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Currently enrolled in the Ph.D. program in Medicinal Chemistry at the University of Coimbra, with research conducted at Texas A&M University under a Fulbright Grant and FCT support. The doctoral project—Structural modulation of porphyrins for antimicrobial applications—is supervised by Prof. Mariette Pereira and co-supervised by Prof. Vanderlei Bagnato (Texas A&M University) and Prof. Miguel A.R.B. Castanho (Gulbenkian Institute for Molecular Medicine). Holds a B.Sc. in Chemistry with a specialization in Medicinal Chemistry from the University of Coimbra (2019), and an M.Sc. in Medicinal Chemistry (2021), with a thesis focused on the Development of cationic photosensitizers for photoinactivation of microorganisms, graded 19/20. Recipient of the Top 3% Best Students Award in both 2019 and 2020, as well as three merit-based scholarships: the 2024 Fulbright Grant, the 2020 FCT Summer School in Medicinal Chemistry scholarship, and a 2019 scholarship from the University of Coimbra’s Chemistry Research Center. Selected for academic mobility programs in the United States (AFS Intercultural Programs, 2012–2013) and Australia (AEN–Utrecht Network, 2018). Author/co-authored nine publications in international peer-reviewed journals and is co-inventor on one patent (PPP116946). Scientific contributions include five poster presentations—such as at the XXVI SPQ Meeting (Portugal), the International Conference on Porphyrins and Phthalocyanines, and the 14th National Organic Chemistry & 7th National Medicinal Chemistry Meeting—and seven oral communications delivered at conferences including the 18th International Photodynamic Association World Congress, the 18th International Congress on Photobiology, and the XXIX European Colloquium on Heterocyclic Chemistry. Finalist in both the first and second National SPQ Retrosynthesis Competitions, and winner of the 2023 edition. Holds advanced know-how in porphyrin synthesis, including flow chemistry techniques for scale-up, and has accumulated over 80 hours of BSL-3 laboratory experience working with viruses. Currently involved in a large-scale research project on pneumonia treatment in sheep, conducted in ABSL-2 facilities, with a focus on drug delivery methods and the application of photodynamic therapy. Completed certified training in Laboratory Animal Science (Modular Course II, 2019), with research internships undertaken at PorphyChem (Dijon, France, 2020) and the University of Heidelberg (Germany, 2021). Elected four times as Chapter Coordinator for AFS Portugal and represented the University of Coimbra at the National University Judo Championships in 2019.
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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Zoe Arcas Arnaut

Nomes de citação

  • Arnaut, Zoe A.

Identificadores de autor

Ciência ID
7613-0B52-7843
ORCID iD
0000-0002-2364-295X

Domínios de atuação

  • Ciências Exatas - Química - Química Orgânica
  • Ciências Exatas - Ciências da Computação e da Informação
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Virologia
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Microbiologia

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Português (Idioma materno)
Francês (Idioma materno)
Inglês Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2)
Formação
Grau Classificação
2021/11/01 - 2025/11/01
Em curso
 Chemistry (Doutoramento)
Especialização em Specialization in Medicinal Chemistry
Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal

Gulbenkian Institute for Molecular Medicine, Portugal

Texas A&M University Department of Biomedical Engineering, Estados Unidos
2019/10/05 - 2021/07/23
Concluído
 Medicinal Chemistry (Master)
Universidade de Coimbra, Portugal
"Development of cationic photosensitizers for photoinactivation of microorganisms" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 18
2016/09/16 - 2019/07/23
Concluído
 Medicinal Chemistry (Bachelor)
Universidade de Coimbra, Portugal
"Design e síntese de sintões para desenvolvimento de compostos com potencial atividade antimicrobiana para a girase B" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 15,24
2019/01/07 - 2019/01/19
Frequentou
 II Modular Training in Laboratory Animal Science (Outros)
Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal

Universidade de Coimbra Faculdade de Medicina, Portugal
16.8
2018/07/28 - 2018/11/15
Frequentou
 Medicinal Chemistry (Bachelor)
University of Wollongong, Austrália
2012/08/18 - 2013/06/28
Frequentou
 Intercultura AFS (Ensino secundário)
South Mecklenburg High School, Estados Unidos
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2021/10/01 - 2021/10/31 Estagiário de Investigação (Investigação) Ruprecht Karls Universitat Heidelberg Fakultät für Chemie und Geowissenschaften, Alemanha
Ruprecht Karls Universitat Heidelberg Fakultät für Chemie und Geowissenschaften, Alemanha
2020/09/01 - 2020/10/31 Estagiário de Investigação (Investigação) PorphyChem, França
PorphyChem, França
2020/08/06 - 2020/10/31 Investigador (Investigação) Universidade de Coimbra, Portugal
Universidade de Coimbra, Portugal
2019/10/01 - 2019/12/31 Investigador (Investigação) Universidade de Coimbra, Portugal
Universidade de Coimbra, Portugal
Projetos

Bolsa

Designação Financiadores
2025/06/25 - Atual Treatment of pneumonia by photodynamic action
173770
Bolseiro de Doutoramento
Texas A&M University Department of Biomedical Engineering, Estados Unidos
Em curso

Outro

Designação Financiadores
2021/10/01 - 2021/10/31 Anchorage of homogeneous gold complexes on solid supports for catalytic applications
Bilateral action Portugal-Germany
Bolseiro de Mestrado
Produções

Publicações

Artigo em revista
  1. Arnaut, Zoe A.; Felgueiras, Alexandre P.; Rodrigues, Fábio M. S.; Aroso, Rafael T.; Sandra Nunes; Pais, A. A. C. C.; Pereira, Mariette M.. Autor correspondente: Pereira, Mariette M.. "A New Rule(r) for Nitrobenzene-Based Synthesis of meso-Tetraarylporphyrins under Continuous Flow: Design of Experiments Guided Optimization". Organic Process Research & Development (2026):
    Aceite para publicação
  2. Anita S. Amorim; Chloe M. Hobbs; Zoe A. Arnaut; Mariette M. Pereira; David Gallagher; Teck Wee Boo; Georgina Gethin; et al. "Selective antimicrobial photodynamic therapy of clinical isolates from patients with infected diabetic foot ulcers using a small cationic chlorin". Antimicrobial Agents and Chemotherapy (2025): https://doi.org/10.1128/aac.00962-25.
    10.1128/aac.00962-25
  3. Alexandre P. Felgueiras; Zoe A. Arnaut; Juliana S.F. Cebola; Guilherme M. Martins; Fábio M.S. Rodrigues; Vanderlei S. Bagnato; Kleber T. de Oliveira; Mario J.F. Calvete; Mariette M. Pereira. "Unlocking BODIPY dye synthetic methodologies with 1H NMR monitoring and continuous flow techniques". Dyes and Pigments (2025): https://doi.org/10.1016/j.dyepig.2025.113075.
    10.1016/j.dyepig.2025.113075
  4. Fernanda Alves; Isabelle Almeida de Lima; Lorraine Gabriele Fiuza; Zoe A. Arnaut; Natalia Mayumi Inada; Vanderlei Salvador Bagnato. "Optimizing Photosensitizer Delivery for Effective Photodynamic Inactivation of Klebsiella pneumoniae Under Lung Surfactant Conditions". Pathogens (2025): https://doi.org/10.3390/pathogens14070618.
    10.3390/pathogens14070618
  5. Szuroczki, Péter; Mikle, Gábor; Aroso, Rafael T.; Arnaut, Zoe A.; Pinto, Sara M. A.; Carrilho, Rui M. B.; Bényei, Attila; Kollár, László; Pereira, Mariette M.. "Unlocking New Porphyrin Aminoacid Bioconjugates with a Pd-Catalyzed Carboxamide Synthesis". ChemPlusChem 90 6 (2025): https://doi.org/10.1002/cplu.202500193.
    10.1002/cplu.202500193
  6. Amorim, Anita S.; Arnaut, Zoe A.; Mata, Ana I.; Pucelik, Barbara; Barzowska, Agata; da Silva, Gabriela J.; Pereira, Mariette M.; Dabrowski, Janusz M.; Arnaut, Luis G.. "Efficient and Selective, In Vitro and In Vivo, Antimicrobial Photodynamic Therapy with a Dicationic Chlorin in Combination with KI". ACS Infectious Diseases 10 9 (2024): 3368-3377. https://doi.org/10.1021/acsinfecdis.4c00492.
    Acesso aberto • 10.1021/acsinfecdis.4c00492
  7. Mendonça, Diogo A.; Cadima-Couto, Iris; Buga, Carolina C.; Arnaut, Zoe A.; Schaberle, Fabio A.; Arnaut, Luis G.; Castanho, Miguel A.R.B.; Cruz-Oliveira, Christine. "Repurposing anti-cancer porphyrin derivative drugs to target SARS-CoV-2 envelope". Biomedicine & Pharmacotherapy 176 (2024): 116768. https://doi.org/10.1016/j.biopha.2024.116768.
    10.1016/j.biopha.2024.116768
  8. Arnaut, Zoe A.; Pinto, Sara M. A.; Aroso, Rafael T.; Amorim, Anita S.; Lobo, Catarina S.; Schaberle, Fabio A.; Pereira, Dina; et al. "Selective, broad-spectrum antiviral photodynamic disinfection with dicationic imidazolyl chlorin photosensitizers". Photochemical & Photobiological Sciences 22 11 (2023): 2607-2620. https://doi.org/10.1007/s43630-023-00476-4.
    10.1007/s43630-023-00476-4
  9. Aroso, Rafael T.; Piccirillo, Giusi; Arnaut, Zoe A.; Gonzalez, Andreia C.S.; Rodrigues, Fábio M.S.; Pereira, Mariette M.. "Photodynamic inactivation of influenza virus as a potential alternative for the control of respiratory tract infections". Journal of Photochemistry and Photobiology 7 (2021): 100043. https://doi.org/10.1016/j.jpap.2021.100043.
    10.1016/j.jpap.2021.100043
Poster em conferência
  1. Arnaut, Zoe A.; Felgueiras, Alexandre P.; Fábio M. S. Rodrigues; Aroso, Rafael T.; Alberto A.C.C. Pais; Pereira, Mariette M.. "Synthesis of various meso-aryl porphyrins using flow chemistry". Trabalho apresentado em 13th International Conference on Porphyrins and Phthalocyanines, 2024.
  2. Arnaut, Zoe A.; Cruz-Oliveira, Christine; Cruz-Oliveira, C.; Oliveira, C. C.; Castanho, Miguel A. R. B.; Pereira, Mariette M.. "Structure-activity relationship of functionalized porphyrins for ZIKV inactivation". Trabalho apresentado em 13th International Conference on Porphyrins and Phthalocyanines, 2024.
  3. Arnaut, Zoe A.; Aroso, Rafael T.; Pinto, Sara M.; Pereira, Mariette M.. "Scale-up of cationic meso-imidazolyl porphyrin photosensitizers as antimicrobial agents". Trabalho apresentado em 14th National Organic Chemistry Meeting & 7th National Medicinal Chemistry Meeting, 2022.
  4. Arnaut, Zoe A.; Pereira, Mariette M.; Arnaut, Luis G.; Pais, A. A. C. C.; Nunes, Sandra C. C.; Vinagreiro, Carolina; Pinto, Sara M. A.. "Computational design and synthesis of imidazolyl-tetrapyrrolic macrocycles based photosensitizers for photodynamic inactivation of micro-organisms". Trabalho apresentado em International Conference on Porphyrins and Phthalocyanines, 2021.
  5. Arnaut, Zoé A.; Pereira, Mariette M.; Aroso, Rafael T.; Pinto, Sara M. A.; Guedes, Rita C.. "The quest for new antibiotics: synthesis of potential DNA gyrase inhibitors". Trabalho apresentado em XXVI Encontro Nacional da SPQ, 2019.
Resumo em conferência
  1. Arnaut, Zoe A.; Lígia C. Gomes-da-silva; Pinto, Sara M. A.; Arnaut, Luis G.; Pereira, Mariette M.. "What makes the strength of very phototoxic photosensitizers". Trabalho apresentado em 18th International Congress on Photobiology 2024, Perth, 2024.
    Publicado
  2. Arnaut, Zoe A.; Felgueiras, Alexandre P.; Rodrigues, Fábio M. S.; Aroso, Rafael T.; Pais, A.C.C.; Pereira, Mariette M.. "Factorial design for optimization of tetra-substituted meso-aryl porphyrins synthesis through flow chemistry". Trabalho apresentado em XXVIII Galego Portuguese Chemistry Encounter, Vigo, 2024.
    Publicado
  3. Arnaut, Zoe A.; Cruz-Oliveira, Christine; Cruz-Oliveira, C.; Oliveira, C. C.; Castanho, Miguel; Pereira, Mariette M.. "Synthesis and evaluation of tetrapyrrolic macrocycles as potential antivirals". Trabalho apresentado em XXVIII Encontro Nacional da SPQ, Aveiro, 2023.
    Aceite para publicação
  4. Arnaut, Zoe A.; Pinto, Sara M. A.; Aroso, Rafael T.; Amorim, Anita; Lobo, Ana Catarina S. ; Pereira, Mariette M.; Arnaut, Luis G.. "Photoinactivation of SARS-CoV-2 using a cationic di-imidazolyl chlorin photosensitizer". Trabalho apresentado em 18th International Photodynamic Association World Congress, Tampere, 2023.
    Publicado
  5. Arnaut, Zoe A.; Felgueiras, Alexandre P.; Stein, Philipp M.; Rudolph, Matthias; Carabineiro, S.A.C.; Carrilho, Rui M. B.; Hashmi, A. Stephen K.; Pereira, Mariette M.. "Gold Tris-BINOL Menthol Monophosphite For The Preparation Of Phenol Derivatives". Trabalho apresentado em 8th Portuguese Young Chemistry Meeting, Vila Real, 2023.
    Publicado
  6. Arnaut, Zoe A.; Aroso, Rafael T.; Pinto, Sara M. A.; Lobo, Ana Catarina S. ; Amorim, Anita; Calvete, Mário J. F. ; Rodrigues-Santos, Paulo; et al. "Synthesis of di-imidazolyl porphyrins and their chlorin derivatives for photoinactivation of bacteria and viruses". Trabalho apresentado em XXVI Encontro Galego-Portugués de Química, 2022.
  7. Arnaut, Zoe A.; Pinto, Sara M. A.; Aroso, Rafael T.; Nunes, Sandra C. C.; Pais, Alberto A C C; Pereira, Mariette M.. "Design and scale-up of amphiphilic cationic meso-imidazolyl porphyrinbased photosensitizers for development of potential antimicrobial agents". Trabalho apresentado em XXIX European Colloquium on Heterocyclic Chemistry, 2021.
    Publicado

Propriedade Intelectual

Pedido provisório de patente
  1. 2020. "Small cationic ortho-5,15-di-heteroaryl-chlorin and bacteriochlorin derivatives and their applications in photoinactivation of microorganisms".
    Protegido
Atividades

Apresentação oral de trabalho

Título da apresentação Nome do evento
Anfitrião (Local do evento)
2025/04/11 Porphyrins: from synthesis to antimicrobial testing
University of Texas at Dallas (Dallas, Estados Unidos)
2024 What makes the strength of very phototoxic photosensitizers 18th International Congress on Photobiology
(Perth, Austrália)
2024 Factorial design for optimization of tetra-substituted meso-aryl porphyrin synthesis through flow chemistry XXVIII Encontro Galego-Portugués de Química
(Vigo, Espanha)
2023/05/19 2ª Competição Nacional de Retrossíntese 2023 8th Portuguese Young Chemists Meeting
(Portugal)
2023 Synthesis and evaluation of tetrapyrrolic macrocycles as potential antivirals XXVIII Encontro Nacional da SPQ
(Aveiro, Portugal)
2023 Photoinactivation of SARS-CoV-2 using a cationic di-imidazolyl chlorin photosensitizer 18th International Photodynamic Association World Congress
(Tampere, Finlândia)
2023 Gold tris-BINOL menthol monophosphite for the preparation of phenol derivatives 8th Portuguese Young Chemistry Meeting
(Vila Real, Portugal)
2022 Synthesis of diimidazolyl porphyrins and their chlorin derivatives for photoinactivation of bacteria and viruses XXVI Encontro Galego-Portugués de Química
(Santiago de Compostela, Espanha)
2021/05/19 1ª Competição Nacional de Retrossíntese 2020 7th Portuguese Young Chemists Meeting
(Bragança, Portugal)

Organização de evento

Nome do evento
Tipo de evento (Tipo de participação) 		Instituição / Organização
2024/06/06 - 2024/06/07 XII Encontro Nacional de Catálise e Materiais Porosos (2024/06/06 - 2024/06/07)
Conferência (Membro da Comissão Organizadora)
2024 - 2024 Junior Chemistry Olympiad (2024 - 2024)
Outro (Membro da Comissão Organizadora)
2024 - 2024 Chemistry Olympiad + (2024 - 2024)
Outro (Membro da Comissão Organizadora)
2023 - 2023/11/29 EducaPlast - A problemática da poluição por microplásticos e o desenvolvimento de bioplásticos como alternativa de futuro: comunicar e envolver a Sociedade (2023 - 2023)
Outro (Outra)
2023 - 2023 Junior Chemistry Olympiad (2023 - 2023)
Outro (Membro da Comissão Organizadora)
2022 - 2022 Junior Chemistry Olympiad (2022 - 2022)
Outro

Participação em evento

Descrição da atividade
Tipo de evento 		Nome do evento
Instituição / Organização
2020/08/29 - 2020/11/30 Training in the areas of Chemistry / Medicinal Chemistry, focused on scientific research and experience of initiation to scientific research in these areas.
Oficina (workshop)
 Training course - Experimental Medicinal Chemistry: From Academia to Pharmaceutical Industry
Universidade de Coimbra, Portugal
2017/08/13 - 2017/08/18 The theme of the Volunteer Summer Summit 2017 was "Equal Opportunities".
Encontro
 Volunteer summer summit
AFS-USA Inc, Estados Unidos

Membro de associação

Nome da associação Tipo de participação
2019 - Atual SPQ - Portuguese Society of Chemistry Member
2013/09/01 - Atual Intercultura- AFS Chapter coordinator; Trainer;
2019 - 2022 SPP member Member

Tutoria

Tópico Nome do aluno
2024 - 2024 Synthesis of di-imidazolyl porphyrin by a continuous flow process Diogo Veiga
Distinções

Prémio

2024 Fulbright Scholarship
2020 3% Best students award
Universidade de Coimbra, Portugal
2019 3% Best students award
Universidade de Coimbra, Portugal

Outra distinção

2020 FCT Verão com ciência scholarship
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
2019 FCT scholarship (CQC SER C3_4)
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal