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Rui Francisco Costa Marcos do Nascimento. Completed the Mestrado in Biologia Molecular e Genética in 2017 by Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências and Licenciatura in Biologia in 2015/07/09 by Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências. Attends the Doutoramento in Genética Molecular Comparativa by Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro since 2024/09. Is Intership at INMLCF in Instituto Nacional de Medicina Legal e Ciências Forenses Delegação do Sul. Published 8 articles in journals. Organized 1 event(s). Participated in 5 event(s). Has received 1 awards and/or honors. In their professional activities interacted with 76 collaborator(s) co-authorship of scientific papers. In his curriculum Ciência Vitae the most frequent terms in the context of scientific, technological and artistic-cultural output are: Vitis vinifera; Plasmopara vitícola; Interação compatível; FTICR-MS; Caracterização metabólica; Modulação dos lípidos; Teses de mestrado - 2017; Domínio/Área Científica::Ciências Naturais::Ciências Biológicas; Diploma; Mérito; pathogen resistance; metabolomics; reference genes; biomarkers; proteomics; bioinformatics; Plasmopara viticola; R; Data Analysis; Data Science; Statistical Analysis; Bioinformatics; .
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Identification

Personal identification

Full name
Rui Francisco Costa Marcos do Nascimento

Citation names

  • Nascimento, Rui

Author identifiers

Ciência ID
CB1A-8B8D-78F1
ORCID iD
0000-0002-0478-336X

Email addresses

  • rui.f.nascimento@inmlcf.mj.pt (Professional)
Education
Degree Classification
2024/09 - 2028/09
Ongoing
 Genética Molecular Comparativa (Doutoramento)
Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro, Portugal
2015/09 - 2017/10/23
Concluded
 Biologia Molecular e Genética (Mestrado)
Major in Sem especialização
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
"Characterization of metabolic pathways involved in the compatible interaction between Vitis vinifera and Plasmopara viticola" (THESIS/DISSERTATION)
 18
2012/09 - 2015/07/09
Concluded
 Biologia (Licenciatura)
Major in Biologia Molecular e Genética
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
 15
Affiliation

Science

Category
Host institution 		Employer
2017/11 - 2021/12 Researcher (Research) Universidade de Lisboa, Portugal
Universidade de Lisboa Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas, Portugal

Other Careers

Category
Host institution 		Employer
2020/06/01 - 2023/12/31 Técnico Superior (Técnico Superior) LGM-LISBOA (Laboratório de Genética e Patologia de Lisboa), Portugal
2020/09/01 - 2021/02/28 Técnico Superior (Técnico Superior) Lumilabo, Portugal

Others

Category
Host institution 		Employer
2020/11/23 - Current Intership at INMLCF Instituto Nacional de Medicina Legal e Ciências Forenses Delegação do Sul, Portugal
Outputs

Publications

Conference poster
  1. Santos, Lúcia; Nascimento, Rui; Duarte, Aires; Patrick T. Harrison; Gama-Carvalho, Margarida; Carlos M. Farinha. "Transcriptomic and proteomic analysis identify changes associated with several prototypical cystic fibrosis-causing mutations". Paper presented in 17th ECFS Basic Science Conference, 2022.
  2. Nascimento, Rui; Maia, Marisa; Ferreira, A. E. N.; Marques, A.P.; Freire, Ana Ponces; Cordeiro, Carlos; Silva, Marta Sousa; Figueiredo, Andreia. "Metabolic profile of V. vinifera cv. Trincadeira upon Plasmopara viticola infection". Paper presented in Encontro Ciência 2018, 2018.
  3. Maia, M.; Nascimento, Rui; Ferreira, AEN; Cordeiro, C.; Figueiredo, A.; Sousa Silva, M.. "FT-ICR-MS metabolomics approach to uncover grapevine resistance to downy mildew". Paper presented in EU FT-ICR MS – End User School 1, 2018.
  4. Nascimento, Rui; Maia, Marisa; Silva, Marta Sousa; Figueiredo, Andreia; Cordeiro, Carlos; Ferreira, António E.N.. "Metabolinks: tools for high-resolution MS metabolomics data analysis". Paper presented in 5th Portuguese Mass Spectrometry Meeting (PTMS2017), 2017.
  5. Nascimento, Rui; Maia, Marisa; Ferreira, António E.N.; Marques, A.P.; Cordeiro, Carlos; Silva, Marta Sousa; Figueiredo, Andreia. "Metabolic characterization of V. vinifera cv. Trincadeira in Plasmopara viticola infected leaves". Paper presented in 5th Portuguese Mass Spectrometry Meeting (PTMS2017), 2017.
  6. Nascimento, Rui; Figueiredo, Andreia; Figueiredo, Joana; Maia, Marisa; Laureano, Gonçalo; Cavaco, Ana Rita; da Silva, Clemente; et al. "Grapevine-downy mildew resistance mechanisms uncovered by a multi-‘Omics approach". Paper presented in 5th Portuguese Mass Spectrometry Meeting (PTMS2017), 2017.
  7. Nascimento, Rui; Maia, Marisa; Ferreira, António E.N.; Marques, A.P.; Freire, Ana Ponces; Cordeiro, Carlos; Silva, Marta Sousa; Figueiredo, Andreia. "Metabolic characterization of V. vinifera cv. Trincadeira upon Plasmopara viticola infection". Paper presented in CQB DAY 2017, Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, 2017.
  8. Nascimento, Rui; Maia, Marisa; Ferreira, A. E. N.; Marques, A.P.; Figueiredo, Joana; Freire, Ana Ponces; Cordeiro, Carlos; Figueiredo, Andreia; Sousa Silva, Marta. "Grapevine leaves metabolic characterization for a resistance biomarker discovery". Paper presented in CQB DAY 2017 (pp 50), Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, 2017.
  9. Nascimento, Rui; Maia, M.; Ferreira, A. E. N.; Marques, A.P.; Freire, A. P.; Cordeiro, C.; Sousa Silva, M.; Figueiredo, A.. "Metabolic characterization of V. vinifera cv. Trincadeira in response to Plasmopara vitícola.". Paper presented in 3rd general COST MEETING (COSTFA1306), 2017.
  10. Nascimento, Rui; Maia, M.; Ferreira, A. E. N.; Marques, A.P.; Figueiredo, J.; Freire, A. P.; Cordeiro, C.; Figueiredo A.; Sousa Silva, M.. "Metabolic characterization of grapevine leaves: phenotyping for resistance.". Paper presented in 3rd general COST MEETING (COSTFA1306) ITQB, Oeiras, 2017.
  11. Maia, M.; Nascimento, Rui; Ferreira, AEN; Marques, A.P.; Figueiredo, J.; Freire, A.P.; Cordeiro, C.; Figueiredo, A.; Sousa Silva, M.. "“I Heard It Through The Grapevine” that leaves are an upcoming valuable by-product". Paper presented in Chem&Biochem Postgraduates Students Meeting, 2017.
  12. Nascimento, Rui; Maia, M.; Ferreira, AEN; Marques, A.P.; Freire, A.P.; Cordeiro, C.; Sousa Silva, M.; Figueiredo, A.. "Metabolic characterization of V. vinifera cv. Trincadeira in response to Plasmopara viticola". Paper presented in EU Cost Action FA1306 - The quest for tolerant varieties: phenotyping at plant and cellular level, 2017.
  13. Maia, M.; Nascimento, Rui; Ferreira, AEN; Figueiredo, J.; Marques, A.P.; Cordeiro, C.; Figueiredo, A.; Sousa Silva, M.. "Grapevine metabolic research: searching for the Plasmopara viticola resistance-associated biomarker". Paper presented in 2º Simpósio SCAP de Proteção das Plantas; 8º Congresso da Sociedade Portuguesa de Fitopatologia e 11º Encontro Nacional de Proteção Integrada, 2017.
  14. Maia, M.; Nascimento, Rui; Marques, A.P.; Ferreira, A. E. N.; Figueiredo, J.; Freire, A. P.; Cordeiro, C.; Figueiredo, A.; Sousa Silva, M.. "Metabolic characterization of grapevine leaves: first clues towards biomarkers discovery.". Paper presented in XIX National Congress of Biochemistry, 2016.
  15. Maia, M.; Nascimento, Rui; Marques, A.P.; Ferreira, A. E. N.; Figueiredo, J.; Freire, A. P.; Cordeiro, C.; Figueiredo, A.; Sousa Silva, M.. "Vitis vinifera cv. Pinot noir metabolome analysis by ESIFTICR- MS: high throughput detection of drugs and pesticides.". 2016.
Journal article
  1. Santos, Lúcia; Nascimento, Rui; Duarte, Aires; Railean, Violeta; Amaral, Margarida D.; Harrison, Patrick T.; Gama-Carvalho, Margarida; Farinha, Carlos M.. "Mutation-class dependent signatures outweigh disease-associated processes in cystic fibrosis cells". Cell & Bioscience 13 1 (2023): http://dx.doi.org/10.1186/s13578-023-00975-y.
    10.1186/s13578-023-00975-y
  2. Sebastiana, M.; Gargallo-Garriga, A.; Sardans, J.; Pérez-Trujillo, M.; Monteiro, F.; Figueiredo, A.; Maia, M.; et al. Corresponding author: Sebastiana, M.. "Metabolomics and transcriptomics to decipher molecular mechanisms underlying ectomycorrhizal root colonization of an oak tree". Scientific Reports 11 1 (2021): http://dx.doi.org/10.1038/s41598-021-87886-5.
    10.1038/s41598-021-87886-5
  3. B. Santos, Rita; Nascimento, Rui; V. Coelho, Ana; Figueiredo, Andreia. "Grapevine-Downy Mildew Rendezvous: Proteome Analysis of the First Hours of an Incompatible Interaction". Plants 9 11 (2020): 1498. http://dx.doi.org/10.3390/plants9111498.
    10.3390/plants9111498
  4. Maia, Marisa; Ferreira, António E. N.; Nascimento, Rui; Monteiro, Filipa; Traquete, Francisco; Marques, Ana P.; Cunha, Jorge; et al. "Integrating metabolomics and targeted gene expression to uncover potential biomarkers of fungal/oomycetes-associated disease susceptibility in grapevine". Scientific Reports 10 1 (2020): http://dx.doi.org/10.1038/s41598-020-72781-2.
    10.1038/s41598-020-72781-2
  5. Maia, M.; Maccelli, A.; Nascimento, R.; Ferreira, A.E.N.; Crestoni, M.E.; Cordeiro, C.; Figueiredo, A.; Sousa Silva, M.. "Early detection of Plasmopara viticola-infected leaves through FT-ICR-MS metabolic profiling". Acta Horticulturae 1248 (2019): 575-580. http://dx.doi.org/10.17660/actahortic.2019.1248.77.
    10.17660/actahortic.2019.1248.77
  6. Nascimento, Rui; Maia, Marisa; Ferreira, António E.N.; Silva, Anabela B.; Freire, Ana Ponces; Cordeiro, Carlos; Silva, Marta Sousa; Figueiredo, Andreia. "Early stage metabolic events associated with the establishment of Vitis vinifera – Plasmopara viticola compatible interaction". Plant Physiology and Biochemistry 137 (2019): 1-13. http://dx.doi.org/10.1016/j.plaphy.2019.01.026.
    10.1016/j.plaphy.2019.01.026
  7. Figueiredo, Andreia; Figueiredo, J.; Maia, Marisa; Cavaco AR; Laureano, Gonçalo; Nascimento, Rui; Da Silva, Clemente; Matos, Ana Rita ; Silva, Marta Sousa. "Grapevine-downy mildew resistance strategies: towards a sustainable viticulture". Revista de Ciências Agrárias / Impact factor 0.9 41 special (2019): 61-66. https://doi.org/10.19084/rca.17068.
    Published
  8. Andreia Cristina Silva Viegas Mata Figueiredo (881D-86E5-D52A); Joana Frazão Figueiredo (6A18-7398-EB64); Maia, M. (5D1F-43D2-E026); Ana Rita Sebastião Mendes Cavaco (3A1B-B9B1-C30A); Gonçalo Miguel Mendes Pais Costa Laureano (6515-3783-E5EF); Nascimento, Rui; Clemente da Silva; Ana Rita Matos; Marta Sousa Silva (F61E-BD62-1579). "Subtilisin-like proteases and lipid signalling events play an important role in grapevine resistance to downy mildew: a systems biology approach". Revista das Ciências Agrárias, CAP 41 (2018): http://dx.doi.org/10.19084/RCA.17068.
    Published
Thesis / Dissertation
  1. Nascimento, Rui Francisco Costa Marcos do. "Characterization of metabolic pathways involved in the compatible interaction between Vitis vinifera and Plasmopara viticola". Master, 2017. http://hdl.handle.net/10451/31751.
Activities

Oral presentation

Presentation title Event name
Host (Event location)
2023/10/12 Introdução da Tecnologia NGS em Genética Forense: Novos marcadores genéticos do tipo Microhaplotipos 21º Congresso Nacional de Medicina Legal e Ciências Forenses
Instituto Nacional de Medicina Legal e Ciências Forenses (Lamego, Portugal)
2017/10 Plant-pathogen interaction in grapevine: a multi ‘Omics approach. Pathway Proteomics (PathProt)
IGC (Oeiras, Portugal)
2017/10 Grapevine-downy mildew resistance strategies: towards a sustainable viticulture. Proteção das Plantas 2017- 2º Simpósio SCAP de Proteção das Plantas; 8º Congresso da Sociedade Portuguesa de Fitopatologia e 11º Encontro Nacional de Proteção
(Portugal)
2017/09 Mass Spectrometry in Grapevine Research: from metabolite extraction to biomarker discovery 5th Portuguese Mass Spectrometry Meeting
(Lisboa, Portugal)
2017/05/31 Metabolic lighthouses in downy mildew resistance CQB Day 2017
Faculdade de Ciência da Universidade de Lisboa (Lisboa, Portugal)
2017/05 Plant-pathogen interaction in modern agriculture: grapevine as a case study. 4th Annual Conference - Foster Innovation through Resilient and Efficient Agro Food & Forestry Systems
redeAGRO (Portugal)
2017/02/09 “I Heard It Through The Grapevine” that leaves are an upcoming valuable by-product. Chemistry and Biochemistry Postgraduate Students Meeting of Faculdade de Ciências
Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa (Lisboa, Portugal)
2016/11/24 Mass spectrometry-based metabolomics in the detection of food contaminants: the grapevine example. 3º Simpósio Nacional “Promoção de uma Alimentação Saudável e Segura – Contaminantes de preocupação emergente: desafios laboratoriais” – SPASS
(Portugal)
2016/10 Plant-pathogen interaction in grapevine: a multi ‘Omics approach. Pathway Proteomics (PathProt) meeting
IGC (Oeiras, Portugal)
2016 Grapevine metabolomics: the downy mildew and the quest for biomarkers PathProt 9 - The international forum on Pathway Analysis in Proteomics
IGC (Portugal)

Event organisation

Event name
Type of event (Role) 		Institution / Organization
2019/02 - 2019/11/22 Tertúlia Vinho com Ciência 2019 (2019/11/22 - 2019/11/22)
Round table (Member of the Organising Committee)
 Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal

Event participation

Activity description
Type of event 		Event name
Institution / Organization
2024/05/14 - 2024/05/15 HIDS 2024 - Human Identification Solutions (HIDS) 2024
Conference
 Human Identification Solutions (HIDS) 2024
Thermo Fisher Scientific Inc Pittsburgh, United States
2023/05/23 - 2023/05/24 HIDS 2023 - Human Identification Solutions (HIDS) 2023
Conference
 Human Identification Solutions (HIDS) 2023
Thermo Fisher Scientific Inc Pittsburgh, United States
2022/11/18 - 2022/11/18 ENFSI - Kinship statistics using Familias workshop
Workshop
 2º ENFSI - Kinship statistics using Familias workshop
European Network of Forensic Science Institutes, Germany
2019/10/11 - 2019/12/13 FCUL R Workshops
Workshop
 FCUL R Workshops
Universidade de Lisboa Departamento de Estatística e Investigação Operacional, Portugal
2019/09/27 - 2019/09/27 European Researchers’ Night 2019 “SciCity – Science in the City”
Exhibition
 European Researchers’ Night 2019 “SciCity – Science in the City”
Universidade de Lisboa Museu Nacional de História Natural, Portugal
2018/11/20 - 2018/11/20 Tertúlia Vinho com Ciência 2018
Round table
 Tertúlia Vinho com Ciência 2018
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2017/11/24 - 2017/11/24 Tertúlia Vinho com Ciência 2017
Round table
 Tertúlia Vinho com Ciência 2017
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2016/10/14 - 2016/10/14 Workshop em Preparação de Amostras
Workshop
 Workshop em Preparação de Amostras
Universidade de Lisboa Faculdade de Farmácia, Portugal
Distinctions

Other distinction

2017 Diploma de Mérito Académico
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal