Curriculum Vitae
Maria Mafalda Vieira Pereira Gonçalves de Sousa
Identificação
Identificação pessoal
- Nome completo
- Maria Mafalda Vieira Pereira Gonçalves de Sousa
Nomes de citação
- Sousa M
Identificadores de autor
- Ciência ID
- EF16-257F-7F49
- ORCID iD
- 0000-0003-2238-1070
Formação
| Grau | Classificação | |
|---|---|---|
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2019/02/02 - 2019/02/07
Concluído
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Advanced Training School for BioImage Analysts (Outros)
Especialização em Image Analysis
Neubias Cost Action, Bélgica
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2016/09/01 - 2018/07/30
Frequentou
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Master in Informatics Engineering - Software engineering (Mestrado)
Especialização em Software engineering
Instituto Politécnico do Porto Instituto Superior de Engenharia do Porto, Portugal
"NA" (TESE/DISSERTAÇÃO)
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15 |
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2018/07/03 - 2018/07/04
Concluído
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Imaris training course for Facility Staff (Curso de Especialização Tecnológica)
Especialização em Image Analysis
Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal
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2015/02 - 2015/03
Concluído
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FELASA B (Outros)
Especialização em Biologia
Universidade do Porto Instituto de Biologia Molecular e Celular, Portugal
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2010/01/01 - 2014/12/03
Concluído
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Doctoral Program in Neuroscience (Doutoramento)
Especialização em Computational Neuroscience
Universidade do Porto Faculdade de Medicina, Portugal
"Construction And Analysis Of Detailedbiophysical Models For Drt And Lamina I neurones" (TESE/DISSERTAÇÃO)
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Approved with distinction |
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2012/08/20 - 2012/08/24
Concluído
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Neuron course (Postgraduate Certificate)
Especialização em Computational Neuroscience
Institute of Science and Technology Austria, Áustria
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2 ECTS |
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2006/10 - 2007/02
Concluído
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Curso livre de Inglês B2.1 (Outros)
Especialização em Línguas
Universidade do Porto Faculdade de Letras, Portugal
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17 |
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2003/10 - 2006/09
Concluído
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Computational Methods in Science and Engineering (Mestrado)
Especialização em Computer science and mathematics
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
"Probabilistic Methods in Hierarchical Classification: Computational Implementation" (TESE/DISSERTAÇÃO)
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Very good |
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2005/09/12 - 2005/09/13
Concluído
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Curso de Formação de Monitores do Projecto FEUP 2005/2006 (Outros)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
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2005/06 - 2005/06
Concluído
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Formação pedagógica de monitores (Outros)
Especialização em Ensino
Universidade do Porto, Portugal
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1999/09 - 2003/07
Concluído
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Mathematics Applied to Technology (Licenciatura)
Especialização em Mathematics; Statistics; Modulation; Programming; Signal Processing; Data Analysis;
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
"Modelação e Simulação do Electrocardiograma a partir de técnicas de simulação e estatística." (TESE/DISSERTAÇÃO)
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14 |
Percurso profissional
Ciência
| Categoria Profissional Instituição de acolhimento |
Empregador | |
|---|---|---|
| 2018/04/01 - 2021/03/31 | Investigador Contratado (Investigação) | Universidade do Porto Instituto de Investigação e Inovação em Saúde, Portugal |
| Universidade do Porto Instituto de Investigação e Inovação em Saúde, Portugal | ||
| 2015/10/01 - 2018/03/31 | Pós-doutorado (Investigação) | Universidade do Porto Instituto de Biologia Molecular e Celular, Portugal |
| Universidade do Porto Faculdade de Medicina, Portugal | ||
| 2014/09/24 - 2015/09/30 | Investigador (Investigação) | Universidade do Porto Faculdade de Medicina, Portugal |
| Universidade do Porto Faculdade de Medicina, Portugal | ||
| 2008/01/01 - 2009/12/31 | Investigador (Investigação) | Universidade do Porto Instituto de Biologia Molecular e Celular, Portugal |
| 2006/01/01 - 2006/12/31 | Investigador (Investigação) | Instituto Nacional de Engenharia Biomédica, Portugal |
| 2004/03/01 - 2004/10/01 | Estagiário de Investigação (Investigação) | Serviço de Bioestatistica e Informática Médica do Porto FMUP, Portugal |
Docência no Ensino Superior
| Categoria Profissional Instituição de acolhimento |
Empregador | |
|---|---|---|
| 2017/01/01 - 2021/03/31 | Assistente Convidado (Docente Universitário) | Universidade do Porto Faculdade de Medicina, Portugal |
| Universidade do Porto Faculdade de Medicina, Portugal | ||
| 2010/11/22 - 2011/09/15 | Assistente convidado (Docente Ensino Superior Politécnico) | Escola Superior Gestão e Tecnologia do Instituto Politécnico de Viana do Castelo., Portugal |
Outras Carreiras
| Categoria Profissional Instituição de acolhimento |
Empregador | |
|---|---|---|
| 2021/04/04 - 2023/04/30 | Especialista de Informática Grau 3 Nível 2 (Especialista de informática) | LabOrders, Portugal |
Outros
| Categoria Profissional Instituição de acolhimento |
Empregador | |
|---|---|---|
| 2023/08/01 - Atual | Operations coordinator (freelancer) | Grand Circle Corporation, Estados Unidos |
| 2007/05 - 2007/12 | Operador de CallCenter | MEO Serviços de Comunicações e Multimédia SA, Portugal |
| 2005/07/01 - 2005/07/31 | Monitor | Universidade do Porto, Portugal |
| Universidade do Porto, Portugal | ||
| 2005/02/01 - 2005/07/01 | Monitor | Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal |
| Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal |
Projetos
Bolsa
| Designação | Financiadores | |
|---|---|---|
| 2016/05/01 - 2018/03/31 | Development of an integral solution for biomedical research combining continuous analysis of depth-sensor imaging, neurophysiology
and optogenetic stimulation.
Projecto NORTE-01-0145-FEDER-000008
Bolseiro de Pós-Doutoramento
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Concluído
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| 2010/01/01 - 2014/06 | Construction And Analysis Of Detailed biophysical Models For Drt And Lamina I neurones
SFRH/BD/60690/2009
Bolseiro de Doutoramento
Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT, Portugal
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Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT
Concluído
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| 2007/07 - 2010/06 | Theoretical models of nociceptive information processing and transmission in the spinal cord´s dorsal horn. | Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P. |
| 2006/01/01 - 2006/12/31 | Segmentation and Alignment of Medical Images
Projecto INEB/Unidade 174/LSI/2005
Bolseiro de Investigação
Instituto Nacional de Engenharia Biomédica, Portugal
|
Concluído
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Projeto
| Designação | Financiadores | |
|---|---|---|
| 2021/02 - Atual | Defragmentation: bringing BioImage Analysts to the cloud!
Financiado sem Ref
Investigador responsável
The Francis Crick Institute, Reino Unido
|
Em curso
|
| 2018/04/01 - Atual | Portuguese Platform of BioImaging
PPBI-POCI-01-0145-FEDER-022122
Investigador
Universidade do Porto Instituto de Investigação e Inovação em Saúde, Portugal
|
Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT
Em curso
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| 2020 - 2020 | Integrated Network of European Bioimage Analysis Core Facilities for Open Access Services to Life Scientists (BIASCores)
Não Financiado
Investigador
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Desativado
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| 2019 - 2019 | Deep learning on microscopy image analysis: a step forward on current methods
Não Financiado
Investigador responsável
Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT, Portugal
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Desativado
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| 2018 - 2018 | Bioimaging software tools and computational infrastructure
Não Financiado
Investigador responsável
|
Desativado
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Produções
Publicações
| Artigo em boletim informativo |
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| Artigo em conferência |
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| Artigo em revista |
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| Edição de número de revista |
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| Poster em conferência |
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| Resumo em conferência |
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Atividades
Apresentação oral de trabalho
| Título da apresentação | Nome do evento Anfitrião (Local do evento) |
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|---|---|---|
| 2020/02 | BioImage Analysis Facility Management Example | Neubias Satellite Meeting
Neubias (Luxemburgo, Luxemburgo)
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| 2013/11 | The electrophysiological properties of a pronociceptive nucleus: Dorsal Reticular Nucleus. | The 10th International Medical Postgraduate Conference
Charles University in Hradec Kralove (Hradec Králové , República Checa)
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| 2013/06 | Reduction in inhibitory control is sufficient to generate hyperalgesia in a spiking model of nociceptive integration in the superficial dorsal horn. | Nociceptive Processing In The Uncharted Spinal Dorsal Horn
Neuroscience Workshop FMUP (Porto, Portugal)
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| 2012/05 | Models for nociceptive information processing. | Mathematical Neuroscience Workshop
CMUP (porto, Portugal)
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| 2007/02 | Probabilistic Methods of Hierarchical Classification: Computational Implementation | Jornadas de Classificação e Análise de Dados
Instituto Superior Engenharia do Porto – Instituto Politécnico do Porto (po, Portugal)
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Orientação
| Título / Tema Papel desempenhado |
Curso (Tipo) Instituição / Organização |
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|---|---|---|
| 2017/01 - 2017/09 | Pathological Anatomy final course project - animal behaviour in a chronic pain model
Coorientador
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Anatomia Patológica, Citológica e Tanatológica (Licenciatura/Bacharelato)
Instituto Politécnico do Porto Escola Superior de Saúde, Portugal
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Organização de evento
| Nome do evento Tipo de evento (Tipo de participação) |
Instituição / Organização | |
|---|---|---|
| 2019/10 - 2019/10 | Neubias Training Schools, Porto 2019
COST Action http://eubias.org/NEUBIAS/training-schools/staff/ts13-porto-2019/ (2019/10)
Encontro (Membro da Comissão Científica)
|
Universidade do Porto Instituto de Investigação e Inovação em Saúde, Portugal Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Tecnologia e Ciência, Portugal |
Participação em evento
| Descrição da atividade Tipo de evento |
Nome do evento Instituição / Organização |
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|---|---|---|
| 2021/11 - 2021/11 | SPAOM is a joint effort from Red Española de Microscopía Óptica Avanzada (REMOA) and the Portuguese Platform of Biomedical
Imaging (PPBI), to organise an annual congress covering new applications in optical microscopy and image analysis.
Congresso
|
SPAOM 2021
Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal
|
| 2020/03/03 - 2020/03/06 | 4th Neubias Satellite meeting talk, Bordeus 2020
http://eubias.org/NEUBIAS/neubias2020-conference/bordeaux-2020/program-bordeaux-2020/
Conferência
|
4th Neubias Conference |
| 2019/11/06 - 2019/11/08 | SPAOM 2019 Spanish & Portuguese Advanced Optical Microscopy
Congresso
|
SPAOM
Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal
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| 2019/02/06 - 2019/02/08 | 3rd NEUBIAS Conference
Conferência
|
3rd NEUBIAS Conference |
| 2019/02/02 - 2019/02/07 | NEUBIAS 2019 Training School #11 BioImage Analysts
Encontro
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Neubias Training Schools |
Júri de grau académico
| Tema Tipo de participação |
Nome do candidato (Tipo de grau) Instituição / Organização |
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|---|---|---|
| 2021/04/23 | Development of Bioimage Analysis tools for the study of neurogenesis and neurodegeneration
Arguente principal
|
PAU CARRILLO BARBERA (Doutoramento)
Universitat de València, Espanha
|
| 2020/06/08 | Development of image analysis tools for the characterization of astrocytic calcium waves in controlled electrophysiological
conditions
Arguente principal
|
Leonor Sá (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
|
Arbitragem científica em conferência
| Nome da conferência | Local da conferência | |
|---|---|---|
| 2021/11/21 - 2021/11/25 | SPAOM | IGC |
Arbitragem científica em revista
| Nome da revista (ISSN) | Editora | |
|---|---|---|
| 2021/04 - 2021/04 | F1000Research ( 2046-1402) | |
| 2019/12 - 2019/12 | Machine Vision and Applications | Springer |
| 2018 - 2018 | Microscopy Research and Technique (1059-910X) | Wiley Online Library |
Curso / Disciplina lecionado
| Disciplina | Curso (Tipo) | Instituição / Organização | |
|---|---|---|---|
| 2020/01/01 - Atual | BioImage Analysis (18h) | Mestrado em Neurobiologia (Outros) | Universidade do Porto Faculdade de Medicina, Portugal |
| 2019 - Atual | Course on Optical Microscopy Imaging for Biosciences. An annual training course of 5 days at I3S | Course on Optical Microscopy Imaging for Biosciences (Outros) | Universidade do Porto Instituto de Investigação e Inovação em Saúde, Portugal |
| 2019 - Atual | Digital Image Analysis, Optical Microscopy Imaging for Biosciences annual course | Optical Microscopy Imaging for Biosciences | Universidade do Porto Instituto de Investigação e Inovação em Saúde, Portugal |
| 2018/09 - Atual | Introduction to digital bioimage analysis, annual training course at I3S of 3 days | (Outros) | Universidade do Porto Instituto de Investigação e Inovação em Saúde, Portugal |
| 2021/10 - 2021/10 | EMBO Practical Course aims at a multidisciplinary approach to the study of molecular interactions from and in biological systems, integrating biochemical/biophysical methodologies with live cell microscopy techniques. | Biomolecular interaction analysis: From molecules to cells | Universidade do Porto Instituto de Investigação e Inovação em Saúde, Portugal |
| 2021/05 - 2021/05 | BioImage Analysis for High Content Screening. An annual training course at I3S | BioImage Analysis for High Content Screening (Outros) | Universidade do Porto Instituto de Investigação e Inovação em Saúde, Portugal |
| 2019/10/14 - 2019/10/17 | Image segmentation | Neubias Training School for Facility Staff (Curso de Especialização Tecnológica) | Universidade do Porto Instituto de Investigação e Inovação em Saúde, Portugal Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Tecnologia e Ciência, Portugal |
| 2019/04 - 2019/10 | BIA Workflows - a series of 2h workshops about image analysis | (Outros) | Universidade do Porto Instituto de Investigação e Inovação em Saúde, Portugal |
| 2017/01 - 2019/07/30 | Neuroscience In-silico (14h discipline) | Mestrado em Neurobiologia (Mestrado) | Universidade do Porto Faculdade de Medicina, Portugal |
| 2010/11/22 - 2011/09/15 | Análise Matemática (teórico-praticas 1 semestre) | Licenciatura Engenharia Informática (Licenciatura) | Escola Superior Gestão e Tecnologia do Instituto Politécnico de Viana do Castelo., Portugal |
| 2010/11/22 - 2011/09/15 | Análise Matemática | Licenciatura em Engenharia Alimentar (Licenciatura) | |
| 2011/01 - 2011/07 | Cálculo Infinitésimal (teórico praticas 1 semestre) | Licenciatura em Gestão (Licenciatura) | Instituto Politécnico de Viana do Castelo, Portugal |
| 2005/07/01 - 2005/07/31 | Bola de Cristal versus Estatística - Universidade Júnior | Universidade Junior (160h) (Ensino básico 2º ciclo) | |
| 2003/10/01 - 2003/10/31 | Matemática 12º ano (38h) | Projecto FEUP MAFIQUI (Outros) | Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal |
| 2003/03/23 - 2003/07/15 | Métodos Estatístisco (praticas 1 semestre) | (Licenciatura) | Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal |
| 2003/03/23 - 2003/07/15 | Investigação Operacional e Delineamento de Experiências (praticas 1 semestre) | (Licenciatura) | Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal |
Membro de associação
| Nome da associação | Tipo de participação | |
|---|---|---|
| 2013 - 2017 | Sociedade Portuguesa de Neurociências | Associate Member |
| 2013 - 2014 | Organization for Computational Neurosciences | Association member |
Membro de comissão
| Descrição da atividade Tipo de participação |
Instituição / Organização | |
|---|---|---|
| 2019 - Atual | NEUBIAS Academy is a new initiative, aimed to provide sustainable material and activities focused on Training in Bioimage
Analysis.
Membro
|
Neubias Cost Action, Bélgica |
Distinções
Prémio
| 2019 | Cost Action Grant for the participation of Neubias Training Schools
Neubias Cost Action, Bélgica
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Outra distinção
| 2012 | Honorable mention. Best poster presentation in the 2nd FMUP Doctoral Students Meeting
Universidade do Porto Faculdade de Medicina, Portugal
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| 2012 | Travel award to FENS Forum |