Rúben Miguel Rosa Branco (F11C-7810-0C86)

Curriculum Vitae

Rúben Miguel Rosa Branco

** PhD student at the Faculty of Sciences of the University of Lisbon (FCUL), conducting research at LASIGE. I am supervised by Professor Sara Madeira from FCUL and Professor Piero Fariselli from the Department of Medical Sciences of the University of Turin. I am also currently teaching at FCUL in classes related to Artificial Intelligence and Machine Learning, as an Invited Assistant Professor. ** I am interested in Deep Learning as a field overall and its applicability to many problems. My current research focuses on improving neurodegenerative disease prognosis, with particular attention to ALS and MS, using Deep Learning. More specifically, I am developing Generative Modeling methods for longitudinal medical datasets to enhance the available resources for low-resource chronic diseases. ** I have previously conducted research in Natural Language Processing, at the NLX-Group. My MSc dissertation, supervised by Professor António Branco to obtain a Masters in Data Science, focused on a particular problem named Shortcut Learning, specifically when learning commonsense reasoning. ** I have received 6 Academic Merit awards and 1 Outstanding Paper award.

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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo: Rúben Miguel Rosa Branco
Género: Masculino

Nomes de citação

Branco, Rúben
Branco, Ruben

Identificadores de autor

Ciência ID: F11C-7810-0C86
ORCID iD: 0000-0002-8126-8513
Google Scholar ID: 7nC30zwAAAAJ

Websites

https://rubenbranco.github.io/ (Pessoal)

Domínios de atuação

Ciências Exatas - Ciências da Computação e da Informação

Idiomas

Idioma	Conversação	Leitura	Escrita	Compreensão	Peer-review
Português (Idioma materno)
Inglês	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador proficiente (C2)

Formação

	Grau	Classificação
2021/09/27 - 2026 Em curso	Informática (Doutoramento) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2019/09/09 - 2021/11/03 Concluído	Ciência de Dados (Mestrado) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal "A Study of Commonsense Reasoning with Language Models" (TESE/DISSERTAÇÃO)	19
2016/09/12 - 2019/07/16 Concluído	Tecnologias de Informação (Licenciatura) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal	17

Percurso profissional

Docência no Ensino Superior

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2021/11/19 - 2022/09	Assistente Convidado (Docente Universitário)	Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
	Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal

Projetos

Bolsa

	Designação	Financiadores
2021/07/29 - Atual	BRAINTEASER - BRinging Artificial INTelligencE home for a better cAre of amyotrophic lateral H2020-SC1-DTH-101017598 Bolseiro de Doutoramento Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal	Em curso
2019/10/22 - 2021/06/19	CLARIN - Infraestrutura Comum para os Recursos e Tecnologia da Linguagem 22117 Bolseiro de Investigação Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2019/04/21 - 2019/10/22	CLARIN - Infraestrutura Comum para os Recursos e Tecnologia da Linguagem 22117 Bolseiro de Técnico de Investigação Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal	Em curso
2018/02/01 - 2019/04/21	ELRI - European Language Resources Infrastructure INEA/CEF/ICT/A2016/1330962 Bolseiro de Técnico de Investigação Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal	Concluído

Produções

Publicações

Artigo em conferência	Branco, Ruben; Barros Valente, Joana; Andreia S. Martins; Diogo F. Soares; Eduardo N. Castanho; Sara C. Madeira; Aidos, Helena. Autor correspondente: Branco, Ruben. "Survival analysis for multiple sclerosis: Predicting risk of disease worsening". Trabalho apresentado em CLEF, Thessaloniki, 2023. No prelo Branco, Ruben; Diogo F. Soares; Andreia S. Martins; Barros Valente, Joana; Eduardo N. Castanho; Sara C. Madeira; Aidos, Helena. Autor correspondente: Branco, Ruben. "Investigating the impact of environmental data on als prognosis with survival analysis". Trabalho apresentado em CLEF, Thessaloniki, 2023. No prelo Branco, Ruben; Diogo F. Soares; Andreia S. Martins; Auletta, Eleonora; Eduardo N. Castanho; Susana Nunes; Filipa Serrano; et al. Autor correspondente: Branco, Ruben. "Hierarchical Modelling for ALS Prognosis: Predicting the Progression Towards Critical Events". Trabalho apresentado em iDPP@CLEF 2022, Bologna, 2022. Aceite para publicação Susana Nunes; Rita Sousa; Filipa Serrano; Branco, Ruben; Diogo F. Soares; Andreia S. Martins; Auletta, Eleonora; et al. Autor correspondente: Susana Nunes. "Explaining Artificial Intelligence Predictions of Disease Progression with Semantic Similarity". Trabalho apresentado em iDPP@CLEF 2022, Bologna, 2022. Aceite para publicação Branco, Rúben; António Branco; António Rodrigues, João; João Ricardo Silva. "Shortcutted Commonsense: Data Spuriousness in Deep Learning of Commonsense Reasoning". Trabalho apresentado em The 2021 Conference on Empirical Methods in Natural Language Processing, Punta Cana, 2021. Publicado António Branco; João Silva; João Rodrigues. "Commonsense Reasoning: how do Neuro-Symbolic and Neuro-only approaches compare?". Trabalho apresentado em KINN 2021: Workshop on Knowledge Injection in Neural Networks, Gold Coast, 2021. Publicado Branco, António; António Rodrigues, João; Salawa, Malgorzata; Branco, Rúben; Saedi, Chakaveh. "Comparative Probing of Lexical Semantics Theories for Cognitive Plausibility and Technological Usefulness". Trabalho apresentado em International Conference on Computational Linguistics, 2020. Publicado • 10.18653/v1/2020.coling-main.354 Lima, Beatriz; Branco, Rúben; Castanheira, João; Fonseca, Gustavo; Pesquita, Cátia. "Learning reference alignments for ontology matching within and across domains". Trabalho apresentado em International Workshop on Ontology Matching, 2020. Publicado Branco, António; Grilo, Sara; Bolrinha, Márcia; Saedi, Chakaveh; Branco, Rúben; Silva, João; Querido, Andreia; et al. "The MWN.PT WordNet for Portuguese: Projection, Validation, Cross-lingual Alignment and Distribution". Trabalho apresentado em Language Resources and Evaluation Conference, Marseílle, 2020. No prelo António Rodrigues, João; Branco, Rúben; Silva, João; Branco, António. "Reproduction and Revival of the Argument Reasoning Comprehension Task". Trabalho apresentado em Language Resources and Evaluation Conference, Marseílle, 2020. No prelo Salawa, Malgorzata; Branco, António; Branco, Rúben; António Rodrigues, João; Saedi, Chakaveh. "Whom to Learn From? Graph- vs. Text-basedWord Embeddings". Trabalho apresentado em International Conference Recent Advances in Natural Language Processing (RANLP), Varna, 2019. Publicado • 10.26615/978-954-452-056-4_120 Branco, Rúben; António Rodrigues, João; Saedi, Chakaveh; Branco, António. "Assessing Wordnets with WordNet Embeddings". Trabalho apresentado em Global WordNet Conference 2019, Wroclaw, 2019. Publicado Gomes, Luís; Apolónia, Frederico; Branco, Rúben; Silva, João; Branco, António. "Setting up the PORTULAN / CLARIN repository". Trabalho apresentado em CLARIN Annual Conference 2018, Pisa, 2018. Publicado António Rodrigues, João; Silva, João; Saedi, Chakaveh; Branco, António. "Predicting Brain Activation with WordNet Embeddings". Trabalho apresentado em Workshop on Cognitive Aspects of Computational Language Learning (CogACLL), 2018. Publicado • 10.18653/v1/w18-2801 António Branco; Branco, Rúben; Chakaveh Saedi; João Silva. "Browsing and Supporting Pluricentric Global Wordnet, or just your Wordnet of Interest". Trabalho apresentado em Language Resources and Evaluation, Miyazaki, 2018. Publicado
Artigo em revista	Tavazzi, Erica; Longato, Enrico; Vettoretti, Martina; Aidos, Helena; Trescato, Isotta; Roversi, Chiara; Martins, Andreia S.; et al. "Artificial intelligence and statistical methods for stratification and prediction of progression in amyotrophic lateral sclerosis: A systematic review". Artificial Intelligence in Medicine 142 (2023): 102588. http://dx.doi.org/10.1016/j.artmed.2023.102588. 10.1016/j.artmed.2023.102588
Capítulo de livro	Gomes, Luís; Branco, Ruben; Silva, João; Branco, António. "Open and inclusive language processing: Language processing services by PORTULAN to meet the widest needs of CLARIN users". In CLARIN. The infrastructure for language resources.. De Gruyter, 2022. No prelo
Pré-impressão	António Rodrigues, João; Branco, Ruben; Branco, António. "Transfer Learning of Lexical Semantic Families for Argumentative Discourse Units Identification". 2022. https://arxiv.org/pdf/2209.02495.pdf.
Tese / Dissertação	"A Study of Commonsense Reasoning with Language Models". Mestrado, Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, 2021. https://repositorio.ul.pt/handle/10451/51357.

Atividades

Apresentação oral de trabalho

	Título da apresentação	Nome do evento Anfitrião (Local do evento)
2022/06/30	Shortcut Learning In Commonsense Reasoning (and NLP overall)	LITHME Whole Action Conference University of Jyväskylä (Jyväskylä, Finlândia)
2022/02/09	Shortcut Learning In Commonsense Reasoning (and NLP overall)	Deep Learning Sessions Portugal Meetups Deep Learning Sessions Portugal (Portugal)

Arbitragem científica em conferência

	Nome da conferência	Local da conferência
2021/06 - 2021/07	The 2021 Conference on Empirical Methods in Natural Language Processing	Empirical Methods in Natural Language Processing
2020/05/11 - 2020/05/16	Language Resources and Evaluation Conference	Marseílle, France

Expedição científica

	Descrição da atividade	Instituição / Organização
2022/02/14 - 2022/02/17	Winter School on e-Health and Pervasive Technologies, hosted at the Faculty of Electrical Engineering and Information Technologies (FEEIT), Ss. Cyril and Methodius University in Skopje (UKIM), North Macedonia.	Saints Cyril and Methodius University in Skopje Faculty of Electrical Engineering and Information Technologies, Macedónia

Tutoria

	Tópico	Nome do aluno
2022/09 - 2023/11	Explaining Deep Prognostic Models of Amyotrophic Lateral Sclerosis	Francisco Miguel Delgado Calado Malveiro

Distinções

Prémio

2022	Academic Merit Scholarship Direção-Geral de Ensino Superior, Portugal
2021	Prémio Maxdata Excelência em Informática Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2021	Outstanding Paper Award - EMNLP2021 EMNLP, Estados Unidos
2020	Academic Merit Award Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2018	FCiências.ID Award Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal

Outra distinção

2019	Academic Merit Diploma Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2018	Academic Merit Diploma Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal