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Arlindo Limede de Oliveira. Concluiu o(a) Licenciatura em Engenharia Electrotécnica e de Computadores em 1986/07/15 pelo(a) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico e Doctor of Philosophy em Electrical and Computer Engineering em 1994/12/20 pelo(a) University of California, Berkeley. Publicou 101 artigos em revistas especializadas. Possui 1 capítulo(s) de livros e 3 livro(s). No seu currículo Ciência Vitae os termos mais frequentes na contextualização da produção científica, tecnológica e artístico-cultural são: Previsão de Tráfego com Contexto Situacional; Análise Integrativa de Dados Urbanos Heterogéneos; Aprendizagem Profunda por Reforço; Optimização da Mobilidade Urbana; Redução de Modelos; Simulação do Cérebro; Controlo Temporal da Simulação; Computação Paralela; Medicina de Precisão; Tecnologias da saúde; Oncologia; Imunidade; Conectividade Funcional no Cérebro; Análise de Redes de Elevada Complexidade; fMRI por Campos de Elevada Intensidade; fMRI em repouso; análise de dados de interacções; Biologia Computacional; Computação Social; Big Data; redes complexas; dinâmica de/em redes complexas; padrões em redes complexas; algoritmia; Neurodegenerative Diseases; Clinical and Omics Data Integration; Knowledge Discovery; Systems Medicine; Arquitectura Heterogénea com Múltiplos Núcleos; Análise de Sequências Biológicas; Tecnologias de Sequenciação de Elevado Débito; Algoritmos Paralelos; Novas Tecnologias de Sequenciação; Sequenciação de DNA e RNA; Algoritmos de Indexação para Alinhamento; Estruturas de dados distribuidas; Algoritmos ; Bioinformática; Redes de regulação genética; MicroRNA; Sistemas dinâmicos; inferência de haplotipos; satisfação proposicional; parcimónia pura; dados reais; Redes de regulação transcricional; Respostas a drogas; Transportadores de multiplas drogas; Genómica Funcional e Bioinformática; Saccharomyces cerevisiae; Respostas a drogas/stresse químico ; recuperação de informação; bibliotecas digitais; organização de documentos; partilha de informação; Gestão de Informação Pessoal; Recuperação de Informação; Interfaces com o Utilizador; Computação Ubíqua; engenharia de ontologias; aprendizagem de ontologias; Análise de risco; Semantic Web; Genómica; Redes de regulação; Sistema de informação; .
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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Arlindo Limede de Oliveira

Nomes de citação

  • Oliveira, Arlindo

Identificadores de autor

Ciência ID
E718-A5FB-4F7D
ORCID iD
0000-0001-8638-5594
Formação
Grau Classificação
1989/08/16 - 1994/12/20
Concluído
 Electrical and Computer Engineering (Doctor of Philosophy)
University of California, Berkeley, Estados Unidos
"Inductive learning by selection of minimal complexity representations" (TESE/DISSERTAÇÃO)
1987/09/01 - 1989/07/30
Concluído
 Engenharia Electrotécnica e de Computadores (Mestrado)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
"A simulação concorrente de faltas em circuitos integrados usando modelos ao nível de interruptor " (TESE/DISSERTAÇÃO)
1981/01/02 - 1986/07/15
Concluído
 Engenharia Electrotécnica e de Computadores (Licenciatura)
Especialização em Sistemas e Computadores
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
 19
Percurso profissional

Docência no Ensino Superior

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2016 - 2018 Professor Catedrático (Docente Universitário) Universidade de Lisboa, Portugal
2013 - 2016 Professor Catedrático (Docente Universitário) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal

Cargos e Funções

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2017 - 2018 Conselho geral ou orgão correspondente Universidade de Lisboa, Portugal
2016 - 2018 Conselho de gestão ou orgão correspondente Universidade de Lisboa, Portugal
2016 - 2018 Diretor ou presidente da unidade orgânica Universidade de Lisboa, Portugal
2013 - 2016 Diretor ou presidente da unidade orgânica Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
Projetos

Projeto

Designação Financiadores
2022/01/01 - 2024/12/30 Precise and Efficient Learning using Attention Mechanisms (PRELUNA)
PTDC/CCI-INF/4703/2021
Investigador responsável
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2019/01/01 - 2021/12/31 iLU: Aprendizagem Avançada em Dados Urbanos com Contexto Situacional para Optimização da Mobilidade nas Cidades
DSAIPA/DS/0111/2018
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal

Camara Municipal de Lisboa, Portugal

Laboratório Nacional de Engenharia Civil, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2018/10/01 - 2021/09/30 Algoritmos para Redução de Modelos e Simulação Eficiente de Redes Neuronais Realistas
PTDC/EEI-EEE/31140/2017
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2020/07/01 - 2021/05/31 INTAKE: INtegrating mobility daTa into spAtial risK modEls
projeto nº 361, INTAKE: INtegrating mobility daTa into spAtial risK modEls
Investigador responsável
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2016/12/01 - 2020/11/30 Promoção do avanço significativo do conhecimento na área de medicina de precisão e sua translação para benefício da sociedade
SAICTPAC/0021/2015
Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes, Portugal

Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal

Associação do Instituto Superior Técnico para a Investigação e Desenvolvimento, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2013/07/01 - 2016/07/03 Tratamento de Dados em Larga-escala em Ambientes Nuvem
EXCL/EEI-ESS/0257/2012
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal

Fundacao para a Computacao Cientifica Nacional, Portugal

Instituto de Biologia Experimental e Tecnológica, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2013/07/01 - 2015/12/31 HIFI-MRI: Análise de Conectividade Funcional no Cérebro usando fMRI por Campos de Elevada Intensidade
PTDC/EEI-ELC/3246/2012
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal

Associação do Instituto Superior Técnico para a Investigação e Desenvolvimento, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2012/01/01 - 2014/06/30 NetDyn: Análise de redes reais de grande dimensão, da estrutura à dinâmica
PTDC/EIA-CCO/118533/2010
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal

Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2011/03/01 - 2014/02/28 NEUROCLINOMICS - Compreendendo as doenças neurodegenerativas através da integração de dados clínicos e genómicos
PTDC/EIA-EIA/111239/2009
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal

Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2011/01/01 - 2013/12/31 HELIX: Arquitectura heterogénea com múltiplos núcleos para análise de sequências biológicas
PTDC/EEA-ELC/113999/2009
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2011/01/01 - 2013/12/31 TAGS : O poder do pequeno - Ferramentas e algoritmos para as novas aplicações de sequenciação
PTDC/EIA-EIA/112283/2009
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2008/01/01 - 2010/12/31 ARN - Algoritmos para a identificação de redes de regulação genética
PTDC/EIA/67722/2006
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal

Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2008/01/01 - 2010/12/31 Dyablo: Modelos para o Comportamento Dinâmico de Redes Biológicas
PTDC/EIA/71587/2006
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2008/01/01 - 2010/12/31 SHIPs: Inferência de Haplotipos por Parcimónia Pura baseada em Satisfação Proposicional
PTDC/EIA/64164/2006
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal

Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências Médicas, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2007/09/12 - 2010/11/10 Caracterização e modelação de uma rede de regulação transcricional específica envolvida na resistência a múltiplas drogas em levedura
PTDC/BIO/72063/2006
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal

Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2005/04/01 - 2008/06/30 IBRID - Informação Biográfica para Recuperação Interactiva de Documentos
POSC/EIA/59022/2004
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2005/06/01 - 2008/06/01 Um Ambiente Integrado para Investigação e Ensino de Tecnologias de Recuperação de Informação
POSC/EIA/58194/2004
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2005/04/01 - 2008/03/31 Onto-SeaWeb - Engenharia de Ontologias para a Semantic Web
POSC/EIA/58210/2004
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2006/01/02 - 2008/01/01 Elucidação das complexas redes de regulação que actuam na levedura sujeita a drogas/stresse químico: abordagens de expressão genómica e de bioinformática
PDCT/BIO/56838/2004
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal

Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2005/01/01 - 2007/12/31 DBYeast: Infraestruturas e algoritmos para análise e identificação de redes de regulação genética
POSC/EIA/57398/2004
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
Produções

Publicações

Artigo em conferência
  1. Lourenço-Silva, João; Arlindo L. Oliveira. "Encoder-decoder architectures for clinically relevant coronary artery segmentation". Trabalho apresentado em 11th International Conference on Computational Advances in Bio and medical Sciences, Virtual, 2021.
    No prelo
  2. Lourenço-Silva, João; Arlindo L. Oliveira. "Using Soft Labels to Model Uncertainty in Medical Image Segmentation". Trabalho apresentado em MICCAI Brain Lesion workshop, Virtual, 2021.
    No prelo
Artigo em revista
  1. Oliveira, Arlindo. "The bio.tools registry of software tools and data resources for the life sciences". Genome Biology (2019): http://dx.doi.org/10.1186/s13059-019-1772-6.
    10.1186/s13059-019-1772-6
  2. Oliveira, Arlindo. "Biotechnology, Big Data and Artificial Intelligence". Biotechnology Journal (2019): http://dx.doi.org/10.1002/biot.201800613.
    10.1002/biot.201800613
  3. Miguel Monteiro; Ana Catarina Fonseca; Ana Teresa Freitas; Teresa Pinho e Melo; Alexandre P. Francisco; Jose M. Ferro; Arlindo L. Oliveira. "Using Machine Learning to Improve the Prediction of Functional Outcome in Ischemic Stroke Patients". IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics 15 6 (2018): 1953-1959. https://doi.org/10.1109/TCBB.2018.2811471.
    10.1109/TCBB.2018.2811471
  4. Oliveira, Arlindo. "ISLES 2016 and 2017-Benchmarking Ischemic Stroke Lesion Outcome Prediction Based on Multispectral MRI". Frontiers in Neurology (2018): http://dx.doi.org/10.3389/fneur.2018.00679.
    10.3389/fneur.2018.00679
  5. Oliveira, Arlindo. "Computational Approach to the Discovery of Phytochemical Molecules with Therapeutic Potential Targets to the PKCZ protein". Letters in Drug Design & Discovery (2018): http://dx.doi.org/10.2174/1570180814666170810120150.
    10.2174/1570180814666170810120150
  6. Oliveira, Arlindo. "DegreeCox – a network-based regularization method for survival analysis". BMC Bioinformatics (2016): http://dx.doi.org/10.1186/s12859-016-1310-4.
    10.1186/s12859-016-1310-4
  7. Niklas Blomberg; Arlindo Oliveira; Barend Mons; Bengt Persson; Inge Jonassen. "The ELIXIR channel in F1000Research [version 2; referees: not peer reviewed]". (2016): http://f1000research.com/articles/4-1471/v2.
    10.12688/f1000research.7587.2
  8. Oliveira, Arlindo. "The YEASTRACT database: an upgraded information system for the analysis of gene and genomic transcription regulation inSaccharomyces cerevisiae". Nucleic Acids Research (2014): http://dx.doi.org/10.1093/nar/gkt1015.
    10.1093/nar/gkt1015
  9. Oliveira, Arlindo. "Using Information Interaction to Discover Epistatic Effects in Complex Diseases". PLoS ONE (2013): http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0076300.
    10.1371/journal.pone.0076300
  10. Oliveira, Arlindo. "Mining query log graphs towards a query folksonomy". Concurrency and Computation: Practice and Experience (2012): http://dx.doi.org/10.1002/cpe.1773.
    10.1002/cpe.1773
  11. Oliveira, Arlindo. "GRISOTTO: A greedy approach to improve combinatorial algorithms for motif discovery with prior knowledge". Algorithms for Molecular Biology (2011): http://dx.doi.org/10.1186/1748-7188-6-13.
    10.1186/1748-7188-6-13
  12. Oliveira, Arlindo. "QUANTITATIVE MODELING OF THE SACCHAROMYCES CEREVISIAE FLR1 REGULATORY NETWORK USING AN S-SYSTEM FORMALISM". Journal of Bioinformatics and Computational Biology (2011): http://dx.doi.org/10.1142/s0219720011005690.
    10.1142/s0219720011005690
  13. Oliveira, Arlindo. "Qualitative modelling and formal verification of the FLR1 gene mancozeb response in Saccharomyces cerevisiae". IET Systems Biology (2011): http://dx.doi.org/10.1049/iet-syb.2011.0001.
    10.1049/iet-syb.2011.0001
  14. Oliveira, Arlindo. "Efficient alignment of pyrosequencing reads for re-sequencing applications". BMC Bioinformatics (2011): http://dx.doi.org/10.1186/1471-2105-12-163.
    10.1186/1471-2105-12-163
  15. CalÇada, D.; Vinga, S.; Freitas, A.T.; Oliveira, A.L.. "Quantitative modeling of the saccharomyces cerevisiae FLR1 regulatory network using an s-system formalism". Journal of Bioinformatics and Computational Biology 9 5 (2011): 613-630. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-80053654755&partnerID=MN8TOARS.
    10.1142/S0219720011005690
  16. Dias, P.J.; Costa, C.P.; Sá-Correia, I.; Teixeira, M.C.; Monteiro, P.T.; Oliveira, A.L.; Freitas, A.T.. "Using systems biology approaches to study a multidrug resistance network". 1st Portuguese Meeting in Biomedical Engineering, ENBENG 2011 (2011): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-80053956931&partnerID=MN8TOARS.
    10.1109/ENBENG.2011.6026073
  17. Gonçalves, J.P.; Francisco, A.P.; Mira, N.P.; Teixeira, M.C.; Sá-Correia, I.; Oliveira, A.L.; Madeira, S.C.. "TFRank: Network-based prioritization of regulatory associations underlying transcriptional responses". Bioinformatics 27 22 (2011): 3149-3157. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-80755171153&partnerID=MN8TOARS.
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  19. Francisco, A.P.; Oliveira, A.L.. "On community detection in very large networks". Communications in Computer and Information Science 116 CCIS (2011): 208-216. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-81755166850&partnerID=MN8TOARS.
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  20. Abdulrehman, D.; Monteiro, P.T.; Teixeira, M.C.; Mira, N.P.; Lourenço, A.B.; Dos Santos, S.C.; Cabrito, T.R.; et al. "YEASTRACT: Providing a programmatic access to curated transcriptional regulatory associations in Saccharomyces cerevisiae through a web services interface". Nucleic Acids Research 39 SUPPL. 1 (2011): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-78651272522&partnerID=MN8TOARS.
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  27. Francisco, A.P.; Baeza-Yates, R.; Oliveira, A.L.. "Mining large query induced graphs towards a hierarchical query folksonomy". Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics) 6393 LNCS (2010): 237-242. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-78549243815&partnerID=MN8TOARS.
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  30. Teixeira, M.C.; Dias, P.J.; Monteiro, P.T.; Sala, A.; Oliveira, A.L.; Freitas, A.T.; Sá-Correia, I.. "Refining current knowledge on the yeast FLR1 regulatory network by combined experimental and computational approaches". Molecular BioSystems 6 12 (2010): 2471-2481. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-78149432402&partnerID=MN8TOARS.
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  31. Trezentos, P.; Lynce, I.; Oliveira, A.L.. "Apt-pbo: Solving the software dependency problem using pseudo-boolean optimization". ASE'10 - Proceedings of the IEEE/ACM International Conference on Automated Software Engineering (2010): 427-436. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-78649766075&partnerID=MN8TOARS.
    10.1145/1858996.1859087
  32. Gonçalves, J.P.; Madeira, S.C.; Oliveira, A.L.. "BiGGEsTS: Integrated environment for biclustering analysis of time series gene expression data". BMC Research Notes 2 (2009): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-75649124958&partnerID=MN8TOARS.
    10.1186/1756-0500-2-124
  33. Bugalho, M.M.F.; Oliveira, A.L.. "Constant time clash detection in protein folding". Journal of Bioinformatics and Computational Biology 7 1 (2009): 55-74. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-65449173167&partnerID=MN8TOARS.
    10.1142/S0219720009003996
  34. Madeira, S.C.; Oliveira, A.L.. "A polynomial time biclustering algorithm for finding approximate expression patterns in gene expression time series". Algorithms for Molecular Biology 4 1 (2009): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-67651018681&partnerID=MN8TOARS.
    10.1186/1748-7188-4-8
  35. Ferreira, A.; Oliveira, A.; Figueiredo, M.. "On the use of suffix arrays for memory-efficient Lempel-Ziv data compression". Proceedings - 2009 Data Compression Conference, DCC 2009 (2009): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-67650671580&partnerID=MN8TOARS.
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  99. Oliveira, Arlindo L.; Sangiovanni-Vincentelli, Alberto. "LSAT--An algorithm for the synthesis of two level threshold gate networks". 1991 IEEE International Conference on Computer-Aided Design Digest of Technical Papers (1992): 130-133. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0027091099&partnerID=MN8TOARS.
  100. Gracio, J.A.; Bicudo, P.A.; Rua, N.N.; Oliveira, A.M.; Almeida, C.F.B.; Teixeira, J.P.. "Bottom-up methodology for test preparation and refinement". Proceedings - IEEE International Symposium on Circuits and Systems 2 (1989): 949-952. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0024946663&partnerID=MN8TOARS.
  101. Gracio, J.A.; Bicudo, P.A.; Rua, N.N.; Oliveira, A.M.; Almeida, C.F.B.; Teixeira, J.P.. "Test preparation and fault analysis using a bottom-up methodology". (1989): 168-174. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0024866858&partnerID=MN8TOARS.
Capítulo de livro
  1. Oliveira, Arlindo. "Efficient and Accurate Haplotype Inference by Combining Parsimony and Pedigree Information". 2012.
    10.1007/978-3-642-28067-2_3
Livro
  1. Oliveira, Arlindo. Inteligência Artificial. Lisboa, Portugal: Fundação Francisco Manuel dos Santos. 2019.
    Publicado
  2. Oliveira, Arlindo. Computer Architecture. 2018.
    10.1142/10940
  3. Oliveira, Arlindo. The Digital Mind. 2017.
    10.7551/mitpress/9780262036030.001.0001
Recurso online
  1. Dinis L. Rodrigues; Miguel Nobre Menezes; Fausto J. Pinto; Oliveira, Arlindo. Automated Detection of Coronary Artery Stenosis in X-ray Angiography using Deep Neural Networks. 2021. https://arxiv.org/abs/2103.02969.
  2. Alexandre Borges; Oliveira, Arlindo. Combining Off and On-Policy Training in Model-Based Reinforcement Learning. 2021. https://arxiv.org/abs/2102.12194.

Outros

Outra produção
  1. Sparse network-based regularization for the analysis of patientomics high-dimensional survival data. 2018. André Veríssimo; Eunice Carrasquinha; Marta B. Lopes; Arlindo L. Oliveira; Marie-France Sagot; Susana Vinga. https://doi.org/10.1101/403402.
    10.1101/403402
Atividades

Orientação

Título / Tema
Papel desempenhado 		Curso (Tipo)
Instituição / Organização
2021/01/01 - 2025/07/30 Attention Mechanisms in Computer Vision
Orientador
 Engenharia Informática e de Computadores (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2019/01/01 - 2025/07/30 Optimization of traffic flow using data mining techniques
Orientador
 Engenharia Informática e de Computadores (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2019/01/01 - 2023/07/30 Machine Learning Techniques for Processing Electrophysiological Signals in Brain-Computer Interfaces
Coorientador
 Engenharia Informática
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2015/01/01 - 2021/02/23 Network-based sparse regularization for the identification of disease signatures
Coorientador de André Veríssimo
 Engenharia Informática e de Computadores (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2010/01/01 - 2014/11/30 Application of data mining techniques to identify disease susceptibility from genotype data
Orientador
 Engenharia Informática e de Computadores (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2008/01/01 - 2012/11/30 Variability in Biological Systems: Modeling Consequences and Applications
Coorientador de Filipe Grácio
 Engenharia Biológica (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2007/01/01 - 2011/07/30 Techniques for the resolution of dependencies in the installation process of software components
Orientador de Paulo Trezentos
 Engenharia Informática e de Computadores (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2007/01/01 - 2011/07/01 Motif representation and discovery
Orientador de Alexandre Carvalho
 Engenharia Electrotécnica e de Computadores (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2007/01/01 - 2011/01/30 Satisfiability-based Algorithms for Haplotype Inference,
Coorientador
 Engenharia Informática e de Computadores (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2006/01/01 - 2010/11/30 Search Based Methods for Proteín Structure Prediction
Orientador
 Engenharia Informática e de Computadores (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2006/01/01 - 2010/05/30 Analyzing graph structure: algorithms and applications
Orientador
 Engenharia Informática e de Computadores (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2004/01/01 - 2008/12/20 Efficient Biclustering Algorithms for Time Series Gene Expression Data Analysis
Orientador
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2004/01 - 2008/03/30 Uma Metodologia para a Determinação de Observabilidade e Controlabilidade em Circuitos Digitais
Orientador de José Ramirez Colaço
 Engenharia Electrotécnica e de Computadores (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2003/01/01 - 2007/10/30 Improving Methods for Single-label Text Categorization
Orientador
 Engenharia Informática e de Computadores (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2002/01/01 - 2005/01/30 Pattern Mining over Nominal Event Sequences using Constraint Relaxations
Orientador de Cláudia Antunes
 Engenharia Informática e de Computadores (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
1998/01/01 - 2002/11/30 Estimação de potência em circuitos digitais utilizando técnicas de enumeração implícita,
Orientador de Ana Teresa Freitas
 Engenharia Electrotécnica e de Computadores (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
Distinções

Prémio

2009 Prémio Científico UTL/Santander Totta
Universidade de Lisboa, Portugal