| Book |
- Antunes, José; Irene Maria Vaquinhas; Luís Reis Torgal; Isabel Nobre Vargues; Fernando Taveira da Fonseca; Fernando Regateiro. Imprensa da Universidade de Coimbra: uma história dentro da história. Coimbra, Portugal: Imprensa da Universidade. 2001.
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| Book chapter |
- Antunes, José. "O Instituto Universitário Justitia et Pax e o contexto social, político e cristão na década de 1961-1971". In Instituto Universitário Iustitia et Pax, 1971-2021. 50 Anos, 50 Histórias, 29-67. Coimbra, Portugal: Instituto Universitário Justiça e Paz, 2023.
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- Antunes, José. "Mateus (1262-1282)". In Bispos e Arcebispos de Lisboa, 197-215. Lisboa, Portugal: Livros Horizonte, 2018.
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- Antunes, José. Corresponding author: Antunes, José. "A glória de um Bispo (Gloria Episcopi)". In D- António Antunes, Bispo de Coimbra, filho ilustre da freguesia de Barreira-Leiria (1875-1948). Textiverso, 2011.
- Antunes, José. Corresponding author: Antunes, José. "A universidade de Coimbra entre as mais antigas da Europa". In Universidade de Coimbra. Ed. Serviço de Documentação e Publicações da Universidade de Coimbra, 2003.
- Antunes, José. Corresponding author: Antunes, José. "A invulgar cultura literária de Frei António de Lisboa". In Homenagem ao Prof. Doutor José Marques. Faculdade de Letras, Universidade do Porto, 2001.
- Antunes, José. "As comunicações como suporte das Instituições Universitárias na Idade Média". Fundação das Comunicações, 2000.
- Antunes, José. "A Imprensa da Universidade na Reforma Pombalina". In Actas do Congresso- O Marquês de Pombal e a sua época, 10-12 de Novembro 1999, 407-419. 1999.
- Antunes, José. "As duas faces do poder na oratória sagrada portuguesa". In Actas do I Congresso da Associação Portuguesa de Estudos Clássicos (APEC). Coimbra, Portugal: Associação de Estudos Clássicos. Univ. de Coimbra, 1998.
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- Antunes, José. "O modelo do príncipe na Vita Theotonii". In Ensaios em homenagem a Joaquim Ferreira Gomes, 167-173. Portugal, 1998.
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- Antunes, José. "A teologia na Universidade Portuguesa (1290-1536)". In História da Universidade em Portugal (1290-1536), 237-264. Lisboa, Portugal: Universidade de Coimbra/Fundação Calouste Gulbenkian, 1997.
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- Antunes, José. Corresponding author: Antunes, José. "Teologia". In Història da Universidade de Portugal, 237-370. Universidade de Coimbra, 1997.
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- Antunes, José. "A versão portuguesa do Tratado de Tui (1137). Uma interpretação diferente da de Paulo Merêa e de outros historiadores". In Actas do 2º Congresso Histórico de Guimarães (24-27 de Outubro e 1996). 1996.
- Antunes, José. "Posição de alguns mestres antes e depois da fundação da Universidade face aos direitos dos povos". 11-37. Coimbra, Portugal: Universidade de Coimbra, 1991.
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- Antunes, José. "Posição de alguns mestres antes e depois da fundação da Universidade face aos direitos dos povos". In Actas do Congresso (História da Universidade no 7º Centenário da sua fundação), 11-37. Universidade de Coimbra, 1991.
- Antunes, José. "O percurso e o pensamento político de Pedro Hispano, Arcebispo-eleito de Braga e Papa João XXI". In Congresso Internacional IX Centenário da Dedicação da Sé de Braga, 125-184. Braga, Portugal: Universidade Católica Portuguesa, 1990.
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| Dictionary entry |
- Antunes, José. "Ensino, época medieval". In Dicionário de História Religiosa de Portugal, 1997.
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- Antunes, José. "Apologética". In Dicionário de Literatura Medieval Galega e Portuguesa, 1993.
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- Antunes, José. "Bíblia". In Dicionário de Literatura Medieval Galega e Portuguesa, 1993.
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- Antunes, José. "Boécio". In Dicionário de Literatura Medieval Galega e Portuguesa, 1993.
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- Antunes, José. "João Claro, frei". In Dicionário de Literatura Medieval Galega e Portuguesa, 1993.
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- Antunes, José. "Ordens religiosas". In Dicionário de Literatura Medieval Galega e Portuguesa, 1993.
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- Antunes, José. "Pedro Hispano portugalense". In Literatura Medieval Galega e Portuguesa, 1993.
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- Antunes, José. Corresponding author: Antunes, José. "Patrologia". In Literatura Medieval Galega e Portuguesa, 1993.
- Antunes, José. Corresponding author: Antunes, José. "Diálogo de Robim e do Teólogo". In Literatura Medieval Galega e Portuguesa, 1993.
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| Journal article |
- Antunes, José. Corresponding author: Antunes, José. "A propósito de possíveis relações culturais entre Pedro Hispano e Afonso X de Castela". Lusitania Sacra 38 (2018):
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- Antunes, José. Corresponding author: Antunes, José. "In Memoriam Manuel Augusto Rodrigues (1936-2016)". Revista de História das Ideias 35 2 (2017):
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- Antunes, José. "O iberismo político medieval e a Bula Manifestis probatum como marco jurídico de divisão". Revista de História das Ideias 31 (2010): 25-52.
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- Antunes, José. "Ateísmo, religião e movimentos revolucionários na Idade Média". Revista de História das Ideias 29 (2008): 61-65.
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- Antunes, José. "Portugal, no seu dealbar histórico, face à unidade hispânica". Revista de História das Ideias (2007): 39-51.
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- Antunes, José. "Res publica, res sacra: notas sobre as formas de presença da noção abstracta de Estado, na Idade Média". Revista de História das Ideias 27 (2006): 41-65.
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- Antunes, José. Corresponding author: Antunes, José. "Homenagem ao Prof. Doutor Joaquim Ferreira Gomes". Arquivo Coimbrão, Boletim da Biblioteca Municipal de Coimbra XXXI (2006):
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- Antunes, José. "A tradição europeia e as relações entre os dois poderes medievais: Igreja e "Estado": a filosofia subjacente". Revista de História das Ideias 26 (2005): 71-93.
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- Antunes, José. "Um apelo à invasão da África em 1344. Do Salado a Ceuta". Biblos, Revista da Faculdade de Letras da Universidade de Coimbra LXXVIII (2002):
- Antunes, José. "Um livro sempre aberto sobre Afonso I, rei de Portugal". Revista de História das Ideias 20 (1999):
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- Antunes, José. "O príncipe ideal cristão nos Annales Domini Alfonsi Portugallensium Regis (1185)". Humanitas 50 (1998): 437-440.
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- Antunes, José. "A nobreza no "discurso medieval da confissão" (séc. XII a XIV)". Revista de História das Ideias 19 (1997): 157-175.
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- Antunes, José. "O testamento de Fernando Joanes de Portocarreiro, deão da Sé de Braga e prior de Guimarães (de 1272)". Revista Theologica XXVIIII2 (1993): 407-431.
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- Antunes, José. "Dos direitos do homem aos direitos dos povos: do Portugal Medieval à Época Moderna". Revista de História das Ideias (1992): 23-56.
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- Antunes, José. "Portugueses no processo histórico da fundação da Universidade de Salamanca". Revista de História das Ideias XII (1991): 19-53.
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- Antunes, José. "A propósito do trabalho e dos "salários em atraso" na Idade Média: uma leitura da teologia moral". Revista Portuguesa da História 26 (1991): 1-44.
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- Antunes, José. "Acerca da liberdade de religião na Idade Média: Mouros e Judeus perante um problema teológico-canónico". Revista de História das Ideias XI (1989): 63-84.
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- Antunes, José. "Conflitos políticos no reino de Portugal entre a reconquista e a expansão: estado da questão". Revista de História das Ideias VII (1985): 25-111.
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- Antunes, José. "Notas sobre o sentido ideológico da reforma pombalina : a propósito de alguns documentos da imprensa da Universidade de Coimbra". Revista de História das Ideias IV II (1982): 143-197.
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