Paulo Afonso é, Professor Auxiliar, desde setembro de 2024, no Mestrado Integrado em Medicina Veterinária, da Cooperativa de Ensino Superior Politécnico e Universitário (CESPU). Paralelamente, exerce funções como Professor Adjunto Convidado, desde setembro de 2024, na Licenciatura em Enfermagem Veterinária, da Escola Superior Agrária, do Instituto Politécnico de Bragança (ESA-IPB), onde colabora desde 2019. Entre 2017 e 2024, foi o Médico Veterinário responsável pelo Cantinho do Animal – Centro de Recolha Oficial Intermunicipal de Animais de Companhia da Associação de Municípios da Terra Quente Transmontana (CRO AMTQT). Concluiu, em julho de 2024, o Doutoramento em Ciências Veterinárias pela Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro (UTAD), com a Tese intitulada "Infectious Diseases in Shelter Medicine in Portugal – An Epidemiological Approach from a One Health Perspective". A Tese foi distinguida com a classificação máxima de Muito Bom e representa o primeiro Doutoramento dedicado à Medicina Veterinária de Abrigo – área de especial interesse na qual tem atuado, investigado e é orador convidado em várias instituições. É Mestre em Medicina Veterinária pela UTAD, desde 2013, tendo apresentando a Dissertação “Atlantoaxial Instability in Dogs”, com 18 valores, no culminar dos estágios no Referência Veterinária, Alcabideche (Portugal), Cornell University Hospital for Animals, Ithaca (Estados Unidos da América), e na Ars Veterinaria, Barcelona (Espanha). Concluiu, em 2017, a Pós-Graduação em Administração Autárquica, pela Escola Superior de Comunicação, Administração e Turismo (EsACT)-IPB. É membro integrado do Centro de Ciência Animal e Veterinária (CECAV) e membro do Laboratório Associado para a Ciência Animal e Veterinária (AL4AnimalS), do Centro de Investigação de Montanha (CIMO), do Laboratório Associado para a Sustentabilidade e Tecnologia em Regiões de Montanha (LA SusTEC) e do One Health Toxicology Research Unit (1H-TOXRUN). É autor de artigos científicos em revistas indexadas, capítulos de livros e comunicações publicadas em atas de conferências. É revisor de revistas internacionais e membro da comissão organizadora e/ou científica de diversas conferências, sendo também orador convidado em eventos científicos. A 01 de fevereiro de 2025 cofundou o European Shelter Medicine Journal Club. Orienta ainda alunos na conclusão de licenciatura e de mestrado. É membro da Ordem dos Médicos Veterinários, da American Shelter Veterinarians, da Associação Nacional de Médicos Veterinários dos Municípios e da Shelter & Charity Veterinarian Association. As principais áreas de interesse são a Medicina Veterinária de Abrigo, a Saúde Pública Veterinária, as Doenças Infeciosas, as Doenças Parasitárias, a Epidemiologia e a One Health.