. "Envisaging a global infrastructure to exploit the potential of digitised collections". Biodiversity Data Journal (2023): https://doi.org/10.3897/BDJ.11.e109439.
    10.3897/BDJ.11.e109439
  6. Tainan Messina; Rui Figueira; José M.L. Santos. "Integrating local and ecological knowledge to assess the benefits of trees for ecosystem services: A holistic process-based methodology". Ecosystem Services (2023): https://doi.org/10.1016/j.ecoser.2023.101556.
    10.1016/j.ecoser.2023.101556
  7. Catarino, S.; Goyder, D.; Darbyshire, I.; Costa, E.; Figueira, R.; Duarte, M.C.; Romeiras, M.M.. "Species Diversity and Endemicity in the Angolan Leguminosae Flora". Frontiers in Ecology and Evolution 10 (2022): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85129339862&partnerID=MN8TOARS.
    10.3389/fevo.2022.871261
  8. Catarino, S.; Romeiras, M.M.; Pereira, J.M.C.; Figueira, R.. "Assessing the conservation of Miombo timber species through an integrated index of anthropogenic and climatic threats". Ecology and Evolution (2021): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85108251037&partnerID=MN8TOARS.
    10.1002/ece3.7717
  9. Silvia Catarino; Maria Manuel Romeiras; Rui Figueira; Valentine Aubard; João M. N. Silva; José M. C. Pereira. "Spatial and Temporal Trends of Burnt Area in Angola: Implications for Natural Vegetation and Protected Area Management". Diversity 12 8 (2020): 307-307. https://doi.org/10.3390/d12080307.
    10.3390/d12080307
  10. Miguel Monteiro; Luís Reino; Anna Schertler; Franz Essl; Rui Figueira; Maria Ferreira; César Capinha; et al. "A database of the global distribution of alien macrofungi". Biodiversity Data Journal 8 (2020): 1-13. https://doi.org/10.3897/BDJ.8.e51459.
    10.3897/BDJ.8.e51459
  11. Talhinhas, P.; Carvalho, R.; Figueira, R.; Ramos, A.P.. "An annotated checklist of rust fungi (pucciniales) occurring in Portugal". Sydowia 71 (2020): 65-84. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85082196711&partnerID=MN8TOARS.
    10.12905/0380.sydowia71-2019-0065
  12. Hardisty, Alex R.; Michener, William K.; Agosti, Donat; Alonso García, Enrique; Bastin, Lucy; Belbin, Lee; Bowser, Anne; et al. "The Bari Manifesto: An interoperability framework for essential biodiversity variables". Ecological Informatics 49 (2019): 22-31. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecoinf.2018.11.003.
    10.1016/j.ecoinf.2018.11.003
  13. Reino, Luís; Triviño, María; Beja, Pedro; Araújo, Miguel B.; Figueira, Rui; Segurado, Pedro. "Modelling landscape constraints on farmland bird species range shifts under climate change". Science of The Total Environment 625 (2018): 1596-1605. http://dx.doi.org/10.1016/j.scitotenv.2018.01.007.
    10.1016/j.scitotenv.2018.01.007
  14. Silva, A.S.; Groz, M.P.; Leandro, P.; Assis, C.A.; Figueira, R.. "Ichthyological collection of the museu oceanográfico D. Carlos I". ZooKeys 2018 752 (2018): 137-148. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85046156486&partnerID=MN8TOARS.
    10.3897/zookeys.752.20086
  15. Luís Reino; Rui Figueira; Pedro Beja; Miguel B. Araújo; César Capinha; Diederik Strubbe. "Networks of global bird invasion altered by regional trade ban". Science Advances 3 11 (2017): e1700783-e1700783. https://doi.org/10.1126/sciadv.1700783.
    10.1126/sciadv.1700783
  16. Cardador, Laura; Lattuada, Matteo; Strubbe, Diederik; Tella, José L.; Reino, Luís; Figueira, Rui; Carrete, Martina. "Regional Bans on Wild-Bird Trade Modify Invasion Risks at a Global Scale". Conservation Letters 10 6 (2017): 717-725. http://dx.doi.org/10.1111/conl.12361.
    10.1111/conl.12361
  17. Sosef, M.S.M.; Dauby, G.; Blach-Overgaard, A.; van der Burgt, X.; Catarino, L.; Damen, T.; Deblauwe, V.; et al. "Exploring the floristic diversity of tropical Africa". BMC Biology 15 1 (2017): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85014600196&partnerID=MN8TOARS.
    10.1186/s12915-017-0356-8
  18. Mori, E.; Grandi, G.; Menchetti, M.; Tella, J.L.; Jackson, H.A.; Reino, L.; van Kleunen, A.; Figueira, R.; Ancillotto, L.. "Worldwide distribution of non–native Amazon parrots and temporal trends of their global trade | Distribución en el mundo de los loros introducidos del género Amazona y tendencias temporales de su comercio a escala mundial". Animal Biodiversity and Conservation 40 1 (2017): 49-62. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85008967676&partnerID=MN8TOARS.
    10.32800/abc.2017.40.0049
  19. Monteiro, M.; Figueira, R.; Melo, M.; Mills, M.S.L.; Beja, P.; Bastos-Silveira, C.; Ramos, M.; et al. "The collection of birds from mozambique at the instituto de investigação científica tropical of the university of Lisbon (Portugal)". ZooKeys 2017 708 (2017): 139-152. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85032012559&partnerID=MN8TOARS.
    10.3897/zookeys.708.13351
  20. Dauby, G.; Zaiss, R.; Blach-Overgaard, A.; Catarino, L.; Damen, T.; Deblauwe, V.; Dessein, S.; et al. "RAINBIO: A mega-database of tropical African vascular plants distributions". PhytoKeys 74 1 (2016): 1-18. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85000501050&partnerID=MN8TOARS.
    10.3897/phytokeys.74.9723
  21. Monteiro, M.; Reino, L.; Melo, M.; Beja, P.; Bastos-Silveira, C.; Ramos, M.; Rodrigues, D.; et al. "The collection of birds from são tomé and príncipe at the instituto de investigação científica tropical of the university of lisbon (Portugal)". ZooKeys 2016 600 (2016): 155-167. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84976330778&partnerID=MN8TOARS.
    10.3897/zookeys.600.7899
  22. Temudo, M.P.; Figueira, R.; Abrantes, M.. "Landscapes of bio-cultural diversity: shifting cultivation in Guinea-Bissau, West Africa". Agroforestry Systems 89 1 (2015): 175-191. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84921895958&partnerID=MN8TOARS.
    10.1007/s10457-014-9752-z
  23. Rodrigues, P.; Figueira, R.; Vaz Pinto, P.; Araújo, M.B.; Beja, P.. "A biogeographical regionalization of Angolan mammals". Mammal Review 45 2 (2015): 103-116. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84925341853&partnerID=MN8TOARS.
    10.1111/mam.12036
  24. Piairo, Helena; Menezes, Raquel; Sousa, Inês; Figueira, Rui; Sérgio, Cecília. "Spatial modeling of factor analysis scores". Environmental Science and Pollution Research 21 23 (2014): 13420-13433. http://dx.doi.org/10.1007/s11356-014-3125-z.
    10.1007/s11356-014-3125-z
  25. Conde, Patrícia; Figueira, Rui; Saraiva, Susana; Catarino, Luís; Romeiras, Maria; Duarte, Maria Cristina. "A Missão Botânica de Moçambique (1942-1948): contribuições para o conhecimento da flora medicinal de Moçambique". História, Ciências, Saúde-Manguinhos 21 2 (2014): 539-585. http://dx.doi.org/10.1590/s0104-59702014000200007.
    10.1590/s0104-59702014000200007
  26. Conde, P.; Figueira, R.; Saraiva, S.; Catarino, L.; Romeiras, M.; Duarte, M.C.. "The Botanic Mission to Mozambique (1942-1948): Contributions to knowledge of the medicinal flora of Mozambique | A Missão Botânica de Moçambique (1942-1948): Contribuições para o conhecimento da flora medicinal de Moçambique". Historia, Ciencias, Saude - Manguinhos 21 2 (2014): 539-585. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84904410090&partnerID=MN8TOARS.
    10.1590/S0104-59702014000200007
  27. Romeiras, M.M.; Figueira, R.; Duarte, M.C.; Beja, P.; Darbyshire, I.. "Documenting biogeographical patterns of African timber species using herbarium records: A conservation perspective based on native trees from Angola". PLoS ONE 9 7 (2014): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84904863144&partnerID=MN8TOARS.
    10.1371/journal.pone.0103403
  28. Sérgio, C.; Garcia, C.A.; Vieira, C.; Hespanhol, H.; Sim-Sim, M.; Stow, S.; Figueira, R.. "Conservation of Portuguese red-listed bryophytes species in Portugal: Promoting a shift in perspective on climate changes". Plant Biosystems 148 4 (2014): 837-850. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84922216414&partnerID=MN8TOARS.
    10.1080/11263504.2014.949329
  29. Monteiro, M.; Reino, L.; Beja, P.; Mills, M.S.L.; Bastos-Silveira, C.; Ramos, M.; Rodrigues, D.; et al. "The collection and database of Birds of Angola hosted at IICT (Instituto de Investigação Científica Tropical), Lisboa, Portugal". ZooKeys 387 (2014): 89-99. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84896840533&partnerID=MN8TOARS.
    10.3897/zookeys.387.6412
  30. Catarino, L.; Martins, E.S.; Abreu, J.A.; Figueira, R.. "Revision of the family Dipterocarpaceae in Angola". Blumea: Journal of Plant Taxonomy and Plant Geography 57 3 (2013): 263-274. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84875750890&partnerID=MN8TOARS.
    10.3767/000651913X664892
  31. Abreu, J.A.; Figueira, R.; Silva, M.I.; Martins, E.; Catarino, L.; Cardoso, J.F.. "Updates on the distribution of Capparaceae and Cleomaceae endemic to Angola". Biodiversity of Angola 50 (2013): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84906706331&partnerID=MN8TOARS.
  32. Martins, A.; Figueira, R.; Sousa, A.J.; Sérgio, C.. "Spatio-temporal patterns of Cu contamination in mosses using geostatistical estimation". Environmental Pollution 170 (2012): 276-284. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84864337858&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.envpol.2012.07.004
  33. Harmens, H.; Ilyin, I.; Mills, G.; Aboal, J.R.; Alber, R.; Blum, O.; Coskun, M.; et al. "Country-specific correlations across Europe between modelled atmospheric cadmium and lead deposition and concentrations in mosses". Environmental Pollution 166 (2012): 1-9. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84860491968&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.envpol.2012.02.013
  34. Matos, P.; Cardoso-Vilhena, J.; Figueira, R.; Sousa, A.J.. "Effects of salinity stress on cellular location of elements and photosynthesis in Ramalina canariensis Steiner". Lichenologist 43 2 (2011): 155-164. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-79957524967&partnerID=MN8TOARS.
    10.1017/S0024282910000757
  35. Hespanhol, H.; Séneca, A.; Figueira, R.; Sérgio, C.. "Microhabitat effects on bryophyte species richness and community distribution on exposed rock outcrops in Portugal". Plant Ecology and Diversity 4 2-3 (2011): 251-264. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84856202153&partnerID=MN8TOARS.
  36. Luis, L.; Bergamini, A.; Figueira, R.; Sim-Sim, M.. "Riparian bryophyte communities on Madeira: Patterns and determinants of species richness and composition". Journal of Bryology 32 1 (2010): 32-45. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-77949510096&partnerID=MN8TOARS.
    10.1179/037366810X12578498135751
  37. Hespanhol, H.; Séneca, A.; Figueira, R.; Sérgio, C.. "Bryophyte-environment relationships in rock outcrops of North-western Portugal: The importance of micro and macro-scale variables". Cryptogamie, Bryologie 31 2 (2010): 147-161. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-77952381671&partnerID=MN8TOARS.
  38. Reis, A.P.; Patinha, C.; Ferreira Da Silva, E.; Sousa, A.; Figueira, R.; Sérgio, C.; Novais, V.. "Assessment of human exposure to environmental heavy metals in soils and bryophytes of the central region of Portugal". International Journal of Environmental Health Research 20 2 (2010): 87-113. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-77949419160&partnerID=MN8TOARS.
    10.1080/09603120903394649
  39. Holy, M.; Pesch, R.; Schröder, W.; Harmens, H.; Ilyin, I.; Alber, R.; Aleksiayenak, Y.; et al. "First thorough identification of factors associated with Cd, Hg and Pb concentrations in mosses sampled in the European Surveys 1990, 1995, 2000 and 2005". Journal of Atmospheric Chemistry 63 2 (2009): 109-124. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-77955978973&partnerID=MN8TOARS.
    10.1007/s10874-010-9160-3
  40. Figueira, R.; Tavares, P.C.; Palma, L.; Beja, P.; Sérgio, C.. "Application of indicator kriging to the complementary use of bioindicators at three trophic levels". Environmental Pollution 157 10 (2009): 2689-2696. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-68049091011&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.envpol.2009.05.001
  41. Sérgio, C.; Figueira, R.; Draper, D.; Menezes, R.; Sousa, A.J.. "Modelling bryophyte distribution based on ecological information for extent of occurrence assessment". Biological Conservation 135 3 (2007): 341-351. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-33846038824&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.biocon.2006.10.018
  42. Figueira, R.; Sérgio, C.; Lopes, J.L.; Sousa, A.J.. "Detection of exposition risk to arsenic in Portugal assessed by air deposition in biomonitors and water contamination". International Journal of Hygiene and Environmental Health 210 3-4 (2007): 393-397. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-34247378192&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.ijheh.2007.01.003
  43. Figueira, R.; Ribeiro, T.. "Transplants of aquatic mosses as biomonitors of metals released by a mine effluent". Environmental Pollution 136 2 (2005): 293-301. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-17444419032&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.envpol.2005.01.003
  44. Figueira, R.; Sérgio, C.; Sousa, A.J.. "Distribution of trace metals in moss biomonitors and assessment of contamination sources in Portugal". Environmental Pollution 118 1 (2002): 153-163. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0036007798&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/S0269-7491(01)00203-2
  45. Figueira, R.; Pacheco, A.M.G.; Sousa, A.J.; Catarino, F.. "Development and calibration of epiphytic lichens as saltfall biomonitors - Dry-deposition modelling". Environmental Pollution 120 1 (2002): 69-78. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0035989658&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/S0269-7491(02)00129-X
  46. Sérgio, Cecília; Carvalho, Palmira; Figueira, Rui. "Dados sobre os briófitos epifíticos no Litoral Alentejano". Portugaliae Acta Biologica 20 (2002): 75-85.
    Published
  47. Figueira, R.; Sousa, A.J.; Pacheco, A.M.G.; Catarino, F.. "Use of secondary information in space-time statistics for biomonitoring studies of saline deposition". Environmetrics 12 3 (2001): 203-217. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0035026223&partnerID=MN8TOARS.
    10.1002/env.457
  48. Pacheco, A.M.G.; Freitas, M.C.; Barros, L.I.C.; Figueira, R.. "Investigating tree bark as an air-pollution biomonitor by means of neutron activation analysis". Journal of Radioanalytical and Nuclear Chemistry 249 2 (2001): 327-331. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0034880345&partnerID=MN8TOARS.
    10.1023/A:1013293814789
  49. Sérgio, C.; Figueira, R.; Viegas Crespo, A.M.. "Observations of heavy metal accumulation in the cell walls of Fontinalis antipyretica, in a Portuguese stream affected by mine effluent". Journal of Bryology 22 4 (2000): 251-255. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-17144469253&partnerID=MN8TOARS.
  50. Figueira, R.; Sousa, A.J.; Pacheco, A.M.G.; Catarino, F.. "Saline variability at ground level after kriging data from Ramalina spp. biomonitors". Science of the Total Environment 232 1-2 (1999): 3-11. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0032767169&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/S0048-9697(99)00104-7
  51. Figueira, R.; Sousa, A.J.; Brown, D.H.; Catarino, F.; Pacheco, A.M.G.. "Natural levels of saline elements in lichens: Determination of cellular fractions and their importance as saline tracers". Lichenologist 31 2 (1999): 183-196. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0033103294&partnerID=MN8TOARS.
    10.1006/lich.1998.0179
Online resource
  1. Mameri, Daniel; Duarte, Gonçalo; Cabo, João; Figueira, Rui; Segurado, Pedro; Santos, José Maria; Ferreira, Maria Teresa. RivFISH - An European database on fish species presence across river basins. 2024. https://zenodo.org/records/13848977.
    zenodo.13848977
  2. Catarino, Silvia; Romeiras, Maria M.; Pereira, José M. C.; Figueira, Rui. Transcription of selected miombo timber species of a floristic inventory in Cuando-Cubango, Angola.. 2021. https://doi.org/10.15468/qheeb2.
    10.15468/qheeb2
  3. Catarino, Silvia; Romeiras, Maria; Pereira, José M. C.; Figueira, Rui. Database of species occurrence records from: Catarino S., Romeiras M.M., Pereira J.M.C., & Figueira R. (2021) Assessing the conservation of Miombo timber species through an integrated index of anthropogenic and climatic threats. [Data set]. Ecology and Evolution.. 2021. http://doi.org/10.5281/zenodo.4752197.
    10.5281/zenodo.4752197
Report
  1. Mameri, Daniel; Duarte, Gonçalo; Cabo, João; Figueira, Rui; Segurado, Pedro; Santos, José Maria; Ferreira, Teresa; Branco, Paulo. 2025. RivFISH Maps – Presence of freshwater fish species in European river basins. https://zenodo.org/records/14884103.
    10.5281/zenodo.13891163
  2. Hardy, Helen; Koivunen, Anne; Groom, Quentin; Berger, Frederik; Gierce, Peter; Von Mering, Sabine; Figueira, Rui; Arsénio, Pedro; Cartaxana, Alexandra. 2021. Milestone 3.4 - Proposed Content for a DiSSCo Digital Maturity Tool. http://hdl.handle.net/10400.5/27084.
  3. Hardy, Helen; Koivunen, Anne; Groom, Quentin; Mergen, Patricia; Berger, Frederik; Giere, Peter; von Mering, Sabine; et al. 2021. Deliverable 3.1 Summary Insights and Recommendations on DiSSCo Competencies and Digital Maturity. http://hdl.handle.net/10400.5/27061.
  4. Hardy, Helen; Koivunen, Anne; Groom, Quentin; Huybrechts, Pieter; Mergen, Patricia; Berger, Frederik; Giere, Peter; et al. 2021. Milestone 3.3 - DiSSCo Capabilities ¿ Additional Case Studies & Analysis. http://hdl.handle.net/10400.5/27082.
  5. Hardy, Helen; Koivunen, Anne; Groom, Quentin; Berger, Frederik; Figueira, Rui; Arsénio, Pedro; Cartaxana, Alexandra. 2021. Milestone 3.2 - DiSSCo Digital Maturity Self -Assessment Tool - Design Blueprint. http://hdl.handle.net/10400.5/27080.
  6. Helen Hardy; Koivunen, A; Groom, Quentin; Patricia Mergen; Frederik Berger ; Figueira, Rui; Arsénio, Pedro; Cartaxana, Alexandra. 2021. DiSSCo Prepare Milestone report MS3.2 "DiSSCo Digital Maturity Self-Assessment Tool - Design Blueprint". https://know.dissco.eu/bitstream/item/159/1/DPP_WP3_MS3.3_DiSSCo%20Capabilities%20%E2%80%93%20Additional%20Case%20Studies%20%26%20Analysis%20%281%29.pdf.
    https://doi.org/10.34960/q1mz-zf45
  7. Hardy, Helen; Koivunen, A; Groom, Quentin; Mergen, Patricia; Berger, Frederik; Figueira, Rui; Arsénio, Pedro; Cartaxana, A. 2021. DiSSCo Prepare Milestone report MS3.1 "Improving Digital Capability - Case Studies & Analysis".
    https://doi.org/10.34960/w8f3-h851
  8. Helen Hardy; Koivunen, Anne; Groom, Quentin; Mergen, Patricia; Berger, Frederik; Figueira, Rui; Arsénio, Pedro; Cartaxana, Alexandra. 2021. DiSSCo Prepare Milestone report MS3.3 "DiSSCo Capabilities - Additional Case Studies & Analysis".
    10.34960/aph7-rf10
  9. Hardy, Helen; Koivunen, Anne; Groom, Quentin; Mergen, Patricia; Berger, Frederik; Figueira, Rui; Arsénio, Pedro; A Cartaxana. 2021. DiSSCo Prepare Milestone report MS3.4 "Proposed Content for a DiSSCo Digital Maturity Tool".
    10.34960/3a39-b979
  10. Hardy, Helen; Koivunen, Anne; Groom, Quentin; Mergen, Patricia; Berger, Frederik; Giere, Peter; von Mering, Sabine; et al. 2021. DiSSCo Prepare Deliverable D3.1 "Summary Insights and Recommendations on DiSSCo Competencies and Digital Maturity". https://know.dissco.eu/handle/item/249.
    10.34960/3pc3-pp32
  11. Cunha, Ana Raquel; Arsénio, Pedro; Figueira, Rui. 2021. LISI Herbarium Digitization Workflow, version 1.0. https://github.com/PORBIOTA/ISA_DMP/blob/main/LISI_DigitizationWorkflow.pdf.
Website
  1. Figueira, Rui. Portal de Dados de Biodiversidade de Portugal - GBIF.pt. 2016. http://dados.gbif.pt.
  2. Figueira, Rui. Portal do Nó Português do GBIF. 2013. http://www.gbif.pt.
  3. Figueira, Rui. Catálogo de Coleções Biológicas do Jardim Botânico Tropical - IICT. 2012. http://colecoes.iict.ulisboa.pt/.
  4. Figueira, Rui. Portal Biomonitor. 2002. http://biomonitor.ist.utl.pt/biomonitor/.
Working paper
  1. Santana, Joana; Reino, Luís; Marcolin, Fabio; Sol, Daniel; Figueira, Rui; Capinha, César; Ducatez, Simon; Vall-llosera, Miquel. 2023. "From the jungle to the cage: why some species become targets for bird trade".

Other

Dataset
  1. Figueira, Rui. IICT Herbário LISC. https://www.gbif.org/dataset/231c5bcf-1b56-4905-a398-6d0e18f6de1a#description.
  2. Figueira, Rui. Bibliographic records of Angola mammals. https://www.gbif.org/dataset/2fea4042-5aba-4cda-bab9-adcfa2bbe97d.
  3. Figueira, Rui. IICT Colecção Zoológica. https://www.gbif.org/dataset/c690c2b5-8002-4d12-831c-9258dd618f78.
  4. Figueira, Rui. Checklist of rust fungi (Pucciniales) occurring in Portugal. https://www.gbif.org/dataset/fc5d3109-95a2-47ae-8bfd-1667fc2b12cc#description.
  5. Figueira, Rui. Occurrence records of rust fungi (Pucciniales) in Portugal. https://www.gbif.org/dataset/651c0bec-bd78-4300-bbb0-5ed172fc82af.
  6. Figueira, Rui. Ichthyological Collection of the Museu Oceanográfico D. Carlos I. https://www.gbif.org/dataset/6005f3b4-da6a-4d88-ac92-81f2e950eb24#description.
  7. Figueira, Rui. Ornithological Collection of the Museu Oceanográfico D. Carlos I. https://www.gbif.org/dataset/49576930-4b51-441e-9f4c-b20a4045e882.
  8. Figueira, Rui. EDP Baixo Sabor: Herpetology – Baseline Studies [2009]. https://www.gbif.org/dataset/611aea9f-9c55-4404-ac36-0d82c0b9edf9#description.
  9. Figueira, Rui. EDP Foz Tua: Arthropoda – Environmental Impact Assessment [2006-2008. https://www.gbif.org/dataset/85a3c886-3312-45c9-b040-4d7634653246.
  10. Figueira, Rui. Benthic marine diatoms from French coastal and transitional waters.
    10.15468/BYYHXU
  11. João Canilho Santos; Paula Paes; Pedro Arsénio; Figueira, Rui; José Carlos Costa; M.D. Lopes; Cotrim H, Cotrim, HM, Cotrim HMC, Cotrim HC; Maria Dalila Espírito Santo. Marine Macroalgae collection dataset from Herbarium João de Carvalho e Vasconcellos (LISI). 2023.
    10.15468/p7quz5
  12. Arsénio, Pedro; Cunha, Ana Raquel; Paes, Ana Paula; Vasconcelos, Teresa; Figueira, Rui. Herbário João de Carvalho e Vasconcellos, I.S.A./U.L.. https://www.gbif.org/installation/33f40aac-2870-454e-b8f4-9958e761d826. 2021.
    10.15468/olfpjv
Other output
  1. O contributo do Jardim Botânico de Lisboa para a Estratégia Global para a Conservação de Plantas (2003-2009). 2010. Martins-Loução, Maria Amélia; Sérgio, Cecilia; Melo, Ireneia; Correia, Ana Isabel; Escudeiro, Alexandra; Barata, Ana Raquel; SimSim, Manuela; et al. http://hdl.handle.net/10451/4052.
    El Botânico. Revista da AIMJB/Revista de la AIMJB. julio/julho 2010. 10-11
  2. Brotero, Herbaria Information System, Version 1.0.1.2., NET C#, J. Casa and FFCUL, Lisbon. 2005. Casa, João; Carvalho, Palmira; Figueira, Rui; Sérgio, Cecília; Calaim, João. http://brotero.politecnica.ul.pt/broteroonline.
Activities

Supervision

Thesis Title
Role
Degree Subject (Type)
Institution / Organization
2018 - Current Mapeando o (des)conhecido: a memória de uma coleção enquanto reflexo da investigação botânica colonial na Universidade do Porto
Co-supervisor
História e Filosofia das Ciências (PhD)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2023 - 2024/04/03 Contributo para a melhoria da classificação das culturas permanentes da região do Alqueva com imagens de satélite, através de aprendizagem automática
Supervisor of Manuel Maria Maymone Martins Quintela
Engenharia Agronómica (Master)
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2023 - 2024 Preenchimento inteligente de lacunas de dados sensoriais: Aplicação de Machine Learning em Sistemas de Rega
Supervisor
Ciência de Dados em Agricultura, Alimentação, Floresta e Ambiente (Master)
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2018 - 2024 Synergies from local and ecological knowledge and the use of databases: enhancing ecosystem service assessment through holistic methodologies and multidisciplinary workflows in farmlands
Co-supervisor
Alterações Climáticas e Políticas de Desenvolvimento Sustentável (PhD)
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal

Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências Sociais e Humanas, Portugal
2017 - 2022/02/09 Conservation planning in tropical regions under climate change: a case-study of Angola flora
Co-supervisor
Biologia (PhD)
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2009 - 2011 Interpolação geoestatística de Cu em musgos usando interpolação da distribuição local
Co-supervisor
Engenharia do Ambiente (Master)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2006 - 2010 Briófitos ripícolas de ecossistemas aquáticos da Ilha da Madeira. Biodiversidade, bioindicação e conservação
Co-supervisor
Biologia (PhD)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2005 - 2010 Comunidades briofíticas saxícolas do Noroeste de Portugal Continental: Delimitação, caracterização ecológica e modelação preditiva
Co-supervisor
Biologia (PhD)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2007 - 2008 Estudo da dinâmica das comunidades epifíticas na monitorização da poluição atmosférica da zona envolvente à CTRSU da Valorsul.
Co-supervisor
Georrecursos (Master)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2005 - 2008 Biomonitorização da deposição salina e de elementos traço no Sudoeste Alentejano
Co-supervisor
Ecologia (Master)
Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal
2005 - 2007 Modelação Geoestatística da Deposição de Poluentes Atmosféricos em Sistemas de Informação Geográfica
Co-supervisor
Sistemas de Informação Geográfica (Master)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2004 - 2006 Desenvolvimento de uma metodologia de remediação ambiental: caso da mina de Sevilha
Supervisor
Georrecursos (Master)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2004 - 2006 A contribuição dos Sistemas de Informação geográfica e da Detecção Remota para a análise de dados em líquenes
Co-supervisor
Georrecursos (Master)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal

Jury of academic degree

Topic
Role
Candidate name (Type of degree)
Institution / Organization
2020 Terrestrial mammals of Mozambique: current knowledge and future challenges for conservation
(Thesis) Main arguer
Isabel Maria Queirós das Neves (PhD)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal

Universidade de Aveiro, Portugal
2015 Spatio-temporal modelling of Environmental data
(Thesis) Main arguer
Luís Manuel dos Santos de Melo Margalho (PhD)
Universidade do Minho, Portugal
2010 Bryophytes communities from rock outcrops: ecological characterization and conservation Helena Canha Pinto Hespanhol (PhD)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal

Committee member

Activity description
Role
Institution / Organization
2013/01/01 - Current Nó Nacional do GBIF
Coordinator
2013 - Current Portuguese delegate to the ESFRI Environmental Strategic Working Group
Member
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2012 - Current Portuguese delegate to the GBIF Governing Board
Member
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal

Course / Discipline taught

Academic session Degree Subject (Type) Institution / Organization
2023 - Current Projecto Hackathon de Ciência de Dados Ciência de Dados em Agricultura, Alimentação, Floresta e Ambiente (Mestrado integrado) Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2022 - Current Fundamentos da Ciência de Dados Agro-Ambientais Ciência de Dados em Agricultura, Alimentação, Floresta e Ambiente (Mestrado integrado) Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2022 - Current Gestão e armazenamento de dados Ciência de Dados em Agricultura, Alimentação, Floresta e Ambiente (Mestrado integrado) Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2022 - Current Ecoturismo e Valorização dos Recursos Naturais Gestão e Conservação de Recursos Naturais (Mestrado) Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2021 - Current Sistemas de Informação Geográfica Engenharia Agronómica (Mestrado integrado) Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2021 - 2023 Geomática Ciências de Engenharia - Engenharia do Ambiente (Licenciatura) Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2001/07/01 - 2006/02/28 Geoestatistica Engenharia dos Recursos Florestais (Mestrado) Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro, Portugal
2002/09/01 - 2005/02/28 Ecologia Enguenharia do Território (Licenciatura) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2003/09/01 - 2004/06/30 Ecotoxicologia Georrecursos (Mestrado) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal

Evaluation committee

Activity description
Role
Institution / Organization Funding entity
2024 - 2025 Working Group “Interdisciplinary Data, Information and Computing Infrastructures”, by invitation of the German Science and Humanities Council (Wissenschaftsrat – WR). Prioritization of RIs based on the scientific evaluation of digital infrastructures, based on the following dimensions: 1 - scientific potential; 2 - scientific use; 3 - relevance for Germany, Europe and globally; 4 - feasibility from a scientific perspective.
Evaluator
2021 - 2021 Member of the scientific committee on the environment for the international assessment of large-scale research infrastructures in the Czech Republic, Czech Republic – Ministry of Education, Youth and Sports
Evaluator
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal