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Rui Fernando Vieira Lisboa Matias Simões.
Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Rui Fernando Vieira Lisboa Matias Simões

Nomes de citação

  • Simões, Rui F.

Identificadores de autor

Ciência ID
DF14-0205-D3D8
ORCID iD
0000-0003-2718-9950

Telefones

Telemóvel
  • 917862392 (Profissional)
  • 917862392 (Pessoal)

Moradas

  • Centro de Neurociências e Biologia Celular da Universidade de Coimbra. MitoXT, UC Biotech Building, University of Coimbra Lot 8A, Biocant Park, 3060-197, Cantanhede, Cantanhede, Portugal (Profissional)

Domínios de atuação

  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia Celular
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Bioquímica
  • Ciências Exatas - Ciências da Computação e da Informação - Bioinformática
  • Ciências Médicas e da Saúde - Medicina Básica - Toxicologia

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Português (Idioma materno)
Inglês Utilizador independente (B2) Utilizador independente (B2) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1)
Formação
Grau Classificação
2016/08/02 - 2021/06/01
Em curso
Doutoramento em Biologia Experimental e Biomedicina (Doutoramento)
Universidade de Coimbra Instituto de Investigação Interdisciplinar, Portugal
"Neuronal mitochondrial metabolism and dynamic profiling under physiological and pathological conditions using biological-based machine learning approaches " (TESE/DISSERTAÇÃO)
2018/11/12 - 2018/11/14
Concluído
Superresolution in Light Microscopy course (Outros)
Institute of Molecular Genetics of the Czech Academy of Science, República Checa
2018/10/22 - 2018/10/26
Concluído
Single Molecule Microscopy and Manipulation course (Outros)
Biotechnologický ústav Akademie ved Ceské republiky, República Checa
2018/06/18 - 2018/06/22
Concluído
High Throughput Screening and Image Analysis for BioSciences (Outros)
Universidade do Porto Instituto de Investigação e Inovação em Saúde, Portugal
2017/09/04 - 2017/09/14
Concluído
Summer School in Computational Biology (Outros)
Universidade de Coimbra, Portugal
2012/08/07 - 2014/09/11
Concluído
Mestrado em Biologia Celular e Molecular (Mestrado)
Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, Portugal
"Brain endothelial cells protection by pinacidil preconditioning in an okadaic acid induced Alzheimer's disease model: role of mitoKATP channels, ROS and HIF-1a" (TESE/DISSERTAÇÃO)
16
2009/09/18 - 2012/07/06
Concluído
Licenciatura em Bioquímica (Licenciatura)
Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, Portugal
16
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento
Empregador
2016/05/01 - 2016/07/31 Investigador (Investigação) Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal
Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal

Outros

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento
Empregador
2018/09/01 - 2019/02/28 Visiting PhD student Biotechnologický ústav Akademie ved Ceské republiky, República Checa, República Checa
Biotechnologický ústav Akademie ved Ceské republiky, República Checa, República Checa
2015/08/01 - 2016/09/30 Laboratory technician in MitoXT Services - Predicative Cellular Toxicology and Protection Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal
Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal
Projetos

Projeto

Designação Financiadores
2021/01/01 - Atual Organelle-targeted Radiocomplexes for Auger Therapy of Cancer
PTDC/MED-QUI/1554/2020
Investigador
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2021/01/01 - Atual SYNAPTIC VESICLE MATURATION AND ITS RELEVANCE FOR NEURODEGENERATION
PTDC/MED-NEU/8030/2020
Bolseiro de Doutoramento
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2018/07/06 - Atual Development and validation of innovative screening methods for mitochondrial health modulators
PTDC/BTM-SAL/29297/2017
Investigador
Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2018/05/01 - Atual Development of Novel Mitochondria-Targeted Antioxidants for Improving SOD1-Familial Amyotrophic Lateral Sclerosis Phenotype
PTDC/MED-FAR/29391/2017
Bolseiro de Doutoramento
Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
Produções

Publicações

Artigo em revista
  1. Moukette, Bruno M.; Castelão-Baptista, José P.; Ferreira, Luciana; Silva, Ana M.; Simões, Rui F.; Cabral, Célia; Pieme, Constant A.; et al. "Afrostyrax lepidophyllus Mildbr. and Monodora myristica (Gaertn.) Dunal Extracts Decrease Doxorubicin Cytotoxicity on H9c2 Cardiomyoblasts". Evidence-Based Complementary and Alternative Medicine 2021 (2021): 1-12. http://dx.doi.org/10.1155/2021/8858165.
    10.1155/2021/8858165
  2. Simões, Rui F.; Ferrão, Rafaela; Silva, Margarida R.; Pinho, Sonia L. C:; Ferreira, Lino; Oliveira, Paulo; Cunha-Oliveira, Teresa. "Refinement of a differentiation protocol using neuroblastoma SH-SY5Y cells for use in neurotoxicology research.". Food and chemical toxicology : an international journal published for the British Industrial Biological Research Association (2021): https://doi.org/10.1016/j.fct.2021.111967.
    10.1016/j.fct.2021.111967
  3. Valdinocci, Dario; Simões, Rui F.; Kovarova, Jaromira; Cunha-Oliveira, Teresa; Neuzil, Jiri; Pountney, Dean L.. "Intracellular and Intercellular Mitochondrial Dynamics in Parkinson’s Disease". Frontiers in Neuroscience 13 (2019): 930. http://dx.doi.org/10.3389/fnins.2019.00930.
    Publicado • 10.3389/fnins.2019.00930
  4. Simões, Rui F.; Coelho, Ana R.; Martins, Tatiana R.; Couto, Renata; Deus, Cláudia; Pereira, Cláudia V.; Simões, Rui F.; et al. "Berberine-induced cardioprotection and Sirt3 modulation in doxorubicin-treated H9c2 cardiomyoblasts.". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Basis of Disease 1863 11 (2017): 2904-2923. http://dx.doi.org/10.1016/j.bbadis.2017.07.030.
    10.1016/j.bbadis.2017.07.030
  5. Ferreira, André; Cunha-Oliveira, Teresa; Simões, Rui F.; Carvalho, Filipa S.; Burgeiro, Ana; Nordgren, Kendra; Wallace, Kendall B.; Oliveira, Paulo J.; Simões, Rui F.. "Altered mitochondrial epigenetics associated with subchronic doxorubicin cardiotoxicity". Toxicology 390 (2017): 63-73. http://dx.doi.org/10.1016/j.tox.2017.08.011.
    10.1016/j.tox.2017.08.011
  6. Kochel, Krzysztof; Tomczyk, Mateusz D.; Simões, Rui F.; Fraczek, Tomasz; Sobon, Adrian; Oliveira, Paulo J.; Walczak, Krzysztof Z.; Koceva-Chyla, Aneta; Simões, Rui F.. "Evaluation of biological properties of 3,3',4,4'-benzophenonetetracarboxylic dianhydride derivatives and their ability to inhibit hexokinase activity". Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters 27 3 (2017): 427-431. http://dx.doi.org/10.1016/j.bmcl.2016.12.055.
    10.1016/j.bmcl.2016.12.055
  7. Silva, Filomena; Simoes, Rui; Couto, Renata; Oliveira, Paulo; Simões, Rui F.. "Targeting Mitochondria in Cardiovascular Diseases". Current Pharmaceutical Design 22 37 (2016): 5698-5717. http://dx.doi.org/10.2174/1381612822666160822150243.
    10.2174/1381612822666160822150243
  8. Simões, Rui F.; Branco, Ana F.; Ferreira, André; Simões, Rui F.; Magalhães-Novais, Sílvia; Zehowski, Cheryl; Cope, Elisabeth; et al. "Ketogenic diets: from cancer to mitochondrial diseases and beyond.". European Journal of Clinical Investigation 46 3 (2016): 285-298. http://dx.doi.org/10.1111/eci.12591.
    10.1111/eci.12591
Capítulo de livro
  1. Simões, Rui F.; Cunha-Oliveira, Teresa; Costa, Cláudio F.; Sardão, Vilma; Oliveira, Paulo. "In Vitro Methodologies to Investigate Drug-Induced Toxicities". In Mitochondrial Dysfunction Caused by Drugs and Environmental Toxicants, 229-247. John Wiley & Sons, Inc., 2018.
    Publicado • 10.1002/9781119329725.ch14
Poster em conferência
  1. Simões, Rui F.; Cunha-Oliveira, Teresa; Oliveira, Paulo; Pereira, Francisco. "Differentiated SH-SY5Y cells as a cellular model to study mitochondrial physiology and dynamics". Trabalho apresentado em 54th Annual Scientific Meeting of the European Society for Clinical Investigation, COVID Edition, 2020.
  2. Simões, Rui F.; Cunha-Oliveira, Teresa; Oliveira, P. J.. "Optimization of experimental and computational processes to study mitochondrial trafficking and metabolic biomarkers". Trabalho apresentado em 52nd Annual Meeting of the European Society for Clinical Investigation, Barcelona (Spain), 2019.
  3. Simões, Rui F.; Cunha-Oliveira, Teresa; Oliveira, Paulo; Pereira, Francisco. "Early mitochondrial metabolism and dynamics changes as predictors of neurodegeneration and neuronal cell death". Trabalho apresentado em 53rd Annual Scientific Meeting of European Society for Clinical Investigation, 2019.
  4. Simões, Rui F.; Cunha-Oliveira, Teresa; Oliveira, Paulo; Pereira, Francisco. "Dose-dependent analysis of mitochondrial parameters in differentiated SH-SY5Y cells exposed to mitochondrial toxicants". Trabalho apresentado em 2nd Edition MitoPorto, 2018.
  5. Campos, J.; Pereira, Francisco; Costa, Ernesto; Sardão, Vilma; Cunha-Oliveira, Teresa; Silva, T.B.; Simões, Rui F.; et al. "Extracting Knowledge from Data to Predict Mitochondrial Toxicity Indexes for Pharmacological Compounds". Trabalho apresentado em MitoPorto - Advances in mitochondrial research. International symposium, 2017.
  6. Sardão, Vilma; Silva, T.B.; Simões, Rui F.; Oliveira, Paulo; Veloso, Caroline; Valente, M.J.; Silva, R.S.; Remião, Fernando; Borges, Fernanda. "Parkinson’s disease therapy with improved Catechol O-Methyltransferase (COMT) inhibitors display lower mitochondrial liabilitie". Trabalho apresentado em MitoPorto - Advances in mitochondrial research. International symposium, 2017.
  7. André, Ferreira; Simões, Rui F.; Vilaça, A.; Carvalho, F.S.; Garcia, R.; Burgeiro, Ana; Cunha-Oliveira, Teresa; Oliveira, Paulo. "Decreased global DNA methylation levels and gene expression patterns related metabolic end epigenetic remodeling enzymes are observed after Doxorubicin sub-chronic treatment". Trabalho apresentado em 50th Annual Scientific Meeting of the European Society for Clinical Investigation, 2016.
Atividades

Apresentação oral de trabalho

Título da apresentação Nome do evento
Anfitrião (Local do evento)
2020/09/15 "Non-supervised analysis of neurotoxicity of mitochondrial poisons 6-OHDA and Rotenone" 54th Annual Scientific Meeting of the European Society for Clinical Investigation, COVID Edition
2017/05/18 "Promising new catechol O-methyltransferase (COMT) inhibitors for Parkinson's disease display lower mitochondrial toxicity" 51st Annual Meeting of the European Society for Clinical Investigation
(Genoa, Itália)
2014/06/28 "Protection of endothelial brain cells by preconditioning with pinacidil in a model of Alzheimer's disease induced by okadaic acid: role of mitoKATP channels, ROS and HIF-1a" 28th Meeting of the Aging and Brain Dementia Study Group
(Aveiro, Portugal)

Organização de evento

Nome do evento
Tipo de evento (Tipo de participação)
Instituição / Organização
2019/05/22 - 2019/05/24 Organização do encontro "53rd Annual Meeting of the European Society for Clinical Investigation" que contou com a presença de investigadores de renome a nível mundial. (2019/05/22 - 2019/05/24)
Conferência (Membro da Comissão Organizadora)
2016/04/11 - 2016/04/15 Organização do curso "Cell Respirometry: Basics and Applications" (2016/04/11 - 2016/04/15)
Oficina (workshop) (Membro da Comissão Organizadora)
2012/03/30 - 2012/04/02 Organização do encontro "V National Meeting of Biochemistry students" (2012/03/30 - 2012/04/02)
Encontro (Membro da Comissão Organizadora)
Distinções

Prémio

2018 Best Poster Award in the 50th Annual Scientific Meeting of the European Society for Clinical Investigation, Barcelona (Spain), May 30- June 1, 2018
European Society for Clinical Investigation, Países Baixos
2016 Travel Grant for the 50th Annual Scientific Meeting of the European Society for Clinical Investigation, Paris (France), April 27-29, 2016
European Society for Clinical Investigation, Países Baixos