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Rafaela Ribeiro Agostinho. Completed the Mestrado in Oncobiologia - Mecanismos Moleculares do Cancro in 2020/03/17 by Universidade do Algarve and Licenciatura in Ciências Biomédicas in 2017 by Universidade do Algarve. Attends the Doutoramento in Ciências Biomédicas by Universidade do Algarve - Campus de Gambelas since 2021/12/01. Is Research Trainee in Universidade do Algarve - Campus de Gambelas. Published 3 articles in journals. Has 1 section(s) of books. Organized 6 event(s). Participated in 14 event(s). Co-supervised 1 MSc dissertation(s). Supervised 1 work(s) of course completion of LSc/BSc e co-supervised 5. Has received 1 awards and/or honors. Participates and/or participated as PhD Student Fellow in 1 project(s) and Research Fellow in 2 project(s). Works in the area(s) of Medical and Health Sciences with emphasis on Basic Medicine with emphasis on Neurosciences, Natural sciences with emphasis on Biological Sciences with emphasis on Molecular Biology, Natural sciences with emphasis on Biological Sciences with emphasis on Cell Biology and Natural sciences with emphasis on Biological Sciences with emphasis on Developmental Biology. In his curriculum Ciência Vitae the most frequent terms in the context of scientific, technological and artistic-cultural output are: Stem Cells; Organoids; gene editing; human IPSCs cultures; therapy; technology; regeneration; human diseases; Quantification; Imaging; .
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Identification

Personal identification

Full name
Rafaela Ribeiro Agostinho

Citation names

  • Agostinho, Rafaela R.

Author identifiers

Ciência ID
231B-D283-9C07

Email addresses

  • rafaelaribeiroagostinho@gmail.com (Professional)

Knowledge fields

  • Medical and Health Sciences - Basic Medicine - Neurosciences
  • Natural sciences - Biological Sciences - Molecular Biology
  • Natural sciences - Biological Sciences - Cell Biology
  • Natural sciences - Biological Sciences - Developmental Biology

Languages

Language Speaking Reading Writing Listening Peer-review
Portuguese (Mother tongue)
English Upper intermediate (B2) Upper intermediate (B2) Upper intermediate (B2) Upper intermediate (B2)
Education
Degree Classification
2021/12/01 - 2025
Ongoing
 Ciências Biomédicas (Doutoramento)
Universidade do Algarve - Campus de Gambelas, Portugal
2020/11 - 2021
Concluded
 Abordagens Experimentais em Biomedicina (Pós-Graduação)
Universidade do Algarve, Portugal
2018/09 - 2020/03/17
Concluded
 Oncobiologia - Mecanismos Moleculares do Cancro (Mestrado)
Universidade do Algarve, Portugal
"Papel da acetilação N-terminal na fertilidade e no envelhecimento" (THESIS/DISSERTATION)
 17
2014 - 2017
Concluded
 Ciências Biomédicas (Licenciatura)
Universidade do Algarve, Portugal
"Efeito da inibição da sinalização BMP na segmentação embrionária" (THESIS/DISSERTATION)
 14
Affiliation

Science

Category
Host institution		 Employer
2021/12/01 - Current Research Trainee (Research) Universidade do Algarve - Campus de Gambelas, Portugal
2020/11/16 - 2021/11/15 Contracted Researcher (Research) Universidade do Algarve, Portugal
Universidade do Algarve Centro de Investigação em Biomedicina, Portugal
2018/07 - 2020/03 Research Trainee (Research) Universidade do Algarve, Portugal
Universidade do Algarve Centro de Investigação em Biomedicina, Portugal
2017/01 - 2017/06 Research Trainee (Research) Universidade do Algarve, Portugal
Universidade do Algarve Centro de Investigação em Biomedicina, Portugal

Teaching in Higher Education

Category
Host institution		 Employer
2026/01 - 2026/07 Assistant Professor (University Teacher) Universidade do Algarve Faculdade de Medicina e Ciências Biomédicas, Portugal
Universidade do Algarve Faculdade de Medicina e Ciências Biomédicas, Portugal
Projects

Contract

Designation Funders
2024 - 2026 T21S-SH – Tackling impaired neurodevelopment in Down Syndrome via identification of S-sulfhydration targets: a new role for the gasotransmitter hydrogen sulfide signaling in neurodevelopment
2379-GRT-2024A
PhD Student Fellow
Fondation Jérôme Lejeune
Ongoing
2022 - 2023 Identification of S-sulfhydration targets in Down Syndrome: the role of gasotransmitter hydrogen sulfide (H2S) signaling in neurodevelopment
EXPL/MED-NEU/1240/2021
Research Fellow
Universidade do Algarve - Campus de Gambelas, Portugal
 Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT
2020/11/16 - 2021 GT-LightUP - Signaling Gasotransmitters Light Up
PTDC/QUI-QFI/29319/2017
Research Fellow
Universidade do Algarve, Portugal
 Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT
Ongoing
Outputs

Publications

Book chapter
  1. Agostinho, Rafaela; Simão, Sónia; Araújo, Inês Maria. "Dimedone Switch Method in Induced Pluripotent Stem Cells". In Methods in Molecular Biology. Springer Nature, 2026.
    Accepted
Conference poster
  1. Agostinho, Rafaela; Teixeira, Mariana; MASCARENHAS MARQUES, VERA; Sofia M. Calado; Bragança, José; Medeiros, Raquel; Martínez-Ruiz, Antonio; Simão, Sónia; Araújo, Inês Maria. "Optimization of Dimedone Switch Method for detection of S-sulfhydrated proteins in human induced pluripotent stem cells derived from Down syndrome individuals". Paper presented in 2nd FEBS Redox Medicine Workshop, 2025., 2025.
  2. Teixeira, Mariana; Agostinho, Rafaela R.; Martínez-Ruiz, Antonio; Outeiro, Tiago; Simão, Sónia; Araújo, Inês Maria. "dentification of S-nitrosylation targets contributing to pathological aggregation of alfa-synuclein in Parkinson´s Disease: a proteomic study". Paper presented in 2nd FEBS Redox Medicine Workshop, 2025.
  3. Agostinho, Rafaela; MARQUES, VERA; Sofia M. Calado; Bragança, José; Nzwalo, Hipólito; Mónica Bota; Raquel Melo Medeiros; et al. "Cystathionine beta-synthase and H S levels are increased in cellular models of trisomy 21". Paper presented in FENS Forum 2024, 2024.
  4. Agostinho, Rafaela; Marques, Vera Lúcia Maia; Sofia M. Calado; Bragança, José; Nzwalo, Hipólito; Mónica Bota; Raquel Melo Medeiros; et al. "Dysregulation of H2S levels in a cellular model of Down Syndrome". Paper presented in IX Clinical Biochemistry Workshop, 2024.
  5. Agostinho, Rafaela; Vera Marques; Sofia M. Calado; Tomás Azevedo; José Bragança; Nzwalo, Hipólito; Simão, Sónia; Araújo, Inês Maria. "Assessment of H2S production in fibroblasts by time-lapse fluorescence imaging prior to establishment of fibroblast-derived iPS cell lines". Paper presented in Spanish & Portuguese Advanced Optical Microscopy (SPAOM) 2023, 2023.
  6. Vera Marques; Agostinho, Rafaela; Tomás Azevedo ; Simão S.; Inês Araújo. "Characterization and modulation of H2S production in fibroblasts derived from Down Syndrome individuals by time-lapse fluorescence imaging". Paper presented in FENS Regional Meeting, Albufeira, 2023.
  7. Agostinho, Rafaela. "Analysis of new corrole-based H 2 S fluorescent probes for cellular imaging". Paper presented in XVII Meeting of the Portuguese Society for Neuroscience, 2021.
  8. Agostinho, Rafaela; Simão, Sónia; Araújo, Inês. "New corrole-based H2S fluorescent probes for time-lapse imaging in cultured cells". Paper presented in IV Jornadas Algarve Biomedical Center (ABC), 2021.
Journal article
  1. Agostinho, Rafaela R.; Calado, Sofia M.; Bragança, José E.; Nzwalo, Hipólito; Marques, Vera Mascarenhas; Bota, Mónica; Medeiros, Raquel Melo; et al. Corresponding author: Araújo, Inês M.. "Establishment and characterization of induced pluripotent stem cell lines from individuals with Down syndrome and age-matched euploid donors". Stem Cell Research 92 (2026): 103932. https://doi.org/10.1016/j.scr.2026.103932.
    10.1016/j.scr.2026.103932
  2. Simão, Sónia; Santos, Daniela F.; Teixeira, Mariana; Agostinho, Rafaela R.; Rodrigues, Joana; Vitorino, Marta; Araújo, Inês M.. "Unraveling the potential of gasotransmitters as neurogenic and neuroprotective molecules: focus on Alzheimer’s and Parkinson’s diseases". Redox Report 31 1 (2025): https://doi.org/10.1080/13510002.2025.2592413.
    10.1080/13510002.2025.2592413
  3. Simão, Sónia; Agostinho, Rafaela; Martínez-Ruiz, Antonio; Araújo, Inês Maria. "Regulation of Ras Signaling by S-Nitrosylation". Antioxidants 12 8 (2023): 1562. http://dx.doi.org/10.3390/antiox12081562.
    10.3390/antiox12081562
Magazine article
  1. Agostinho, Rafaela; Simão, Sónia; Araújo, Inês. "Como é que a formação de novos neurónios é estimulada a seguir a uma lesão cerebral provocada por crises epilépticas?", Ualgoritmo - Ciência Trocada por Miúdos, 2021
Thesis / Dissertation
  1. Agostinho, Rafaela. "Papel da acetilação N-terminal na fertilidade e no envelhecimento". Master, Universidade do Algarve, 2020.

Other

Other output
  1. 21 de Marco, dia da Trissomia 21.. 2 min video production about research ongoing at University of Algarve on Trisomy 21 and neurodevelopment.. 2023. Agostinho, Rafaela; Araújo, Inês Maria. https://abcri.pt/outreach/world-down-syndrome-day/. 2023.
Activities

Oral presentation

Presentation title Event name
Host (Event location)
2025/06/19 Identification of new therapeutic targets for Down syndrome; the role of H2s signaling during neurodevelopment Seminarios Científicos del Instituto de Investigación Sanitaria Princesa (IIS-Princesa
IIS-Princesa (Madrid, Spain)
2025 Identificação de novos alvos terapêuticos para Síndrome de Down: o papel da sinalização H2S durante o neurodesenvolvimento Seminário
Unidade Curricular de Genética Molecular (Portugal)
2024/01/26 Contribuition of S-nitrosylation of PDI to the aggregation and toxicity of alpha-synuclein in SH-SY5Y cells IX Clinical Biochemistry Workshop
Portuguese Society of Biochemistry (Faro, Portugal)
2019/11/19 Papel da acetilação N-terminal na fertilidade e no envelhecimento LabClub seminars
CBMR (Faro, Portugal)

Supervision

Thesis Title
Role		 Degree Subject (Type)
Institution / Organization
2025/10 - 2026/09 Avaliação da produção de H2S em células progenitoras neuronais derivadas de pacientes com Síndrome de Down
Co-supervisor
 Biologia Molecular e Microbiana (Master)
Universidade do Algarve Faculdade de Medicina e Ciências Biomédicas, Portugal
2024/04 - 2024/06 Estabelecimento e caracterização de linhas de células progenitoras neuronais para o estudo do neurodesenvolvimento em pacientes com Síndrome de Down
Co-supervisor
 Ciências Biomédicas (Degree)
Universidade do Algarve Departamento de Ciências Biomédicas e Medicina, Portugal
2023/03 - 2023/06 Characterization of the contribution of S-nitrosylation to the aggregation of alpha-synuclein in Parkinson's Disease
Co-supervisor
 Ciências Biomédicas (Degree)
Universidade do Algarve Departamento de Ciências Biomédicas e Medicina, Portugal
2023/04 - 2023/05 Estabelecimento e caracterização de linhas de células progenitoras neuronais para o estudo do neurodesenvolvimento em pacientes com Síndrome de Down
Co-supervisor
 Project of medicine’s master (Other)
Universidade do Algarve Faculdade de Medicina e Ciências Biomédicas, Portugal
2022 - 2023 Estabelecimento de modelos celulares de Síndrome de Down: uma nova ferramenta para o estudo do desenvolvimento neuronal
Co-supervisor
 Ciências Biomédicas (Degree)
Universidade do Algarve Faculdade de Medicina e Ciências Biomédicas, Portugal
2022/04 - 2022/05 Desenvolvimento de uma linha iPSC para estudar o papel do H2S na diferenciação neuronal em portadores de trissomia 21
Co-supervisor
 Project of medicine’s master (Other)
Universidade do Algarve Faculdade de Medicina e Ciências Biomédicas, Portugal
2022 - 2022 Validação de sondas fluorescentes para a medição em tempo real de H2S
Co-supervisor
 Intership (Other)
Universidade do Algarve Faculdade de Medicina e Ciências Biomédicas, Portugal
2022 - 2022 Células HeLa como modelo para otimização do protocolo com a sonda SF7
Co-supervisor
 Intership (Other)
Universidade do Algarve Faculdade de Medicina e Ciências Biomédicas, Portugal
2022 - 2022 Estabelecimento de uma linha de iPS reprogramada a partir de células de indivíduos com trissomia 21
Supervisor
 Intership (Other)
Universidade do Algarve Faculdade de Medicina e Ciências Biomédicas, Portugal
2021 - 2021 Caracterização do neurodesenvolvimento em crianças com trissomia 21: avaliação cognitiva e modelos celulares de neurodesenvolvimento
Supervisor
 Ciências Biomédicas (Degree)
Universidade do Algarve Faculdade de Medicina e Ciências Biomédicas, Portugal
2021 - 2021 Estabelecimento de modelos celulares a partir de pacientes com Síndrome de Down: uma nova ferramenta para o estudo do desenvolvimento neuronal
Co-supervisor
 Ciências Biomédicas (Degree)
Universidade do Algarve Faculdade de Medicina e Ciências Biomédicas, Portugal
2021 - 2021 Quantificação dos níveis de H2S em plasma de indivíduos jovens com trissomia 21
Co-supervisor
 Bioquímica (Degree)
Universidade do Algarve Faculdade de Medicina e Ciências Biomédicas, Portugal

Event organisation

Event name
Type of event (Role)		 Institution / Organization
2026/02/25 - 2026/02/25 Dia Aberto- Universidade do Algarve (2026) Universidade do Algarve Faculdade de Medicina e Ciências Biomédicas, Portugal
2024/11/23 - 2024/11/23 Semana da Ciência e da Tecnologia 2023: Dinamização de atividade "Como manter o teu cérebro forte?" (2023/11/23 - 2023/11/23)
Seminar (Co-organisor)
 Centro Ciência Viva do Algarve, Portugal
2023/10/29 - 2023/11/04 Organizer of the workshop "Seeing is believing: time-lapse analysis of neuronal activity using fluorescent probes" at the ESN-ISN neurochemistry school 2023 (2023/10/29 - 2023/11/04)
Workshop (Other)
 Universidade do Algarve Departamento de Ciências Biomédicas e Medicina, Portugal
2023/05/03 - 2023/05/05 Fens Regional Meeting 2023, 3rd-5th May 2023, Algarve, Portugal (2023/05/03 - 2023/05/05)
Congress (Other)
 Federation of European Neuroscience Societies, Belgium

Algarve Biomedical Center Research Institute, Portugal
2023/05/02 - 2023/05/02 VII Symposium Portuguese Glial Network (2023/05/02 - 2023/05/02)
Symposium (Other)
 Federation of European Neuroscience Societies, Belgium

Algarve Biomedical Center Research Institute, Portugal
2022/11/22 - 2022/11/22 Programa da Visita de Estudo UAlg “ DNA dentro da Célula”, “A Medicina na UAlg”. (2022/11/22 - 2022/11/22)
Seminar (Co-organisor)
 Universidade do Algarve Departamento de Ciências Biomédicas e Medicina, Portugal

Event participation

Activity description
Type of event		 Event name
Institution / Organization
2024/04/11 - Current Hands-on Workshop “Quantification in ImageJ”
Workshop
 Hands-on Workshop “Quantification in ImageJ”
Universidade do Algarve Departamento de Ciências Biomédicas e Medicina, Portugal
2024/01/31 - 2024/01/31 How to get Published and Get your Article Accepted in a Good Journal (with Elsevier UK) Workshop
Workshop
 How to get Published and Get your Article Accepted in a Good Journal (with Elsevier UK) Workshop
Centre for Doctoral Studies at King’s College London , United Kingdom
2022/05/03 - 2022/05/05 Dia Aberto - Universidade do Algarve
Meeting
 Dia Aberto
Universidade do Algarve - Campus de Gambelas, Portugal
2021/11/02 - 2021/11/02 ABC-RI Fall international forum | Neuroscience in Health and Diseases
Conference
Universidade do Algarve Algarve Biomedical Center, Portugal
2021/07/07 - 2021/07/08 Imaging in Neuroscience | Virtual conference
Conference
 Imaging in Neuroscience, Virtual Conference
2021/05/24 - 2021/05/29 The CRISPR Revolution: a workshop on Gene Editing
Workshop
 The CRISPR Revolution: a workshop on Gene Editing
Universidade do Algarve Centro de Investigação em Biomedicina, Portugal
2021 - 2021 Visita de estudo UAlg - Sessão experimental: DNA inside cells
Seminar
Universidade do Algarve Algarve Biomedical Center, Portugal
2020/11/23 - 2020/11/23 Organoids With]Out[ Borders | Online Symposium
Symposium
 Organoids With]Out[ Borders | 23 November 2020 | Online Symposium
Universidade do Porto Instituto de Investigação e Inovação em Saúde, Portugal
2020/04 - 2020/04 TAGC 2020 Online - The Allied Genetics Conference
Conference
 TAGC 2020 Online - The Allied Genetics Conference
Genetics Society of America, United States
2018/03/16 - 2018/03/16 II Jornadas Algarve Biomedical Center
Other
 II Jornadas Algarve Biomedical Center
Universidade do Algarve, Portugal
2016/11/10 - 2016/11/16 V Simpósio de Ciências Biomédicas, Faro
Symposium
 V Simpósio de Ciências Biomédicas, Faro
Universidade do Algarve, Portugal
2016/11/11 - 2016/11/12 II Jornadas da Saúde da Universidade do Algarve
Other
 II Jornadas da Saúde da Universidade do Algarve
Universidade do Algarve, Portugal
2016/11/11 - 2016/11/12 Técnicas de Suturas
Workshop
 Técnicas de Suturas
Universidade do Algarve, Portugal
2015/03/12 - 2015/03/14 IV Jornadas Nacionais de Ciências Biomédicas
Other
 IV Jornadas Nacionais de Ciências Biomédicas
Universidade do Algarve, Portugal

Association member

Society Organization name Role
2021 - Current Sociedade Portuguesa de Neurociências Adherent member
2021 - Current Federation of European Neuroscience Societies (FENS) Adherent member
2016/11 - 2017/12 Santa Casa da Misericórdia de Faro Volunteer at Santa Casa da Misericórdia of Faro, in the areas of animation and socialization

Course / Discipline taught

Academic session Degree Subject (Type) Institution / Organization
2024/01 - 2024/06 Escrita Científica (Curso de doutoramento (conclusão de unidades curriculares)) Universidade do Algarve - Campus de Gambelas, Portugal
2023/07/01 - 2023/07/06 Brain Organoids Advanced Hands-on Course (40h) (Curso de mestrado (conclusão do curso de especialização)) Centre de Regulació Genòmica, Spain
2023/05 - 2023/05 ANIMAL CELL CULTURE TECHNOLOGY - Practical Classes TECNOLOGIA DE CULTURA DE CÉLULAS ANIMAIS (Bacharelato) Universidade do Algarve Departamento de Ciências Biomédicas e Medicina, Portugal
2022/09/08 - 2022/09/09 Basic training on maintenance of Pluripotent Stem Cells (Curso de doutoramento (conclusão de unidades curriculares))
2022/09/01 - 2022/09/05 Hands-on Molecular Biology Tools - a beginners crash course (Curso de doutoramento (conclusão de unidades curriculares)) Fundação Champalimaud, Portugal
2022/05 - 2022/05 ANIMAL CELL CULTURE TECHNOLOGY - Practical Classes TECNOLOGIA DE CULTURA DE CÉLULAS ANIMAIS (Bacharelato) Universidade do Algarve Departamento de Ciências Biomédicas e Medicina, Portugal
2022/03/17 - 2022/03/19 Online Course “Scientific tools in biological assays: principles of cell cultures and genetics” “Scientific tools in biological assays: principles of cell cultures and genetics” (Curso de mestrado (conclusão do curso de especialização)) Universidade de Lisboa Faculdade de Farmácia, Portugal
2021/11/08 - 2021/11/12 PhD Advance Course Stem Cell Technologies PhD Advance Course Stem Cell Technologies (Curso de doutoramento (conclusão de unidades curriculares)) Universidade de Lisboa Faculdade de Farmácia, Portugal

Fundação Champalimaud, Portugal
Distinctions

Award

2024 Best Oral Communication Award
Universidade do Algarve - Campus de Gambelas, Portugal